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Sistemática e biogeografia de besouros curculionídeos (Curculionoidea; Coleoptera) associados a figueiras (Ficus; Moracae) / Sistemática e Biogeografia de Besouros Curculionídeos (Curculionoidea; Coleoptera) associados a figueiras (Ficus; Moraceae).Rocha, Luciano Palmieri 19 May 2017 (has links)
Among the number of examples of broad radiations of insects on plants, the fig fig wasp system is one of the most remarkable. Although this interaction has frequently been used as a model for studies of mutualism and coevolution, other groups of insects associated with fig trees have received less attention. The weevils (Coleoptera: Curculionidae) associated with figs are one notable example. Being the largest family of animals, weevils achieved great evolutionary success due to their early association with their host plants. Despite few reports in literature, there is strong evidence of the specialization of weevils on figs. The main objective of this thesis was to understand how diversification of Curculionidae took place in fig trees. Previous studies have never addressed the systematics and biogeography of fig weevils under a phylogenetic framework. Therefore, we analyzed the tempo of diversification of Curculionidae lineages that use fig trees as host in order to reconstruct their historical biogeography. To gather information on fig weevils, we collected 325 fruit sets from more than 12% of the total Ficus species, from the Neotropical, Afrotropical and Oriental regions. We also examined seven entomological collections (AMNH, BMNH, INBIO, MNHN, MZUSP, NMNH, SAMC) searching for weevil specimens collected on figs. At least 80 weevil species from five genera (Cetatopus, Omophorus, Carponinus, Curculio, and Indocurculio) were found to be associated with figs. The radiation of curculionids on figs occurred at least three times independently. The tempo of diversification of the crown fig weevils is congruent with the diversification of figs during the Upper-Cretaceous/Lower-Eocene period. We hypothesize that the variation of the sea level and warmer climate in the past had great influence on the evolution of the species. Our results encourage future research on the biology and ecology of these species and will help us to understand the role weevils may have played in the evolution of the fig- fig wasp mutualism. / Um dos mais notáveis exemplos de radiação adaptativa de insetos em classes de plantas é o sistema figueiras - vespas de figo. Embora essa interação tenha sido frequentemente usada como modelo nos estudos de mutualismo e coevolução, outros grupos de insetos relacionados às figueiras têm sido negligenciados. Besouros curculionídeos (Coleoptera: Curculionidae) associados a figueiras representam um desses grupos pouco estudados. Apesar dos relatos escassos na literatura, existem fortes evidências do alto grau de especialização destes besouros às suas plantas hospedeiras. O objetivo geral desta tese foi entender como se deu a diversificação dos curculionídeos sobre as figueiras. Trabalhos anteriores nunca utilizaram uma abordagem filogenética para estudar a sistemática e biogeografia dos curculionídeos de figo e, por isso, este estudo analisa o tempo de diversificação das linhagenes destes besouros para reconstruir sua biogeografia histórica. De modo a obter informações das espécies estudadas, foram coletadas 325 amostras de frutos de cerca de 12% do total de espécies de figueiras das regiões Neotropical, Afrotropical e Oriental. Sete coleções entomológicas (AMNH, BMNH, INBIO, MNHN, MZUSP, NMNH, SAMC) foram vistadas em busca de espécimes de curculionídeos coletados em figo. Pelo menos 80 espécies de cinco gêneros (Cetatopus, Omophorus, Carponinus, Curculio e Indocurculio) foram encontradas. A radiação dos curculionídeos de figo ocorreu independentemente pelo menos três vezes ao longo da história dos Curculionidae. O período de diversificação das linhagenes de curculionídeos de figo é fortemente congruente com o período de diversificação das linhagenes de figueiras durante o fim do Cretáceo/Paleoceno. Acredita-se que fatores como a forte variação no nível dos oceanos e o clima mais quente no passado tiveram grande influência na evolução das espécies. Espera-se que os resultados deste trabalho encorajem estudos futuros sobre a biologia e ecologia dos curculionídeos associados às figueiras e auxilie no entendimento do papel que os curculionídeos possam ter desempenhado na evolução do sistema Ficus - vespas de figo.
