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Hybridization and Speciation in Common and Black-Tufted Marmosets (Callithrix jacchus and C. penicillata)

January 2013 (has links)
abstract: As an evolutionary force, hybridization outcomes include introgression, admixture, speciation, and reproductive isolation. While hybridization has been studied in several primates, the marmoset genus Callithrix is an important, but little studied example of Neotropical hybridization. Varying degrees of reproductive isolation exist between Callithrix species, and hybridization occurs at species borders or regions containing introduced and native species. Interbreeding between Callithrix species carries important implications for biodiversity and genetic integrity within the genus. However, species origins and levels of genetic admixture in marmoset hybrid zones are generally unknown, and few population genetic studies of individual Callithrix species exist. Using the mitochondrial control region and 44 microsatellite markers, this work explored the genetic diversity and species origins of two C. penicillata and C. jacchus hybrid zones, as well as genetic diversity and divergence in the parental species. Both marker types showed that C. penicillata is more genetically diverse than C. jacchus. Based on mtDNA, C. jacchus seems to have experienced a past population expansion and C. penicillata evolved under constant population size. The data revealed the existence of a previously undocumented natural hybrid zone along the São Francisco River in NE Brazil and confirmed species origins of an anthropogenic zone in Rio de Janeiro state. The data also showed much lower levels of admixture and genetic diversity within the natural hybrid zone than in the anthropogenic zone. Further, the data suggested that the São Francisco River is an important geographic barrier to gene flow in the natural hybrid zone. On the other hand, admixture patterns within the anthropogenic hybrid zone suggested collapse of reproductive barriers, and the formation of a hybrid marmoset swarm. Thus, this work suggested different evolutionary dynamics in anthropogenic vs. natural animal hybrid zones. Restriction Associated DNA sequencing (RADseq) identified a large number of single nucleotide polymorphisms within C. jacchus and C. penicillata genomes. These preliminary data were used to measure intraspecific genomic diversity and interspecific divergence. In the future, RADseq will be used to study genus-wide diversity of Callithrix species, examine past and present marmoset demographic history, and applied to the evolutionary study of marmoset hybridization. / Dissertation/Thesis / Ph.D. Biology 2013
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Ecologia alimentar do cuxiu-de-nariz-vermelho Chiropotes albinasus (Primates : Pitheciidae) na Floresta Nacional do Tapajos, Para / Feeding ecology of the red-nosed saki monkey Chiropotes albinasus (Primates : Pitheciidae) at Tapajos National Forest, Para State

Pinto, Liliam Patricia 29 January 2008 (has links)
Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T19:06:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pinto_LiliamPatricia_D.pdf: 1402160 bytes, checksum: 5781b9e9527706d97db9acae22b9a353 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A ecologia de um grupo cuxiú-de-nariz-vermelho (Chiropotes albinasus) foi estudada entre agosto de 2004 e janeiro de 2006 em uma mata primária na Floresta Nacional do Tapajós, Pará. Para analisar a disponibilidade de itens e preferências por alimentos, foi realizado em 16 parcelas de 25 x 25 m (1 ha) um levantamento florístico e um monitoramento fenológico na área de estudo. A dieta e o padrão de atividades diárias de C. albinasus foram investigados pelo método de varredura instantânea. Esta pesquisa está entre os estudos de maior esforço amostral já realizados com o gênero Chiropotes. Durante 38 dias completos distribuídos em onze meses, os cuxiús se alimentaram de 125 espécies de plantas pertencentes a 38 famílias (n = 5.197 registros de alimentação). Brosimum parinarioides (Moraceae) foi a fonte de alimentos mais utilizada (9,5% dos registros), e teve um alto índice de seletividade. Sementes imaturas foram os itens mais consumidos (48,2%), seguidas de polpa de frutos maduros (39,2%) e sementes maduras (6,0%). A maior parte do tempo (n = 22.373 registros) foi gasta em viagem (36,3%) e repouso (27,5%). As atividades de alimentação somaram 23,8% dos registros e a socialização 8,8%. O grupo teve um tamanho máximo de 56 membros e apresentou uma dinâmica de agrupamento muito variável. Os subgrupos podiam permanecer fissionados por algumas horas ou por vários dias, um padrão diferente do observado em outros estudos com cuxiús. A área de vida de 1.000 ha é uma das maiores