Amostras de sedimento foram coletadas no talude superior e médio da Bacia de Campos para avaliar a quantidade e qualidade da matéria orgânica (MO) disponíveis no ambiente. A partir de dados geoquímicos, sedimentológicos (tamanho médio de grão e razão silte/argila), e microfaunísticos foi possível identificar diferenças no aporte de MO no talude. O talude superior apresentou valores maiores de conteúdo de carbono orgânico (COT) e lipídeos, elevados valores de densidade, baixos valores de diversidade, riqueza, equitatividade, ALD10, e perfil vertical com densidades maiores, predomínio de espécies epifaunais e/ou infaunais rasos, indicando ambiente com maior produtividade primária sobre maior influência de pulsos de fitodetrito, decorrente da influência do Vórtice de Vitória transportando nutrientes para o mar profundo. Já o talude médio, apresentou menores valores de COT, lipídeos e densidade, maiores valores de diversidade, riqueza, equitatividade, ALD10, predomínio de espécies aglutinantes, indicando condições com menor aporte de nutrientes lábeis. Pelos dados microfaunísticos obtidos, o modelo TROX não pode ser aplicado no talude da Bacia de Campos como avaliador de condições tróficas possivelmente pela não inclusão de fatores como disponibilidade de MO lábil, e bioturbação que influenciam na distribuição vertical dos foraminíferos bentônicos vivos no talude superior e médio da Bacia de Campos. / Sediment samples were collected in the upper and middle slope of Campos Basin to evaluate the quantity and quality of organic matter (OM) available in the environment. From geochemical, sedimentological (grain size, ratio and silt/clay), and microfaunistic data was possible to identify differences in the contribution of OM in slope. The upper slope had higher organic carbon content (TOC) and lipids, high density values, low values of diversity, richness, evenness, ALD10, and vertical profile with higher densities, predominance of epifaunal and/or shallow infaunal species, indicating higher primary productivity environment with greater influence on the pulse of phytodetritus, due to the influence of the Vitória Eddy carrying nutrients to the deep sea. The average slope had lower TOC values, lipids and density, higher values of diversity, richness, evenness, ALD10, predominant agglutinated species, indicating conditions with lower input of labile nutrients. Microfaunistic data obtained cannot be applied by the TROX model to the upper and middle slope of Campos Basin as an evaluator of trophic conditions due to non-inclusion of factors such as availability of labile OM, and bioturbation that influence the vertical distribution of living benthic foraminifera in the upper and middle slope of Campos Basin.

Amostras de sedimento foram coletadas no talude superior e médio da Bacia de Campos para avaliar a quantidade e qualidade da matéria orgânica (MO) disponíveis no ambiente. A partir de dados geoquímicos, sedimentológicos (tamanho médio de grão e razão silte/argila), e microfaunísticos foi possível identificar diferenças no aporte de MO no talude. O talude superior apresentou valores maiores de conteúdo de carbono orgânico (COT) e lipídeos, elevados valores de densidade, baixos valores de diversidade, riqueza, equitatividade, ALD10, e perfil vertical com densidades maiores, predomínio de espécies epifaunais e/ou infaunais rasos, indicando ambiente com maior produtividade primária sobre maior influência de pulsos de fitodetrito, decorrente da influência do Vórtice de Vitória transportando nutrientes para o mar profundo. Já o talude médio, apresentou menores valores de COT, lipídeos e densidade, maiores valores de diversidade, riqueza, equitatividade, ALD10, predomínio de espécies aglutinantes, indicando condições com menor aporte de nutrientes lábeis. Pelos dados microfaunísticos obtidos, o modelo TROX não pode ser aplicado no talude da Bacia de Campos como avaliador de condições tróficas possivelmente pela não inclusão de fatores como disponibilidade de MO lábil, e bioturbação que influenciam na distribuição vertical dos foraminíferos bentônicos vivos no talude superior e médio da Bacia de Campos. / Sediment samples were collected in the upper and middle slope of Campos Basin to evaluate the quantity and quality of organic matter (OM) available in the environment. From geochemical, sedimentological (grain size, ratio and silt/clay), and microfaunistic data was possible to identify differences in the contribution of OM in slope. The upper slope had higher organic carbon content (TOC) and lipids, high density values, low values of diversity, richness, evenness, ALD10, and vertical profile with higher densities, predominance of epifaunal and/or shallow infaunal species, indicating higher primary productivity environment with greater influence on the pulse of phytodetritus, due to the influence of the Vitória Eddy carrying nutrients to the deep sea. The average slope had lower TOC values, lipids and density, higher values of diversity, richness, evenness, ALD10, predominant agglutinated species, indicating conditions with lower input of labile nutrients. Microfaunistic data obtained cannot be applied by the TROX model to the upper and middle slope of Campos Basin as an evaluator of trophic conditions due to non-inclusion of factors such as availability of labile OM, and bioturbation that influence the vertical distribution of living benthic foraminifera in the upper and middle slope of Campos Basin.

