Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000410923-Texto+Completo-0.pdf: 13934438 bytes, checksum: ee355e5c27aa53c04afc0422aafa6e74 (MD5) Previous issue date: 2008 / A phylogenetic analysis of the Neoplecostominae was performed under the maximum parsimony optimality criterion, based on characters originally proposed in this study as well as on characters from previous analyses. Seventy one taxa were included in the analysis, 12 as outgroup and 59 as ingroup. In this analysis all species of Pareiorhaphis, Pareiorhina and Kronichthys were included as well as most of the species of Neoplecostomus and Isbrueckerichthys. Were also included five genera of the Hypoptopomatinae (Parotocinclus, Eurycheilichthys, Epactionotus, Otocinclus and Hisonotus), all species of Hemipsilichthys and most of Delturus. The analysis of the 303 characters from external morphology and anatomy resulted in two maximally parsimonious cladograms with 2171 steps, consistency index of 0. 21 retention index of 0. 66. The genera Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis, Pareiorhina, and Kronichthys were recovered as monophyletic. The subfamily Neoplecostominae is considered monophyletic and includes the genera Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis and an undescribed genus. The relationships among the genera included in the Neoplecostominae recovered Isbrueckerichthys and Neoplecostomus as sister-groups and more related to Pareiorhaphis. The new genus is basal, sister to the genera mentioned above. Pareiorhina and Kronichthys were recovered as sister to each other and more related to the members of the Hypoptopomatinae, and are transferred to that subfamily. The basal position of Delturus and Hemipsilichthys in the family was confirmed in the present analysis, corroborating previous hypothesis. Delturinae includes the genera Delturus and Hemipsilichthys. Phylogenetic relationships among Delturinae are (Hemipsilichthys nimius (H. gobio + H. papillatus)) (Delturus brevis (D. angulicauda + D. parahybae)).Several new species were recognized: six Pareiorhaphis, one Neoplecostomus, two Pareiorhina, one Kronichthys, and one Hisonotus. Finally, three new genera were recognized, one Neoplecostominae and two Hypoptopomatinae. / A análise filogenética de Neoplecostominae foi realizada pelo método de parcimônia, com base em caracteres originalmente propostos e oriundos de análises prévias. Foram analisados 71 táxons terminais, sendo 12 considerados como grupo-externo e 59 como grupo-interno. Nessa análise foram incluídas todas as espécies dos gêneros: Pareiorhaphis, Pareiorhina e Kronichthys, a maioria das espécies de Neoplecostomus e Isbrueckerichthys. Também foram incluídos cinco gêneros de Hypoptopomatinae (Parotocinclus, Eurycheilichthys, Epactionotus, Otocinclus e Hisonotus), todas as espécies de Hemipsilichthys, e a maioria das espécies de Delturus. A análise dos 303 caracteres morfológicos externos e anatômicos, resultou em dois cladogramas maximamente parcimoniosos com 2171 passos, índice de consistência de 0,21 e índice de retenção de 0,66. Os gêneros Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis, Pareiorhina, e Kronichthys foram recuperados como monofiléticos. A subfamília Neoplecostominae é considerada monofilética e inclui os gêneros Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis e um novo gênero. As relações de parentesco entre os gêneros incluídos em Neoplecostominae recuperam Isbrueckerichthys e Neoplecostomus como grupos-irmãos e mais relacionados a Pareiorhaphis. O novo gênero é mais basal, grupo-irmão dos gêneros acima. Pareiorhina e Kronichthys foram recuperados como grupos-irmãos e são mais relacionados com os membros de Hypoptopomatinae, e foram transferidos para esta subfamília. A posição basal de Delturus e Hemipsilichthys foi confirmada na presente análise, corroborando com hipóteses prévias. Delturinae inclui os gêneros Delturus e Hemipsilichthys. As relações de parentesco mostraram (Hemipsilichthys nimius (H. gobio + H. papillatus)) (Delturus brevis (D. angulicauda + D. parahybae)). Foram reconhecidas seis novas espécies de Pareiorhaphis, uma de Neoplecostomus, duas de Pareiorhina, uma de Kronichthys, uma de Hisonotus, além de três novos gêneros, um representante de Neoplecostominae e dois incluídos em Hypoptopomatinae.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000418843-Texto+Completo-0.pdf: 3552633 bytes, checksum: 84ec8875567ea185fbad22a2012002a8 (MD5) Previous issue date: 2009 / The Loricariidae, or armored catfishes, is one of the most diverse fish families, currently containing nearly 800 recognized species. They are solely freshwater inhabitants, with a distribution from Uruguay and Argentina to Costa Rica. Loricariids occur in every kind of waters, from cool mountain streams to lakes in the Amazon floodplain and reach sizes from a few centimeters up to more than one meter. Though the first species have been described by Linnaeus in 1758 and much effort has been done, especially in the last 15 years, their phylogenetic relationships could be only partly resolved so far. In particular, molecular analyses showed some groupings that conflict with the results from morphological analyses. The most problematic groups are the subfamilies Hypostominae, Hypoptopomatinae, and Neoplecostominae. Both morphologic and molecular studies suggest that the latter two form a monophyletic group, although leaving doubts if they are monophyletic separately. Therefore, the Hypoptopomatinae and the Neoplecostominae were chosen as subjects for the present project. In a flrst study, sequences from a 709 basepair fragment of the first subunit of the mitochondrial cytochrome e oxidase gene (COI) were used. The maximum parsimony (MP) and maximum likelihood (ML) analyses included data from 83 loricariid species from 29 genera representing five loricariid subfamilies. Additionally, eight species from four closely related families were used as outgroup. The results conflrmed the Delturinae as the most basal subfamily and showed the Hypoptopomatinae + Neoplecostominae as sister to