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Utilização da espectroscopia com análise multivariada na identificação de diferentes DTUs do Trypanosoma cruzi em Triatoma brasiliensis infectados experimentalmente

Jales, Jéssica Teixeira 16 February 2018 (has links)
Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-07-02T21:32:55Z No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-07-09T11:25:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T11:25:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / A infecção pelo Trypanosoma cruzi é um problema de saúde pública, e é importante que seu diagnóstico seja realizado com rapidez e eficiência. Entretanto, as técnicas aplicadas para esse fim apresentam baixa sensibilidade e especificidade no que concerne a vigilância entomológica e epidemiológica do parasito. Pensando nesta problemática, a bioespectroscopia com análise multivariada foi utilizada neste trabalho para avaliar a eficiência na identificação da infecção experimental de Triatoma brasiliensis por diferentes Unidades de tipagem discreta (DTU) do T. cruzi. Na padronização do modelo de classificação foram utilizadas ninfas de 4° e 5º estádio de T. brasiliensis, infectadas experimentalmente com diferentes DTUs do parasito (TcI, TcII, TcIII ou infecção mista), na concentração de 40.000 parasitos/mL de sangue. Seguidos 15 e 30 dias após infecção (DAI), espectros de infravermelho foram coletados do abdômen de cada inseto; 30 DAI, dejetos intestinais foram coletados e posteriormente utilizados para análise do kDNA. A padronização do modelo de calibração mostrou que a aplicação do infravermelho médio utilizando o Infravermelho médio com transformada de Fourrier com reflexão total atenuada (ATR-FTIR) discriminou os triatomíneos não infectados e infectados com o T. cruzi. Além disso, a técnica foi capaz de distinguir as DTUs utilizadas, e separar os 5 grupos estudados apenas com a análise exploratória de dados por meio da aplicação da Análise dos componentes principais (PCA), a qual identificou diferencialmente grupamentos proteicos, ácidos nucleicos e em menor proporção, lipídeos. A análise do kDNA confirmou 92,5% das infecções, enquanto o ATR-FTIR identificou corretamente todas as amostras. Desta forma, a bioespectroscopia foi eficiente, simples e acurada na identificação da infecção de T. brasiliensis por T. cruzi, podendo ser utilizado como ferramenta de diagnóstico futura, auxiliando na vigilância entomológica da infecção por este parasita. / The Trypanosoma cruzi infection is a public health problem and it is substancial that its diagnosis be performed quickly and efficiently. However, the techniques applied on the diagnosis of T. cruzi infection present low sensitivity and specificity regarding the entomological and epidemiological surveillance of the parasite. Considering this problem, the biospectroscopy with the use of ATR-FTIR was used in this study to evaluate its efficiency in the identification of the experimental infection of Triatoma brasiliensis by different DTUs of T. cruzi. The standardization of the calibration model included the use of fourth and fifth instars of T. brasiliensis, which were infected with different DTUs of the parasite (TcI, TcII, TcIII or mixed infection) at a concentration of 40,000 parasites / ml of blood. Followed 15 and 30 days after infection (DAI), infrared spectra were collected from the abdomen of each insect; 30 DAI, intestinal wastes were collected and later used for kDNA analysis. The standardization of the calibration model showed that the application of the mild-infrared using the ATR-FTIR distinguished the triatomines that were not infected and experimentally infected with T. cruzi. In addition, the technique was able to identify the DTUs used, separating the 5 distinct groups only with the exploratory data analysis through the application of Principal Component Analysis (PCA), which differentially identified protein clusters, nucleic acids and to a lesser extent, lipids. The kDNA analysis confirmed 92.5% of the infected insects, while the ATR-FTIR correctly identified all samples. Thus, biospectroscopy applied with the use of ATR-FTIR was efficient in the identification of the T. brasiliensis infection by T. cruzi, and could be used as a diagnostic tool for the future, assisting in the entomological surveillance of the infection by this parasite.
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Desenvolvimento, validação, avaliação da incerteza de medição e análise de custos de método baseado em espectroscopia no infravermelho e análise multivariada para previsão de parâmetros de qualidade de amostras de E85 /

Hatanaka, Rafael Rodrigues. January 2015 (has links)
Orientador: José Eduardo de Oliveira / Banca: Edenir Rodrigues Pereira Filho / Banca: Alberico Borges Ferreira da Silva / Banca: Ivano Gebhardt Rolf Gutz / Banca: Leonardo Sena Gomes Teixeira / Resumo: O uso do etanol como combustível pode reduzir as emissões dos gases do efeito estufa e a dependência de combustíveis fósseis, já que pode ser obtido de fontes renováveis. Entretanto, este biocombustível pode apresentar problemas de ignição e de dirigibilidade em regiões com clima frio devido à menor pressão de vapor em relação à gasolina. Para evitar tais problemas, pode-se misturar etanol à gasolina em várias proporções (50-85% na Europa e nos Estados Unidos), essas misturas são comercialmente denominadas de E85. Outros parâmetros (como o teor de metanol e de água) também são importantes para garantir a qualidade do combustível e estão previstos em normas internacionais. Sendo assim, o presente trabalho mostra o desenvolvimento, a validação e a estimativa de incerteza de métodos analíticos, utilizando espectroscopia na região do infravermelho (médio e próximo) e regressão multivariada, que permitem quantificar os teores de etanol, metanol, hidrocarbonetos e água em amostras de E85 preparadas em laboratório. A validação se deu através do cálculo das figuras de mérito utilizando o conceito de sinal analítico líquido (NAS). Com isso, foi possível observar que os métodos propostos são capazes de quantificar os teores de etanol, metanol, hidrocarbonetos e água de forma linear, livre de erros sistemáticos, com precisão de 0,2% (m/m), 0,03% (m/m), 0,2% (m/m) e 0,03% (m/m), exatidão de 0,3% (m/m), 0,02% (m/m), 0,2% (m/m) e 0,02% (m/m), respectivamente, e com intervalos de medição cobrindo toda faixa dos parâmetros estabelecidos pelas normas. Além disso, as formas pseudounivariadas dos modelos de regressão multivariada (utilizando o NAS) foram empregadas na estimativa da incerteza de medição dos métodos, permitindo os cálculos de acordo com a abordagem do Guia para Incerteza de Medição e também por simulação de Monte Carlo. / Abstract: The use of ethanol as fuel can reduce emissions of greenhouse gases and dependence on fossil fuels, as it can be obtained from renewable sources. However, this biofuel can present problems of ignition and driving in areas with cold climates due to lower vapor pressure in relation to gasoline. To avoid such problems, ethanol can be mixed with in various proportions (50-85% in Europe and the United States). These mixtures are commercially known as E85. Other parameters (such as methanol and water content) are also important to ensure the quality of the fuel and are fixed by international standards. Thus, the present study shows the development, validation and estimation of the uncertainty of analytical methods using spectroscopy in the infrared region (middle and near) and multivariate regression, which allow quantifying levels of ethanol, methanol, oil and water in E85 samples prepared in laboratory. The validation was made by calculating the figures of merit using the concept of net analytical signal (NAS). Thus, the proposed methods were able to quantify the levels of ethanol, methanol, oil and water linearly, free of systematic errors, with accuracy of 0.2% (m/m), 0.03% (m/m), 0.2% (m/m) and 0.03% (m/m), accuracy of 0.3% (m/m), 0.02% (m/m), 0.2% (m/m) and 0.02% (m/m), respectively, and measuring intervals covering whole range of parameters established by the standards. Furthermore, pseudounivariate forms of multivariate regression models (using NAS) were used to estimate uncertainty of measuring methods, allowing calculations in accordance with the Guide to the Expression of Uncertainty in Measurement and also Monte Carlo simulation. / Doutor
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MODELOS DE CLASSIFICAÇÃO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE LEITE EQUANTIFICAÇÃO DE ÁCIDOS GRAXOSPOR ESPECTROSCOPIA NIR / MILK PRODUCTION SYSTEMS CLASSIFICATION OF MODELS AND QUANTIFICATION OF FATTY ACIDS FOR NIR SPECTROSCOPY

Milani, Marceli Pazini 22 July 2016 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / It was evaluate the fatty acid profile of organic and conventional milk in differen seasons, the use of spectral data obtained in the near infrared region for classification of milk (organic vs conventional) and quantification of fatty acids. The tested rating models were: support vector machine (SVM) and independent flexible modeling by analogy class (SIMCA); and quantification: regression by partial least square (PLS) by interval (iPLS), principal component regression (PCR), regression by support vectors machine (SVR) and artificial neural networks (RNA). The milk samples used tanks producing units 135 and individual cows. The database used to develop the classification models were constructed from milk samples collected every two months, from July 2011 to May 2012, from 20 units producing organic milk and 20 conventional, located in the Southern of Brazil. The reference method the quantification of fatty acids used was gas chromatography (GC/FID). Spectral recordings were made in the range of 1100 to 2500nm in both samples of fresh milk as freeze-dried. The results did not show significant difference between the production system (organic and conventional) and the content of most fatty acids, including those identified as beneficial to consumer health. The use of near infrared spectroscopy associated with chemometric classification models made it possible to differentiate between milk samples from different systems, with an accuracy of 80,93% for freeze-dried samples and 59,32% for in natura samples by MVS method. Quantification of fatty acid in milk from NIR data is possible, and the selection of wavelengths by iPLS improved prediction model regarding the use of the entire spectrum. The artificial neural network has better performance than other models. The water content interfere with the performance of the models, both as to rate the samples to quantify fatty acids with significantly superior results with lyophilized samples. / Foi avaliado operfil de ácidos graxos do leite orgânico e convencional em diferentes estações do ano e, o uso de dados espectrais obtidos na região do infravermelho proximal para classificação do leite (orgânico vs convencional) e quantificação de ácidos graxos. Os modelos de classificação testados foram: máquina de vetores de suporte (SVM) e modelagem independente flexível por analogia de classe (SIMCA); e de quantificação: regressão por mínimos quadrados parciais (PLS) por intervalo (iPLS), regressão por componentes principais (PCR), regressão por máquina de vetores de suporte (SVR) e redes neurais artificiais (RNA). As amostras de leite utilizadas para desenvolver os modelos de quantificação totalizaram 421, sendo 286 oriundas de tanques de resfriamento de unidades produtoras e 135 individuais de vacas. O banco de dados utilizado para desenvolver os modelos de classificação foi construído a partir de amostras de leite coletadas a cada 2 meses, de julho de 2011 a maio de 2012, proveniente de 20 unidades produtora de leite orgânico e 20 convencionais, localizadas na região Sul do Brasil. Utilizou-se como método de referência para quantificação de ácidos graxosa cromatografia gasosa (GC/FID). Os registros espectrais foram realizados na faixa de 1100 a 2500nm tanto nas amostras de leite in natura como liofilizada. Os resultados não acusaram diferença significativa entre o sistema de produção (orgânico e convencional) quanto ao teor da maioria dos ácidos graxos, inclusive para os identificados como benéficos à saúde do consumidor. O uso da espectroscopia no infravermelho proximal associado a modelos quimiométricos de classificação possibilitou a diferenciação entre amostras de leite de diferentes sistemas, com acurácia de 80,93% para amostras liofilizadas e 59,32% para amostras in natura pelo método SVM. A quantificação de ácidos graxos no leite a partir de dados NIR é possível, sendo que a seleção de comprimentos de onda através do iPLS melhorou a predição do modelo em relação ao uso do espectro inteiro. A rede neural artificial apresentou desempenho superior aos demais modelos. O teor de água interfere no desempenho dos modelos, tanto para classificar as amostras como para quantificar ácidos graxos, com resultados significativamente superiores com amostras liofilizadas.
