Coronavirus disease 2019 (COVID-19), an infectious respiratory disease propagated by a new virus known as Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2), has resulted in global healthcare crises. Emerging evidence from patients with COVID-19 suggests that endothelial cell damage plays a central role in COVID-19 pathogenesis and could be a major contributor to the severity and mortality of COVID-19. Like other infectious diseases, the pathogenesis of COVID-19 is closely associated with metabolic processes. Lactate, a potential biomarker in COVID-19, has recently been shown to mediate endothelial barrier dysfunction. In this review, we provide an overview of cardiovascular injuries and metabolic alterations caused by SARS-CoV-2 infection. We also propose that lactate plays a potential role in COVID-19-driven endothelial cell injury.

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<p dir="ltr">Infectious diseases are caused by a multitude of organisms, ranging from viruses to bacteria, from parasites to fungi, and can be passed directly or indirectly from one person to another. Further, they continue to be a leading cause of death, especially in low-resource countries, thereby emphasizing the need for continued investigation. Understanding transmission of such diseases is vital as management or prevention of outbreaks through detection, reporting, isolation, and case management are ever-evolving. One way by which scientists can study infectious diseases is through a combination of epidemiological, genomic, and evolutionary biology approaches. This doctoral research occurred precisely at this interface, spanning across the fields of genomics, molecular biology, and epidemiology, as applied to the study of infectious disease dynamics of two separate pathogen systems (protozoan and virus).</p><p dir="ltr">The first half of this research (Chapters 1 + 2) involved the implementation of SARS-CoV-2 genomic sequencing and surveillance at Purdue University. Through this investigation in a university setting (Chapter 1), this work identified relevant variants of concern in hundreds of newly sequenced viral genomes and compared variant temporal trends with other similar university settings using publicly available data. Further phylodynamic analysis of Gamma (P.1) genomes from campus revealed multiple introductions into the Purdue community, predominantly from states within the United States. A second study (Chapter 2) assessed the transmission of variants over the course of an entire academic year from 2021-2022 in Purdue’s highly vaccinated community. This research described the rapid transition from Delta to Omicron variants and investigated variant introduction events into the campus. This comprehensive analysis showed that robust surveillance programs coupled with viral genomic sequencing and phylogenetic analysis can provide critical insights into SARS-CoV-2 spread and can help inform mitigation strategies for future pandemics.</p><p dir="ltr">The latter half of this body of research (Chapters 3 + 4) focused on malaria, which is a disease caused by <i>Plasmodium </i>species<i> </i>parasites and transmitted to humans through the bites of infected mosquitoes. The first investigation explored diagnostic accuracy metrics across a malaria transmission gradient in Zambia through a comparison of the diagnostic performance of Rapid Diagnostic Tests (RDT) and Light Microscopy (LM) with photo-induced electron transfer polymerase chain reaction (PET-PCR) as the gold standard using 2018 Malaria Indicator Survey (MIS) data. Results suggested that RDTs and LM both performed well across a range of transmission intensities, but low parasitaemia infections can affect accuracy. This suggests that more sensitive tools should be utilized to identify the last cases as Zambia moves towards malaria elimination. In addition to diagnostic metrics, preventing disease is also crucial for infectious diseases, and vaccines present one mechanism by which this can be done. Research to develop a malaria vaccine with sustained high efficacy has spanned decade. However, the process has proven to be challenging, with several vaccine candidates having advanced to early-stage trials, but only a few demonstrating sustained efficacy in clinical testing. The goal of the last investigation (Chapter 4) was to shed light on the diversity of <i>Plasmodium falciparum </i>antigens which could be considered when developing future malaria vaccines. Results of evolutionary and genomic analyses of Whole-Genome-Sequences from Zambia and other countries in Africa suggest that conserved merozoite antigens and/or transmission-blocking antigens should be prioritized when developing future malaria vaccines.</p>

40% of severe acute respiratory syndrome coronavirus two (SARS-CoV-2) severe cases develop acute kidney injury (AKI). Current treatment for renal complications limits financial and material resources available. To explore alternative treatments and accelerate research in case of future coronavirus outbreaks, a mouse model of coronavirus disease 2019-associated AKI (C19-AKI) would represent a critical biomedical research tool. The surrogate model of C19-AKI (SMC) developed consisted of angiotensin-converting enzyme two (ACE2) knockout (KO) mice receiving 400 ng/kg/min of angiotensin (Ang) II by osmotic minipump for eight days with a single injection of lipopolysaccharide (LPS; 10 mg/kg) on the seventh day of Ang II and euthanasia 24 hours after LPS. Similarly, to C19-AKI, the SMC exhibited albuminuria, elevated blood urea nitrogen, electrolyte imbalance, neutrophil infiltration, and upregulation of the G-coupled protein receptor (GPR)84 and pro-inflammatory and injury markers. GPR84 was found in bronchoalveolar lavage fluid neutrophils of coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients, suggesting a potential implication of GPR84 in the disease. We hypothesised that GPR84 deletion or antagonism with GLPG-1205 could attenuate SMC’s indices of renal injury and inflammation. GLPG-1205 and GPR84 KO had no effects in the SMC model, as suggested by unchanged albuminuria, electrolytes, and markers expression. Interestingly, neutrophil infiltration was attenuated by GLPG-1205 only. The SMC is an interesting tool for therapeutic development for infections associated with renal injury, such as SARS-CoV-2. GPR84 role in the SMC needs to be further assessed.