já registradas para primatas neotropicais. A desigualdade na distribuição espacial e temporal dos recursos alimentares afeta a ecologia alimentar dos cuxiús-de-nariz-vermelho, que selecionaram espécies mais produtivas e ajustaram seus padrões de forrageio de acordo a oferta de alimentos / Abstract: The ecology of a group of red-nosed bearded sakis (Chiropotes albinasus) was studied between August 2004 and January 2006 in continuous primary forest at the Floresta Nacional do Tapajós, Pará. To investigate food availability and food preferences, tree composition, forest structure and phenology were measured in 16 plots of 25 x 25 m, totaling 1 ha. C. albinasus diet and activity budgets were recorded by instantaneous scan method. This study represents the largest study of Chiropotes in continuous forest. During 38 complete observation days over eleven months, bearded sakis fed on 125 plant species from 38 families (n = 5,197 feeding records). Brosimum parinarioides (Moraceae) was the most used food source (9.5% of records), and has a high selectivity index. Immature seeds were the most consumed items (48.2%), followed by ripe fruit pulp (39.2%) and mature seeds (6.0%). Most time (n = 22,373 activity records) was spent in traveling (36.3%) and resting (27.5%). Feeding represented 23.8% of the records and social activities 8.8%. The group with up to 56 individuals could subdivide in subgroups of variable sizes, which could remain apart for some hours or up to several days. This grouping dynamic differed from other studied bearded sakis. Home range was estimated in more than 1000 ha, one of the largest recorded for a Neotropical primate. Food resource heterogeneity in space and time influenced feeding ecology of the red-nosed bearded saki, which showed preference for more productive plant species and adjusted their foraging patterns to food availability / Doutorado / Doutor em Ecologia
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Ocupação de fragmentos florestais e uso da matriz por primatas na paisagem urbanizada de Goiânia, Goiás / Forest fragments occupancy and matrix use by primates in the urbanized landscape of Goiânia, Goiás

Grande, Thallita Oliveira de 17 April 2012 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-05-05T17:10:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thallita Oliveira de Grande - 2012.pdf: 3848580 bytes, checksum: ec68aa19c0e1c983173e42c895fecfaa (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-05-05T17:11:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thallita Oliveira de Grande - 2012.pdf: 3848580 bytes, checksum: ec68aa19c0e1c983173e42c895fecfaa (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-05T17:11:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thallita Oliveira de Grande - 2012.pdf: 3848580 bytes, checksum: ec68aa19c0e1c983173e42c895fecfaa (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2012-04-17 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / As atividades humanas alteram as florestas, principais habitats dos primatas, modificando-as em escala de paisagem e em escala de fragmento. Tais alterações não afetam igualmente todas as espécies, que respondem singularmente às mudanças. Investigar fatores ambientais determinantes da probabilidade de ocorrência dos primatas em fragmentos florestais fundamenta a escolha de áreas prioritárias para a conservação deste grupo. Neste trabalho investigamos atributos da estrutura da vegetação de fragmentos florestais urbanos e da composição da paisagem que influenciam a ocupação dos fragmentos por primatas (Alouatta caraya, Sapajus libidinosus e Callithrix penicillata) em Goiânia, Goiás. Realizamos o levantamento das populações de primatas com o uso de playbacks, amostramos a heterogeneidade estrutural do interior dos fragmentos florestais, mapeamos a matriz e relacionamos estas variáveis. Encontramos que C. penicillata é altamente prevalente em fragmentos urbanos. Somente características da paisagem circundante aos fragmentos influenciaram sua ocupação por S. libidinosus e A. caraya, como a porcentagem de áreas de pasto e fragmentos florestais, e a porcentagem de áreas de pasto e cursos d’água, respectivamente. A estrutura da vegetação dos fragmentos não exerceu efeito sobre a chance de ocupação de fragmentos por macacos-prego e bugios-pretos. Nossos resultados indicam a importância da composição da paisagem para a efetiva conservação de primatas, principalmente da presença de manchas florestais na paisagem, cursos d’água e matrizes minimamente permeáveis. Os primatas que ocorrem no Cerrado necessitam de estudos acerca de sua prosperidade na paisagem fragmentada, por meio de investigações da densidade e viabilidade das populações. A fragmentação e perda de área de florestas resultam no isolamento, redução