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Combinação de ferramentas quimiométricas e infravermelho próximo para análise de material desfibrado de cana-de-açúcar / Combination between nir and chemometrics tools to analyse fibered samples of sugarcane

Carvalho, Renato de 29 January 2015 (has links)
Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-09-26T12:14:42Z No. of bitstreams: 1 DissRC.pdf: 1987188 bytes, checksum: 45e1cf0e51c0dc944969d7867b85c4d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:33:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissRC.pdf: 1987188 bytes, checksum: 45e1cf0e51c0dc944969d7867b85c4d3 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:33:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissRC.pdf: 1987188 bytes, checksum: 45e1cf0e51c0dc944969d7867b85c4d3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T19:34:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissRC.pdf: 1987188 bytes, checksum: 45e1cf0e51c0dc944969d7867b85c4d3 (MD5) Previous issue date: 2015-01-29 / Não recebi financiamento / The Monsanto Company presents in one of its segments the development of varieties of sugacane which have high productivity. The productive capacity of these clones is measured using at lest six analytical parameters: brix degree, Pol, purity, fiber, juice pol and cane pol. The determination of these parameters is done by instrumental measurements that require intense attention of the operator. Beyond that, in Monsanto, the cost per analysis is the order to R$7.50. Of course, not only the cost per analysis is the main parameter, but how fast the frequency of results to verify if the variety is or isn’t economically viable. The proposal of this professional master’s degree project is to use the near infrared spectrophotometer (NIR) combined with chomometric tools to propose calibration models. These models would be used to provide faster and low costs of the analytical parameters reported above. In realization of this project were used over 7000 NIR spectra were obtained after defibration sugarcane. Spectra were obtained and constructed multivariate calibration models (6300 spectra) with the chemometric tool PLS (partial least squares). The models were created in the Conchal laboratory and validated with 700 spectra that not were part of the calibration database and the validation errors ranged from 0.57 (for brix degrees) to 3.55 (for pol). Furthmore, the models of calibration were used in two other experimental stations of Monsanto. The first is located in Araçatuba (SP) and the second in Mandaguaçu (PR) At this part were tested 3 strategies of transfer calibration (recalibration, model update and slope and intercept) and slope and intercept had the lowest validation errors (around twice lower when compared with no transfer). The professional master degree represented up to now a saving of financial resources around R$ 100.000,00 per harvest. / A empresa Monsanto apresenta em um dos seus segmentos o desenvolvimento de variedades de cana-de-açúcar que apresentam alta produtividade. A capacidade produtiva dessas variedades é aferida por meio de pelo menos 6 parâmetros analíticos: Grau brix, leitura de Pol, pureza, teor de fibra, Pol de caldo e Pol de cana. A determinação destes parâmetros é feita por medidas instrumentais que requerem intensa atenção do operador. Além disso, na Monsanto, o custo por análise é da ordem de R$ 7,50. Logicamente, não somente o custo por análise é o parâmetro principal, mas sim a rapidez na frequência de resultados para atestar se determinada variedade é ou não economicamente viável. Assim, a proposta desse projeto de mestrado profissional é utilizar um espectofotômetro de infravermelho próximo (NIR, near, infrared) combinado com ferramentas quimiométricas para propôr modelos de calibração. Esses modelos seriam utilizados para prever de forma mais rápida e com baixo custo os valores dos parâmetros analíticos reportados acima. Na realização desse projeto foram utilizados mais de 7000 espectros de infravermelho próximo que foram obtidos após o desfibramento de cana-de-açúcar. Os espectros foram obtidos e construídos modelos de calibração multivariada (6300 espectros) com a ferramenta quimiométrica PLS (Partial least squares). Os modelos foram criados no laboratório de Conchal e validados com 700 espectros que não fizeram parte do banco de dados da calibração e os erros de validação variaram de 0,57 (para grau brix) até 3,55 (para leitura de Pol). Além disso, os modelos de calibração criados foram empregados em duas outras estações experimentais da Monsanto. A primeira delas é localizada na cidade de Araçatuba (SP) e a segunda em Mandaguaçu (PR). Nessa etapa foram testadas 3 estratégias de transferência (recalibration, model update e slope and intercept) de calibração e a slope and intercept apresentou os menores erros de validação (cerca de 2 vezes mais baixos quando comparados sem transferência). O projeto de mestrado profissional representou até o presente momento uma economia de recursos financeiros da ordem de R$100.000,00 por safra.
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Avaliação de procedimentos de digestão de amostras da cadeia produtiva de materiais escolares usando forno de micro-ondas com cavidade / Digestion procedures evaluation of samples of the production chain of school supplies using microwave radiation with closed vessel.

