Introdução: Pneumonias causadas por Staphylococcus aureus meticilina resistentes (Methicillin resistant Staphylococcus aureus - MRSA) estão associadas com uma alta mortalidade em pacientes internados em Centros de Terapia Intensiva (CTI). Não é incomum que ocorra falha no tratamento de pneumonia por MRSA com vancomicina. Alguns estudos têm mostrado que há uma relação entre mortalidade em infecções por MRSA e concentrações inibitórias mínimas (CIM) elevadas para vancomicina por Etest®, apesar dos isolados serem sensíveis à vancomicina (CIM ≤2μg/mL), conforme o Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). Objetivos: O objetivo deste estudo foi avaliar as CIMs para vancomicina em pacientes com diagnóstico de pneumonia por MRSA, descrever a relação entre a CIM da vancomicina obtido por Etest® e microdiluição em caldo com mortalidade em 30 dias em pacientes com pneumonia por MRSA internados em um hospital terciário, acadêmico, no sul do Brasil. Métodos: Estudo prospectivo de coorte. Foram incluídos todos os pacientes com pneumonia adquirida no hospital (hospital adquired pneumonia - HAP) e pneumonia associada à ventilação (ventilator associated pneumonia - VAP) por MRSA entre Junho de 2009 e Dezembro de 2011. A CIM da vancomicina do primeiro isolado do trato respiratório foi determinado por Etest® e microdiluição em caldo. As variáveis selecionadas para serem analisadas incluíram idade, sexo, comorbidades, dosagem sérica de vancomicina, escore APACHE II (Acute Physiological and Chronic Health Evaluation II) e a presença do accessory gene regulator II (agr II). O desfecho principal foi morte em 30 dias. Resultados: Foram incluídos 85 pacientes. A mortalidade em 30 dias foi de 42,4%. Em sessenta e oito pacientes (80,1%) as CIMs da vancomicina obtidos por Etest® foram menores ou iguais a 1,0μg/mL, enquanto todas as CIMs (N=85) obtidas por microdiluição em caldo foram ≤1,0μg/mL. Não houve correlação entre as CIMs por Etest® e microdiluição em caldo com morte em 30 dias. Quarenta e seis isolados de MRSA (54,1%) foram positivos para o locus agr II. A média da vancomicina sérica foi 20,7μg/mL (12,0 – 29,0) e a média do escore APACHE II foi 23,0 (17,5 – 29,0). O escore APACHE II foi relacionado com mortalidade em 30 dias. Conclusões: As CIMs da vancomicina obtidas por Etest® e microdiluição em caldo não foram associadas com altos níveis de mortalidade em pacientes com pneumonia grave por MRSA. / Background: Pneumonias due to methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) are associated with significant mortality in Intensive Care Units (ICU) patients. Vancomycin treatment failure in MRSA pneumonia patients is not uncommon. Some reports found a link between high mortality in MRSA infections and higher vancomycin minimum inhibitory concentrations (MICs) by Etest®, despite the susceptibility of the isolates (MIC ≤2,0μg/mL), according to the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI). Objectives: The purpose of this study was evaluate vancomycin MICs in patients with MRSA pneumonia, describe the relationship between vancomycin MIC generated by Etest® and broth microdilution with 30-day mortality in MRSA pneumonia patients. Methods: We conducted a prospective cohort study. All patients with MRSA hospital acquired pneumonia (HAP) and ventilator-associated pneumonia (VAP) admitted in ICU between June 2009 and December 2011 were included. Vancomycin MIC for the first isolate of the respiratory tract was determined by Etest® and broth microdilution. The variables selected for the analysis included age, sex, comorbid conditions, vancomycin serum trough concentration, APACHE II (Acute Physiological and Chronic Health Evaluation II) score and the presence of the accessory gene regulator II (agr II). The primary outcome was mortality at 30-day. Results: Eithy five patients were included. All case mortality at the 30-day was 42.4%. Sixty eight of the patients (80.1%) of the vancomycin MICs generated by Etest® were equal or below 1.0μg/mL. While all MICs generated by broth microdilution were ≤1.0μg/mL. MICs generated by Etest® and broth microdilution were not associated with 30-day mortality. Forty six isolates of MRSA (54.1%) from patients were positive for agr II. The median serum vancomycin was 20.7μg/mL (12.0 – 29.0) and the median APACHE II score was 23.0 (17.5 – 29.0). The APACHE II score was related to 30-day mortality. Conclusions: Vancomycin MICs by Etest® and broth microdilution were not associated with higher mortality leves in patients with severe MRSA pneumonia.

