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Marcadores moleculares na análise de espécies e composição populacional de peixes marinhos de recifes de corais da família Pomacanthidae (Perciformes).

Affonso, Paulo Roberto Antunes de Mello 12 November 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TesePRAMA.pdf: 5748873 bytes, checksum: 6e01feb6698bd8a82b3887d7a78e7f4c (MD5) Previous issue date: 2004-11-12 / Universidade Federal de Minas Gerais / The Brazilian coast extends over nearly 8,000km. Along the coastline, several marine ecosystems can be found and determine a rich ichthyofauna, regarding both diversity and number of species. The reef sites are characterized as the main reason for such abundance. As a paradox, genetic studies aiming to characterize the several species and populations from this environment are nearly absent in Brazil. Based on these statements, the major goals of the present work were to analyze the population structure and the relationship among marine fish species from a Perciform family, common at coral reefs and important for aquarium trade Pomacanthidae. The selected species were Centropyge aurantonotus, Holacanthus ciliaris, H. tricolor, Pomacanthus arcuatus and P. paru, distributed over nearly all the Brazilian shore, besides another species from the family Chaetodontidae, closely related to that focused in this work - Chaetodon striatus. For that, molecular markers obtained from analyses of genomic DNA by RAPD and microsatellites were adopted. The results based on RAPD profiles, from a set of primers, indicate that species from both families show a high genetic variability, with inter-specific and inter-populational differences. Specific marks were found in all species, useful for the establishment of phylogenetic relationships and taxonomical discrimination. The dendrogram generated allowed to distinguish each species, revealing that those from a same genus are more closely related. Albeit the values of gene flow and genetic identity were relatively high after inter-populational comparisons, indications of structuring along the Brazilian Province were detected, particularly if we consider φs t values. The most conspicuous species along the coast, composing widely distributed populations, tended to exhibit greater genetic similarities among samples. Animals from oceanic isolates were not quite differentiated from inshore populations, but showed decreased variability. The isolation and characterization of microsatellites in the species P. paru and H. ciliaris, according to PIMA (PCR isolation of microsatellite arrays) methodology, allowed us to select several microsatellite loci, useful for populational approaches. Primers flanking such regions were designed and it was verified that one locus, called Pp02 was polymorphic and it is present in Pomacanthus and Holacanthus representatives. The populational analyses of the locus Pp02 in P. paru revealed significant values of Fst and genetic differentiation, in agreement with population structure hypothesis. These data, described for the first time, are useful for the conservation management of such exploited animals and for the inferences of dispersal and populational composition of reef species from the Brazilian Province. / A costa brasileira apresenta cerca de 8.000 Km de extensão. Ao longo do litoral, diversos ecossistemas marinhos podem ser encontrados e determinam uma ictiofauna rica tanto em diversidade quanto quantidade de espécies. Os ambientes recifais são caracterizados como os maiores responsáveis por tal abundância. Paradoxalmente, estudos genéticos que procurem caracterizar as muitas de suas espécies e populações são praticamente ausentes no Brasil. Com base nessas premissas, esse trabalho teve como objetivos básicos analisar a estrutura populacional e a relação entre espécies de peixes marinhos em uma família de Perciformes comum nos recifes e importante para aquariofilia Pomacanthidae. As espécies selecionadas foram Centropyge aurantonotus, Holacanthus ciliaris, H. tricolor, Pomacanthus arcuatus e P. paru, com ocorrência ao longo de quase todo o litoral do Brasil, além de uma espécie adicional da família Chaetodontidae, intimamente relacionada com a enfocada nesse trabalho - Chaetodon striatus. Para tal, marcadores moleculares a partir da análise do DNA genômico por RAPD e microssatélites foram adotados. Os resultados obtidos com as análises por RAPD, a partir de um conjunto de primers, indicam que as espécies dessas famílias apresentam alta variabilidade genética, com diferenças interespecíficas e interpopulacionais. Marcas específicas foram detectadas em todas as espécies, úteis para a identificação e estabelecimento das relações filogenéticas das espécies. O dendrograma obtido permitiu distinguir cada espécie, revelando que aquelas do mesmo gênero estão intimamente relacionadas. Embora os valores de fluxo gênico e de identidade genética tenham sido relativamente altos nas comparações interpopulacionais, indícios de estruturação ao longo da Província do Brasil foram detectados, particularmente se considerarmos os valores de φs t. As espécies mais conspícuas ao longo do litoral, formando populações de distribuição mais ampla, foram as que apresentaram maior similaridade genética entre as regiões. Animais de isolados oceânicos não se mostraram tão diferenciados de populações costeiras, mas apresentaram variabilidade reduzida. A prospecção de microssatélites nas espécies P. paru e H. ciliaris, pelo método PIMA (PCR isolation of microssatelite arrays) permi tiu a seleção de alguns locos microssatélites, informativos para abordagens populacionais. Os primers das regiões flanqueadoras desses locos foram desenhados e foi verificado que um deles, denominado Pp02, é polimórfico e está presente nas espécies de Pomacanthus e Holacanthus. A análise populacional desse loco em P. paru revelou índices significativos de Fst e de diferenciação genética, condizentes com estruturação populacional. Esses dados, até então inéditos, são importantes para o manejo de conservação desses animais comercialmente explorados e permitem inferir padrões de dispersão e composição populacional das espécies recifais da Província Brasileira.
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Caracterização genética do pirarucu Arapaima gigas (Cuvier) (Teleostei, Osteoglossidae) da bacia Tocantins-Araguaia, estado do Mato Grosso.

