Orientador: Robinson Antonio Pitelli / Banca: Janete Apparecida Desidério Sena / Banca: Ricardo Victoria Filho / Resumo: Estudos laboratoriais foram realizados com o objetivo de estudar a caracterização genética de plantas de Euphorbia heterophylla, provenientes de áreas em que a resistência aos herbicidas inibidores da ALS (Acetolactase) estava caracterizada (Santo Ângelo, RS), em processo de desenvolvimento (Sonora, MS) e onde nunca havia sido aplicado herbicida com este mecanismo de ação (Jaboticabal, SP). Testes preliminares comprovaram elevada resistência para as plantas provenientes de Santo Ângelo, moderada resistência para plantas de Sonora e elevada susceptibilidade para plantas provenientes de Jaboticabal. A análise dos resultados através das isoenzimas revelou que existem pequenas diferenças entre as três populações estudadas. A análise do DNA dos indivíduos das diferentes populações através de marcadores moleculares RAPD, permitiu a construção do Dendrograma de Cluster, que mostra uma similaridade mínima de 88% e máxima de 99% entre os diferentes indivíduos, quer pertencentes à mesma população, quer pertencentes às diferentes populações. Tal análise permitiu inferir que, apesar dos indivíduos analisados mostrarem grande similaridade entre si, apresentam variabilidade genética entre os indivíduos e as populações estudadas, de acordo com a conclusão obtida quando da utilização das isoenzimas. Crescendo em condições similares, o biótipo da Santo Ângelo apresentou maior absorção de fósforo em comparação com os demais, e maior absorção de potássio em relação ao biótipo de Jaboticabal. Comparando a densidade estomática, houve diferença estatística entre os três biótipos, sendo maior para o biótipo mais tolerante ao herbicida e menor para o susceptível. Não foi possível estabelecer qualquer relação confiável entre as características morfológicas e de crescimento das plantas e a resistência ao imazethapyr. / Abstract: Laboratory studies were carried out aim to characterize genetically Euphorbia heterophylla plants were collect in three regions. At Santo Ângelo (RS) region this plant is highly resistant to ALS inhibitors herbicides, but moderately at Sonora (MS) and susceptible at Jaboticabal region. Greenhouse tests confirmed the plants reaction in face of imazethapyr spraying. The isoenzymes studies showed small differences between the three populations. The DNA analysis using molecular markers make feasible the Cluster dendrogram showing 88-99% of similarity comparing plants, regardless the plant origin. Besides the high similarity index between the plants, it was possible to determine lower genetic variation in Jaboticabal and Santo Ângelo populations using isoenzymes technique. The nitrogen and potassium contents in the plants shoot was higher in the Santo Ângelo byotipe, although there was no difference between the K contents when the Jaboticabal and Sonora byotipes were compared. The stomata and trichomes densities decreased in the same order of the plant tolerance to herbicide: Santo Ângelo > Sonora > Jaboticabal. None correlation between biotype resistance to imazethapyr and the plant morphology features for the three biotypes studied. The differences in the plant feature may be attributable to the adaptative mechanism of the plant to the regional characteristics they were collected. / Mestre

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:39:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Juliana Rosa Ramos.pdf: 17613343 bytes, checksum: 68ed1271f638431652b7a38e62ad7129 (MD5) Previous issue date: 2008-08-12 / O cerrado é um dos ecossistemas mais ricos do mundo em diversidade, possuindo um grande número de espécies endêmicas, como é o caso de Tibouchina papyrus. Entretanto, os estudos sobre essa grande riqueza ainda deixam a desejar. Por isso, tornase necessário a realização de estudos em todas as áreas da biologia das espécies, possibilitando planejamentos mais efetivos de conservação. Nesse contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar a repetibilidade de marcadores RAPD e caracterizar a variabilidade genética intrapopulacional de T. papyrus (pau-papel), com endemismo nos campos rupestres do cerrado. Para tanto, foram utilizados seis iniciadores RAPD e 207 plantas, distribuídas em três subpopulações. A análise de repetibilidade foi realizada utilizando-se a matriz contendo o total de locos produzidos, com base em um algoritmo de otimização (simulated annealing), para definir soluções que contemplassem o número mínimo de indivíduos que apresentassem todos os locos. Os indivíduos de uma das soluções foram escolhidos para a realização de uma nova PCR, para cada um dos iniciadores RAPD, produzindo uma nova matriz de dados binários, contendo somente