the Hypostominae. Corroborating previous molecular studies, the Neoplecostominae was monophyletic only when including the hypoptopomatine genus Pseudotocinclus.The Hypoptopomatinae formed a paraphyletic group, embracing the Neoplecostominae. In a second study, more taxa as well as partial sequences from the nuclear recombination activating genes 1 (RAG1) and 2 (RAG2), and the F-Reticulon 4 gene were included, increasing the data set to a total of 136 species and 4678 basepairs. The MP, ML, and Bayesian analyses confirmed most previous molecular results, but some new polyphyletic taxa were found such as Pareiorhaphis, Neoplecostomus, and the Neoplecostominae. To try to better understand the conflicts between the morphological and molecular approaches and to reach a more complete solution, a total evidence analysis was undertaken, since this approach had already yielded good solutions for similar problems. A new data set with a total of 207 species and concatenated sequences from COl, RAG1, and RAG2, as well as 472 morphological characters from previous studies was analyzed using MP, resulting in the largest catflsh phylogeny done so far. The Hypoptopomatinae and the Neoplecostominae were recovered as monophyletic sister groups, the latter including the genus Pseudotocinclus. Inside the Neoplecostominae, only the genus Pareiorhina remained polyphyletic, probably because of the lack of morphological data. The phylogeny of the genus Pareiorhaphis showed a previously unknown structured biogeographic pattern. From the two hypoptopomatine tribes, Hypoptopomatini was recovered as monophyletic, but Otothyrini remained paraphyletic. Although three monophyletic clades were found for the genus Parotocinclus, part of its species remained scattered in the phylogeny. Summarizing, the total evidence analysis was able to resolve several of the previous uncertainties in the loricariid phylogeny, but a further complementation of characters and an expansion of the taxon sampling will be necessary to completely resolve the phylogenetic relationships of this group. / Loricariidae é uma das mais diversas famílias de peixes, atualmente incluindo cerca de 800 espécies reconhecidas. Os loricarídeos são popularmente conhecidos como cascudos ou acaris e têm tamanho de poucos centímetros a mais que um metro. São encontrados somente em água doce, com ampla variação tanto na temperatura, como tipo de ambiente, ou seja, podem ser encontrados desde em córregos frios das montanhas até em lagos da área de inundação do rio Amazonas. A distribuição do grupo é ampla, abrangendo praticamente todas as bacias hidrográficas da América do Sul e parte da América Central, da Argentina até a Costa Rica. Apesar das primeiras espécies terem sido descritas por Linnaeus em 1758 e do trabalho realizado deste então, especialmente nos últimos 15 anos, as relações filogenéticas dos loricarídeos estão apenas parcialmente resolvidas. Os resultados das análises moleculares são conflitantes com os agrupamentos propostos pelas análises morfológicas e um consenso ainda não foi alcançado. Os grupos mais problemáticos são as subfamílias Hypostominae, Hypoptopomatinae e Neoplecostominae. Os estudos morfológicos e moleculares sugerem que Hypoptopomatinae e Neoplecostominae formam um grupo monofilético, porém a monofilia das mesmas ainda é incerta. Por esta razão, o principal objetivo da presente tese é testar a monofilia destas duas subfamílias atráves de uma análise de evidência total. Num primeiro estudo, sequências de um fragmento de 709 pares de bases da primeira subunidade do gene mitocondrial citocromo c oxidase (COI) foram usadas. As análises de Máxima Parcimônia (MP) e de Máxima Verossimilhança (ML) incluíram dados de 83 espécies, pertencentes a 29 gêneros, representando cinco subfamílias de Loricariidae. Adicionalmente, oito espécies de quatro famílias próximas foram usadas como grupo externo.Os resultados confirmaram Delturinae como a subfamília mais basal e mostraram a Hypoptopomatinae + Neoplecostominae como grupo irmão de Hypostominae. Corroborando estudos moleculares anteriores, Neoplecostominae é monofilética somente quando incluído o gênero Pseudotocinclus (Hypoptopomatinae). Neoplecostominae ficou inserida dentro de Hypoptopomatinae, que assim formou um grupo parafilético. Num segundo estudo, foram adicionados mais táxons e sequências parciais dos genes nucleares recombination activating gene 1 (RAG1) e 2 (RAG2) e F-Reticulon 4, resultando na análise de 136 espécies e 4678 pares de bases. As análises de MP, ML e Bayesianas confirmaram a maioria dos resultados moleculares anteriores, exceto pela polifilia de Pareiorhaphis, Neoplecostomus e Neoplecostominae. A análise final dos dados constituiu uma análise de evidência total, com o intuito de compreender melhor os conflitos entre as análises morfológicas e moleculares e encontrar, assim, uma solução mais robusta para o grupo. O novo conjunto de dados inclui 207 espécies e sequências concatenadas de COI, RAG 1 e RAG2, bem como 472 caracteres morfológicos de estudos anteriores, resultando na maior filogenia de bagres já elaborada. A análise de MP confirmou a monofilia de Hypoptopomatinae e de Neoplecostominae + Pseudotocinclus. Dentro de Neoplecostominae, somente o gênero Pareiorhina ficou polifilético, provavelmente devido à falta de dados morfológicos. A filogenia do gênero Pareiorhaphis revelou um padrão biogeográfico de distribuição previamente desconhecido. Das duas tribos de Hypoptopomatinae, Hypoptopomatini foi recuperada como monofilética, mas Otothyrini se manteve parafilética. O gênero Parotocinclus ficou polifilético, formando três ciados monofiléticos e parte das espécies espalhada na filogenia.O resultado obtido pela análise de evidência total conseguiu resolver vários conflitos entre as propostas filogenéticas anteriores para Loricariidae. Porém, os grupos não resolvidos foram os que apresentaram a menor quantidade de caracteres, mostrando que, para resolver as relações filogenéticas dentro desta família, é necessária a complementação dos caracteres, assim como a adição de novos táxons.

