La modélisation du savoir-faire des systématiciens à l'aide des Bases de Connaissances, offre le moyen de mieux comprendre, préserver et transmettre aux générations futures les connaissances sur la biodiversité des espèces. Pour construire une base de connaissances, il est nécessaire de disposer de méthodes de gestion des connaissances, de modèles de représentation et d'outils informatiques adaptés d'une part, à la complexité des concepts manipulés par les systématiciens et d'autre part, à la richesse des descriptions des spécimens représentatifs des espèces. La plate-forme logicielle proposée, appelée IKBS, offre aux systématiciens un environnement pour la construction de bases de connaissances évolutives, ainsi qu'une méthodologie itérative fondée sur l'approche expérimentale de nature inductive des naturalistes. Le paradigme objet utilisé pour sa réalisation favorise l'extensibilité et la réutilisabilité des composants logiciels développés. IKBS associé aux technologies multimédia et hypertextuelles a été utilisé par un groupe d'experts pour la construction d'une "base de connaissances sur les coraux des Mascareignes".

Les recherches sur la génétique des populations et l'évolution des organismes marins relèvent d'une thématique au sens propre, du fait qu'elles sont envisagées essentiellement à travers les conséquences d'une phase larvaire planctonique, trait original et quasi-général chez ces organismes, dans un environnement océanique qui est à la fois dense, dispersif, homogène horizontalement et stratifié verticalement. La phase larvaire est synonyme de fécondité et de potentiel de dispersion sans équivalents en milieu terrestre. Ces caractéristiques autorisent à leur tour des dynamiques de reproduction extrêmes, ainsi qu'une gamme étendue de combinaisons génétiques à chaque génération. Mes recherches sont présentées selon trois axes principaux. Axe 1 : structure géographique des espèces marines en relation avec leur phase de dispersion ; axe 2 : identification des barrières au flux génique en milieu dispersif ; axe 3 : systématique moléculaire. Les objectifs en sont à la fois fondamentaux et appliqués. Les résultats acquis sur la structure géographique et la phylogéographie des espèces économiquement importantes ont des implications en matière de gestion des " stocks ", mais aussi vis-à-vis de la conservation des espèces et des écosystèmes.

Dans ce travail de thèse, nous avons effectué l'étude systématique, bio-écologique et chimique des ascidies dans les golfes de Tunis et de Hammamet et dans deux lagunes (Bizerte et El Bibane). Nous avons prélevé par plongée en scaphandre autonome, entre janvier 2006 et Janvier 2008, 70 espèces d'ascidies dont la majorité sont des espèces à affinités Atlantoméditerranéenne et parmi eux 6 espèces ont été signalées pour la première fois en Tunisie. Ces espèces présentent une variabilité spatiale et temporelle. L'analyse de correspondance entre les ascidies et les communautés étudiées a permis de mettre en relief une relation entre les communautés sous pressions environnementales et certaines espèces d'ascidies. Les ascidies présentent une corrélation entre les stratégies morphologiques, les différentes familles, la forme coloniale ou solitaire et le type de substrat. Ce dernier apparaît comme le facteur physique le plus important dans la distribution des ascidies. Ainsi, la majorité des espèces ont été récoltées dans l'herbier de Posidonie qui constitue le substrat idéale pour la fixation des ascidies. D'autre part, la profondeur intervient indirectement dans la variation spatio-temporelle des facteurs environnementaux, en effet elle joue un rôle important dans la distribution des stratégies d'adaptations des ascidies. La zone la plus riche en faune ascidiologique a été entre 6 et 18 m. Outre cette variabilité spatiale, les ascidies en Tunisie montrent une variabilité saisonnière qui se distingue par une richesse spécifique importante en faune ascidiologique pendant la saison estivale. Outre ces volets biologiques et écologiques, nous avons procédé à une étude chimique de deux espèces d'ascidies coloniales qui sont Cystodytes dellachiajei et Aplidium conicum. Cette étude a montré l'existence chez l'espèce Cystodytes dellachiajei de couleur violette de cinque alcaloïdes qui sont : la shermilamine B (SB), la désacetylshermilamine B (daSB), la kuanoniamine D (KD), la désacétylkuanoniamine D (daKD) et un nouveau composé : un isomère de l'ascididémine. Pour Aplidium conicum, l'analyse des chromatogrammes de deux couleurs beige et orangé révèle des profils chimiques différents. En effet, pour chaque chromotype étudié nous avons trouvé un profil spécifique qui est différent d'un site à l'autre.