Después de la pandemia más conocida como la gripe española del año 1918, no hubo otra capaz de poner en serios problemas la economía mundial, en especial los mercados de valores de todos los países hasta la llegada del nuevo coronavirus SARS-COV2, denominado también COVID19. Por ello, el presente trabajo busca analizar y comparar los efectos de dos pandemias ocurridas en el periodo 2008-2020 en los mercados de renta de variable. Estas pandemias son la gripe A(H1N1) ocurrida en el periodo 2009- 2011 y el nuevo coronavirus SARS-COV2 que inició a finales del 2019 en Wuhan, China. El periodo de análisis para el SARS-COV2 será 2009-2020. Se plantea que para las Bolsas de Valores de los países desarrollados (EE.UU, China y España) existirá un impacto negativo sobre el rendimiento asociado a dichas bolsas ante la presencia del COVID-19 en el corto y mediano plazo; esto a su vez desencadenará un efecto en cadena similar o incluso mayor sobre las Bolsas de Valores de los países que conforman el MILA (Mercado Integrado Latinoamericano) Perú, Chile y Colombia. Este impacto sería de mayor escala que el impacto ocasionado por la gripe A (H1N1) pdm09, debido a que se considera que la crisis financiera internacional del año 2008 fue el determinante de la caída de las bolsas de valores de Estados Unidos, España y de los países en desarrollo en ese periodo. En esta investigación se va a utilizar un modelo Panel Least Squares para poder estimar los efectos de las pandemias en los índices de rendimiento de los países mencionados / After the pandemic better known as the Spanish flu of 1918, there was no other capable of putting the world economy, especially the stock markets of all countries, in serious trouble until the arrival of the new SARS-COV2 coronavirus, also called COVID19. For this reason, the present research seeks to analyze and compare the effects of two pandemics that occurred in the 2008-2020 period in the equity markets. These pandemics are influenza A (H1N1) that occurred in the 2009-2011 period and the new SARS-COV2 coronavirus that started in late 2019 in Wuhan, China. The analysis period for SARS-COV2 will be 2009-2020. It is proposed that for the Stock Exchanges of developed countries (USA, China and Spain) there will be a negative impact on the performance associated with these exchanges in the presence of COVID-19 in the short and medium term; this in turn will unleash a similar or even greater chain effect on the Stock Exchanges of the countries that make up the MILA (Latin American Integrated Market) Peru, Chile and Colombia. This impact would be of a larger scale than the impact caused by influenza A (H1N1) pdm09, because it is considered that the international financial crisis of 2008 was the determinant of the fall of the stock markets of the United States, Spain and developing countries in that period. In this research, a Panel Least Squares model will be used to estimate the effects of pandemics on the performance indexes of the mentioned countries.