Garcia, José Augusto 19 September 2014 (has links)
Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-09-26T13:28:29Z No. of bitstreams: 1 DissJAG.pdf: 1269540 bytes, checksum: 5c8bbc44505b3dfbb6251ce433f1966c (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:34:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJAG.pdf: 1269540 bytes, checksum: 5c8bbc44505b3dfbb6251ce433f1966c (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T19:35:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJAG.pdf: 1269540 bytes, checksum: 5c8bbc44505b3dfbb6251ce433f1966c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T19:35:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissJAG.pdf: 1269540 bytes, checksum: 5c8bbc44505b3dfbb6251ce433f1966c (MD5) Previous issue date: 2014-09-19 / Não recebi financiamento / This study aimed to optimize the digestion of solid samples using microwave oven with closed flasks and understand the physicochemical parameters involved in this process. The development of this study was based on EN71 / 3 and CPSC-CH_E1001-08 standards. We performed a fractional factorial design (screening) to identify the significant variables for the process. The variables studied were volume of HNO3, heating program conditions, the addition of analytes and residual. The following responses were used to identify the most important variables: acidity of digested (%), the presence of the remaining solids digestion process (%), and recovery of previously added analytes (Pb and Cr). After identification of significant variables it was possible to set some parameters of the system and a new full factorial design 2³ (Design 1) was performed for 10 different types of samples, and the variables studied addition of H2O2, addition of analytes and sequential digestion. The responses observed were previously added recoveries of analytes (Ba, Cd, Cr, Hg, and Pb) and presence of the remaining solids digestion process (%). Data of Desing 1 was evaluated using multivariate analysis in order to detect clusters and trends among the strains. A new full factorial design 2³ (Design 2) was performed with selected samples and the following variables investigated: addition of H2O2, addition of analytes and volume of HNO3. The responses observed for Design 2 were recoveries of analytes previously added (Ba, Cd, Cr, Hg, and Pb), and comparison between the two systems digestion microwave assisted samples. The conclusions are that it is not possible to digest samples with different physicochemical characteristics in the same batch, the proposed system is not recommended for the determination of Cd and Hg and the proposed system can be used in order to perform a screening in samples. / O presente trabalho teve como objetivos otimizar o processo de digestão de amostras sólidas utilizando forno de micro-ondas com frascos fechados e entender os parâmetros físico-químicos envolvidos neste processo, sendo as normas EN71/3 e CPSC-CH_E1001-08 utilizadas como parâmetro para o desenvolvimento dos métodos. No início dos trabalhos, foi realizado um planejamento fatorial fracionário (triagem) para identificar as variáveis significativas para o processo. As variáveis estudadas foram volume de HNO3, condições do programa de aquecimento, adição de analitos e tipo de amostra. As respostas utilizadas para identificar as variáveis mais importantes foram: acidez do digerido resultante (%), presença de sólidos remanescentes do processo de digestão (%) e recuperação de analitos previamente adicionados (Pb e Cr). Após a identificação das variáveis significativas foi possível fixar alguns parâmetros do sistema e um novo planejamento fatorial completo 2³ (Planejamento 1) foi realizado para 10 tipos de amostras diferentes, sendo estudadas as seguintes variáveis: adição de H2O2, adição de analitos e digestão sequencial. As respostas observadas foram: recuperações de analitos previamente adicionados (Ba, Cd, Cr, Hg e Pb) e presença de sólidos remanescentes do processo digestão (%). Os dados do Planejamento 1 foram estudados utilizando métodos de análise multivariada, sendo possível detectar agrupamentos e tendências entre as amostras testadas. Um novo planejamento fatorial completo 2³ (Planejamento 2) foi realizado com as amostras selecionadas e as variáveis testadas foram adição de H2O2, adição de analitos e volume de HNO3. As respostas observadas para o Planejamento 2 foram: recuperações de analitos previamente adicionados (Ba, Cd, Cr, Hg e Pb) e comparação entre dois sistemas de digestão de amostras assistidas por micro-ondas. As conclusões são que não é possível digerir amostras com características físico-químicas diferentes em uma mesma batelada, o sistema proposto não é recomendado para a determinação de Cd e Hg e é possível utilizar o sistema proposto para realizar uma triagem nas amostras.
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Desenvolvimento de modelos de calibração multivariada em espectroscopia de infravermelho próximo para ácidos graxos em amostras de carne bovina / DEVELOPMENT OF MULTIVARIATE CALIBRATION MODELS FOR NEARINFRARED SPECTROSCOPY TO FATTY ACIDS IN BEEF SAMPLES

Sousa, Jonas da Silva 21 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Sebin (lusebin@ufscar.br) on 2016-09-30T13:02:12Z No. of bitstreams: 1 DissJSS.pdf: 5198309 bytes, checksum: 1bddd2741512bf6bf9509fe9e86d2ad9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:27:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJSS.pdf: 5198309 bytes, checksum: 1bddd2741512bf6bf9509fe9e86d2ad9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:27:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissJSS.pdf: 5198309 bytes, checksum: 1bddd2741512bf6bf9509fe9e86d2ad9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T19:28:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissJSS.pdf: 5198309 bytes, checksum: 1bddd2741512bf6bf9509fe9e86d2ad9 (MD5) Previous issue date: 2016-03-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The Brazilian cattle have shown promise prominence in the international market compared to other commodities. It already knows the important role of fatty acids in the complimentarily of human nutrition. On the other hand, studies have linked the consumption of beef with increasing rate of diseases associated with high levels of "bad" cholesterol (LDL) in the blood. Because of these two aspects on the topic meat (nutritional value and human health), it is seen necessary to determine the levels oftrans fatty acids in meat. Among the methods for analysis of total lipids and lipid profile, stands out the extraction of fat and chromatography, respectively. In this project was proposed to develop multivariate calibration models for the analysis of total lipids and lipid profile with the use of near-infrared spectroscopy in beef samples which the levels were previously determined. Eighteen properties were analyzed, including: total lipids and myristic fatty acids, pentadecylic, palmitic, margaric, stearic, palmitoleic, oleic, elaidic, linoleic, α-linolenic and families of fatty acids with branched, saturated, monounsaturated (cis), conjugated linoleic (cis, trans), and omega 3 and 6 polyunsaturated. We used 127 bovine meat samples from the calibration steps and internal validation (2/3 to 1/3 calibration and validation for internal and 32 external validation samples. We used the PLSR method for the construction of multivariate models. Flesh spectra were extended from 1111 to 1937, and from 2016 to 2500 nm regions, and regions concerning water and noise judged as interfering in the calibration process were removed during the models construction. We evaluated the performance of the models based on the applied pre-treatments (smoothing, first derivative Savitzky-Golay, SNV), the number of latent variables, consistency, SEC, SEP and determination coefficients (R2 cal/val). The models chosen as having better predictive capacity were those of total lipids, myristic