The glycopeptide vancomycin is commonly used to treat a variety of bacterial infections, especially multi-drug resistant species of bacteria such as Staphylococcus aureus. While vancomycin remains an effective treatment for Staphylococcal infections, strains of vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus (VISA) and vancomycin-resistant Staphylococcus aureus (VRSA) strains have emerged. One mechanism for the increased antibiotic (vancomycin-intermediate) resistance is due to acquisition of various mutations within different genes that alter the cell wall physiology making vancomycin ineffective. Biofilm development is a bacterial mode of growth that can lead to mutations within the bacterial genome and allow for advantageous traits such as increased antibiotic resistance. The biofilm environment can be harsh, having niches that are often nutrient and oxygen deficient, leading to damaged DNA. This DNA damage induces the SOS response to repair double-stranded breaks in DNA, and enables bacterial survival. However, DNA repair via the SOS response is an error-prone system that often results in mutations within the genome. We hypothesize that the acquisition of vancomycin intermediate resistance is an unintended consequence within the S. aureus biofilm environment. To assess the hypothesis, both wildtype and RecA/LexA deficient biofilms were grown in microtiter assays with and without the addition of sub-inhibitory concentrations of vancomycin. Efficiency of plating techniques were used to quantify the subpopulation of biofilm-derived S. aureus cells that developed vancomycin intermediate resistance. Microtiter assays and efficiency of plating techniques were repeated using multiple strains of S. aureus. Experimentation was repeated by comparing the subpopulation of biofilm-derived and planktonic culture cells that grew in intermediate-concentrations of vancomycin with three additional strains of S. aureus. Mutagenesis that occurs within the biofilm environment was further assessed by plating both biofilm-derived and planktonic culture cells on sheep blood agar and tryptic soy agar supplemented with streptomycin, novobiocin, or rifampicin, and quantifying the non-hemolytic variants that grew on blood agar, or the number of colonies that grew in the presence of an antibiotic, respectively. The biofilm results were then compared to the results from wildtype and RecA/LexA deficient planktonic cultures and used to determine the impact of the S. aureus biofilm environment in the acquisition of vancomycin intermediate resistance. The results indicate that a larger subpopulation of cells derived from wildtype biofilms grew in increased concentrations of vancomycin (4 µg/ml) as compared to the planktonic counterpart. The subpopulation of cells derived from wildtype biofilms was also higher than all subpopulations of RecA/LexA deficient biofilm and planktonic cultures. Further experimentation indicates that this phenomenon may not be specific to all strain backgrounds of S. aureus. Additionally, growth with sub-inhibitory concentrations of vancomycin did not exhibit an exaggerated subpopulation of cells in biofilm environments or planktonic cultures that could grow in intermediate-concentrations of vancomycin, however standard antibiotic testing suggests that the mechanism by which point mutations occur in planktonic conditions may be mediated by the RecA and SOS response system. Bacteria that live in a biofilm community are often subjected to harsh environments. In order to survive, the SOS response system will be activated to repair damaged DNA. This error prone process will result in mutational changes and increased genetic diversity. The VISA phenotype may be a result of the diversity that occurs within the biofilm environment. While the VISA phenotype would be an unintended consequence of genetic diversity and gene transfer in the biofilm setting, it demonstrates that mutations that occur within the biofilm environment allow for S. aureus to better adapt to new environments, including the presence of widely used antibiotics such as vancomycin.

Made available in DSpace on 2014-07-28T18:09:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 103.pdf: 652449 bytes, checksum: ea164ab2e7463c3fab8f472fadef32d6 (MD5) Previous issue date: 2008 / Made available in DSpace on 2014-12-22T16:56:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 103.pdf: 652449 bytes, checksum: ea164ab2e7463c3fab8f472fadef32d6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Staphylococus aureus e Staphylococcus Coagulase negative(CNS) são reconhecidos como causadores de infecções hospitalares e comunitárias em todas as regiões do mundo. Nós estudamos a produção de biofilme em 43 cepas de Staphylococus aureus meticilina resistente (MRSA) e em 21 isolados de Staphylococus epidermidis meticilina resistente (MRSE) e a susceptibilidade a antibióticos destas cepas que foram obtidas de pacientes infectados do Hospital Universitário Antônio Pedro (HUAP), localizado na cidade de Niterói no estado do Rio de Janeiro. Foi realizado também a Eletroforese em campo pulsado (PFGE) de fragmentos de macrorestrição de SmaI do DNA genômico, bem como a tipificação do cassete cromossômico estafilocócico mec (SCCmec).Os isolados que carreaiam mecA foram usados para estudar a distribuição do tipo clonal entre 43 cepas de MRSA colhidas no HUAP de 2003 a 2006. Nossos resultados demonstraram que a maioria das cepas de MRSA (83.7 por cento) e MRSE (52,4 por cento) produziram biofilme,e altas taxas de resistência de MRSA e MRSE à eritromicina, à clindamicina e ao ciprofloxacino foram observadas. Dois tipos clonais predominantes (A e B) foram identificados por PFGE, tendo ambos compreendendo a maioria das cepas (32,6 por cento cada um). De acordo com a tipificação de SCCmec, o SCCmec tipo IV foi o que prevaleceu (51,2 por cento). Porém, o mais interessante em nosso estudo foi a mudança observada no background genético dos MRSA isolados do HUAP, pois o Clone Epidêmico Brasileiro(CEB) que era o clone predominante neste hospital, está sendo substituído pelo USA-400, um clone que a princípio foi denominado de clone comunitário Staphylococcus aureus meticilina resistente (CA-MRSA). / Staphylococus aureus and coagulase-negative staphylococci (CNS) are recognized as causing nosocomial and community-acquired infection in every region of the world. We study biofilm production in 43 isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and 21 isolates methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis (MRSE) and the antibiotics susceptibilities of these strains that were obtained from infected patients at Antônio Pedro University Hospital (HUAP) located in Niterói city, Rio de Janeiro. In addition, Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) of SmaI macrorestriction fragments of genomic DNA as well as staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing for mecA-carrying isolates were used to study the distribution of clonal types among 43 MRSA recovered in HUAP between 2003 and 2006. Our results demonstrated that the majority strains of MRSA (83.7%) and MRSE (52,4%) produced biofilm and high resistance of MRSA and MRSE to erytromicin, clindamicin and ciprofloxacin were observed. The two major clones types (A and B) were identified by PFGE, with both them comprising the majority of strains (32,6% each). According to SCCmec typing, SCCmec type IV were the most prevalent type, showing 51,2% . But the most interesting in our study is a changed observed in the genetic background of MRSA isolates from HUAP, because of Brazilian clone, which was the major clone in this hospital, was replaced by the USA-400, one type of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA).

Staphylococcus aureus destaca-se como principal micro-organismo associado à mastite bovina contagiosa, sendo que as infecções crônicas podem ser causadas pelo crescimento bacteriano na forma de biofilmes, o que pode estar associado à persistência desta bactéria na glândula mamária e à resistência a diversos antimicrobianos. Estudos epidemiológicos empregando técnicas como a macrorestrição seguida de eletroforese em campo pulsado (PFGE) têm sido realizados, com a finalidade de identificar clones e caracterizar as infecções por S. aureus. Os objetivos deste estudo foram: avaliar a frequência de isolamento de S. aureus em amostras de leite colhidas periodicamente em um grupo de propriedades leiteiras do Vale do Taquari, RS; avaliar o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos dos isolados de S. aureus identificados; classificar esses isolados em grupos clonais; avaliar a distribuição e a permanência dos grupos clonais nas propriedades leiteiras ao longo do tempo, além de verificar a presença de genes relacionados à formação de biofilmes (icaA e icaD). Foram colhidas amostras de leite de todas as vacas em lactação de 21 propriedades, amostradas semestralmente durante dois anos, totalizando 1060 amostras. A presença de S. aureus nas amostras foi detectada por isolamento e a identificação foi realizada de acordo com o National Mastitis Council. Isolados confirmados foram testados, pela técnica de disco difusão em ágar, quanto à suscetibilidade frente a treze antimicrobianos. Os isolados também foram submetidos à macrorrestrição do DNA total – PFGE e posteriormente testados pela PCR para detecção dos genes icaA e icaD. Das 1060 amostras avaliadas, 395 não apresentaram crescimento bacteriano. Staphylococcus sp. coagulase negativa foram identificados em 262 amostras, seguido de 136 amostras em que identificou-se S. aureus. A frequência de isolamento de S. aureus variou de 3,45% a 70,59% nas 17 propriedades em que este agente estava presente. No teste de suscetibilidade aos antimicrobianos, a maioria (75,7%) dos 132 isolados testados apresentaram perfil de sensibilidade, sendo a resistência mais frequente à penicilina (18,2%) e ampicilina (14,4%). Em apenas 27,3% dos isolados detectou-se os genes associados à formação de biofilmes pesquisados, sendo o gene icaD o mais prevalente, seguido da presença de ambos os genes. Os 122 isolados clivados pela enzima SmaI e submetidos à PFGE foram classificados em 38 grupos clonais. Observaram-se