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Distribuição de Trichoptera Kirby, 1813 (Insecta) em riachos de Mata Atlântica da Serra de Paranapiacaba, Estado de São Paulo, Brasil. / Distribution of Trichoptera Kirby, 1813 (Insecta) in Atlantic Rainforest streams of Serra de Paranapiacaba, São Paulo State, Brazil.Yokoyama, Elisa 28 July 2008 (has links)
No presente trabalho foram levantados dados sobre a fauna de imaturos de Trichoptera dentro e fora de unidades de conservação estaduais da região da Serra de Paranapiacaba, Estado de São Paulo, com o objetivo de testar os efeitos dos fatores ambientais e do estado de conservação ambiental sobre a composição faunística, abundância e riqueza das larvas. Também foi testada a relação entre a abundância e a distribuição dos diferentes gêneros de Trichoptera. As coletas foram feitas em riachos de 1a a 4 a ordem totalizando 33 pontos de coleta. 25 pedras de tamanho padronizado (18-20 cm de maior diâmetro) foram amostradas com auxílio de um puçá. Análises de ordenação e agrupamento não detectaram nenhuma estruturação da fauna de Trichoptera. Entre os fatores ambientais testados, os escores de integridade ambiental, características físico-químicas e localização do riacho (dentro e fora das unidades de conservação) não foram significativos para explicar a distribuição faunística, enquanto vazão e distância geográfica foram significativos, porém com baixo poder explicativo. Não houve diferença significativa entre a abundância e a riqueza (observada e padronizada) de riachos dentro e fora das unidades de conservação. A ausência de estruturação da fauna pode ter sido provocada pelos picos de chuva registrados antes e durante as coletas, o que poderia ter homogeneizado a fauna, e pelo diferentes graus de impacto antrópico encontrados nos riachos fora dos parques, os quais podem não ter sido fortes o suficiente para provocar diferenças de comunidades. Foi encontrada uma relação positiva entre a abundância relativa e a distribuição de gêneros, corroborando resultados de diversos estudos de macroecologia. / Data on the fauna of immature stages of Trichoptera were gathered for sites within and outside the range of conservation units in Serra de Paranapiacaba, State of São Paulo, aiming to test the effects of environmental variables and degree of environmental integrity on faunistic composition, abundance and richness of larvae. The relationship between abundance and occupancy of Trichoptera genera was also tested. Sampling was conducted in 1st-4th order streams, in a total of 33 stations. 25 stones with a standardized size (18-20cm along the longest axis) were sampled with a net (0,250mm mesh size). Ordination and cluster analysis failed to detect any faunal structure of Trichoptera. Among the environmental variables, the environmental integrity scores, physico-chemical factors and location (inside and outside of the conservation unit) were non significant in explaining the distribution, whereas discharge and geographic distance were significant, although with little explanatory power. No significant differences were found for abundance and richness (observed and standardized) between sites inside and outside of the conservation units. The absence of faunal structure may have resulted from peaks of rain recorded just before and during sampling days, which could have homogeneized the fauna, and due to differences in the degree of anthropic impacts found for sites outside of the conservation units, which may not have been severe enough to cause the differentiation of faunal assemblages. A positive relationship between relative abundance and distribution of genera was found, in accordance with various macroecology studies.
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Sistemática de Bruggmanniella Tavares, 1909 (Diptera, Cecidomyiidae) / Systematics of Bruggmanniella Tavares, 1909 (Diptera, Cecidomyiidae)Garcia, Carolina de Almeida 03 August 2018 (has links)
A tribo Asphondyliini, pertencente à família Cecidomyiidae, conta com 521 espécies divididas em 44 gêneros com distribuição cosmopolita. Os Asphondyliini estão inseridos na subfamília Cecidomyiinae, que é a maior subfamília em número de espécies, 5100, e se encontra dividida em quatro supertribos: Brachineuridi, Stromatosematidi, Cecidomyiidi e Lasiopteridi. As larvas de Cecidomyiinae possuem hábito micetófago, predador e galhador, sendo que este último aparece nas supertribos Cecidomyiidi e Lasiopteridi. Os galhadores são os organismos indutores responsáveis por malformações de porções dos tecidos ou órgãos das plantas, conhecidas como galhas. A relação entre os insetos galhadores e suas plantas hospedeiras é de alta especificidade e devido a isso, para as espécies descritas, é possível identificá-las pelo seu tipo de galha induzida no hospedeiro. O gênero Bruggmanniella Tavares, 1909, possui 11 espécies com distribuição majoritária na região Neotropical (oito espécies) e representantes descritos para as regiões Neártica (uma espécie) e Oriental (duas espécies). Neste trabalho foi realizada a primeira análise cladística para compreensão da relação de parentesco entre as espécies de Bruggmanniela, a descrição de uma espécie nova do Estado de São Paulo, Brasil, além da atualização da chave de identificação das espécies de Bruggmanniella. Na análise cladística foram levantados 56 caracteres morfológicos para 26 táxons terminais. Entre esses, 15 pertencem ao grupo-externo e 11 ao interno. A análise utilizando busca heurística de pesos iguais resultou em uma única árvore mais parcimoniosa com comprimento igual a 148 passos (IC=0.443 e IR=0.565) e a de busca por pesagem implícita também gerou uma única árvore com 149 passos (IC=0.440 e IR=0.561). O gênero Bruggmanniella tem sua monofilia suportada principalmente pela ausência do espessamento da margem cefálica da pupa. B. byrsonimae ainda possue posicionamento incerto por falta de conhecimenro do estágio larval. As duas espécies orientais descritas originalmente em Bruggmanniella, B. actinodaphnes e B. cinnamomi, posicionaram-se no ramo do grupo-irmão Pseudasphondylia, ensejando a proposição de duas novas combinações: P. actinodaphnes comb. nov e