Orchids are characterized by producing minute endosperm-lacking seeds, which depend on mycorrhizal fungi for germination and embryo development. Some aclorophyllous orchids remain dependent on the mycorrhizal association for carbon acquisition during their whole life history, whereasother orchids develop photosynthesis. Despite the biological significance of orchid mycorrhiza, gene expression studies are lacking. We have used different highthroughput approaches in order to understanding the mechanisms regulating orchid mycorrhiza development and functioning. Firstly, we have used a 2D-LC-MS/MS approach coupled to isobaric tagging for relative and absolute quantification (iTRAQ) to identify proteins with differential accumulation in Oncidium sphacelatum at different stages of mycorrhizal protocorm development (achlorophyllous and green protocorms) after seed inoculation with a Ceratobasidium sp. isolate. Quantitative analysis showed that the expected changes in carbon metabolism in green protocorms were accompanied by enhanced accumulation of proteins involved in the modulation of reactive oxygen species homeostasis, defense related responses, phytoalexins and carotenoid biosynthesis, suggesting that orchid protocorms undergo profound metabolic changes during the switch from the fully mycoheterotrophic to the photosynthethic stage. Secondly, three different proteomic techniques were carried out in independent experiments aiming to identify changes in protein accumulation in mycorrhizal roots of the terrestrial orchid Oeceoclades maculata.Finally, O. maculatamycorrhizal roots were used for transcriptome analyses. The data revealed a strong increase in general stress responses, accompanied by changes in signaling pathways possibly related to fungal recognition and establishment of a compatible interaction. Some of the upregulated genes may be involved in the reorganization of cell structure, likely related to accommodation of the fungal symbiont in the plant roots. We have also observed in mycorrhizal roots up-regulation of genes involved in carbon metabolism, including glycolysis/gluconeogenesis and amino sugars metabolism, as well as genes involved innitrogen assimilation. The down-regulation of genes involved in the jasmonate and ABA transduction pathways, and key genes encoding anti-fungal proteins, such as chitinase and a mannose-specific binding lectin, strongly suggests an alleviation of plant defense responses in O. maculata mycorrhizal roots. In general, our data suggest that the physiology of an orchid mycorrhiza is more similar to a compatible interaction than to an arm-race between plant and fungi. Overall orchid mycorrhiza have proved to be a promising model for investigating plantfungal interactions and further studies should now address the specific roles of the genes showing differential regulation in this study. / As orquídeas são caracterizadas por produzirem sementes diminutas, que não possuem endosperma. Necessitam, portanto, da interação com fungos micorrízicos para germinação e desenvolvimento do embrião. Algumas orquídeas aclorofiladas se mantêm dependentes dos fungos micorrízicos para a aquisição de carbono, enquanto outras desenvolvem a maquinaria fotossintética. Apesar do significado biológico das micorrizas de orquídeas, alterações na expressão gênica e no acúmulo de proteínas foram altamente negligenciads nos últimos anos. Neste trabalho, foram utilizadas diferentes técnicas sequenciamento e identificação de genes e proteínas em larga-escala para acessar as alterações moleculares responsáveis pela regulação das micorrizas de orquídeas. Uma abordagem baseada em 2D-LC MS/MS acoplada a técnica de quantificação absoluta e relativa iTRAQ, foiutilizada para identificar proteínas com acúmulo diferencial em Oncidium sphacelatum em diferentes estágios do desenvolvimento do protocormo (protocormos aclorofilados versus protocormos fotossintetizantes), após inoculação com um fungo do gênero Ceratobasidium. As análises mostraram que, as alterações esperadas no metabolismo do carbono foram acompanhadas de um acúmulo aumentado de proteínas envolvidas na modulação de espécies reativas de oxigênio, respostas de defesa, biossíntese de fitoalexinas e carotenóides, sugerindo que os protocormos de orquídeas passam por profundas alterações metabolicas durante a transição do metabolismo micoheterotrófico para o fotossintético. Posteriormente foram utilizadas três diferentes técnicas de proteômica quantitativa para explorar alterações fisiológicas em raízes micorrizadas e não-micorrizadas de Oeceoclades maculata.Este estudo foi ampliado, pela utilização de uma abordagem transcritômica ao mesmo modelo biológico. Em conjunto, os dados revelaram um forte aumento em respostas relacionadas ao estresse, acompanhadas de alterações em vias de transdução de sinal possivelmente relacionadas ao reconhecimento do simbionte fúngico e estabelecimento de uma interação compatível. Alguns genes com expressão aumentada devem estar envolvidos na reorganização celular, provavelmente ligada a acomodação do simbionte fúngico nas raízes das plantas. Também foi observado o aumento de genes envolvidos no metabolismo do carbono e de açúcares aminados, juntamente a genes relacionados a assimilação de nitrogênio em raízes micorrizadas. A expressão diminuída de genes envolvidas nas vias do jasmonato e ácido abscícico, juntamente a genes-chave que codificam para proteínas anti-fúngicas sugerem fortemente uma atenuação das respostas de defesa da planta em raízes micorrizadas de Oeceoclades maculata. No geral, parece que as micorrizas de orquídeas são fisiológicamente mais próximas de uma simbiose compatível do que de uma interação unilateral em favor da planta. Sobretudo, este sistema biológico provou ser promissor para investigação de interações planta-fungo e, próximas pesquisas devem agora ser focadas em funções específicas dos genes que mostraram regulação diferencial neste estudo.

