Cette étude a eu comme but principal de définir le profil des pratiquants de Gymnastique Artistique des deux sexes et pour cela nous avons analysé les mesures somatiques, la composition corporelle, le développement tubérale, la densité minérale des os, la teneur minérale des os et l’ingestion des aliments. Pour une meilleure perception des variables des gymnastes, au long de quatre ans nous avons fait la comparaison avec un groupe de contrôle. Ainsi, l’échantillon a été composé par des sujets des deux sexes, âgés de six à douze ans d’abord, et totalisant une population de 280 sujets. L’étude a été longitudinale et les variables suivantes ont été analysées: taille, hauteur assise, longueur des membres inférieurs, taille des parents, âge des premières règles des mères, poids corporel, index de la masse corporelle, pourcentage de matière grasse corporelle, masse exempte de graisse, développement tubérale, densité minérale des os, segmentaire et totale, contenu minéral total des os et ingestion des aliments suivants: calcium, protéines, phosphore et fer. La taille et la stature assise ont été mesurées par un stadiomètre portable. Pour la collecte des données de la taille des parents et l’âge des premières règles des mères, on a utilisé un questionnaire padron. Le poids corporel a été obtenu à l’aide d’une balance Filizola, avec une précision d’environ 100 grammes. Pour identifier le développement tubérale nous avons utilisé la classification de Tanner. L’examen densitométrique des os a été effectué par le système Dual- Energy X-ray Absorptiometry, dans le dispositif LUNAR DPX IQ#5610, afin d’établir, avec rigueur la densité minérale des os des membres supérieurs, des membres inférieurs, pelviennes, du tronc, de la colonne vertébrale, des côtes, de la tête et du corps entier, le contenu minéral total des os, la masse exempte de matière grasse et le pourcentage de matière grasse corporelle. Enfin, pour établir la quantité absorbée de calcium, protéines phosphore et fer, on a utilisé un enregistrement alimentaire pendant 7 jours. Le traitement statistique des données a été réalisé à l’aide d’une analyse de variation (ANOVA) de comparaisons multiples de Tukey, test T de Student , corrélation de Pearson et test qui carré. Ensuite, nous avons réalisé l’analyse de variation des mesures répétées. Le programme statistique utilisé fut le SPSS for Windows (‘version 11.0) et le niveau de signification fut de 5%. Les résultats ont révélé que la petite taille était déjà propre des gymnastes, avant même qu’ils ne s’initient au sport de compétition. Cependant, leur croissance fut atténuée en raison de la lenteur de croissance des membres inférieurs par rapport aux autres parties du corps. Les gymnastes des deux sexes ont présenté une prédisposition génétique à avoir une petite taille et une puberté tardive. Le sport qu’ils pratiquaient n’a donc exercé aucune influence sur ces variations. Ayant pour base les résultats présentés par cette étude, nous pouvons affirmer que la gymnastique artistique tout en étant un sport d’impact, dû au stress mécanique, permet un excellent remoulage des os, même dans les cas où on a observé une ingestion insuffisante de calcium. / Este estudo teve como objectivo principal investigar os praticantes de Ginástica Artística de ambos os géneros e para isso analisamos as medidas somáticas, a composição corporal, o desenvolvimento puberal, a densidade mineral óssea, o conteúdo mineral ósseo e a ingestão de nutrientes. Para melhor percepção das variáveis dos ginastas, ao longo de 4 anos, fizemos a comparação com um grupo controlo. Assim, a amostra foi composta por sujeitos de ambos os géneros numa faixa etária inicial dos 6 aos 12 anos e totalizando uma população de 280 sujeitos. O estudo foi longitudinal e analisaram-se as seguintes variáveis: estatura, altura sentada, comprimento dos membros inferiores, estatura dos pais, idade de menarca das mães, peso corporal, índice de massa corporal, percentual de gordura corporal, massa isenta de gordura, desenvolvimento puberal, densidade mineral óssea dos segmentos corporais e total, conteúdo mineral ósseo total e ingestão dos seguintes nutrientes: cálcio, proteínas, fósforo e ferro. A estatura e altura sentada foram medidas com um estadiómetro portátil. Para a colecta de dados da estatura dos pais e idade de menarca das mães foi utilizado um questionário padronizado. O peso corporal foi obtido através de uma balança Filizola, com precisão de 100 gramas. Para a identificação do desenvolvimento puberal utilizamos a classificação de Tanner. O exame de densitometria óssea foi efectuado através do sistema Dual-Energy X-ray Absorptiometry, no aparelho LUNAR DPX IQ#5610, a fim de estabelecer com rigor a densidade mineral óssea dos segmentos corporais (membros superiores, membros inferiores, pélvis, tronco, coluna vertebral, costelas, cabeça e corpo total) o conteúdo mineral ósseo total, a massa isenta de gordura e o percentual de gordura corporal. Por fim, para quantificar os nutrientes cálcio, proteínas, fósforo e ferro, foi utilizado um registo alimentar de sete dias. O tratamento estatístico dos dados foi realizado através do recurso a uma análise de variância (ANOVA) comparações múltiplas de Tukey, teste t de Student, correlação de Pearson e teste qui-quadrado. Posteriormente realizamos a análise de variância de medidas repetidas. O programa estatístico utilizado foi o SPSS for Windows (versão 11.0) e o nível de significância adoptado foi de 5%. Os resultados revelaram que a baixa estatura já era característica dos ginastas em ambos os géneros mesmo antes de se iniciarem no desporto de competição, sendo que o seu crescimento em estatura foi atenuado devido a uma menor velocidade de crescimento do comprimento dos membros inferiores em relação aos outros segmentos corporais. Os ginastas de ambos os géneros mostraram predisposição genética para terem baixa estatura e maturação tardia, e que a modalidade desportiva Ginástica Artística não exerceu influência nestas variáveis. Com base nos resultados apresentados nesta investigação podemos afirmar que, sendo a Ginástica Artística um desporto de impacto, através do stress mecânico, proporcionou uma óptima remodelação óssea, mesmo nos casos em que se observou uma insuficiente ingestão de cálcio / The main objective of this study was to performance research on people who practice artistic gymnastics, both male and female. In order to do so we analyze the somatic measures, body composition, pubertal development, bone mineral density, bone mineral content and nutrient intake. For a better perception of the gymnasts’ variables over 4 years, we compared them with a control group. The samples were composed of subjects of both sexes, in an initial age range from 6 to12 years and totalizing a population of 280 subjects. The study was longitudinal and analyzed the following variables: stature, seated height, length of lower limbs, parents’ stature, mothers’ age at menarche, body weight, body mass index, percentage of body fat, mass without fat, pubertal development, bone mineral density of the body and total segments, and intake of the following nutrients: calcium, proteins, phosphorus and iron. The stature and seated height were measured using a portable stadiometer. A standardized questionnaire was used to collect data concerning the stature of the parents and mothers’ age at menarche. The body weight was obtained using a Filizola balance, with a 100- gram precision. We used the Tanner classification to identify pubertal development. The bone densitometry exam was carried out using the Dual- Energy X-ray Absorptiometry system in the following apparatus: LUNAR DPX IQ#5610, to measure strictly the bone mineral density of the following segments of the body: upper limbs, lower limbs, pelvis, torso, spine, ribs, head and total body, total bone mineral content, mass without fat and percentage of body fat. Finally, to quantify the nutrient calcium, proteins, phosphorus and iron, a sevenday food record was used. The statistical treatment of the data was performance using an analysis of variance (ANOVA) multiple comparisons of Tukey, Student t test. Pearson correlation and chi-square test. Later we performance an analysis of variance with repeated measures. The statistical program used was SPSS for Windows (version 11.0) and the level of significance adopted was 5% The results revealed that the low stature was already a characteristic of the gymnasts of both sexes, even before they began to do competitive sports, and their growth in stature was attenuated due to a lower velocity of growth in length of the lower limbs, compared with the other body segments. Gymnasts of both sexes showed a genetic predisposition to be short and mature late, and that the sports modality called Artistic Gymnastics did not exert any influence on these variables. Based on the results presented in this research, we can state that since artistic gymnastics is an impact sport, through mechanical stress, it provided an optimal bone remodeling, even in cases in which insufficient calcium intake was observed.

