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RNAs não-codificantes associados a IS200/605: identificação e caracterização funcional na archaea Halobacterium salinarum NRC-1 / Non-coding RNAs associated with IS200/605: Identification and functional characterizal in the archaea Halobacterium salinarum NRC-1

Gomes Filho, José Vicente 13 June 2017 (has links)
Os elementos genéticos móveis (mobile genetic elements MGEs), são elementos extremamente importantes para plasticidade e evolução dos genomas. Uma das classes mais importantes de MGEs são as sequências de inserção (insertion sequences - IS). Estes elementos são encontrados em bactérias e archaea e apresentam grande diversidade de famílias e mecanismos de movimentação. Uma família interessante de IS é IS200/605, esta família encontra-se distribuída em bactérias, archaea e vírus e utiliza substratos de DNA de fita simples para seu processo de transposição. Neste trabalho, através da análise de dados públicos de transcritoma identificamos RNAs sobrepostos ao 3\' de genes tnpB de IS200/605 em archaea e bactérias, estes transcritos foram chamados de sense overlapping transcripts (sotRNAs). As extremidades 5\' e 3\' dos sotRNAs foram mapeadas através de dados de RNA-seq de pequenos RNAs (sRNA-seq) e validadas através da técnica de C-RACE. Análises de sequência e estrutura secundária demonstraram que estes RNAs apresentam um motivo conservado chamado de RE-like. Utilizando a sequência consenso deste motivo pudemos identificar RNAs intergênicos derivados de IS200/605 em H. salinarum NRC-1. Para caracterização funcional, construímos linhagens superexpressando os RNAs VNG_sot0042 e VNG_R0052, ambos contendo o motivo RE-like. Curvas de crescimento, utilizando as linhagens construídas demonstraram que a superexpressão destes RNAs aumenta o crescimento de H. salinarum demonstrando sua funcionalidade. Devido a presença do motivo RE-like, extremidades 5\' e 3\' determinadas e fenótipo visualizado em curva de crescimento padrão, o sotRNA VNG_sot0042 foi estudado mais a fundo. Realizamos experimentos de RNA-seq para avaliar o impacto desta superexpressão no transcritoma de H. salinarum NRC-1, assim como experimentos de SILAC para identificação de proteínas parceiras em larga escala. Nestes ensaios identificamos proteínas e genes associados ao processo de adesão, geração de células persistentes e resistência a metais pesados. Ensaios de adesão e sobrevivência a metais pesados demonstraram que a linhagem de superexpressão apresenta maior capacidade de aderir a vidro e maior sobrevivência em diversas condições de estresse. Deste modo, podemos sugerir que ncRNAs derivados de IS200/605 são importantes moléculas regulatórias em H. salinarum NRC-1 e nos ajudam a compreender a manutenção de IS200/605 e seus derivados nos genomas de procariotos. / Mobile genetic elements (MGEs) are extremely important for plasticity and evolution of genomes. Their impacts are diverse and could be related to antibiotic resistence or symbiosis. One of the most important class of MGEs are insertion sequences (ISs). These elements are found widespread throughout bacteria and archaea, presenting a great diversity of families. An interesting family is the IS200/605, this family is found widespread in bacteria, archaea and viruses and is divided in three subgroups according to it\'s genetic composition: IS200 with tnpA gene alone, IS605 with tnpA and tnpB and IS1341 with tnpB only. Another interesting aspect is the utilization of single-stranded DNA as a substrate during the transposition process. In this work, through the analysis of public available transcriptomic data we identified transcripts that overlaps the 3\' end of tnpB in IS200/605 in both bacteria and archaea. These transcripts were named sense overlapping transcripts (sotRNAs). Sequence and secondary structure analysis showed a conserved motif present in sotRNAs, the RE-like motif. Using the consensus sequence of this motif we identified novel intergenic ncRNAs containing this motif that are derived from IS200/605. For functional characterization we overexpressed a sotRNA (VNG_sot0042) and a intergenic (VNG_R0052), both containing the RE-like motif. Standard growth curves demonstrated that the overexpression of these ncRNAs improve H. salinarum growth showing that this RNA is functional. To further evaluate the impact of the overexpressions we prepared RNA-seq libraries of the strain overexpressing VNG_sot0042 and in parallel performed SILAC experiments to identify potential protein-RNA interaction partners. Differentially regulated genes and interacting proteins associated with adhesion and persistent cells generation were found. Adhesion and survival assays showed that the lineage overexpressing VNG_sot0042 has a better capability to adhere in glass surfaces and survive more in diverse stressful conditions.