Orchids are characterized by producing minute endosperm-lacking seeds, which depend on mycorrhizal fungi for germination and embryo development. Some aclorophyllous orchids remain dependent on the mycorrhizal association for carbon acquisition during their whole life history, whereasother orchids develop photosynthesis. Despite the biological significance of orchid mycorrhiza, gene expression studies are lacking. We have used different highthroughput approaches in order to understanding the mechanisms regulating orchid mycorrhiza development and functioning. Firstly, we have used a 2D-LC-MS/MS approach coupled to isobaric tagging for relative and absolute quantification (iTRAQ) to identify proteins with differential accumulation in Oncidium sphacelatum at different stages of mycorrhizal protocorm development (achlorophyllous and green protocorms) after seed inoculation with a Ceratobasidium sp. isolate. Quantitative analysis showed that the expected changes in carbon metabolism in green protocorms were accompanied by enhanced accumulation of proteins involved in the modulation of reactive oxygen species homeostasis, defense related responses, phytoalexins and carotenoid biosynthesis, suggesting that orchid protocorms undergo profound metabolic changes during the switch from the fully mycoheterotrophic to the photosynthethic stage. Secondly, three different proteomic techniques were carried out in independent experiments aiming to identify changes in protein accumulation in mycorrhizal roots of the terrestrial orchid Oeceoclades maculata.Finally, O. maculatamycorrhizal roots were used for transcriptome analyses. The data revealed a strong increase in general stress responses, accompanied by changes in signaling pathways possibly related to fungal recognition and establishment of a compatible interaction. Some of the upregulated genes may be involved in the reorganization of cell structure, likely related to accommodation of the fungal symbiont in the plant roots. We have also observed in mycorrhizal roots up-regulation of genes involved in carbon metabolism, including glycolysis/gluconeogenesis and amino sugars metabolism, as well as genes involved innitrogen assimilation. The down-regulation of genes involved in the jasmonate and ABA transduction pathways, and key genes encoding anti-fungal proteins, such as chitinase and a mannose-specific binding lectin, strongly suggests an alleviation of plant defense responses in O. maculata mycorrhizal roots. In general, our data suggest that the physiology of an orchid mycorrhiza is more similar to a compatible interaction than to an arm-race between plant and fungi. Overall orchid mycorrhiza have proved to be a promising model for investigating plantfungal interactions and further studies should now address the specific roles of the genes showing differential regulation in this study. / As orquídeas são caracterizadas por produzirem sementes diminutas, que não possuem endosperma. Necessitam, portanto, da interação com fungos micorrízicos para germinação e desenvolvimento do embrião. Algumas orquídeas aclorofiladas se mantêm dependentes dos fungos micorrízicos para a aquisição de carbono, enquanto outras desenvolvem a maquinaria fotossintética. Apesar do significado biológico das micorrizas de orquídeas, alterações na expressão gênica e no acúmulo de proteínas foram altamente negligenciads nos últimos anos. Neste trabalho, foram utilizadas diferentes técnicas sequenciamento e identificação de genes e proteínas em larga-escala para acessar as alterações moleculares responsáveis pela regulação das micorrizas de orquídeas. Uma abordagem baseada em 2D-LC MS/MS acoplada a técnica de quantificação absoluta e relativa iTRAQ, foiutilizada para identificar proteínas com acúmulo diferencial em Oncidium sphacelatum em diferentes estágios do desenvolvimento do protocormo (protocormos aclorofilados versus protocormos fotossintetizantes), após inoculação com um fungo do gênero Ceratobasidium. As análises mostraram que, as alterações esperadas no metabolismo do carbono foram acompanhadas de um acúmulo aumentado de proteínas envolvidas na modulação de espécies reativas de oxigênio, respostas de defesa, biossíntese de fitoalexinas e carotenóides, sugerindo que os protocormos de orquídeas passam por profundas alterações metabolicas durante a transição do metabolismo micoheterotrófico para o fotossintético. Posteriormente foram utilizadas três diferentes técnicas de proteômica quantitativa para explorar alterações fisiológicas em raízes micorrizadas e não-micorrizadas de Oeceoclades maculata.Este estudo foi ampliado, pela utilização de uma abordagem transcritômica ao mesmo modelo biológico. Em conjunto, os dados revelaram um forte aumento em respostas relacionadas ao estresse, acompanhadas de alterações em vias de transdução de sinal possivelmente relacionadas ao reconhecimento do simbionte fúngico e estabelecimento de uma interação compatível. Alguns genes com expressão aumentada devem estar envolvidos na reorganização celular, provavelmente ligada a acomodação do simbionte fúngico nas raízes das plantas. Também foi observado o aumento de genes envolvidos no metabolismo do carbono e de açúcares aminados, juntamente a genes relacionados a assimilação de nitrogênio em raízes micorrizadas. A expressão diminuída de genes envolvidas nas vias do jasmonato e ácido abscícico, juntamente a genes-chave que codificam para proteínas anti-fúngicas sugerem fortemente uma atenuação das respostas de defesa da planta em raízes micorrizadas de Oeceoclades maculata. No geral, parece que as micorrizas de orquídeas são fisiológicamente mais próximas de uma simbiose compatível do que de uma interação unilateral em favor da planta. Sobretudo, este sistema biológico provou ser promissor para investigação de interações planta-fungo e, próximas pesquisas devem agora ser focadas em funções específicas dos genes que mostraram regulação diferencial neste estudo.