Cette étude comparative est une révision de la famille des Harrimaniidae basée sur les caractères morphologiques d'espèces connues et nouvelles provenant des collections de William E. Ritter, Theodore H. Bullock et Kandula P. Rao rassemblées au cours du 20e siècle. Les descriptions présentées ici portent le total des genres de cinq à neuf par l'ajout de Horstia n. gen., Mesoglossus n. gen., Ritteria n. gen et Saxipendium, un genre auparavant attribué à la famille monospécifique des Saxipendidae. Le nombre d'espèces est porté à 34 par la description de cinq nouvelles espèces du Pacifique oriental: Horstia kincaidi, Mesoglossus intermedius, Mesoglossus macginitiei, Protoglossus mackiei et Ritteria ambigua. La description d'une sixième espèce, Stereobalanus willeyi Ritter et Davis, 1904 (nomen nudum) est présentée ici pour la première fois, ainsi qu'une description abrégée de Saxipendium coronatum. Quatre espèces précédemment attribuées au genre Saccoglossus sont transférées au genre Mesoglossus: M. bournei, M. caraibicus, M. gurneyi, et M. pygmaeus et Saccoglossus borealis est transféré au genre Harrimania. Une hypothèse phylogénétique sur la famille des Harrimaniidae est émise, présentant l'évolution possible des caractères morphologiques au sein du groupe. Finalement, des notes sur la distribution géographique étendue mais discontinue de plusieurs espèces suggère que les entéropneustes auraient pu avoir une distribution ancienne continue et plus grande qui aurait été fragmentée par la suite. / This comparative study is a revision of the family Harrimaniidae based on morphological characters of described and undescribed species from the collections of William E. Ritter, Theodore H. Bullock and Kandula P. Rao, gathered in the 20th century. The new descriptions bring the total number of genera to nine by the addition of Horstia n. gen., Mesoglossus n. gen., Ritteria n. gen and Saxipendium, a genus previously assigned to the monospecific family Saxipendidae The number of species is increased to 34, resulting from the description of five new species from the eastern Pacific: Horstia kincaidi, Mesoglossus intermedius, Mesoglossus macginitiei, Protoglossus mackiei and Ritteria ambigua. The description of a sixth species, Stereobalanus willeyi Ritter et Davis, 1904 (nomen nudum) is presented here for the first time and a brief description of Saxipendium coronatum is also presented. Four species previously assigned to the genus Saccoglossus are transfered to the genus Mesoglossus: M. bournei, M. caraibicus, M. gurneyi, and M. pygmaeus, while Saccoglossus borealis is transfered to the genus Harrimania. A phylogenetic hypothesis on the Harrimaniidae is postulated presenting the possible evolution of morphological characters within the group. Finally, notes on the wide but spotty distribution of several species suggest that the Enteropneusta may have once had a wider distribution that has since become fragmented.

La Nouvelle-Calédonie est un archipel du Pacifique Sud-Ouest. Sa flore est riche, unique, et dysharmonique. L'origine temporelle et géographique de cette flore constitue une des problématiques majeures des botanistes. Une étude systématique a été menée sur le genre Psychotria (Rubiaceae), et ses genres alliés (clade Psychotrieae-Palicoureeae), afin de comprendre les modes d'établissement et de diversification des plantes dans l'archipel. Les deux tribus comportent 86 espèces néo-calédoniennes réparties entre les genres Geophila (une espèce), Margaritopsis (quatre espèces) et Psychotria (81 espèces). L'étude taxonomique a permis de déterminer pour chacun d'eux les noms d'espèces valides, et d'identifier 26 espèces nouvelles de Psychotria et Margaritopsis. Neuf combinaisons et noms spécifiques nouveaux sont proposés.La Nouvelle-Calédonie a été colonisée au moins quatre fois par les Psychotrieae-Palicoureeae. Bien que leurs arrivées soient simultanées durant le Néogène, ces quatre lignées ont des histoires évolutives différentes à mettre en lien avec leurs modes propres d'établissement et de diversification. Le genre Geophila n'a pas diversifié. Les Margaritopsis ont eu une diversification modeste, à l'image des autres espèces des îles du Pacifique. Les Psychotria clade NC1 constituent une lignée relique, ayant probablement subit une extinction, et qui se serait uniquement maintenue dans les maquis miniers. Les Psychotria cladeNC2 constituent la plus large, jeune et rapide radiation de plantes de la Nouvelle-Calédonie, probablement originaire des forêts humides d'Australie.Le clade NC2 est en pleine expansion évolutive. Il est constitué de 12 lignées internes. Sa capacité à tolérer les substrats ultramafiques, acquise avant son arrivée dans l'archipel, a favorisé son établissement local. Sa large diversité a probablement différentes origines : une labilité vis-à-vis de la nature des substrats géologiques, des changements éventuels de pollinisateurs, un changement de niche écologique amorcé, lié à l'acquisition d'adaptations à la sécheresse et à l'avènement d'un climat plus aride en Nouvelle-Calédonie durant le Pliocène.