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Sequências textuais descritivas em cartas de reclamação / Descriptive textual sequences in complaint letters

Rocha, Debora Ferreira da 11 August 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-28T19:33:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Debora Ferreira da Rocha.pdf: 446239 bytes, checksum: f6ad97a0770768eef9aa3d7e71a46f36 (MD5) Previous issue date: 2015-08-11 / This dissertation is based in the research line of Text and speech in oral and written forms and its theme is the descriptive textual sequences in complaint letters. The general objective of this study is to contribute to a better understanding of descriptive textual sequences present in the genre complaint letters texts. The specific objectives are to identify and analyze the descriptive sequences in complaint letters and interpret their occurrence in this textual genre.In order to develop our study, we have chosen as the theoretical linguistics Textual, to deal with textual typology (TRAVAGLIA, 1991, 2002, 2004a, 2004b, 2007a, 2007b, 2007c, 2009 and 2014), descriptive genre (Marquesi, 2004) textual sequences (ADAM, 2008) and descriptive textual sequences (ADAM, 2008; Marquesi, 2011) and the theory of genres (Bakhtin, 2006 [1979]; Marcuschi (2008), to deal with the genre letter of complaint (GREGÓRIO and Cecilio 2006; MIRANDA, 2004; SILVA and LEAL, 2003; Wilson, 2001; MELO, 1999. The methodology was a review of the literature about text types and descriptive text, textual sequences and descriptive textual sequences, besides the theory that treats textual genre, with special focus on the complaint letter; establishment of categories of analysis, due to the recurrent strategies observed in the selected corpus, newspaper letters selection from the newspaper Diário de S. Paulo and analysis of the corpus according to the categories proposed in the theoretical foundation chapter. The corpus has about 22 complaint letters selected from April to July 2014, in the section A Vez e a Voz do Leitor , from the newspaper Diário de S. Paulo. The results show that the descriptive textual sequences not only indicate as well, along with other textual sequences, contribute in building the argue that the text producer has in mind / Esta dissertação está inserida na linha de pesquisa Texto e discurso nas modalidades oral e escrita e tem como tema as sequências textuais descritivas em cartas de reclamação. O objetivo geral deste trabalho é contribuir para uma melhor compreensão das sequências textuais descritivas presentes em textos do gênero cartas de reclamação. Os objetivos específicos são: identificar e analisar as sequências descritivas em cartas de reclamação e interpretar suas ocorrências nesse gênero textual. De modo a desenvolvermos nosso estudo, elegemos como aporte teórico a Linguística Textual, para tratarmos de tipologia textual (TRAVAGLIA, 1991, 2002, 2004a, 2004b, 2007a, 2007b, 2007c, 2009 e 2014), tipo descritivo (MARQUESI, 2004), sequências textuais (ADAM, 2008) e sequências textuais descritivas (ADAM, 2008; MARQUESI, 2011) e a teoria de gêneros (BAKHTIN, 2006 [1979]; MARCUSCHI (2008), para tratarmos do gênero textual carta de reclamação (GREGÓRIO e CECÍLIO, 2006; MIRANDA, 2004; SILVA e LEAL, 2003; WILSON, 2001; MELO, 1999. No que se refere à metodologia, procedemos à revisão da literatura sobre tipologias textuais e tipo descritivo, sequências textuais e sequências textuais descritivas, além da teoria que trata de gênero textual, com enfoque especial sobre carta de reclamação; estabelecimento das categorias de análise, em virtude das estratégias mais recorrentes observadas no corpus selecionado; seleção de cartas do jornal Diário de S. Paulo e análise do corpus de acordo com as categorias propostas no capítulo de fundamentação teórica. O corpus é composto por 22 cartas de reclamação selecionadas entre abril a julho de 2014, na seção A Vez e a Voz do Leitor , do jornal Diário de S. Paulo. Os resultados mostram que as sequências textuais descritivas não só indiciam como também, juntamente com as demais sequências textuais, contribuem na construção da argumentação visada pelo produtor do texto
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Sequências textuais descritivas e inferências na avaliação de leitura do PISA

Mirabile, Luciana 27 November 2018 (has links)