acid, palmitic acid, margárico and saturated fatty acids, demonstrating that the NIRS has a high potential for the quantification of lipid constituents of the beef. / A bovinocultura brasileira tem mostrado promissor destaque no mercado internacional quando comparada a outras commodities. Já se conhece o importante papel de ácidos graxos na complementaridade da alimentação humana. Por outro lado, estudos relacionam o consumo de carne bovina com o aumento de índice de doenças associadas com os altos teores do “mau” colesterol (LDL) no sangue. Em virtude dessas duas vertentes que abordam o tema carne (valor nutricional e a saúde humana), a determinação dos teores de ácidos graxos em carne é importante. Entre as metodologias para análise de lipídeos totais e perfil lipídico, se destacam a extração de gordura e a cromatografia, respectivamente. No presente projeto foi proposto o desenvolvimento de modelos de calibração multivariada para a análise de lipídeos totais e perfil lipídico com o emprego de espectroscopia no infravermelho próximo em amostras de carne bovina cujos teores foram previamente determinados. Foram analisadas dezoito propriedades, entre elas: lipídeos totais e os ácidos graxos mirístico, pentadecílico, palmítico, margárico, esteárico, palmitoleico, oleico, elaídico, linoleico, α-linolênico e as famílias de ácidos graxos com cadeia ramificada, saturados, monoinsaturados (cis), linoleicos conjugados (cis, trans), ômega 3 e 6 e poli-insaturados. Utilizou-se 127 amostras de carne de bovinos entre as etapas de calibração e validação interna (2/3 para a calibração e 1/3 para validação a interna e 32 amostras para validação externa). Empregou-se o método PLSR para construção dos modelos multivariados. Os espectros de carne estenderam-se de 1111 a 1937 nm e de 2016 a 2500 nm, sendo removidas regiões referentes à água e a ruídos, julgados como interferentes no processo de calibração. Avaliou-se o desempenho dos modelos com base nos pré-tratamentos aplicados (alisamento, primeira derivada Savitzky-Golay, SNV), número de variáveis latentes, consistência, SEC, SEP e coeficientes de determinação (R2 cal/val). Os modelos escolhidos como tendo melhor capacidade preditiva foram os de lipídeos totais, ácido mirístico, palmítico, margárico e ácidos graxos saturados, demonstrando que a NIRS possui alto potencial na quantificação dos constituintes lipídicos da carne bovina.
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Uso de técnicas espectroanalíticas na avaliação de amostras de placas de circuito impresso de lixo eletrônico / Techniques espectroanalíticas use the boards samples assessment of printed circuit electronic waste

Santos, Jozemir Miranda dos 26 November 2015 (has links)
Submitted by Livia Mello (liviacmello@yahoo.com.br) on 2016-10-04T14:41:11Z No. of bitstreams: 1 TeseJMS.pdf: 2119796 bytes, checksum: b78891c13a589bb6546e47a89e7da228 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-13T19:48:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseJMS.pdf: 2119796 bytes, checksum: b78891c13a589bb6546e47a89e7da228 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-13T19:49:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseJMS.pdf: 2119796 bytes, checksum: b78891c13a589bb6546e47a89e7da228 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-13T19:49:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseJMS.pdf: 2119796 bytes, checksum: b78891c13a589bb6546e47a89e7da228 (MD5) Previous issue date: 2015-11-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / The increase in the consumer electronics equipment, especially, the cell has aroused the academia and society in general interest. Such equipment when obsolete became part of the so-called junk mail. Among the components of this type of waste, are the printed circuit boards (PCB’s). The concentration of toxic elements such as Cd, Cr and Pb these PCB has proved high. Because of this situation becomes important to develop analytical methodologies for evaluation of these dangerous elements in PCB. Among the analytical techniques available, the most used in the determination of these elements has been the ICP OES. The evaluation of samples PCB by ICP OES performed in this study revealed that in addition to the regulated elements by RoHS (Cd, Cr and Pb), are present in high quantities, the elements Ba (2% w/w) and As (400 mg/kg). The Cu element was the one with the highest levels of concentration in some samples amounted to 35% (m/m). The use of a multivariate analysis such as PCA, showed some correlation between certain elements of the PCB. This is observed for the elements Ba and Ni, and also to the As, Cr and Fe. Alternatively to the use of techniques that require a pretreatment of the samples comes LIBS. The obtained emission spectra provided important information about the composition of these PCB’s. An analysis of the spectra reveals the presence of emission lines of elements such as Ba, Cd, Pb, Ni, Cu, Fe, Sb, among others. The elements that provide the most intense emission lines were Cu and Ba. Based on the obtained reference concentration by ICP OES and the values of the area and intensity of the spectra obtained, the construction of multivariate calibration models has been proposed. Employing MLR was possible to build the multivariate calibration models for elements of interest. However, due to lack of verified correction, among the area parameters, maximum intensity and reference concentrations, the proposed models are considered viable. However, the use of LIBS for characterization purposes samples for the presence of an element, shown to be feasible from a qualitative point of view. / O aumento no consumo de equipamentos eletroeletrônicos, em especial os celulares têm despertado o interesse acadêmico e da sociedade em geral. Tais equipamentos quando obsoletos passam a compor o denominado lixo eletrônico. Entre os componentes desse tipo de lixo, estão as placas de circuito impresso (PCI). A concentração de elementos tóxicos, como por exemplo, Cd, Cr e Pb nestas PCI’s tem se mostrado elevadas. Devido a esse panorama torna-se importante o desenvolvimento de metodologias analíticas para avaliação desses elementos perigosos em PCI. Entre as técnicas analíticas disponíveis, a mais utilizada na determinação desses elementos tem sido a ICP OES. A avaliação de amostras de PCI por ICP OES realizada neste trabalho, revelou que além dos elementos mencionados pela RoHS (Cd, Cr e Pb), estão presentes em quantidades elevadas, os elementos Ba (até 2% m/m) e As (até 400 mg/kg). O elemento Cu foi o que apresentou os maiores teores de concentração, em algumas amostras atingiu os 35% (m/m). O uso de uma análise multivariada, como a PCA, revelou a correlação entre alguns elementos determinados nas PCI’s. Isso é observado para os elementos Ba e Ni, e ainda para os elementos As, Cr e Fe. Alternativamente ao uso de técnicas que necessitam de um pré-tratamento das amostras, surge a LIBS. Os espectros de emissão obtidos forneceram informações importantes sobre a composição dessas PCI’s. Uma análise dos espectros obtidos revelou a presença de linhas de emissão de elementos, como por exemplo, Ba, Cd, Pb, Ni, Cu, Fe, Sb, dentre outros. Os elementos que forneceram as linhas de emissão mais intensas foram o Cu e o Ba. A partir das concentrações de referência obtidas por ICP OES e dos valores da área e intensidade obtidas dos espectros, foi proposto a construção de modelos de calibração multivariada. Empregando Regressão Linear Múltipla (MLR) foi possível construir os modelos de calibração multivariada para os elementos de interesse. Entretanto, devido a falta de correção verificada, entre os parâmetros área, intensidade máxima e concentrações de referência, os modelos propostos são considerados não confiáveis. Contudo, a utilização da LIBS para fins de caracterização de amostras quanto a presença de um determinado elemento, mostrou-se viável e aplicável do ponto de vista qualitativo.