P. cinnamomi comb. nov. Apresentamos ainda, uma discussão acerca da distribuição geográfica das espécies de Bruggmanniella e Pseudasphondylia e a ocupação dos hospedeiros. / The tribe Asphondyliini, belonging to the family Cecidomyiidae, has 521 species divided into 44 genera with cosmopolitan distribution. The Asphondyliini are included in the subfamily Cecidomyiinae, which is the largest subfamily in number of species, 5100, and is divided into four supertribes: Brachineuridi, Stromatosematidi, Cecidomyiidi and Lasiopteridi. The larvae of Cecidomyiinae have mycethophagous, predatory and galling habit, the latter appearing in the supertribes Cecidomyiidi and Lasiopteridi. Gallers are the inducing organisms responsible for malformations of portions of the tissues or organs of plants, known as gall. The relation between the galling insects and their host plants is of high specificity and due to this, for the described species, it is possible to identify them by their type of host-induced gall. Bruggmanniella Tavares, 1909 has 11 species with major distribution in the Neotropical region (eight species) and representatives described for the regions Neartica (one species) and Oriental (two species). In this work, the first cladistic analysis was carried out to understand the kinship relationship between the Bruggmanniela species, the description of a new species from São Paulo State, Brazil. Bruggmanniela species identification key was also updated. In the cladistic analysis, 56 morphological characters were collected for 26 terminal taxa. Of these, 15 belong to the external group and 11 to the internal group. The analysis using heuristic search of equal weights resulted in a single more parsimonious tree with length equal to 148 steps (IC = 0.443 and IR = 0.565) and the search for implicit weighing also generated a single tree with 149 steps (CI = 0.440 and IR = 0.561). The genus Bruggmanniella has its monophyly supported mainly by the absence of thickening of the cephalic margin of the pupa. B. byrsonimae still has uncertain position due to lack of larval stage. The two eastern species originally described in Bruggmanniella, B. actinodaphnes and B. cinnamomi, were placed in the branch of the sister-group Pseudasphondylia, indicating two new combinations: P. actinodaphnes comb. nov and P. cinnamomi comb. nov. We also argue the geographical distribution of Bruggmanniella and Pseudaphondylia species and the occupation of the hosts.
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Parasitas gastrointestinais de Peltocephalus dumerilianus no Parque Nacional do Jaú, Barcelos, Amazonas: taxonomia-alfa e aspectos da relação parasita-hospedeiro / Gastrintestinal parasites Peltocephalus dumerilianus (SCHWEIGGER 1812) in Jaú National Park, Barcelos, Amazonas state: apha-taxonomy and aspects of parasite-host interactionFerreira, Luciana Raffi Menegaldo [UNESP] 24 June 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-06-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Peltocephalus dumerilianus (Chelonia: Podocnemididae) é um quelônio amplamente distribuído na Bacia Amazônica, encontrado preferencialmente em rios, igapós e lagos de água preta. Ocorrem em simpatria com outros animais da família Podocnemididae, embora sofram menor pressão cinegética por concentrarem seus ninhos em locais mais reclusos, no interior das florestas de igapó. Apesar de sua ampla distribuição e importância como fonte de proteína para os moradores da Amazônia, são raras as pesquisas relacionadas à patógenos desses répteis, inclusive de helmintos parasitos, fato que motivou este projeto. Para o estudo da helmintofauna de P. dumerilianus, 21 espécimes foram obtidos através de caça de subsistência na comunidade Tapiíra, situada às margens do rio Unini e inserida no Parque Nacional do Jaú, Barcelos, Estado do Amazonas, região bastante preservada e caracterizada por diversas Unidades de Conservação de Uso Sustentável e de Uso Integral. Após a colheita do conteúdo gastrointestinal, os helmintos obtidos foram identificados por métodos morfológicos de rotina aliados a estudos com microscopia eletrônica de varredura (MEV). Foram identificados espécies de nematódeos, Ancyracanthus pinnatifidus, Paratractis hystrix, Atractis trematophila, Klossinemella conciliatus, e mais três espécies indeterminadas do gênero Klossinemella. Também foram identificados os digenéticos Nematophila grandis, Helicotrema spirale e Telorchis hagmanni. Os resultados apresentados enriquecem o conhecimento acerca da biodiversidade parasitária amazônica e demonstram aspectos sobre a relação parasita-hospedeiro do P. dumerilianus. / Peltocephalus dumerilianus (Chelonia: Podocnemididae) is a chelonian widely distributed in the Amazon Basin, preferably found in rivers, flooded forests and black water lakes. Occur sympatric with other animals Podocnemididae family, although they suffer less pressure hunting by concentrating their nests in more prisoners locations within igapó forests. Despite its wide distribution and importance as a protein source for the inhabitants of the Amazon are few studies related to pathogens such animals, including helminth parasites, a fact that motivated this project. For the study of helminth parasites of P. dumerilianus, 21 specimens were obtained through subsistence hunting in Tapiíra community, situated on the banks of the river Unini and inserted in the Jau National Park, Barcelos, State of Amazonas; region well preserved and characterized by several Conservation Units of Sustainable Use and Full Use. After harvesting of gastrointestinal contents, helminths obtained were identified by traditional morphological methods combined with studies with scanning electron microscopy (SEM). Four species of nematodes were identified, Ancyracanthus pinnatifidus, Paratractis hystrix, Atractis trematophila, Klossinemella conciliatus, and more three undetermined species of the genus Klossinemella. Also were identified digeneas Nematophila grandis, Helicotrema spirale and Telorchis hagmanni. The results presented enrich the knowledge of the Amazon parasitic biodiversity and demonstrate aspects of the host-parasite relationship of P. dumerilianus.