os locos que repetiram. Os resultados mostraram que as subpopulações de T. papyrus (pau-papel) exibiram consideráveis níveis de variabilidade genética, tanto com base na matriz contendo o total de locos (176), quanto aquela com os locos RAPD com repetibilidade (147). De uma maneira geral, todos os parâmetros genéticos estimados, com base nas duas matrizes e com diferentes metodologias de análise se apresentaram muito semelhantes, exibindo uma média de 95% dos locos polimórficos, valores de diversidade média igual a 0,351e coeficiente de endogamia igual a 0,962. Além disso, foi possível verificar que existe uma elevada estruturação da variabilidade genética nessas subpopulações de T. papyrus (18%), uma vez que duas dessas subpopulações estão muito próximas geograficamente. A análise de repetibilidade indica que a técnica de RAPD, quando bem padronizada, permite a obtenção de resultados robustos, uma vez que a taxa de repetibilidade dos locos é relativamente alta, com 84% de reprodutibilidade. O índice de agregação (R), nas três subpopulações, menores que 1, indica que há uma distribuição em agregados das plantas de T. papyrus. O padrão espacial intrapopulacional da variabilidade genética, nas subpopulações, revelou a formação de patches de indivíduos geneticamente mais similares, gerado por um padrão de diferenciação de isolamento-por-distância ou stepping-stone. As diferenças nos tamanhos dos patches sugere que os processos de polinização e dispersão atuam ligeiramente diferente entre as subpopulações, produzindo padrões espaciaos similares, com escalas geográficas variáveis. Considerando as informações sobre a biologia reprodutiva da espécie, os valores elevados de endogamia podem ser explicados por um balanço entre autofecundação e fecundação cruzada entre indivíduos aparentados. Outro argumento que corrobora com essa argumentação é o fato dos frutos serem rompidos com facilidades (autocoria), seguido de uma dispersão secundária pelos ventos fortes (anemocoria) que ocorrem nessas regiões, gerando agrupados de indivíduos aparentados.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 keithcassiadacunha_dissert.pdf: 1691081 bytes, checksum: fab0d44d3deb2f20e40bba856dd1b78f (MD5) Previous issue date: 2010-04-16 / Candida albicans is widely recognized as the pathogen often occurring in vulvovaginal candidiasis. Objective: To compare the genotypes, among infection or colonization and recurrent isolates, with virulence determinants (phospholipase, proteinase, amylase, gelatinase, haemolysin, thermotolerance and biofilm), and to in vitro antifungal susceptibilities. Methods: 317 samples of vaginal fluid of were collected from women with or without symptomatic indications to VVC, including vaginal itching, abnormal discharge, soreness and dyspareunia to mycological investigation. The antimicrobial susceptibility was evaluated for 4 drugs (fluconazole, Itraconazole, ketoconazole and amphotericin B, by dilution method (M27A2- CLSI). Yeasts were subjected PCR (polimerase chain reaction), RAPD (randomly amplified polymorphic DNA), and to RFLP (Restriction fragment lenght polymorphic), this last one, used for identification of Candida dubliniensis. Results: Considering the prevalent species, C. albicans showed high rates of significant sensitivity to azoles and the vast majority of produced virulence factors, regardless of their origin, infection or colonization. Statistical analysis enabled identification of 17 clusters with identical genetic identity, and other moderately related, or unrelated. Conclusions: There was no correlation between the genetic patterns with virulence and antimicrobial susceptibility for all isolates, suggesting that, the amplified genetic regions do not match with variables and might be related to other biological events. The inclusion of other primers could allow higher association among C. albicans strains. / Candida albicans é amplamente reconhecida como patógeno, ocorrendo freqüentemente em candidíase vulvovaginal. Objetivos. Comparar os genótipos entre os isolados de infecção, colonização e isolados recorrentes com os determinantes de virulência (fosfolipase, proteinase, amilase, gelatinase, hemolisina, termotolerância e biofilme) e susceptibilidade antifúngica in vitro. Material e Método. 