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Caracterização de espécies brasileiras de Adesmia DC. por RAPD

Dias, Paula Menna Barreto January 2003 (has links)
Dentro do gênero Adesmia, as técnicas moleculares ainda não foram empregadas na caracterização de germoplasma e na análise da diversidade genética das espécies brasileiras que compôem o gênero. Portanto os objetivos deste trabalho foram: caracterizar, com a utilização de marcador molecular do tipo RAPD, as espécies brasileiras do gênero Adesmia DC; com base nestas informações estabelecer relações de diversidade genética entre as espécies e os acessos analisados; relacionar dados de diversidade com dados morfológicos e de reprodução.
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Análise de genes diferencialmente expressos por Trichophyton rubrum na presença de queratina e tipagem molecular /

Baeza, Lilian Cristiane. January 2006 (has links)
Orientador: Maria José Soares Mendes Giannini / Banca: Clarice Queico Fujimura Leite / Banca: Celia Maria de Almeida Soares / Banca: Paulo Inácio da Costa / Banca: Mário Hiroyuki Hirata / Resumo: As dermatofitoses são processos infecciosos de pele, pêlo e unhas muito comuns no mundo inteiro. Trichophyton rubrum é o dermatófito mais freqüentemente isolado em lesões superficiais de pele e unha. Estudos envolvendo este patógeno são cada vez mais importantes devido ao aparecimento de linhagens resistentes aos medicamentos antifúngicos disponíveis no mercado e ao comportamento invasivo deste agente em pacientes com o sistema imune comprometido. Estes fatos e poucos estudos levam à necessidade de se ampliar o conhecimento sobre a biologia deste agente. Visando colaborar nesse sentido, o presente trabalho teve dois objetivos centrais: 1) Realizar a tipagem molecular de isolados clínicos de T. rubrum com e sem relação epidemiológica por RAPD (Amplificação Randômica de DNA Polimórfico) com duas seqüências randômicas diferentes (denominadas de 1 e 6), bem como a análise dos elementos repetitivos (TRS-1 e TRS-2) do espaço não transcrito (NTS) do DNA ribossomal (DNAr) e 2) Identificar transcritos envolvidos na interação deste patógeno com fonte humana de queratina, através do RDA (Análise de Diferença Representacional). A aplicação do RDA permitiu pela primeira vez a identificação de alguns transcritos expressos, provavelmente relacionados à patogênese deste microrganismo. / Abstract: Dermatophytosis is common infection process which occurs in skin, hair and nails and Trichophyton rubrum is the most frequently isolated dermatophyte. Studies on this pathogen are becoming increasingly important because of frequent reports on resistant strains to antifungal drugs commercially available and the invasive behavior of these agents in immunocompromised patients. These facts, associated with few studies with this agent, indicate the need to expand the information about the fungal biology. As a contribution to this goal, the present study had two central objectives: 1) To compare different methodologies for molecular typing of clinical isolates of T. rubrum epidemiologically related and unrelated for RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) with two different random primers (denominated of 1 and 6); as well as the analysis of the repetitive elements (TRS-1 and TRS-2) of the space non-transcribed (NTS) of the ribosomal DNA (DNAr) and 2) To identify transcripts involved in the interaction of this pathogen with human keratin by RDA (Representational Difference Analysis). The application of the RDA allowed for the first time the identification of expressed transcripts during the microorganism proliferation that could be related to the T. rubrum virulence. / Doutor
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Variabilidade genética e taxa de deflexão dos estigmas em cultivos de maracujá (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) do Vale do São Francisco Salvador

Rocha, Maria Cecília de Lima e Sá de Alencar 23 August 2013 (has links)
Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-08-20T20:44:22Z No. of bitstreams: 1 Maria Cecília dissertação final c ficha catalográfica.pdf: 1998128 bytes, checksum: 105c3f384cab54bb0efdd9bdf5d06b9d (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-08-23T21:46:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Maria Cecília dissertação final c ficha catalográfica.pdf: 1998128 bytes, checksum: 105c3f384cab54bb0efdd9bdf5d06b9d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-23T21:46:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Cecília dissertação final c ficha catalográfica.pdf: 1998128 bytes, checksum: 105c3f384cab54bb0efdd9bdf5d06b9d (MD5) / A análise da variabilidade genética dos genótipos de Passiflora edulis, cultivados na região de Juazeiro, nordeste do Brasil, revelou que as culturas