Flow cytometry (FCM) is a well established technique used for enumeration and characterization of marine biological particles, which fulfills the scientific demands of rapid cell counting automation. FCM allows the discrimination of pico- and nanoplankton populations regarding its abundance, cell size, and pigment content both by natural or induced fluorescence. The cyanobacterium Prochlorococcus is widespread in the euphotic zone of the tropical and subtropical oceans, and is considered the smallest and most abundant photosynthetic organism in the planet. Synechococcus, other important cyanobacterium genus present in the picoplankton, is highly diverse and is widely distributed in marine ecosystems from cold and mesotrophic, to warm, open ocean oligotrophic waters. Photosynthetic pico- and nanoeukaryotes display a range of physiologies and life strategies. Although its abundance is generally lower, the larger cell size leads to a significant contribution to the epipelagic community biomass. In this thesis I aimed to investigate the abundance and carbon biomass distribution of heterotrophic bacteria, Prochlorococcus, Synechococcus, autotrophic pico- and nanoeukaryotes in the Southwest Atlantic Ocean off Brazil, their relation to the different water masses and the influence of hydrodynamic (South Atlantic Central Water intrusion) and biological processes (Trichodesmium spp. and Mesodinium rubrum blooms) on such distributions. / A citometria de fluxo (FCM, sigla em inglês) é uma técnica bem estabelecida, usada para enumeração e caracterização de partículas biológicas marinhas, a qual supre a demanda científica por automação rápida de contagem de células. A FCM permite a discriminação de populações pico- e nanoplanctônicas no que concerne à sua abundância, tamanho de célula e pigmentação, tanto por fluorescência natural ou induzida. A cianobactéria Prochlorococcus é amplamente disseminada pela zona eufótica dos oceanos tropicais e subtropicais, sendo considerada o menor e mais abundante organismo fotossintético do planeta. Synechococcus, outro importante gênero de cianobactérias presente no picoplâncton, é diverso e amplamente distribuído em ecossistemas marinhos, de águas frias e mesotróficas à regiões oceânicas quentes e de águas oligotróficas. Pico- e nanoeucariotos fotossintéticos apresentam uma grande variedade de fisiologias e estratégias de vida. Embora a abundância destes grupos seja geralmente menor, o maior tamanho de suas células resulta numa contribuição significante dos mesmos para a biomassa da comunidade epipelágica. Na presente tese eu objetivei investigar a abundância e a distribuição da biomassa de carbono de bactérias heterotróficas, Prochlorococcus, Synechococcus, pico- e nanoeucariotos autotróficos no sudoeste do Oceano Atlântico ao largo do Brasil, sua relação com as diferentes massas d\'água e a influência de processos hidrodinâmicos (como a intrusão da Água Central do Atlântico Sul) e biológicos (florações de Trichodesmium spp. e Mesodinium rubrum) em tais distribuições.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-02-04T14:42:58Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Winder Rodrigues Pires - 2014.pdf: 4503535 bytes, checksum: ddebcb242e4cbf591f49648569b6ee6e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-02-11T11:40:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Winder Rodrigues Pires - 2014.pdf: 4503535 bytes, checksum: ddebcb242e4cbf591f49648569b6ee6e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-11T11:40:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Winder Rodrigues Pires - 2014.pdf: 4503535 bytes, checksum: ddebcb242e4cbf591f49648569b6ee6e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-09-03 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The sugar cane plantation is present in Brazil since the Portuguese colonization beginning. The techniques used by the sugar cane industry toward production of sugar, and then alcohol, were not worried with preservation of natural resources, being associated, along its history, with environment damages as deforestation, fires, natural biodiversity injuries, water and soil contamination, among others. However, with the growth of social mobilization and the State rules around natural resources preservation and environmental quality, since the mid-twentieth century, the field and the industry suffered a technical reformulation to reduce their environmental liabilities and increase its scale production, at the same time. The growing demand for renewable fuels originated with international agreements to reduce emissions of greenhouse gases intensified the expansion of the sugar cane industry in the areas of Cerrado in Brazil. The adequate climate (settings), soil and topographical conditions of this biome- territory made the success and intensification of this plantations, reconfiguring the areas an restructuring the environmental where they were planted. In micro south-west of Goiás State works ten sugar cane industries and another one being implemented. The goal of this study is set up a series of information about this sector, its transformations in a technical way, passing trough different phases (sugar cane, than alcohol and energetic cane at least) until nowadays, when incorporates the fame of sustainable development provider. In this search, the relationships between environmental policies, especially