313 amostras de fluido vaginal foram coletadas de mulheres com ou sem indicações sintomáticas para candidíase vulvovaginal (CVV), como prurido vaginal, corrimento, ardência e dispareunia. A susceptibilidade antimicrobiana foi avaliada frente a quatro drogas (fluconazol, itraconazol, cetoconazol e anfotericina B), determinada pelo método de diluição (M27A2-CLSI). As leveduras foram submetidas ao PCR (polimerase chain reaction), RAPD (randomly amplified polymorphic DNA), e ao RFLP (Restriction fragment lenght polymorphic), este último, utilizada para a identificação de Candida dubliniensis. Resultados. Considerandose a espécie prevalente, C. albicans mostrou taxas elevadas de sensibilidade significativos aos azólicos e, a grande maioria, produziu vários fatores de virulência, independente de sua origem, infecção ou colonização. A análise estatística permitiu a identificação de 17 clusters com identidade genética idêntica, e outros moderadamente relacionados, ou independentes. Conclusão. Não houve correlação entre os padrões genéticos com a virulência e susceptibilidade antimicrobiana, sugerindo que as regiões genéticas amplificadas estão relacionadas a outros eventos biológicos; a inclusão de outros primers poderá permitir uma associação maior entre os isolados de C. albicans.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-27Bitstream added on 2014-06-13T20:48:48Z : No. of bitstreams: 1 massago_h_me_jabo.pdf: 505723 bytes, checksum: 1b1f4ab5136c45685bc1851b627e27fc (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Este trabalho teve como objetivo verificar o desempenho inicial de quatro linhagens comerciais de Oreochromis niloticus denominadas Bouaké, GIFT, Supreme e Chitralada, com ênfase no ganho em peso e sobrevivência. Utilizou-se os alevinos revertidos com o peso médio de um grama. O experimento foi conduzido em sistema fechado durante 112 dias, com biometrias realizadas a cada 28 dias. Inicialmente eram mantidos 38 peixes por 120 L em cada caixa e, após 84 dias, 13 peixes por 180 L. A qualidade da água foi avaliada através dos seguintes parâmetros: temperatura, oxigênio dissolvido (OD) e Potencial Hidrogeniônico (pH). Forneceu-se inicialmente a ração em pó com 45% de proteína bruta e, depois, a ração extrusada contendo 40% do mesmo nutriente. Os pesos médios finais das linhagens Bouaké, GIFT, Supreme e Chitralada foram 98,83 g, 121,46 g, 133,20 g e 112,89 g, respectivamente. As linhagens Supreme e GIFT apresentaram melhor desempenho, sendo que o desempenho da linhagem GIFT foi semelhante ao da Chitralada. O desempenho da linhagem Bouaké não diferiu da Chitralada (p<0,05). A taxa de sobrevivência (acima de 80%, com exceção da Bouaké) pode ser considerada normal. / This work aimed to verify the initial performance of four commercial Oreochromis niloticus strains named Bouaké, GIFT, Supreme and Chitralada, with special attention on the weight gain and survival rates. Tilapia fingerlings, post reversion with mean weight of one gram were used. The experiment was carried out in a closed system of Tilapia laboratory of CAUNESP, during 112 days, and biometries for performance evaluation have been done every 28 days. Water quality was evaluated through the following parameters: temperature, dissolved oxygen and pH value. Feeding was initially with powdered ration with 45 % crude protein, and after three weeks, with extruded ration with 40% crude protein. The final mean weight of the Bouaké, GIFT, Supreme and Chitralada strains were 98.83g, 121.46 g, 133.20 g and 112.89 g, respectively. Supreme and GIFT strains presented better performance, and the GIFT and Chitralada strains were similar too (p<0.05). Survival rate was considered normal (above 80%), with the exception of Bouaké strain.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-10T14:18:44Z No. of bitstreams: 1 Gabriela de Morais Guerra Ferraz.pdf: 1062151 bytes, checksum: b0123f5d7101341f981de975826dc25b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T14:18:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gabriela de Morais Guerra Ferraz.pdf: 1062151 bytes, checksum: b0123f5d7101341f981de975826dc25b (MD5) Previous issue date: 2008-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Northeast of Brazil, major national producer of bananas, presents as a major limiting factor the stretch of saline soil. The urgency in the development of tolerant cultivars to salinity has led to breeding programs with the aimed to differ the bananas cultivars in diploid genotypes tolerant and sensitive, to be considered viable genetic material for pollination of triploid and tetraploid cultivars. Generally, the present study aimed to characterize diploid genotypes belonging to the AA banana genomic group on salinity and identify genes differentially expressed in contrasting genotypes. At first, this research assessed the growth and accumulation of inorganic ions in 19 diploid genotypes (AA) of bananas subjected to salt stress. The genotypes were grown in a greenhouse and submitted to irrigation with no saline water (0 mM NaCl) or with saline water (100 mM NaCl) for a period of 21 days, when the experiment was collected. To the physiological evaluation, were considered the parameters of growth:leaf