Orientador: Hussam El Dine Zaher / Resumo: Apostolepis Apostolepis é o gênero mais diversificado da Tribo Elapomorphini, composto por 40 espécies válidas, sendo 36 brasileiras e quatro que distribuem-se nas Guianas, Colômbia, Peru, Bolívia, Paraguai e Argentina. Apostolepis é reconhecido como um dos grupos taxonomicamente mais problemáticos de Dipsadidae, principalmente por causa de descrições de espécies com informações insuficientes, por vezes baseadas em variações intraespecíficas e em indivíduos anômalos. Mais de 50 táxons nominais são relacionados a Apostolepis, dos quais 21 foram descritos nos últimos 30 anos e 35 baseados apenas no holótipo; vários já sinonimizados a espécies descritas anteriormente. Por causa dos hábitos de vida as espécies do gênero não são abundantemente encontradas, fazendo com que muitas espécies ainda sejam minimamente conhecidas e outras conhecidas apenas pelo holótipo. Combinando todos esses fatores, foram gerados muitos equívocos na identificação das espécies, contribuindo para uma sucessão massiva de controvérsias taxonômicas e resultando no insatisfatório entendimento da evolução, ecologia e história natural das espécies do grupo. Por essas razões este estudo objetivou revisar a taxonomia das espécies atualmente alocadas no gênero, examinando séries de museus nacionais e internacionais, através de visitas, empréstimos e dados enviados pelas instituições. Analisei caracteres merísticos de 1803 espécimes provenientes de 32 coleções científicas na América do Sul, Estados Unidos e Europa... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Apostolepis is the most diverse genus of the Tribe Elapomorphini. It is composed of 40 valid species, being 36 from Brazil and others distributed in the Guianas, Colombia, Peru, Bolivia, Paraguay and Argentina. The genus Apostolepis is recognized as one of the most problematically taxonomic groups of Dipsadidae because original species descriptions with insufficient information, sometimes based on intraspecific variations and anomalous specimens. More than 50 nominal taxa are related to Apostolepis, of which 21 were described in the last 30 years and 35 based only on the holotype; several taxa already synonimized to species described above. Because of life habits of species are not abundantly found, causing that many species are still minimally known and others known only by the holotype. Combining all these factors, many misunderstandings were generated in the identification of the species, contributing to a massive succession of taxonomic controversies and resulting in an unsatisfactory understanding of the evolution, ecology and natural history of the species. For these reasons, this study aimed to review the taxonomy of species currently allocated to the genus, examining series of European, South and North American museums through visits, loans and data sent by institutions. Of 1803 specimens from 32 scientific collections, referring to 50 nominal taxa I analyzed meristic characters, of small part I observed the hemipenian and cranial morphology, of about 817 specimens ob... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Colletotrichum truncatum tem sido amplamente estudado como fitopatógeno da soja. No entanto, diferentes isolados possuem diferentes graus de agressividade, podendo, inclusive, serem encontrados em plantas aparentemente sadias. Assim, primeiramente objetivou-se comparar isolados de C. truncatum obtidos de plantas assintomáticas e sintomáticas de soja, a fim de identificar características que os diferenciassem. Obtiveram-se 17 isolados de plantas assintomáticas e três de plantas doentes. Com os testes de patogenicidade, verificou-se que alguns isolados obtidos de plantas assintomáticas podem ser endofíticos e que outros causaram sintomas na parte aérea, com severidade variável, e afetaram a germinação e a emergência de plântulas obtidas a partir de sementes inoculadas. Na análise concatenada dos genes ITS, GAPDH, HIS3 e do gene ß-tub verificou-se que isolados caracterizados como hipovirulentos e endofíticos foram alocados em um mesmo clado, assim como os mais agressivos também se agruparam. Na análise do marcador molecular IRAP não houve diferenças. Em meio SNA isolados mais agressivos tiveram menores taxas de crescimento, porém, esporulação em maiores quantidades, ao contrário, avirulentos e hipovirulentos. A germinação de conídios dos isolados agressivos foi maior quando comparada à dos isolados endofíticos e hipovirulentos, assim como a porcentagem de conídios formando apressório. Em relação à atividade enzimática in vitro, não foi possível a diferenciação dos isolados com diferentes graus de patogenicidade utilizando-se sistema API-ZYM® e todos os isolados obtidos produziram as enzimas esterase, esterase-lipase, fosfatase ácida e a naftol-AS-BI- fosfohidrolase. Para a atividade de pectina-liase, isolados mais agressivos produziram menos pectina liase que os