têm uma base genética estreita. Essa grande similaridade encontrada nos campos de produção de maracujá amarelo, tanto de Maniçoba quanto de outras regiões do país, mostra que essa cultura pode estar em risco, pois o incremento da uniformidade dos genótipos sem que haja uma seleção pode aumentar o numero de indivíduos auto-incompatíveis prejudicando a produtividade dos cultivares. A formação de dois grandes grupos no dendrograma obtido deve-se a introdução de um novo genótipo na região, esse fato ocorreu, pois a produção local estava muito abaixo do esperado principalmente por causa da alta taxa de incidência de flores funcionalmente masculinas. O presente trabalho encontrou taxas que variaram de 6% até 66% de flores não curvadas, e os dois únicos locais que apresentaram uma taxa dentro da faixa considerada normal tinham alguma estratégia de seleção de sementes. Essa estratégia só se torna viável quando a polinização natural é suficiente. A inserção de novas culturas perenes (Manga, uva e coco) juntamente com a baixa produtividade do maracujá gerou um aumento da área utilizada pela agricultura na região, diminuiu a conservação das poucas áreas de sequeiro que ainda restavam dentro dos lotes Essa nova configuração de paisagem vem contribuindo para o comprometimento de diversos processos ecossistêmicos o que resulta em sérios problemas como, os surtos freqüentes de pragas e doenças agrícolas, alagamentos, empobrecimento dos solos e, principalmente, a limitação de polinizadores. / Salvador, Bahia
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Uso de marcadores RAPD para mapeamento de QTLs que determinam teor de proteína em soja / Use of RAPD markers for mapping QTLs that control protein content in soybean

Miranda, Fábio Demolinari 12 August 2002 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-11T18:28:19Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 602028 bytes, checksum: efe6a1e35c1ed71ce3c3f711672053d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-11T18:28:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 602028 bytes, checksum: efe6a1e35c1ed71ce3c3f711672053d2 (MD5) Previous issue date: 2002-08-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho teve como objetivo o aumento do número de marcas no mapa de ligação da soja construído pelo programa de melhoramento da qualidade da soja do Bioagro/UFV e também a identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) associados à determinação do conteúdo de proteínas em sementes de soja. Para isso, foram acrescentados ao mapa original, marcadores do tipo RAPD e marcadores microssatélites não mapeados anteriormente. Foram utilizadas 118 linhagens recombinantes endogâmicas (RILs) obtidas do cruzamento entre a variedade norte- americana BARC 8 (genótipo com alto teor protéico) e a variedade brasileira Garimpo (genótipo com teor normal de proteínas). Foram testados inicialmente 1200 “primers” RAPD, dos quais 127 evidenciaram polimorfismo entre os progenitores, dos quais somente 65 mostraram polimorfismos na população de RILs segregando na proporção mendeliana esperada de 1:1, pelo teste do qui-quadrado. Foram obtidos 24 grupos de ligação pouco saturados, contendo 75 marcadores, além de 70 marcas não ligadas. Nas análises de regressão e mapeamento por intervalo composto para associação entre marcadores e a característica “teor de proteína”, foram identificados 11 marcadores e mapeados três QTLs, nos grupos de ligação MGL D2, MGL L e MGL C22 os quais explicam 7,8% e 8,1% e 7,4%, respectivamente, para as famílias cultivadas em Cascavel. Para as famílias cultivadas em Viçosa foram identificados nove marcadores e mapeado um QTL, no grupo de ligação MGL 3, que explica aproximadamente 16,7% da característica. Estudos posteriores deverão ser conduzidos, visando aumentar o grau de saturação do mapa. Isto poderá permitir a identificação de novos QTLs que determinem um maior porcentagem da expressão da característica. / The present work aimed at increasing the number of markers in the soybean linkage map built by the Bioagro/UFV breeding program for soybean quality. It also aimed at identifying QTLs (Quantitative Trait Loci) governing protein accumulation in the seed. RAPD molecular markers and microsatellites which had not been mapped before were added to the original map. One hundred and eighteen recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross between the north american variety BARC-8 (with high protein content) and the Brazilian variety Garimpo (with normal protein content) were used. Initially 1,200 RAPD primers were tested. One hundred and twenty seven of them showed polymorphism between the progenitors and 65 of these showed polymorphism among the RILs. All 65 markers segregated according to the expected 1:1 ratio as indicated by the chi-square test. Twenty four linkage groups