area, height, number of leaves, diameter of the pseudostem, weight of the tax burden of fresh and dry, while the chemical assessment observed the concentration of sodium ions, potassium, chloride, magnesium and calcium in limbo leaf, and root pseudostem / subroot. The addition of NaCl to the cultivar solution has, in general, reduced the growth expressed by height, formation of new leaves, leaf area, diameter of the pseudostem and production of fresh and dry materials. This reduction in growth probably due to factors such as: the toxic effect of ions that have been absorbed, the low osmotic and water potential of the cells as well as the use of metabolic energy in the process of osmotic adjustment. In assessing chemical factors, it was possible to observe that the ions concentration has been preferentially presented in root tissue, showing that it is a culture moderately tolerant to salinity.The sodium and chlorine ions increased significantly with the salt increase in differentparts of the plant, while potassium suffered reduction in the leaf lamina and the pseudostem probably because it is associated to the competition with the sodium ion leading to the conclusion that the differential accumulation of ions potentially toxic (sodium and chlorine) and the maintenance of potassium, contribute to the tolerance to salinity in banana. From the physiological analysis and by means of the toxicity symptoms caused by NaCl, it was possible to observe that the effects were less intense in Birmania and Khai Nai On genotypes, than in Sowmuk, its indicates the possibility of use of this plants in programmes for cultivars improvement as tolerant and sensitive, respectively. Seven genotypes were selected for characterization by means of molecular markers RAPD, with the aim to link the physiological responses to salt stress with the formation of groups. We tested 16 random primers. The resultsshow a broad molecular genetic variability among seven genotypes studied. The formation of groups, in part is related to the data obtained in the physiological assessment, keeping in the same group the Birmania and Khai Nai On genotypes.These genotypes that showed higher tolerance to salt stress, when compared to the more salt-sensitive genotype (Showmuk), became distant genetically, so, it can be noticed the possibility of use of this molecular marker in the study of genetic diversity for this species. For the genome functional study, or transcriptoma, this study aimed the detection of possible changes in the pattern of genes expressed in the three diploid genotypes (AA) of banana, Khai Nai On, Burma and Sowmuk with contrasting results when in the absence and presence of high salt concentrations. The Differential Display PCR - ddPCR technique was used to identify and compareregions of bands from fragments of cDNA on agarose gel. A total of 43 fragments of differentially expressed cDNA was generated from the combination of four primers anchors and six random primers. Among the transcripts, 30 were once expressed by the genotype Burma and Kha Nai On, and 13 only by Sowmuk genotype. Theregions of bands with greater consistency of formation, is between 4000 bp and 150 bp. By the results of this research, it was possible to identify some fragments potentially involved to the condition of salinity in banana. The isolation, purification and sequencing of these - Expressed sequence tags - ESTs can assist in the development of new varieties of banana, more adapted to salt stress, in addition to enriching the database of public functional sequences of genomes banks. / O Nordeste do Brasil, maior produtor nacional de banana, apresenta como fator limitante a grande extensão de solos salinos. A urgência no desenvolvimento de cultivares tolerantes a salinidade tem levado programas de melhoramento genético da cultura a classificar os genótipos diplóides de bananeira em tolerantes e sensíveis, por serem considerados materiais genéticos viáveis para polinização de cultivares triplóides e tetraplóides. De modo geral, o presente trabalho buscou caracterizar genótipos diplóides pertencentes ao grupo genômico AA de bananeira quanto a salinidade além de identificar genes diferencialmente expressos nos genótipos contrastantes. Na primeira fase desta pesquisa, foi avaliado o crescimento vegetativo e o acúmulo de íons inorgânicos em 19 genótipos diplóides (AA) de bananeiras submetidas a estresse salino. Os genótipos foram cultivados em casa de vegetação e submetidos à irrigação com água não salina (0 mM de NaCl) ou águasalina (100 mM de NaCl) durante um período de 21 dias, quando foi coletado o experimento. Para a avaliação fisiológica, foram considerados os parâmetros de crescimento: área foliar, altura, nº de folhas, diâmetro do pseudocaule, peso