não agressivos. A partir da identificação dos dois estilos de vida, selecionou-se um isolado endofítico e um patogênico para verificar a capacidade de C. truncatum endofítico ativar o sistema de defesa de plantas de soja e conferir proteção contra a antracnose e mofo branco (Sclerotinia sclerotiorum). Para tanto, plantas de soja foram inoculadas com os isolados endofítico patogênico de C. truncatum, separadamente. Um outro tratamento consistiu da pré-inoculação do endofítico, seguido do patogênico. Avaliou-se a atividade de proteínas relacionadas à patogênese - PR-proteínas (peroxidases - POX e fenilalanina amônia-liase-FAL) e da quantidade de peróxido de hidrogênio (H2O2). Plantas de soja foram pré-inoculadas com o endofítico seguido de inoculação de S. sclerotiorum após cinco dias, sendo avaliada a severidade do mofo branco após 10 dias da inoculação do mesmo. Plantas pré-inoculadas com C. truncatum endofítico e desafiadas com o C. truncatum patogênico tiveram aumento da atividade de POX e da FAL e da quantidade de H2O2. Quando inoculados separadamente, endofítico e patogênico não foram capazes de aumentar a atividade ou quantidade dessas moléculas. Demonstrou-se redução de mais de 88% na severidade do mofo-branco em plantas de soja pré-inoculadas com isolado endofítico. A redução da doença pode ser devido a capacidade dessas plantas em aumentar a resposta de defesa mais rapidamente e em níveis maiores do que quando expostas ao endofítico isoladamente. / Colletotrichum truncatum, the causal agent of anthracnose of soybean: a comparison of isolates obtained from asymptomatic and symptomatic plants Colletotrichum truncatum has been widely studied as soybean pathogen. However, different isolates have different degrees of aggressiveness, and it can even be found in apparently healthy plants. Thus, the first objective was to compare isolates of C. truncatum from asymptomatic and symptomatic soybean plants, in order to identify characteristics that differentiate them. Seventeen asymptomatic plant isolates and three diseased plants were obtained. From the pathogenicity tests, it was verified that some isolates obtained from asymptomatic plants could be endophytic and others caused symptoms in the aerial part, with variable severity, and affected the germination and emergence of seedlings obtained from inoculated seeds. In the concatenated analysis of the genes ITS, GAPDH, HIS3 and ß-tub gene, it was verified that the isolates characterized as hypovirulent and endophytic were allocated in the same clade, as well as the more aggressive were also grouped. In the analysis of the molecular marker IRAP there were no differences. In the SNA (Synthetic - Poor in Nutrient - Agar) medium, the aggressive isolates had the lowest growth rates, however, they had higher sporulation. The endophytic and hypovirulent ones had higher rates of mycelial growth and less sporulation in vitro. The germination of conidia and the percentage of conidia forming appressory of the aggressive isolates was higher when compared to the endophytic and hypovirulent isolates. In relation to the enzymatic activity in vitro, it was not possible to differentiate the isolates with different degrees of pathogenicity using the API-ZYM® system. Furthermore, all the isolates obtained produced the enzymes esterase, esterase-lipase, acid phosphatase and naphthol-AS- BI-phosphohydrolase. For pectin-lyase activity, isolates that are more aggressive produced less lyase pectin than non- aggressive pectin. From the identification of the two lifestyles, an endophytic and pathogenic isolate were selected to verify the ability of C. truncatum to activate the soybean defense system and to protect soybean plants against anthracnose and white mold (Sclerotinia sclerotiorum). For that, soybean plants were inoculated with an endophytic, a C. truncatum pathogenic, and an endophytic followed by the inoculation of the pathogen after 5 days. These plants were evaluated for the activity of proteins related to the pathogenesis - PR-proteins (peroxidases - POX and phenylalanine ammonia-lyase-FAL), the amount of hydrogen peroxide (H2O2) and malondialdehyde (MDA). Soybean plants were pre-inoculated with the endophytic followed by inoculation of S. sclerotiorum after five days, and the severity of the white mold was evaluated after 10 days of inoculation. Plants pre-inoculated with endophytic C. truncatum and challenged with pathogenic C. truncatum had increased POX and FAL activity and the amount of H2O2. When inoculated separately, endophytic and pathogenic were not able to increase the activity or quantity of these molecules. There was a reduction of more than 88% in the severity of white mold in soybean plants preinoculated with endophytic isolate. The reduction of the disease may be due to the ability of these plants to increase the defense response more rapidly and at higher levels than when exposed to the endophyte alone.