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-01-15T21:53:38Z No. of bitstreams: 1 IzabelleVirginiaLopesDePaiva_DISSERT.pdf: 2707348 bytes, checksum: 0ca95ec4431b14103b77ba2857a54ba1 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-01-17T16:11:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 IzabelleVirginiaLopesDePaiva_DISSERT.pdf: 2707348 bytes, checksum: 0ca95ec4431b14103b77ba2857a54ba1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-17T16:11:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 IzabelleVirginiaLopesDePaiva_DISSERT.pdf: 2707348 bytes, checksum: 0ca95ec4431b14103b77ba2857a54ba1 (MD5) Previous issue date: 2016-07-28 / O modelo de produ??o observado na ind?stria da constru??o civil utiliza em boa parte recursos naturais n?o renov?veis e ? respons?vel pela gera??o de uma grande quantidade de res?duos. Uma das formas de amenizar os impactos desses res?duos ? a reciclagem. Diante deste cen?rio, o objetivo deste trabalho ? propor a cria??o de uma usina de reciclagem de Res?duos da Constru??o Civil na perspectiva da simbiose industrial, avaliando a sua viabilidade econ?mica e ambiental. A pesquisa ? um Estudo de caso de car?ter explorat?rio, de natureza aplicada, com uma abordagem quanti-qualitativa. Um question?rio estruturado foi aplicado junto ?s empresas da constru??o civil da grande Natal, cadastradas no SINDUSCON-RN, com o objetivo de conhecer a quantidade m?dia de res?duos gerada pelas construtoras, o destino dado aos res?duos e se h? separa??o dos res?duos na obra antes da destina??o. Com isso foi poss?vel estimar o tamanho da usina e seu volume de produ??o, para, assim, dimensionar os impactos ambientais envolvidos e estimar os custos e despesas, fatores essenciais para realiza??o das an?lises de viabilidade. Utilizou-se o Estudo de Impacto Ambiental (EIA) para a avalia??o ambiental e os m?todos de Valor Presente L?quido (VPL), Taxa Interna de Retorno (TIR) e payback para a realiza??o da avalia??o econ?mica. O trabalho concluiu que a implanta??o da usina de reciclagem de res?duos da constru??o civil na regi?o metropolitana de Natal ? vi?vel tanto ambiental quanto economicamente, bem como a organiza??o de forma simbi?tica das empresas ? vista de forma positiva no sentido de incentivar a separa??o dos res?duos na obra e, consequentemente, melhorar a qualidade do agregado reciclado produzido. Al?m disso, o reaproveitamento de res?duos pelas pr?prias construtoras reduz a extra??o de recursos naturais n?o renov?veis e a gera??o de novos res?duos, contribuindo para a diminui??o do impacto ambiental gerado por este setor. / The production model observed in the construction industry uses largely non-renewable natural resources and is responsible for generating a large number of waste. One way to mitigate the impacts of this waste is recycling. In this scenario, the objective of this study is to propose the creation of a construction waste recycling plant from the perspective of industrial symbiosis, assessing their economic and environmental viability. The research is an exploratory case study of applied nature, with a quantitative and qualitative approach. A structured questionnaire was administered with the companies of civil construction of the great Natal registered in SINDUSCON-RN, in order to know the average amount of waste generated by construction companies, the destination of the waste and if there is separation of waste in the work before allocation. Thus, it was possible to estimate the size of the plant and its production volume, to thereby scale the environmental impacts involved and estimate the costs and expenses, essential factors for carrying out feasibility studies. We used the Environmental Impact Assessment (EIA) for environmental assessment and methods of Net Present Value (NPV), Internal Rate of Return (IRR) and payback for the realization of economic evaluation. The study concluded that the implementation of the construction waste recycling plant in the metropolitan region of Natal is viable environment as much as economically, as well as the organization symbiotically of companies is seen in a positive way to encourage the separation of waste at work and, consequently, improve the quality of the recycled aggregate produced. In addition, the reuse of waste by own construction companies reduces the extraction of non-renewable natural resources and the generation of new waste, contributing to the reduction of the environmental impact generated by this sector.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-28T15:07:29Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1959285 bytes, checksum: 899be21930ffc050976fe55ee57f724f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-28T15:07:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1959285 bytes, checksum: 899be21930ffc050976fe55ee57f724f (MD5) Previous issue date: 2012-07-06 / O Brasil possui uma grande biodiversidade de orquídeas, principalmente de espécies epífitas. Dentre essa diversidade ressaltam-se as espécies Hadrolaelia jongheana, Hoffmannseggella cinnabarina, Hoffmannseggella caulescens presentes em diferentes formações vegetacionais da Floresta Atlântica. As espécies pertencentes à família Orchidaceae associam-se com fungos micorrízicos para promover a germinação de sementes e o estabelecimento do protocormo em seu ambiente natural. O conhecimento da diversidade da comunidade microbiana com qual