da matéria fresca e peso da matéria seca; enquanto que a avaliação química observou a concentração dos íons sódio, potássio, cloro, magnésio e cálcio no limbo foliar, pseudocaule e raiz/rizoma. A adição de NaCl à solução de cultivo, provocou, de modo geral, redução no crescimento expresso pela altura, formação de novas folhas, área foliar, diâmetro do pseudocaule e produção de matéria fresca e seca, provavelmente devido a fatores como: o efeito tóxico dos íons que foram absorvidos; o baixo potencial osmótico e hídrico das células; bem como a utilização de energia metabólica no processo de ajustamento osmótico. Na avaliação química, foi possívelobservar que a concentração dos íons foi preferencialmente no tecido radicular, reafirmando tratar-se de uma cultura moderadamente tolerante a salinidade. Os íonssódio e cloro aumentaram significativamente frente ao incremento salino nas diferentes partes da planta, enquanto o potássio sofreu redução no limbo foliar e no pseudocaule, possivelmente por estar associado a competição com o íon sódio levando a conclusão de que o acúmulo diferencial de íons potencialmente tóxicos (sódio e cloro) e a manutenção do potássio, contribuem para a tolerância à salinidade em bananeira. A partir da análise fisiológica e por meio da sintomatologia de toxidez provocada pelo NaCl, foi possível observar que os efeitos foram menos intensos nos genótipos Birmânia e Khai Nai On, do que no Sowmuk, indicando possíveis plantas a serem utilizadas nos programas de melhoramento da cultura como tolerantes e sensível, respectivamente. Sete genótipos foram selecionados para caracterização por meio de marcadores moleculares RAPD, buscando-se relacionar as respostas fisiológicas ao estresse salino com a formação de grupos.Foram testados 16 primers randômicos. Os resultados moleculares mostram uma ampla variabilidade genética entre os sete genótipos estudados. A formação dos agrupamentos, em parte correspondeu aos dados obtidos na avaliação fisiológica, mantendo em um mesmo grupo os genótipos Birmânia e Khai Nai On. Estes genótipos que apresentaram maior tolerância ao estresse salino, quando comparados com a mais sensível ao sal (Showmuk), mostraram-se distantes geneticamente, o que vem a demonstrar a possibilidade de utilização deste marcador molecular no estudo da diversidade genética para esta espécie. Para o estudo do genoma funcional, ou transcriptoma, o presente trabalho objetivou a detecção das possíveis alterações no padrão de genes expressos nos três genótipos diplóides (AA) de bananeira, Khai Nai On, Birmânia e Sowmuk, com respostascontrastantes quando na ausência e presença de alta concentração salina. A técnica de Differential Display PCR – ddPCR foi utilizada para identificar e comparar regiões de bandas de fragmentos de cDNA em gel de agarose. Um total de 43 fragmentosde cDNA diferencialmente expressos foram gerados a partir da combinação de quatro primers âncoras e seis primers aleatórios. Dentre os transcritos, 30 foram expressos unicamente pelos genótipos Birmânia e Kha Nai On, e 13 apenas pelo genótipo Sowmuk. As regiões de bandas com maior consistência de formação, encontraram-se entre 4000 pb e 150 pb. Pelos resultados deste trabalho, foi possível identificar alguns fragmentos potencialmente envolvidos em respostas à condição de salinidade em bananeira. O isolamento, purificação e sequenciamento destes –Expressed sequence tags - ESTs poderá auxiliar no desenvolvimento de novos cultivares de bananeira, mais adaptados ao estresse salino, além de enriquecer a base de dados de bancos públicos de seqüências de genomas funcionais.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:16:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Jessika Mara Martins Ribeiro.pdf: 4505620 bytes, checksum: 3ace512cbb45ea3a26cc5d88a93ac2b2 (MD5) Previous issue date: 2008-06-24 / Irradiation is a physical process efficiently used in the conservation of foods. The purpose of this study was to investigate the effects of irradiation on the natural mycoflora of poultry feeds and on strains of Aspergillus spp. Maize flour samples, soy crumb and feed were collected directly from the production line of a poultry farm in Avelar, RJ, and exposed to doses of 0, 3.5, 8 and 15 kGy of gamma radiation. Counting, isolation and identification of the contaminant mycoflora were performed before and after irradiation. The radiosensitivity of strains of reference of Aspergillus spp. was determined in CYA medium and in corn for doses ranging from 0 to 8 kGy. Comparisons between the morphologies of control and irradiated strains were performed by using macroscopy, optical microscopy and transmission electron microscopy. Toxigenic profile determination and genetic evaluation by RAPD were also