Cette étude a eu comme but principal de définir le profil des pratiquants de Gymnastique Artistique des deux sexes et pour cela nous avons analysé les mesures somatiques, la composition corporelle, le développement tubérale, la densité minérale des os, la teneur minérale des os et l’ingestion des aliments. Pour une meilleure perception des variables des gymnastes, au long de quatre ans nous avons fait la comparaison avec un groupe de contrôle. Ainsi, l’échantillon a été composé par des sujets des deux sexes, âgés de six à douze ans d’abord, et totalisant une population de 280 sujets. L’étude a été longitudinale et les variables suivantes ont été analysées: taille, hauteur assise, longueur des membres inférieurs, taille des parents, âge des premières règles des mères, poids corporel, index de la masse corporelle, pourcentage de matière grasse corporelle, masse exempte de graisse, développement tubérale, densité minérale des os, segmentaire et totale, contenu minéral total des os et ingestion des aliments suivants: calcium, protéines, phosphore et fer. La taille et la stature assise ont été mesurées par un stadiomètre portable. Pour la collecte des données de la taille des parents et l’âge des premières règles des mères, on a utilisé un questionnaire padron. Le poids corporel a été obtenu à l’aide d’une balance Filizola, avec une précision d’environ 100 grammes. Pour identifier le développement tubérale nous avons utilisé la classification de Tanner. L’examen densitométrique des os a été effectué par le système Dual- Energy X-ray Absorptiometry, dans le dispositif LUNAR DPX IQ#5610, afin d’établir, avec rigueur la densité minérale des os des membres supérieurs, des membres inférieurs, pelviennes, du tronc, de la colonne vertébrale, des côtes, de la tête et du corps entier, le contenu minéral total des os, la masse exempte de matière grasse et le pourcentage de matière grasse corporelle. Enfin, pour établir la quantité absorbée de calcium, protéines phosphore et fer, on a utilisé un enregistrement alimentaire pendant 7 jours. Le traitement statistique des données a été réalisé à l’aide d’une analyse de variation (ANOVA) de comparaisons multiples de Tukey, test T de Student , corrélation de Pearson et test qui carré. Ensuite, nous avons réalisé l’analyse de variation des mesures répétées. Le programme statistique utilisé fut le SPSS for Windows (‘version 11.0) et le niveau de signification fut de 5%. Les résultats ont révélé que la petite taille était déjà propre des gymnastes, avant même qu’ils ne s’initient au sport de compétition. Cependant, leur croissance fut atténuée en raison de la lenteur de croissance des membres inférieurs par rapport aux autres parties du corps. Les gymnastes des deux sexes ont présenté une prédisposition génétique à avoir une petite taille et une puberté tardive. Le sport qu’ils pratiquaient n’a donc exercé aucune influence sur ces variations. Ayant pour base les résultats présentés par cette étude, nous pouvons affirmer que la gymnastique artistique tout en étant un sport d’impact, dû au stress mécanique, permet un excellent remoulage des os, même dans les cas où on a observé une ingestion insuffisante de calcium. / Este estudo teve como objectivo principal investigar os praticantes de Ginástica Artística de ambos os géneros e para isso analisamos as medidas somáticas, a composição corporal, o desenvolvimento puberal, a densidade mineral óssea, o conteúdo mineral ósseo e a ingestão de nutrientes. Para melhor percepção das variáveis dos ginastas, ao longo de 4 anos, fizemos a comparação com um grupo controlo. Assim, a amostra foi composta por sujeitos de ambos os géneros numa faixa etária inicial dos 6 aos 12 anos e totalizando uma população de 280 sujeitos. O estudo foi longitudinal e analisaram-se as seguintes variáveis: estatura, altura sentada, comprimento dos membros inferiores, estatura dos pais, idade de menarca das mães, peso corporal, índice de massa corporal, percentual de gordura corporal, massa isenta de gordura, desenvolvimento puberal, densidade mineral óssea dos segmentos corporais e total, conteúdo mineral ósseo total e ingestão dos seguintes nutrientes: cálcio, proteínas, fósforo e ferro. A estatura e altura sentada foram medidas com um estadiómetro portátil. Para a colecta de dados da estatura dos pais e idade de menarca das mães foi utilizado um questionário padronizado. O peso corporal foi obtido através de uma balança Filizola, com precisão de 100 gramas. Para a identificação do desenvolvimento puberal utilizamos a classificação de Tanner. O exame de densitometria óssea foi efectuado através do sistema Dual-Energy X-ray Absorptiometry, no aparelho LUNAR DPX IQ#5610, a fim de estabelecer com rigor a densidade mineral óssea dos segmentos corporais (membros superiores, membros inferiores, pélvis, tronco, coluna vertebral, costelas, cabeça e corpo total) o conteúdo mineral ósseo total, a massa isenta de gordura e o percentual de gordura corporal. Por fim, para quantificar os nutrientes cálcio, proteínas, fósforo e ferro, foi utilizado um registo alimentar de sete dias. O tratamento estatístico dos dados foi realizado através do recurso a uma análise de variância (ANOVA) comparações múltiplas de Tukey, teste t de Student, correlação de Pearson e teste qui-quadrado. Posteriormente realizamos a análise de variância de medidas repetidas. O programa estatístico utilizado foi o SPSS for Windows (versão 11.0) e o nível de significância adoptado foi de 5%. Os resultados revelaram que a baixa estatura já era característica dos ginastas em ambos os géneros mesmo antes de se iniciarem no desporto de competição, sendo que o seu crescimento em estatura foi atenuado devido a uma menor velocidade de crescimento do comprimento dos membros inferiores em relação aos outros segmentos corporais. Os ginastas de ambos os géneros mostraram predisposição genética para terem baixa estatura e maturação tardia, e que a modalidade desportiva Ginástica Artística não exerceu influência nestas variáveis. Com base nos resultados apresentados nesta investigação podemos afirmar que, sendo a Ginástica Artística um desporto de impacto, através do stress mecânico, proporcionou uma óptima remodelação óssea, mesmo nos casos em que se observou uma insuficiente ingestão de cálcio / The main objective of this study was to performance research on people who practice artistic gymnastics, both male and female. In order to do so we analyze the somatic measures, body composition, pubertal development, bone mineral density, bone mineral content and nutrient intake. For a better perception of the gymnasts’ variables over 4 years, we compared them with a control group. The samples were composed of subjects of both sexes, in an initial age range from 6 to12 years and totalizing a population of 280 subjects. The study was longitudinal and analyzed the following variables: stature, seated height, length of lower limbs, parents’ stature, mothers’ age at menarche, body weight, body mass index, percentage of body fat, mass without fat, pubertal development, bone mineral density of the body and total segments, and intake of the following nutrients: calcium, proteins, phosphorus and iron. The stature and seated height were measured using a portable stadiometer. A standardized questionnaire was used to collect data concerning the stature of the parents and mothers’ age at menarche. The body weight was obtained using a Filizola balance, with a 100- gram precision. We used the Tanner classification to identify pubertal development. The bone densitometry exam was carried out using the Dual- Energy X-ray Absorptiometry system in the following apparatus: LUNAR DPX IQ#5610, to measure strictly the bone mineral density of the following segments of the body: upper limbs, lower limbs, pelvis, torso, spine, ribs, head and total body, total bone mineral content, mass without fat and percentage of body fat. Finally, to quantify the nutrient calcium, proteins, phosphorus and iron, a sevenday food record was used. The statistical treatment of the data was performance using an analysis of variance (ANOVA) multiple comparisons of Tukey, Student t test. Pearson correlation and chi-square test. Later we performance an analysis of variance with repeated measures. The statistical program used was SPSS for Windows (version 11.0) and the level of significance adopted was 5% The results revealed that the low stature was already a characteristic of the gymnasts of both sexes, even before they began to do competitive sports, and their growth in stature was attenuated due to a lower velocity of growth in length of the lower limbs, compared with the other body segments. Gymnasts of both sexes showed a genetic predisposition to be short and mature late, and that the sports modality called Artistic Gymnastics did not exert any influence on these variables. Based on the results presented in this research, we can state that since artistic gymnastics is an impact sport, through mechanical stress, it provided an optimal bone remodeling, even in cases in which insufficient calcium intake was observed.

Cette étude a eu comme but principal de définir le profil des pratiquants de Gymnastique Artistique des deux sexes et pour cela nous avons analysé les mesures somatiques, la composition corporelle, le développement tubérale, la densité minérale des os, la teneur minérale des os et l’ingestion des aliments. Pour une meilleure perception des variables des gymnastes, au long de quatre ans nous avons fait la comparaison avec un groupe de contrôle. Ainsi, l’échantillon a été composé par des sujets des deux sexes, âgés de six à douze ans d’abord, et totalisant une population de 280 sujets. L’étude a été longitudinale et les variables suivantes ont été analysées: taille, hauteur assise, longueur des membres inférieurs, taille des parents, âge des premières règles des mères, poids corporel, index de la masse corporelle, pourcentage de matière grasse corporelle, masse exempte de graisse, développement tubérale, densité minérale des os, segmentaire et totale, contenu minéral total des os et ingestion des aliments suivants: calcium, protéines, phosphore et fer. La taille et la stature assise ont été mesurées par un stadiomètre portable. Pour la collecte des données de la taille des parents et l’âge des premières règles des mères, on a utilisé un questionnaire padron. Le poids corporel a été obtenu à l’aide d’une balance Filizola, avec une précision d’environ 100 grammes. Pour identifier le développement tubérale nous avons utilisé la classification de Tanner. L’examen densitométrique des os a été effectué par le système Dual- Energy X-ray Absorptiometry, dans le dispositif LUNAR DPX IQ#5610, afin d’établir, avec rigueur la densité minérale des os des membres supérieurs, des membres inférieurs, pelviennes, du tronc, de la colonne vertébrale, des côtes, de la tête et du corps entier, le contenu minéral total des os, la masse exempte de matière grasse et le pourcentage de matière grasse corporelle. Enfin, pour établir la quantité absorbée de calcium, protéines phosphore et fer, on a utilisé un enregistrement alimentaire pendant 7 jours. Le traitement statistique des données a été réalisé à l’aide d’une analyse de variation (ANOVA) de comparaisons multiples de Tukey, test T de Student , corrélation de Pearson et test qui carré. Ensuite, nous avons réalisé l’analyse de variation des mesures répétées. Le programme statistique utilisé fut le SPSS for Windows (‘version 11.0) et le niveau de signification fut de 5%. Les résultats ont révélé que la petite taille était déjà propre des gymnastes, avant même qu’ils ne s’initient au sport de compétition. Cependant, leur croissance fut atténuée en raison de la lenteur de croissance des membres inférieurs par rapport aux autres parties du corps. Les gymnastes des deux sexes ont présenté une prédisposition génétique à avoir une petite taille et une puberté tardive. Le sport qu’ils pratiquaient n’a donc exercé aucune influence sur ces variations. Ayant pour base les résultats présentés par cette étude, nous pouvons affirmer que la gymnastique artistique tout en étant un sport d’impact, dû au stress mécanique, permet un excellent remoulage des os, même dans les cas où on a observé une ingestion insuffisante de calcium. / Este estudo teve como objectivo principal investigar os praticantes de Ginástica Artística de ambos os géneros e para isso analisamos as medidas somáticas, a composição corporal, o desenvolvimento puberal, a densidade mineral óssea, o conteúdo mineral ósseo e a ingestão de nutrientes. Para melhor percepção das variáveis dos ginastas, ao longo de 4 anos, fizemos a comparação com um grupo controlo. Assim, a amostra foi composta por sujeitos de ambos os géneros numa faixa etária inicial dos 6 aos 12 anos e totalizando uma população de 280 sujeitos. O estudo foi longitudinal e analisaram-se as seguintes variáveis: estatura, altura sentada, comprimento dos membros inferiores, estatura dos pais, idade de menarca das mães, peso corporal, índice de massa corporal, percentual de gordura corporal, massa isenta de gordura, desenvolvimento puberal, densidade mineral óssea dos segmentos corporais e total, conteúdo mineral ósseo total e ingestão dos seguintes nutrientes: cálcio, proteínas, fósforo e ferro. A estatura e altura sentada foram medidas com um estadiómetro portátil. Para a colecta de dados da estatura dos pais e idade de menarca das mães foi utilizado um questionário padronizado. O peso corporal foi obtido através de uma balança Filizola, com precisão de 100 gramas. Para a identificação do desenvolvimento puberal utilizamos a classificação de Tanner. O exame de densitometria óssea foi efectuado através do sistema Dual-Energy X-ray Absorptiometry, no aparelho LUNAR DPX IQ#5610, a fim de estabelecer com rigor a densidade mineral óssea dos segmentos corporais (membros superiores, membros inferiores, pélvis, tronco, coluna vertebral, costelas, cabeça e corpo total) o conteúdo mineral ósseo total, a massa isenta de gordura e o percentual de gordura corporal. Por fim, para quantificar os nutrientes cálcio, proteínas, fósforo e ferro, foi utilizado um registo alimentar de sete dias. O tratamento estatístico dos dados foi realizado através do recurso a uma análise de variância (ANOVA) comparações múltiplas de Tukey, teste t de Student, correlação de Pearson e teste qui-quadrado. Posteriormente realizamos a análise de variância de medidas repetidas. O programa estatístico utilizado foi o SPSS for Windows (versão 11.0) e o nível de significância adoptado foi de 5%. Os resultados revelaram que a baixa estatura já era característica dos ginastas em ambos os géneros mesmo antes de se iniciarem no desporto de competição, sendo