Dans un contexte d’émergence ou de réémergence des maladies à transmission vectorielle, certaines espèces de Culicoides (Diptera : Ceratopogonidae) sont impliquées dans la transmission de certains virus (Reoviridae : Orbivirus) et de nématodes (Onchocercidae : Mansonella) en région Afrotropicale. Cependant, le schéma systématique et taxonomique ainsi que la bio-écologie des espèces d’intérêt vétérinaire restent à explorer. Ce travail de taxonomie intégrative a pour objectifs de réaliser (i) une révision systématique et taxonomique des espèces appartenant à des sous-genres et des groupes d’intérêt à partir de phylogénie moléculaire multi-marqueur et de délimitation d’espèces, et (ii) de développer des outils moléculaires pour l’étude de la bio-écologie des espèces d’intérêt vétérinaire et de la dynamique de leurs populations d’immatures. Nos résultats mettent en évidence (i) la présence de trois clades monophylétiques le groupe d’espèces Imicola, le groupe d’espèces Milnei et le sous-genre Remmia, (ii) une nouvelle espèce pour la science nommée C. sp. #22 et affiliée au sous-genre Avaritia, groupe Imicola, (iii) la présence d’une nouvelle espèce non-décrite nommée C. sp. #54 appartenant au groupe d’espèces Dasyops, sous-genre Avaritia, (iii) d’affilier les groupes d’espèces Similis et Neavei au sous-genre Synhelea et, (iv) de poser l’hypothèse d’une présence d’espèces cryptiques au sein de C. oxystoma (sous-genre Remmia). D’un point de vue bio-écologique, le travail réalisé combinant suivi entomologique et identification moléculaire avec une librairie de séquences barcodes a permis de décrire le comportement trophique de C. imicola, C. kingi et C. oxystoma ainsi que leurs habitats larvaires dans des environnements équins de la zone des Niayes au Sénégal. L’ensemble de ce travail permet de compléter le corpus de connaissances sur le genre Culicoides en région Afrotropicale afin d’améliorer la compréhension de l’épidémiologie des pathogènes transmis et proposer des pistes de recherches pour mieux contrôler les populations immatures et adultes des espèces vectrices afin de mieux anticiper et prévenir des évènements sanitaires. / In a context of emergence or re-emergence of vector-borne diseases, certain species of Culicoides (Diptera: Ceratopogonidae) are involved in the transmission of certain viruses (Reoviridae: Orbivirus) and nematodes (Onchocercidae: Mansonella) in the Afrotropical region. However, the systematic and taxonomic schemes as well as the bio-ecology of species of veterinary interest remain to be explored. This work of integrative taxonomy aims to achieve (i) a systematic and taxonomic revision of species belonging to subgenera and groups of veterinary interest using a multi-marker molecular phylogeny and species delineation, and (ii) to develop molecular tools for studying the bioecology of species of veterinary interest and dynamics of their immature populations. Our results show (i) the presence of three monophyletic clades, the Imicola group, the Milnei group and the subgenus Remmia, (ii) a new species for science named C. sp. # 22 and affiliated into the subgenus Avaritia, Imicola group, (iii) the presence of a new undescribed species named C. sp. # 54 belonging to the Dasyops group, subgenus Avaritia, (iii) affiliating the Similis and Neavei species groups to the subgenus Synhelea, and (iv) cryptic species within C. oxystoma (subgenus Remmia). From a bioecological point of view, this work combining entomological follow-up and molecular identification with a library of barcode sequences allowed to describe the trophic behavior of C. imicola, C. kingi and C. oxystoma as well as their larval habitats in equine environments of the Niayes area in Senegal. This work completes the corpus of knowledge about the genus Culicoides in the Afrotropical region to improve our knowledge on the epidemiology of the transmitted pathogens and to propose research tracks to better control the immature and adult populations of the vector species in order to better anticipate and prevent Culicoides-borne diseases outbreaks.