post-Kyoto, and the expansion of the sector are emphasized. Inside this, we sought to understand how the installation of the sugarcane industry in the micro region of south-west Goiás could offer empirical subsidies, from a socio-spatial analysis of territorial dynamics and legitimacy of the environmental speech made by the environmental sector. The methodology used was semi-structured interviews with those responsible for environment part and with the mill workers; lifting of the environmental legislation related; analysis of the studies and reports of environmental impacts of installed plants; and research of environmental public Agencies assessments. It was found that technological standard used by new plants installed in the micro south-west Goiás allowed minimize some environmental liabilities historically rooted to the sector. However, the intensification of sugar cane cultivation at this micro region can result in new impacts as increase the use of water for irrigation, soil compaction and monoculture. It is necessary therefore, an environmental regulation that covers the specific situation of the sector and consider the situations experienced by local actors in order to preserve environmental quality. / A cultura da cana-de-açúcar está presente no Brasil desde o início do processo da colonização portuguesa. As técnicas utilizadas pela atividade canavieira voltadas para produção do açúcar e posteriormente do álcool não tiveram como base uma preocupação com a preservação dos recursos naturais, sendo associadas, ao longo de sua história, a grandes prejuízos ambientais, como desmatamento, queimadas, perda da biodiversidade natural, contaminação hídrica e dos solos, entre outros. No entanto, com o crescimento da mobilização social e do Estado em torno da preservação dos recursos naturais e da qualidade ambiental a partir de meados do século XX, houve uma reformulação técnica por parte deste setor, tanto no campo como na indústria, com o intuito de diminuir seus passivos ambientais ao mesmo tempo em que aumentava sua escala de produção. A crescente demanda por combustíveis renováveis, originada com os acordos internacionais para diminuir as emissões de gases do efeito estufa, intensificou a expansão do setor sucroenergético nas áreas de Cerrados no Brasil. Devido às condições (configurações) climáticas, pedológicas e topográficas deste bioma-território serem adequadas ao cultivo da cana-de-açúcar, houve uma reconfiguração espacial e uma reestruturação socioambiental nos locais onde este plantio foi implantado ou intensificado. Na microrregião do Sudoeste de Goiás, estão em atividades dez usinas sucroenergéticas e uma em fase de implantação. Este trabalho tem como objetivo verificar a estruturação do setor nesta microrregião e as consequências ambientais que se estabeleceram. O trabalho procura estabelecer, inicialmente, um conjunto de informações sobre como o setor foi se transformando na perspectiva técnica, passando por diferentes fases (açucareiro, sucroalcooleiro, sucroenergético), até chegar aos dias atuais, quando incorpora no seu portfólio de “provedor do desenvolvimento sustentável”. Dentro desse itinerário, dá-se ênfase entre as relações das políticas ambientais, especialmente pós-Kyoto, e a expansão do setor. E dentro dessa expansão, procurou-se compreender como a instalação do setor sucroenergético na microrregião do Sudoeste de Goiás poderia oferecer subsídios empíricos, a partir de uma análise socioespacial, da articulação da dinâmica territorial e sua legitimação do discurso ambiental feito pelo setor. Para isso, utilizou-se como metodologia entrevistas semiestruturadas com os responsáveis da parte ambiental e operários das usinas; levantamento da legislação ambiental que abrange o setor; análise dos estudos e relatórios de impactos ambientais das usinas instaladas; e levantamento das autuações ambientais nos órgãos públicos. Verificou-se que o padrão tecnológico utilizado pelas novas usinas instaladas na microrregião Sudoeste de Goiás permitiu minimizar alguns passivos ambientais historicamente arraigados ao setor. No entanto, a intensificação do cultivo canavieiro na microrregião pode acarretar novos impactos, como a intensificação do uso da água para irrigação, a perda de área para outras culturas, compactação dos solos e a monocultura. Faz-se necessária, assim, uma normatização ambiental que abranja as situações específicas desse setor e que leve em consideração as situações vivenciadas pelos agentes locais, no intuito de preservar a qualidade ambiental.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-08-05T19:55:42Z No. of bitstreams: 2 Dissertação- Luciana Oliveira Bento - 2016.pdf: 3533613 bytes, checksum: f67fe73c6af12700e4cba39192ea7c95 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-08T14:23:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação- Luciana Oliveira Bento - 2016.pdf: 3533613 bytes, checksum: f67fe73c6af12700e4cba39192ea7c95 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-08T14:23:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação- Luciana Oliveira Bento - 2016.pdf: 3533613 bytes, checksum: f67fe73c6af12700e4cba39192ea7c95 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The prevalence of isolates of HIV-1 with resistance mutations to antiretroviral drugs should be monitored continuously and in different population groups from geographical regions Brazilian, since