poucos grupos clonais persistentes, pois somente seis foram descritos consecutivamente em pelo menos duas coletas. O grupo clonal 16 foi o mais prevantente, apresentando isolados em uma mesma propriedade ao longo de dois anos. Conclui-se que Staphylococcus aureus está presente na glândula mamária de bovinos em lactação em pequenas propriedades da região. Esses isolados apresentam baixa frequência de resistência aos antimicrobianos. Há uma grande variabilidade de pulsotipos entre os isolados presentes nessas propriedades, porém poucos grupos clonais persistem nas propriedades amostradas. Não foi possível associar a permanência dos grupos clonais nos rebanhos à presença dos genes icaA e icaD ou ao perfil de resistência a antimicrobianos. / Staphylococcus aureus stands out as the main microorganism associated with bovine contagious mastitis, whereas chronic infections can be caused by bacterial growth in the form of biofilms, which can be associated with the persistence of the bacteria in the mammary gland and resistance to various antibiotics. Epidemiological studies employing techniques such as macrorestriction followed by pulsed field gel electrophoresis (PFGE) have been carried out, aiming to identify clones and characterize S. aureus infections. The objectives of this study were: to assess the frequency of S. aureus isolation in milk samples collected periodically in a group of dairy farms from Taquari Valley, RS; evaluate the profile of antimicrobial susceptibility of S. aureus identified isolates; classify these isolates in clonal groups; assess the distribution and retention of clonal groups in dairy herds over time and to verify the presence of genes related to biofilm formation (icaA and icaD). Milk samples were collected from all lactating cows from 21 properties that were sampled every six months for two years, totaling 1060 samples. The presence of S. aureus in the samples was detected by isolation and the identification was performed according to National Mastitis Council. Confirmed isolates were tested for susceptibility to thirteen antimicrobial by disk diffusion technique in agar. The isolates also underwent macro-restriction of total DNA - PFGE and were subsequently tested by PCR for detection of genes icaA and icaD. Of the 1060 samples tested, 395 showed no bacterial growth. Staphylococcus sp. coagulase-negative samples were identified at 262, followed by 136 samples in which S. aureus was identified. The frequency of isolation of S. aureus ranged from 3.45% to 70.59% in 17 properties wherein this agent was present. In antimicrobial susceptibility testing, the majority (75.7%) of the 132 isolates tested showed sensitivity profile, being most frequent resistance to penicillin (18.2%) and ampicillin (14.4%). In only 27.3% of the isolates were detected genes associated with biofilm formation surveyed and icaD was the most prevalent, followed by the presence of both genes. The 122 isolates cleaved by SmaI and submitted for PFGE were classified into 38 clonal groups. There were few persistent clonal groups, because only six groups were described consecutively in at least two collections. The clonal group 16 was the most prevalent, presenting isolates at the same property over two years. Is conclusive that Staphylococcus aureus is present in the mammary gland of lactating cattle on small farms in the region. These isolates have low frequency of antimicrobial resistance. There is great variability of pulsotypes among isolates in those properties, but few clonal groups persist in the sampled properties. It was not possible to associate the permanence of clonal groups in herds to the presence of icaA and icaD or to the profile of antimicrobial resistance.

Quatro tipos de meios de transporte comerciais (Amies, Amies com carvão, Cary Blair e Stuart) e suabes sem meio foram avaliados quanto à capacidade de conservar S. hyicus por 10 dias de armazenamento sob duas temperaturas (ambiente [20-25ºC] e refrigerada [4-8ºC]). Não foram encontrados na literatura trabalhos que avaliassem o efeito da temperatura e de meios de transporte na sobrevivência desta bactéria. Foi usado o Roll-Plate Method para o teste, utilizando uma amostra padrão de S. hyicus (ATCC 11249), de acordo com as normas do NCCLS (2003). Durante o período de 10 dias, as amostras foram armazenadas nas duas temperaturas e a seguir os suabes foram plaqueados em Ágar Tween 80 com contagem das colônias a cada 24 horas. As amostras conservadas em todos os meios de transporte apresentaram desempenho significativamente superior (P ≤ 0,05) quando mantidas em refrigeração. A conservação no Amies refrigerado foi superior a todos os outros tipos de meios e suabes (P ≤ 0,05). Na temperatura ambiente, o meio Amies e os suabes mantidos sem meio de transporte foram similares (P > 0,05), sendo os melhores nesta temperatura. Adicionalmente, o meio Amies refrigerado demonstrou alta performance até nove dias de armazenamento e os suabes sem meio até três dias. Coletivamente, a alta performance em meio Amies refrigerado indicou ser este o mais adequado para o transporte de amostras de S. hyicus. No