que o seu crescimento em estatura foi atenuado devido a uma menor velocidade de crescimento do comprimento dos membros inferiores em relação aos outros segmentos corporais. Os ginastas de ambos os géneros mostraram predisposição genética para terem baixa estatura e maturação tardia, e que a modalidade desportiva Ginástica Artística não exerceu influência nestas variáveis. Com base nos resultados apresentados nesta investigação podemos afirmar que, sendo a Ginástica Artística um desporto de impacto, através do stress mecânico, proporcionou uma óptima remodelação óssea, mesmo nos casos em que se observou uma insuficiente ingestão de cálcio / The main objective of this study was to performance research on people who practice artistic gymnastics, both male and female. In order to do so we analyze the somatic measures, body composition, pubertal development, bone mineral density, bone mineral content and nutrient intake. For a better perception of the gymnasts’ variables over 4 years, we compared them with a control group. The samples were composed of subjects of both sexes, in an initial age range from 6 to12 years and totalizing a population of 280 subjects. The study was longitudinal and analyzed the following variables: stature, seated height, length of lower limbs, parents’ stature, mothers’ age at menarche, body weight, body mass index, percentage of body fat, mass without fat, pubertal development, bone mineral density of the body and total segments, and intake of the following nutrients: calcium, proteins, phosphorus and iron. The stature and seated height were measured using a portable stadiometer. A standardized questionnaire was used to collect data concerning the stature of the parents and mothers’ age at menarche. The body weight was obtained using a Filizola balance, with a 100- gram precision. We used the Tanner classification to identify pubertal development. The bone densitometry exam was carried out using the Dual- Energy X-ray Absorptiometry system in the following apparatus: LUNAR DPX IQ#5610, to measure strictly the bone mineral density of the following segments of the body: upper limbs, lower limbs, pelvis, torso, spine, ribs, head and total body, total bone mineral content, mass without fat and percentage of body fat. Finally, to quantify the nutrient calcium, proteins, phosphorus and iron, a sevenday food record was used. The statistical treatment of the data was performance using an analysis of variance (ANOVA) multiple comparisons of Tukey, Student t test. Pearson correlation and chi-square test. Later we performance an analysis of variance with repeated measures. The statistical program used was SPSS for Windows (version 11.0) and the level of significance adopted was 5% The results revealed that the low stature was already a characteristic of the gymnasts of both sexes, even before they began to do competitive sports, and their growth in stature was attenuated due to a lower velocity of growth in length of the lower limbs, compared with the other body segments. Gymnasts of both sexes showed a genetic predisposition to be short and mature late, and that the sports modality called Artistic Gymnastics did not exert any influence on these variables. Based on the results presented in this research, we can state that since artistic gymnastics is an impact sport, through mechanical stress, it provided an optimal bone remodeling, even in cases in which insufficient calcium intake was observed.

Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal. / La maladie d'Alzheimer (MA) est une maladie neurodégénérative caractérisée par la détérioration progressive et irréversible de toutes les facultés intellectuelles. Les récents développements scientifiques, et en particulier les apports de la génétique moléculaire, ont permis des avancées considérables dans la compréhension de l'étiologie de cette maladie. En fait, il s'agit d'une maladie dont les causes, tant environnementales que génétiques, sont nombreuses. Malgré ces progrès remarquables, les causes précises de la majorité des cas de MA demeurent en cette année 1999, inconnues. Il faut en déduire que d'autres facteurs restent à être identifiés. Plusieurs indices biochimiques et génétiques suggèrent qu'une anomalie mitochondriale pourrait être impliquée dans le développement de la MA. Ainsi, on rapporte que l'activité de l'un des maillons de la chaîne respiratoire mitochondriale (complexe cytochrome oxydase) est diminuée en comparaison d'individus normaux du même âge. La littérature scientifique suggère très fréquemment que le génome mitochondrial pourrait être la cause de ce déficit enzymatique. Cependant, aucune publication n'a pu jusqu'à ce jour lever le voile sur le rôle exact que joue ce génome dans la MA. Pour cette raison, nous avons amorcé un programme de recherche ayant pour but premier d'étudier la séquence de l'ADN mitochondrial (ADNmt) d'un nombre important de patients et de témoins provenant, pour la grande majorité, de la population fondatrice du Saguenay-Lac-St-Jean. Notre objectif était de déterminer si le déficit de l'activité cytochrome oxydase (CO) était associé à des variations de l'ADNmt situées dans les gènes pouvant affecter directement l'activité de cette enzyme (gènes COI, COII, COIII et les 22 ARN de transfert mitochondriaux). Avant de débuter l'analyse du génome mitochondrial, nous avons mesuré l'activité CO dans différentes régions du cortex cérébral de patients décèdes de la MA et comparé l'activité mesurée à celle d'individus normaux ou décèdes suite au développement d'une autre maladie neurodégénérative (démence à corps de Lewy, maladie de Parkinson ou démence cérébrovasculaire). Ainsi, nous avons démontré que l'activité CO était significativement diminuée dans le cortex frontal et pariétal des patients Alzheimer. Par contre, nous ignorons pourquoi certaines régions cérébrales, comme l'hippocampe qui est une structure très affectée par la MA, présentent une activité CO comparable à celle des témoins. D'autres part, nous avons observé que les patients Alzheimer de type sénile ayant une durée de maladie très courte ont une activité CO dans le cortex frontal et pariétal encore plus faible que ceux qui sun/ivent plus de dix ans à la maladie. Comme le niveau d'activité CO est un reflet de l'activité neuronale, on ne peut dire si cette diminution de fonction du complexe CO est réellement impliquée dans le développement de la MA ou si elle n'en est qu'une conséquence. Pour pouvoir incriminer ce déficit enzymatique, il faudrait pouvoir l'associer à une ou plusieurs anomalies génétiques, comme c'est le cas dans les cytopathies mitochondriales. Puisque le complexe CO est composé d'unités codées par le génome nucléaire et mitochondrial, la cause du déficit enzymatique pourrait se situer à l'intérieur de l'un de ces deux génomes. Pour notre étude, nous avons analysé toutes les régions du génome mitochondrial pouvant influencer le niveau d'activité de cette enzyme. C'est-à-dire les trois gènes indispensables à la formation du complexe CO (CO l, II et III) ainsi que les 22 ARN de transfert mitochondriaux (ARNt) qui servent à leur traduction. Au total, nous avons détecté la présence de 95 variations différentes à l'intérieur du génome mitochondrial de 69 patients Alzheimer et de 83 individus témoins. Ce qui ressort essentiellement de cette analyse génétique, c'est