The reproductive systems of angiosperms are quite diverse. In the flowers of Meliaceae (Sapindales) we found a wide diversity of these systems, including reports of monoecious, dioecious and polygamous plants. However, the sexual dimorphism of flowers in the family is very subtle, and structurally each flower always has a gynoecium and a developed androecium, even though functionally one or the other may be sterile (pistillodes or staminodes). Consequently, the determination of floral sexuality in the family is often difficult or even inconclusive in many taxa, and the available data often come from the analysis of herbarium material. This lack of detailed information on floral structure, development and function still prevent an accurate identification of floral sexuality in most members of Meliaceae, and also limits a comparison with the data known to other representatives of Sapindales, especially in relation to the structure and development of the carpels and stamens in the families most closely related, which are Rutaceae and Simaroubaceae. Studies on flower development associated with pollination studies and phylogenetic through comparative analysis, provide a better understanding on how these systems behave, and allow a more accurate classification of the sexual system present in particular species, leading to evolutionary data and assisting in clarifying kinship issues. The present dissertation addresses a detailed study of the structure of flowers of two Brazilian taxa (Trichilia claussenii and Guarea macrophylla subsp. tuberculate) belonging to the subfamily Melioideae, with emphasis on the organization and development of their sexual systems. Our study includes analysis of the external morphology, anatomy, vascularization, ontogeny, and histochemical tests of both species. We also analyzed the functional aspects of flowers of T. claussenii, related to floral sexuality, which was evaluated by means of pollination tests, associated to tests of pollen viability, stigmatic receptivity and morphoanatomic and ontogenetic analyzes. Among the main results, floral dimorphism was detected only in T. claussenii, which is likely gynodioecius, and provided with a peculiar sterility of the androecium in the female flower morphotype: pollen grains remain concealed by a secretion from the tapetum. In addition, we promote the discussion of pathways of the evolution of sexual systems within the Meliaceae, as well as of its main flower and fruit morphological characters, through hypotheses evaluated upon the current molecular phylogenetic framework of the family / Os sistemas reprodutivos das angiospermas são bastante diversos. Nas flores de Meliaceae (Sapindales) encontramos uma grande diversidade desses sistemas, sendo relatada a presença de plantas monoicas, dioicas e poligâmicas. No entanto, o dimorfismo sexual das flores nessa família é muito sutil, e estruturalmente cada flor sempre possui um gineceu e um androceu desenvolvidos, mesmo que funcionalmente um ou outro seja estéril (pistilódio ou estaminódio). Consequentemente, a determinação da sexualidade floral na família é muitas vezes difícil ou até mesmo inconclusiva em muitos táxons, sendo a maioria dos dados disponíveis provenientes da análise de material herborizado. A carência de informações mais detalhadas sobre estrutura, desenvolvimento e função, ainda limita muito uma acurada identificação da sexualidade floral em Meliaceae, assim como impede uma comparação com os dados conhecidos sobre outros representantes de Sapindales, especialmente em relação à estrutura e desenvolvimento do androceu e gineceu, nas famílias mais proximamente aparentadas a ela, que são Rutaceae e Simaroubaceae. Estudos sobre o desenvolvimento floral, associados a estudos de polinização e filogenia, por meio de análises comparativas, propiciam melhor compreensão de como esses sistemas se comportam, permitindo uma classificação mais acurada do sistema sexual presente numa determinada espécie, além de fornecer dados evolutivos importantes e auxiliar no esclarecimento de questões de parentesco. Neste contexto, a presente dissertação aborda um estudo detalhado da estrutura das flores de dois táxons brasileiros (Trichilia claussenii e Guarea macrophylla subsp. tuberculata) pertencentes à subfamília Melioideae, com ênfase na organização e desenvolvimento do sistema sexual. Tal estudo é composto por análise da morfologia externa, anatomia, vascularização, ontogenia e testes histoquímicos em ambos táxons. Também foram feitas análises dos aspectos funcionais das flores de Trichilia claussenii, relativos à sexualidade floral, por meio de testes de polinização, testes de viabilidade polínica, receptividade estigmática e análises morfoanatômicas e ontogenéticas. Entre os principais resultados, destacamos o dimorfismo floral detectado apenas em T. claussenii, espécie ginodioica na qual a esterilidade do androceu no morfotipo floral feminino é alcançada pela impossibilidade de liberação dos grãos de pólen, retidos por uma secreção do tapete. Além disso, promovemos a discussão de transições evolutivas do sistema sexual na história da família, bem como de outros caracteres morfológicos florais e de fruto, por meio de avaliação de hipóteses estruturadas sobre a filogenia molecular atual da família