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Distribuição de Trichoptera Kirby, 1813 (Insecta) em riachos de Mata Atlântica da Serra de Paranapiacaba, Estado de São Paulo, Brasil. / Distribution of Trichoptera Kirby, 1813 (Insecta) in Atlantic Rainforest streams of Serra de Paranapiacaba, São Paulo State, Brazil.Elisa Yokoyama 28 July 2008 (has links)
No presente trabalho foram levantados dados sobre a fauna de imaturos de Trichoptera dentro e fora de unidades de conservação estaduais da região da Serra de Paranapiacaba, Estado de São Paulo, com o objetivo de testar os efeitos dos fatores ambientais e do estado de conservação ambiental sobre a composição faunística, abundância e riqueza das larvas. Também foi testada a relação entre a abundância e a distribuição dos diferentes gêneros de Trichoptera. As coletas foram feitas em riachos de 1a a 4 a ordem totalizando 33 pontos de coleta. 25 pedras de tamanho padronizado (18-20 cm de maior diâmetro) foram amostradas com auxílio de um puçá. Análises de ordenação e agrupamento não detectaram nenhuma estruturação da fauna de Trichoptera. Entre os fatores ambientais testados, os escores de integridade ambiental, características físico-químicas e localização do riacho (dentro e fora das unidades de conservação) não foram significativos para explicar a distribuição faunística, enquanto vazão e distância geográfica foram significativos, porém com baixo poder explicativo. Não houve diferença significativa entre a abundância e a riqueza (observada e padronizada) de riachos dentro e fora das unidades de conservação. A ausência de estruturação da fauna pode ter sido provocada pelos picos de chuva registrados antes e durante as coletas, o que poderia ter homogeneizado a fauna, e pelo diferentes graus de impacto antrópico encontrados nos riachos fora dos parques, os quais podem não ter sido fortes o suficiente para provocar diferenças de comunidades. Foi encontrada uma relação positiva entre a abundância relativa e a distribuição de gêneros, corroborando resultados de diversos estudos de macroecologia. / Data on the fauna of immature stages of Trichoptera were gathered for sites within and outside the range of conservation units in Serra de Paranapiacaba, State of São Paulo, aiming to test the effects of environmental variables and degree of environmental integrity on faunistic composition, abundance and richness of larvae. The relationship between abundance and occupancy of Trichoptera genera was also tested. Sampling was conducted in 1st-4th order streams, in a total of 33 stations. 25 stones with a standardized size (18-20cm along the longest axis) were sampled with a net (0,250mm mesh size). Ordination and cluster analysis failed to detect any faunal structure of Trichoptera. Among the environmental variables, the environmental integrity scores, physico-chemical factors and location (inside and outside of the conservation unit) were non significant in explaining the distribution, whereas discharge and geographic distance were significant, although with little explanatory power. No significant differences were found for abundance and richness (observed and standardized) between sites inside and outside of the conservation units. The absence of faunal structure may have resulted from peaks of rain recorded just before and during sampling days, which could have homogeneized the fauna, and due to differences in the degree of anthropic impacts found for sites outside of the conservation units, which may not have been severe enough to cause the differentiation of faunal assemblages. A positive relationship between relative abundance and distribution of genera was found, in accordance with various macroecology studies.