Parmi les grillons de la sous-famille Eneopterinae, Cardiodactylus Saussure, 1878 (Orthoptera : Eneopterinae : Lebinthini) est le genre avec le plus grand nombre d’espèces et le plus largement distribué. Il comprend 82 espèces organisées en deux groupes d'espèces (groupes Noveaguineae et Efordi). L’aire de distribution des espèces englobe des centaines d'îles et de territoires allant des côtes de l'Asie du Sud-Est aux îles Samoa. Les espèces de Cardiodactylus présentent des patrons de distribution contrastés, certaines étant fortement endémiques tandis que d'autres sont distribuées dans toute la région du Pacifique occidental. Cette diversité, conjuguée au riche contexte géologique des régions de l'Asie du Sud-Est et du Pacifique, offre de grandes opportunités pour aborder des questions biogéographiques et étudier la dynamique de la diversification insulaire. Malgré les efforts récents pour améliorer les connaissances taxonomiques de Cardiodactylus, la diversité du genre est telle que de nombreuses nouvelles espèces restent encore à découvrir. Dans un premier temps, des études taxonomiques fondées sur des données morphologiques, moléculaires et acoustiques ont permis de décrire cinq nouvelles espèces de Nouvelle-Guinée orientale et de redécrire deux espèces. Dans un second temps, la phylogénie moléculaire de Cardiodactylus a été reconstruite. Les résultats soutiennent la monophylie du genre, des espèces testées et du groupe d'espèces Novaeguineae. Le groupe d'espèces Efordi est clairement paraphylétique, ce qui tend à confirmer la présence d'un troisième groupe d'espèces, comme le suggère l'étude taxonomique. Selon l'analyse de biogéographie historique, l'origine de Cardiodactylus se situe dans le Pacifique Ouest au cours de l'Éocène moyen (environ 42 Ma). Cardiodactylus a ensuite colonisé l'Asie du Sud-Est depuis l'Est vers l’Ouest via une zone de transition correspondant à la Nouvelle-Guinée, et ce en empruntant trois chemins indépendants : Java, Sulawesi et les Philippines. Ce travail montre que la grande diversité de Cardiodactylus en Asie du Sud-Est s’est mise en place au Miocène à travers l'accumulation d’événements de diversification in situ et d'événements d’immigration. Dans un troisième temps, un protocole et des jeux d'amorces ont été mis au point pour amplifier les mitogénomes de grillons. La méthode a été illustrée par l'amplification du mitogénome de l'espèce Cardiodactylus muiri Otte, 2007 par une approche de PCR longue associée au séquençage de nouvelle génération. Le but de ce travail est d'obtenir des données moléculaires plus informatives à faible coût, mais avec une couverture taxonomique élevée pour de futures reconstructions phylogénétiques. / Among the crickets of the subfamily Eneopterinae, Cardiodactylus Saussure, 1878 (Orthoptera: Eneopterinae: Lebinthini) is the most speciose and widely distributed genus. It consists of 82 species organized in two species groups (Noveaguineae and Efordi species groups). The species distributions encompass hundreds of islands and territories ranging from the coasts of Southeast Asia to the Samoan islands. Cardiodactylus species show contrastive distribution patterns, some being highly endemic while others are distributed in the whole Western Pacific region. This diversity coupled with the rich geological context of the Southeast Asian and Pacific regions, offers great opportunities to address biogeographical questions and investigate the dynamics of diversification in islands.Despite recent efforts to improve the taxonomical knowledge of Cardiodactylus, its diversity is so high that many new species still continue to be discovered. In a first stage, taxonomic studies based on morphological, molecular and acoustic data led to the description of five new species from Eastern New Guinea and to the redescription of two species. In a second stage, the molecular phylogeny of Cardiodactylus was reconstructed. The results support the monophyly of the genus, of the tested species, and of the Novaeguineae species group. The Efordi species group is clearly found paraphyletic, which tends to confirm the presence of a third species group, as suggested by the taxonomical study. According to the historical biogeographic analysis, the origin of Cardiodactylus was recovered in the Western Pacific during the Mid-Eocene (ca. 42 Ma). Through the transition zone of New Guinea, Cardiodactylus colonized Southeast Asia from East to West through three independent passageways: Java, Sulawesi and the Philippines. This work showed that the high diversity of Southeast Asian Cardiodactylus took place during the Miocene, as a result of accumulation of in situ diversification and immigration events. In a third stage, a protocol and sets of primers were designed to amplify mitogenomes in crickets. The method was exemplified by amplifying the mitogenome of the species Cardiodactylus muiri Otte, 2007 with a long-PCR approach combined with Next-Generation Sequencing. The purpose of this work is to obtain more informative molecular data with relatively low-cost but high taxonomic coverage for future phylogenetic reconstructions.