Marques, Débora Karla Silvestre 29 August 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseDKSM.pdf: 1610771 bytes, checksum: c876a68dec001f134b288f61b73e2bf8 (MD5) Previous issue date: 2003-08-29 / Universidade Federal de Sao Carlos / In South America the osteoglossiforms are represented by the Arapaima and the Osteoglossum sorts, which are mostly found in the Amazonic basin, Tocantins Araguaia. There are virtually no genetic studies on this group, which highlights conservation groups need for information. The Arapaima gigas species, of the hydrographic basin Tocantins Araguaia, showed a 2n=56 chromosomes, with cariotypical formula: 28M/SM+28ST/A. Silver nitrate marking revealed a simple RON, located intersticially in the shorter arm of pair three, confirmed by a fluorescent hybration in situ, with a rDNA 18S probe, that highlighted a polymorphism in the RON sites. The constituent heterocromatin was found in the centromerical region of all chromosomes. The molecular genetic studies with RAPD marker showed the presence of only one Arapaima gigas population, with a significant intrapopulational variation. The results obtained in this work are an important contribution to the understanding of the genetics of the Arapaima gigas species and the Osteoglossiforms group, providing, moreover, subsidies for genetic handling and conservation of the Arapaima gigas species in the Médio Araguaia, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. / Os Osteoglossiformes são representados na América do Sul pelos gêneros Arapaima e Osteoglossum, que ocorrem particularmente na região Amazônica, nas bacias Amazônica e Tocantins-Araguaia. Os estudos genéticos neste grupo são praticamente inexistentes, evidenciando a necessidade de informações para programas de conservação. A espécie Arapaima gigas da bacia hidrográfica Tocantins-Araguaia apresentou um 2n=56 cromossomos, com fórmula cariotípica 28M/SM+28ST/ A. A marcação por nitrato de prata evidenciou uma RON simples localizada intersticialmente no braço curto do par três, confirmada pela hibridação fluorescente in situ com sonda de rDNA 18S, que evidenciou um polimorfismo de tamanho nos sítios de RON. A heterocromatina constitutiva foi localizada na região centromérica de todos os cromossomos. Os estudos genéticos moleculares com marcador RAPD evidenciaram a ocorrência de uma única população de Arapaima gigas na região de coleta, com variabilidade intrapopulacional significativa. Os resultados obtidos no presente trabalho são contribuições importantes para o conhecimento da genética da espécie Arapaima gigas e do grupo Osteoglossiformes, fornecendo, ainda, subsídios para programas de manejo e conservação genética da espécie Arapaima gigas no Médio Araguaia, estado do Mato Grosso, Brasil.
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Estimativa de variabilidade genética em acessos crioulos e cultivares comerciais de tomates (Lycopersicon esculentum Mill.) do sul do Brasil e avaliação da presença do Gene Mi.