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Sistemática e biogeografia de besouros curculionídeos (Curculionoidea; Coleoptera) associados a figueiras (Ficus; Moracae) / Sistemática e Biogeografia de Besouros Curculionídeos (Curculionoidea; Coleoptera) associados a figueiras (Ficus; Moraceae).Luciano Palmieri Rocha 19 May 2017 (has links)
Among the number of examples of broad radiations of insects on plants, the fig fig wasp system is one of the most remarkable. Although this interaction has frequently been used as a model for studies of mutualism and coevolution, other groups of insects associated with fig trees have received less attention. The weevils (Coleoptera: Curculionidae) associated with figs are one notable example. Being the largest family of animals, weevils achieved great evolutionary success due to their early association with their host plants. Despite few reports in literature, there is strong evidence of the specialization of weevils on figs. The main objective of this thesis was to understand how diversification of Curculionidae took place in fig trees. Previous studies have never addressed the systematics and biogeography of fig weevils under a phylogenetic framework. Therefore, we analyzed the tempo of diversification of Curculionidae lineages that use fig trees as host in order to reconstruct their historical biogeography. To gather information on fig weevils, we collected 325 fruit sets from more than 12% of the total Ficus species, from the Neotropical, Afrotropical and Oriental regions. We also examined seven entomological collections (AMNH, BMNH, INBIO, MNHN, MZUSP, NMNH, SAMC) searching for weevil specimens collected on figs. At least 80 weevil species from five genera (Cetatopus, Omophorus, Carponinus, Curculio, and Indocurculio) were found to be associated with figs. The radiation of curculionids on figs occurred at least three times independently. The tempo of diversification of the crown fig weevils is congruent with the diversification of figs during the Upper-Cretaceous/Lower-Eocene period. We hypothesize that the variation of the sea level and warmer climate in the past had great influence on the evolution of the species. Our results encourage future research on the biology and ecology of these species and will help us to understand the role weevils may have played in the evolution of the fig- fig wasp mutualism. / Um dos mais notáveis exemplos de radiação adaptativa de insetos em classes de plantas é o sistema figueiras - vespas de figo. Embora essa interação tenha sido frequentemente usada como modelo nos estudos de mutualismo e coevolução, outros grupos de insetos relacionados às figueiras têm sido negligenciados. Besouros curculionídeos (Coleoptera: Curculionidae) associados a figueiras representam um desses grupos pouco estudados. Apesar dos relatos escassos na literatura, existem fortes evidências do alto grau de especialização destes besouros às suas plantas hospedeiras. O objetivo geral desta tese foi entender como se deu a diversificação dos curculionídeos sobre as figueiras. Trabalhos anteriores nunca utilizaram uma abordagem filogenética para estudar a sistemática e biogeografia dos curculionídeos de figo e, por isso, este estudo analisa o tempo de diversificação das linhagenes destes besouros para reconstruir sua biogeografia histórica. De modo a obter informações das espécies estudadas, foram coletadas 325 amostras de frutos de cerca de 12% do total de espécies de figueiras das regiões Neotropical, Afrotropical e Oriental. Sete coleções entomológicas (AMNH, BMNH, INBIO, MNHN, MZUSP, NMNH, SAMC) foram vistadas em busca de espécimes de curculionídeos coletados em figo. Pelo menos 80 espécies de cinco gêneros (Cetatopus, Omophorus, Carponinus, Curculio e Indocurculio) foram encontradas. A radiação dos curculionídeos de figo ocorreu independentemente pelo menos três vezes ao longo da história dos Curculionidae. O período de diversificação das linhagenes de curculionídeos de figo é fortemente congruente com o período de diversificação das linhagenes de figueiras durante o fim do Cretáceo/Paleoceno. Acredita-se que fatores como a forte variação no nível dos oceanos e o clima mais quente no passado tiveram grande influência na evolução das espécies. Espera-se que os resultados deste trabalho encorajem estudos futuros sobre a biologia e ecologia dos curculionídeos associados às figueiras e auxilie no entendimento do papel que os curculionídeos possam ter desempenhado na evolução do sistema Ficus - vespas de figo.
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Systematics, taxonomy, and ecology of Neotropical Tachinidae (Diptera) with focus on the tribe PolideiniPerilla López, Juan Manuel 07 June 2023 (has links)
No description available.
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Filogenia molecular e filogeografia de espécies de passeriformes (Aves): história biogeográfica da região neotropical com ênfase na Floresta Atlântica / Molecular Phylogeny and Phylogeography of Species of Passeriformes (Aves): historical Biogeography of the neotropical region with emphasis on Atlantic ForestD\'Horta, Fernando Mendonça 12 February 2009 (has links)