Made available in DSpace on 2013-11-04T16:02:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000451889-Texto+Completo-0.pdf: 4456883 bytes, checksum: e742e45558fe54b9dfa42a4657b631fb (MD5) Previous issue date: 2013 / The phylogeny of the family Callichthyidae (Siluriformes) was investigated performing a Cladistic parsimony analysis under a Total Evidence approach. Characters explored are mainly based in osteology and molecular data of nuclear and mitochondrial genes. The ingroup included 131 terminals representing 111 species, the outgroup included 13 terminals representing 13 species including Copionodon as the rooting taxa. The phylogenetic analysis resulted in 89 most parsimonious trees which are summarized in a strict consensus cladogram; a new phylogenetic classification and the discussion of this paper are addressed based in this topology. The Total Evidence phylogenetic analysis corroborated the monophyly of the family Callichthyidae, subfamilies Callichthyinae and Corydoradinae, genera Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis, and Scleromystax. However, the genera Aspidoras, Corydoras, and Hoplosternum are recovered nonmonophyletic. To reconcile this situation, a revalidation of the genera Hoplisoma and Gastrodermus is proposed to accommodate most species currently recognized in Corydoras. Aspidoras virgulatus and Corydoras lacerdai are transferred to Scleromystax to conceive their currently containing genera monophyletic. On the other hand, Hoplosternum is recovered paraphyletic. However, it was decided to hold making taxonomic changes at this moment until molecular dataset is completed for this genus, which is referred temporarily as “Hoplosternum”. Synapomorphies for each clade recovered and ranked in the phylogenetic classification are reported here, emphasizing their morphological diagnoses. Interrelationships between species and clades are discussed and compared with previous taxonomic and phylogenetic hypotheses. In addition, the taxonomy of Hoplisoma nattereri was reviewed in order to elucidate its synonymy and investigate the presence of cryptic diversity under this name. Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are considered valid species. Geographic distribution for each species is also reported. Corydoras juquiaae is removed from the synonymy of Hoplisoma nattereri and transferred to Scleromystax juquiaae, new combination. Scleromystax prionotos is considered a junior synonym of S. juquiaae. All these species are illustrated in this paper. In addition, the original figure of S. juquiaae prepared but never published by Rudolph von Ihering is reproduced here. Phylogenetic relationships of Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are discussed and also the morphometric and genetic distance of some of the populations sampled. / A filogenia da família Callichthyidae (Siluriformes) foi estudada realizando uma análise de Parcimônia Cladística sob uma abordagem de Evidência Total. Caracteres explorados foram principalmente baseados em osteologia e dados moleculares de genes nucleares e mitocondriais. O grupo interno incluiu 131 terminais representando 111 espécies; o grupo externo incluiu 13 terminais representando 13 espécies e incluindo Copionodon como o terminal de enraizamento da topologia. A análise filogenética resultou em 89 árvores mais parcimoniosas que foram resumidas em um cladograma de consenso estrito; com base nessa topologia, se propõe e discute uma nova classificação filogenética para Callichthyidae. A análise filogenética de Evidência Total corroborou o monofiletismo da família Callichthyidae, subfamílias Callichthyinae e Corydoradinae, gêneros Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis e Scleromystax. No entanto, os gêneros Aspidoras, Corydoras e Hoplosternum foram recuperados nãomonofiléticos. Para conciliar esta situação, se propõe a revalidação dos gêneros Hoplisoma e Gastrodermus para acomodar a maioria das espécies atualmente reconhecidas em Corydoras. Aspidoras virgulatus e Corydoras lacerdai foram transferidas para Scleromystax e assim conceber esses gêneros como monofiléticos. Por outro lado, as espécies de Hoplosternum foram recuperadas como parafiléticas. No entanto, decidiu-se não fazer mudanças taxonômicas no momento até concluir a coleta de dados moleculares para este grupo, o qual é reconhecido temporariamente como “Hoplosternum”. Sinapomorfias para cada clado recuperado e proposto na classificação filogenética são aqui mostrados, enfatizando seus caracteres morfológicos diagnósticos. Inter-relações entre as espécies e clados são discutidas e comparadas com estudos taxonômicos e hipóteses filogenéticas anteriores. Adicionalmente, a taxonomia de Hoplisoma nattereri foi revisada a fim de elucidar sua sinonímia e investigar a presença de diversidade críptica sob este nome. Hoplisoma nattereri e H. triseriatus são consideradas espécies válidas. A distribuição geográfica para cada espécie é reportada. Corydoras juquiaae é removida da sinonímia de Hoplisoma nattereri e transferida para Scleromystax juquiaae, nova combinação. Scleromystax prionotos é considerada um sinônimo júnior de S. juquiaae. Todas estas espécies são ilustradas neste artigo. Também, a figura original de Corydoras juquiaae preparada, mas nunca publicada, por Rudolph von Ihering é aqui reproduzida. As relações filogenéticas de Hoplisoma nattereri e H. triseriatus foram discutidas como assim a sua morfometría e a distância genética de algumas das populações amostradas.