carried out. Higher doses have been found to reduce the number of active colonies, causing elimination of the mycoflora at 8 kGy. A larger radiosensitivity of yeasts was observed in comparison with filamentous fungi. A significant reduction in fungi population occurred at 3.5 kGy to levels below the limit that ensures the hygienic quality of ingredients and poultry feeds. The residual mycoflora was found to decrease with post-irradiation time and included mostly Cladosporium spp., Curvularia spp., Fusarium spp. and Aspergillus spp. and sterility of mycelium prevented further identification of the surviving species of Aspergillus spp. Differences in radioresistance were found among species of Aspergillus and the highest tolerance to radiation was observed for A. parasiticus. Initial morphologic changes were found to be more severe during the first isolation after irradiation than in later ones, with the fungi gradually recovering their normal growth rate. Ultrastructural changes in the irradiated strains were observed mostly in the plasmatic membrane and membranous organelles of nuclei and mitochondria. An increase in the rate of production of toxins by the irradiated strains has been found, however no significant alterations have been observed in their genotypes. Such findings apparently indicate that irradiation stress affected the metabolic response of the fungi, leading to a larger production of toxins. In addition, when appropriate conditions of feeding and growth were restored, the physiologic damages were gradually repaired. Therefore, under such circumstances, irradiated strains may resume growing, thus further deteriorating the substratum. / Irradia??o ? um processo f?sico eficazmente utilizado na preserva??o de alimentos. Este estudo teve como objetivo investigar os efeitos da exposi??o ? radia??o gama sobre a micobiota natural de ra??es av?colas e cepas de Aspergillus spp. Amostras de fub?, farelo de soja e ra??o foram coletadas diretamente da linha de produ??o de uma granja av?cola, no munic?pio de Avelar, RJ e, submetidas ?s doses de 0; 3,5; 8 e 15 kGy de radia??o gama. Foram realizados: contagem, isolamento e identifica??o da micobiota contaminante antes e ap?s a irradia??o. A radiossensibilidade de cepas de refer?ncia do g?nero Aspergillus spp. foi estudada em meio CYA e em milho, com doses de 0 a 8 kGy. Foi comparada a morfologia de cepas controle e irradiadas por macroscopia, microscopia ?ptica e microscopia eletr?nica de transmiss?o. Estudou-se o perfil tox?geno e realizou-se uma avalia??o gen?tica pela t?cnica de polimorfismo de ADN amplificado ao acaso. Observou-se redu??o na contagem com o aumento da dose, tendo sido verificada a elimina??o da micobiota com 8 kGy. Constatou-se tamb?m uma maior radiossensibilidade de leveduras, em rela??o aos fungos filamentosos. Ocorreu efeito do tempo de armazenamento, sendo que as contagens ap?s 45 dias foram inferiores ?s encontradas aos 7 dias ap?s a irradia??o. A dose 3,5 kGy proporcionou significativa redu??o da contagem f?ngica, a n?vel abaixo do limite estipulado para a garantia da qualidade higi?nica de ingredientes e ra??o av?cola. No entanto, h? uma micobiota residual, formada principalmente pelos g?neros: Cladosporium spp., Curvularia spp., Fusarium spp. e Aspergillus spp., esses ?ltimos ap?s serem repicados, apresentaram apenas o desenvolvimento de mic?lio est?ril, o que n?o permitiu a identifica??o da esp?cie. Diferen?as em radiossensibilidade foram observadas entre as cepas de refer?ncia de Aspergillus avaliadas, sendo A. parasiticus o mais radiorresistente em ambos os substratos avaliados: meio CYA e milho. Observou-se menor conidiog?nese e aumento de estruturas de resist?ncia, como os escler?cios. As altera??es morfol?gicas foram mais intensas no isolamento inicial ap?s irradia??o sendo que, gradualmente, os isolados irradiados voltaram a apresentar crescimento semelhante ao padr?o nos repiques sucessivos. Altera??es ultraestruturais nas cepas irradiadas foram observadas principalmente em n?vel de membrana plasm?tica e de organelas, em especial n?cleo e mitoc?ndrias. Essas cepas tiveram aumentada sua produ??o de toxinas. Por outro lado, n?o foram observadas altera??es significativas no gen?tipo, ao menos com os tr?s marcadores utilizados. Esses relatos refor?am a hip?tese de que situa??es de estresse induzem uma maior produ??o de toxina pelos fungos. A irradia??o produz um estresse, afetando metabolicamente o fungo. Contudo, ao serem fornecidos nutrientes e condi??es adequadas de crescimento, essa altera??o fisiol?gica ? superada. Esses achados sugerem que cepas sobreviventes ? irradia??o podem voltar a se desenvolver, deteriorando o substrato, desde que sejam fornecidas condi??es favor?veis ao para seu crescimento.