with a low saturation level (75 markers) were obtained. Seventy other markers were not mapped in the linkage groups. Regression analyses and composed interval mapping identified 11 markers and three QTLs associated with “protein content” were mapped. These QTLs were located in the linkage groups MGL D2, MGL L and MGL C22 and explained 7.8, 8.1 and 7.4% of variation of this trait, respectively in the lines grown in Cascavel (state of Paraná). For the lines grown in Viçosa (state of Minas Gerais) nine markers were idenfied and one QTL was mapped to linkage MGL 3, and it explained 16.7% of the trait variation. Further studies should be conducted to increase the saturation level of the map. This should allow the identification of new QTLs which might explain a higher percentage of the variation of the protein content in soybean seeds. / Dissertação importada do Alexandria
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Melhoramento genético do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) para alto teor de proteínas / Genetic improvement of common bean (Phaseolus vulgaris L.) for high protein content

Silva, Maguida Fabiana da 18 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:25:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 314241 bytes, checksum: 482f255a265e7117d2b92fc2816fc6a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:25:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 314241 bytes, checksum: 482f255a265e7117d2b92fc2816fc6a0 (MD5) Previous issue date: 2004-02-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O feijão é um dos constituintes básicos da dieta do brasileiro, além de ser um produto agrícola de grande valor econômico-social. Neste sentido, para atender as exigências dos consumidores, os programas de melhoramento começam a voltar atenção para características de qualidade do grão. Este trabalho faz parte do programa de melhoramento de qualidade do feijoeiro desenvolvido pelo BIOAGRO/UFV em parceria com a Embrapa - Arroz e Feijão e visa o aumento do teor de proteínas nos grãos do feijoeiro por meio de retrocruzamentos assistidos por marcadores moleculares. Foram utilizadas as variedades Baliza, Laranja, Gaurama e PVA 109 como fontes doadoras de genes para alto teor de proteína e a linhagem CNFC 7827 como genitor recorrente. Para atingir este objetivo as seguintes etapas foram realizadas: (a) realização de cruzamentos entre genótipos de alto teor de proteína com uma linhagem elite; (b) análise do teor de proteína de cerca de 400 sementes segregantes (F 2 ) de cada cruzamento por método não destrutivo; (c) seleção das sementes com maior teor de proteína de cada cruzamento (intensidade de seleção de 10%); (d) realização de fingerprinting das plantas F 2 selecionadas com marcadores RAPD; (e) retrocruzamentos de todas as plantas F 2 selecionadas com o genitor recorrente; (f) confirmação do teor de proteína pelo método Kjeldahl nas sementes F 2:3 ; (g) seleção das plantas RC 1 F 1 com base nos resultados de distância genética determinada com marcadores moleculares e o teor de proteína das plantas F 2 selecionadas e confirmadas na geração F 2:3 . Todas as populações tiveram herdabilidades altas variando de 58 a 77 %, o que sugere que são adequadas para obter alta eficiência de seleção ou estudos de mapeamento para a característica teor de proteína. Os ganhos gerais variaram e - 0,95 a 4,26%, este resultado indica que a seleção em F 2 tem baixa eficiência quando utilizada isoladamente. Entretanto, a ampla variação do teor de proteína em progênies F 2:3 e as porcentagens de ganho observadas (13,66 a 25,84% considerando as cinco progênies de maiores teores) demonstram que o processo de transferência de genes para alto teor protéico por meio de retrocruzamentos é eficiente quando baseado na pré-seleção de sementes F 2 e posterior seleção das melhores famílias F 2:3 . A seleção em geração F 2 com auxílio de micro análise não destrutiva foi pouco eficiente para a população derivada do cruzamento Laranja x CNFC 7827. Fatores como o efeito de dominância e interações genótipo x ambiente diferenciadas causaram dificuldades na seleção dos genótipos superiores. Em vista deste resultado, modificações no método de seleção utilizado podem ser propostas visando aumentar sua eficiência. Os ganhos de seleção para teor de proteína com o auxílio de marcadores moleculares variaram entre 9,92 a 15,65%. As plantas F 2 das diferentes populações apresentaram distância genética em relação ao progenitor recorrente bastante variável. Foi possível obter ganhos de similaridade em relação à média de similaridade encontrada nas populações F 2 variando de 12 a 16%. Com a utilização indivíduos selecionados de alto teor de proteína mais próximos ao genitor recorrente o número de retrocruzamentos necessários para recuperar o genoma do mesmo deve ser