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2016-06-20T18:26:16Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE _DFBC_.pdf: 1525509 bytes, checksum: 91079bb98aed005cbb284a2ec816c4c1 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-20T18:26:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE _DFBC_.pdf: 1525509 bytes, checksum: 91079bb98aed005cbb284a2ec816c4c1 (MD5) Previous issue date: 2016-02-02 / Capes / Este trabalho teve o objetivo de avaliar a influência entre macronutrientes energéticos, com o desempenho, metabolismo e fisiologia digestiva de diferentes surubim híbridos (Pseudoplatystoma corruscans x Pseudoplatystoma fasciatum e Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus). Esses surubim híbridos são amplamente cultivados no Brasil, para abate sendo a carne destinada ao mercado interno e externo. No entanto, são poucos os dados na literatura em relação às exigências nutricionais para esses peixes, bem como o efeito da relação entre os macronutrientes com a fisiologia digestiva e metabolismo. Deste modo, o capítulo um avaliou o efeito da manga de uma fonte de carboidrato não amiláceo. Para tal foram fornecidas dietas contendo farinha de manga em substituição ao milho em quatro níveis diferentes (0; 33%; 66% e 100%) para alevinos de Pseudoplatystoma sp. Após o período de 60 dias para a análise de desempenho, foram realizadas as atividades das enzimas digestivas: protease total alcalina, tripsina e amilase. Como indicativos de mudança no metabolismo foram avaliados no plasma: triglicérides, glicose, proteínas totais, colesterol, amino ácidos livres; no fígado: glicogênio e alanina aminotransferase. Foi observado que não houve diferença significativa nos parâmetros de desempenho analisados. Entretanto foram observadas alterações nas atividades das enzimas digestivas e intermediários metabólicos, provavelmente devido à quantidade de fatores antinutricionais encontrados na casca da manga. Estes resultados demonstram que em longo prazo a inclusão de farinha de manga acarretará decréscimo no desempenho dos animais. No capítulo dois foi avaliado o efeito de diferentes valores da relação proteína(P):lipídio(L). Quatro dietas (45P 5L; 42P 9L; 39P 11L; 34P 19L%) foram fornecidas por 60 dias para observar o efeito sobre o desempenho, enzimas digestivas, intermediários metabólicos e parâmetros hematimétricos de alevinos do surubim híbrido Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus. O excesso de lipídio na dieta diminuiu o desempenho o que consequentemente afetou os demais parâmetros avaliados. Valores de proteínas totais e aminoácidos livres no plasma demostraram danos causados pela deficiência de proteína na dieta. Os valores de colesterol, triglicérides e glicose mostraram resposta consequente da baixa ingestão de nutrientes. A lipase foi a enzima digestiva mais influenciada pelos nutrientes dietéticos. Os parâmetros hematimétricos foram afetados pelas dietas e demonstraram que animais que ingeriram maior quantidade de lipídio tiveram adaptação metabólica e fisiológica para suprir a deficiência nutricional. No capítulo três foi avaliado o efeito de diferentes valores da relação proteína(P):carboidrato(C). Quatro dietas (28P 53C; 36P 44C; 40P 39C; 45P 37C%) foram fornecidas por 60 dias para observar o efeito sobre o desempenho, composição corporal, enzimas digestivas e intermediários metabólicos de alevinos do surubim híbrido Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus. O excesso de carboidrato na dieta diminuiu o desempenho, sem afetar demasiadamente os parâmetros fisiológicos e metabólicos avaliados, mostrando grande adaptação do híbrido avaliado. A eficiência energética das dietas avaliadas foi maior no tratamento com menor inclusão de carboidrato e maior inclusão proteica. Valores de atividades enzimáticas específicas foram maiores no tratamento com maior inclusão de proteína. A maior reserva de glicogênio hepático também foi observado no mesmo tratamento citado acima. Como conclusão geral pode-se afirmar que diferentes relações proteína:energia, independente de ser fonte lipídica ou de carboidrato, afeta o desempenho, fisiologia digestiva e metabolismo do surubim híbrido. / This study aimed to evaluate the influence of macronutrients energetic, growth, metabolism and digestive physiology of different surubim hybrids (Pseuduplatystoma corruscans x Pseudoplatystoma fasciatum and Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus). These hybrids are highly raised in Brazil with its main products being sold to domestic and international market. However there is few information on literature published about data on nutrient requirements to this fish, as well as the effects among macronutrients and digestive physiology and metabolism. Thus, chapter one evaluated the effect of mango meal as a non-starch carbohydrate source. In order to accomplish it, diets containing mango meal replacing corn meal in four different levels (0; 33%; 66%; 100%) were given to Pseudoplatystoma sp. juvenile. After 60 days growth analysis were done as well as the digestive enzymes activities: total alkaline protease, trypsin and amylase. As indicative of metabolism changes were evaluated in the blood plasma: triglycerides, glucose, total proteins, cholesterol, free amino acids; in the liver: glycogen and alanine aminotransferase. It was observed no significant difference among growth parameters evaluated. However digestive enzymes activities and intermediary metabolic changes were observed, probably due to anti-nutritional factors found in mango skin. These results shows that, in long term feeding mango meal inclusion can lead to animal growth decrease. In chapter two it was evaluated the effect of different protein(P):lipid(L) ratios. Four diets (45P 5L; 42P 9L; 39P 11L; 34P 19L) were offered for 60 days to observe the effect on growth performance, digestive enzymes activities, intermediary metabolism and hematimetric parameters of hybrid surubim Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus juvenile. Dietary lipid excess decreased growth which consequently affected the