Tesis por compendio / [ES] Los oligosacáridos de la leche humana (OLHs) y la parte glicana de los glicoconjugados son hidrolizados por las glicosil hidrolasas (GHs), las cuales son expresadas por la microbiota intestinal de niños lactantes promoviendo el establecimiento de una microbiota intestinal con beneficios para su salud. El objetivo de esta Tesis Doctoral consistió en la caracterización funcional de GHs de la microbiota intestinal de niños lactantes capaces de metabolizar OLHs y glicoconjugados, y el estudio de su relevancia biológica y su potencial biotecnológico. Se aislaron cepas bacterianas a partir de heces de niños lactantes.Solo las cepas del género Bifidobacterium metabolizaron alguno de los OLHs testados. Bifidobacterium infantis Y538 consumió eficientemente todos los OLHs testados, mientras que las dos cepas de Bifidobacterium dentium Y510 y Y521 solo metabolizaron lacto-N-tetraosa (LNT) y lacto-N-neotetraosa (LNnT). Se caracterizaron dos ß-galactosidasas de B. dentium Y510; Bdg42A mostró la mayor actividad en LNT, hidrolizándolo en galactosa y lacto-N-triosa (LNTII), mientras que Bdg2A mostró actividad contra lactosa, 6'-galactopiranósil-N-acetilglucosamina, N-acetillactosamina y LNnT. También se aislaron cepas bacterianas con actividad glicosidasa extracelular de las heces de lactantes. B. infantis E17 y E18, y Enterococcus faecalis E8 y E41 exhibieron actividad de endo-ß-N-acetilglucosaminidasa, liberando N-glicanos de glicoproteínas. La endo-ß-N-acetilglucosaminidasa EndoE de E. faecalis E8 deglicosiló eficientemente la proteína S1 del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2). Tanto la EndoE silvestre como un mutante catalíticamente inactive mostraron actividad lectina frente a la proteína S1 y actividad neutralizante frente a la infección de un virus pseudotipado que presenta la proteína S de SARS-CoV-2 expresada. También se identificaron GHs putativas a través del análisis metagenómico de las heces de niños lactantes, pertenecientes a los géneros Bifidobacterium, Bacteroides, Ruminococcus, Actinomyces, Klebsiella, Phocaeicola y Streptococcus. Se seleccionaron diez ¿-L-fucosidasas GH29 (Fuc18, Fuc19A, Fuc30, Fuc35A, Fuc35B, Fuc39, Fuc193, Fuc1584, Fuc2358 y Fuc5372). Las ¿-L-fucosidasas Fuc18, Fuc19A, Fuc35B, Fuc39 y Fuc1584 mostraron actividad hidrolítica frente a enlaces de fucosa ¿-1,3/4 y Fuc35A, Fuc193 y Fuc2358 mostraron actividad enlaces de fucosa ¿-1,2/3/4/6. Fuc30 mostró actividad sobre la enlaces de fucosa ¿-1,6 mientras que Fuc5372 mostró preferencia por los enlaces ¿-1,2. Fuc2358 mostró actividad frente a glicoconjugados con lacto-N-fucopentaosa II, lacto-N-fucopentaosa III y contra la mucina. Fuc18, Fuc19A y Fuc39 eliminaron fucosa de neoglicoproteínas y de la glicoproteína ¿-1 ácida. Las ¿-L-fucosidasas aisladas fueron evaluadas por su capacidad para sintetizar fucosil-oligosacáridos (FUS) a través de reacciones de transfucosilación. Fuc2358 produjo rendimientos del 35% de 2'-fucosillactosa (2'FL) y también 3'-fucosillactosa (3'FL) y 1-fucosillactosa (1FL). Fuc5372 sintetizó 2'FL, 3'FL y 1FL, con una proporción más alta de 3'FL. Se llevó a cabo mutagénesis dirigida para aumentar los rendimientos de transfucosilación. Los mutantes Fuc2358-H132F, Fuc2358-F184H, Fuc2358-R301Q, Fuc2358-K286R y Fuc5372-R230K mostraron una mayor relación entre la 2'FL producida y el pNP-Fuc hidrolizado que sus respectivas enzimas silvestres. Además, se observó que los residuos F184 de Fuc2358 y W151 de Fuc5378 afectan a la regioselectividad de la transfucosilación, la fenilalanina aumentando la selectividad por los enlaces ¿-1,2 y el triptófano aumentando la selectividad por los enlaces ¿-1,3. Los resultados presentados muestran la diversidad de GHs presentes en la microbiota intestinal de niños lactantes y expanden el conocimiento sobre su especificidad, contribuyendo al conocimiento del posible papel de las GHs en la colonización bacteriana del tracto gastrointestinal y, además, muestra su potencial biotecnológico / [CA] Els oligosacàrids de la llet humana (OLHs) i la part glicana de glicoconjugats són hidrolitzats per les glicosil hidrolases (GHs), les quals són expressades per la microbiota intestinal de xiquets lactants, promovent l'establiment d'una microbiota intestinal amb beneficis per a