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Avaliação da variabilidade do metabolismo secundário em Cordia verbenacea DC / Evaluation of secondary metabolism variability in Cordia verbenacea DC

Pereira, Juhan Augusto Scardelato [UNESP] 31 March 2017 (has links)
Submitted by JUHAN AUGUSTO SCARDELATO PEREIRA null (juhan_01@yahoo.com.br) on 2017-05-02T14:37:47Z No. of bitstreams: 1 TESE - Juhan.pdf: 6743117 bytes, checksum: 50e774d88c707774b6f0ab9bbb9969f8 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-03T20:25:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pereira_jas_dr_arafcf.pdf: 6743117 bytes, checksum: 50e774d88c707774b6f0ab9bbb9969f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-03T20:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pereira_jas_dr_arafcf.pdf: 6743117 bytes, checksum: 50e774d88c707774b6f0ab9bbb9969f8 (MD5) Previous issue date: 2017-03-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Cordia verbenacea DC. pertence à família Boraginaceae, a qual contém aproximadamente 100 gêneros com mais de 2.000 espécies. Ocorre ao longo de todo litoral brasileiro, sendo comum na Floresta Tropical Atlântica e possuindo vários nomes populares, sendo o mais comum erva-baleeira. É utilizada tradicionalmente para tratar vários processos inflamatórios. O laboratório Aché® desenvolveu um medicamento fitoterápico anti-inflamatório tópico à base do óleo essencial de C. verbenacea (Acheflan®) e a espécie está presente no Formulário Nacional de Fitoterápicos da Farmacopeia Brasileira. Considerando a relevância de estudos de variabilidade química para espécies medicinais e a ausência destes dados na literatura para C. verbenacea propomos realizar um estudo da dinâmica do metabolismo da espécie focado nas variações sazonal, circadiana e populacional. As folhas de C. verbenacea foram coletadas, secas, trituradas e submetidas à maceração com etanol (1:15 m/v). Posteriormente, foi realizada uma extração em fase sólida com o extrato etanólico seco obtendo-se 10 frações, as quais foram analisadas por CCD e CLAE-UV. A fração 4.1 foi escolhida para cromatografia em coluna originando 120 subfrações, das quais três estavam semipurificadas. Utilizando a técnica de CLAE preparativa foram purificadas quatro substâncias, sendo três obtidas com mais de 95 % de pureza (CLAE-UV). As substâncias foram analisadas por técnicas espectrométricas (UV, IV e RMN), sendo identificados os triterpenos cordialina A e cis-cordialina A e dois flavonoides, 4’,5-diidroxi-2’,3,5’,6,7-pentametoxiflavona ou 2’,5-diidroxi-4’,3,5’,6,7-pentametoxiflavona e a artemetina. Um método por CLAE-DAD foi desenvolvido e aplicado na análise dos extratos etanólicos dos estudos populacional, circadiano e sazonal, incluindo a obtenção de seus perfis cromatográficos e a quantificação das substâncias purificadas. Os estudos populacional, circadiano e sazonal evidenciaram diferenças quantitativas em relação as substâncias majoritárias após a análise cromatográfica, sendo a substância diidroxipentametoxiflavona encontrada em maior quantidade no espécimen 13II4 do estudo populacional, já no estudo circadiano o horário das 04:30 h apresentou maior rendimento e no estudo sazonal maior tendência de produção deste flavonoide no período de janeiro a março de 2015/2016, enquanto que para os triterpenos o espécimen 3IV1 apresentou maior rendimento no estudo populacional e os espécimens 2II5 e 3II5 maior rendimento no estudos circadiano e sazonal, sendo os períodos de março a maio de 2015 e janeiro a março de 2016 os de maior tendência de produção desses triterpenos. A análise quimiométrica evidenciou uma diferença quantitativa dos metabólitos não voláteis entre os espécimens. A análise estatística utilizando ANOVA evidenciou que o rendimento do extrato e o teor dos triterpenos e flavonoide são afetados pelos períodos do ano. Foram obtidos os óleos essenciais dos 27 espécimens do estudo populacional e dos sete espécimens dos estudos circadiano e sazonal. O teor de óleo essencial na droga vegetal e sua coloração (amarelo claro, amarelo, esverdeado e azul) variaram entre os espécimens analisados. A análise por CCD também evidenciou diferenças significativas entre eles. Os dados obtidos por CCD dos 27 espécimens do estudo populacional foram utilizados em análises por PCA e HCA, observando-se agrupamento dos espécimes de óleo de cor azul/esverdeados em relação aos demais óleos de cor amarela. Esses agrupamentos também foram verificados nas PCA e HCA obtidas com dados por CG-EM, evidenciando que a amostra do óleo essencial do espécimen 13I5 possui maior tendência de produção do trans-cariofileno e do α-humuleno. Os óleos de cor azul/esverdeados evidenciaram a presença de três substâncias específicas: elemeno, camazuleno e espatulenol. A análise estatística utilizando ANOVA evidenciou que o rendimento do óleo essencial e o teor de seus componentes são afetados pelos períodos do ano, mas não pelo ritmo circadiano. / Cordia verbenacea DC. belongs to the Boraginaceae family which contains about 100 genera with more than 2,000 species. C. verbenacea is popularly named erva-baleeira and occurs throughout the Brazilian coast including the Atlantic Rainforest. It is traditionally used to treat various inflammatory processes and was employed by Aché® laboratory for the development of Acheflan®, an anti-inflammatory topical medicine containing the essential oil of C. verbenacea. Considering the relevance of chemical variability studies for medicinal plants we propose to develop a study of the metabolism dynamics focused on seasonal, circadian and population variations. The leaves of C. verbenacea were collected, dried, crushed and macerated with ethanol (1:15 m/v). The solid phase