Neste trabalho buscou-se contribuir para a compreensão da história biogeográfica das florestas da Região Neotropical e, em particular, da Floresta Atlântica a partir de estudos de diversificação inter e intra-específica de grupos de aves. Para investigar a história biogeográfica das florestas da região neotropical foram sequenciados genes mitocondriais (citb, ND2 e ND3) e nucleares (Fib7) de 102 amostras das seis espécies que compõem o gênero Sclerurus, S. mexicanus, S. rufigularis, S. guatemalensis, S. caudacutus, S. albigularis e S. scansor. Por outro lado, para o estudo de diversificação intra Floresta Atlântica, foram utilizadas seqüências dos mesmos marcadores de 86 indiíduos de S. scansor e de 57 de A. leucophthalmus. As análises que envolveram o gênero Sclerurus indicam que as seis espécies que o compõem são reciprocamente monofiléticas e que a diversificação do grupo se deu nos últimos 10 Ma. A origem dos padrões associados às áreas de endemismo do neotrópico, por outro lado, tiveram suas origens durante o Plioceno Superior e Pleistoceno. A congruência verificada na distribuição das linhagens associada à incongruência das relações entre linhagens indicam que histórias evolutivas distintas podem ter dado origem a padrões de distribuição de linhagens similares. Verifica-se, ainda, que populações associadas a diferentes regiões da Amazônia apresentam histórias demográficas distintas. Os estudos filogeográficos e de demografia histórica realizados com Scleurus scansor e Automolus leucophthalmus evidenciam histórias distintas associadas à Floresta Atlântica. Apesar do tempo de divergência entre essas espécies e as linhagens irmãs associadas à Amazônia serem similares, em S. scansor foi verificada marcante estruturação filogeográfica, enquanto em A. leucophthalmus não foi identificado qualquer sinal de estruturação. A partir destes resultados são analisadas as hipóteses biogeográficas propostas para explicar a origem dos padrões de diversidade biológica no Neotropico e, em particular, na Floresta Atlântica. / This work attempts to contribute to the understanding of biogeographic history of the neotropical forest domains, based on studies of inter and intra-specific diversification of birds. For this I sequenced mitochondrial (citb, Nd2 and ND3) and nuclear (Fib7) genes of 102 samples from all Sclerurus species, S. mexicanus, S. rufigularis, S. guatemalensis, S. caudacutus, S. albigularis and S. scansor. For the study of diversification intra Atlantic Forest, I used sequences of the same genes from 86 specimens of S. scansor and 57 of A. leucophthalmus. The analyses involving Sclerurus indicated that the six species are reciprocally monophyletic and that the diversification of the group took place in the last 10 Ma. The origin of the patterns associated with neotropical areas of endemism, on the other hand, is recent, during the Upper Pliocene and Pleistocene. The geographic congruence in lineage distribution associated with incongruity of the relationship between them indicate that distinct evolutionary histories may have shaped similar geographic patterns. Besides, populations associated with distinct regions of the Amazon exhibit different demographic histories. The phylogeographic and historical demographic studies performed with Scleurus scansor and Automolus leucophthalmus show different histories associated with Atlantic Forest. Despite of the congruence on divergence times between these species and their Amazonian sisters, in S. scansor a deep phylogeographic structure was identified, while in A. leucophthalmus no population was observed. From these results I analyzed the biogeographic hypotheses proposed to explain the origins of biodiversity patterns associated to the Neotroical Region and, in particular, to the Atlantic Forest.
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Evolução do canto de anúncio nos gêneros Adenomera e Leptodactylus (Anura, Leptodactylidae, Leptodacylinae), com aplicação taxonômica a populações e espécies de Leptodactylinae / Evolution of advertisement call in the genera Adenomera and Leptodactylus (Anura, Leptodactylidae, Leptodacylinae), with taxonomic application to populations and species within LeptodactylinaeTavares, Thiago Ribeiro de Carvalho 27 April 2017 (has links)
As vocalizações em anuros são comumente conspícuas e, até certo ponto, estereotipadas. Nesse grupo, o principal sinal acústico emitido por machos (canto de anúncio) basicamente codifica dois tipos de informação: a atração de fêmeas coespecíficas e o anúncio da posição do macho em atividade de vocalização, especialmente relevante na orientação espacial e delimitação de sítios de vocalização em espécies territoriais. Mais modernamente, com o devenvolvimento de métodos computacionais para incorporar a informação filogenética disponível para um dado grupo de organismos, tornou-se factível explorar tendências evolutivas e testar hipóteses adaptivas para de maneira mais apropriada, levando em conta a dependência filogenética dos táxons. Leptodactylinae é um grupo de anuros Neotropicais rico em espécies (ca. 95 spp.), cuja distribuição está essencialmente compreendida na região Neotropical. Esse táxon apresenta uma diversidade notável de vocalizações. A diversidade de padrões acústicos em Leptodactylidae por si só ressalta o potencial desse táxon representar um bom modelo para estudos focados no entendimento dos padrões e processos macroevolutivos envolvidos na evolução acústica nesse grupo de vertebrados. Nesse estudo, foi realizada uma revisão detalhada dos sinais acústicos reprodutivos, i.e. canto de anúncio, pela primeira vez analisados para esse táxon através de procedimentos e configurações padronizadas e com quantificações automatizadas. Os resultados das análises acústicas foram então associados aos padrões morfológicos na investigação dos padrões de diversidade críptica e reavaliação taxonômica de algumas populações e