qu'il n'y a pas de différence majeure dans la séquence de l'ADNmt (gènes CO l, II, III et les 22 ARNt) entre les patients et les témoins. Nous pouvons donc affirmer que la baisse d'activité CO observée dans le cortex cérébral de la majorité des patients Alzheimer n'est pas causée directement par une anomalie de ces gènes mitochondriaux. En conséquence, l'hypothèse voulant que le génome mitochondrial soit la cause de ce déficit enzymatique et qu'il ait un rôle dans la MA est rejetée. Il existe seulement deux autres possibilités principales qui pourraient expliquer l'origine de ce déficit enzymatique. Soit que l'un des gènes nucléaires impliqués dans la formation ou le fonctionnement du complexe CO est défectueux ou finalement soit que cette diminution d'activité CO ne résulte que d'une adaptation de la chaîne respiratoire à une diminution importante de l'activité synaptique et du métabolisme cellulaire dans le cortex des patients Alzheimer. Néanmoins, nous ne pouvons pas totalement exclure la possibilité que l'ADNmt soit impliqué dans l'étiologie de la MA. En effet, nous avons observé qu'un nombre restreint de sujets sont porteurs de variations que l'on retrouve uniquement chez les individus qui ont développé la MA. Cependant, puisque ces variations sont relativement rares, elles ne sont certainement pas la cause du déficit CO présent chez la majorité des patients. Une de ces variations est un haplotype composé des polymorphismes situés aux positions 5633 (ARNtA'a), 7476 (ARNtSer) et 15812 (cytochrome b) que l'on a détecté chez 4,7% des patients mais chez aucun des 83 témoins. Étant donné que l'une de ces variations (15812) est déjà associée à une autre maladie neurodégénérative, que ces trois modifications sont modérément conservées et que leur fréquence dans différentes populations a été établie à environ 0,1%, nous pensons que la présence de cet haptotype pourrait représenter un risque de développer la MA. Il est donc possible que cette anomalie de l'ADNmt explique un faible pourcentage des cas de MA. Cependant, cette affirmation n'est pour l'instant que spéculative et ne serrait vérifiée que lorsque d'autres groupes de recherche auront confirmé ou infirmé cette association. D'autres résultats ont également été obtenus concernant, entre autres, 2 modifications de l'ADNmt qui avaient déjà été associées à la MA dans des études antérieures. Nous avons détecté ces deux variations (4336/ARNtQ et 5460/ND2) aussi bien chez les patients que chez les témoins; elles ne sont donc pas associées à la MA, du moins pas dans notre population. Par ailleurs, le troisième article (Chagnon étal., 1999) de la section résultat de cette thèse, rapporte que nous avons observé une différence significative (p Dans la dernière portion de notre étude, nous avons mesuré le taux de mutations somatiques (mutations ponctuelles qui s'accumulent au cours de la vie d'un individu) de plusieurs sujets et démontré qu'il n'y a pas plus de mutagenèse dans le gène COIII de l'ADNmt chez les patients que chez les témoins. Ce mécanisme, souvent cité dans la littérature pour sa participation au phénomène du vieillissement cellulaire, ne serait pas la cause du déficit CO et ne jouerait aucun rôle dans l'étiologie de la MA. En conclusion, cette étude du génome mitochondrial a nécessité l'analyse de la séquence de près de 10 kb d'ADN chez plus de 150 individus (au total, plus de 1 million de nucléotides analysés). Malgré l'ampleur de cette tâche, nous savions dès le départ que cette étude complète des trois gènes CO et des 22 ARNt mitochondriaux était, en quelque sorte, préliminaire. En effet, comme la MA est une maladie complexe et que les gènes connus faisant partie de son étiologie n'expliquent qu'un faible pourcentage de cas Alzheimer, il était peu probable de trouver un gène muté pouvant expliquer une majorité de cas. Le mieux que nous pouvions espérer était d'identifier des variations présentes chez certains patients mais pas chez les témoins. Le problème avec ce type de résultats, c'est qu'il est pratiquement impossible d'arriver à des conclusions fermes. Ainsi, pour l'haplotype que nous avons détecté chez un certain nombre de patients, il faudra attendre la confirmation de d'autres études ultérieures pour conclure définitivement de son implication dans la MA. -2- Quoi qu'il en soit, cette étude a déjà atteint un objectif très important puisque nous savons maintenant que les trois gènes CO et les 22 ARNt mitochondriaux, qui étaient des gènes candidats importants, ne sont pas la cause du déficit CO qui est observé chez la majorité des patients Alzheimer.

La mammite subclinique est un problème de santé fréquent et coûteux. Les infections intra-mammaires (IIM) sont souvent détectées à l’aide de mesures du comptage des cellules somatiques (CCS). La culture bactériologique du lait est cependant requise afin d’identifier le pathogène en cause. À cause de cette difficulté, pratiquement toutes les recherches sur la mammite subclinique ont été centrées sur la prévalence d’IIM et les facteurs de risque pour l’incidence ou l’élimination des IIM sont peu connus. L’objectif principal de cette thèse était d’identifier les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, l’élimination et la prévalence d’IIM d’importance dans les troupeaux laitiers Canadiens. En premier lieu, une revue systématique de la littérature sur les associations entre pratiques utilisées à la ferme et CCS a été réalisée. Les pratiques de gestion constamment associées au CCS ont été identifiées et différentiées de celles faisant l’objet de rapports anecdotiques. Par la suite, un questionnaire bilingue a été développé, validé, et utilisé afin de mesurer les pratiques de gestion d’un échantillon de 90 troupeaux laitiers canadiens. Afin de valider l’outil, des mesures de répétabilité et de validité des items composant le questionnaire ont été analysées et une évaluation de l’équivalence des versions anglaise et française a été réalisée. Ces analyses ont permis d’identifier des items problématiques qui ont du être recatégorisés, lorsque possible, ou exclus des analyses subséquentes pour assurer une certaine qualité des données. La plupart des troupeaux étudiés utilisaient déjà la désinfection post-traite des trayons et le traitement universel des vaches au tarissement, mais beaucoup des pratiques recommandées n’étaient que peu utilisées. Ensuite, les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, à l’élimination et à la prévalence d’IIM à Staphylococcus aureus ont été investigués de manière longitudinale sur les 90 troupeaux sélectionnés. L’incidence d’IIM semblait être un déterminant plus important de la prévalence d’IIM du troupeau comparativement à l’élimination des IIM. Le port de gants durant la traite, la désinfection pré-traite des trayons, de même qu’une condition adéquate des bouts de trayons démontraient des associations désirables avec les différentes mesures d’IIM. Ces résultats viennent souligner l’importance des procédures de traite pour l’obtention d’une réduction à long-terme de la prévalence d’IIM. Finalement, les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, à l’élimination et à la prévalence d’IIM à staphylocoques coagulase-négatif (SCN) ont été étudiés de manière similaire. Cependant, afin de prendre en considération les limitations de la culture bactériologique du lait pour l’identification