others parameters evaluated. Plasma total protein and free amino acids values demonstrated injuries caused by protein deficiency in the diet. Cholesterol, triglycerides and glucose values showed consequent response to low nutrient ingestion. Lipase was the enzyme more influenced by dietary nutrients. Hematimetric parameters were affected by diets and showed that animals that ingested higher lipid amount had metabolic and physiologic adaptation to make up nutritional deficiency. In chapter three it was evaluated the effect of different protein(P):carbohydrate (C)values. Four diets (28C 53C; 36P 44C; 40P 39C; 45P 37C) were offered for 60 days in order to observe the effect on growth, whole body composition, digestive enzymes and intermediary metabolism of hybrid surubim Pseudoplatysma fasciatum x Leiarius marmoratus juvenile. Dietary carbohydrate in excess decreased growth without affecting all of others physiological and metabolic parameters evaluated, which shows high adaptation. Feed energetic efficiency evaluated was higher in the treatment with lower carbohydrate inclusion and higher protein inclusion. Specific digestive enzymes activities were higher in the treatment with higher protein inclusion. Higher hepatic glycogen reserve was also observed in the same treatment cited above. As a general conclusion it can be affirmed that different protein:energy ratio, no matter if it is lipidic or carbohydrate source, affects growth, digestive physiology and metabolism of hybrid surubim.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-26T18:27:37Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Wellington Silva Pedroza.pdf: 4717095 bytes, checksum: f580c77bfcbaa73f2b2a520911ed43d6 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-26T18:27:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Wellington Silva Pedroza.pdf: 4717095 bytes, checksum: f580c77bfcbaa73f2b2a520911ed43d6 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-04-07 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The morphology of the pelvic girdle is compared throughout the six families of Loricarioidea. Representatives of the families were: Nematogenyidae (1 species), Trichomycteridae (7 species), Callichthyidae (6 species), Scoloplacidae (2 species), Astroblepidae (1 species) and Loricariidae (8 species). All families showed synapomorphies on the pelvic girdle. Nematogenyidae has a laminar extension on the basipterygium and cartilages on the 1 st and 2 nd pelvic rays; Trichomycteridae, besides showing a large diversity of shapes of pelvics, have structures such as fused cartilage, very long internal anterior processes and posterior cartilage on basipterygium; Callichthyidae showed a very peculiar shape of pelvic girdle but very conservative throughout the family, and some features like a unique conexion of the pelvics with the axial skeleton, strong tridimensional shape of the basipterygium and external anterior processes modified; Scoloplacidae also showed a very peculiar and conservative pelvic girdle, without anterior or posterior processes, and with a reduced and posterior sutural joint between the basipterygia; Astroblepidae shows a very distinguished pelvic girdle, with long posterior processes, racquet-like lateropterygium and musculature well developed; and Loricariidae showed a spike- like lateropterygium, synchondral joint of the basipterygia between sutures or not, and well developed condyles for articulation of the pelvic rays. Nematogenyidae and Trichomycteridae share a similar disposition of the anterior processes and the presence of unfused cartilage between the basipterygia. The other Loricarioidea, or ‘advanced Loricarioidea’, already show sutural joints between the basipterygia. Astroblepidae and Loricariidae share, among other features, the presence of the lateropterygium, presence of condyles for articulation of the pelvic rays and synchondral joint followed by sutures. Some new features are described for some of the families (Nematogenyidae, Trichomycteridae and Astroblepidae). The present work brought additional support to the current hypothesis of relationship among Loricarioidea families. / A morfologia da cintura pélvica de representantes das seis famílias de Loricarioidea é comparada. Foram usados representantes de Nematogenyidae (1 espécie), Trichomycteridae (7 espécies), Callichthyidae (6 espécies), Scoloplacidae (2 espécies), Astroblepidae (1 espécie) e Loricariidae (8 espécies). Todas as famílias apresentaram sinapomorfias relacionadas à cintura pélvica. Nematogenyidae apresenta uma expansão laminar no basipterígio e cartilagens nos 1o e 2o raios pélvicos; Trichomycteridae, apesar de possuirem uma grande diversidade de formas de pélvicas, apresentaram características como presença de cartilagem fusionada, processos anteriores internos extremamente longos e presença de cartilagem posterior; Callichthyidae apresentaram uma cintura pélvica muito diferenciada mas conservada dentro da família, e como características únicas a conexão da pélvica com o esqueleto axial em alguns representantes, tridimensionalidade acentuada na forma do basipterígio e modificações nos processos anteriores externos; Scoloplacidae também apresentaram a pélvica muito modificada e conservada na família, sem processos anteriores e posteriores, e com um ponto de sutura entre os basipterígios muito reduzido e posterior; Astroblepidae apresenta uma pélvica muito diferenciada, com longos processos posteriores, lateropterígio em forma de raquete e musculatura muito desenvolvida; e Loricariidae apresentaram lateropterígio em forma de bastão, articulação sincondral entre os basipterígios seguida por suturas ou não, e côndilos bem desenvolvidos para articulação dos raios pélvicos. Nematogenyidae e Trichomycteridae compartilham uma disposição semelhante dos processos anteriores e presença de cartilagem não fusionada entre os basipterígios. Os demais Loricarioidea, ou ‘Loricaroidea avançados’, já apresentam uma articulação com suturas entre os basipterigios. Astroblepidae e Loricariidae compartilham, entre outras estruturas, a presença de lateropterígio, presença de côndilos para articulaçao dos raios pélvicos e articulação sincondral dos basipterigíos seguida por suturas. Algumas características novas são descritas para algumas das famílias (Nematogenyidae, Trichomycteridae e Astroblepidae). O presente estudo veio dar um suporte adicional a atual proposta de relacionamento entre as famílias de Loricarioidea.