la seua salut. L'objectiu d'aquesta Tesi Doctoral va ser la caracterització funcional de GHs de la microbiota intestinal de xiquets lactants capaços de metabolitzar OLHs i glicoconjugats i l'estudi de la seua rellevància biològica i el seu potencial biotecnològic. Es van aïllar soques bacterianes a partir de les femtes de xiquets lactants. Només els soques del gènere Bifidobacterium van metabolitzar algun dels OLHs testats. Bifidobacterium infantis Y538 va consumir eficientment tots els OLHs testats. Les dos soques de Bifidobacterium dentium Y510 i Y521 sol van metabolitzar lacto-N-tetraosa (LNT) i lacto-N-neotetraosa (LNnT).Es van caracteritzar dos ß-galactosidasas de B. dentium Y510; Bdg42A va exhibir la major activitat enfront de LNT, hidrolitzant-la en galactosa i lacto-N-triosa (LNTII), mentre que Bdg2A va mostrar activitat enfront de lactosa, 6'-galactopiranósil-N-acetilglucosamina, N-acetillactosamina i LNnT. També es van aïllar soques bacterianes amb activitat glicosidasa extracelul·lar. B. infantis E17 i E18, i Enterococcus faecalis E8 i E41 van exhibir activitat endo-ß-N-acetilglucosaminidasa, alliberant N-glicans de glicoproteïnes. La endo-ß-N-acetilglucosaminidasa EndoE de E. faecalis E8 va deglicosilar eficientment la proteïna S1 del coronavirus 2 del síndrome respiratori agut greu (SARS-CoV-2).Tant la EndoE salvatge com un mutant catalíticament inactiu van mostrar activitat lectina enfront de la proteïna S1 i activitat neutralitzador enfront de la infecció d'un virus pseudotipat que presenta la proteïna S de SARS-CoV-2 expressada. També es van identificar GHs putatives a través de l'anàlisi metagenómic de la femta de xiquets lactants, pertanyents als gèneres Bifidobacterium, Bacteroides, Ruminococcus, Actinomyces, Klebsiella, Phocaeicola i Streptococcus. Es van seleccionar deu ¿-L-fucosidasas GH29 (Fuc18, Fuc19A, Fuc30, Fuc35A, Fuc35B, Fuc39, Fuc193, Fuc1584, Fuc2358 i Fuc5372). Les ¿-L-fucosidasas Fuc18, Fuc19A, Fuc35B, Fuc39 i Fuc1584 van mostrar activitat hidrolítica enfront d'enllaços de fucosa ¿-1,3/4 i Fuc35A, Fuc193 i Fuc2358 van mostrar activitat enllaços de fucosa ¿-1,2/3/4/6. Fuc30 va mostrar activitat enfront d'enllaços de fucosa ¿-1,6 mentre que Fuc5372 va mostrar preferència pels enllaços ¿-1,2. Fuc2358 va mostrar activitat enfront de glicoconjugats amb lacto-N-fucopentaosa II, lacto-N-fucopentaosa III i contra la glicoproteïna de la mucina. Fuc18, Fuc19A i Fuc39 van eliminar fucosa de neoglicoproteïnes i de la glicoproteïna ¿-1 àcida. Les ¿-L-fucosidasas aïllades van ser avaluades per la seua capacitat per a sintetitzar fucosil-oligosacàrids (FUS) mediant reaccions de transfucosilació. Fuc2358 va produir rendiments del 35% de 2'-fucosillactosa (2'FL) i també 3'-fucosillactosa (3'FL) i 1-fucosillactosa (1FL). Fuc5372 va sintetitzar 2'FL, 3'FL i 1FL, amb una proporció més alta de 3'FL. Es va dur a terme mutagénesis dirigida per a augmentar els rendiments de transfucosilación. Els mutants Fuc2358-H132F, Fuc2358-F184H, Fuc2358-R301Q, Fuc2358-K286R i Fuc5372-R230K van mostrar una major relació entre la 2'FL produïda i el pNP-Fuc hidrolitzat que els seus respectius enzims salvatges.A més, els residus F184 de Fuc2358 i W151 de Fuc5378 afecten la regioselectivitat de la transfucosilación; la fenilalanina augmenta la selectivitat pels enllaços ¿-1,2 i el triptòfan augmenta la selectivitat pels enllaços ¿-1,3. Els resultats presentats mostren la diversitat de GHs presents en la microbiota intestinal de xiquets lactants i expandixen el coneixement sobre la seua especificitat, contribuint al coneixement del possible paper de les GHs en la colonització bacteriana del tracte gastrointestinal i, a més, mostra el seu potencial biotecnològic. / [EN] Human milk oligosaccharides (HMOs) and the glycan portion of glycoconjugates are hydrolyzed by glycoside hydrolases (GHs) that are expressed by the neonatal intestinal microbiota, promoting the establishment of an intestinal microbiota with health benefits for infants. The objective of this Doctoral Thesis consisted of the functional characterization of GHs from the intestinal microbiota of breastfed infants capable of metabolizing HMOs and glycoconjugates and the study of their biological relevance and their biotechnological potential. Bacterial strains were isolated