des IIM causées par ce groupe de pathogènes, une approche semi-Bayesienne à l’aide de modèles de variable à classe latente a été utilisée. Les estimés non-ajusté de l’incidence, de l’élimination, de la prévalence et des associations avec les expositions apparaissaient tous considérablement biaisés par les imperfections de la procédure diagnostique. Ce biais était en général vers la valeur nulle. Encore une fois, l’incidence d’IIM était le principal déterminant de la prévalence d’IIM des troupeaux. Les litières de sable et de produits du bois, de même que l’accès au pâturage étaient associés à une incidence et une prévalence plus basse de SCN. / Subclinical mastitis is a very frequent and costly health issue that can be detected using somatic cell count (SCC) measurements, but requires the use of milk bacteriological culture for identification of the causal pathogen. Because of this latter difficulty, nearly all subclinical mastitis research has focused on prevalent intramammary infections (IMI) and less is known on risk factors for IMI incidence or elimination. The main objective of this thesis was to identify the manageable risk factors associated with the incidence, elimination, and prevalence of IMI of importance in Canadian dairy herds. First, a systematic review of the literature on the associations between management practices used on farms and SCC was carried out. Management practices consistently associated with SCC were identified and differentiated from other practices for which anecdotic reports were available. Then, a bilingual questionnaire was developed, validated, and employed to measure the practices used on a sample of 90 Canadian dairy herds. To validate this tool, measures of repeatability and of validity of the questionnaire’s items were analyzed and an evaluation of the equivalence of the English and French versions was conducted. These analyses indicated that the questionnaire was, in general, acceptable, but also pinpointed some problematic items. These items were recategorized when possible or otherwise excluded from subsequent analyses to ensure good data quality. Most of the herds studied were already using post-milking teat disinfection and blanket dry cow therapy. Many other frequently recommended practices were not widely adopted. Next, manageable risk factors associated with Staphylococcus aureus IMI incidence, elimination, and prevalence were investigated on the 90 selected herds in a longitudinal fashion. The S. aureus IMI incidence appeared to be a stronger determinant of the herd prevalence than the elimination rate. Among other practices, wearing gloves during milking, using pre-milking teat disinfection, and having an adequate teat end condition showed desirable associations with the outcomes. These results highlight the importance of good milking practices to achieve a long-term reduction of S. aureus IMI prevalence. Finally, manageable risk factors associated with coagulase-negative staphylococci (CNS) IMI incidence, elimination, and prevalence were investigated in a similar manner. Because of the greater limitations of milk bacteriological culture to identify IMI caused by this group of pathogens, a semi-Bayesian latent class model approach was used. Sensitivity and specificity estimates from an internal validation study were used to link the observed IMI milk culture result to the latent true quarter IMI status. Non-adjusted estimates of IMI incidence, elimination, prevalence, and of associations with expositions appeared to be considerably biased by the diagnostic procedure’s imperfections. Most often, estimates were biased toward the null value. Again, IMI incidence was the main determinant of the herd IMI prevalence. Sand and wood products bedding were associated with lower CNS incidence and prevalence. Sending cows to pasture was also associated with lower CNS IMI incidence and prevalence.

L’objectif de cette étude était de déterminer l’impact d’une infection intra-mammaire (IIM) subclinique causée par staphylocoque coagulase-négative (SCN) ou Staphylococcus aureus diagnostiquée durant le premier mois de lactation chez les taures sur le comptage de cellules somatiques (CCS), la production laitière et le risque de réforme durant la lactation en cours. Des données bactériologiques provenant d’échantillons de lait composites de 2 273 taures Holstein parmi 50 troupeaux ont été interprétées selon les recommandations du National Mastitis Council. Parmi 1 691 taures rencontrant les critères de sélection, 90 (5%) étaient positives à S. aureus, 168 (10%) étaient positives à SCN et 153 (9%) étaient négatives (aucun agent pathogène isolé). Le CCS transformé en logarithme népérien (lnCCS) a été modélisé via une régression linéaire avec le troupeau comme effet aléatoire. Le lnCCS chez les groupes S. aureus et SCN était significativement plus élevé que dans le groupe témoin de 40 à 300 jours en lait (JEL) (P < 0.0001 pour tous les contrastes). La valeur journalière du lnSCC chez les groupes S. aureus et SCN était en moyenne 1.2 et 0.6 plus élevé que le groupe témoin respectivement. Un modèle similaire a été réalisé pour la production laitière avec l’âge au vêlage, le trait génétique lié aux parents pour la production laitière et le logarithme népérien du JEL de la pesée inclus. La production laitière n’était pas statistiquement différente entre les 3 groupes de culture de 40 à 300 JEL (P ≥ 0.12). Les modèles de survie de Cox ont révélé que le risque de réforme n’était pas statistiquement différent entre le groupe S. aureus ou SCN et le groupe témoin (P ≥ 0.16). La prévention des IIM causées par SCN et S. aureus en début de lactation demeure importante étant donné leur association avec le CCS durant la lactation en cours. / The objective of this study was to determine the effect of a subclinical intramammary infection (IMI) caused by coagulase-negative staphylococci (CNS) or Staphylococcus aureus diagnosed during the first month of lactation in heifers on somatic cell count (SCC), milk production and culling risk during the entire first lactation. Bacteriological analysis data of composite milk samples taken from 2,273 Hostein heifers among 50 dairy herds were interpreted according to the National Mastitis Council guidelines. Among the 1,691 heifers meeting the selection criteria, 90 (5%) were diagnosed with S. aureus, 168 (10%) with CNS, and 153 (9%) were negative (no pathogen isolated). Test-day SCC transformed in natural logarithm (lnCCS) was fit in a linear regression model with herd as random effect. The lnSCC in S. aureus and CNS groups were significantly higher than in negative group from 40 to 300 days in milk (DIM) (P < 0.0001 for all contrasts). At test-day level, lnSCC in S. aureus and CNS groups was on average 1.2 and 0.6 higher than the negative group respectively. A similar model was used for milk yield with age at calving, parent average genetic value for milk yield and natural logarithm of tested DIM included. Milk yield was not statistically different between culture groups from 40 to 300 DIM (P ≥ 0.12). Compared with negative heifers, the culling hazard ratio estimated using Cox survival analysis in S. aureus and CNS infected heifers was not significant (P ≥ 0.16). Prevention of CNS or S. aureus IMI in early lactation remains important for its association with SCC during the ensuing lactation.