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 410923.pdf: 13934438 bytes, checksum: ee355e5c27aa53c04afc0422aafa6e74 (MD5) Previous issue date: 2009-01-08 / A an?lise filogen?tica de Neoplecostominae foi realizada pelo m?todo de parcim?nia, com base em caracteres originalmente propostos e oriundos de an?lises pr?vias. Foram analisados 71 t?xons terminais, sendo 12 considerados como grupo-externo e 59 como grupo-interno. Nessa an?lise foram inclu?das todas as esp?cies dos g?neros: Pareiorhaphis, Pareiorhina e Kronichthys, a maioria das esp?cies de Neoplecostomus e Isbrueckerichthys. Tamb?m foram inclu?dos cinco g?neros de Hypoptopomatinae (Parotocinclus, Eurycheilichthys, Epactionotus, Otocinclus e Hisonotus), todas as esp?cies de Hemipsilichthys, e a maioria das esp?cies de Delturus. A an?lise dos 303 caracteres morfol?gicos externos e anat?micos, resultou em dois cladogramas maximamente parcimoniosos com 2171 passos, ?ndice de consist?ncia de 0,21 e ?ndice de reten??o de 0,66. Os g?neros Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis, Pareiorhina, e Kronichthys foram recuperados como monofil?ticos. A subfam?lia Neoplecostominae ? considerada monofil?tica e inclui os g?neros Neoplecostomus, Isbrueckerichthys, Pareiorhaphis e um novo g?nero. As rela??es de parentesco entre os g?neros inclu?dos em Neoplecostominae recuperam Isbrueckerichthys e Neoplecostomus como grupos-irm?os e mais relacionados a Pareiorhaphis. O novo g?nero ? mais basal, grupo-irm?o dos g?neros acima. Pareiorhina e Kronichthys foram recuperados como grupos-irm?os e s?o mais relacionados com os membros de Hypoptopomatinae, e foram transferidos para esta subfam?lia. A posi??o basal de Delturus e Hemipsilichthys foi confirmada na presente an?lise, corroborando com hip?teses pr?vias. Delturinae inclui os g?neros Delturus e Hemipsilichthys. As rela??es de parentesco mostraram (Hemipsilichthys nimius (H. gobio + H. papillatus)) (Delturus brevis (D. angulicauda + D. parahybae)). Foram reconhecidas seis novas esp?cies de Pareiorhaphis, uma de Neoplecostomus, duas de Pareiorhina, uma de Kronichthys, uma de Hisonotus, al?m de tr?s novos g?neros, um representante de Neoplecostominae e dois inclu?dos em Hypoptopomatinae

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 418843.pdf: 3552633 bytes, checksum: 84ec8875567ea185fbad22a2012002a8 (MD5) Previous issue date: 2009-09-18 / Loricariidae ? uma das mais diversas fam?lias de peixes, atualmente incluindo cerca de 800 esp?cies reconhecidas. Os loricar?deos s?o popularmente conhecidos como cascudos ou acaris e t?m tamanho de poucos cent?metros a mais que um metro. S?o encontrados somente em ?gua doce, com ampla varia??o tanto na temperatura, como tipo de ambiente, ou seja, podem ser encontrados desde em c?rregos frios das montanhas at? em lagos da ?rea de inunda??o do rio Amazonas. A distribui??o do grupo ? ampla, abrangendo praticamente todas as bacias hidrogr?ficas da Am?rica do Sul e parte da Am?rica Central, da Argentina at? a Costa Rica. Apesar das primeiras esp?cies terem sido descritas por Linnaeus em 1758 e do trabalho realizado deste ent?o, especialmente nos ?ltimos 15 anos, as rela??es filogen?ticas dos loricar?deos est?o apenas parcialmente resolvidas. Os resultados das an?lises moleculares s?o conflitantes com os agrupamentos propostos pelas an?lises morfol?gicas e um consenso ainda n?o foi alcan?ado. Os grupos mais problem?ticos s?o as subfam?lias Hypostominae, Hypoptopomatinae e Neoplecostominae. Os estudos morfol?gicos e moleculares sugerem que Hypoptopomatinae e Neoplecostominae formam um grupo monofil?tico, por?m a monofilia das mesmas ainda ? incerta. Por esta raz?o, o principal objetivo da presente tese ? testar a monofilia destas duas subfam?lias atr?ves de uma an?lise de evid?ncia total. Num primeiro estudo, sequ?ncias de um fragmento de 709 pares de bases da primeira subunidade do gene mitocondrial citocromo c oxidase (COI) foram usadas. As an?lises de M?xima Parcim?nia (MP) e de M?xima Verossimilhan?a (ML) inclu?ram dados de 83 esp?cies, pertencentes a 29 g?neros, representando cinco subfam?lias de Loricariidae. Adicionalmente, oito esp?cies de quatro fam?lias pr?ximas foram usadas como grupo externo. Os resultados confirmaram Delturinae como a subfam?lia mais basal e mostraram a Hypoptopomatinae + Neoplecostominae como grupo irm?o de Hypostominae. Corroborando estudos moleculares anteriores, Neoplecostominae ? monofil?tica somente quando inclu?do o g?nero Pseudotocinclus (Hypoptopomatinae). Neoplecostominae ficou inserida dentro de Hypoptopomatinae, que assim formou um grupo parafil?tico. Num segundo estudo, foram adicionados mais t?xons e sequ?ncias parciais dos genes nucleares recombination activating gene 1 (RAG1) e 2 (RAG2) e F-Reticulon 4, resultando na an?lise de 136 esp?cies e 4678 pares de bases. As an?lises de MP, ML e Bayesianas confirmaram a maioria dos resultados moleculares anteriores, exceto pela polifilia de Pareiorhaphis, Neoplecostomus e Neoplecostominae. A an?lise final dos dados constituiu uma an?lise de evid?ncia total, com o intuito de compreender melhor os conflitos entre as an?lises morfol?gicas e moleculares e encontrar, assim, uma solu??o mais robusta para o grupo. O novo conjunto de dados inclui 207 esp?cies e sequ?ncias concatenadas de COI, RAG 1 e RAG2, bem como 472 caracteres morfol?gicos de estudos anteriores, resultando na maior filogenia de bagres j? elaborada. A an?lise de MP confirmou a monofilia de Hypoptopomatinae e de Neoplecostominae + Pseudotocinclus. Dentro de Neoplecostominae, somente o g?nero Pareiorhina ficou polifil?tico, provavelmente devido ? falta de dados morfol?gicos. A filogenia do g?nero Pareiorhaphis revelou um padr?o biogeogr?fico de distribui??o previamente desconhecido. Das duas tribos de Hypoptopomatinae, Hypoptopomatini foi recuperada como monofil?tica, mas Otothyrini se manteve parafil?tica. O g?nero Parotocinclus ficou polifil?tico, formando tr?s ciados monofil?ticos e parte das esp?cies espalhada na filogenia. O resultado obtido pela an?lise de evid?ncia total conseguiu resolver v?rios conflitos entre as propostas filogen?ticas anteriores para Loricariidae. Por?m, os grupos n?o resolvidos foram os que apresentaram a menor quantidade de caracteres, mostrando que, para resolver as rela??es filogen?ticas dentro desta fam?lia, ? necess?ria a complementa??o dos caracteres, assim como a adi??o de novos t?xons.