Submitted by Filipe dos Santos (fsantos@pucsp.br) on 2018-12-17T11:52:13Z No. of bitstreams: 1 Luciana Mirabile.pdf: 5276759 bytes, checksum: 2037b925fcd886f4422364aa9dba6595 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-17T11:52:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciana Mirabile.pdf: 5276759 bytes, checksum: 2037b925fcd886f4422364aa9dba6595 (MD5) Previous issue date: 2018-11-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This thesis is situated in the Reading, Writing and Portuguese Teaching research area of the Program of Postgraduate Studies in Portuguese Language at the Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP) and its main subject is the descriptive textual sequences and their contribution to the inferences generation on reading. The hypothesis of this study is that descriptive textual sequences operate as textual indexes from which the reader can generate the necessary inferences in order to understand the text. Guided by this proposition, the following research question is defined: How do descriptive textual sequences contribute to the inferences generation on reading? The general objective of this research is establish a relation between the descriptive textual sequences and the inferences generation. In order to achieve this major purpose, the following specific objectives have been established: 1º) identify and describe the inferences requested in PISA questions; 2º) identify, describe and analyze the descriptive textual sequences present in the texts related to PISA questions and 3º) reflect on how the descriptive textual sequences contribute to the inference generation in reading. The theoretical contribution that underlies this research is mostly constituted by the assumptions of Text Linguistics (KOCH, 2002; 2004a; 2004b; KOCH, ELIAS, 2006), Textual Analysis of Discourses (ADAM, 2011; PASSEGGI et al., 2010; MARQUESI 2004 [1996]; 2013; 2014; 2016; 2017) and by the studies on inferences (MARCUSCHI, 1999; 2008; THURLOW & VAN DER BROEK, 1997; COLLINS, BROWN, LARKIN, 2010; GRAESSER, LOUWERSE, MCNAMARA, 2007; GRAESSER, SINGER, TRABASSO, 1994; DELL’ISOLA, 2001). The corpus consists of five PISA questions. The chosen categories of analysis are the descriptive categories in descriptive textual sequences and the inferences. The obtained results in the analysis demonstrate that descriptive textual sequences contribute to the inferences generation in reading / Esta tese situa-se na linha de pesquisa Leitura, Escrita e Ensino de Língua Portuguesa do Programa de Estudos Pós-Graduados em Língua Portuguesa da Pontifícia Universidade Católica de São Paulo (PUC-SP) e tem como tema as sequências textuais descritivas e sua contribuição para a geração de inferências na leitura. Nossa hipótese é a de que as sequências textuais descritivas operam como índices textuais com base nos quais o leitor pode gerar as inferências necessárias para compreender o texto. Orientados por essa proposição, definimos a seguinte pergunta de pesquisa: Como as sequências textuais descritivas colaboram para a geração de inferências na leitura? Temos como objetivo geral relacionar as sequências textuais descritivas à geração das inferências. A fim de alcançarmos esse objetivo geral, estabelecemos os seguintes objetivos específicos: 1º) identificar e descrever as inferências solicitadas nas questões do PISA; 2º) identificar, descrever e analisar as sequências textuais descritivas presentes nos textos relacionados às questões do PISA e 3º) refletir sobre como as sequências textuais descritivas colaboram para a geração de inferências. O aporte teórico que embasa esta pesquisa é constituído, sobretudo, pelos pressupostos da Linguística Textual (KOCH, 2002; 2004a; 2004b; KOCH, ELIAS, 2006), da Análise Textual dos Discursos (ADAM, 2011; PASSEGGI et al., 2010; MARQUESI 2004 [1996]; 2013; 2014; 2016; 2017) e pelos estudos sobre inferências (MARCUSCHI, 1999; 2008; THURLOW & VAN DER BROEK, 1997; COLLINS, BROWN, LARKIN, 2010; GRAESSER, LOUWERSE, MCNAMARA, 2007; GRAESSER, SINGER, TRABASSO, 1994; DELL’ISOLA, 2001). O corpus é composto por cinco questões do PISA. Elegemos como categorias de análise as sequências textuais descritivas nas categorias descritivas e as inferências. Os resultados obtidos nas análises demonstram que as sequências textuais descritivas contribuem para a geração de inferências na leitura
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PADRÕES E O TRABALHO COM SEQUÊNCIAS RECURSIVAS: UMA ABORDAGEM NO DESENVOLVIMENTO DO PENSAMENTO ALGÉBRICO / PADRÕES E O TRABALHO COM SEQUÊNCIAS RECURSIVAS: UMA ABORDAGEM NO DESENVOLVIMENTO DO PENSAMENTO ALGÉBRICO

Theodorovski, Ronaldo 11 July 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-21T20:56:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ronaldo Theodorovski.pdf: 2397904 bytes, checksum: 7a489d39fd5bcb4d6dc34a5ed2a4217f (MD5) Previous issue date: 2014-07-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This paper aims to present educational proposals for the teaching of algebra in order to promote the development of students' algebraic thinking. To do so a bibliographical survey searching for papers that demonstrate that such goal can be achieved through an education that prioritizes the recognition and the generalization of mathematical patterns was conducted. At first, we tried to analyze how some textbooks of elementary school deal with this issue. To address high school, we highlighted the sequences defined recursively, which appear as a good starting point for the generalization of patterns. Thus, we present a study of the methods of solving the recurrence relations that allows the formula to find the general term for this type of sequence. Moreover, with the study of linear recurrences, it is possible to