do tamanho e empobrecimento de manchas florestais habitadas por primatas. Estas conseqüências negativas podem ser amenizadas pelo movimento dos animais entre os fragmentos, por meio do uso da matriz, algo pouco conhecido. Neste trabalho investigamos os padrões gerais do uso de elementos da matriz pelos primatas do Cerrado (Alouatta caraya, Sapajus libidinosus e Callithrix penicillata) em uma paisagem urbana fragmentada. Buscamos saber se o uso da matriz é relacionado com o tipo de matriz disponível e com o grau de distúrbio do fragmento. Com entrevistas semi-estruturadas, entrevistamos pessoas situadas nas adjacências dos fragmentos florestais habitados pelos primatas em Goiânia-GO. Encontramos que a espécie mais visualizada utilizando a matriz foi C. penicillata, seguida por S. libidinosus e A. caraya. Os tipos de matriz mais utilizados foram o ambiente urbano e pasto. As principais atividades desempenhadas na matriz foram o forrageio (com consumo predominante de manga) e o deslocamento. Em geral, o uso dos tipos de matriz não esteve correlacionado com sua disponibilidade na paisagem. O uso da matriz esteve negativamente relacionado com a conectividade entre as manchas florestais. Nossos resultados segurem que as três espécies utilizam os elementos da matriz, refletindo sua plasticidade em superar os limites impostos pela paisagem fragmentada. Isto indica a necessidade da inclusão da permeabilidade da matriz em abordagens para o manejo do ambiente para os primatas. / As atividades humanas alteram as florestas, principais habitats dos primatas, modificando-as em escala de paisagem e em escala de fragmento. Tais alterações não afetam igualmente todas as espécies, que respondem singularmente às mudanças. Investigar fatores ambientais determinantes da probabilidade de ocorrência dos primatas em fragmentos florestais fundamenta a escolha de áreas prioritárias para a conservação deste grupo. Neste trabalho investigamos atributos da estrutura da vegetação de fragmentos florestais urbanos e da composição da paisagem que influenciam a ocupação dos fragmentos por primatas (Alouatta caraya, Sapajus libidinosus e Callithrix penicillata) em Goiânia, Goiás. Realizamos o levantamento das populações de primatas com o uso de playbacks, amostramos a heterogeneidade estrutural do interior dos fragmentos florestais, mapeamos a matriz e relacionamos estas variáveis. Encontramos que C. penicillata é altamente prevalente em fragmentos urbanos. Somente características da paisagem circundante aos fragmentos influenciaram sua ocupação por S. libidinosus e A. caraya, como a porcentagem de áreas de pasto e fragmentos florestais, e a porcentagem de áreas de pasto e cursos d’água, respectivamente. A estrutura da vegetação dos fragmentos não exerceu efeito sobre a chance de ocupação de fragmentos por macacos-prego e bugios-pretos. Nossos resultados indicam a importância da composição da paisagem para a efetiva conservação de primatas, principalmente da presença de manchas florestais na paisagem, cursos d’água e matrizes minimamente permeáveis. Os primatas que ocorrem no Cerrado necessitam de estudos acerca de sua prosperidade na paisagem fragmentada, por meio de investigações da densidade e viabilidade das populações. A fragmentação e perda de área de florestas resultam no isolamento, redução do tamanho e empobrecimento de manchas florestais habitadas por primatas. Estas conseqüências negativas podem ser amenizadas pelo movimento dos animais entre os fragmentos, por meio do uso da matriz, algo pouco conhecido. Neste trabalho investigamos os padrões gerais do uso de elementos da matriz pelos primatas do Cerrado (Alouatta caraya, Sapajus libidinosus e Callithrix penicillata) em uma paisagem urbana fragmentada. Buscamos saber se o uso da matriz é relacionado com o tipo de matriz disponível e com o grau de distúrbio do fragmento. Com entrevistas semi-estruturadas, entrevistamos pessoas situadas nas adjacências dos fragmentos florestais habitados pelos primatas em Goiânia-GO. Encontramos que a espécie mais visualizada utilizando a matriz foi C. penicillata, seguida por S. libidinosus e A. caraya. Os tipos de matriz mais utilizados foram o ambiente urbano e pasto. As principais atividades desempenhadas na matriz foram o forrageio (com consumo predominante de manga) e o deslocamento. Em geral, o uso dos tipos de matriz não esteve correlacionado com sua disponibilidade na paisagem. O uso da matriz esteve negativamente relacionado com a conectividade entre as manchas florestais. Nossos resultados segurem que as três espécies utilizam os elementos da matriz, refletindo sua plasticidade em superar os limites impostos pela paisagem fragmentada. Isto indica a necessidade da inclusão da permeabilidade da matriz em abordagens para o manejo do ambiente para os primatas.