entanto, devido à resistência à dessecação da bactéria e em função da praticidade e baixo custo, poderiam também ser indicados suabes sem meio de transporte, mantidos na temperatura ambiente. Esta forma de envio seria viável quando a previsão de tempo para o transporte ao laboratório for menor que 48 horas, pois nesta forma de conservação houve sobrevivência adequada até 72 horas. / Four commercial transport media (Amies, Amies with charcoal, Cary Blair and Stuart) and swabs without transport medium were assessed regarding their capacity to preserve S. hyicus for periods of up to 10 days at two different temperatures (room temperature [20-25ºC] and refrigerated [4-8ºC]). We did not find in the literature information on the effect of temperature and transport media for the survival of this bacteria. The Roll-Plate Method was used with a reference strain of S. hyicus (ATCC 11249), following recommendation of NCCLS (2003). The samples were stored for 10 days in two temperatures and after that, swabs were plated in Tween 80 Agar, counting bacterial colonies at each 24 hours. Samples held in all transport media showed significantly better performance (P ≤ 0.05) in refrigeration. Storage in refrigeration in Amies medium performed better than all other transport media and swabs (P ≤ 0.05). In room temperature, Amies medium and swabs without transport medium worked similarly (P > 0.05), and presented the bests results in this temperature. Additionally, refrigerated Amies medium showed high performance for up to nine storage days and swabs without transport medium for up to three days. Collectively, the high performance in refrigerated Amies medium indicated that this is the most suitable medium for shipping of S. hyicus. However, considering S. hyicus resistance to desiccation, easiness of transportation and low cost, swabs without transport medium could also be indicated, when stored at room temperature. This form of shipment could be viable when the time predicted to transport to the laboratory would be smaller than 48 hours, since this form of preservation showed survival for up to 72 hours.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8803_Dissertação_Lais Bride20150826-123328.pdf: 2055744 bytes, checksum: 1146a6725158c35133695a1dbf985724 (MD5) Previous issue date: 2015-04-27 / CAPES / Epidemiologia Molecular e Caracterização da Resistência e Virulência de Amostras de Staphylococcus aureus Provenientes de Hospitais da Grande Vitória - ES.

Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / A infecção pulmonar de etiologia bacteriana é um dos principais problemas que levam a morbi-mortalidade na fibrose cística (FC). Staphylococcus aureus se destaca como um dos micro-organismos mais frequentes e com um agravante para a terapêutica quando se apresentam resistentes à oxacilina (MRSA). Amostras MRSA podem ser classificadas tanto genotipicamente quanto fenotipicamente em MRSA adquiridas na comunidade (CA-MRSA) ou adquiridas no hospital (HA-MRSA). Fenotipicamente, essa classificação é muito controversa, podendo se basear em critérios epidemiológicos ou ainda pelo perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos. Por outro lado, a classificação genotípica consiste na determinação dos cassetes cromossômicos (SCCmec), local de inserção do gene mecA (que confere resistência a meticilina). Atualmente são reconhecidos 11 tipos de SCCmec, sendo os de tipo I ao III e VIII relacionados ao genótipo HA-MRSA e IV ao XI ao genótipo CA-MRSA. Classicamente CA-MRSA é capaz de produzir a toxina Panton-Valentine leukocidin (PVL), codificada pelos genes luk-S e luk-F que está associada à pneumonia necrotizante e infecções de tecidos moles em pacientes com FC com quadros de exacerbação pulmonar. No Brasil, raros são os trabalhos envolvendo caracterização de SCCmec em amostras de pacientes com FC. Diante disso, este estudo teve como objetivo principal a caracterização dos tipos de SCCmec e ainda a determinação do perfil de susceptibilidade a antimicrobianos em uma população de MRSA recuperada de pacientes com FC assistidos em dois centros de tratamento no Rio de Janeiro, Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE) e Instituto Fernandes Figueira (IFF). Foram estudadas 108 amostras de MRSA isoladas do período de 2008 a 2010, sendo 94 oriundas de 28 pacientes adultos atendidos no IFF e 14 de 2 pacientes adultos atendidos no HUPE. Foram encontradas altas taxas de resistência para os antimicrobianos oxacilina, cefoxitina e eritromicina. Todas as amostras foram sensíveis à vancomicina e a linezolida quando determinada as Concentrações Inibitórias Mínimas (CIM). Através da técnica de PCR foi possível a tipificação dos SCCmec em 82,4% das amostras, sendo 64% destas compatíveis ao genótipo CA-MRSA. Não houve diferença estatística nas taxas de susceptibilidade aos antimicrobianos entre as amostras CA-MRSA e HA-MRSA. Foram encontrados os SCCmec dos tipos I, III, IV e V, sendo os tipos I e IV os mais frequentes. O gene que codifica a toxina PVL foi encontrado em 34,2% das amostras e foi observado em amostras CA-MRSA e HA-MRSA. Nosso estudo se