from breastfed infant faeces, showing that only Bifidobacterium genus strains metabolized any of the HMOs tested. Bifidobacterium infantis Y538 efficiently consumed all tested HMOs, while the two strains isolated from Bifidobacterium dentium Y510 and Y521 only metabolized lacto-N-tetraose (LNT) and lacto-N-neotetraose (LNnT). Two ß-galactosidases from B. dentium Y510 were characterized; Bdg42A exhibited the highest activity on LNT, hydrolyzing it into galactose and lacto-N-triose (LNTII), while Bdg2A displayed activity against lactose, 6'-galactopyranosyl-N-acetylglucosamine, N-acetyllactosamine and LNnT. Bacterial strains with extracellular glycosidase activity were also isolated from breastfed infant faeces. B. infantis E17 and E18, and Enterococcus faecalis E8 and E41 exhibited endo-ß-N-acetylglucosaminidase activity, releasing N-glycans from glycoproteins. The endo-ß-N-acetylglucosaminidase EndoE from E. faecalis E8 efficiently deglycosylated the spike S1 protein of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Both the EndoE wild-type and a catalytically inactive mutant exhibited lectin activity towards the S1 protein and neutralizing activity against SARS-CoV-2 S pseudotyped virus infection. Putative GHs were also identified through metagenomic analysis of breastfed infant faeces, belonging to Bifidobacterium, Bacteroides, Ruminococcus, Actinomyces, Klebsiella, Phocaeicola, and Streptococcus genera. Ten ¿-L-fucosidases GH29 (Fuc18, Fuc19A, Fuc30, Fuc35A, Fuc35B, Fuc39, Fuc193, Fuc1584, Fuc2358, and Fuc5372) were selected. The ¿-L-fucosidases Fuc18, Fuc19A, Fuc35B, Fuc39, and Fuc1584 showed hydrolytic activity on ¿-1,3/4-linked fucose and Fuc35A, Fuc193 and Fuc2358 showed activity on ¿-1,2/3/4/6-linked fucose. Fuc30 displayed activity only on ¿-1,6-linked fucose, and Fuc5372 showed a preference for ¿-1,2-linked fucose. Fuc2358 displayed activity against glycoconjugates carrying lacto-N-fucopentaose II, lacto-N-fucopentaose III and against the mucin glycoprotein. Fuc18, Fuc19A, and Fuc39 removed fucose from neoglycoproteins and human ¿-1 acid glycoprotein. The isolated ¿-L-fucosidases were evaluated for their capacity to synthesize fucosyl-oligosaccharides (FUS) through transfucosylation reactions. Fuc2358 produced 35 % yields of 2'-fucosyllactose (2'FL) and also 3'-fucosyllactose (3'FL) and 1-fucosyllactose (1FL). Fuc5372 synthesized 2'FL, 3'FL and 1FL, with a higher proportion of 3'FL. Site-directed mutagenesis was conducted to increase the transglycosylation yields. Mutants Fuc2358-H132F, Fuc2358-F184H, Fuc2358-R301Q, Fuc2358-K286R and Fuc5372-R230K showed a higher ratio between 2'FL yields and hydrolyzed pNP-Fuc than their respective wild-type enzymes. The transfucosylation activity results also showed that the residues F184 of Fuc2358 and W151 of Fuc5378 affect transfucosylation regioselectivity, with phenylalanine increasing the selectivity for ¿-1,2 linkages and tryptophan for ¿-1,3 linkages. The results presented in this doctoral thesis illustrate the diversity of GHs in the intestinal microbiota of breastfed infants and have expanded our knowledge of their specificities, which could contribute to a better understanding of the possible role of GHs in the bacterial colonization of the infant gastrointestinal tract and presents significant biotechnological potential. / This work is part of the Grant PID2020-115403RB (C21 and C22) funded by the Spanish Ministry of Science and Innovation (MICIN)/Spanish State Research Agency (AEI)/10.13039/501100011033. The study was also supported by Valencian Government grant AICO/2021/033. EMM-G was supported by the Grant PRE2018-085768 funded by MICIN/AEI/10.13039/501100011033 and by “ESF Investing in your future”. / Moya Gonzálvez, EM. (2024). Isolation, Functional Characterization and Biotechnological Applications of Glycoside Hydrolases from the Intestinal Microbiota of Breastfed Infants [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/203171 / Compendio