extraction with ethanolic extract yielded 10 fractions which were analyzed by TLC and HPLC. Fraction 4.1 was selected for column chromatography yielding 120 subfractions. Four compounds were isolated using preparative HPLC-UV and three compounds presented high purity (≤95 %; HPLC-UV) and were analyzed by spectrophotometric techniques (UV, IR, NMR). Compounds were identified as the triterpenes cordialin A and cis-cordialin A and the flavonoides 4',5-dihydroxy-2',3,5',6,7-pentametoxiflavone or 2',5-dihydroxy-4',3,5',6,7-pentametoxiflavone and artemetin. An HPLC-DAD method was developed for the analysis of the ethanolic extract. The ethanolic extracts of seasonal, circadian and population studies were analyzed by HPLC-DAD. All these studies showed quantitative differences in relation to the majority compounds, being the substance dihydroxypentamethoxyflavone found in a larger quantity in specimen 13II4 of the population study, already in the circadian study the time of 04:30 h had a higher yield and in the seasonal study a greater trend of production of this flavonoid in the period from january to march of 2015/2016, while for the triterpenes the specimen 3IV1 presented higher yield in the population study and the specimens 2II5 and 3II5 greater yield in the circadian and seasonal studies, being the periods of march to may of 2015 and january to march of 2016 the ones of greater tendency of production of these triterpenes. The statistical analysis using ANOVA showed that the yield of the extract and the content of triterpenes and flavonoid were affected by the periods of the year. Essential oils were obtained from the 27 specimens from the population study and the seven specimens from the circadian and seasonal studies. The essential oil content in the plant drug and its color (light yellow, yellow, green and blue) differed among the specimens. The TLC analysis also showed significant differences among the oils. Data obtained by TLC analyzes of the 27 specimens of the population study were used in PCA and HCA analyzes that showed two groups of oils - blue / green oil specimens and yellow color oil specimens. These clusters were also verified in PCA and HCA obtained with GC-MS data, evidencing that the sample of the 13I5 of the specimen has a greater trend of production of trans-caryophyllene and α-humulene. The blue/green oils showed the presence of 3 specific compounds: elemene, camazulene and spatulenol. The statistical analysis using ANOVA showed that the yield of the essential oil and the content of its components were affected by the periods of the year, but not by circadian rythm. / FAPESP: 2013/24298-9
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Estudo e sistematização estatística e quimiométrica na determinação de hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs) por HPLC-Flu

Machado, Marcos Canto [UNESP] 16 August 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-16Bitstream added on 2014-06-13T20:18:55Z : No. of bitstreams: 1 machado_mc_me_araiq.pdf: 1435306 bytes, checksum: 7ad8bbad80c831b71dec4d08b6da5555 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A análise da literatura aponta para um crescente número de trabalhos em matrizes ambientais que buscam identificar e quantificar diversas substâncias poluentes. O estudo destas substâncias resulta em grandes conjuntos de dados, que necessitam ser devidamente analisados para a interpretação mais confiável possível. Por outro lado, os métodos analiticos utilizados nestas determinações envolvem diversas etapas e parâmetros que podem influenciar na confiabilidade analítica. Resultados analíticos sem confiabilidade identificada podem levar a tomada de decisões totalmente equivocadas na área ambiental. Neste contexto, é fundamental que os laboratórios disponham de meios e critérios objetivos para demonstrar que os métodos de ensaio que executam conduzem a resultados confiáveis e adequados à qualidade pretendida. Este trabalho teve como objetivo o estudo de procedimentos estatisticos e quimiométricos na determinação dos hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs) empregando a cromatografia líquida de alta performance com detecção por fluorescência (HPLC-FLU), enfocando a otimização estatística de procedimentos para validação do método para obtenção e tratamento de sinais analíticos dos HPAs, bem como o estudo do comportamento dos analitos em diferentes matrizes ambientais. Neste sentido foram utilizadas ferramentas quimiométricas, como análise de componentes principais, analise hierárquica de agrupamentos e técnicas de planejamento experimental para analise exploratória dos dados e indicação das similaridades cromatográficas entre os HPAs e do perfil destes em matrizes ambientais. Também foram realizados testes estatísticos inferenciais e descritivos cujas ferramentas foram implementadas em planilhas de cálculo para utilização em procedimentos necessários a parâmetros de validação, como estabilidade de soluções, linearidade, limites de detecção e quantificação, recuperação e efeito matriz / The literature review points to a growing number of studies in environmental matrices which identify and quantify various pollutants. The study of these substances results in large data sets that need to be properly considered for the interpretation to be as more reliable as possible. On the other hand, the analytical methods used in these determinations involve several steps and parameters that can influence the analytical reliability. Analytical results that do not identify reliability can lead to completely flawed decision-making in the environmental area. In this context, it is essential laboratories to have adequate and objective criteria to demonstrate that the