destaca por apresentar um alto percentual de amostras CA-MRSA e ainda por ser o primeiro do país a detectar a presença do gene que codifica a toxina PVL em pacientes com FC. Além disso, de forma inédita na literatura, encontramos o gene luk-S, em amostras classificadas como HA-MRSA em pacientes com FC. Os poucos estudos nacionais, bem como as diferenças encontradas entre trabalhos, refletem a necessidade de conhecimento mais aprimorado do MRSA envolvido nas infecções pulmonares dos pacientes com FC. / Bacterial lung infections are the major cause of morbidity and mortality in CF patients. Staphylococcus aureus is one of the most common pathogens isolated from colonization/infection in pediatric patients particulary when it shows methicillin resistance (MRSA), causing problems to a choice of antimicrobial therapy. This samples MRSA are classified either genotypically or phenotypically in CA-MRSA (community acquired MRSA) or HA-MRSA (hospital acquired MRSA). However, this phenotypic classification is controverse and is based on criteria epidemiological features or antimicrobial susceptibility. In the other hand, genotypic classification based on the diversity of the cassette chromosomal, wich harbours gene mecA (responsible for methicillin resistant). Currently, there are 11 SCCmec. types Types I to III and VIII are related with HA-MRSA genotype and types IV to XI with CA-MRSA genotype. Classicaly, CA-MRSA is able to produce the Panton-Valentine Leukocidin toxin that is encoded by genes luk-S and luk-F. This toxin is associated to necrotizant pneumonia and soft tissue infections and in FC patients with pulmonary exacerbation. In Brazil, the are few studies envolving SCCmec characterization. Thus the main purpose of this study was to determine the presence of SCCmec types and the antimicrobial susceptibility profiles of MRSA strains recover from patients with CF attended at Hospital Universitário Pedro Ernesto (HUPE) - UERJ and Instituto Fernandes Figueiras (IFF) FIOCRUZ. One hundred and eight MRSA isolates from FC patients were studied in a period of two years (2008-2010). Ninety and four isolates belongs to pediatric patients treated in IFF and 14 from adults patients from HUPE. We found high rates of resistance to antimicrobials such as oxacillin, cefoxitin and erythromycin. All isolates were susceptible to vancomycin and linezolid by the microdilution testing. 82.4% of the isolates where typed by multiplex PCR and 64 % belonged to CA-MRSA. No statistical difference were detected between samples CA-MRSA and HA-MRSA. The SCCmec types I, IIII, IV and V were detected, and the types I and IV were the most frequent. 34,2% of the isolates harbored the PVL gene. This is the first in Brazil detecting the PVL toxin gene and high rates of CA-MRSA isolates among CF patients. Furthermore, we find luk-S gene HA-MRSA isolates from CF patients. The few national studies, as well as the differences between studies, reflecting the need for more improved knowledge of MRSA involved in lung infections of CF patients.

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:18:31Z : No. of bitstreams: 1 000847587.pdf: 882405 bytes, checksum: 203a9f03040e737b3a41cc7bffeec3a9 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Staphylococcus aureus é comum em infecções intramamárias, que frequentemente se tornam crônicas, entre outros fatores, pela capacidade dessa bactéria em produzir biofilme. Objetivou-se verificar a capacidade produtora de biofilme em estirpes de S. aureus e Staphylococcus coagulase negativa (SCN), oriundas de mastite bovina clínica e subclínica. Um total de 100 cepas de S. aureus e 100 cepas de SCN foram isoladas de casos de mastites subclínicas e clínicas em duas propriedades do Estado de São Paulo. O teste de triagem da mastite subclínica foi o California Mastitis Test (CMT). Foi realizada Contagem de Células Somáticas (CCS) e cultivo microbiológico das amostras de leite. Pesquisou-se a presença de genes icaA, icaD e bap pela Reação em Cadeia pela Polimerase (Polimerase Chain Reaction - PCR) e caracterização fenotípica no ágar Vermelho Congo (VC) e teste de produção de biofilme em placas. Não houve relação entre a intensidade da reação ao CMT e a CCS. A média de CCS foi de 2,88±0,59 para S. aureus e 2,71±0,35 para SCN. Não houve significância estatísticas entre os valores de CCS para estirpes que continham a presença dos genes pesquisados. Porém as médias dos valores de CCS foram maiores nos isolados que continham tais genes. As frequências de icaA, icaD e bap em S. aureus foram de 82%, 83% e 58%, respectivamente. Observou-se que dos 83 isolados de S. aureus que apresentaram icaD, 82 (98,8%) também apresentaram icaA, com significância estatística no Teste Exato de Fischer (p<0,001). Na associação entre os genes icaA e bap, também foi observada associação significante pois das 82 estirpes que apresentaram icaA, foi possível observar a presença de bap em 56 (68,3%). Das 83 linhagens que continham o gene icaD em 56 (67,5%) delas, também foi detectada presença do gene bap. Não houve concordância entre os testes fenotípicos (K<0,2). A positividade