Brazil offers universal access to treatment for all people living with HIV and AIDS. Because of the scarcity of related studies in cities of the interior of Brazil, this study aimed to identify the HIV-1 genetic diversity and to evaluate the profile and the prevalence of HIV-1 isolates with mutations in non-antiretroviral (ARV) exposed patients attended at the Specialized Service in STD/AIDS of the Jataí city, southwestern of Goiás state. From January 2015 to January 2016, 57 patients not exposed to ARVs were recruited and whole blood samples were collected. The protease (PR) and about 2/3 of the reverse transcriptase (RT) regions were amplified in 46 samples by "nested"-PCR and sequenced. Resistance mutations to ARVs were determined by Calibrated Population Resistance Tool from Stanford University and HIV-1 subtypes were identified by REGA and phylogenetic inference. In this study, the prevalence of HIV-1 resistant was more frequent among young male population, heterosexual, especially in the reproductive age group and brown race. Among 46 HIV-1 isolates sequenced, 5 had primary resistance mutations to ARVs, giving a prevalence of 10.9%. The mutations were detected both non-nucleoside RT inhibitors-NNRTIs (K103N, E138K/A and V179E) and for PR inhibitors-IP (M46L and T74S). As the K103N mutation confers resistance to high profile ARV composing the first line of treatment (EFV), it was introduced into the second line with IP for this patient. The E138K mutation confers resistance to an ARV not used in Brazil (RPV), allowing the introduction of the first line of treatment with the fixed-dose combination (formulation 3 in 1). Two isolates of HIV-1 were IP resistance mutations (M46L and T74S) but not yet started therapy. In this case, the introduction of the treatment with the formulation 3 to 1 is possible, since the first line has no IP in its formulation. HIV-1 subtype B was the prevalent isolates and three recombinants involving subtypes B and F1 were observed. The subtype C and recombinant forms were first reported in Goiás southwestern region. The moderate prevalence of primary resistance of HIV-1 isolates among patients from southwestern Goiás state and co-circulation of “pure” HIV-1 subtypes and recombinant forms, it is evident the importance of monitoring of newly diagnosed patients to optimize initial therapy, improving clinical management and control of transmission of HIV-1. / A prevalência de isolados do HIV-1 com mutações de resistência aos antirretrovirais deve ser monitorada continuamente nas diferentes regiões geográficas e grupos populacionais brasileiros, visto que o Brasil disponibiliza acesso universal ao tratamento para todas as pessoas vivendo com HIV e aids. Devido à escassez de estudos relacionados em cidades do interior do Brasil, este trabalho teve como objetivo identificar a diversidade genética do HIV-1 e avaliar o perfil e a prevalência de isolados do HIV-1 com mutações, em pacientes não expostos aos antirretrovirais (ARVs) atendidos no Serviço de Atendimento Especializado em DST/aids do município de Jataí, no sudoeste goiano. De janeiro de 2015 a janeiro de 2016, foram recrutados 57 pacientes não expostos aos ARVs e amostras de sangue total foram coletadas. Os genes da protease (PR) e cerca de 2/3 da transcriptase reversa (TR) foram amplificados em 46 amostras pela “nested”-PCR e sequenciados. As mutações de resistência aos ARVs foram determinadas mediante a ferramenta Calibrated Population Resistance Tool da Universidade de Stanford e os subtipos do HIV-1 foram identificados pela análise por REGA e inferência filogenética. Neste estudo, a prevalência da resistência aos antirretrovirais foi mais frequente na população jovem não exposta do sexo masculino, heterossexual, na cor parda, e especialmente nas faixas etárias de 30 a 34 anos, e de 40 a 49 anos de idade. Entre os 46 isolados de HIV-1 sequenciados, 5 apresentaram mutações de resistência primária aos ARVs, conferindo uma prevalência de 10,9%. Foram detectadas mutações tanto para inibidores da TR não nucleosídicos-NNRTI (K103N, E138K/A e V179E) quanto para inibidores da PR-IP (M46L e T74S). Como a mutação K103N confere alto perfil de resistência ao ARV que compõe o esquema de primeira linha de tratamento (EFV), foi introduzida a segunda linha com IP (LPV/r) para este paciente. A mutação E138K confere resistência a um ARV ainda não utilizado no Brasil (RPV), o que permitiu a introdução da primeira linha de tratamento constituída pela dose fixa combinada com TDF+3TC+EFV (formulação 3 em 1). Dois isolados do HIV-1 apresentaram mutações de resistência (M46L e T74S) que conferem resistência ao IP (NFV), mas ainda não iniciaram a terapia. Nesse caso, a introdução do tratamento com a formulação 3 em 1 será possível, já que a primeira linha não tem o IP (NFV) em sua formulação. O subtipo B do HIV-1 foi o prevalente e três isolados recombinantes foram observados, envolvendo os subtipos B e F1. O subtipo C e as formas recombinantes foram relatados pela primeira vez na região do sudoeste goiano. Com a identificação de uma prevalência moderada de isolados de HIV-1 com resistência primária entre pacientes do sudoeste goiano e a co-circulação de subtipos “puros” e mosaicos do HIV-1, fica evidente a importância do monitoramento dos pacientes recém-diagnosticados para a otimização da terapia inicial, melhorando a conduta clínica e o controle da transmissão do HIV-1.