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000427068-Texto+Completo-0.pdf: 8347716 bytes, checksum: 26c36c058e667deb23fc44a8707abd13 (MD5) Previous issue date: 2010 / The Neotropical Loricariidae represents the most diverse catfish family (Order Siluriformes), comprising 716 valid species distributed in 96 genera. For this reason, Loricariidae is also one of the most taxonomic and phylogenetic complex families in the order. Hypoptopomatinae is a subfamily of the Loricariidae that includes above 100 species arranged in 19 genera. These fishes are generally known as "cascudinhos" and most are characterized by the reduced body size. Further on the valid species, Hypoptopomatinae includes a significant portion of undescribed diversity, which has been discovered in the recent past years. Most of these undescribed species are phenotypically similar to Microlepidogaster, Pseudotocinclus or Otothyropsis. In this study we analyzed a data matrix based on phylogenetic studies of previous authors, with the inclusion of 52 ingroup and six outgroup terminals. The analysis was conducted using the heuristic searching algorithm of multiple “Random Addition Sequence (RAS)” followed by branch swapping with “Tree Bissection and Reconnection (TBR)”. We also performed an implied weighting analysis implemented with “Parsimony Ratchet” and with a concavity constant of 3 (K = 3). The analysis of the 60 morphological characters using multiple TBR + TBR resulted in six maximally parsimonious trees of 319 steps, consistency index of 24 and retention index of 64. In the second analysis, conducted with implied weighting, one tree was obtained with fit= 25. 91063. The tree obtained with the weighted analysis had a better resolution than that with equal weighting of characters. The results of both analyses corroborate the monophyly of the Hypoptopomatinae and of the tribe Hypoptopomatini. In addition, the weighted analysis corroborated the monophyly of the tribe Otothyrini. The species of Microlepidogaster, although not found as clade, cluster in close proximity in the trees, indicating the need of a broader characters sampling. The species Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde", and "Tibaji" formed a clade with Otothyropsis marapoama, indicating their generic position as members of Otothyropsis. Pseudotocinclus is included within of a clade also containing Pseudotothyris + Otothyris, and Pseudotocinclus parahybae showing closer proximity to the clade formed by Pseudotohyris + Otothyris than to the other species of Pseudotocinclus. Finally, two new species were recognized and described, belonging the genera Microlepidogaster and Otothyropsis. / Loricariidae é a família mais diversa da Ordem Siluriformes, contendo 716 espécies válidas distribuídas em 96 gêneros. Por este motivo, Loricariidae é também uma das famílias de maior complexidade taxonômica e filogenética dentro da ordem. Hypoptopomatinae é uma subfamília que inclui mais de 100 espécies agrupadas em 19 gêneros. Estes peixes são geralmente conhecidos por “cascudinhos” e a maioria é caracterizada pelo tamanho reduzido. Além das espécies válidas conhecidas, Hypoptopomatinae possui um número significativo de espécies ainda não descritas, que vem sendo descobertas ao longo dos últimos anos. A maioria dessas espécies são fenotipicamente similares a Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis. Foi analisada uma matriz de dados, baseada em estudos filogenéticos de autores prévios, com a inclusão de um total de 58 táxons terminais, sendo 52 considerados como grupo interno e seis como grupo externo. A análise filogenética utilizou o método de busca heurística através de múltiplos “Random Addition Sequences (RAS)” seguida de rearranjos dos ramos "Tree Bissection and Reconnection (TBR)". Também foi realizada uma análise com pesagem implícita de caracteres, implementada com “Parsimony Ratchet”, no programa TNT com uma constante de concavidade igual a 3 (K = 3). A análise de 60 caracteres morfológicos implementada com o algoritmo heurístico de múltiplo TBR + TBR resultou em seis árvores maximamente parcimoniosas com 319 passos, índice de consistência (CI) de 24 e índice de retenção (RI) de 64. Na segunda análise realizada com pesagem implícita foi encontrada uma árvore com fit = 25. 91063. A árvore resultante gerada na análise com pesagem implícita mostrou maior resolução do que aquela obtida na análise com pesos iguais. Os resultados obtidos das duas diferentes análises corroboram a monofilia da subfamília Hypoptopomatinae e da tribo Hypoptopomatini. Além disso, a análise com pesagem implícita encontrou suporte também para tribo Otothyrini. As espécies do gênero Microlepidogaster, apesar de não apresentarem-se como um clado, ocuparam posições sempre próximas entre elas, o que indica a necessidade de uma maior amostragem de caracteres. As espécies Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde" e "Tibaji" foram recuperadas agrupadas em um clado com Otothyropsis marapoama, indicando a alocação destas espécies também dentro desse gênero. Pseudotocinclus ficou agrupado juntamente aos gêneros Pseudotothyris e Otothyris, sendo Pseudotocinclus parahybae mais proximamente relacionado ao clado formado por Pseudotohyris + Otothyris do que as demais espécies de Pseudotocinclus. São reconhecidas e descritas duas novas espécies pertencentes aos gêneros Microlepidogaster e Otothyropsis.