propose an alternative approach to teaching progressions in high school. Seeking to work with numerical regularities to describe and generalize relationships, we suggest the use of computational resources, in particular, the use of spreadsheets as a methodological approach in the teaching of algebra. / Este trabalho tem por objetivo apresentar propostas pedagógicas para o ensino da álgebra tendo em vista promover o desenvolvimento do pensamento algébrico dos alunos. Para tanto foi realizado um levantamento bibliográfico buscando trabalhos que demonstram que tal objetivo pode ser alcançado por meio de um ensino que prioriza o reconhecimento e a generalização de padrões matemáticos. Em um primeiro momento, procuramos analisar como alguns livros didáticos do Ensino Fundamental tratam desse tema. Para contemplar o Ensino Médio, demos destaque às sequências definidas recursivamente, que se revelam como um bom ponto de partida para a generalização de padrões. Dessa forma, apresentamos um estudo dos métodos de resolução das relações de recorrências que permitem encontrar a fórmula do termo geral para esse tipo de sequência. Além disso, com o estudo de recorrências lineares, é possível propor uma abordagem alternativa para o ensino de progressões no Ensino Médio. Buscando trabalhar com regularidades numéricas para descrever e generalizar relações, sugerimos a utilização de recursos computacionais, em particular, o uso das planilhas eletrônicas, como proposta metodológica no ensino da álgebra.
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Modelagem matemática no arremesso de peso

Francisco, Samuel January 2013 (has links)
Orientador: Rodney Carlos Bassanezi / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC. Programa de Mestrado Profissional em Matemática em Rede Nacional - PROFMAT, 2013
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O estabelecimento da cadeia referencial em português: uma análise em diferentes sequências textuais

Souza, Luciana Ribeiro de 26 November 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-03-15T19:45:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciana Ribeiro de Souza.pdf: 1272328 bytes, checksum: dcecae964d9cbf23b680770a948b9704 (MD5) Previous issue date: 2013-11-26 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de São Paulo / This dissertation analyzes, from the viewpoint of enunciative relations, referential chains in different textual sequences excerpts (narrative, descriptive and argumentative) of Brazilian novels. Anchored in functionalism (HALLIDAY 1964; 1973; 1978; 1989; HALLIDAY; MATTHIESSEN, 2004; DIK, 1997; NEVES, 2004, 2007), related with text linguistics and cognitive linguistics, this proposal analyzes language in function a textual-discursive view of grammar. In the realization of this research, it was established as central to the analysis the chain of endophoric reference and its triadic categories. In this proposal, it was aimed at verifying and interpreting: the different fillers for referential slots in the text (noun phrases, pronouns, ø); the relation between the filler of the referential slots and the creation and maintenance of the referential network; the interplay of enuncive-enunciative categories set up in this network, according to selected textual sequences from different novels of different literary periods. The verification had its focus on: in narrative sequences, the type of phoric filler used in reference to the characters; in descriptive sequences, the introduction and maintenance of phoric elements on the spatial construction of the descripted scenario. The results of the analysis showed, among other things, (i) in narrative sequences: the relevance of noun phrases in creating descriptive traits of characters; the non-canonical use of personal pronouns, which were used to introduce referents; (ii) in descriptive sequences: a great number of noun phrases and a very low number of pronominal forms and zeroes; the introduction of new referents associated with to the description of space; (iii) in argumentative sequences: in which, most of the times, the author opines, there is a special contribution . It was concluded that in any textual sequence there are elements that construct the referential chain, through which these elements are made part of the construction of the cohesive meaning of the utterance. However, it became evident that in different textual sequences and, specially, different novels from different literary periods are a conditioning factor to the construal and maintenance of referential chain in the text. / Este trabalho tem o objetivo de analisar, do ponto de vista das relações enunciativas, o estabelecimento da cadeia referencial em diferentes sequências textuais (narrativas, descritivas e dissertativas) do gênero romance, no Brasil. Numa perspectiva funcionalista (HALLIDAY 1964; 1973; 1978; 1989; HALLIDAY; MATTHIESSEN, 2004; DIK, 1997; NEVES, 2004, 2007) que aproveita desenvolvimentos da linguística do texto e da linguística cognitiva, a proposta se dirige à língua em função, numa visão