Vibrio cholerae é uma bactéria autóctone do ambiente aquático e pode causar sérios riscos à saúde quando cepas patogênicas são acidentalmente consumidas. V. cholerae se encontra associada aos copépodes em concentrações que podem alcançar mais de 1000 vezes a densidade das bactérias livres na água. Se ingerido, um único copépode pode conter a dose mínima de bactérias necessária para a manifestação da doença. Verificar a presença e a distribuição dos sorogrupos O1 e O139 no complexo estuarino de Santos-Bertioga e plataforma continental adjacente em associação com o zooplâncton e seus distintos grupos taxonômicos foi o objetivo desse trabalho. O zooplâncton (>330 µm) foi coletado e a detecção dos sorogrupos O1 e O139 realizada nas amostras totais e nos táxons mais abundantes através das técnicas DVC-DFA e DFA (Contagem direta de bactérias viáveis e ensaio de imunofluorescência direta). Amostras fixadas em formol foram maceradas e preservadas numa solução tampão estéril, previamente aos experimentos. Para o DVC-DFA, animais vivos foram selecionados, lavados, macerados e uma alíquota transferida para meio de cultura. A presença da bactéria no zooplâncton foi correlacionada a parâmetros abióticos e bióticos. O sorogrupo O1 foi detectado em 88% e O139 em 77% das amostras de plâncton no complexo estuarino de Santos-Bertioga, valores mais altos do que os publicados na literatura mundial para outros estuários. Para a plataforma, a presença dos sorogrupos foi menor devido à salinidade mais elevada. Foram testados isoladamente 43 táxons, pertencentes a 9 filos. Dados inéditos da associação entre Vibrio cholerae e quetognatos, estágios larvas de equinodermos, urocordados e ovos de peixes foram registrados. Este trabalho sugere a existência de um gradiente costa-oceano para V. cholerae aderido ao zooplâncton de águas costeiras e ampla capacidade de V. cholerae O1 e O139 em aderir a diversos táxons do zooplâncton marinho. / Vibrio cholerae is an autochthonous bacterium in the sea and may cause serious health problems when pathogenic strains are accidentally ingested. V. cholerae are found associated with copepods in concentrations up to a thousand times higher than the free bacteria in the water. If ingested, a single copepod may have enough bacteria necessary for human infection. The objective of this study was to verify the presence and distribution of Vibrio cholerae O1 and O139 serogroups over Santos-Bertioga estuarine complex and adjacent continental shelf in association with zooplankton and over its distinct taxa. Zooplankton (>330 µm) sampling was carried out and detection of V. cholerae O1 and O139 assessed in whole samples and on most abundant taxa by the DFA and DVC-DFA (Direct Viable Count and Direct Fluorescence Assay) methods. Briefly, formalin-fixed samples were grinded and preserved in a sterilized buffer solution previously to the experiments. Live animals were selected, washed and grinded and an aliquot transferred to culture media for the DVC-DFA assay. Presence of these bacteria on zooplankton was correlated with physical and biological parameters of the seawater. Serogroup O1 was found on 88% while O139 on 77% of the samples from Santos-Bertioga estuarine complex, values higher than the ones found in other estuaries in global literature. For the adjacent shelf, detection was smaller due to higher salinity. 43 taxa, belonging from 9 phyla were individually tested. Inedited data from the association of V. cholerae and chaetognaths, Urochordata, larval stages of Polychaeta, Echinodermata, and fish eggs were documented. This study suggests the existence of an inshore-offshore gradient in V. cholerae attached to zooplankton from coastal waters and the high ability of V. cholerae O1 and O139 to adhere on diverse marine zooplanktonic taxa.

Flow cytometry (FCM) is a well established technique used for enumeration and characterization of marine biological particles, which fulfills the scientific demands of rapid cell counting automation. FCM allows the discrimination of pico- and nanoplankton populations regarding its abundance, cell size, and pigment content both by natural or induced fluorescence. The cyanobacterium Prochlorococcus is widespread in the euphotic zone of the tropical and subtropical oceans, and is considered the smallest and most abundant photosynthetic organism in the planet. Synechococcus, other important cyanobacterium genus present in the picoplankton, is highly diverse and is widely distributed in marine ecosystems from cold and mesotrophic, to warm, open ocean oligotrophic waters. Photosynthetic pico- and nanoeukaryotes display a range of physiologies and life strategies. Although its abundance is generally lower, the larger cell size leads to a significant contribution to the epipelagic community biomass. In this thesis I aimed to investigate the abundance and carbon biomass distribution of heterotrophic bacteria, Prochlorococcus, Synechococcus, autotrophic pico- and nanoeukaryotes in the Southwest Atlantic Ocean off Brazil, their relation to the different water masses and the influence of hydrodynamic (South Atlantic Central Water intrusion) and biological processes (Trichodesmium spp. and Mesodinium rubrum blooms) on such distributions. / A citometria de fluxo (FCM, sigla em inglês) é uma técnica bem estabelecida, usada para enumeração e caracterização de partículas biológicas marinhas, a qual supre a demanda científica por automação rápida de contagem de células. A FCM permite a discriminação de populações pico- e nanoplanctônicas no que concerne à sua