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:59:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo275_1.pdf: 7525903 bytes, checksum: 16bd77dc45160a0da156c83bb8ac42f2 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Esse estudo apresenta os eventos morfológicos durante a ontogenia das espécies Cathorops spixii (Agassiz, 1829) e C. agassizii (Eigenmann & Eigenmann, 1888), usando os padrões de crescimento como resposta às necessidades anatômicas no momento das transições morfológicas (embriogênese e metamorfoses). Os espécimes de C. spixii e C. agassizii foram coletados nas três áreas (superior, media, inferior) do canal principal do estuário do Rio Goiana. Ovos, embriões livres e juvenis (< 40 mm) foram retirados da cavidade bucal do macho incubador de ambas as espécies. O desenvolvimento dos bagres ariideos foi estudado desde um embrião logo após a neurulação até a formação de um juvenil. Em geral, embriões de C. agassizii possuem sacos vitelínicos mais pesados comparado com C. spixii (0.27g ± 0.01 e 0.22g ± 0.02, respectivamente). As descrições revelam que o aparecimento das vértebras e dos otólitos, bem como a ossificação dos otólitos e do aparelho de Weber ocorre primeiro em embriões de C. agassizii. Antes da eclosão os embriões de ambas as espécies apresentam o esqueleto axial e apendicular bem ossificado. As divergências morfológicas externas são mais visíveis em embriões livres. Embriões livres de C. agassizii possuem olhos maiores em diâmetro e barbilhões maxilares mais curtos quando comparado com C. spixii; e o focinho e a cabeça são mais longos. Embriões livres de C. spixii possuem nadadeiras peitoral, dorsal, pélvica e anal localizadas numa posição mais posterior comparado com C. agassizii. Embriões livres de C. agassizii também possuem vitelos maiores. Durante o período juvenil, o principal caráter morfológico que difere as espécies é o diâmetro do olho e o comprimento do barbilhão maxilar, maiores em C. agassizii. Os embriões crescem lentamente no sentido longitudinal, mas padrões de crescimento acelerado [alométrico positivos (&#946;0>1)] foram observados para a largura da cabeça e o diâmetro do olho. Isto parece estar relacionado com o rápido desenvolvimento dos órgãos sensoriais como os otólitos, o aparelho de 2 Weber, o cristalino, as narinas e os barbilhões. Após a eclosão, embriões livres incubados na cavidade bucal dos machos crescem isometricamente (&#946;0=1). Padrões de crescimento lento [alométrico negativo (&#946;0<1)] foram observados na largura da cabeça e no diâmetro do olho durante o período de saco vitelínico, considerando que os órgãos sensoriais já estão formados. Os ossos da cabeça são bem reconhecidos em embriões livres, que se assemelham com juvenis. O final do período de saco vitelínico é caracterizado por uma mudança direta de embrião livre para juvenil, sem um período larval verdadeiro. O período juvenil é caracterizado por padrões de crescimento próximos ao isométrico em todas as regiões do corpo, sugerindo que os juvenis são altamente desenvolvidos e apresentam a maioria das características de peixes adultos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The improvement of technologies is essential to increase the productivity in aquaculture. One of the bottlenecks in the cultive of native species with regard to larval feeding. The pacamã Lophiosilurus alexandri is an endemic species in São Francisco river basin with high potential for aquaculture and nowadays it is showing vulnerable conservation status. The purpose of this study was to evaluate the post-larval performance of L. alexandri from different diets (Artemia sp. and Panagrellus redivivus), concentrations (C300, C500 and C700) and food frequencies (F1, F3 and F6) in experiments lasting ten days. When the food with better performance is evaluated , the Artemia sp. and Artemia sp. with P. redivivus shows higher survival rates as well as higher weight (F = 371.13, p <0.05), length (F = 79.31; p <0.05) and specific growth rate (TCE) (F = 105.97, p <0.01) than post larvae fed only with P. redivivus and post larval without food supply. The second stage used only Artemia sp. as a food due to the better performance. The survival of post larvae stage was not affected by the gradient and the feed frequency, but the weight (F = 46.63, p <0.001), length (p <0.05; F = 38.398) and TCE (F = 36, 91, p <0.05) showed significant differences, in an increasing manner, with the rise of food gradient. From these results, the best performance of L. Alexandri post larvae were obtained from a daily diet feed with higher gradient (C700). The cultivation of L. alexandri should be encouraged in São Francisco basin. Fish stock reduction due to anthropic actions reinforces the importance of repopulation programs in order to try to restore the natural populations and make this species be one of the main important among the species commercially exploited at São Francisco river basin. / O desenvolvimento de tecnologias é fundamental para aumento da produtividade na aquicultura. Um dos gargalos no cultivo de espécies nativas está na alimentação das larvas. O pacamã Lophiosilurus alexandri é uma espécie endêmica na bacia do rio São Francisco com grande potencial para aquicultura e atualmente apresenta status de conservação vulnerável. O objetivo do presente estudo foi avaliar o desempenho de pós-larvas de L. alexandri a partir de diferentes dietas (Artemia sp. e Panagrellus redivivus), concentrações (C300, C500 e C700) e frequências alimentares (F1, F3 e F6) em experimentos com duração de dez dias. Quando avaliado o alimento com melhor rendimento, Artemia sp. e Artemia sp. com P. redivivus apresentaram maiores taxas de sobrevivência, bem como maiores peso (F=371,13; p<0,05), comprimento (F=79,31; p<0,05) e taxa de crescimento específico (TCE) (F=105.97; p<0,01) do que pós-larvas alimentadas apenas com P. redivivus e pós-larvas sem fornecimento de alimento. A segunda etapa utilizou apenas Artemia sp. como alimento em função do melhor rendimento. A sobrevivência das pós-larvas não foi afetada pela concentração de presas e pela frequência alimentar, porém o peso (F=46,63; p<0,001), comprimento (p<0,05; F=38,398) e TCE (F=36,91; p<0,05) apresentaram diferenças significativas de forma crescente com o aumento da concentração de presas. A partir destes resultados, o melhor desempenho das pós-larvas de L. alexandri foi obtido a partir de uma alimentação diária com maior concentração de presas (C700). O cultivo de L. alexandri deve ser incentivado na bacia hidrográfica do São Francisco. A redução dos seus estoques naturais decorrente de ações antrópicas reforça a importância de programas de repovoamento na tentativa de restaurar as populações naturais e fazer com que volte a figurar dentre as espécies explotadas comercialmente na bacia do rio São Francisco.