menor. / The common bean is one of the most important component of the brazilian diet, in addition, is an agricultural product of great economic and social importance. In this sense, to attend the consumers exigencies, the breeding programs start to give attention for quality traits of the grain. This work is part of the quality bean breeding program being developed by BIOAGRO/UFV in partnership with Embrapa - Rice and Bean center and aims to increase the common bean protein content by means of backcrosses assisted by molecular markers. There were used the varieties Baliza, Laranja, Gaurama and PVA as gene donors for high protein content and the CNFC 7827 as recurrent genitor. To achieve this goal, specific steps were reached: (a) crossings high protein content genotypes with an elite cultivar (b) analysis of protein content of 400 F 2 seeds from each cross by using non-destructive method; (c) selection of seeds with high protein content from each cross (selection intensity of 10%); (d) fingerprinting the F 2 selected plants with RAPD markers; (e) backcrosses the selected F 2 plants with the recurrent genitor; (f) confirmation the protein content in the F 2:3 seeds by the Kjeldahl method; (g) selection and planting the RC1F1 based on genetic distances, obtained with molecular markers, and protein content of the F 2 plants selected and confirmed in the F2:3. All the populations had a high heritability varying from 58 to 77%, which suggested that they are adequate for selection or protein mapping loci. The general gains varied from - 0.95 to 4.26%, which indicates that the selection in F 2 has low efficiency when used isolated. However, the wide variation of protein content in F 2:3 and the gains observed (13,66 to 25,84% considering the five F 2:3 of high protein contents) demonstrate that the genes transfer process for high protein content by backcrosses is efficient when based on pre-selection of F 2 seeds and posterior selection of the best F 2:3 families . The selection gains for protein using molecular markers varied from 15.65 to 9.92%. The F 2 plants of the different populations had genetic distances regarding the recurrent genitor highly variable. It was possible to obtain similarity gains, regarding the similarity average found in the F 2 populations, varying from 12 to 16%. With the utilization of selected individuals of high protein content and genetically closer to the recurrent progenitor the number of backcrosses necessary to recover the genome of the recurrent should be smaller.
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Caracterização da diversidade genética de ovinos no Brasil com quatro técnicas moleculares / Genetic characterization of Brazilian sheep breeds by means of four molecular techniques

Paiva, Samuel Rezende 14 December 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-06T11:18:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 909512 bytes, checksum: 95d360795ba1a42ae10b3949c99caca0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T11:18:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 909512 bytes, checksum: 95d360795ba1a42ae10b3949c99caca0 (MD5) Previous issue date: 2005-12-14 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os ovinos foram introduzidos no Brasil principalmente pelos portugueses e espanhóis durante o processo de colonização. Por motivos sócio-culturais, a criação desses animais foi considerada no Brasil uma atividade de categoria inferior, de modo que foram criados somente para subsistência. Esse descaso fez com que os produtos derivados de ovinos (lã, carne, pele) perdessem competitividade frente aos produtores de outros países. Para que ocorra uma mudança desse cenário, é necessária uma profunda modificação logística de todas as classes envolvidas na produção de ovinos, visto que os ovinos representam, principalmente nas regiões Sul e Nordeste, uma fonte de recursos importante do ponto de vista social, cultural e histórico. O objetivo desse trabalho foi realizar um conjunto de técnicas moleculares que permitam a caracterização genética das principais raças e/ou estoques de ovinos naturalizados do Brasil de modo a.oferecer subsídios para a elaboração de programas estratégicos de conservação e melhoramento desta espécie. Foram utilizadas quatro classes de marcadores moleculares (RAPD, microssatélites, sequenciamento do DNA mitocondrial e do cromossomo Y) em até 11 raças de ovinos naturalizadas e comerciais existentes no Brasil. Os resultados permitiram identificar padrões de estruturação genética existentes nessa espécie no Brasil, bem como demonstraram a viabilidade de aplicação de marcadores moleculares para: 1) monitoramento genético de rebanhos; 2) testes de exclusão de paternidade para controle de pedigrees; 3) origem geográfica de raças ou populações; 4) inferências filogenéticas