espécies em Leptodactylinae, além da abordagem comparativa a partir dos resultados obtidos das análises acústicas a fim de explorar as principais tendências e processos evolutivos dos sinais acústicos nesse grupo de anuros. Os resultados revelaram que existem diferentes padrões de diferenciação fenotípica nesse táxon, apontando para a necessidade de revisões taxonômicas em diferentes clados de Leptodactylinae, com resultados contundentes para o clado L. melanonotus (a reavaliação de sinônimos juniores nesse clado indicaram que duas espécies devem ser revalidadas) e Adenomera (reconhecimento de diversidade críptica em A. hylaedactyla com base em evidência acústica). A exploração de métodos comparativos filogenéticos relevou tendências evolutivas interessantes, como, por exemplo, os surgimentos e desaparecimentos recorrentes de estruturas temporais (pulsos) e mudanças acentuadas na estrutura espectral dos sinais acústicos (deslocamento da frequência fundamental em algumas espécies de Adenomera), tais fenômenos sem relação aparente com tamanho corporal ou estrutura dos habitats ocupados por essas espécies. Os dados acústicos oriundos desse estudo se mostraram eficazes nas resoluções taxonômicas em várias espécies de Leptodactylinae. Estudos futuros focando em aspectos da morfologia do aparato vocal, e biomecânica de produção de som, podem informativos acerca do entendimento dos processos envolvidos em distintos padrões acústicos reconhecidos em Leptodactylinae / In anurans, vocalizations are usually conspicuous and stereotyped to some extent. In this group, the major acoustic signal broadcast by males (advertisement signal/call) basically encodes two kinds of information: the attraction of conspecific females and the advertisement of the position of a calling male, maintaining male spacing functioning as an auditory cue in the delimitation of calling sites in territorial species. More recently, the development of computational methods as a means of incorporation of phylogenetic information available for a given group of organisms allowed scientists to explore evolutionary trends and to test for adaptative hypotheses more properly, taking into consideration phylogenetic dependence among taxa. Leptodactylinae is a species-rich taxon (ca. 95 spp.), whose distribution encompasses the Neotropical region. This frog group exhibits a remarkable diversity of vocalizations. This pattern in Leptodactylinae draws attention to the fact that this group could be a promising model organism to studies focused on macroevolutionary patterns and processes involved in the acoustic evolution in this vertebrate group. In the present study, a comprehensive acoustic review was conducted, and it was the first time for this group that the analytical procedures and standardized settings were employed in an automated fashion for the quantification of acoustic traits. The results of the acoustic analysis was then associated with morphological patterns as a means to investigate the patterns of cryptic diversity and taxonomic reappraisals for some populations and species, as well as the application of comparative methods from the results obtained to explore the major evolutionary trends and processes of acoustic traits in this frog group. The results revealed that there are distinctive patterns of phenotypic differentiation present across Leptodactylinae clades, which indicate that taxonomic reassessments are required, particularly in the L. melanonotus clade (revaluation of the junior synonyms showed that two species should be relavalidated) and Adenomera (cryptic diversity was uncovered under the name A. hylaedactyla based on acoustic evidence). The phylogenetic comparative methods recovered interesting evolutionary trends as, for instance, the convergent appearances and losses of structures related to the time domain (pulses) and remarkable changes in the frequency domain (doubling of the fundamental frequency in some species of Adenomera), both phenomena being apparently unrelated to differences in body size or calling habitats. The acoustic data gathered here was efficient in species discrimination and should represent a good line of evidence to address species-level taxonomy in Leptodactylinae. Future research focused on aspects of the vocal apparatus and the mechanisms of sound production might tell us more about the evolutionary processes involved in the distinctive acoustic patterns that were recognized in Leptodactylinae
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Biodiversidade das comunidades endoparasit?rias de peixes forrageiros do reservat?rio de Tr?s Marias, alto rio S?o Francisco, Brasil / Biodiversity of endoparasite communities of forage fishes from the Tr?s Marias Reservoir, Upper S?o Francisco river, BrazilALBUQUERQUE, M?rcia Cavalcanti de 25 January 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-01-25 / CAPES / CNPq / This study aimed to identify the parasite species of eight forage fish species from the Tr?s Marias reservoir; to clarify some aspects about their parasite faunas through the quantification of the parasite parameters (prevalence, intensity and , abundance); to determine diversity indices of each endocommunity; to compare the endoparasite communities using qualitative and quantitative methods; and to investigate which biotic and abiotic factors were relevant in the endoparasite communities structuration. A total of 492 fish (Characiformes, Characidae) were collected in the Tr?s Marias reservoir (18?12'59"S, 45?17'34"W), upper S?o Francisco river, State