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Tuberculose em primatas não humanos mantidos em cativeiro: uma revisão / Tuberculosis in nonhuman primates in captivity: a review

Tatiana Almeida Valvassoura 06 February 2012 (has links)
A Tuberculose vem acometendo animais selvagens desde o surgimento das primeiras coleções organizadas. Particularmente, macacos são altamente suscetíveis as micobactérias, gerando grandes perdas econômicas para as instituições, além do risco de transmissão para o homem e animais. As principais micobatérias, que causam a doença em primatas em cativeiro, são o Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium bovis. Acredita-se que primatas do "novo mundo" são menos suscetíveis do que os do "velho mundo", entretanto observa-se que tuberculose tem sido documentada em várias espécies. A principal forma de transmissão é através de aerossóis contendo os bacilos. A doença pode evoluir para a forma ativa ou latente, dependendo do estado imunológico do animal. Os sinais clínicos podem ser insidiosos, com somente uma alteração comportamental, seguido por anorexia e letargia, alterações respiratórias ou simplesmente o animal pode aparecer morto no recinto. O diagnóstico clínico é difícil e problemático, sendo que muitas vezes as lesões consistentes com a doença só são observadas na necropsia. Por isso o uso de outras ferramentas de diagnóstico é importante, como o teste de tuberculinização, cultivo e isolamento bacteriano, que são os mais usados na rotina das instituições, e os exames radiográficos do tórax e abdômen, testes moleculares e sorológicos. Toda instituição que mantém primatas em cativeiro deveriam possuir programas de prevenção para evitar a entrada da micobactéria dentro da coleção, principalmente ao se adquirir novos animais. Por isso, o emprego de medidas de biossegurança é essencial para diminuir o risco de doenças para o homem e para os animais dentro das instituições. Essas medidas consistem na implantação de uma série de procedimentos e normas operacionais rígidas, como programas de quarentena, programas de saúde para os funcionários e formação de equipe capacitada e treinada. / Tuberculosis has been affecting wild animals since the arising of the first organized collections. Specially, monkeys are highly susceptible to mycobacteria, which cause great economic losses in the institutions, beyond the risk of transmission to man and animals. The main species of mycobacteria, that cause disease in nonhuman primates in captivity, are Mycobacerium tuberculosis and Mycobacterium bovis. It is believed that nonhuman primates from the "new world" are less susceptible than the "old world" ones, however it is noted that tuberculosis has been continually documented in several species. Aerosols that contain infectious bacilli are the main transmission mode. The disease can progress to active or latent form, which depends on the animal's immune status. The clinical signs can be insidious, with only a behavior change, followed by anorexia and lethargy, respiratory alteration or the animal can appear dead in the room. The clinical diagnostic is difficult and problematic, and often lesions are only observed at necropsy. Therefore, the use of other diagnostic tools is important, as the tuberculin skin test, bacterial culture and isolation, that are most used during the routine of institutions, and radiography of the chest and abdomen, molecular and serological tests. Every institution that maintains nonhuman primates in captivity should have prevention programs to avoid the entry of mycobacteria inside of collection, mainly when new animals are acquired. Thus, the use of biosecurity measures is essential to reduce the risk of disease in humans and animals within institutions. These measures consist in implanting series of rigid procedures and operational standards, like quarantine programs, health programs for employees and formation of the qualified team.
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Análise comparativa dos aspectos da ultraestrutura do espermatozoide de Mico-Leão-de-Cara-Dourada (Leontopithecus chrysomelas) e Bugio (Alouatta caraya e Alouatta guariba clamitans) / Ultrastructure characteristics comparative analysis of spermatozoa from Golden-headed Lion Tamarin (Leontopithecus chrysomelas) and Howler Monkey (Alouatta caraya and Alouatta guariba clamitans)

Ana Paula Grabner 13 June 2016 (has links)
Os primatas neotropicais, ou primatas do novo mundo, são pertencentes a um grupo diverso e variado de animais, com características anatômicas, comportamentais e taxonômicas próprias, que os diferem dos primatas do velho mundo. Estima-se que representem 31% dos primatas não-humanos do planeta. Têm sofrido com as altas taxas de crescimento populacional e perturbação antrópica resultante do desflorestamento, agricultura e criação de gado. Com o intuito de reverter esta situação e maximizar o potencial reprodutivo das espécies, o desenvolvimento de biotecnologias associadas à reprodução tem sido amplamente justificado nos dias de hoje, por representarem importantes ferramentas reprodutivas, contribuindo para a preservação da biodiversidade e manutenção da diversidade genética. Assim, o objetivo do presente estudo foi padronizar a colheita de sêmen de Alouatta guariba clamitans por eletroejaculação por via retal com posterior análise do sêmen fresco, procedimentos nunca descritos para a espécie, e adaptar o método de preparo de sêmen de Leontopithecus chrysomelas, Alouatta caraya e Alouatta guariba clamitans para microscopia eletrônica de transmissão, permitindo a comparação da ultraestrutura dos espermatozoides das três espécies e apresentando resultados também inéditos na literatura científica. Para este estudo, foram utilizados quatro exemplares de L. chrysomelas, dois exemplares de A. caraya e dois exemplares de A.g. clamitans, machos adultos mantidos em cativeiro. L. chrysomelas tiveram o sêmen colhido por vibroestimulação peniana, e A. caraya e A.g. clamitans foram submetidos à eletroejaculação por via retal. Após a obtenção dos ejaculados, o sêmen foi avaliado quanto ao volume, pH, concentração, motilidade, integridade de membrana plasmática, integridade de membrana acrossomal e morfologia, e posteriormente preparado para microscopia eletrônica de transmissão. A análise dos 12 