discursivo-textual da gramática. Na realização da pesquisa, instituiu-se como campo central da análise a cadeia referencial endofórica, vista sob o ângulo da enunciação, com suas categorias triádicas. Nessa proposta, objetivou-se, especificamente, a verificação e a interpretação: dos diferentes preenchimentos fóricos das casas em que se opera a referenciação textual (sintagma nominal, pronome, zero); da relação entre o modo de preenchimento das casas e o modo de criação e manutenção da rede referencial; do jogo enuncivo-enunciativo que se monta nessa rede, segundo as sequências textuais selecionadas em romances de diferentes escolas literárias. A busca de verificação dirigiu-se para: nas sequências narrativas, o tipo de preenchimento fórico usado para referência às personagens e, em relação a isso, o grau de identificação dessas personagens, em correlação com esse tipo de preenchimento; nas sequências descritivas, a introdução e a manutenção dos elementos fóricos que contribuem para construção espacial das cenas em que se operam as descrições; nas sequências dissertativas, a introdução e a manutenção dos elementos fóricos usados na construção do ponto de vista do enunciador. Os resultados dessas análises, dentre outras coisas, mostram (i) nas sequências narrativas: a relevância dos sintagmas nominais na composição descritiva das personagens; o uso não canônico do pronome pessoal que apareceu, mais de uma vez, introduzindo referente; (ii) nas sequências descritivas: uma proporção muito maior de sintagmas nominais e, em contrapartida, um número pouco significativo de pronome ou da referenciação textual zero; a introdução de novos referentes associada à descrição do espaço; (iii) nas sequências dissertativas: em que, na maioria das vezes, o autor introduz sua opinião, uma contribuição especial do conhecimento do contexto de situação para a construção do sentido do texto. Dentro da proposta aqui instituída, conclui-se que qualquer que seja a sequência textual, nela há elementos que constituem uma rede referencial, pela qual entram na constituição da coesão e de todo o sentido do enunciado. Entretanto, ficou evidente que diferentes sequências textuais e, especialmente, diferentes inserções das obras e dos autores em diferentes contextos de situação condicionam conduções específicas na montagem das cadeias referenciais textuais.
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Mais uma imagem no espelho: a colocação de clíticos pronominais em sequências verbais do espanhol e do português brasileiro / Another image in the mirror: the placement of pronominal clitics in verbal sequences of Spanish and Brazilian Portuguese

Petrolini Junior, Carlos Donato 02 October 2009 (has links)
As possibilidades de colocação dos pronomes pessoais átonos em sequências de verbos do espanhol e do português brasileiro não são simétricas: enquanto neste último se verificam menos oportunidades para a chamada subida do clítico, naquele ela é claramente mais frequente. Para descrever tal situação, esta dissertação analisa a configuração de composições verbais, perifrásticas ou não, dos dois sistemas linguísticos, de modo a classificá-las de acordo com seus diferentes níveis de gramaticalização e, a partir daí, com base em determinadas características sintáticas e semânticas relevantes para a problemática do posicionamento dos clíticos nessas estruturas. A seguir, se constata, mediante o exame de alguns exemplos representativos, que a coincidência nos parâmetros anteriores não implica um mesmo padrão quanto aos lugares ocupados pelas formas pronominais átonas junto a cadeias de verbos da língua espanhola e do português do Brasil. Com o objetivo de incluir outros fatores e de encontrar respostas mais completas, se pesquisam, então, novas explicações sobre o fenômeno e essas, por fim, também são debatidas, já que se identifica que nem sempre são suficientes ou totalmente precisas. / The possibilities of positioning atonic pronouns in verbal sequences in Spanish and Brazilian Portuguese are not symmetrical: while in the latter less opportunities for clitic climbing are noted, in the former it is clearly more frequent. To describe this situation, this dissertation analyses the configuration of periphrastical or not periphrastical verbal compositions of the two linguistic systems, in order to classify them according to their different levels of grammaticalization and, from there, based on certain syntactical and semantic characteristics relevant to the question of clitic positioning in those structures. Subsequently, it is evidenced, through the exam of a few representative examples, that the coincidence in previous parameters does not imply the same standard regarding the positions of atonic pronominal forms in verbal chains in the Spanish language and Brazilian Portuguese spoken in Brazil. With the objective of including other factors and finding more complete answers, we research new explanations for that phenomenon, which are finally also debated, since it is identified that not always they are sufficient or totally precise.