intra- específicas. / In Brazil, sheep breeds were introduced during the colonization process by Spanish and Portuguese settlers. Social and cultural factors determined that sheep rearing was considered a low-status activity, and therefore, sheep were raised only to meet subsistence goals. The outcome of this is that products derived from sheep such as wool, meat and hides are non competitive in the international market. A change of this scenario requires a profound logistic alteration involving all sheep production-related groups, particularly in the northern and southern regions in the country, where sheep are of high cultural, social and historical relevance. The objective of this work was to characterize the main naturalized Brazilian sheep breeds using molecular markers. Our results will be a baseline for the development of management and conservation programs. Four kinds of molecular markers were used (RAPD, microsatellites, and sequences of mtDNA and Y chromosome) and were applied on 11 breeds of naturalized and commercial breeds. Results identified the genetic structure of the species in the Country and demonstrated the efficiency of molecular markers for 1) herd genetic monitoring, 2) paternity (exclusion) analyses, 3) for determining the geographic origin of breeds and populations, and 4) for investigating within-species phylogenies.
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Quantificação da severidade, herança da resistência e identificação de marcadores RAPD ligados à resistência à ferrugem (Puccinia psidii) em Eucalyptus grandis / Rust (Puccinia psidii) severity evaluation, inheritance of resistance and identification of RAPD markers linked to resistance in Eucalyptus grandis

Junghans, Davi Theodoro 14 July 2000 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-21T12:44:11Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 533052 bytes, checksum: b0aaa088353b0a9f7705de0705d1f822 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T12:44:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 533052 bytes, checksum: b0aaa088353b0a9f7705de0705d1f822 (MD5) Previous issue date: 2000-07-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Utilizando o tamanho das pústulas e o número de soros como critérios para avaliar a severidade, estabeleceu-se a seguinte escala de notas para quantificação da ferrugem em mudas inoculadas de Eucalyptus: S0 = imunidade ou reação de hipersensibilidade, com necrose ou “fleck”; S1 = pústulas puntiformes, < 0,8 mm de diâmetro, com uma ou duas uredínias; S2 = pústulas medianas, de 0,8 a 1,6 mm de diâmetro, com aproximadamente 12 uredínias; e S3 = pústulas grandes, > 1,6 mm de diâmetro, com 20 ou mais uredínias. Aferiu-se a utilidade dessa escala utilizando marcadores RAPD, geneticamente ligados a um gene de resistência à ferrugem, em uma progênie de E. grandis. Plantas das classes S0 e S1 apresentaram os referidos marcadores e foram consideradas resistentes. Plantas das classes S2 e S3 não apresentaram aqueles marcadores e foram consideradas suscetíveis. O erro na classificação entre plantas resistentes e suscetíveis foi apenas de 8%, o que se deveu à proximidade dos limites superior e inferior no tamanho das pústulas das classes S1 e S2, respectivamente. O uso dessa escala permitiu a seleção de grande número de materiais resistentes à ferrugem com relativas rapidez, facilidade e precisão. Mediante a inoculação artificial e a avaliação da severidade entre os 12 e 24 dias após a inoculação em famílias de irmãos- completos de E. grandis, identificou-se, no clone G21, um gene de efeito principal na resistência à ferrugem, aqui denominado Ppr1 (Puccinia psidii resistance, gene 1). A inclusão de plantas da classe S1 entre as plantas resistentes indicou que, além de Ppr1, outros genes de efeito secundário podem atuar na resistência à ferrugem. Esse foi o primeiro caso de identificação de um gene de resistência à ferrugem em Eucalyptus e um dos poucos genes de efeito principal em patossistema não co-evoluído. Utilizando uma progênie de E. grandis, constituída de 994 indivíduos segregantes para resistência à ferrugem, identificaram-se seis marcadores RAPD ligados ao gene Ppr1. O marcador AT9/917 apresentou completa co-segregação com o gene Ppr1 em todas as plantas segregantes avaliadas, indicando localizar-se a uma distância genética máxima estimada de 0,462 cM de Ppr1. Esse marcador foi clonado e seqüenciado, não revelando homologia significativa com seqüências depositadas em bancos de dados. No entanto, esse marcador poderá ser utilizado na clonagem posicional de Ppr1. / Based on the number of sorus and pustule size, a rating scale was developed for evaluation of rust severity in inoculated seedlings of Eucalyptus as follow: S0 = immunity or hypersensitive reaction, with necrosis or fleck; S1 = small pustules, < 0,8 