O gênero Pagurus é um táxon heterogêneo de ermitões, com ampla distribuição mundial, descrito há mais de duzentos anos. A sistemática do grupo é complexa com uma longa história de rearranjos taxonômicos. A classificação conta com a inclusão de numerosas novas espécies e separação de algumas inicialmente contidas no táxon estabelecendo-se novos gêneros. Devido à extensa distribuição das espécies que compõem o táxon, foi necessário restringir o objetivo deste estudo. Assim foi avaliado o status taxonômico das espécies que ocorrem nas costas Pacífica e Atlântica da América do Sul, por meio da combinação de análises morfológicas e moleculares das espécies, utilizando dois marcadores genéticos (16S rDNA e Histona 3). As análises taxonômicas mostraram uma alta variabilidade morfológica nas 22 espécies examinadas. As espécies se encaixam perfeitamente em quatro dos onze grupos preestabelecidos dentro de Pagurus. Além disso, foram fornecidos os caracteres morfológicos que definem um desses grupos. Adicionalmente foi incluída uma chave para ajudar na identificação de todas as espécies. As análises independentes dos dados moleculares mostraram resultados contrastantes. O gene mitocondrial foi mais variável e portanto mais informativo, proporcionando uma hipótese mais clara das relações internas entre os membros de Pagurus. Assim, as topologias moleculares resultantes, concordaram em vários aspectos com o reportado nos dados morfológicos das espécies. De modo que, as semelhanças morfológicas foram refletidas na formação dos nós internos. Assim, as análises do gene 16S e H3 mostraram-se concordante com a morfologia, refletindo-se na formação de alguns dos grupos previamente propostos. Como ponto importante, ressalta-se a separação das espécies que compõe o grupo provenzanoi como um táxon diferenciado dentro de Pagurus. Ao mesmo tempo, as análises com o gene H3 mostraram a espécie Propagurus gaudichaudii inserida dentro de Pagurus, questionando a validade taxonômica de Propagurus. Como só foi incluída uma das cinco espécies do gênero, é claramente necessário a inclusão de outras espécies contidas neste táxon, bem como alguns outros genes uma revisão das espécies contidas neste táxon, junto com análises de outros genes, a fim de resolver definitivamente o status taxonômico de Propagurus. / The genus Pagurus is a heterogeneous taxon of hermit crabs, with worldwide distribution which was described more than two hundred years ago. Systematics of the group is complex and with a long history of taxonomic rearrangements. Thus current classification accounts for inclusion of many new species and splitting-off of some of the original species in order to establish new genera. Because of the extensive distribution of the species that conform this taxon it was necessary to restrict the aim of this study. Thus I evaluated the taxonomic status of the species found in the Pacific and Atlantic coasts of South America using a combination of both morphologic and molecular analyses (16S rDNA and Histona 3). The taxonomic analysis showed high morphological variation among all the 21 examined species. The analyzed species seemed to perfectly fit four out of the eleven morphologically pre-established groups of Pagurus. Furthermore I provide morphological characters that define one of these groups. Additionally, I included a key to aid in the identification of all the target species. Independent analysis of the molecular data showed contrasting results. The mitochondrial gene was the most variable and thus the most informative, providing a clearer hypothesis of the internal relationships among members of Pagurus. Therefore, both 16S and H3 analyses were in general agreement with the morphology. Thus, the resultant molecularly based topologies reflected some of the groups previously proposed. It is important to point out that all the included species belonging to the provenzanoi group were clustered together separated from other clades within Pagurus. At the same time, the analysis with the gen H3 showed Propagurus gaudichaudii clustered within Pagurus, thus questioning the taxonomic validity of Propagurus. As I only included one of the five species of the genus, it is obviously necessary to include other the species contained in this taxon, as well as some other genes in order to definitely solve the taxonomic status of Propagurus.

A crescente adoção do paradigma experimental na pesquisa em Engenharia de Software visa a obtenção de evidências experimentais sobre as tecnologias propostas para garantir sua correta avaliação e para a construção de um corpo de conhecimento sólido da disciplina. Uma das abordagens de pesquisa experimental é a revisão sistemática, um método rigoroso, planejado e auditável para a realização da coleta e análise crítica de dados experimentais disponíveis sobre um determinado tema de pesquisa. Apesar de produzir resultados confiáveis, a condução de uma revisão sistemática pode ser trabalhosa e muitas vezes demorada, principalmente quando existe um grande volume de estudos a serem considerados, selecionados e avaliados. Uma solução encontrada na literatura é a utilização de ferramentas de Mineração Visual de Textos (VTM) como a Projection Explorer (PEx) para apoiar a fase de seleção e análise de estudos primários no processo de revisão sistemática. Neste trabalho foi realizada uma reengenharia de software na ferramenta PEx com dois objetivos principais: apoiar, utilizando VTM, a fase de seleção e análise de estudos primários no processo de revisão sistemática e implementar novos requisitos não-funcionais relativos à melhoria da manutenibilidade e escalabilidade da ferramenta. Como resultado foi construída uma plataforma modular para a instanciação de ferramentas de visualização e, a partir da mesma, uma ferramenta de revisão sistemática apoiada por VTM. Os resultados de um estudo de caso executado com a ferramenta mostraram que a abordagem de aplicação de técnicas VTM usada nesse contexto é viável e promissora, melhorando tanto a performance quanto a efetividade da seleção / The increasing adoption of the experimental paradigm in Software Engineering research aims at obtaining experimental evidence of the proposed technologies to ensure their proper evaluation and to build a solid body of knowledge for the discipline. One approach of experimental research is the systematic review, a rigorous, auditable and planned method to carry out the collection and analysis of experimental data available on a particular research topic. Despite producing reliable results, conducting a systematic review can be a cumbersome and often lengthy process, especially when a large volume of studies is to be considered, selected and evaluated. One solution found in the literature is the use of Visual Text Mining (VTM) tools such as the Projection Explorer (PEx) to support the selection and analysis of primary studies in the systematic review process. In this work a software re-engineering was performed on PEx with two main goals: to support, using VTM, the stage of selection and analysis of primary studies in the systematic review process and to implement new non-functional requirements related to improving the maintainability and scalability of the tool. The results were the building of a modular platform for instantiating visualization tools and, from it, the instantiation of a systematic review tool supported by VTM. The results of a case study carried out with the tool showed that the VTM approach used in this context is feasible and promising, improving both performance and the effectiveness of selection