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Desenvolvimento e aplicação de sequências de pulsos CWFP uni e bidimensionais para RMN no domínio do tempo / Development and applications of uni and bidimensional CWFP pulse sequences in time-domain NMR

Monaretto, Tatiana 26 July 2019 (has links)
Os tempos de relaxação longitudinal (T1) e transversal (T2) são largamente utilizados em medidas qualitativas e quantitativas em Ressonância Magnética Nuclear no domínio do tempo (RMN-DT). As constantes de tempo T2 e T1 são medidas com as sequências de pulsos Carr-Purcel-Meiboom-Gill (CPMG) e Inversão Recuperação (IR), respectivamente. Além dessas sequencias, também têm sido desenvolvidos outros métodos que permitem a medição de T1 e T2 em um único experimento. Dentre esses, destacam-se os provenientes da condição Continuous Wave Free Precession: CWFP e CP-CWFP (Carr-Purcel-CWFP) com ou sem alternância de fase entre os pulsos que compõe o trem de pulsos de 90º desses métodos. Baseando-se no fato de que os métodos provenientes da condição CWFP têm sido promissores para a determinação das constantes de tempo de uma forma rápida, esse trabalho visou aprofundar o estudo das sequências de pulsos oriundas dessa condição a fim de desenvolver um método de determinação rápida da constante de tempo T1 em um único experimento e também implementar a condição CWFP em sequências de pulsos 2D (2D-CWFP). Utilizando-se de pulso de baixo ângulo de rotação (θ ~10 graus) foi possível determinar a constante de tempo T1 utilizando a condição CWFP, esse método foi denominado de CWFP-T1. Contudo, este apresentou um sinal com baixa razão sinal ruído (S/R) devido aos baixos valores de q. Para minimizar esse efeito foram estudados cinco métodos de redução de ruído que podem ser aplicados em sinais de RMN-DT após a aquisição, sendo que, dentre os métodos estudados foi comprovado que os filtros wavelet (WA) e o Savistiky-Goaly (SG) são os mais eficazes para redução do ruído sem distorcer as informações da amostra. Além disso, o sinal obtido pelo método CWFP-T1 associado ao filtro WA demonstrou ser eficiente para determinação de gordura em carne bovina. Dentre os métodos 2D-CWFP desenvolvidos neste trabalho, o CPMG-CWFP-T1 apresentou vantagem em tempo de experimento sobre o método IR-CPMG. Além disso, o sinal adquirido pelo método CPMG-CWFP-T1 quando associado ao filtro SG propiciou a obtenção de mapas com melhor resolução na dimensão de T1, que as outras sequências de pulsos abordadas neste estudo, e também demonstrou ser um método promissor para a análise da carne e gordura bovina. Esta foi a primeira vez em que a constante de tempo T1 foi utilizada como dimensão de aquisição de uma forma conveniente em experimento 2D de correlação dos tempos de relaxação, visto que aquisições dessa natureza geralmente requerem longos tempos de experimento. / The longitudinal (T1) and transverse (T2) relaxation times are widely used in the qualitative and quantitative measurements in time domain Nuclear Magnetic Resonance (TD-NMR). Those relaxation times are generally measured by the Carr-Purcel-Meiboom-Gill (CPMG) and Inversion Recovery (IR) pulse sequences, respectively. In addition to these sequences, other methods have been development, which makes it possible to measure T1 and T2 in a single experiment. Among these, a special reference is made those ones coming from the Continuous Wave Free Precession condition: CWFP and CP-CWFP (Carr-Purcel-CWFP) with or without phase alternation between the pulses that make up the pulse train of 90º of these methods. Based on the fact that the methods from the CWFP condition have been promising to determine the time constants fast, the purpose of this work was to deepen the study of the sequences from that condition in order to develop a rapid method to determine the T1 relaxation time in a single experiment, and also to implement the CWFP condition in 2D sequences (2D-CWFP). Using a small flip angle (θ ~10 degrees) it was possible to determine the T1 relaxation time using the CWFP condition; this method was named CWFP-T1­. Nevertheless, this sequence has a signal with a low signal-to-noise ratio (SNR) because of the small values of q. In order to minimize this effect was studied five denoise methods to applied in the post-acquisition TD-NMR signals. Among the denoise methods studied, the wavelet (WA) and the Savistiky-Goaly (SG) are the most effective to reduce the noise of the signal without distorting the sample information. In addition, the CWFP-T1 signal associated to the WA has shown to be effective for determining the fat in beef samples. Among the 2D-CWFP methods developed in this work, the CPMG-CWFP-T1 had advantage in the experimental time compared with the IR-CPMG method. Furthermore, the signal acquired by CPMG-CWFP-T1 sequence, when associated with the SG filter, had 2D maps with the best resolution in the T1 dimension than the other sequences addressed in this work and also proved to be effective to analyze fat beef. This was the first time that T1 time constant was encoded in the acquisition dimension at a convenient way in the 2D experiments of relaxation times correlation, once such acquisitions generally require extensive experimental time.