mm diameter, with one or two uredinia; S2 = medium sized pustules, from 0,8 to 1,6 mm diameter, with approximately 12 uredinia and S3 = large pustules, > 1,6 mm diameter, with 20 or more uredinia. Plants belonging to S0 and S1 classes were considered resistant and those belonging to S2 and S3 classes, susceptible. The error in the classification of resistant and susceptible plants was of only 8%. The error is due to similarities in pustule size among plants at the upper limit in the S1 class with plants at the lower limit in the S2 class. The use of this scale allows the screening of rust resistant genotypes. The segregation ratio of resistant to susceptible plants in artificially inoculated E. grandis full-sib progenies suggested that rust resistance is controlled by a major gene, designated Ppr1 (after Puccinia psidii resistance, gene 1). Inclusion of plants belonging to S1 class suggests that, besides Ppr1, other genes of minor effect can be involved in rust resistance. This is the first case of a resistance gene identified in Eucalyptus and one of the few of single inheritance in non-coevolved pathosystems. Using a full-sib progeny of 994 individuals of E. grandis, six RAPD markers linked to the Ppr1 gene were identified. The AT9/917 marker was tightly linked to Ppr1 gene, although sequence does not reveal homology with previously characterized resistance genes in other plant species. This marker can be used as a starting point to positional cloning of Ppr1. / Tese importada do Alexandria
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Influência de obstáculos naturais na divergência de populações de Astyanax bimaculatus na bacia do rio Doce - MG / Geographic isolation and patterns of variation of Astyanax bimaculatus (Pisces, Characidae) in the Doce river basin (State of Minas Gerais)

Paiva, Samuel Rezende 13 August 2001 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-28T14:21:26Z No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 359561 bytes, checksum: e76fd23ea8e153e98766f8431f0a7c31 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-28T14:21:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 359561 bytes, checksum: e76fd23ea8e153e98766f8431f0a7c31 (MD5) Previous issue date: 2001-08-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com o objetivo de avaliar os efeitos de obstáculos naturais na estruturação de populações em espécies de peixes de pequeno porte, foram analisados os padrões de semelhança molecular (marcadores do tipo RAPD- PCR) e morfológica (caracteres morfométricos e merísticos) em cinco amostras (cada uma de N=50) isoladas por cachoeiras ou barragens da espécie Astyanax bimaculatus (lambari-de-rabo-amarelo, tambiú), em dois afluentes do rio Doce, Minas Gerais (rios Casca e Matipó). Uma amostra adicional em outro afluente do rio Doce (rio Santo Antônio) foi realizada como controle para estimar os parâmetros de divergência genética na bacia. O padrão de variação de 28 loci permitiu caracterizar uma perda de alelos (25% dos loci) no rio Casca e conseqüente diminuição da variabilidade intrapopulacional (menor índice de heterozigosidade e porcentagem de loci polimórficos) em relação aos outros afluentes. No nível interpopulacional foi observado uma diferenciação genética significativa entre todos os três afluentes do rio Doce analisados (p<0,00001), com 21% da variância total obtida na AMOVA observada entre esses três afluentes (p<0,01806). Apenas uma das barreiras geográficas analisadas (localizada no rio Casca) foi efetiva populações à jusante e à montante (p<0,0016). na diferenciação das No rio Matipó, as populações localizadas à jusante e à montante da barragem são geneticamente similares (p<0,6469), e subsidiam a recomendação de adoção de mecanismos de transposição naquele empreendimento, para permitir a continuidade de fluxo gênico. No rio Casca, o padrão de variação de dois caracteres merísticos corroboraram os resultados das análises moleculares. Contudo, a Análise Discriminante Independente do Tamanho realizada com os 15 caracteres morfométricos não foi capaz de diferenciar claramente as populações, o que sugere a presença de apenas uma espécie do complexo A. bimaculatus na bacia do rio Doce. Com base nos dados, pode-se concluir que a diferenciação genética e morfológica de A. bimaculatus do rio Doce não está necessariamente associada à presença de cachoeiras, e que depende de fatores demográficos e/ou históricos dos obstáculos geográficos. / To evaluate the effects of natural barriers in the process of population structure of small-sized species, it was carried out analyses on molecular similarity (with RAPD-PCR markers) and morphologic patterns (morphometric and meristic characters) in five samples (each 2n=50) isolated by waterfalls and dams Astyanax of bimaculatus (lambari-de-rabo-amarelo, tambiú) in two