Chez les eucaryotes, le complexe kinase TORC1 (Target Of Rapamycin Complex 1) joue un rôle central dans le contrôle de la croissance cellulaire. Il intègre de nombreux signaux et agit en modulant l’état de phosphorylation de différents effecteurs, principalement des protéines impliquées dans des processus anaboliques ou cataboliques. Parmi ces signaux, on distingue notamment les acides aminés. Ces derniers agissent sur TORC1 via l’action de protéines de la famille des GTPases Rag, elles-mêmes régulées par des facteurs GEF et GAP. Des études récentes sur des cellules mammifères ont mis en évidence l’existence de senseurs d'acides aminés, capables de moduler l'activité des facteurs GEF et GAP. Chez la levure, ces senseurs restent toutefois inconnus. Chez la levure, TORC1 contrôle la fonction de plusieurs protéines y compris des transporteurs d'acides aminés de la membrane plasmique, comme la perméase générale des acides aminés, Gap1. C’est via sa branche de signalisation Tap2-PP2A/Npr1 que TORC1 contrôle l'ubiquitylation et le trafic intracellulaire de ces transporteurs, et ceci, en modulant l’activité d’adaptateurs de type α-arrestine de l'ubiquitine-ligase Rsp5.Dans ce travail, nous avons combiné des approches de génétique et de biochimie chez la levure afin d’étudier la régulation de TORC1 et son rôle dans l'endocytose en réponse au substrat de Gap1, la perméase générale des acide aminés, et de Can1, la perméase spécifique de l'arginine.Dans la première et la deuxième partie de ce travail, je décris ma contribution à l'étude qui visait à élucider le mécanisme d'ubiquitylation de Gap1 et de Can1 induite par le transport de leurs substrats. Le modèle déduit de ce travail propose que cette régulation négative n'est pas due à l'accumulation intracellulaire des acides aminés transportés, mais à un changement conformationnel des perméases, couplé à la réaction de transport et qui fait apparaitre un état ouvert vers l'intérieur, entraînant ainsi le remodelage de la queue cytoplasmique N-terminale et en conséquence l’exposition d'un site de liaison caché pour des adaptateurs de Rsp5 de type α-arrestine. Dans le cas de Can1, l'α-arrestine principale impliquée est Art1 et doit être stimulée via TORC1. Cependant, les α-arrestines Bul1/2, impliquées dans la régulation négative de Gap1, sont capables de promouvoir son ubiquitylation induite par le transport de substrat, qu'elles aient ou non été stimulées via TORC1. Nous fournissons également des preuves que d'autres perméases d'acides aminés spécifiques (Mup1, Lyp1) sont régulées par leurs propres substrats d'une manière similaire à Can1.Dans la dernière partie de ce travail, nous avons étudié le mécanisme par lequel le transport des acides aminés chez la levure stimule l'activité de TORC1 via les GTPases Rag, Gtr1 et Gtr2. En analysant en Western Blot l’état de phosphorylation de Npr1 et Sch9, deux kinases effectrices de TORC1, nous avons révélé que le signal général qui déclenche l'activation Gtr-dépendante de TORC1 est le flux de H+ couplé au transport des acides aminés généré par des symporteurs H+/acide-aminés. Dans ce contexte, nous avons identifié la pompe à H+ de la membrane plasmique, Pma1, comme étant un régulateur essentiel de l'activité de TORC1. L'activité de transport de Pma1 étant elle-même stimulée par une augmentation des protons cytosoliques, nous suggérons que Pma1 module TORC1 par un effet de signalisation.Collectivement, nos résultats fournissent de nouvelles perspectives sur le rôle central de TORC1 dans le contrôle des transporteurs de nutriments chez la levure. / The Target of Rapamycin Complex 1 (TORC1) plays a pivotal role in controlling cell growth in probably all eukaryotic organisms. It operates by integrating upstream signals like growth factors and nutrients to modulate by phosphorylation multiple downstream effectors, mostly proteins involved in anabolic or catabolic processes. Among the various signals that impinge on TORC1, nitrogen sources, in particular amino acids are primordial input signals modulating TORC1 activity through the conserved Rag family of GTPases. Recent studies in mammals have shed the light on the existence of various sensor systems of internal amino acids that modulate the activity of the GEF and GAP factors acting on the Rag GTPases. Yet, in yeast the amino acid sensing events acting upstream of the Rag GTPase (named Gtr1 and Gtr2) regulators remain poorly known. Yeast TORC1 controls the function of many proteins