abundância, tamanho de célula e pigmentação, tanto por fluorescência natural ou induzida. A cianobactéria Prochlorococcus é amplamente disseminada pela zona eufótica dos oceanos tropicais e subtropicais, sendo considerada o menor e mais abundante organismo fotossintético do planeta. Synechococcus, outro importante gênero de cianobactérias presente no picoplâncton, é diverso e amplamente distribuído em ecossistemas marinhos, de águas frias e mesotróficas à regiões oceânicas quentes e de águas oligotróficas. Pico- e nanoeucariotos fotossintéticos apresentam uma grande variedade de fisiologias e estratégias de vida. Embora a abundância destes grupos seja geralmente menor, o maior tamanho de suas células resulta numa contribuição significante dos mesmos para a biomassa da comunidade epipelágica. Na presente tese eu objetivei investigar a abundância e a distribuição da biomassa de carbono de bactérias heterotróficas, Prochlorococcus, Synechococcus, pico- e nanoeucariotos autotróficos no sudoeste do Oceano Atlântico ao largo do Brasil, sua relação com as diferentes massas d\'água e a influência de processos hidrodinâmicos (como a intrusão da Água Central do Atlântico Sul) e biológicos (florações de Trichodesmium spp. e Mesodinium rubrum) em tais distribuições.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:31:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edson Bertoldo.pdf: 5608945 bytes, checksum: fd55c97dda4b7d20b2fa9438b702daf3 (MD5) Previous issue date: 2010-12-15 / This study identifies paleoenvironmental records in the remaining at planed surface VIII, in Pato Branco (SW PR), more precisely in conservation area (A.R.I.E. do Buriti) by analysis of palynomorphs in a bog, characterization of the surface formations and the 14C dating method. Throughout the testimony of 130 cm, 37 different taxa were identified, which were separated into five ecological categories (trees, shrubs, ground herbs, algae and fern spores). The dating estimated suggests that the base of the bog was formed approximately 13,700 years BP, a period related to the Last Glacial Maximum (LGM). At that time the head of drainage would not have a connection to the piped drainage waterway of Independence river, local base level. According to the data obtained, we can affirm that in the region of the study area during the transition from the Pleistocene / Holocene to the present, there are no records of savannah, only grassland areas in the Pleistocene, inferred by the presence of ground herbs, especially Borreria and Asteraceae found in 12,700 years BP 14C (estimated) and total absence of algae and pollen grains of tree species, suggesting drier hydrological regime. Occasionally, high precipitation phenomeno occurred on the slopes and promoted the degradation of soil horizons in the upper slope (nose), promoting the deposition of colluvial layers until the new water regime, wetter, allowing the establishment of a herbaceous vegetation accompanied by ferns, mainly in the lower areas. In about 10,600 years BP 14C (est.), maintenance of high humidity is established and high precipitation caused the water table surface in the hollow constantly accelerating the hidromorfization paleohorizonte A humic, and developing in the rainy seasons, a small pond in the central axis of the headboard. Fact evidenced by the presence of algae and a significant expansion of Araucaria angustifolia, which requires an annual rainfall exceeding 1,400 mm.yr-1, without a dry season. The predominant vegetation is replaced by the Araucaria Forest and Atlantic Rain Forest composed of genres trees, ground herbs and ferns. The maximum expansion of the Araucaria Forest is logged about 6,880 years BP 14C (est.), face the increase of all taxa recorded, mainly from Araucaria. The presence of algae was more pronounced, again suggesting the occurrence of a blade of water conserved by an abundant and regular rainfall. In the years that followed, probably to 1,060 years BP 14C (est.), a reduction of vegetation as a general rule, changing only in the present with the planting of araucaria after the creation of A.R.I.E. do Buriti. Sometime in this period, the hollow head of the drainage began to develop perennial drainage channels, allowing efficient drainage at the head of drainage, reducing moisture levels in the bog / O presente estudo identifica registros paleoambientais no remanescente de superfície aplainada VIII, no município de Pato Branco (SW PR), mais precisamente na Unidade de Conservação - A.R.I.E. do Buriti, através da análise de palinomorfos de uma turfeira, caracterização das formações superficiais e datação pelo método do 14C. Ao longo de um testemunho de 130 cm, foram identificados 37 táxons diferentes, os quais foram separados em cinco categorias ecológicas (árvores, arbustos, ervas terrestres, algas e esporos de pteridófitas). A datação estimada sugere que a base da turfeira formou-se à aproximadamente 13.700 anos A.P, período relacionado ao Último Máximo Glacial (UMG). Nessa época a cabeceira de drenagem não teria uma ligação canalizada com a rede de drenagem do rio Independência, nível de base local. De acordo com os dados obtidos, pode-se afirmar que na região da área de estudo, durante a passagem do Pleistoceno/Holoceno até o presente, não há registros de cerrado, apenas de áreas campestres no Pleistoceno, inferido pela presença de ervas terrestres, principalmente Asteraceae e Borreria encontrados em 12.700 anos A.P. (est.) e total ausência de algas e grãos de pólen de espécies arbóreas, sugerindo regime hidrológico mais