a orquídea mantém essa associação é de extrema relevância para a compreensão da ecologia e complexidade das associações simbióticas. O presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade genética dos fungos associados às orquídeas H. jongheana, H. cinnabarina, H. caulescens, utilizando-se abordagens moleculares, como a contrução de bibliotecas de clones e amplificação do DNA diretamente das raízes. Os valores do índice de diversidade de Shannon-Wiener para H. cinnabarina, coletada em distintas áreas, foram diferentes, sugerindo que os fatores locais influenciam na diversidade. Observamos que as comunidades fúngicas das três espécies de orquídeas analisadas apresentaram alta diversidade, sendo a composição dessas comunidades estruturalmente diferentes entre si de acordo com as análises do LIBSHUFF. A construção de bibliotecas de clones permitiu identificar táxons de fungos basidiomicetos e ascomicetos associados às raízes dessas plantas. Os fungos basidiomicetos encontrados, em sua maioria, são potenciais candidatos a fungos micorrízicos de orquídeas. Ao passo que, os ascomicetos identificados são, possivelmente, fungos endofíticos dessas plantas. Além disso, verificamos que essas orquídeas tropicais são generalistas em suas associações micorrízicas com fungos rizoctonióides sebacinóides e tulasnelóides. Estes resultados são relevantes à medida que são informações importantes para traçar estratégias de conservação para espécies da flora brasileira ameaçadas de extinção e endêmicas de um importante e ameaçado hotspot. / Brazil has a huge orchid biodiversity, mostly epiphytic species. Among this we emphasize Hadrolaelia jongheana, Hoffmannseggella cinnabarina, and Hoffmannseggella caulescens species occur in different vegetation formations of the Atlantic Forest. The species belonging to the family Orchidaceae are associated with mycorrhizal fungi to promote seed germination and establishment of protocormo in their natural environment. The knowledge of the microbial community diversity which the orchids maintain association is extremely important for understanding the ecology and complexity of symbiotic associations. The present work aimed to study the genetic diversity of fungi associated with orchids H.jongheana, H. cinnabarina, H. caulescens, using molecular approaches, such as the clone library construction and DNA amplification directly from the roots. The values of diversity index Shannon-Wiener for H. cinnabarina, collected in different areas were different, suggesting that local factors influence the diversity.We observed that the fungal communities of those three orchid species analyzed showed high diversity, and the composition of these communities are structurally different from each other according to the LIBSHUFF analysis. The clones libraries construction allowed to identify Basidiomycetes and Ascomycetes taxa associated with the roots of these plants. Basidiomycete fungi found, mostly, are potential candidates for orchid mycorrhizal fungi. While the identified Ascomycete fungi found are possibly endophytes of these plants. Furthermore, we found that these tropical orchids are generalists in their mycorrhizal associations with sebacnioid and tulasnelloid Rhizoctonia-like fungi. These results are relevant as they are important information to develop conservation strategies to threaten and endemic Brazilian orchid species from an important and threatened hotspot. / Dissertação antiga

Simbiose é a associação permanente entre dois ou mais organismos de espécies distintas, pelo menos durante uma parte do ciclo de vida. Existe uma grande diversidade de casos de simbiose, os quais são frequentemente classificados de acordo com os benefícios ou deficits no valor adaptativo do hospedeiro, i.e., mutualismo, comensalismo ou parasitismo. Outras características importantes são a localização, a dependência e o modo de transmissão dos simbiontes. O conjunto de organismos selecionado para este trabalho consiste de 58 bactérias que foram agrupadas segundo características das associações simbióticas que elas estabelecem. A análise comparativa das redes metabólicas foi realizada de forma sistêmica, analisando toda a rede sem fazer a partição em vias metabólicas selecionadas a priori. Duas maneiras de comparação foram utilizadas: (i) análise dos conjuntos de compostos e de reações, e (ii) análise da topologia das redes metabólicas modeladas como grafos de compostos. Como fruto dessas análises foi possível observar o contraste entre a conservação de um núcleo metabólico nas bactérias extracelulares, de vida livre e associadas à célula, e a ausência de partes comuns da rede metabólica nas intracelulares estritas. Nota-se que o grupo das mutualistas (MIV) foi o que especialmente contribuiu para os valores baixos de interseção para os conjuntos de compostos e de reações. Esses endocitobiontes apresentam uma proporção maior dos seus genomas dedicada ao metabolismo. Além disso, partes distintas do metabolismo foram conservadas em diferentes subconjuntos dessas bactérias intracelulares mutualistas. / Symbiosis is the permanent association between two or more organisms that are distinct, at least during a part of the life cycle. Cases of symbiosis are widely diverse and are often classified based on the benefits or the deficits on the host fitness, e.g., mutualism, commensalism or parasitism. Location, type of dependency and transmission of the symbionts are also important features. The data set is composed of 58 bacteria which were grouped according to the features of the symbiotic associations established by them. The metabolic network comparison was carried out in a systematic way, taking into account the whole network without previously selecting metabolic pathways. The comparison was performed by analysing: (i) the sets of compounds and reactions, and (ii) the topology of the metabolic networks modelled as compound graphs. A conserved metabolic core inside the groups of extracellular, free-living and cell-associated bacteria was observed, contrasting with the absence of common parts in the metabolic networks of the obligate intracellular bacteria. The group of mutualists (MIV) specially contributed to the low values of the intersections of sets of compounds and reactions. The portion of the genome dedicated to metabolism is higher in these endocytobionts and distinct parts of the metabolism were conserved in different subsets of the intracellular mutualist bacteria.