espermatozoides das três espécies estudadas revelou que todos apresentam os componentes básicos descritos para o espermatozoide humano cabeça, colo e cauda, formada pelas peças intermediária, principal e terminal com variações na forma e tamanho de cada componente. As diferenças mais significativas encontradas entre os espermatozoides comparados foram extensão de acrossomo, comprimento, largura e organização de peça intermediária. O presente estudo atingiu os objetivos propostos, apresentando resultados inéditos na literatura científica / The neotropical primates, also known as primates of the new world, are a diverse and varied group of animals, with unique anatomical and taxonomic characteristics, as well a unique behaviour, that distinguish those from the old world primates. It is estimated that these present 31% of the non-human primate population of the planet. High taxes of populational growth and anthropological disturbance have been undergoing due to deforestation, agriculture and cattle farms. In order to revert this situation and maximize the reproductive potential of the species, the development of biotechnologies associated to the reproduction are widely justified nowadays, for representing important reproductive tools, contributing to the preservation of the biodiversity and maintenance of genetic diversity. Hence, the purpose of this study was to collect Alouatta guariba clamitans semen by rectal electroejaculation then analyze the fresh semen, procedures never before described for the species, and adapt the preparation method of Leontopithecus chrysomelas, Alouatta caraya and Alouatta guariba clamitans semen for electron transmission microscope, allowing the comparison of the spermatozoa ultrastructure from the three species and also presenting new results to the scientific literature. For this study, it was used four specimens of L. chrysomelas, two specimens of A. caraya and two specimens of A.g. clamitans, adult males kept in captivity. L. chrysomelas had the semen taken by penine vibratory stimulation, and A. caraya and A.g. clamitans were submitted to rectal electroejaculation. After the semen was obtained, it was evaluated regarding the volume, pH, concentration, motility, sperm membrane integrity, acrosome integrity and morphology, and then prepared for electron transmission microscopy. The analysis of the spermatozoa of the three studied species revealed that all present the basic components described for the human spermatozoa - head, neck region and tail, formed by middle, principal and terminal pieces - with variations in 14 shape and size of each component. The most significant differences found between the compared spermatozoa were the acrosome extension and middle piece length, thickness and organization. The present study attained the proposed goals, presenting unprecedented results for the scientific literature
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Extraction de régularités en situation d'apprentissage de séquences : étude chez l'humain et le primate non-humain / Regularity extraction in sequence learning : a comparative study between humans and non-human primates

Minier-Munding, Laure 13 November 2015 (has links)
Chez les humains et les animaux, l’exposition répétée à une séquence de stimulus conduit à la création de représentations mentales isomorphes aux régularités statistiques de cette séquence. Cette thèse étudie la dynamique avec laquelle les unités et sous-unités sont extraites, s’influencent et s’organisent lors de l’apprentissage séquentiel chez l’humain et le primate non-humain (babouin Papio papio). Nos résultats montrent que lors de l’apprentissage d’une séquence régulière ABC, la sous-unité finale BC est apprise plus rapidement que la sous-unité initiale AB chez les humains comme les primates non- humains. Avec une séquence plus longue ABCD, cet effet ne s’étend pas au-delà des deux termes précédents celui à prédire lors des 2000 essais d’apprentissage. Une seconde étude montre que les humains sont capables d’utiliser la prédictibilité des éléments à différents niveaux de complexité, alors que les singes sont limités aux dépendances locales. Enfin notre dernière étude montre que les humains comme les singes ne bénéficient pas d’un contexte d’homogénéité de longueurs des unités par rapport à un contexte d’hétérogénéité de longueurs des unités. Ensemble, ces études montrent des continuités et discontinuités entre les primates humains et non-humains dans l’extraction, l’influence et l’organisation des unités de différents niveaux. Elles donnent des informations d’une finesse nécessaires pour contraindre les différents modèles computationnels qui ont été proposés pour décrire l’apprentissage de régularités. / In humans and animals, the repeated exposure to a sequence of stimulus creates mental representations which have the same statistical regularities as that sequence. This thesis investigates the dynamics, influence and organization of units and sub-units during sequence learning, in humans and non-human primates (Guinea baboons, Papio papio).Our results show an advantage of the final sub- unit BC over the initial sub-unit AB during learning of sequences with the form ABC in both humans and baboons. We interpret this effect as resulting from the richer contextual information AB predicting C compared to the single term A predicting B. This effect is limited to the 2 previous terms before the one term to be predicted, across 2000 learning trials. A second finding shows that in learning sequences of 3 units (i.e. ABC, DEF, HGI), humans are able to use the predictability of elements at both local (within units) and global (within sequence) levels, whereas monkeys are limited to local dependencies. A third section investigates the extraction of regularities in homogeneous (i.e., units of the same length) and heterogeneous contexts (units of different lengths). Results in humans and monkeys showed no advantage for either of these contexts.Considered together, our studies show continuities and discontinuities between human and non-human primates in the extraction, influence and organization of units of different levels. This fine-grained level of information is necessary to constrain the computational models proposed to describe the mechanisms underlying regularity extraction.