Carelli, Bernardete Primieri 18 December 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseBPC.pdf: 597791 bytes, checksum: cb6991d45b1e69e3a67491404df82f2a (MD5) Previous issue date: 2003-12-18 / Universidade Federal de Minas Gerais / Cultivated tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) is one of the most important horticultural crops. Although original from the Andes region, this crop was officially introduced in Brazil by the European immigrants during the last half of the XIX century. Today, old varieties and new improved cultivars are planted in the different Brazilian regions. In the last 20 years the Ecological Center of Ipê proceeded a rescue of old tomato varieties maintained by small agriculturists in the Northeast region of Rio Grande do Sul State. The present work had the objective to estimate the variability among 35 tomato accessions, 12 commercial cultivars and 23 Brazilian landraces using morphological descriptors and molecular traits (proteins and DNA), and to verify the Meloidogyne resistance/susceptibility status of these genotypes, as well as the presence of the Mi genes. The landraces were separate in five groups by their fruit characteristics: large oblate, cherry, heart-shape, large cylindrical, and rounded, whereas the commercial cultivars were restricted to the most common groups in the market. Both the quantitative evaluation of seed protein electrophoretic profiles, and RAPD markers allowed identifying all the accessions. The cluster analysis of RAPD data allowed to separate the genotypes in seven similarity groups that were not related with those formed by the protein analysis. Conversely, a discriminant analysis showed a relation between RAPD markers and fruit morphology. Landraces exhibited higher levels of protein and genetic (RAPD) variations compared with the commercial cultivars confirming the genetic variability reduction caused by the limited number of genotypes used in breeding programs. Experimental results showed that all the landraces and commercial cultivars, with the exception of the cultivars Polka Baixo and Gaucho (Feltrin) were susceptible to M. javanica, M. incognita, and M. arenaria. PCR data showed that the Mi1.2 gene was present only in the Polka Baixo cultivar, whereas the Mi1.1 was found in 26 accessions, most of which susceptible to root-knot nematodes, confirming the gene Mi1.2 as the nematode resistant determinant, and the inefficiency of the Mi1.1. Considering the high incidence of Meloidogyne in South Brazil, the low frequency of resistant accessions point-out the necessity of a special effort of breeding programs on the transfer of root-knot nematode resistance genes to Brazilian tomato varieties and cultivars. / O tomate (Lycopersicon esculentum) é uma das mais importantes hortaliças. Apesar, de ser nativo da região dos Andes, esta hortaliça foi oficialmente introduzida no Brasil pelos imigrantes europeus durante a última metade do século XIX. Hoje, variedades antigas e cultivares melhorados, são cultivados em diferentes regiões brasileiras. Nos últimos 20 anos, o Centro Ecológico de Ipê realizou um resgate das antigas variedades de tomate mantidas por pequenos agricultores da região Nordeste do Rio Grande do Sul. O presente trabalho teve como objetivo estimar o grau de variabilidade entre 35 acessos de tomate, 12 comerciais e 23 acessos crioulos, utilizando marcadores morfológicos e moleculares (protéicos e DNA), além de verificar a resistência e/ou susceptibilidade a Meloidogynes destes genótipos, bem como a presença do gene de resistência Mi através de PCR. A variabilidade morfológica dos frutos apresentada pelos acessos crioulos formou cinco grupos: os tipo Cereja, Pimentão, Coração de Boi, Gaúcho e Paulista, enquanto que os materiais comerciais restringiram-se aos grupos mais comuns no mercado, Gaúcho e Paulista. Os perfis eletroforéticos de proteínas totais solúveis de sementes mostraram a ocorrência de baixa variabilidade qualitativa, mas variações quantitativas permitiram a identificação de todos os materiais avaliados. A análise da variabilidade através de marcadores de RAPD permitiu a identificação de todos os genótipos avaliados, confirmando a eficiência deste tipo de marcadores na caracterização de materiais. A análise de agrupamentos permitiu a separação em sete grupos, os quais não apresentaram relação com aqueles formados com base nos perfis protéicos. Por outro lado, análise discriminante mostrou a existência de relação entre os marcadores de RAPD e os grupos de morfologia de fruto. De um modo geral, os materiais crioulos apresentaram maior variação nas proteínas de sementes e marcadores de RAPD o que pode ser tomado como indicativo de estreitamento da base genética nos materiais comerciais. Os resultados obtidos no teste de resistência mostraram que todos os materiais crioulos e comerciais, com exceção dos cultivares Polka Baixo e Gaúcho (Feltrin) são suscetíveis a Meloidogyne javanica, M. incognita e M. arenaria. Considerando a alta incidência de Meloidogyne no Sul do Brasil, a baixa freqüência de acessos resistentes, apontam a necessidade de um esforço especial na transferência dos genes de resistência aos nematóides das galhas da raiz para os acessos crioulos e cultivares do tomate comerciais do Brasil.
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Chromobacterium violaceum : Caracterização cultural, bioquímica, molecular e detecção da produção de polihidroxialcanoato-PHA