[Truncated abstract] Traditional medicines are used by millions of people throughout the world as their primary source of medical care. A range of materials are in used traditional medicines including plant and animal parts. Even though the traditional medicine trade is estimated to be worth sixty billion dollars annually the trade remains largely unregulated. Unscrupulous practices by vendors to increase their profit margins such as substituting and adulterating expensive material with cheaper varieties go unchecked. This can be dangerous to consumers because some substitutions involve poisonous material. Also, animal parts from endangered species can find their way into traditional medicines, therefore there needs to be a way to identify them in traditional medicines to prosecute poachers. The traditional techniques used for the identification of material used in Traditional Chinese Medicine (TCM) include, morphological, histological, chemical and immunological analysis. However, these techniques have their limitations. This makes applying multiple techniques essential to provide thorough authentication of the material. DNA profiling provides a technique well suited to analysing material used in TCM. DNA profiling is advantageous over other techniques used to authenticate material used in TCM because it requires only a small sample amount, can determine the cultivator, be used on all forms of TCM and potentially distinguish the components of mixtures. ... Therefore, profiles of different species/individual are different and species? can be distinguished. Commercially sold traditional medicines are processed which is likely to degrade the DNA of the sample making extraction and amplification difficult. Here an organic Phenol:Chloroform extraction technique extracted DNA from commercial dried root samples. The extracted DNA was amplifiable using RAPD primers. The RAPD primers used here produced enough polymorphic bands to distinguish different plant species. They were used to distinguish commercial samples that were sold as three different species within the Panax genus, Panax ginseng, Panax quinquefolium and Panax notoginseng and genetically unrelated plant material; Potato and Eleutherococcus senticosus. Liquid samples and mixtures were also profiled with the RAPD primers to determine whether the RAPD primers provide enough distinguishing ability to analyse these forms of TCM. DNA was extracted from the liquid samples, one a ginseng drink and the other an ginseng extractum. However, there was no reliability in the production of PCR products. The analysis of the mixture samples found that not enough polymorphic bands were produced by the RAPD primers used here to identify Panax species within mixtures of two Panax species. While when P. ginseng was mixed with a genetically unrelated sample there was enough polymorphism to differentiate the two samples in the mixture. The results of this research show that RAPD analysis provides a simple and inexpensive technique to begin analysis of materials used in TCM. Using RAPD analysis it is possible to distinguish Panax plant species from each other. However, the RAPD primers used here did not provide enough reproducibility or polymorphism to analyse liquid and mixtures of Panax species plants.