seco. Eventualmente, fenômenos de alta precipitação ocorreram nas encostas e promoveram a degradação dos horizontes de solo na alta encosta (nose), promovendo a deposição de camadas coluviais até o novo regime hídrico, mais úmido, propiciando a instalação de uma vegetação herbácea acompanhada de pteridófitas, principalmente nas áreas mais baixas. Há cerca de 10.600 anos A.P. 14C (est.), a manutenção da elevação de umidade se estabelece e altos índices de precipitação fizeram com que o lençol freático aflorasse no hollow constantemente, acelerando a hidromorfização do paleohorizonte A húmico e desenvolvendo, nas estações chuvosas, uma pequena lagoa no eixo central da cabeceira. Fato evidenciado pela presença de algas e por uma expansão significativa de Araucaria angustifolia, a qual necessita de um regime pluviométrico superior a 1.400 mm.ano-1, sem estação seca definida. A vegetação predominante passa a ser de Floresta Ombrófila Mista e Floresta Pluvial Atlântica composta por gêneros arbóreos, ervas terrestres e pteridófitas. A máxima expansão da Floresta Ombrófila Mista é registrada a cerca de 6.880 anos A.P. (est.), face o aumento de todos os táxons registrados, principalmente Araucaria. A presença de algas ficou mais acentuada, sugerindo novamente a ocorrência de uma lâmina de água, conservada por um regime pluviométrico abundante e regular. Nos anos que se seguiram, provavelmente à 1.060 anos A.P. (est.), ocorreu uma redução da vegetação de modo generalizado, modificando-se apenas no presente com o plantio de araucárias após a criação da A.R.I.E. do Buriti. Em algum momento desse período o hollow da cabeceira de drenagem passou a desenvolver canais de drenagem perenes, que permitiram a drenagem eficiente na cabeceira, diminuindo os níveis de umidade da turfeira

We use four current meter mooring records and quasi-synoptic hydrographic observations in conjunction with a one-dimensional quasi-geostrophic (QG) linear stability model to investigate the downstream changes in the Brazil Current (BC) System off the southeast Brazil (22°S-28°S) as well as its implications. The dataset depicts the downstream thickening of the BC: Its vertical extension increases from 350 m at 22.7°S to 800 m at 27.9°S. Most of this deepening occurs between 25.5°S and 27.9°S, and it is likely linked to the Santos bifurcation. To the south of that bifurcation, the BC transport is increased by at least 5 Sv. Moreover, the analysis of the water column average kinetic energy (IKE) and its barotropic/baroclinic partition show that the Santos bifurcation is associated with a substantial increase in the barotropic component of the BC System: The IKE is, on average, 70 % baroclinic to the north and becomes 63 % barotropic to the south of that bifurcation. The water column average eddy kinetic energy (IEKE) and its ratio to the IKE quantitatively reveal the conspicuous mesoscale activity associated to the BC off the southeast Brazil; accordingly, the IEKE accounts for (30-60)% of the IKE. The linear stability model predicts southwestward-propagating fastest-growing waves [~(180-190) km] within 25.5°S-27.9°S and quasi-standing most-unstable waves (~230 km) at 22.7°S, roughly consistent with observations and previous work. We also assess the ability of the QG modes and surface QG (SQG) solutions to represent the vertical structure of the sub-inertial time-varying flow in the southwestern Atlantic. At two moorings, which present a sharp near-surface decay in the vertical structure of the 1st empirical orthogonal function (EOF) of current meter time series, the SQG solutions are consistent with the data, accounting for up to 85 % of the 1st EOF variance. The SQG solutions are nonetheless indistinguishable from a four QG mode representation. In contrast, at a third mooring that do not present such sharp-decay, the vertical structure of the 1st EOF is fairly well-captured by the traditional barotropic/1st baroclinic mode combination, which accounts for 91 % of its variance. We argue that such vertical structures may be associated with the type of instability experimented by the mean flow in each region. \"Charney-like\" or surface-intensified \"Phillips-like\" instabilities may rationalize the observed SQG-like vertical structures depicted at two moorings. Mid-depthintensified \"Phillips-like\" instabilities are consistent with a two QG mode representation at a third mooring. / Séries temporais correntográficas, observações hidrográficas quase-sinóticas e um modelo linear quase-geostrófico (QG) são combinados com o propósito de investigar as transformações no Sistema Corrente do Brasil (CB) ao largo da costa sudeste (22°S-28°S) e suas implicações. O conjunto de dados revela o espessamento vertical da CB, que ocupa os 350 m superiores da coluna de água em 22,7°S e atinge 800 m em 27,9°S. Parte significativa deste espessamento ocorre entre 25,5°S e 27,9°S, provavelmente relacionado à Bifurcação de Santos. Ao sul desta bifurcação, o transporte da CB é pelo menos 5 Sv superior. Ademais, a análise da energia cinética média na coluna de água (ECM) e sua partição entre componentes barotrópica e baroclínica revela que a Bifurcação de Santos está associada ao aumento significativo da componente barotrópica do Sistema CB. A ECM é, em média, 70% baroclínica ao norte da bifurcação, tornando-se 63% barotrópica ao sul desta. A análise da energia cinética turbulenta média na coluna de água (ECTM) corrobora o importante papel da atividade de mesoescala do Sistema CB ao largo do sudeste do Brasil: A ECTM é responsável por (30-60)% da ECM. O