A família Psittacidae possui 332 espécies de papagaios, periquitos e afins, e os táxons Neotropicais formam um grupo monofilético (tribo Arini), dentro desta tribo está o gênero Aratinga. A sistemática deste gênero é mal resolvida, com poucos estudos morfológicos e algumas filogenias moleculares que apontam que não seja monofilético. Porém, é preciso destacar que esses estudos não amostraram uma quantidade representativa de espécies do gênero, o que deixa essas relações incertas. Para melhor compreender a história evolutiva do gênero Aratinga, realizamos uma análise filogenética com 21 das 22 espécies do gênero, o táxon monotípico Nandayus nenday que é proximamente relacionado a algumas espécies de Aratinga e representantes de outros gêneros da tribo Arini. Foram sequenciados cinco genes mitocondriais (12S, 16S, citocromo b, NADH2, COIII) e um nuclear (RAG-1). As filogenias obtidas por máxima verossimilhança e análise Bayesiana foram congruentes e indicam a ausência de monofilia do gênero Aratinga. A maioria das espécies do gênero foi posicionada em três clados com alto suporte, mas que não se apresentam agrupados em um clado monofilético. Estes três clados são congruentes com grupos previamente propostos com base em caracteres morfológicos. Nandayus nenday está dentro de um destes clados, que é grupo irmão de um clado que contém outros quatro gêneros da tribo Arini. A única espécie que não foi incluída em nenhum destes clados é Aratinga acuticaudata, que aparentemente é mais proximamente relacionada aos gêneros Diopsittaca e Guarouba. A maioria dos eventos de divergência das espécies do gênero Aratinga nesses diferentes clados parece ter ocorrido nos últimos 5 milhões de anos (Ma.). Enquanto as estimativas de datas de divergências entre os principais clados sugerem que elas ocorreram durante o Mioceno inicial. O padrão biogeográfico da diversificação dos clados de Aratinga foi complexo, possivelmente relacionado com o soerguimento dos Andes, com múltiplas colonizações da América Central antes e depois do fechamento do Istmo do Panamá e com ciclos glaciais do Pleistoceno. Esses resultados refutam a monofilia do gênero e uma revisão taxonômica do táxon parece ser necessária. / Family Psittacidae includes 332 species of parrots and all Neotropical taxa form a monophyletic group (tribe Arini), among those, is the parakeet genus Aratinga. This genus has an unresolved systematics, with few morphological studies and some molecular phylogenies suggest that it is not monophyletic. However, these phylogenies did not include a representative sample of species of the genus. To better understand the evolutionary history of genus Aratinga, we conducted a phylogenetic analysis that included 21 of 22 species of the genus, the monospecific taxon Nadayus nenday that is closely related to some Aratinga species, plus various taxa from tribe Arini. We sequenced five mitochondrial (12S, 16S, cytochrome b, NADH2, COIII) and one nuclear (RAG-1) genes. The phylogenies were reconstructed based on maximum likelihood analysis and Bayesian inference. Relaxed molecular clock estimates were conducted under a Bayesian analysis for inferring the divergence times of the phylogeny and to study the biogeographic history of these species. The phylogenies recovered by both methods were highly congruent and support the absence of monophyly for genus Aratinga. The majority of the species from the genus Aratinga was placed in three highly supported clades that did not group in a monophyletic clade. These three clades match previously suggested groups based on morphological characters. Nandayus nenday was included in one of these clades, that is closely related to a clade that contains four other Arini genera. The only species that was not included in any of these clades was Aratinga acuticaudata, that seems to be more closely related to the genera Diopsittaca and Guarouba with high support values. Most of the speciation within the Aratinga clades may have occurred during the last 5 Mya., but the divergence times between these clades seems to have occurred during the early Miocene. The biogeograhic pattern of the diversification of the Aratinga clades was complex, possibly related to the history of the Andes, multiple colonization of Central America before and after the closure of the Panama Isthmus and also Pleistocene glacial cycles. These results further refute the monophyly of genus Aratinga and a taxonomical revision may be necessary for the taxon.

Heteroponerinae Bolton (2003) compreende três gêneros de formigas: Acanthoponera Mayr, Aulacopone Arnol\'di e Heteroponera Mayr. Acanthoponera é exclusivamente Neotropical, enquanto Heteroponera mostra uma distribuição disjunta nas Américas e Oceania. O gênero Aulacopone, de posição incerta na subfamília, é conhecido por uma única espécie representada por um par de rainhas coletadas por volta da década de 1930 em duas localidades no sudoeste da Ásia (Azerbaijão). O presente estudo representa a primeira revisão taxonômica global de Heteroponerinae em nível específico e a primeira tentativa de se analisar as relações filogenéticas internas da subfamília com base em caracteres morfológicos externos de todos os táxons nela incluídos. O estudo dos terminais utilizados na análise filogenética resultou em uma matriz com 101 caracteres, sendo 50 destes empregados pela primeira vez em uma análise cladística envolvendo formigas. A análise filogenética demonstra a monofilia de Heteroponerinae, com pelo menos quatro sinapomorfias sustentando esta hipótese. Os gêneros Acanthoponera e Heteroponera também são monofiléticos em todas as topologias aqui encontradas. As relações internas apontam para uma posição basal do gênero paleártico Aulacopone, que figura como grupo-irmão do clado