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Perspectivas sobre o reconhecimento de padrões de modularidade e suas implicações para a evolução de morfologias complexas / On the recognition of modularity patterns and its implications for the evolution of morphological systems

Guilherme Garcia 07 April 2016 (has links)
A modularidade é uma propriedade característica que sistemas biológicos exibem em relação à distribuição de interações entre seus elementos constituintes; neste contexto, um módulo é um subconjunto de elementos que interagem entre si mais do que com outros subconjuntos. Em relação aos sistemas morfológicos, tais propriedades referem-se geralmente à estrutura do componente linear do mapa genótipo/fenótipo; no entanto, as interações genéticas, ontogenéticas e funcionais que produzem fenótipos são descritas de forma adequada através de dinâmicas não-lineares, e uma apreciação completa da complexidade destas interações é necessária para a compreensão das propriedades variacionais do fenótipo. Ademais, dados avanços metodológicos na área da morfometria, é possível escolher diferentes maneiras de representar a variação morfológica, e as diferenças entre as representações podem impactar inferências feitas sobre estas propriedades variacionais. A presente tese tem como objetivo explorar a relação entre representações morfométricas e a caracterização das propriedades variacionais, focada na análise comparativa de tais propriedades em uma escala macroevolutiva; Primatas Antropóides são utilizados como modelo, dada a disponibilidade de uma grande base de dados de mensurações cranianas destes organismo. Esta relação foi avaliada sob três perspectivas diferentes. Em primeiro lugar, estima-se taxas de erro associadas aos testes de hipótese que descrevem padrões de modularidade, relacionadas com três representações morfométricas distintas; tal avaliação é também associada à exploração de um subconjunto da base de dados utilizada aqui, levando-se em consideração a dinâmica de interações ontogenéticas que produzem o crânio dos Antropóides. Os resultados deste capítulo implicam que uma dessas representações, resíduos de Procrustes, não são capazes de detectar padrões de modularidade neste contexto, considerando suas propriedades matemáticas específicas. Outras duas representações, distâncias entre marcos anatômicos e variáveis locais de forma, produzem resultados semelhantes, que estão diretamente associados à dinâmica de desenvolvimento, e as diferenças que elas apresentam são consistentes com suas diferenças principais; taxas de erro para os testes sobre as duas representações também são aceitáveis. O próximo capítulo trata da comparação entre estas duas representações no que diz respeito a estas diferentes propriedades, focado em estimar relações alométricas associadas às variáveis locais de forma e a relação entre estas estimativas e os padrões de modularidade estimados para distâncias entre marcos anatômicos. Os resultados encontrados enfatizam que os padrões de modularidade observados em distâncias entre marcos são consequência da alometria; linhagens como Homo e Gorilla, que apresentam padrões distintos de modularidade para as distâncias entre marcos estão associados a mudanças substanciais nas relações alométricas dos caracteres cranianos. O último capítulo explora a estrutura filogenética de mudanças nas propriedades variacionais fenotípicas na diversificação de Anthropoidea, considerando apenas variáveis de forma locais, uma vez que este capítulo também visa reforçar os resultados anteriores obtidos a partir de distâncias entre marcos, considerando-se um tipo diferente de representação morfométrica. Este capítulo muda o foco de testes a respeito de padrões de modularidade definidos a priori em direção a estimar a incerteza relacionada à estrutura de matrizes de covariância, decomposta sobre a filogenia de Anthropoidea. Os resultados obtidos demonstram que as mudanças na estrutura de covariância nesta linhagem são localizadas nas mesmas regiões do crânio ao longo de toda a história evolutiva do grupo, enquanto outras regiões mantêm associações estáveis. Assim, quando se considera as diferentes propriedades de representações morfométricas cuidadosamente, inferências feitas a partir de tais representações sobre propriedades variacionais são de fato compatíveis / Modularity is a characteristic property biological systems exhibit regarding the distribution of interactions between their composing elements; in this context, a module is a subset of elements which interact more among themselves than with other subsets. Regarding morphological systems, such property usually refers to the structure of the linear component of the genotype/phenotype map; however, the genetic, developmental, and functional interactions that produce phenotypes are often best described by non-linear dynamics, and a full appreciation of the complexity of such interactions is necessary for understanding phenotypic variational properties. Furthermore, given methodological advances in the field of morphometrics, one may choose different ways to represent morphological variation, and differences between representations may impact inferences made regarding variational properties. The present dissertation aims at exploring the relationship between morphometric representations and the characterization of variational properties, focusing on the comparative analysis of such properties on a macroevolutionary timeframe; Anthropoid Primates are used as a model lineage, given the availability of a large database of skull measurements. This relationship was evaluated under three different perspectives. First, an estimation of the error rates associated with tests for hypothesis that describe modularity patterns related to three different morphometric representations; such evaluation is also associated with an exploration of a subset of the database used here, considering the dynamical properties of developmental interactions that produce the Anthropoid skull. The results of this chapter imply that one of such representations, Procrustes