tributaries of the rio Doce basin, State of Minas Gerais (rio Casca and rio Matipó). An additional sample from Santo Antonio was added to the analysis for a broader overview of genetic divergence in the basin. The rio Casca was characterized by 25% loss of alleles (out of 28 loci), with decrease of within population levels of variation (lower heterozigosity polymorphic loci) relative to the other samples. index proportion of Genetic differentiation among tributaries was significative (p<0,00001) and represented 21% of total variance (p<0,01806). We concluded that only one of the analyzed barriers (in rio Casca) was an effective factor for the differentiation of populations (p<0,0016). In rio Matipó, the populations were genetically similar (p<0,6469) suggested the need for maintenance of high levels of gene flow. and In rio Casca, the patterns of variation of meristic characters was consistent with molecular data. As a whole, however, the size-independent discriminant analysis based on 15 morphometric characters did not differentiate the populations, showing the existence of only one species of the A. bimaculatus species complex in the rio Doce basin. The pattern of variation of data suggested that the genetic and morphologic variation of A. bimaculatus in the rio Doce basin was not necessarily associated to waterfalls and that they instead result as an interaction of demographic and historic factors associated to geographic obstacles.
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Estudo de herança e de marcadores moleculares para teor de ácido Iinolênico em soja / Inheritance studies and molecular of linolenic acid content in soybean seeds

Gesteira, Abelmon da Silva 28 June 1997 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-10T19:50:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 9708946 bytes, checksum: 640b45368bb37ece3d264e629a2ce731 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-10T19:50:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 9708946 bytes, checksum: 640b45368bb37ece3d264e629a2ce731 (MD5) Previous issue date: 1997-06-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A redução do teor de ácido linolênico em soja está associado com a estabilidade oxidativa e melhoria do sabor do óleo. O acesso BARC-12, que possui baixo teor de ácido linolênico (3% em média), foi cruzado com o cultivar comercial CAC-1 (8.5 em média). Analises da composição dos ácidos graxos de sementes dos progenitores e da gerações F1, F2, 9 F3 foram deterrninadas por cromatografia a gás, de forma não destrutiva. Os estudos de herança indicam que o teor de ácido Iinolênico é controlado por dois genes de efeito maior. Contudo, a distribuição continua observada em sementes F2 e em familias F3 sugere que genes de efeito menor também estao envolvidos. As gerações F1, F2, e F3 também foram utilizadas para se estimarem alguns parâmetros genéticos. Análises quantitativas indicam que poucos genes com efeitos aditivos controlam o caráter em questão e que seus efeitos são principalmente aditivos. As estimativas de herdabilidade foram altas, possibilitando identificar, com precisão, os individuos desejados na população segregante, em gerações precoces. A metodologia “Bulked Segregant Analysis” foi utilizada para identificar marcadores RAPD Iigados a genes que determinam teor de ácido Iinolênico. Os 1000 “primers” aleatórios testados não detectaram nenhum polimorfismo de DNA que estivesse associado aos genes que controlam o baixo teor de ácido Iinolênico. / Genetic reduction of Iinolenic acid content in the soybean oil is considered to be important in order to increase oil stability and flavor. In this work, BARC-12 (an accession from USDA, USA), that contain low level of linolenic acid (3% on average), was crossed to the brazilian commercial variety CAC-t (8.5% on average). Fatty acid composition of the oil fraction extracted from F1, F2, and F3 seeds, by a non-destructive single seed analysis, was determined by gas chromatography. Inheritance studies indicated that Iinolenic acid levels are under the control of two independent major genes. However, the continuous distribution observed for Iinolenic acid content in F2 seeds and in F3 derived families suggested that minor genes also are involved. Quantitative analysis indicated that linolenic acid content in soybean is under the control of a low number of genes with additive effects. Stimated coefficient of heritabilities were high, indicating to be feasible to follow the character in individuals of segregant populations. Bulked segregant analysis was used to identify RAPD markers linked to gene(s) that determine low level of Iinolenic acid in F2 population from the cross CAC-1 x BARC 12. However, after testing 1000 primers, we were not able to find a RAPD marker linked to low Iinolenic acid in this cross.