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Práticas de Letramento na EJA: possibilidades de desenvolvimento da escrita letrada numa interface do oral com o escrito

Santos, Rubeny Ramalho 15 August 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-05-14T12:43:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1265953 bytes, checksum: 24b7674898fc76a14523119574fadc13 (MD5) Previous issue date: 2014-08-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Based upon a theoretical-discursive perspective of the speech-writing continuum, the present paper results from a research accomplished with students of the Young and Adult People s Education programme, the perceptive teaching practice analysis of which pointed out to the need of a methodological intervention as regards the development of the capacity in the production of written texts by students characterized with relative developed competence, in the production of oral texts. To do so, we searched for contribution in papers with wording practices, contemplating the textual genders and the use of didactic sequences as methodological resource, as well. While approaching textual gender works, we opted for the experienced life report gender to accredit the existence of a larger and better gender similarity with the students knowledge and their life histories. To accomplish our target, we developed a didactic sequence to contemplate a series of systematically organised activities about the gender we chose to develop the study. Out of this practice, there resulted a group of texts classified as follows: text 01 (initial written production), text 02 (initial oral production), text 03 (final written production), used as basic instruments of the analysis and evaluation of the learning results. For the evaluating analysis, we established a compositional structure of the experienced life report gender as a delimiting parameter of an adequate production. We observed the occurrence of a relative evolution in the students knowledge during the accomplishment of the analysis between the initial production context and the final production one. Another point observed in the second moment of the analysis, i. e., the one regarding the texts produced in the oral version, was that we can confirm the students better performance in the oral texts. And, in a more comprehensive scope of the analysis, the results showed the development of a more significant learning when we consider the relationships of the interface composing the space between the oral practice and writing as a guiding point to the students formation, so confirming the growth of the autonomy and the consequent proficiency in the production of written texts. / Embasado em uma perspectiva teórico discursiva do Continuum fala-escrita, o presente trabalho é resultante de uma pesquisa realizada com alunos da Educação de Jovens e Adultos, cuja análise perceptiva da prática docente, pontuou a necessidade de uma intervenção metodológica no tocante ao desenvolvimento da capacidade na produção de textos escritos, para alunos caracterizados com competência, relativamente desenvolvida, na produção de textos oralizados. Nesse sentido, buscamos aporte nos trabalhos com as práticas do letramento, contemplando os gêneros textuais e o uso das sequências didáticas, enquanto recurso metodológico. Na abordagem do trabalho com os gêneros textuais, optamos pelo gênero relatos de experiências vividas, por credenciar a existência de uma maior e melhor similaridade, do gênero, com os conhecimentos dos alunos e suas histórias de vida. Na intenção de efetivar o nosso objetivo, desenvolvemos uma sequência didática, de modo a contemplar uma série de atividades, sistematicamente organizadas, em torno do gênero que escolhemos para desenvolver o estudo. Dessa prática, decorreu um grupo de textos, classificados como texto 01 (produção escrita inicial); texto 02 (produção oral inicial) e texto 03 (produção escrita final), utilizados como instrumentos base, da análise e avaliação dos resultados da aprendizagem. Para análise avaliativa, estabelecemos a estrutura composicional do gênero relatos de experiências vividas, como parâmetro delimitador de uma produção adequada. Tendo sido verificada a ocorrência de uma relativa evolução nos conhecimentos dos alunos, quando da realização de análise entre o contexto de produção inicial e o contexto de produção final. Outra constatação, verificada em um segundo momento da análise, está instaurada nos textos produzidos na versão oral, quando foi possível confirmar a maior capacidade dos alunos em textos oralizados, e a preponderância de uma aprendizagem mais significativa, quando consideramos as relações de interface, que compõe o espaço entre a oralidade e a escrita, como ponto norteador na formação de alunos com perfil de maior eficiência e autonomia na produção de textos escritos.