residuals, fails to capture modularity patterns in this setting, considering its particular mathematical underpinnings. Other two representations, interlandmark distances and local shape variables, produce similar results which are directly associated with developmental dynamics, and the differences they exhibit are consistent with their different properties; error rates for tests over both representations are also acceptable. The next chapter deals with comparing these two representations with respect to these different properties, focusing on estimating allometric relationships over local shape variables and the relationship between such estimates and modularity patterns estimated for interlandmark distances. The results found stress out that modularity patterns observed in interlandmark distances are a consequence of allometry; lineages such as Homo and Gorilla, which exhibit distinct modularity patterns in interlandmark distances are associated with substantial changes in allometric relationships for skull traits. The last chapter explores the phylogenetic structure of changes in phenotypic variational properties across Anthropoid diversification, considering local shape variables alone, since this chapter also aims at reinforcing previous results obtained from interlandmark distances, considering a different type of morphometric representation. This chapter shifts the focus from testing a priori-defined modularity patterns to estimating the uncertainty related to covariance matrix structure decomposed over the Anthropoid phylogeny. The results obtained demonstrate that changes in covariance structure on this lineage are localized in the same skull regions across the entire evolutionary history of Anthropoidea, while other regions maintain stable associations. Thus, when one considers the different properties of morphometric representations carefully, inferences made from such representations regarding variational properties are in fact compatible
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Conectando florestas e primatas: as mudanças no uso da terra para a conservação do muriqui-do-norte (Brachyteles hypoxanthus Kuhl, 1820) em propriedades rurais / Connecting primates and forests: land use changes to conserve the spider monkey (Brachyteles hypoxanthus Kuhl, 1820) in rural properties

Maria Otávia Silva Crepaldi 05 October 2015 (has links)
As mudanças no uso e na cobertura da terra, principalmente em áreas florestais, causam alterações ambientais em diversas escalas. Uma das suas consequências negativas é a fragmentação de habitats, que causa desequilíbrio nos diversos ecossistemas e perda de espécies e populações. Investigar os fatores que influenciam o aumento da cobertura florestal e as suas consequências para a conservação da biodiversidade é fundamental para o planejamento de políticas públicas ambientais, principalmente em regiões de ocorrência de espécies ameaçadas de extinção. No caso do muriqui-do-norte (Brachyteles hypoxanthus), um primata neotropical criticamente em perigo de extinção, a existência de conectividade entre fragmentos florestais remanescentes é um dos maiores limites para a sua conservação, pois mudanças no uso e na cobertura da terra serão necessárias. A conservação desse primata requer estratégias mais integradas do que apenas a criação de áreas protegidas, sendo necessário o envolvimento dos proprietários rurais, juntamente com os tomadores de decisão. A aplicação de instrumentos políticos econômicos, como compensações e pagamentos por serviços ambientais, pode ser uma estratégia para estimular proprietários rurais a participarem de programas de conservação da biodiversidade em terras privadas. O problema da pesquisa deste trabalho foi identificar os fatores que levaram ao aumento de áreas florestadas em propriedades rurais em regime familiar de exploração e as suas consequências à conservação da biodiversidade. A pesquisa foi desenvolvida no município de Santa Maria de Jetibá, ES, onde ocorrem populações do muriqui-do-norte e predominam as propriedades agrícolas familiares, nas quais tem ocorrido aumento de áreas florestadas, muitas delas fragmentadas. O trabalho foi dividido em três partes: Análise das mudanças de uso e da cobertura da terra entre 1970 e 2005, identificando os principais indutores do aumento da cobertura florestal em uma região de ocorrência do muriqui-do-norte; Descrição do perfil socioeconômico, da percepção e das motivações dos proprietários rurais para a conservação de serviços ecossistêmicos; Proposição de corredores estruturais para sete populações de muriqui-do-norte, baseada na permeabilidade da matriz e na aceitação dos donos da terra. Foram utilizados mapas de uso e cobertura da terra, censos agropecuários, entrevistas semiestruturadas, métodos de valoração e compensação de serviços ambientais baseados no mercado de bens substitutos e na preferência declarada, além de simulações dos corredores ecológicos no programa LORACS. A decisão de deixar áreas naturais na propriedade rural é fortemente influenciada por fatores econômicos. O aumento da produtividade, possibilitada pela tecnificação agrícola, permitiu a ampliação da cobertura florestal no município de Santa Maria de Jetibá. O perfil socioeconômico dos agricultores entrevistados e as características das propriedades nos permitem inferir sobre a importância dos instrumentos políticos econômicos, do tipo de agricultura praticada e da percepção ambiental para criar oportunidades de conservação da biodiversidade. Programas de conservação que têm como meta a efetivação de corredores de vegetação em áreas privadas e, consequentemente, a perda de áreas produtivas, podem utilizar instrumentos políticos econômicos, baseados na disposição a receber, no custo de oportunidade da terra e no custo de restauração ecológica, para serem mais atrativos aos proprietários rurais, motivando-os a romper as barreiras para sua aceitação. / The changes imposed in land use and land cover, especially in forest areas, produce environmental changes at various levels. One negative consequence is the