of Minas Gerais, between May 2003 and July 2010. Of these total, 44 specimens were of Astyanax bimaculatus (Linnaeus, 1758), 76 of Astyanax fasciatus (Cuvier, 1819), 70 of Bryconops affinis (G?nther, 1864), 64 of Hemigrammus marginatus Ellis, 1911, 41 of Moenkausia costae (Steindachner, 1907), 51 of Orthospinus franciscensis (Eigenmann, 1914), 63 of Tetragonopterus chalceus Spix & Agassiz, 1829 and 83 of Triportheus guentheri (Garman, 1890). Were found 21 endoparasite species among the eight communities ? Digenea: Creptotrema creptotrema Travassos, Artigas & Pereira, 1928, Magnivitellinum simplex Kloss, 1966, unidentified species of Digenea (adults), Austrodiplostomum sp. and Clinostomum marginatum (Rudolphi, 1819) Braun, 1899 (metacercariaes); Eucestoda: unidentified species of Cyclophyllidea (metacestode) and unidentified species of Proteocephalidae (plerocercoids); Nematoda: Procamallanus saofranciscencis Moreira, Oliveira & Costa, 1994, Rhabdochona spA., Spinitectus rodolphiheringi Vaz & Pereira, 1934 (adults), Contracaecum sp., Hysterothylacium sp., Goezia sp., unidentified species of Cucullanidae, Procamallanus sp., Procamallanus (Spirocamallanus) sp., Spiroxys sp., Rhabdochona sp. and Cystidicoloides fischeri (Travassos, Artigas & Pereira, 1928) (larvas); Myxozoa: Henneguya sp. (plasmodium with spores); and Protozoa (Apicomplexa): Calyptospora sp. (cysts with oocysts). Seven of these species were more frequent between the eight hosts: plerocercoids of Proteocephalidae, P. saofranciscencis, Contracaecum sp., Hysterothylacium sp., Spiroxys sp., Rhabdochona sp. and Henneguya sp.. The A. bimaculatus was the richest (16 endoparasite species) and the T. guentheri was the most diverse (Shannon-Wiener = 0,86) communiity. The H. marginatus was the less rich (nine taxa) and diverse community (Shannon-Wiener = 0,03). The most qualitative similarity was between the A. bimaculatus and A. fasciatus communities, while the most quantitative similarity occurred between the H. marginatus and O. franciscensis communities. The structure of parasite communities was mainly influenced by five factors: biotic ? fish species, size and diet; and abiotic: water electrical conductivity and fish collection period. However, the fish diet seems to be the major determining composition of the parasite communities of forage fish from the Tr?s Marias reservoir. / Este trabalho teve como objetivos identificar as esp?cies de parasitos de oito esp?cies de peixes forrageiros do reservat?rio de Tr?s Marias; esclarecer alguns aspectos sobre suas faunas parasit?rias atrav?s da quantifica??o dos par?metros parasit?rios (preval?ncia, intensidade e abund?ncia); determinar ?ndices de diversidade de cada endocomunidade; comparar quantitativa e qualitativamente as comunidades endoparasit?rias desses oito hospedeiros; e investigar quais fatores bi?ticos e abi?ticos foram relevantes na estrutura??o das comunidades endoparasit?rias. Um total de 492 peixes (Characiformes, Characidae) foram coletados no reservat?rio de Tr?s Marias (18?12'59"S, 45?17'34"W), alto rio S?o Francisco, Minas Gerais, entre maio de 2003 e julho 2010. Desse total, 44 esp?cimes eram de Astyanax bimaculatus (Linnaeus, 1758), 76 de Astyanax fasciatus (Cuvier, 1819), 70 de Bryconops affinis (G?nther, 1864), 64 de Hemigrammus marginatus Ellis, 1911, 41 de Moenkausia costae (Steindachner, 1907), 51 de Orthospinus franciscensis (Eigenmann, 1914), 63 de Tetragonopterus chalceus Spix & Agassiz, 1829 e 83 de Triportheus guentheri (Garman, 1890). Foram encontradas 21 esp?cies de endoparasitos dentre as oito comunidades - Digenea: Creptotrema creptotrema Travassos, Artigas & Pereira, 1928, Magnivitellinum simplex Kloss, 1966, uma esp?cie n?o identificada (adultos), Austrodiplostomum sp. e Clinostomum marginatum (Rudolphi, 1819) Braun, 1899 (metacerc?rias); Eucestoda: esp?cie n?o identificada de Cyclophyllidea (metacestoide) e esp?cie n?o identificada de Proteocephalidae (plerocercoides); Nematoda: Procamallanus saofranciscencis Moreira, Oliveira & Costa, 1994, Rhabdochona spA., Spinitectus rodolphiheringi Vaz & Pereira, 1934 (adultos), Contracaecum sp., Hysterothylacium sp., Goezia sp., esp?cie n?o identificada de Cucullanidae, Procamallanus sp., Procamallanus (Spirocamallanus) sp., Spiroxys sp., Rhabdochona sp. e Cystidicoloides fischeri (Travassos, Artigas & Pereira, 1928) (larvas); Myxozoa: Henneguya sp. (plasm?dio com esporos); e Protozoa (Apicomplexa): Calyptospora sp. (cistos com oocistos). Sete dessas foram mais frequentes dentre os oito hospedeiros: plerocercoides de Proteocephalidae, P. saofranciscencis, Contracaecum sp., Hysterothylacium sp., Spiroxys sp., Rhabdochona sp. e Henneguya sp.. A comunidade de A. bimaculatus foi a mais rica (16 esp?cies de endoparasitos) e a de T. guentheri a mais diversa (Shannon-Wiener = 0,86). A comunidade de H. marginatus foi a menos rica (nove t?xons) e diversa (Shannon-Wiener = 0,03). A maior similaridade qualitativa foi entre as comunidades de A. bimaculatus e A. fasciatus, enquanto que a maior similaridade quantitativa se deu entre as comunidades de H. marginatus e O. franciscensis. A estrutura das comunidades parasit?rias foi influenciada principalmente por cinco fatores: bi?ticos ? esp?cie, comprimento e dieta dos peixes; e abi?ticos ? condutividade el?trica da ?gua e ?poca de coleta dos peixes. Contudo, a dieta dos peixes pareceu ser o maior determinante da composi??o das comunidades endoparasit?rias dos forrageiros do reservat?rio de Tr?s Marias.
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