Experiments were conducted to determine the outcrossing rate, the inheritance of markers and establish a basic linkage map in grasspea, <i> Lathyrus sativus </i>L. The outcrossing rate in a white-flowered line of grasspea ranged from 1.7 to 2.7% among eight combinations of gene frequency and location. The outcrossing rate in this study (2.2 ± 0.7%) suggests that individual lines of grasspea should be maintained in isolation to maintain their genetic integrity. Inheritance and linkage were determined for one morphological, 11 isozyme and 72 RAPD markers in five F₂ populations (all RAPD markers were in one F₂ population). The inheritance of flower colour was monogenic with colour dominant over white. The isozymes, ACO-1, ACO-2, AAT-1, AAT-2, EST-6, FDH, LAP-1, PGD-2, SKDH and TPI-1, were codominantly expressed with monogenic inheritance. The isozymes LAP-1 and PGD-2 segregated in a non-Mendelian ratios in the crosses PI 426891.1.3 x PI 283564c.3.2 and PI 426891.1 x PI 172930.4, respectively. The isozymeEST-3 was monogenically inherited and dominantly expressed. Most RAPD markers segregated in a 3:1 ratio. Marker UBC368_425/655 segregated in a co-dominant fashion. The RAPD markers UBC304₈₃₁, UBC304₉₆₄, UBC308₉₉₀, UBC322₁₄₃₂, UBC328₈₃₁, UBC332₁₁₁₈, UBC3321₁₅₈₁, UBC333₆₁₇, UBC349<sub>752<?sub>, UBC365₁₀₁₃ and UBC388₄₅₉ showed distorted segregation. In two F₂ populations, PI 283564c.3 x PI 426885.2 and PI 358601.5 x PI 173714.5, a linkage between AAT-2 and SKDH was reconfirmed. In the cross PI 426891.1.3 x PI 283564c.3.2, one morphological, three isozyme and 71 RAPD markers were mapped resulting in the delineation of 14 linkage groups including 69 markers (1 morphological, 3 isozyme and 65 RAPD markers). The total genome length covered by these 75 markers (69 linked and six unlinked) was about 864 cM. Considering cost, simplicity and abundance, RAPD analysis was more efficient than isozyme analysis in developing linkage map.

Lactic acid bacteria are associated with preservation of foods, including milk, meat and vegetables. Yoghurt is produced by the cooperative action of two starter bacteria / S. thermophilus and L. delbrueckii subsp. bulgaricus. In this study, identification and typing of yoghurt starter bacteria were aimed. Traditional home made yoghurts were collected from different areas of Turkey, identification of those isolates at species and subspecies level and typing at strain level were achieved using PCR based methods. In our study, identification of yogurt starter bacteria was studied using species specific primers and ARDRA. These methods were inefficient in identification of yoghurt starter bacteria, at species and subspecies level. Consequently, a reliable and quick method for accurate identification of yoghurt starter bacteria was developed. The new method focuses on amplification of methionine biosynthesis genes, for selective identification of yoghurt starter bacteria together with some cheese starters. Further discrimination by ARDRA enabled differentiation of yoghurt starter bacteria from cheese starters. Confirmation of the proposed method has been accomplished by partial sequencing of the 16S rRNA gene. After correct identification of starter bacteria had been achieved, the strains were typed at strain level using RAPD-PCR and MLST. RAPD-PCR with primer 1254 resulted better fingerprints, compared to primer M13 at strain level. Comparisons of the two typing methods showed that RAPD-PCR revealed strain diversity better than MLST, however MLST was a more robust and reliable method and resulted in clustering of the strains depending on the isolation source.

We analyzed a total of 760 worker bees, two samples per colony, 390 colonies in 26 provinces in Turkey to determine and compare the genetic variation of Turkish honey bee (Apis mellifera L.) populations using 10 primers for RAPD and 6 microsatellite loci. Mean gene diversity levels ranged from 0.035 (Sanliurfa) to 0.175 (Antalya) for RAPD and 0.449 (Mugla) to 0.739 (Artvin) for microsatellite markers. Private band patterns and alleles, pairwise FST values support that the Anatolian honey bees belong to C lineage except for Hatay and Sanliurfa populations illustrated from previous findings of mitochondrial DNA studies. Genetic differentiation (GST) from RAPD data ranged from 0.060 (Bilecik and Mugla) to 0.395 (G&ouml / k&ccedil / eada and Sanliurfa). The genetic diversity (FST) for microsatellites ranged from -0.068 (G&ouml / k&ccedil / eada and &amp / #272 / zmir) to 0.347 (Konya and Mugla). The results of the present research are in agreement to that of previous study in Turkish honey bee populations which used different microsatellite loci. That is the genetic variation was the highest in African, the lowest in European and intermediate in the Mediterranean honey bee populations. The data presented here indicate that in spite of extensive migratory beekeeping, there is still a large genetic differentiation among honey bee populations. These results should be considered in establishment of conservation plans particularly in moving of colonies between regions. The most importantly introduction of bees with foreign origin and distribution queen bees from one center to all over the country which will homogenize the gene pool of the populations should be prevented