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2506.pdf: 900946 bytes, checksum: 97bcd58db188bc414e74218995bbe7c1 (MD5) Previous issue date: 2009-05-27 / Financiadora de Estudos e Projetos / A hundred sixty samples of water were collected to assess the sanitary and ecoepidemiological conditions of collective swimming pools in São Carlos SP. The samples were collected between August/2007 and Abril/2008. The pools were characterized by application of a questionnaire, answered by people responsable for the water treatment. Physical and chemical analysis included: pH, temperature, alkalinity, free chlorine concentration and turbidity. All water samples were analyzed for heterotrophic plate counts by pour plate method. Membrane filter technique was used to isolate amoebae and other bacteria. Eleven pools were heated and nine were unheated. Half of the pools was indoors and the other half was outdoors. Seventeen pools were chlorinated and three pools had a combined disinfection, two using chlorine and UV and one using chlorine and ozone. Only 13 samples (8%) conformed within the desired standards for pH, turbidity and free chlorine concentration at the same time. Twelve samples (7.5 %) were unacceptable for heterotrophic bacteria and 63 (39 %) were unsatisfactory for the presence of total coliforms. Escherichia coli was detected in two samples. Moreover, 102 samples (64 %) were contaminated with at least one microorganism.The percentages of occurrence were: 14 % for Staphylococcus spp, 35 % for Pseudomonas spp, 33 % for Mycobacterium spp and 21 % for free-living amoebae. The amoebae identified were used to recover bacteria possibly present intracellularly . Of these 33 samples positive for protozoa, 18 (54 %) harbored Mycobacterium spp, 15 (45 %) harbored Pseudomonas spp and one (3 %) harbored Staphylococcus spp. Escherichia coli was not recovered from amoebae. The physical and chemical parameters most related to the occurrence of microorganisms in the samples studied were pH and chlorine. No significant relationship was identified between water temperature and occurrence of microorganisms. Overall, the inappropriate forms of treatment and maintenance of swimming pools studied might create conditions for the development of microorganisms, including those potentially pathogenic for human. / Com o intuito de avaliar as condições ecoepidemiológicas e sanitárias de piscinas coletivas da cidade de São Carlos SP, foram coletadas 160 amostras de água em 20 piscinas, entre Agosto/2007 e Abril/2008. As piscinas foram caracterizadas através de aplicação de questionário junto aos responsáveis pelo tratamento da água. Os parâmetros físico-químicos analisados foram: pH, temperatura, alcalinidade, concentração de cloro livre e turbidez. A análise microbiológica foi realizada através de contagem de bactérias heterotróficas (método de pour plate ) e de concentração em membrana filtrante para a pesquisa de coliformes totais, Escherichia coli, Staphylococcus spp, Pseudomonas spp, Mycobacterium spp e amebas de vida livre. Entre as piscinas analisadas, 11 eram aquecidas e nove não-aquecidas. Metade das piscinas localizava-se em ambiente interno e a outra metade em ambiente externo. Dezessete piscinas eram cloradas e três delas faziam tratamento de desinfecção combinado: duas utilizando cloro e UV e uma utilizando cloro e ozônio. Apenas 13 amostras (8 %) se apresentaram dentro dos padrões desejados para pH, turbidez e concentração de cloro livre ao mesmo tempo. Doze amostras (7,5 %) estavam fora do padrão sugerido para bactérias heterotróficas e 63 (39 %) foram consideradas insatisfatórias quanto à presença de coliformes totais. Escherichia coli foi detectada em duas amostras apenas. Em relação aos outros microrganismos pesquisados, 102 amostras (64 %) apresentaram-se com pelo menos um deles. As porcentagens de ocorrência foram: 14 % para Staphylococcus spp, 35 % para Pseudomonas spp, 33 % para Mycobacterium spp e 21 % para amebas de vida livre. As amebas detectadas foram utilizadas para recuperar bactérias possivelmente presentes em seu interior. Das 33 amostras positivas para esses protozoários, 18 (54 %) demonstraram hospedar Mycobacterium spp, 15 (45 %) abrigavam Pseudomonas spp e uma (3 %) apresentava Staphylococcus spp internalizados. Escherichia coli não foi recuperada a partir de células amebianas. Os parâmetros físico-químicos mais relacionados com a ocorrência de microrganismos nas amostras estudadas foram o pH e o cloro. Não foi identificada relação significativa entre a temperatura da água e a ocorrência de microrganismos. De forma geral, foi possível observar certo descuido quanto às formas adequadas de tratamento e manutenção das águas das piscinas estudadas, o que pode colocar em risco a saúde dos freqüentadores, ao criar condições para o desenvolvimento de microrganismos, inclusive para aqueles potencialmente patogênicos.