test methods performed lead to reliable results and appropriate to the desired quality. This work aimed to study the statistical and chemometric procedures for the determination of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) by liquid chromatography high performance with fluorescence detection (HPLC-FLU). It focuses on the optimization of statistical procedures for validating the method for obtaining and processing signals from analytical PAH as well as the study of the behavior of different analytes in environmental matrices. In this sense were used chemometric tools, such as principal component analysis, hierarchical cluster analysis and experimental design techniques for exploratory data analysis, indicating the similarities between PAH and chromatographic profile in environmental matrices. Tests were made descriptively and use of inferential statistical tools which have been implemented in spreadsheets for use in procedures required for validation parameters, such as stability of solutions, linearity, limits of detection and quantification, recovery and matrix effect. For studies on PAHs was determined as the optimal use of 5 replicates, the use of labor standards for a maximum period of 30 days and the development of analytical curves in the matrix
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Estudo de Jatropha gossypifolia e J. multifida (Euphorbiaceae) aplicando métodos analíticos in silico e de desreplicação, visando a detecção e elucidação in situ dos constituintes micromoleculares com atividade acetilcolinesterásicas e antioxidante

Pilon, Alan Cesar [UNESP] 14 January 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-01-14Bitstream added on 2014-06-13T20:59:21Z : No. of bitstreams: 1 pilon_ac_me_araiq.pdf: 768972 bytes, checksum: d0679df3c0e294a23794ae46d2fea361 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / No presente trabalho foram detectados e analisados os metabólitos secundários majoritários das espécies Jatropha multifida L. e J. gossypifolia L., fazendo uso de ferramentas quimiométricas de vanguarda, visando a otimização do processo de extração para, posteriormente, obter cromatogramas de fingerprint através da técnica acoplada CLAE-UV/DAD. Para a espécie J. gossypifolia L. a mistura 1 : 1 clorofórmio : isopropanol apresentou a melhor condição de extração enquanto para J. multifida L. a composição 2/3 : 1/6 : 1/6 de etanol : acetona : 1,4-dioxano foi a que obteve a melhor resposta. Os cromatogramas de fingerprint foram realizados fazendo uso de uma coluna monolítica C-18 (5 µm), como fase estacionária, enquanto a fase móvel para análise da espécie J. gossypifolia L. foi composta por água e uma mistura de solventes orgânicos, MeOH : ACN, na proporção (68 : 32), em gradiente exploratório de 5-100% de fase orgânica. Para a espécie J. gossypifolia L., as condições otimizadas foram: temperatura de coluna de 30 °C, fluxo em 2,0 mL·min-1 e o volume de injeção de 30 µL. Para J. multifida L. a fase móvel foi composta por água e uma mistura MeOH : ACN 1 : 1 em gradiente exploratório 5-100% de fase orgânica. A temperatura de coluna de 40 °C, o fluxo de 2,5 mL·min-1 e o volume de injeção foi de 30 µL. Foram realizados bioensaios in vitro, tais como a redução do reagente DPPH (ação antioxidante), inibição da polimerização da hematina bovina (ação antimalárica), inibição enzimática de acetilcolinesterase (doença de Alzheimer) e o ensaio da inibição do crescimento de fungos fitopatógenos. Nenhum dos extratos brutos avaliados, apresentou atividade significativa quando comparados com os padrões. Quanto à detecção dos metabólitos, a aplicação de métodos de desreplicação aos extratos permitiram a identificação de algumas classes... / The main goal of this research was to detect and analyze major secondary metabolites from Jatropha multifida L. and J. gossypifolia L. species, using state of art techniques in chemometrics aiming the optimization of the extraction process prior to the acquisition of the fingerprint chromatogram using HPLC-UV/DAD. The optimized extraction condition for Jatropha gossypifolia was the binary mixture 1:1 chloroform:isopropanol, while to Jatropha multifida L. the mixture was ternary consisting of 2/3:1/6:1/6 ethanol:acetone:1,4-dioxane. The fingerprint chromatograms were runned using an exploratory gradient consisting of 5-100% of organic solvent, using a C-18 (5 µm) column, as stationary phase, and then the mobile phase was optimized, through the use of chemometrics for each species. In the case of Jatropha gossypifolia L. the phase consisted in a mixture of 68:32 MeOH:ACN, under a column temperature of 30 oC, injection volume of 30 µL and a flow of 2.0 mL.min-1. For Jatropha multifida L. was 1:1 MeOH:ACN, under column temperature of 40 oC, flow of 2,5 mL.min-1 and an injection volume of 30 µL. Some in vitro bioassays were performed, such as, reduction of the reagent DPPH (antioxidant action), inhibition of polymerization of the haematin bovine (antimalarial), enzymatic inhibition of the acetylcholinesterase (Alzheimer’s disease) and the assay of inhibition of the growth of phytopatogenic fungi. None of the crude extracts showed significant activities when compared to the used standards. The application of dereplication methods allowed the identification of some classes of compounds, already reported for Jatropha, such as terpenoids and flavonoids. The strategy developed to performed the dereplication, used an in silico approach through the matching and analysis of the spectrometric and spectroscopic data sets obtained using NMR and HPLC-HRMS(ESI)-MS2 with databases of high... (Complete abstract click electronic access below)

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