Acanthoponera + Heteroponera. Ainda assim, devido à falta de caracteres que ofereçam maior suporte à inclusão de Aulacopone em Heteroponerinae, este gênero é mantido como incertae sedis na subfamília. A relativa falta de resolução nas relações internas em Acanthoponera e nos ramos mais apicais de Heteroponera não impede o reconhecimento de algumas linhagens como evolutivamente independentes. A presença destas linhagens em pelo menos duas regiões biogeográficas e a proximidade filogenética encontrada entre grupos neotropicais e australianos revelam um interessante cenário biogeográfico a ser investigado. Após o exame de 33 dos 36 espécimes-tipo designados para as espécies e subespécies de Heteroponerinae, seis espécies são reconhecidas para o gênero Acanthoponera, das quais duas são descritas como novas. Heteroponera apresenta 21 espécies (seis delas descritas aqui pela primeira vez), sete das quais restritas à Região Australiana (três novas) e 14 exclusivamente neotropicais (três novas). Heteroponera flava Kempf é sinonimizada sob H. panamensis (Forel) e H. georgesi Perrault passa a ser sinônimo júnior de H. microps Borgmeier. Indivíduos de castas e sexos ainda não registrados (incluindo machos, gines e operárias) são aqui descritos pela primeira vez para diferentes espécies de Heteroponerinae. Novos registros de localidades expandem significativamente a distribuição conhecida para a maior parte das espécies. Observações de campo aliadas a dados de rótulo de espécimes de museus fornecem importantes informações adicionais acerca da história natural do grupo. Larvas de Heteroponerinae são predominantemente predadoras, alimentando-se de pequenos artrópodes coletados pelas operárias. Ocasionalmente, adultos podem se alimentar dos líquidos (hemolinfa) resultantes das feridas provocadas no tegumento das presas caçadas por operárias e de exudatos vegetais no caso de espécies arborícolas. Os ninhos de Heteroponera são encontrados no solo ou na vegetação e podem abrigar colônias com algumas dezenas a poucas centenas de indivíduos, sendo que as operárias forrageiam preferencialmente no solo. Acanthoponera nidifica e forrageia exclusivamente em árvores. Com relação à estratégia reprodutiva, algumas espécies de Heteroponera podem apresentar gines ergatóides dividindo a função reprodutiva com as gines aladas na mesma colônia, enquanto em outras espécies as gines aladas foram completamente substituídas por ergatóides. Como uma próxima etapa para a compreensão da história evolutiva deste grupo sugere-se uma análise das relações internas dos gêneros através de ferramentas moleculares e um estudo dos padrões biogeográficos de Heteroponerinae. / Heteroponerinae Bolton (2003) comprises three ant genera: Acanthoponera Mayr, Aulacopone Arnol\'di and Heteroponera Mayr. Acanthoponera is exclusively Neotropical, while Heteroponera shows a disjunct distribution in the Americas and Australia. The position of Aulacopone within the subfamily is uncertain as it is known by a single species represented by two gynes collected around the 1930s in two localities in Southeast Asia (Azerbaijan). This study represents the first comprehensive taxonomic revision of Heteroponerinae at specific level and the first attempt to analyze the internal phylogenetic relationships of the subfamily based on the external morphology of all heteroponerine taxa. The study of the species used in the phylogenetic analysis resulted in a matrix with 101 characters, of which 50 are used for the first time in a cladistic analysis involving ants. The phylogenetic analysis demonstrates the monophyly of Heteroponerinae with at least four synapomorphies supporting this hypothesis. The genera Acanthoponera and Heteroponera are also monophyletic in all topologies found here. The internal relationships indicate a basal position of the paleartic genus Aulacopone, which appears as sister group to the clade Acanthoponera + Heteroponera. Due to the lack of characters to provide robust support to the inclusion of Aulacopone within Heteroponerinae, this genus is considered as incertae sedis in the subfamily. The relative low resolution of the internal relationships in Acanthoponera and in the apical branches of Heteroponera does not prevent the recognition of evolutionarily independent lineages. The presence of these lineages in at least two biogeographic regions and the phylogenetic proximity found between Neotropical and Australian groups reveal an interesting biogeographic scenario to be investigated. After examining 33 out of the 36 type specimens designated for the species and subspecies of Heteroponerinae, six species are recognized in the genus Acanthoponera, two of which are here described as new. Heteroponera comprises 21 species, of which six are described as new; seven are restricted to the Australian Region (three newly described) and 14 are exclusively Neotropical (also three newly described). Heteroponera flava Kempf is synonymized under H. panamensis (Forel) and H. georgesi Perrault becomes a junior synonym of H. microps Borgmeier. Individuals yet not registered of castes and sexes (including males, gynes and workers) are here described for the first time for different species of Heteroponerinae. New records greatly expand the known distribution for most species. Field observations allied to label data from museum specimens provide important additional information about the natural history of the group. Larvae of Heteroponerinae are predominantly predators, and workers are occasionally observed feeding on plant exudates. Nests can support colonies with a some dozens to a few hundred of individuals. Heteroponera can nest in soil and vegetation, but preferably forage in the soil, while Acanthoponera is exclusively arboreal. With respect to the reproductive strategy, some species of Heteroponera may present ergatoid gynes sharing the reproductive function with dealate gynes, while in other species the winged gynes were completely replaced by ergatoids. As a next step to understand the evolutionary history of this group it is suggested an analysis of the internal relations within the heteroponerine genera using molecular tools and a study on the subfamily biogeographic patterns.