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para avaliar potenciais ações visando à minimização dos custos ambientais a partir dos conceitos da Simbiose Industrial em redes horizontais de empresas. Para cumprir tal objetivo, foi realizada uma Revisão Sistêmica de Literatura (RBS) utilizando a metodologia Methodi Ordinatio, donde resultou um portfólio com 149 artigos, que foram utilizados para desenvolver a metodologia proposta. Com os resultados, foi possível identificar descrições sobre custos ambientais e simbiose industrial e, posteriormente, possibilitou a adaptação do modelo de custos ambientais com o questionário de identificação de simbiose industrial. A metodologia foi aplicada em um aglomerado de leiterias na cidade de Piraí do Sul - PR, em três etapas, sendo: a 1ª etapa, a coleta de dados através de questionário; a 2ª etapa, elaborar um novo cenário para cada empresa e, a 3ª etapa, a análise dos resultados. Contudo, foi possível identificar a relação de potenciais de Simbiose Industrial, no aglomerado, relacionando-os com os custos ambientais, possibilitando, assim, estabelecer uma redução dos referidos custos, através da colaboração e confiança dos integrantes do aglomerado. / The objective of this work was to develop a methodology to evaluate potential actions aimed at minimizing environmental costs from the concepts of Industrial Symbiosis in horizontal networks of companies. To accomplish this objective, a Systemic Literature Review (RBS) was carried out using Methodi Ordinatio methodology, which resulted in a portfolio of 149 articles, which were used to develop the proposed methodology. With the results, it was possible to identify descriptions of environmental costs and industrial symbiosis, and later allowed the adaptation of the environmental cost model with the industrial symbiosis identification questionnaire. The methodology was applied in a cluster of dairies in the city of Piraí do Sul - PR, in three stages, being: the first stage, the data collection through a questionnaire; The second stage, to elaborate a new scenario for each company and, the third stage, the analysis of the results. However, it was possible to identify the relationship of potential of Industrial Symbiosis in the cluster, relating them to the environmental costs, thus allowing a reduction of these costs through the collaboration and trust of the members of the agglomerate.

O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma metodologia para avaliar potenciais ações visando à minimização dos custos ambientais a partir dos conceitos da Simbiose Industrial em redes horizontais de empresas. Para cumprir tal objetivo, foi realizada uma Revisão Sistêmica de Literatura (RBS) utilizando a metodologia Methodi Ordinatio, donde resultou um portfólio com 149 artigos, que foram utilizados para desenvolver a metodologia proposta. Com os resultados, foi possível identificar descrições sobre custos ambientais e simbiose industrial e, posteriormente, possibilitou a adaptação do modelo de custos ambientais com o questionário de identificação de simbiose industrial. A metodologia foi aplicada em um aglomerado de leiterias na cidade de Piraí do Sul - PR, em três etapas, sendo: a 1ª etapa, a coleta de dados através de questionário; a 2ª etapa, elaborar um novo cenário para cada empresa e, a 3ª etapa, a análise dos resultados. Contudo, foi possível identificar a relação de potenciais de Simbiose Industrial, no aglomerado, relacionando-os com os custos ambientais, possibilitando, assim, estabelecer uma redução dos referidos custos, através da colaboração e confiança dos integrantes do aglomerado. / The objective of this work was to develop a methodology to evaluate potential actions aimed at minimizing environmental costs from the concepts of Industrial Symbiosis in horizontal networks of companies. To accomplish this objective, a Systemic Literature Review (RBS) was carried out using Methodi Ordinatio methodology, which resulted in a portfolio of 149 articles, which were used to develop the proposed methodology. With the results, it was possible to identify descriptions of environmental costs and industrial symbiosis, and later allowed the adaptation of the environmental cost model with the industrial symbiosis identification questionnaire. The methodology was applied in a cluster of dairies in the city of Piraí do Sul - PR, in three stages, being: the first stage, the data collection through a questionnaire; The second stage, to elaborate a new scenario for each company and, the third stage, the analysis of the results. However, it was possible to identify the relationship of potential of Industrial Symbiosis in the cluster, relating them to the environmental costs, thus allowing a reduction of these costs through the collaboration and trust of the members of the agglomerate.

Diaphorina citri Kuwayama, 1908 (Hemiptera: Psyllidae) é um inseto exótico no Brasil, registrado desde a década de 40. Apesar dos danos diretos que pode causar, só recebeu atenção como praga em 2004, quando foi confirmada a doença Huanglonbing (HLB) em citros, a qual foi posteriormente relacionada a D. citri como inseto-vetor. Atualmente, não há cura para plantas doentes. Portanto, o manejo do HLB é baseado na retirada de árvores infectadas e no controle dos psilídeos, o qual se fundamenta no controle biológico clássico, ação natural de predadores e no controle químico. Porém, o uso contínuo e intenso de agrotóxicos é sempre problemático devido ao desequilíbrio que pode causar nos agroecossistemas. Portanto, investigar as populações de D. citri no Brasil e discutir possíveis medidas alternativas para o controle ou manejo do vetor/doença são desejáveis. Assim, este trabalho apresenta como objetivos i) avaliar a diversidade genética intra e interpopulacional de D. citri e verificar a existência de estruturação populacional no Brasil, especialmente entre as populações que se distribuem na principal região citrícola do país; ii) determinar a ocorrência e frequência de infecção por Wolbachia em diferentes populações desse psilídeo, além de caracterizar a diversidade desse simbionte e definir a relação entre os haplótipos do