no vermelho congo revelou que 25% das... / Staphylococcus aureus is common in intramammary infections, which often become chronic, among other factors, by the ability of this bacteria to produce biofilm. The objective was to verify the production of biofilm capacity in strains of S. aureus and coagulase negative Staphylococcus (CNS), derived from clinical and subclinical bovine mastitis. A total of 100 strains of S. aureus and 100 strains of CNS were isolated from cases of subclinical and clinical mastitis in two properties of São Paulo State. The screening test of subclinical mastitis was the California Mastitis Test (CMT). Somatic Cell Count (SCC) and microbiological culture of milk samples was performed. We researched the presence of icaA, icaD and bap genes by the Polymerase Chain Reaction (PCR) and phenotypic characterization on congo red agar (CRA) and biofilm production on plates. There was no observed relationship between the intensity of the reaction to the CMT and SCC. The mean of SCC was 2.88 ± 0.59 for S. aureus and 2.71 ± 0.35 for CNS. There was no significant statistical between SCC values for strains containing the presence of those researched genes. But the means of the CCS values were higher in isolates that containing such genes. The frequency icaA, icaD and bap in S. aureus were 82%, 83% and 58%, respectively. It was observed that the 83% of S. aureus isolates that had icaD, 82 (98.8%) also had icaA, with statistical significance in the Fischer's exact test (p <0.001). In association between icaA and bap genes, was also observed significant association, for the 82 strains that showed icaA, we observed the presence of bap in 56 (68.3%). Of the 83 strains that containing the icaD gene, 56 (67.5%) of them was also detected the presence of bap gene. There was no agreement between the phenotypic tests (K<0.2). The positivity on congo red agar revealed that 25% of S. aureus strains produced in vitro biofilm. In the adhesion test plates, this number was lower, with ... / FAPESP: 2013/14383-9

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-30. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:56Z : No. of bitstreams: 1 000849670.pdf: 1421991 bytes, checksum: 5b10092e2a2350f4d4a5b9c0411c1341 (MD5) / O presente estudo teve como objetivo o isolamento de Staphylococcus aureus e estafilococos coagulase negativos (ECN), associados com casos de mastite subclínica, a partir de amostras de leite de 134 vacas, em dez pequenas propriedades leiteiras familiares, da região de Bauru - SP, determinar a susceptibilidade a antimicrobianos e investigar a presença de genes de enterotoxinas e do gene mecA de resistência à oxacilina, dos casos de mastite subclínica, a partir das cepas bacterianas isoladas do leite dos animais, e dos tanques de resfriamento. Isolaram se 105 amostras de Staphylococcus spp, sendo 55 (52,4%) estafilococos coagulase positivos (ECP) e 50 (47,6%) ECN. Entre os ECP, S.aureus foi isolado em 48 (87,3%) dos casos. Das 12 espécies de ECN isoladas, as mais freqüentes foram S. warneri, S. hyicus, e S. xylosus. Os maiores níveis de resistência, foram observados frente ao grupo dos beta-lactâmicos tanto para os ECP - 92,7% para penicilina e 90,9% para ampicilina, como para os ECN - 56% e 52% de resistência, respectivamente. Todas amostras de ECP foram sensíveis a cefalexina, e 96% dos isolados de ECN a enrofloxacina. Em relação a presença de genes codificadores de enterotoxinas, dos casos de mastite subclínica, 17/142 (12%) foi positiva para algum dos genes estudados. O gene sea foi o mais prevalente, sendo detectado em 11 (7,7%). O gene seb em 05 (3,5%) e o sec em 01 (0,7%) das amostras. Todas foram negativas para o gene sed. Dos Staphylococcus spp isolados das mastites subclínicas, houve detecção do gene sec em 8/105 (7,6%), sendo que cinco (4,7%) eram ECP, e três (2,8%) ECN. Das 10 amostras de leite dos tanques, duas (20%) foram positivas para sea e uma (10%) para seb. O gene mecA foi detectado em três cepas de S. aureus, (6,2%). A identificação de genes codificadores de enterotoxinas em casos de mastite subclínica e em tanques comunitários, sinalizam a importância do monitoramento destes agentes visando a... / This study aimed at the isolation of Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci, from bovine milk samples, associated with cases of subclinical mastitis detected in ten small properties from Bauru - SP. Also, determine the antimicrobial susceptibility of the agents isolated and to investigate the presence of enterotoxin gene and the mecA gene of oxacillin resistance from the bacterial strains, and milk samples from bulk tanks . Of 105 samples obtained, 55 ( 52.4 %) were coagulase positive staphylococcus (CPS) and 50 (47.6%) coagulase negative staphylococcus (CNS). Among the CPS, S. aureus was isolated in most cases, 48 ( 87.3 %). Of the 12 CNS species isolated, the most frequent were S. warneri, S. hyicus, both with 8 (16%) and S. xylosus 7 (14%) . The highest levels of antibiotics resistance were observed for the group of β - lactam antibiotics - penicillin 92.7% and ampicillin 90.9% CPS and ECN - 56 % and 52 % respectively. The greatest sensitivity of the CPS strains was to cephalexin, and for CNS isolates to enrofloxacin. From the cases of subclinical mastitis, genes encoding enterotoxins were found in, 17/142 (12%) . The sea gene was the most prevalent being detected in 11 ( 7.7 %). The seb gene was detected in five (3.5%) samples, and in one sec (0.7%). All were negative for sed gene. When we consider the results directly from cultures of Staphylococcus spp. isolated from subclinical mastitis, there was only the gene sec in 8/105 (7.6%).From these isolates of Staphylococcus spp., positive for sec 05/105 (4.8%) were CPS, (03 S. aureus and 02 S.intermedius) and 03/105 (2.8%) CNS, (01 S. xylosus, 01 S.hyicus and 01 S.lugdunensis). To sea, seb and sed samples were negative. Of the ten samples from the bulk tanks, 02/10 (20%) were positive for sea and 01/10 (10%) to seb. The mecA gene was detected in three strains of S. aureus, representing 6.2% of the total of 48 S. aureus strains isolated. The identification ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-20Bitstream added on 2014-06-13T18:44:23Z : No. of bitstreams: 1 souza_v_dr_jabo.pdf: 824781 bytes, checksum: 699e9efd378fb4c601290d43aebe88bb (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mastite bovina é a principal doença do gado leiteiro em todo o mundo, devido a sua elevada ocorrência, aos prejuízos econômicos que acarreta aos produtores e à perda da qualidade do leite. Dentre os agentes da mastite, o Staphylococcus aureus é o mais frequentemente isolado. Sabe-se que o conhecimento do perfil molecular deste microrganismo é de fundamental importância para uma melhor compreensão dos estudos epidemiológicos de dispersão deste patógeno nas propriedades rurais. Sendo assim, durante o período de janeiro a abril de 2009, 222 vacas lactantes pertencentes a 12 propriedades rurais situadas no Município de Sacramento-MG foram submetidas ao California Mastitis Test (CMT). Foram colhidas amostras de leite dos quartos reagentes ao CMT, assim como do leite produzido em cada propriedade rural e do leite de conjunto das 12 propriedades contido em dois tanques de expansão comunitários. Paralelamente, foram colhidas, também, amostras dos óstios papilares, dos latões, dos baldes, dos coadores, dos insufladores das ordenhadeiras, das mãos dos ordenhadores, da superfície dos tanques de expansão, da tubulação auxiliar no transvase do leite, da água utilizada no processo de produção e da água utilizada para higienização dos tanques comunitários. A partir das 446 amostras colhidas nos diversos pontos, 244 estirpes foram isoladas e caracterizadas bioquimicamente como estafilococos coagulase-positivos. O fragmento de DNA cromossômico específico da espécie de S. aureus foi amplificado em 106 estirpes, das quais 103 foram submetidas à eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE). Os pontos de colheita de amostras que apresentaram maior frequência de isolamento de estirpes de Staphylococcus aureus foram os óstios papilares (31,1%), o leite das vacas reagentes ao CMT (21,7%), os insufladores das ordenhadeiras mecânicas (21,7%), o leite dos latões (6,6%)... / Bovine mastitis is a main disease in milk cattle worldwide. Staphylococcus aureus is the most frequently isolated among mastitis agents. The microorganism’s molecular profile is of paramount importance for a better understanding of epidemiologic studies of these pathogens on farms and ranches. Two hundred twenty-two cows on 12 farms in the municipality of Sacramento-MG, Brazil were tested by the California Mastitis Test (CMT) between January and April 2009. Milk samples were collected from four CMT reagents, from the milk produced on each farm and from milk collectively collected from the 12 farms and maintained in two community bulk tanks. At the same time samples of papillary ostia were collected from milk pails, cans, sieves, milking machine insufflators, milkers’ hands, from the water used on the 12 farms and from the two community bulk tanks. Two hundred and forty-four strains among the 446 samples collected from several sites were isolated and biochemically characterized as positive coagulase Staphylococcus. Chromosome DNA fragment, specific to S. aureus, was amplified in 106 strains. Further, when 103 S. aureus strains underwent pulsed field gel electrophoresis (PFGE), the samples’ collection sites with the highest isolation frequency of S. aureus strains were papillary ostia (31.1%), milk of cows which reacted to CMT (21.7%), the insufflators of milking machines (21.7%), milk in pails (6.6%) and milk in the community bulk tanks (5.6%). Since 32 different pulsotypes were identified, genetic heterogeneity existed among the 106 S. aureus isolated strains. Pulsotype 1 had the highest similarity among the S. aureus isolated strains at the different sites of the milk production flowchart. Since highest isolation frequency of pulsotype 1 of S. aureus strains were papillary ostia (10.6%), milk of cows which reacted to CMT (5.8%), the insufflators of milking machines (3.8%)... (Complete abstract click electronic access below)