including several plasma membrane amino acid transporters, e.g. Gap1, the general amino acid permease. It does so via the Tap2-PP2A/Npr1-signaling branch that controls the ubiquitylation and intracellular trafficking of these proteins through regulation of α-arrestin-type adaptors of the ubiquitin-ligase Rsp5. In this work, we combined yeast genetics and biochemical assays to study TORC1 regulation by amino acids and to illustrate the role of TORC1 in substrate-transport mediated endocytosis of Gap1 and of the arginine specific permease, Can1. In the first and second part of this work, I describe my contribution to the study that aimed at elucidating the mechanism of substrate-transport-mediated ubiquitylation and endocytosis of Gap1 and Can1. The model deduced from this work states that this down-regulation is not due to intracellular accumulation of the transported amino acids, but to substrate-transport-induced conformational transition of the transporters to an inward-facing state, resulting in remodeling of their N-terminal cytoplasmic tail and subsequent exposure of a hidden binding site for α-arrestin-like adaptors of Rsp5. In the case of Can1, the main α-arrestin involved is Art1 and needs be stimulated via TORC1. The Bul1/2 α-arrestins involved in Gap1 down-regulation, however, are able to promote its substrate-transport-elicited ubiquitylation regardless of whether they have been stimulated via TORC1 or not. We also provide evidence that other specific amino acid permeases (Mup1, Lyp1) are regulated by their own substrates in a manner similar to Can1. In the last part of this work, we investigated how amino acid uptake by yeast cells triggers Rag/Gtr-dependent activation of TORC1. By assaying the phosphorylation on western blot of two TORC1-downstream effectors, the Npr1 and Sch9 kinases, we showed that uptake by Gap1 of ß-alanine, which cannot be used as a nitrogen source, unexpectedly stimulates TORC1 activity. Further analysis of this response allowed us to show that the general signal triggering Gtr-dependent activation of TORC1 in response to amino acid uptake is the influx of H+ coupled to transport via H+/amino-acid symporters. Furthermore, we identified Pma1, the H+-ATPase establishing the H+ gradient at the plasma membrane, as a central player of this control of TORC1 activity. As the transport activity of Pma1 itself is known to be stimulated by an increase of cytosolic protons, we suggest that Pma1 modulates TORC1 via signaling. Altogether, our results provide new insights on the central role of TORC1 in control of nutrient permeases in yeast. / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Cette étude comparative est une révision de la famille des Harrimaniidae basée sur les caractères morphologiques d'espèces connues et nouvelles provenant des collections de William E. Ritter, Theodore H. Bullock et Kandula P. Rao rassemblées au cours du 20e siècle. Les descriptions présentées ici portent le total des genres de cinq à neuf par l'ajout de Horstia n. gen., Mesoglossus n. gen., Ritteria n. gen et Saxipendium, un genre auparavant attribué à la famille monospécifique des Saxipendidae. Le nombre d'espèces est porté à 34 par la description de cinq nouvelles espèces du Pacifique oriental: Horstia kincaidi, Mesoglossus intermedius, Mesoglossus macginitiei, Protoglossus mackiei et Ritteria ambigua. La description d'une sixième espèce, Stereobalanus willeyi Ritter et Davis, 1904 (nomen nudum) est présentée ici pour la première fois, ainsi qu'une description abrégée de Saxipendium coronatum. Quatre espèces précédemment attribuées au genre Saccoglossus sont transférées au genre Mesoglossus: M. bournei, M. caraibicus, M. gurneyi, et M. pygmaeus et Saccoglossus borealis est transféré au genre Harrimania. Une hypothèse phylogénétique sur la famille des Harrimaniidae est émise, présentant l'évolution possible des caractères morphologiques au sein du groupe. Finalement, des notes sur la distribution géographique étendue mais discontinue de plusieurs espèces suggère que les entéropneustes auraient pu avoir une distribution ancienne continue et plus grande qui aurait été fragmentée par la suite. / This comparative study is a revision of the family Harrimaniidae based on morphological characters of described and undescribed species from the collections of William E. Ritter, Theodore H. Bullock and Kandula P. Rao, gathered in the 20th century. The new descriptions bring the total number of genera to nine by