habitat fragmentation, followed by disturbance in many ecosystems, such as the loss of species and its populations. The study of factors influencing the increase of forest cover and its consequences for the conservation of biodiversity is essential for the planning of environmental policies, particularly for the regions where endangered species occur. One critical factor for the conservation of the spider monkeys (Brachyteles hypoxanthus) - a neotropical primate critically endangered, is the connectivity between remaining forest fragments, because necessary changes in land use and land cover will happen. The above mentioned conservation requires more integrated strategies than just the creation of protected areas, whereas the involvement of landowners and decision makers are needed. The use of economic policy instruments, such as compensation and payments for environmental services, can provide a strategy to encourage landowners to participate in biodiversity conservation programs on their lands. The present research consists in identifying the leading factors to the increase of forested areas on lands in family regime of exploitation and its consequences for biodiversity conservation. This study has been conducted in Santa Maria de Jetibá, a county of Espírito Santo, Brazil, where there are populations of spider monkeys inside little farms, whose forested areas have been increased, but fragmented. This work comprehends three parts: - Analysis of land use and land cover change between 1970 and 2005, identifying the main drivers of forest cover increase, in a region where spider monkeys occur; - Study of the socioeconomic profile, the perception and motivations of landowners for the conservation of ecosystem services; - Proposition of structural corridors for seven populations of spider monkeys, based on the matrix permeability and acceptance of landowners. The employed resources are: land cover maps, agricultural census, semi-structured interviews, and methods of valuation and compensation of environmental services based on the market of substitute goods and the declared preference, as well as simulations of ecological corridors in LORACS program. The decision to leave natural areas on the farm is strongly influenced by economic factors. The increase in productivity enabled by agricultural mechanization, allowed the expansion of forest cover in farms of Santa Maria de Jetibá. The socioeconomic profile of farmers and the characteristics of their properties prompted the influence of economic policy instruments, the type agriculture and the environmental conscience among farmers, to create biodiversity conservation opportunities. Conservation programs aiming to lay vegetation corridors in private land and, consequently, the loss of productive areas, can be implemented by economic policy instruments, based on the economical compensation, in the land opportunity cost and cost of ecological restoration, bring down barriers of landowners against conservational programs.
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Assessment of lateralized behaviour in free-ranging Mexican mantled howler monkeys (Alouatta palliata mexicana)

Crespo Mingueza, Laia January 2015 (has links)
The evolutionary origins of human handedness are still unknown. The study of lateralized behaviour in our closest relatives, the nonhuman primates, is useful to clarify how this trait appeared and evolved in our species. In the present study, lateralized behaviour was assessed in a population of 32 free-ranging Mexican mantled howler monkeys (Alouatta palliata mexicana) for thirteen spontaneous motor patterns, at individual and group levels, as well as the effect that age, sex and posture have on its strength and direction. The studied population of howler monkeys displayed only few significant lateral biases at the individual level with single motor patterns (Binomial tests, p≤0.05). No biases towards the use of a particular limb or side of the body were found at a population level. Therefore, even though some individuals showed significant limb/side preference with single motor patterns, no signs of task specialization, side specialization, or true handedness were found. Similarly, no effects of sex, age or posture were found on the direction or strength of lateralized behaviour. The general absence of limb/side preferences found in this population may be due to the constraints imposed by the arboreal life and/or the type of diet. Possible causal agents of the few significant individual biases found here may be the presence of handicaps and/or experience. Further research is needed in order to assess whether the lack of human-like handedness reported in this study is only specific to the studied population, a general phenomenon of the genus Alouatta or perhaps of all the Platyrrhini.
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Functional analysis and elimination of SIB in an olive baboon (Papio hamadryas anubis).

Dorey, Nicole R. 08 1900 (has links)
Self injurious behavior (SIB), such as self-biting and head-banging, has been reported to occur in approximately 10% of captive, individually housed primates (Novak, Kinsely, Jorgensen, and Hazen, 1998). Accounts of the causes of SIB range from environmental to physiological. However, to date, no researchers have investigated the possible influence of social consequences, delivered by handlers and keepers, in the maintenance of SIB. There is only one research report showing that self-injury can be shaped in primates by the manipulation of food as a reinforcing consequence for the animal's behavior. The current study investigated the effects of social contact as potentially reinforcing consequences for the SIB displayed by an olive baboon (Papio hamadryas anubis). Results indicated that the behavior was maintained by attention from humans. As treatment, reinforcement was arranged for an appropriate alternative attention-getting behavior, resulting in increases in the appropriate alternative behavior and decreases in SIB.

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