Synthesizing proteins for use in therapeutics is restrained by, in part, contaminants in in vivo expression systems and limited production capacity of in vitro systems. Cell free expression (CFE) systems have emerged as a potential alternative for protein expression because of the inherently lower contents of contaminants, and their flexible modular design that allows the addition of factors that aid in synthesis of complex products. Here, we investigate and establish an in-house Escherichia coli-based cell free protein synthesis (CFPS) system, explore different CFPS commercial kits, develop assays to test performance of these systems and identify potential rules that dictate expression levels. Using CFE, we were able to test different vectors and conditions of system, as well as scale-up protein synthesis reactions. In conclusion, this work shows that CFPS is a functional and easy-to-use platform and can potentially meet the requirements for the synthesis of therapeutics.

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Tesis por compendio / [ES] El brote de Coronavirus SARS-CoV-2 representó un reto para la economía, la vida social y los servicios sanitarios. Justo cuando más se necesitaba la información para la planificación económica, los servicios de vigilancia y notificación no fueron capaces de ofrecer, a pesar de esfuerzos extraordinarios, datos consistentes, como así reconocieron los propios orga-nismos gubernamentales. Esta tesis incluye tres artículos publicados durante los brotes de COVID-19 y una investi-gación adicional fuera del conjunto de publicaciones. La investigación tiene como objetivo general proporcionar información a través de estimaciones alternativas. Para ello se han utilizado varias metodologías, entre ellas los modelos matemáticos de predicción epidemio-lógica, el Mejor Ajuste de Valores Relacionados (BARV), los análisis de diferentes encues-tas y la metodología bibliométrica, aprovechando u ofreciendo alternativas a los métodos bayesianos más complejos, las simulaciones de Monte Carlo o las cadenas de Markov, aun-que algunos datos obtenidos se apoyan parcialmente en estas metodologías. Cada artículo aborda un tema esencial relacionado con la pandemia COVID-19. La primera publicación se centra en los datos epidemiológicos básicos. Se refiere al primer brote de COVID-19, estimando su duración, incidencia, prevalencia, tasa de fallecimientos sobre infectados (IFR) y tasa de fallecimientos sobre casos (confirmados) (CFR). Como dato destacado de este trabajo, se previó que la seroprevalencia era demasiado baja para que la inmunidad de rebaño desempeñara algún papel. Aunque el valor obtenido fue aproxima-damente un 2% inferior al que demostró posteriormente un estudio poblacional (Instituto Carlos III), la conclusión sobre la inmunidad de rebaño no cambió, y los resultados confir-maron la idoneidad del enfoque. La segunda publicación se centró en las cuestiones legales y las noticias falsas, analizando la reticencia de la población a vacunarse, el impacto de las falsas noticas en estos comporta-mientos, las posibilidades legales de hacer obligatoria la vacuna y las posibles acciones contra los profesionales de la salud que publican noticias falsas. La principal conclusión fue que, aunque se podría encontrar una vía legal para la obligatoriedad de la vacunación, y para la persecución gubernamental de las noticias falsas, la opinión ciudadana parece prefe-rir que la administración no tome la iniciativa, por lo que se recomienda promover y fomen-tar la concienciación ciudadana. La tercera publicación presentó un modelo matemático simplificado para la estimación del coste-efectividad de la vacuna contra la COVID-19. Se actualizan los datos de dos fechas para la estimación de los costes directos para el sistema sanitario debidos a la COVID-19, computando el coste por ciudadano y por Producto Interior Bruto (PIB), así como el coste-efectividad de la vacuna. La estimó razón de coste-efectividad incremental (RCEI) para dos dosis por persona a un coste de 30 euros cada dosis (incluida la administración). Asumien-do al 70% de efectividad y con el 70% de la población vacunada resultó ser de 5.132 euros (4.926 - 5.276) por año de vida ajustado a calidad (AVAC) ganado (a 17 de febrero de 2021). Una cifra que desciende cada día de pandemia activa. Se incluyó una investigación adicional, no incorporada en el conjunto de artículos, centrada en los recursos humanos y la educación. Se analizaron los temas preocupan al personal de primera línea, es decir, a la enfermería, y cómo la pandemia ha afectado a sus publicaciones