Dans le but de reconnaitre et répondre de manière efficace à une très grande variétés d’agents pathogènes, les cellules B ont développé au cours des mécanismes de diversifications des immunoglobulines contrôlés par des processus génétiques complexes comme la recombinaison V(D)J, l’hypermutation somatiques (SHM), et le changement de classe par recombinaison (CSR). L’ensemble de ces processus est contrôlé par différentes voies de réparations de l’ADN. L’anémie de Fanconi est une maladie génétique rare caractérisée par une défaillance progressive de la moelle osseuse, des anomalies de développement et un risque accru de développer des leucémies et des cancers oesopharyngés. La voie FANC est impliquée dans la réparation des pontages de l’ADN et dans le maintien de la fourche de réplication en cas de stress génotoxique. Il est également bien décrit que la voie FANC joue un rôle important dans la coordination des voies de réponses aux dommages à l’ADN. Dans ce travail de thèse, nous nous sommes intéressés au rôle de la voie FANC dans les processus de diversifications des immunoglobulines.En utilisant des souris déficientes pour le gène Fanca, nous montrons que la voie FANC (ou FANCA) participe à la recombinaison V(D)J en contrôlant, dans la moelle osseuse, la transition des cellules B, du stade pre-B au stade de cellules B immatures. Ceci se ferait probablement par le contrôle de la transcription des gènes codant les chaines légères κ des immunoglobulines. Nous montrons également que Fanca pourrait avoir un rôle dans l’addition de nucleotides aux extrémités codantes, en régulant d’une manière indéterminée l’activité et/ou l’activation de l’enzyme TdT ou de la polymérase Polµ. Par ailleurs, nous avons montré que Fanca est nécessaire pour l’induction des mutations de type transitions A/T pendant le processus de SHM en régulant l’expression ou la stabilisation de Polη. Enfin, Fanca (ou la voie FANC) participe à l’inhibition de la recombinaison non homologue (NHEJ) et est requis durant le CSR pour stabiliser les duplexes entre 2 régions de microhomologies qui facilitent le recrutement d’endonucléases et réguler l’accès des DNA polymérases aux cassures de l’ADN. / To recognize and respond dynamically to an enormous variety of different pathogens, B lymphocytes of the immune system have evolved controlled genetic processes at their immunoglobulin (Ig) loci that are known as Ig diversification including V(D)J recombination, somatic hypermutation (SHM), and class switch recombination (CSR). These complex and vulnerable processes are orchestrated by multiple DNA repair pathways. Fanconi anemia (FA) is a rare genetic disorder that can lead to bone marrow failure, congenital abnormalities, and an increased risk of leukemia and cancer. FANC pathway has been implicated in DNA interstrands crosslinks (ICL) repair and in the rescue of stalled replication forks. The FANC pathway also plays a fundamental role in coordinating the DNA repair pathways. Several lines of evidence suggest a possible involvement of the FANC pathway in Ig diversification processes, thus we are particularly interested in revealing function of FANC pathway during these processes. By using Fanca-/- mice, our results first show that during V(D)J recombination, Fanca (or FANC pathway) participates to the control of the transition from pre-B to immature B cells in bone marrow (BM), probably through transcriptional activation of post-rearranged κ light chain. In addition, Fanca might play a role in nucleotide addition at coding end, possibly by regulating either TdT or Polµ activity/activation. Secondly, we found that Fanca is required for the induction of transition mutations at A/T during SHM via regulation of Polη expression/stabilization. Finally, Fanca (or FANC pathway) inhibits short-range recombination and is required during CSR to stabilize duplexes between 2 short microhomology regions that facilitate the recruitment of endonucleases to trim overhangs and avoid unscheduled access of polymerases to DNA ends.

Sur fond d’incertitude radicale, les entrepreneurs ne peuvent s’en remettre à un calcul précis de rentabilité. Pour les anticipations d’investissement, ils ont recours à leurs esprits animaux, c’est-à-dire un jugement analogique instinctif sur le futur associé à une décision émotionnelle automatique par rapport à lui en fonction de motivations. La notion remonte à l’Antiquité. Elle était synonyme d’influx nerveux. Si l’on interroge les neurosciences d’aujourd’hui, ce sont les marqueurs somatiques qui l’éclairent. Nos émotions servent à arrêter la réflexion, restreindre l’espace des possibles et valoriser certaines options. Elles contribuent à l’intelligence de nos décisions. C’est l’excès, de cognition ou d’émotion, qui est à éviter. Les émotions servent également à réviser ou renforcer nos croyances. Par leur mouvement propre, elles peuvent créer des cycles, ce que nous proposons d’appeler « le paradoxe de la confiance ». Une confiance élevée prépare le terrain de la chute future. À l’inverse, une confiance basse met peu à peu en place les conditions du retournement de conjoncture. Notre travail propose une analyse du raisonnement inductif en économie, à l’origine de l’élaboration de scénarios anticipatifs. Le capital culturel et symbolique semble également orienter les esprits animaux. Notre enquête empirique établit l’existence d’un lien entre capital culturel et prise de risque. Elle dessine aussi une typologie des esprits animaux à même de saisir l’hétérogénéité des entrepreneurs. 11 familles sont dégagées, en fonction de leurs motivations, émotions, capitaux culturels, comportements d’investissement et scénarios anticipatifs privilégiés. / In a background of fundamental uncertainty, entrepreneurs cannot rely on a precise calculus of profitability. For their investment expectations, they have to lean on their animal spirits, that is an analogical, instinctive judgment about the future associated with an automatic emotional decision under the guidance of motivations. The notion traces back to the Ancient times. She was then synonymous with “nerve impulse”. Nowadays, if one probes neuroscience, it appears that somatic markers could shed some light on them. Emotions are useful to stop thoughts, restrict the states of nature and value certain options. They contribute to the intelligence of decisions. It is the excess, be it of cognition or emotion, that is detrimental. Emotions also serve to update or strengthen our beliefs. By their own momentum, they can create cycles, which I propose to dub “the confidence paradox”. When confidence is high, the terrain for the future fall is being prepared. Conversely, when it is low, little by little the conditions for a reversal are being staged. Our work proposes an analysis of inductive reasoning responsible for the elaboration of anticipative scripts. Cultural and symbolic capital also appears to come into play. Our empirical inquiry establishes a link between cultural capital and risk-taking. It outlines as well a clustering of animal spirits so as to grasp the heterogeneity of entrepreneurs. 11 different sorts are outlined and sorted by their motivations, emotions, cultural capital, investment behaviors and preferred anticipative scripts.

L’objectif de cette étude était de déterminer l’impact d’une infection intra-mammaire (IIM) subclinique causée par staphylocoque coagulase-négative (SCN) ou Staphylococcus aureus diagnostiquée durant le premier mois de lactation chez les taures sur le comptage de cellules somatiques (CCS), la production laitière et le risque de réforme durant la lactation en cours. Des données bactériologiques provenant d’échantillons de lait composites de 2 273 taures Holstein parmi 50 troupeaux ont été interprétées selon les recommandations du National Mastitis Council. Parmi 1 691 taures rencontrant les critères de sélection, 90 (5%) étaient positives à S. aureus, 168 (10%) étaient positives à SCN et 153 (9%) étaient négatives (aucun agent pathogène isolé). Le CCS transformé en logarithme népérien (lnCCS) a été modélisé via une régression linéaire avec le troupeau comme effet aléatoire. Le lnCCS chez les groupes S. aureus et SCN était significativement plus élevé que dans le groupe témoin de 40 à 300 jours en lait (JEL) (P < 0.0001 pour tous les contrastes). La valeur journalière du lnSCC chez les groupes S. aureus et SCN était en moyenne 1.2 et 0.6 plus élevé que le groupe témoin respectivement. Un modèle similaire a été réalisé pour la production laitière avec l’âge au vêlage, le trait génétique lié aux parents pour la production laitière et le logarithme népérien du JEL de la pesée inclus. La production laitière n’était pas statistiquement différente entre les 3 groupes de culture de 40 à 300 JEL (P ≥ 0.12). Les modèles de survie de Cox ont révélé que le risque de réforme n’était pas statistiquement différent entre le groupe S. aureus ou SCN et le groupe témoin (P ≥ 0.16). La prévention des IIM causées par SCN et S. aureus en début de lactation demeure importante étant donné leur association avec le CCS durant la lactation en cours. / The objective of this study was to determine the effect of a subclinical intramammary infection (IMI) caused by coagulase-negative staphylococci (CNS) or Staphylococcus aureus diagnosed during the first month of lactation in heifers on somatic cell count (SCC), milk production and culling risk during the entire first lactation. Bacteriological analysis data of composite milk samples taken from 2,273 Hostein heifers among 50 dairy herds were interpreted according to the National Mastitis Council guidelines. Among the 1,691 heifers meeting the selection criteria, 90 (5%) were diagnosed with S. aureus, 168 (10%) with CNS, and 153 (9%) were negative (no pathogen isolated). Test-day SCC transformed in natural logarithm (lnCCS) was fit in a linear regression model with herd as random effect. The lnSCC in S. aureus and CNS groups were significantly higher than in negative group from 40 to 300 days in milk (DIM) (P < 0.0001 for all contrasts). At test-day level, lnSCC in S. aureus and CNS groups was on average 1.2 and 0.6 higher than the negative group respectively. A similar model was used for milk yield with age at calving, parent average genetic value for milk yield and natural logarithm of tested DIM included. Milk yield was not statistically different between culture groups from 40 to 300 DIM (P ≥ 0.12). Compared with negative heifers, the culling hazard ratio estimated using Cox survival analysis in S. aureus and CNS infected heifers was not significant (P ≥ 0.16). Prevention of CNS or S. aureus IMI in early lactation remains important for its association with SCC during the ensuing lactation.