modelo de estabilidade linear prevê ondas com maiores taxas de crescimento [~(180-190) km] que se propagam para sudoeste entre 25,5°S-27,9°S. Em 22,7°S, as ondas mais instáveis (~230 km) crescem essencialmente sem propagação, consistente com as observações e também com informações presentes na literatura. A habilidade dos modos QG e das soluções QG superficiais (QGS) em representar a variabilidade subinercial no Atlântico Sudoeste também é investigada. Em dois fundeios, a estrutura vertical da 1ª função empírica ortogonal (FOE) apresenta um decaimento agudo. Este decaimento é consistente com soluções QGS, que contêm até 85% da variância da 1ª FOE. No entanto, estas soluções convergem para uma representação por quatro modos QG. Por outro lado, a estrutura vertical da 1ª FOE em um terceiro fundeio não apresenta tal decaimento marcante. Consequentemente, a 1ª FOE é bem representada pela tradicional combinação dos modos barotrópico/1o baroclínico. Argumentamos que estas estruturas podem estar associadas ao tipo de instabilidade experimentada pelo escoamento médio em cada região. Instabilidades tipo \"Charney\" ou \"Phillips\" (intensificadas em superfície) são consistentes com estruturas verticais tipo QGS presentes em dois fundeios. Instabilidades tipo \"Phillips\" (intensificadas em meia água) são consistentes com a representação por dois modos QG em um terceiro fundeio

Made available in DSpace on 2017-05-12T14:41:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ivonete_Plein.pdf: 1503154 bytes, checksum: c6e03d2e6e0d66dea0d832baa1f3d486 (MD5) Previous issue date: 2013-06-10 / With the purpose of creating strategies for strengthening and preservation of family farms, farmers southwestern Paraná, supported by local leaders, inspired by French initiatives, implemented the Rural Family Houses as a form of education possible to improve the quality of life in agriculture, offering their children a proper education, based on their reality and to come to meet their needs by providing their children the prospect of remaining in rural areas, fully exercising their citizenship and work with dignity. Understanding this model is important, since the Rural Family Houses have spread throughout Brazil as a strategy for rural development, keeping the bond with the land and local culture, while at the same time offering training for young farmers through their realities. Therefore, the aim of this research was to investigate the possibilities and limitations of Teaching through the Pedagogy of Alternation in Rural Family Houses in Paraná (the Regional I ARCAFAR-SUL) in the current period. The research methods used were a literature review, secondary data analysis and field research (documents and questionnaires). As main conclusions highlight that: the Pedagogy of Alternation can be a major contribution to the integral formation, making an effort in the different situations that education somehow need to be more specific, where the local reality can be considered in their wisdom and life experiences exploited as subsidies for vocational training and human. In these places, like the communities of family farmers, the Pedagogy of Alternation makes a difference. Their specific methodological principles and foundations contribute to human development and the environment, thus achieving its two main objectives. However, it is not the solution to all problems of education everywhere. It is unique to specific places, as it has been to the Southwest of Paraná. / Com o propósito de criar estratégias de fortalecimento e preservação da agricultura familiar, agricultores do Sudoeste do Paraná, apoiados por lideranças locais, inspirados em iniciativas francesas, implementaram as Casas Familiares Rurais como uma forma de educação possível para melhorar a qualidade de vida na agricultura, oferecendo a seus filhos uma formação adequada, baseada em sua realidade e que viesse ao encontro de suas necessidades proporcionando a seus filhos perspectivas de permanecer no meio rural, exercendo plenamente sua cidadania com trabalho e dignidade. Entender esse modelo é fundamental, já que as Casas Familiares Rurais têm-se espalhado pelo Brasil como uma estratégia de desenvolvimento do espaço rural, mantendo o vínculo com a terra e a cultura local, e, ao mesmo tempo, oferecendo formação para os jovens agricultores através das suas realidades. Portanto, o objetivo desta pesquisa foi investigar as possibilidades e limitações do Ensino através da Pedagogia da Alternância nas Casas Familiares Rurais no Sudoeste do Paraná (Regional I da ARCAFAR-SUL) no período atual. Os métodos de investigação utilizados foram a pesquisa bibliográfica, análise de dados secundários e pesquisa de campo (documental e questionários). Como principais conclusões destaca-se que: a Pedagogia da Alternância pode ser um grande contributo para a formação integral, fazendo-se um esforço nas diferentes situações em que a educação de alguma forma precisa ser mais específica, onde a realidade local possa ser considerada em sua sabedoria e as experiências vivenciais aproveitadas como subsídios de formação profissional e humana. Nestes lugares, como nas comunidades de agricultores familiares, a Pedagogia da Alternância faz diferença. Suas especificidades metodológicas, seus princípios e fundamentos contribuem para o desenvolvimento humano e do meio, atingindo assim seus dois grandes objetivos. Porém, ela não é a solução para todos os problemas de educação em todos os lugares. Ela é singular, para lugares específicos, como tem sido para o Sudoeste do Paraná.