científicas, como índice de los cambios en el clima laboral que sufre este colectivo. Median-te un estudio bibliométrico comparativo entre las publicaciones de 2019 y 2020, se analizó el cambio de temas y ámbitos como reflejo del impacto del COVID-19 en el personal de enfermería. Así se comprobó que, en los ámbitos de enfermería de atención especializada, y sobre todo e / [CA] El brot de Coronavirus SARS-CoV-2 va representar un repte per a l'economia, la vida soci-al i els serveis sanitaris. Quan més es necessitava la informació per a la planificació econò-mica, malgrat esforços extraordinaris, els serveis de vigilància i notificació no van ser capa-ços d'oferir dades consistents, com així van reconèixer els mateixos organismes governa-mentals. Aquesta tesi inclou tres articles publicats durant els brots de COVID-19 i una investigació addicional fora del conjunt de publicacions. La investigació té com a objectiu general pro-porcionar informació a través d'estimacions alternatives. Per a això s'han utilitzat diverses metodologies, entre elles els models matemàtics de predicció epidemiològica, el Millor Ajust de Valors Relacionats (BARV), les anàlisis de diferents enquestes i la metodologia bibliomètrica, aprofitant o oferint opcions alternatives als mètodes bayesians més comple-xos, les simulacions de Montecarlo o les cadenes de Markov, tot i que algunes dades obtin-gudes es recolzen parcialment en aquestes metodologies. Cada article aborda un tema essen-cial relacionat amb la pandèmia COVID-19. La primera publicació se centra en les dades epidemiològiques bàsiques. Es refereix al pri-mer brot de COVID-19, calculant la seua durada, incidència, prevalença, taxa de defuncions sobre infectats (IFR) i taxa de defuncions sobre casos (confirmats) (CFR). Com a dada des-tacada d'aquest treball, es va preveure que la seroprevalença era massa baixa perquè la im-munitat de ramat exercirà algun paper. Tot i que el valor obtingut va ser aproximadament un 2% inferior al demostrat posteriorment en un estudi poblacional (Institut Carles III), la conclusió sobre la immunitat de ramat no va canviar, i els resultats van confirmar la idoneï-tat de l'enfocament. La segona publicació es va centrar en les qüestions legals i les notícies falses, analitzant la reticència de la població a vacunar-se, l'impacte de les falses notícies en aquests comporta-ments, les possibilitats legals de fer obligatòria la vacuna i les possibles accions contra els professionals de la salut que publiquen notícies falses. La principal conclusió va ser que, tot i que es podria trobar una via legal per l'obligatorietat de la vacunació, i per la persecució governamental de les notícies falses, l'opinió ciutadana sembla preferir que l'administració no prenga la iniciativa, per la qual cosa es recomana promoure i fomentar la conscienciació ciutadana. La tercera publicació va presentar un model matemàtic simplificat per a l'estimació del cost-efectivitat de la vacuna contra la COVID-19. S'actualitzen les dades de dues dates per a l'estimació dels costos directes per al sistema sanitari deguts a la COVID-19, computant el cost per ciutadà i per Producte Interior Brut (PIB), així com el cost-efectivitat de la vacuna. La va estimar raó de cost-efectivitat incremental (RCEI) per dues dosis per persona a un cost de 30 euros cada dosi (inclosa l'administració). Assumint al 70% d'efectivitat i amb el 70% de la població vacunada va resultar ser de 5.132 euros (4.926 - 5.276) per any de vida ajustat a qualitat (AVAQ) (a 17 de febrer de 2021). Una xifra que descendeix cada dia de pandèmia activa. Es va afegir una investigació addicional, no inclosa en el conjunt d'articles, centrada en els recursos humans i l'educació. Es van analitzar els temes que preocupen al personal de pri-mera línia, és a dir, a la infermeria, i com la pandèmia ha afectat les seues publicacions cien-tífiques, com a índex dels canvis en el clima laboral que pateix aquest col·lectiu. Mitjançant un estudi bibliomètric comparatiu entre les publicacions de 2019 i 2020, es va analitzar el canvi de temes i camps com a reflex de l'impacte del COVID-19 en el personal d'infermeria. Així es va comprovar que en els àmbits d'infermeria d'atenció especialitzada, i sobretot en atenció primària, els principals problemes detectat / [EN] The SARS-CoV-2 Coronavirus outbreak has posed a challenge to the economy, social life, and health services. Just when information was most needed for economic planning, moni-toring, and reporting services were unable, despite extraordinary efforts to provide con-sistent data, as government agencies themselves acknowledged. This thesis includes three articles published during the COVID-19 outbreaks and additional research outside the publication set. The overall aim of the research is to provide infor-mation through alternative estimates. Several methodologies have been used, including mathematical models for epidemiological prediction, Best Adjustment of Related Values (BARV), analyses of different surveys and bibliometric methodology, taking advantage of or offering an alternative to, more complex options such as Bayesian methods, Monte Carlo simulations or Markov chains, although some data obtained are partially supported by these methodologies. Each article addresses a key issue related to the COVID-19 pandemic. The first publication focuses on basic epidemiological data. It refers to the first outbreak of COVID-19, estimating its duration, incidence, prevalence, Infection Fatality Rate (IFR) and Case Fatality Rate (CFR). As a highlight of this work, the seroprevalence was anticipated to be too low for herd immunity to play a role. Although the value obtained was approximate-ly 2% lower than that subsequently demonstrated by a population-based study (Instituto Carlos III), the conclusion on herd immunity remained unchanged, and the results con-firmed the appropriateness of the approach. The second publication focuses on legal issues and fake news, analysing reluctance to be vaccinated in the population, the impact of fake news on these behaviours, the legal possi-bilities of making vaccination mandatory, and possible actions against health professionals who publish fake news. The main conclusion was that, although a legal avenue could be found for mandatory vaccination and for governmental prosecution of fake news, public opinion seems to prefer that the authorities do not take the initiative, therefore it recom-mends promoting and encouraging public awareness. The third publication presented a simplified mathematical model for estimating the cost-effectiveness of the COVID-19 vaccine. Data from two dates were obtained for the estimation of the direct costs to the health system due to COVID-19, computing the cost per citizen and per Gross Domestic Product (GDP), as well as the cost-effectiveness of the vaccine. The estimated incremental cost-effectiveness ratio (ICER) was calculated for two doses per person at a cost of 30 euros per dose (including administration). Assuming 70% effectiveness and with 70% of the population vaccinated, it was found to be 5,132 euros (4,926 - 5,276) per quality-adjusted life year (QALY) gained (as of 17 February 2021). The figure decreases with each day of the active pandemic. Additional research not included in the set of articles focuses on human resources and education. It analyses the concerns of frontline staff, i.e., nurses, and how the pandemic has affected their scientific publications, as an index of the changes in the work climate experienced by this group. Through a comparative bibliometric study of publications in 2019 and 2020, the change in topics and fields was analysed, as a reflection of the impact of COVID-19 on nursing staff. It was found that in the fields of specialised care nursing and above all in primary care, the main problems detected are those related to protective measures and psychological factors, while the publications of nursing staff in nursing homes showed an increase in topics related to management and organisation. Finally, some aspects of the implementation of telecommuting and distance learning have been reviewed. Some of the boosts in this field resulting from the pandemic could be very useful and remain in the future, such as the incorporation of telewo / Marco Franco, JE. (2021). What have we learned from the economic impact of the Covid-19 outbreak? Critical analysis of economic factors and recommendations for the future [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/174883 / Compendio

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