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Epidemiologia molecular das cepas de Yersinia pestis isoladas no Nordeste do Brasil pela análise do número variável de repetições em Tandem (MLVA) / Molecular epidemiology from Yersinia pestis strains isolated in Brazil for multiple locus variable analisys (MLVA)

Nepomuceno, Mirele Regina de Araújo January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-21T13:43:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 833.pdf: 2723781 bytes, checksum: a830784ddefc542106be74ce8aa431fa (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Made available in DSpace on 2016-07-05T22:16:54Z (GMT). No. of bitstreams: 3 833.pdf.txt: 159741 bytes, checksum: 9e6065c4897ceb926534eb7e10453293 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 833.pdf: 2723781 bytes, checksum: a830784ddefc542106be74ce8aa431fa (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / A Yersinia pestis é o agente etiológico da peste, uma doença primária de roedores, transmitida por pulgas infectadas e que pode infectar o homem e outros mamíferos. O objetivo do trabalho foi realizar a tipagem de 63 cepas de Y. pestis de três focos de peste do PE. As cepas foram isoladas de diferentes fontes e períodos. Das 63 cepas, 20 foram isoladas de um epizootia, em agosto de 1967, na Chapada do Araripe-PE. Também foram estudadas oito cepas de Y. pestis isoladas em outros países, cinco cepas de Y. pseudotuberculosis e nove de Y. enterocolitica. Foram utilizados onze VNTRs pela técnica do MLVA. Dos onze VNTRs para as cepas da epizootia apenas um revelou-se polimórfico apresentando diferentes alelos. Os demais VNTRs revelaram-se monomórficos. Entre os onze VNTRs analisados para as 51 cepas de Y. pestis (43 brasileiras e 8 estrageiras) dois se revelaram monomórficos gerando amplicons com 7 e 2 unidades repetitivas (UR). Os outros nove VNTRs analisados revelaram-se polimórficos gerando dois a oito alelos. As cepas de Y. pseudotuberculosis apresentaram-se polimórficas para 10 VNTRs gerando amplicons de tamanhos diversos, o VNTR ms09 foi o único monomórfico gerando um amplicon de 700 pb com 28 UR. Das nove cepas de Y. enterocolitica analisadas com os onze locos, sete apresentaram-se monomórficos com amplicons de 700, 250, 270, 690, 231 e 379 pb. Os outros quatro VNTRs analisados apresentaram um padrão de amplificação polimórfico com amplicons de tamanhos diferentes para o mesmo loco. O padrão de amplificação gerado com as cepas de Y. pestis possibilitou distribui-las em 35 perfis genotípicos. A análise das cepas pelo dendrograma permitiu agrupá-las em cinco clados, onde no clado I ficaram agrupadas a maioria das cepas brasileiras de Y. pestis, as cepas estrangeiras de Y. pestis ficaram agrupadas nos clados II e IV, enquanto que Y. enterocolitica e Y. pseudotuberculosis ficaram nos clados III e V respectivamente. Diante dissso pode-se considerar que o MLVA mostrou-se uma ferramenta útil em estudos filogenéticos e epidemiológicos das cepas brasileiras de Y. pestis, além de estudos intraespecíficos com as espécies de Y. enterocolitica e Y. pseudotuberculosis. As análises revelaram diversidade genética entre as cepas de Y. pestis isoladas de diferentes fontes e períodos e sua continuação poderá gerar dados importantes para estabelecer relações filogenéticas entre as cepas, contribuindo para um melhor entendimento da disseminação e transmissão do agente etiológico da peste na natureza e a dinâmica da epidemiologia no Brasil

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