ANTUNES, Adriana Almeida January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:53:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5244_1.pdf: 1285875 bytes, checksum: 5de402e10c4ec2c9f263508fa2280a1d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Estudos foram realizados com treze linhagens de Chromobacterium violaceum avaliando as características bioquímicas, a variabilidade genética e a produção de polihidroxialcanoato. Os isolados demonstraram maior crescimento no meio Luria Bertani, suplementado com glicose. Todos os isolados foram negativos para os testes de uréia, manitol, lactose e indol, e positivos para frutose, lisina, sacarose, glicose, catalase, gelatinase, motilidade e oxidase. Todas as linhagens demonstraram resistência aos antimicrobianos ampicilina e cefalotina. Observouse ainda, resistência para gentamicina e amicacina (UCP 1035-Ceará) e para imipenen, cloranfenicol e amicacina (UCP 1489-Pernambuco), evidenciando características fenotípicas distintas entre as treze linhagens. A variabilidade genética das linhagens de C. violaceum foi avaliada pelo índice de similaridade de Jaccard, utilizando-se o método UPGMA nas análises de agrupamento. Os índices de similaridade variaram de 0,17 a 0,35 para onze isolados, enquanto que, os isolados UCP 1462 e UCP 1463 apresentaram 100% de similaridade. O perfil de RAPD foi característico para cada linhagem, permitindo a formação de dois grupos indicando a variabilidade genética dos isolados analisados. A detecção da produção de polihidroxialcanoato foi realizada utilizando os corantes Nilo blue e verde malaquita, destacando-se a linhagem de C. violaceum UCP 1467, como maior produtora do biopolímero
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Estudos fisiológicos, bioquímicos e moleculares de isolados de Ganoderma lucidum (Fr.) karst. cultivados pela técnica Jun-Cao

ROLIM, Leonardo do Nascimento 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Universidade Federal de Pernambuco / Ganoderma lucidum é um basidiomiceto muito popular na medicina tradicional chinesa, sendo chamado de Lingzhi ou cogumelo da imortalidade . Estudos revelaram diversas propriedades farmacológicas benéficas deste fungo, sugerindo sua utilização como auxiliar em diversos tratamentos contra doenças humanas. Por não ser muito comum na natureza, o cultivo é a melhor maneira de suprir um mercado cada vez mais amplo. Dentre os vários métodos de cultivo existentes para a fungicultura, a técnica Jun-Cao é considerada a mais promissora para a produção de cogumelos em escala que atenda à demanda crescente. Sabendo que a bioquímica de um organismo pode variar entre diferentes linhagens, e entendendo a necessidade de descobrir novas variedades de G. lucidum, para ampliar as opções de cultivo deste fungo, este trabalho buscou comparar linhagens comerciais chinesas com linhagens brasileiras inexploradas de G. lucidum, para avaliar o valor bioquimico destas. Os resultados mostram que o cultivo combinado de madeira com gramínea, na técnica Jun-Cao, foi mais promissor no desenvolvimento das linhagens tanto em redução no tempo de cultivo quanto na qualidade e quantidade dos cogumelos. A linhagem brasileira (CC-144) destacou-se tanto na velocidade de crescimento, quanto na produtividade de basidiomas e na concentração bioquímica de proteínas, carboidratos, β- glucanas e fenóis, superando as chinesas e se mostrando uma opção para a fungicultura. A análise RAPD mostrou distinção genética entre as linhagens, descartando a possibilidade de ocorrência de clones
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Diversidade genética e caracterização molecular em linhagens de Beauveria bassiana