La mammite subclinique est un problème de santé fréquent et coûteux. Les infections intra-mammaires (IIM) sont souvent détectées à l’aide de mesures du comptage des cellules somatiques (CCS). La culture bactériologique du lait est cependant requise afin d’identifier le pathogène en cause. À cause de cette difficulté, pratiquement toutes les recherches sur la mammite subclinique ont été centrées sur la prévalence d’IIM et les facteurs de risque pour l’incidence ou l’élimination des IIM sont peu connus. L’objectif principal de cette thèse était d’identifier les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, l’élimination et la prévalence d’IIM d’importance dans les troupeaux laitiers Canadiens. En premier lieu, une revue systématique de la littérature sur les associations entre pratiques utilisées à la ferme et CCS a été réalisée. Les pratiques de gestion constamment associées au CCS ont été identifiées et différentiées de celles faisant l’objet de rapports anecdotiques. Par la suite, un questionnaire bilingue a été développé, validé, et utilisé afin de mesurer les pratiques de gestion d’un échantillon de 90 troupeaux laitiers canadiens. Afin de valider l’outil, des mesures de répétabilité et de validité des items composant le questionnaire ont été analysées et une évaluation de l’équivalence des versions anglaise et française a été réalisée. Ces analyses ont permis d’identifier des items problématiques qui ont du être recatégorisés, lorsque possible, ou exclus des analyses subséquentes pour assurer une certaine qualité des données. La plupart des troupeaux étudiés utilisaient déjà la désinfection post-traite des trayons et le traitement universel des vaches au tarissement, mais beaucoup des pratiques recommandées n’étaient que peu utilisées. Ensuite, les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, à l’élimination et à la prévalence d’IIM à Staphylococcus aureus ont été investigués de manière longitudinale sur les 90 troupeaux sélectionnés. L’incidence d’IIM semblait être un déterminant plus important de la prévalence d’IIM du troupeau comparativement à l’élimination des IIM. Le port de gants durant la traite, la désinfection pré-traite des trayons, de même qu’une condition adéquate des bouts de trayons démontraient des associations désirables avec les différentes mesures d’IIM. Ces résultats viennent souligner l’importance des procédures de traite pour l’obtention d’une réduction à long-terme de la prévalence d’IIM. Finalement, les facteurs de risque modifiables associés à l’incidence, à l’élimination et à la prévalence d’IIM à staphylocoques coagulase-négatif (SCN) ont été étudiés de manière similaire. Cependant, afin de prendre en considération les limitations de la culture bactériologique du lait pour l’identification des IIM causées par ce groupe de pathogènes, une approche semi-Bayesienne à l’aide de modèles de variable à classe latente a été utilisée. Les estimés non-ajusté de l’incidence, de l’élimination, de la prévalence et des associations avec les expositions apparaissaient tous considérablement biaisés par les imperfections de la procédure diagnostique. Ce biais était en général vers la valeur nulle. Encore une fois, l’incidence d’IIM était le principal déterminant de la prévalence d’IIM des troupeaux. Les litières de sable et de produits du bois, de même que l’accès au pâturage étaient associés à une incidence et une prévalence plus basse de SCN. / Subclinical mastitis is a very frequent and costly health issue that can be detected using somatic cell count (SCC) measurements, but requires the use of milk bacteriological culture for identification of the causal pathogen. Because of this latter difficulty, nearly all subclinical mastitis research has focused on prevalent intramammary infections (IMI) and less is known on risk factors for IMI incidence or elimination. The main objective of this thesis was to identify the manageable risk factors associated with the incidence, elimination, and prevalence of IMI of importance in Canadian dairy herds. First, a systematic review of the literature on the associations between management practices used on farms and SCC was carried out. Management practices consistently associated with SCC were identified and differentiated from other practices for which anecdotic reports were available. Then, a bilingual questionnaire was developed, validated, and employed to measure the practices used on a sample of 90 Canadian dairy herds. To validate this tool, measures of repeatability and of validity of the questionnaire’s items were analyzed and an evaluation of the equivalence of the English and French versions was conducted. These analyses indicated that the questionnaire was, in general, acceptable, but also pinpointed some problematic items. These items were recategorized when possible or otherwise excluded from subsequent analyses to ensure good data quality. Most of the herds studied were already using post-milking teat disinfection and blanket dry cow therapy. Many other frequently recommended practices were not widely adopted. Next, manageable risk factors associated with Staphylococcus aureus IMI incidence, elimination, and prevalence were investigated on the 90 selected herds in a longitudinal fashion. The S. aureus IMI incidence appeared to be a stronger determinant of the herd prevalence than the elimination rate. Among other practices, wearing gloves during milking, using pre-milking teat disinfection, and having an adequate teat end condition showed desirable associations with the outcomes. These results highlight the importance of good milking practices to achieve a long-term reduction of S. aureus IMI prevalence. Finally, manageable risk factors associated with coagulase-negative staphylococci (CNS) IMI incidence, elimination, and prevalence were investigated in a similar manner. Because of the greater limitations of milk bacteriological culture to identify IMI caused by this group of pathogens, a semi-Bayesian latent class model approach was used. Sensitivity and specificity estimates from an internal validation study were used to link the observed IMI milk culture result to the latent true quarter IMI status. Non-adjusted estimates of IMI incidence, elimination, prevalence, and of associations with expositions appeared to be considerably biased by the diagnostic procedure’s imperfections. Most often, estimates were biased toward the null value. Again, IMI incidence was the main determinant of the herd IMI prevalence. Sand and wood products bedding were associated with lower CNS incidence and prevalence. Sending cows to pasture was also associated with lower CNS IMI incidence and prevalence.