hospedeiro e as linhagens de Wolbachia,visando fornecer subsídios para o controle alternativo deste inseto-vetor. A análise de diversidade genética utilizou o gene da citocromo oxidase I (COI) como marcador molecular. Os cálculos dos índices de fixação F indicaram a presença de estrutura genética e os cálculos dos índices de diversidade molecular mostraram um quadro de expansão populacional recente. Já a caracterização de Wolbachia via tipagem pela análise de sequências de multilocos (multilocus sequencing typing - MLST) indicou a ocorrência de cinco STs (173, 174, 175, 225 e 236), enquanto que análises das sequências do wsp indicaram quatro tipos de Wolbachia. O ST-173 foi predominante, estando presente em todas as populações, enquanto que os demais foram populações-específicos. Análises da relação hospedeiro-simbionte não revelou a existência de relações específicas entre os haplótipos do hospedeiro e os STs de Wolbachia, nem a diminuição da diversidade nucleotídica de D. citri frente à infecção por mais de um ST do simbionte. A relação entre os STs de Wolbachia e as consequências desta diversidade na bioecologia do hospedeiro ainda permanecem desconhecidas, mas a constatação de que Wolbachia ocorre em todas as populações e de que há um ST com distribuição abrangente abre caminhos para a utilização desse simbionte no desenvolvimento de estratégias alternativas de controle de D. citri. / Diaphorina citri Kuwayama, 1908 (Hemiptera: Psyllidae) is an exotic insect in Brazil, first recorded in the 40s. Although it causes direct damage, D. citri only received attention as a pest in 2004, when the \"Huanglonbing\" (HLB) disease was confirmed infecting citrus in Brazil, and subsequently related to D. citri as vector. Currently, there is no cure for diseased plants, and the management of HLB is based on the removal of infected trees and psyllid control, which is based on classical biological control, natural predation and chemical control. However, the continuous use of pesticides is always problematic due to the imbalance it can cause in agrosystems. Therefore, investigations on the populations structure of D. citri in Brazil and possible alternative measures for vector/disease control or management are highly desired. Thus, this study was aimed to i) evaluate the intra and interpopulation genetic diversity of D. citri and verify the existence of population structuring in Brazil, especially in the main citrus producing region of the country, ii) determine the natural rate of infection and characterize the Wolbachia strains associated with different populations of D. citri and iii) investigate the relationship among host haplotypes and the strains of Wolbachia, in order to provide data for the alternative control of this vector. The analysis of genetic diversity was done using the cytochrome oxidase I (COI) gene as a molecular marker. The fixation rates F calculated indicated the presence of genetic structure, while the molecular diversity indices pointed to a recent population expansion of D. citri in Brazil. The multilocus sequence typing analysis (\"multilocus sequencing typing - MLST\") for Wolbachia demonstrated the presence of five new sequence-types (STs = 173, 174, 175, 225 and 236), while only four were identified when using the wsp sequences as markers. The ST-173 was the predominant ST associated with D. citri, being present in all populations, while others were specific to certain populations. Analysis of the hostsymbiont relationship did not reveal the existence of specific interactions between host haplotypes and the STs of Wolbachia, or the decrease of nucleotide diversity of D. citri in populations infected by more than one ST. The effects of Wolbachia diversity on the host bioecology are still unknown, but the fact that Wolbachia is fixed in all populations and that there is a ST broadly distributed throughout the D. citri populations highlights the use of Wolbachia for the development of alternative strategies to control D. citri.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-07-05T12:16:24Z No. of bitstreams: 1 Emmanuella Vila Nova da Silva.pdf: 1939037 bytes, checksum: f521d3bf721007766ec42ccf2f7454a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T12:16:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Emmanuella Vila Nova da Silva.pdf: 1939037 bytes, checksum: f521d3bf721007766ec42ccf2f7454a6 (MD5) Previous issue date: 2012-03-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The use of plants symbiotically associated with N2 fixing bacteria and mycorrhizal fungi (AMF) provides an efficient strategy to accelerate the recovery of impacted areas and reduces its costs considerably. The term "mycorrhiza helper bacteria” (MHB) has been introduced and discussed due to the synergistic effect that this dual combination promotes to plants. They are bacteria associated with roots and AMF that selectively promote the establishment of symbiosis with fungi. Thus, the objectives were to verify the AMF activity in the area with native vegetation in the Pernambucano semiarid, municipality of Sertânia; determine glomerospores number and the most probable number (MPN) of infective propagules; quantify the content of glomalin-related protein in the soil and determine the feasibility of bacteria (MHB) co-inoculation and AMF mixture in “sabiá” (Mimosa caesalpiniifolia Benth) aiming at obtaining combinations and compatibility of symbiotic pairs, as well as to evaluate the mycorrhizal efficiency and colonization. The experiments were conducted in greenhouse of the Agronomic Institute of Pernambuco (IPA). 