Paula Duarte Pires, Ana January 2002 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4416_1.pdf: 690757 bytes, checksum: 6e1d8fd2843b82ae7a0a60b516bd6c3c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2002 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foram analisadas vinte linhagens de Beauveria bassiana isoladas de diferentes regiões e hospedeiros, quanto ao perfil de DNA, através da análise da região ITS do rDNA, de RAPD e Intron, para avaliação da diversidade genética e auxílio na caracterização. A região ITS1-5.8s-ITS2 do rDNA foram digeridas com as enzimas Eco RI, Dra I, Msp I e Hae III, onde a Eco RI e Dra I não apresentaram sítio de restrição e a Hae III e Msp I não apresentaram polimorfismo entre as linhagens, confirmando a espécie estudada. Para RAPD foram selecionados cinco primers OPX17, OPW4, OPW7, OPW19, 0PW20, que produziram um total de 442 bandas. Os dados obtidos foram submetidos à análise estatística pelo programa NTSYS.PC e construída uma matriz de similaridade utilizando o coeficiente de Jaccard, que gerou um dendrograma através do método de agrupamento UPGMA. A similaridade foi em torno de 70%. A análise do dendrograma mostrou a formação de quatro grupos, onde não houve correlação com o hospedeiro ou origem geográfica, embora duas linhagens isoladas de Nezara viridula e duas de Deois flavopicta tenham mostrado maior nível de similaridade. Os dados obtidos pela análise de Intron, mostraram o aparecimento de cinco grupos
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Caracterização de linhagens do grupo Aspergillus flavus baseada em marcadores de DNA

BATISTA, Patrícia Pires January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6215_1.pdf: 1677963 bytes, checksum: e550537f637e0f99ab5e08d9174c5447 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / O gênero Aspergillus pertence ao grupo de fungos filamentosos de grande dispersão no meio ambiente. Algumas espécies estão associadas a doenças, principalmente em pessoas imunocomprometidas. Outras são importantes por razões econômicas, devido à aplicação biotecnológica ou à produção de aflatoxinas. A identificação das espécies por métodos tradicionais, aliados ao uso de marcadores moleculares, estão somando conhecimentos e estabelecendo maior eficiência na caracterização de isolados. Foram utilizados os marcadores moleculares ISSR, utilizando os primers (GACA)4 e (GTG)5, e os marcadores ITS e RAPD, com o objetivo de caracterizar geneticamente linhagens de Aspergillus flavus e linhagens de outras espécies pertencentes ao grupo A. flavus. Alta diversidade genética foi obtida com os marcadores RAPD e ISSR, sendo que o primer (GTG)5 gerou menor diversidade que o (GACA)4, mas apresentou perfis característicos para cada espécie. A partir destes dados foi construída uma matriz de similaridade e confeccionados os dendrogramas, através do método de agrupamento UPGMA. Os perfis dos marcadores ISSR e RAPD mostraram que entre as linhagens estudadas de A. flavus, quatro apresentaram perfis diferenciados, tendo sido reclassificadas como A. oryzae, A. parasiticus e duas como A. tamarii. No entanto, uma das linhagens previamente identificadas como A. parasiticus, devido ao seu perfil de marcadores ser idêntico ao de A. flavus, foi revisada como sendo desta espécie. Esses resultados reforçam a importância do uso de marcadores moleculares para a diferenciação de espécies e linhagens fúngicas
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Variação genética em Aedes aegypti e Aedes albopictus

Pereira Gomes Júnior, Plinio January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6297_1.pdf: 1280422 bytes, checksum: 6dbf4fac7abd5986311944cbb4ed97fd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Aedes aegypti e Aedes albopictus são espécies invasivas, considerada importante do ponto de vista médico, porque eles são vetores de arboviroses muitos. Uma pesquisa de doze meses de variação sazonal na freqüência de alelos em populações destas espécies foi realizado para verificar as possíveis alterações na estrutura genética e sua relação com as condições ambientais. Padrões de diversidade genética foram examinadas usando Random Amplified Polymorphic DNA e haplótipos de Citochrome c oxidase subunidade II do mtDNA. Amostras de Ae. aegypti e Ae. albopictus foram coletados entre dezembro de 2003 a novembro de 2004 em duas áreas do Recife. Evidência de diferenciação genética significativa foi detectada ao longo do ano para ambas as espécies, sem perdas de diversidade genética dentro das populações (heterozigosidade e polimorfismo). Amostras de Ae. albopictus em áreas silvestres e urbanas mostrou fluxo gênico intensiva (Nm = 4.2 e 22), durante dois momentos distintos. Os dados obtidos podem ser muito úteis para melhorar as estratégias de controle de vetores
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Intraspecific Variability within Globodera tabacum solanacearum and Selection for Virulence Against Flue-Cured Tobacco