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Mapeamento genético do cacaueiro e identificação de QTLs para resistência à vassoura-de-bruxa / Cocoa genetic mapping and QTL identification to withes’ broom resistance

Queiroz, Vagner Tebaldi de 18 October 1999 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-09-23T17:25:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 712974 bytes, checksum: 2b6cc94c42dae05b9cc95ca1bdc6de6f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-23T17:25:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 712974 bytes, checksum: 2b6cc94c42dae05b9cc95ca1bdc6de6f (MD5) Previous issue date: 1999-10-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Uma progênie de 82 indivíduos F2, obtida do cruzamento entre Scavina-6 e ICS-1, foi analisada utilizando marcadores moleculares. Por meio das técnicas de RAPD e AFLP, foram amplificados 196 fragmentos polimórficos, que foram distribuídos em 26 grupos de ligação. Estes marcadores cobriram uma distância de recombinação de 1.733 cM, com distância média entre dois marcadores adjacentes de 8,84 cM. Análises de regressão simples e múltipla e mapeamento por intervalo foram utilizados para detectar e mapear regiões genômicas associadas com a resistência à vassoura-de-bruxa. A proporção da variância fenotípica explicada por marcador variou entre 8,4%, para o loco iacacac.261, e 12,7%, para o loco sacgcat.78. Dos seis marcadores associados à resistência à vassoura-de-bruxa a 1% de probabilidade, os marcadores iAE06.950, saggcat.108 e iAB09.464 foram mantidos no modelo de regressão múltipla, utilizando o método de eliminação stepwise. Os três marcadores explicaram juntos 27,8% da variação fenotípica. Através do mapeamento por intervalo, foram identificadas associações significativas a 5% de probabilidade, nos grupos de ligação 01 e 11. No grupo de ligação 01 foram identificados três QTLs, flanqueados pelos marcadores iaagctc.65 - iBB12.1100, iAH18.850 - iBG09.580 e iAC01.475 - iAS19.970. O grupo 11 apresentou dois QTLs altamente significativos (P < 0,01) entre os marcadores saggcat.108 - sAV14.940 e sAV18.590 - sZ04.500. Os marcadores identificados pela análise de regressão múltipla também o foram pelo mapeamento por intervalo, com exceção do marcador iAB09.464, que não se encontra ligado no mapa de ligação construído no presente trabalho. / An F2 progeny composed by 82 individuals derived from a cross between Scavina-6 and ICS-1 was analyzed using molecular markers. RAPD and AFLP techniques amplified 196 polymorphic fragments distributed along 26 linkage groups. These markers covered a recombination distance of 1,733 cM, with an average of 8.84 cM between two linked markers. Simple and multiple regression analysis, and interval mapping were used to identify and to map genomic regions associated with witches’ broom resistance. The proportion of phenotypic variation explained by each marker varied from 8.4%, for iacacac.261 loci, to 12.7%, for sacgcat.78 loci. Out of the six markers associated with witches’ broom resistance at 1% of probability, only the markers iAE06.950, saggcat.108 and iAB09.464 were mantained on the multiple regression model using the stepwise elimination method. The three markers explained together 27.8% of the phenotypic variation. Interval mapping analysis detected significative associations in the linkage groups 01 and 11 at 5% of probability. In the linkage group 01 were identified three QTLs, flanked by the markers iaagctc.65 - iBB12.1100, iAH18.850 - iBG09.580 and iAC01.475 - iAS19.970. The linkage group 11 showed two QTLs highly significant (P < 0,01) between the markers saggcat.108 - sAV14.940 and sAV18.590 - sZ04.500. Markers identified by multiple regression analysis were also detected by interval mapping, except for the marker iAB09.464 that were not linked on the genetic map performed in this work.

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