Membros do gênero Rhinebothroides são parasitas exclusivos de potamotrigonídeos, elasmobrânquios de água doce endêmicos da região Neotropical. Atualmente, seis espécies são reconhecidas para este gênero dentre as oito espécies nominais disponíveis. A taxonomia de Rhinebothroides é convoluta, pois a maioria de suas espécies são diagnosticadas por caracteres morfométricos e merísticos definidos por estudos que desconsideram a variabilidade intraespecífica destas linhagens. A ampla distribuição de algumas espécies, bem como seus padrões generalistas de especificidade padrão este discrepante em relação à tetrafilídeos marinhos sugere a existência de complexos de espécies que requerem melhor refinamento taxonômico. Este estudo visa refinar a taxonomia de um destes complexos Rhinebothroides freitasi, no qual estão inseridas outras 3 especies nominais (R. campbelli, R. circularisi, R. venezuelensis) cujas circunscrições são ambíguas. Neste estudo, partiuse da premissa de que a conjunção de dados moleculares e morfológicos pode elucidar a taxonomia deste complexo. Com este objetivo, dados moleculares para os genes 28S, ITS1 e COI foram compilados para 57 haplótipos de Rhinebothroides representando todas as espécies válidas para o gênero e a ampla distribuição biogeográfica no gênero nas bacias hidrográficas brasileiras. A otimização direta das sequências nucleotídicas destes haplótipos concatenadas com outros 26 terminais que incluem linhagens de tetrafilídeos marinhos e de água doce, resultou em cinco clados de Rhinebothroides que possuem morfologia congruente com a série tipo de cinco espécies nominais. Desta forma, este estudo reconhece cinco espécies de Rhinebothroides como válidas: R. glandularis, R. freitasi, R. moralarai, R. scorzai e R. venezuelensis. Dentre as espécies do complexo R. freitasi, os dados morfológicos compilados para ~ 400 indivíduos permitiu delimitar os níveis de variabilidade morfológica de R. freitasi e R. venezuelensis. A representatividade biogeográfica e de hospedeiros contemplada neste estudo revela que, ao contrário das linhagens de tetrafilídeos marinhos, membros de Rhinebothroides possuem baixa especificidade aos seus hospedeiros. / Members of Rhinebothroides are parasites of the Neotropical freshwater stingrays of the family Potamotrygonidae. To date, six species are recognized for the genus within which there are eight nominal species available. The taxonomy of Rhinebothroides is confusing, since most of its species are currently diagnosed by morphometric and meristic characters that have been defined by studies that disregarded the intraspecific variability of its lineages. The widespread distribution of some species, as well as their relaxed host specificity pattern which differs from what has been documented for marine tetraphyllideans suggests the existence of species complexes that require taxonomic refinement. This study aims at refining the taxonomy of one of these complexes Rhinebothroides freitasi, in which are included other three nominal species (R. campbelli, R. circularisi, R. venezuelensis) circumscribed ambiguously. In this study, it has been assumed that the combination of molecular and morphological data can shed some light on the taxonomic status of this complex. Within this framework, molecular data were compiled for 28S, ITS1, and COI for 57 haplotypes of Rhinebothroides representing all currently valid species within the genus and their biogeographical distribution along the major Brazilian river basins. The direct optimization of nucleotide sequences from these haplotypes, simultaneously analised with 26 terminals which included marine and freshwater lineages of tetraphyllideans, generated a phylogenetic hypothesis that recognized five major clades within Rhinebothroides. Each of these clades are morphologically congruent with the type series of five nominal species. Therefore, this study recognizes five valid species within Rhinebothroides: R. glandularis, R. freitasi, R. moralarai, R. scorzai, and R. venezuelensis. Within the R. freitasi complex, the compiled morphological data for ~ 400 specimens provided a robust assessment of intraspecific variability for R. freitasi and R. venezuelensis. The biogeographic and host extensive sampling available for this study reveals that members of Rhinebothroides show low host specificity, as opposed to the marine tetraphyllidean lineages.

Os Bombyliidae constituem uma das maiores famílias de Diptera, com mais de 5.000 espécies conhecidas em todo mundo, sendo o grupo de moscas com maior representatividade nas regiões desérticas da Terra, atualmente divididos em 17 subfamílias e 19 tribos. A subfamília Phthiriinae inclui duas tribos, 12 gêneros e 134 espécies válidas presentes em todas as regiões biogeográficas, são caracterizadas por serem moscas pequenas, variando de 3 mm a 12 mm de comprimento, com um acentuado dimorfismo sexual, pela presença de prolongamento dorsal no flagelo e presença de saco basal localizado na base do bulbo espermático na espermateca. Esta tese tem como objetivo central contribuir para a compreensão do padrão evolutivo em Bombyliidae por meio da realização de análise filogenética da subfamília Phthiriinae utilizando caracteres morfológicos. De modo específico, esta pesquisa realiza um estudo comparativo da morfologia externa e interna de Phthiriinae, testa a monofilia da subfamília, das tribos e dos gêneros incluídos, propõe uma nova classificação para a subfamília e delimita as espécies que apresentam dimorfismo sexual com base em ferramentas morfológicas e moleculares (DNA Barcoding). Foram estudados espécimes de todos os gêneros de Phthiriinae, totalizando 937 espécimes pertencentes a 74 espécies, das quais sete representam o grupo externo e 67 o grupo interno. A análise cladística baseada em 216 caracteres morfológicos, recupera a monofilia de Phthiriinae, com a inclusão do gênero Elektrophthiria + Nel, 2006 em uma nova subfamília aqui proposta, Elektrophthiriinae + subfam. nov., uma vez que este