Syracuse, Aaron James 25 November 2002 (has links)
The tobacco cyst nematode (TCN), Globodera tabacum solanacearum [(Miller and Gray, 1972) Behrens 1975] Stone 1983, is one of the most economically important pests of flue-cured tobacco (Nicotiana tabacum L.) in Virginia. Although TCN has been reported from other countries, the geographical distribution of G. t. solanacearum within the United States is limited to Virginia, North Carolina, and one county in Maryland. Approximately 30% of the tobacco acreage in Virginia is infested; average yield reduction is 15%, but complete crop failure can occur. The objectives of this research were to examine intraspecific variability within G. t. solanacearum and to evaluate the relative adaptability of G. t. solanacearum on a resistant (NC567) and a susceptible (K326) flue-cured tobacco cultivar. Nineteen geographic isolates of G. t. solanacearum, one isolate each of G. t. virginiae and the Mexican cyst nematode (G. "mexicana"), two isolates of G. t. tabacum, and five Heterodera species were characterized by DNA fingerprinting using the RAPD-PCR technique. Reproducible differences in fragment patterns allowed similar differentiation of the isolates and species with each primer. Hierarchical cluster analysis was performed to illustrate the relatedness between nematode isolates and species. In contrast to reports in the literature, we found a Miller isolate of G. "mexicana" to cluster more closely with G. t. solanacearum than with G. t. tabacum or G. t. virginiae. Although no pathotype differences have been found within G. t. solanacearum, the average Jaccard's similarity index among isolates of G. t. solanacearum was 74%, representing greater variation than that observed across different pathotypes of the closely related potato cyst nematode, Globodera pallida. This result suggests that the emergence of resistance-breaking biotypes is more likely than previous research suggests. If a new pathotype is reported, a RAPD marker associated with virulence against a specific host resistance gene could prove to be a valuable tool in population diagnosis, resistance screening, and overall TCN management. One isolate of G. t. solanacearum was cultured on a resistant (NC567) and a susceptible (K326) flue-cured tobacco cultivar over five generations. Variable TCN reproduction was observed on both cultivars over each generation. This variability in reproduction could be attributed to differences among generations in the time interval between inoculation and cyst extraction, temperature, possible diapause effects, and/or daylength. Ninety-eight cysts were produced in the fifth and final generation compared to the 14 to 50 cysts produced during each of the previous four generations. Increased reproduction on the resistant variety suggests that increased virulence might be selected, but research involving additional generations would need to be carried out in order to conclude whether or not TCN virulence is being selected. / Master of Science
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Biochemical Separation of Geographical Strains of Plum Curculio, Conotrachelus nenuphar (Herbst) (Coleoptera: Curculionidae), and Evaluation of Olfactory Attractants in Virginia Orchards

McClanan, Michelle Erin Garlic 14 August 2002 (has links)
Plum curculio, Conotrachelus nenuphar (Herbst), is an endemic pest of stone and pome crops of the eastern United States. Two morphologically identical strains of plum curculio have been described and documented in Virgina: a univoltine strain and a multivoltine strain. Because of the cryptic coloring and behaviours of the plum curculio adults, monitoring in orchards is difficult and often ineffective. RAPD-PCR assay was an effective method for separation of the geographical strains. Of the tested primers four, OPE 01, OPE 03, OPE 04, and OPE 07, gave 21 amplimers that are useful for distinguishing individuals from the univoltine and multivoltine populations. Gene targeted PCR revealed the presence of Wolbachia in both populations. Analysis of the wsp gene sequence showed the univoltine population of plum curculio is associated with a strain of Wolbachia in supergroup B, most closely related to a strain identified from Perithemis tenera (Say) (Odonata). The multivoltine populations of plum curculio are associated with strains of Wolbachia which are in supergroup A, and most closely related to Wolbachia strains associated with Dacus destillatoria, Bactrocera sp., and Callosobruchus chinensis Linn. Three different trap designs baited with grandisoic acid, plant volatiles, and a combination of pheromone and plant volatiles were tested. In 1999, significantly more plum curculios were captured with Tedders traps baited with grandisoic acid and unbaited control in traps baited with limonene, plum essence or ethyl isovalerate. In 2000, Circle traps baited with plum essence, sour cherry essence and grandisoic acid yielded no results. In 2001, branch mimic traps yielded no significant differences among three release rates of a blend of benzaldehyde, ethyl isovalerate, trans-2-hexenal, and limonene; although, there was a significant interaction between the pheromone and the host plant volatiles. Overall however, all three of the traps were not effective. / Master of Science

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