10 composite soil samples were collected with points were defined at random. Samples were homogenized and analyzed for physical and chemical characteristics. Composite samples were used for direct count (DC) and propagation of AMF for indirect count (IC) of spores, using trap- cultures and sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) and peanut (Arachis hypogea L.) as host plants (experiment I). To determine the MPN of infective propagules of AMF in the Haplic Luvisol was used a system of serial dilution: 0, 1:10, 1:100 and 1:1000 with five replicates each, with maize (Zea mays L.) as host plant (experiment II). In the experiment III were used pots with Haplic Luvisol soil (8 kg pot-1) at pH 6.0 and the plant used was the “sabiá”. On seeding, inoculation with Burkholderia sabiae (BR 3405) and co-inoculation with BR3405 + MHB were performed and each seed was inoculated with 2 mL of specific medium for each of MHB bacteria and for the BR3405 containing 108 CFU mL-1. In the inoculation with AMF mixture was used 4 g pot-1 in the form of propagule containing approximately 670 spores. Plants were harvested at 110 days after planting (DAP) and the following variables were evaluated: shoot dry mass (SDM), root (RDM), RDM/SDM ratio, plant height (PH) on periods of 45, 90 and 110 days, root length (RL), total N accumulated in SDM (Nat), strains efficiency (E) and mycorrhizal colonization. The experimental design was randomized blocks, with 9 x 2 factorial arrangement plus an absolute control (AC) - without inoculation; MHB strains and one control treatment inoculated only with Burkholderia sabiae with and without AMF (AMF mixture) with 3 blocks . The experimental results show that the MPN of AMF infective propagules found in the city of Sertânia was 23 propagules cm-3. Soil proteins related to easily extractable glomalin (PSRGFE) and soil proteins related to total glomalin (PSRGT) were approximately 0.46 and 0.26 mg g soil-1, respectively. The AMF colonization combined with the bacteria was positive, as in the case of RL, treatments with BR 3405 + Azospirillum amazonenses (Y2) and BR 3405 + Herbaspirillum seropedicae (Z67) showed significant difference by the Tukey test (p <0.05) compared to the factor with and without AMF. Thereby ensuring that, in the presence of MHB bacteria there was increase in root length of “sabiá” plants. Strains efficiency showed better results when bacteria were in the presence of AMF and the treatment BR 3405 + Paenibacillus brasilensis (24) + AMF showed the best response. The treatments that received AMF were higher compared to the others on the variables SDM, RDM, E, Nac, coming to present on average 84% of root colonization. / A utilização de plantas associadas simbioticamente, com bactérias fixadoras de N2 e fungos micorrízicos arbusculares (FMA), constitui uma estratégia eficiente para acelerar a recuperação de áreas impactadas além de reduzir consideravelmente os custos com a mesma. O conceito de “mycorrhiza helper bacteria (MHB)” tem sido introduzido e discutido devido ao efeito sinergístico que essa dupla associação promove às plantas. São bactérias associadas com raízes e FMA que, seletivamente, promovem o estabelecimento da simbiose com os fungos. Deste modo, os objetivos deste trabalho foram verificar a atividade de FMA em área com vegetação nativa do semiárido Pernambucano, no município de Sertânia; determinar o número de glomerosporos e o número mais provável (NMP) de propágulos infectivos; quantificar o teor de proteínas do solo relacionadas à glomalina; determinar a viabilidade da co-inoculação entre bactérias (MHB) e mistura de FMA em sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth) visando obter combinações e compatibilidade de pares simbióticos, assim como avaliar a eficiência e colonização micorrízica. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação na Sede do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA). Foram coletadas 10 amostras compostas de solo, sendo os pontos definidos aleatoriamente. As amostras foram homogeneizadas e analisadas quanto às características físicas e químicas. Amostras compostas foram utilizadas para contagem direta (CD) e multiplicação de FMA para contagem indireta (CI) de esporos, com o uso de culturas-armadilha, empregando sorgo granífero (Sorghum bicolor L. Moench) e amendoim (Arachis hypogea L.) como plantas hospedeiras (experimento I). Para a determinação do NMP de propágulos infectivos de FMA no Luvissolo Háplico foi utilizado um sistema de diluição em série: 0, 1:10, 1:100 e 1:1000, com 5 repetições cada e, tendo o milho (Zea mays L.) como planta hospedeira (experimento II). No experimento III foram utilizados vasos com o solo Luvissolo Háplico (8 kg vaso-1) com pH 6,0 e a planta utilizada foi a sabiá. Na semeadura, foi efetuada inoculação com Burkholderia sabiae (BR 3405) e co-inoculação com BR3405 + MHB contendo 108 UFC mL-1. Na inoculação com a mistura do FMA, foram utilizados 4 g vaso-1 em forma de propágulo, contendo aproximadamente 670 esporos. A colheita foi realizada 110 dias após plantio (DAP) e foram avaliadas as seguintes variáveis: massa seca da parte aérea (MSPA), raiz (MSR), relação MSR/MSPA, altura de planta (AP) nos períodos de 45, 90 e 110 dias, comprimento da raiz (CR), N total acumulado na MSPA (Nac), eficiência das estirpes (E%) e colonização micorrízica. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, com arranjo fatorial 9 x 2 mais uma testemunha absoluta (TA) – sem inoculação; estirpes de MHB e um tratamento controle inoculado apenas com Burkholderia sabiae com e sem FMA (mistura de FMA) com 3 blocos. Os resultados dos experimentos mostram que o NMP de propágulos infectivos de FMA encontrados no município de Sertânia foi de 23 propágulos cm-3. As proteínas do solo relacionadas à glomalina facilmente extraível (PSRGFE) e as proteínas do solo relacionadas à glomalina total (PSRGT) ficaram em torno de 0,46 e 0,26 mg g solo-1, respectivamente. A colonização dos FMA em conjunto com as bactérias foi positiva, como no caso do CR, os tratamentos com BR 3405 + Azospirillum amazonenses (Y2) e BR 3405 + Herbaspirillum seropedicae (Z67) apresentaram diferença significativa pelo teste de Tukey (p<0,05) em relação ao fator com e sem FMA. Confirmando deste modo que, na presença das bactérias MHB houve aumento no comprimento do sistema radicular das plantas de sabiá. A eficiência das estirpes obteve os melhores resultados quando as bactérias estavam em presença de FMA e o tratamento BR 3405 + Paenibacillus brasilensis (24) + FMA foi o que obteve melhor resposta. Os tratamentos que receberam os FMA foram superiores em relação aos demais nas variáveis MSPA, MSR, E, Nac, chegando a apresentar uma média em torno de 84% de colonização radicular.