aparece fora do clado. Com essa alteração, a tribo Phthriini também passa a ser considerada monofilética. A maioria dos gêneros são recuperados como monofiléticos, no entanto Phthiria Meigen,1820, Poecilognathus Jaennicke, 1867, Relictiphthiria Evenhuis, 1986 e Tmemophlebia Evenhuis, 1986, com suas atuais composições, mostraram-se parafiléticos. Para recuperar a monofilia de Phthiria, um novo gênero é eregido para reunir as espécies Afrotropicais. Com relação ao gênero Poecilognathus, sua monofilia só pode ser recuperada após a remoção de Po. philippianus Rondani, 1863 e Po. xanthogaster Hall, 1976, que passam a compor dois novos gêneros monotípicos, pertencentes a Phthiriini e Poecilognathini, respectivamente, e, desse modo, a monofilia da tribo Poecilognathini também é recuperada. Além disso, Tmemophlebia é considerado sinônimo junior de Relictiphthiria. Esta tese propõe pela primeira vez a utilização do DNA Barcoding para a associação de machos e fêmeas de uma mesma espécie de Bombyliidae. Esse estudo possibilita a associação de machos e fêmeas pertencentes a 12 diferentes espécies sexualmente dimórficas, garantindo sua inclusão na análise cladística. / The Bombyliidae constitutes one of the largest family of Diptera, with more than 5.000 species known worldwide, being the group of flies with the largest representativeness in desertic regions of Earth, currently divided into 17 subfamilies and 19 tribes. The subfamily Phthiriinae comprises, two tribes, 12 genera and 134 valid species present in all biogeographic regions, are characterized by being small flies, varying from 3 mm to 12 mm, with accentuated sexual dimorphism, for the presence of dorsal prong on flagellum and presence of basal sac on spermathecae This thesis has the main goal to contribute for comprehension of the evolutionary pattern in Bombyliidae, performing a phylogenetic analysis of Phthiriinae based on morphological characters. Specifically, this research aims to realize a comparative study of external morphology of Phthiriinae, test the monophyly of the subfamily, tribes and included genera, propose a new classification for the subfamily and also delimit the species with sexual dimorphism based on molecular and morphological data (DNA Barcoding). Were studied specimens of all Phthriiinae genera, in a total of 937 specimens, belonging of 74 species, of which seven represents the outgroup and 67 the ingroup. The cladist analysis based in 216 morphological characters, recover the monophily of Phthirrinae, with the inclusion of the genus Elektrophthiria + Nel, 2006 in a new subfamily, Elektrophthiriinae + subfam. nov., once was positioned outside the group. With this change, Phthiriini tribe also becames monophyletic. Most genera are recovered as monophyletic, however, Phthiria Meigen,1820, Poecilognathus Jaennicke, 1867, Relictiphthiria Evenhuis, 1986 and Tmemophlebia Evenhuis, 1986, with the current composition, were shown to be paraphyletic. To recover the monophily of Phthiria, a new genus is erected to gather the Afrotropical species. Concerning the Poecilognathus genus, its monophyly can only be recovered with the withdrawal Po. philippianus Rondani, 1863 and Po. xanthogaster Hall, 1976, which begins to compose two new monotipic genera, belonging to Phthiriini and Poecilognathini, respectively, thus the monophily of Poecilognathini tribe is also recovered. Therefore, it is proposed Tmemophlebia as a junior synonym of Relictiphthiria. This thesis proposed for the first time the use of DNA Barcoding for the association of males and females of the same species of Bombyliidae. This study allows the association of males and females belonging to 12 different sexually dimorphic species, ensuring their inclusion in the cladistic analysis.

A pesquisa consiste em um esforço de exposição, análise e interpretação de algumas questões teórico-metodológicas referentes à natureza da ciência geográfica presentes na obra do geógrafo estadunidense Richard Hartshorne (1899-1992). O recorte de análise escolhido pretende, a partir da definição do propósito da Geografia formulada pelo autor, compreender suas reflexões a respeito da relação entre os enfoques sistemático e regional na disciplina e pensar seu papel na história do pensamento geográfico do século XX, buscando evidenciar a operação de determinados mecanismos constitutivos do campo científico e de certas posturas filosóficas em sua obra. Hartshorne deixou um extenso legado para a Geografia em importantes obras e artigos publicados, sobretudo, entre as décadas de 1930 e 1960. Dentre essas contribuições, as obras The Nature of Geography (1939) e Perspective on The Nature of Geography (1959) estão entre as mais importantes peças da extensa produção intelectual do autor. Essas duas obras, conjuntamente aos textos de alguns comentadores e críticos, constituem o material fundamental da nossa análise. / The research consists in an effort to display, analysis and interpretation of some theoretical and methodological issues concerning the nature of geographical science in the works of American geographer Richard Hartshorne (1899-1992). The chosen analysis clipping want, from the definition of the purpose of Geography formulated by the author, understand his reflections on the relationship between systematic and regional approaches in the discipline and think his role in the history of geographical thought of the twentieth century in order to enhance the operation of certain constituent mechanisms of the scientific field and certain philosophical positions in his work. Hartshorne left an extensive legacy for Geography in important works and published articles, especially between the 1930s and 1960. Among these contributions, the works The Nature of Geography (1939) and Perspective on The Nature of Geography (1959) are among the most important parts of the extensive intellectual production of the author. These two works, together to the texts of some commentators and critics, are the fundamental material of our analysis.