the addition of Horstia n. gen., Mesoglossus n. gen., Ritteria n. gen and Saxipendium, a genus previously assigned to the monospecific family Saxipendidae The number of species is increased to 34, resulting from the description of five new species from the eastern Pacific: Horstia kincaidi, Mesoglossus intermedius, Mesoglossus macginitiei, Protoglossus mackiei and Ritteria ambigua. The description of a sixth species, Stereobalanus willeyi Ritter et Davis, 1904 (nomen nudum) is presented here for the first time and a brief description of Saxipendium coronatum is also presented. Four species previously assigned to the genus Saccoglossus are transfered to the genus Mesoglossus: M. bournei, M. caraibicus, M. gurneyi, and M. pygmaeus, while Saccoglossus borealis is transfered to the genus Harrimania. A phylogenetic hypothesis on the Harrimaniidae is postulated presenting the possible evolution of morphological characters within the group. Finally, notes on the wide but spotty distribution of several species suggest that the Enteropneusta may have once had a wider distribution that has since become fragmented.

Nous avons réalisé deux expériences afin d'évaluer l'efficacité de la désensibilisation systématique combinée à la musique et déterminer la contribution exacte de la musique. Dans la première expérience, nous avons comparé l'effet de la désensibilisation systématique combinée à la musique méditative in vivo et l’effet de la désensibilisation systématique combinée à une musique relaxante enregistrée. La comparaison porte sur les niveaux d’envie pendant l'exposition à des stimuli associées à la substance, sur la réactivité à l’envie dans la vie quotidienne, sur les pensées permissives et les croyances liées à l’envie ainsi que sur la dépression et l'anxiété. La deuxième expérience a consisté à identifier la contribution exacte de la musique au contre-conditionnement de stimuli associés à la substance ainsi qu’à l'amélioration des autres variables. Les résultats de la première expérience ont révélé que les deux formes de traitement provoquent une diminution de la réactivité aux stimuli associées à la substance et ont des influences positives importantes sur les autres variables. La deuxième expérience a démontré que l'écoute de la musique relaxante induit des réductions significatives de l’envie pendant l'exposition à des stimuli associées à la substance et qu’elle améliore les croyances liées au comportement compulsif. En conclusion, ces études ont démontré la contribution significative de la musique à la désensibilisation systématique pour le traitement de la dépendance aux substances. Elle ouvre ainsi de nouvelles voies pour l'utilisation de la musique comme un outil thérapeutique complémentaire pour la réhabilitation des personnes dépendantes aux substances. / Two experiments were conducted in order to examine the effectiveness of music-assisted systematic desensitization and determine the exact contribution of listening to music in the therapeutic process. The first experiment examined the effect of live-played meditation music and recorded relaxing music combined with systematic desensitization, on craving responses during exposure to substance-conditioned cues, craving reactivity in everyday life, permissive thoughts on substance use, craving beliefs, depression and anxiety. The second experiment investigated the exact therapeutic contribution of listening to recorded relaxing music in the counterconditioning of cues related to substance use and the extinction of the implicated craving responses, as well as in the amelioration of everyday life craving reactivity, craving beliefs, depression and anxiety. The results of the first trial revealed an emphatic amelioration of craving intensity in response to cues conditioned with substance use and significant or close to statistical significance positive influences on the other variables by both forms of treatment. The findings of the second experiment suggested that listening to recorded relaxing music accounts for significant reductions in craving intensity during exposure to substance-conditioned cues and in craving beliefs associated with compulsive behaviour. In conclusion, this study showed the significant therapeutic contribution of music to in vitro cue-exposure therapy for substance addiction treatment and opens new avenues for future exploration and use of music as a complementary therapeutic tool in the rehabilitation of substance addicted individuals.