Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-09T14:42:24Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-09T14:44:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-09T14:44:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Population genomics studies in Neotropical species are scarce, however, they are of great importance for the understanding of the neutral and adaptive variations, in order to develop strategies of management and conservation for the species. In this context our objective was to verify the role of natural selection in the distribution of populations diversity in Handroanthus serratifolius and Tabebuia aurea. Here, we study population genomics based in sequence capture using 24,751 pre-developed probes. For H serratifolius were sampled c. 64,000 SNPs in 144 individuals from 16 populations. For T aurea were sampled c. 18,000 SNPs in 48 individuals from 6 populations. Genetic differentiation was high (FST = 0.194, p <0.001) in H. serratifolius and intermediate (FST = 0.144, p <0.001) in T. aurea. The inbreeding coefficient was low in both species, however, in three populations of H. serratifolius it was intermediate or high. The genetic structure of populations presented two genetic groups for the populations sampled in the two species. H. serratifolius with high genetic differentiation and T. aurea with admixture in all populations. We did not find SNPs outliers in the distribution of FST values, due to the wide distribution of values found for the populations of the two species. In the search for correlation between environmental variables and changes in allelic frequency H. serratifolius presented only three SNPs, inside six genes and T. aurea presented 16 SNPs, inside 25 genes. The functional annotation of these genes showed relationship with molecular processes, transposable elements and one in T. aurea related to resistance to diseases. In conclusion, our data show a selection signal in H. serratifolius for only three loci with local adaptation signal. In T. aurea our data show a greater number of locos (16 locos) with local adaptation signal. / Estudos de genômica de populações em espécies Neotropicais são escassos, no entanto, apresentam grande importância para o entendimento das variações neutras e adaptativas, a fim de desenvolver estratégias de manejo e conservação das espécies. Nesse contexto nosso objetivo foi verificar o papel da seleção natural na distribuição da diversidade de populações de Handroanthus serratifolius e Tabebuia aurea. Aqui, nós estudamos a genômica de populações baseado em sequence capture utilizando 24.751 sondas previamente desenvolvidas. Para H serratifolius foram amostrados c. 64.000 SNPs em 144 indivíduos de 16 populações. Para T aurea foram amostrados c. 18.000 SNPs em 48 indivíduos de 6 populações. A diferenciação genética foi alta (FST = 0,194, p < 0,001) em H. serratifolius e intermediária (FST = 0,144, p < 0,001) em T. aurea. O coeficiente de endogamia foi baixo nas duas espécies, no entanto, em três populações de H. serratifolius foi intermediária ou alta. A estrutura genética das populações apresentou dois grupos genéticos para as populações amostradas nas duas espécies. H. serratifolius com alta diferenciação genética e T. aurea com mistura em todas as populações. Nós não encontramos SNPs outliers na distribuição de valores de FST, devido a ampla distribuição de valores encontrada para as populações das duas espécies. Na busca por correlação entre variáveis ambientais e mudanças na frequência alélica H. serratifolius apresentou apenas três SNPs, presentes em seis genes e T. aurea apresentou 16 SNPs, presentes em 25 genes. A anotação funcional desses genes mostrou relação com processos moleculares, elementos transponíveis e um em T. aurea ligado a resistência a doenças. Concluindo, nossos dados apresentam sinal de seleção em H. serratifolius para apenas três locos com sinal de adaptação local. Em T. aurea nossos dados mostram maior número de locos (16 locos) com sinal de adaptação local.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Aleteia Lang.pdf: 170301 bytes, checksum: de6d7b985b43e81964fc7b2e7e171471 (MD5) Previous issue date: 2008-07-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The use of fertilizers of controlled liberation is made one of the modern techniques in the raising of Young plants. However, there are few reports of its effects on the growing in native forest species in the area of ciliar dominion. It has been aimed to try different fertilizers of controlled liberation with a convencional fertilizer in the establishment of young in the field of Anadenanthera colubrine and Tabebuia avellanedae. The young plants were taken from the municipal nursey of Palotina-Pr, and they were planted in an area of ciliar dominion, by fertilization in the hole, with Basacote 3M, Basacote 6M, Basacote 9M, mineral manure in the formulation 16-08-12 (N, P2O5, K2O) with dose of 55 grams in each hole and witness. The experiment was conducted by outlining casual blocks, with subdivided portions, in which the factors were made by three treatments of Basacote, one of mineral manure and witness. It was evaluated the following features: diameter of the coleto length, number of leaves, foliar area, dried biomass of the root, dried biomass area, length of the root, and average of Dickson`s. Along 90 days of cultivation, the tested fertilization Basacote 3M influenced on the increment of the diameter of the coleto off Anadenanthera colubrine. With the increments of the length there was statistical difference amoing the species, with larger average (58, 96 cm) for the young plants of Tabebuia avellanedae and smaller average (48,70cm) to Anadenanthera colubrine. For the number of leaves, youngs plants of Anadenanthera colubrine showed better averages (150, 30). After 180 days of the plantations the young plants which received the treatment Basacote 9M, got larger average (113,37). Whereas, after 270 days of the plantation, the species Tabebuia avellanedae, got better results to the Basacote 3M in increments of the length. In the 360 days of the plantation, the differences happened among the with bigger increments off coleto (7,48mm) to young plants of Tabebuia avellenedae. The destructive analyses dried biomass of root, didn t answer the treatments, showing difference between the species with larger average to Tabebuia avellanedae. Dried biomass of the airy part, both the species didn t answer the treatments. The length of the root, answered in a negative way to the treatments, where it happened differences only among the species with larger average to young plants off Anandenanthera colubrine. To variable foliar area, only after the 360 days off the plantation, young plants off Tabebuia avellanedae, showed larger average, without interference off the treatments. On the Dickson s, both species didn t suffer big affects / O uso de fertilizantes de liberação controlada constitui-se em umas das modernas técnicas na produção de mudas. Porém, existem poucos relatos de seus efeitos sobre crescimento em espécies florestais nativas em área de domínio ciliar. Objetivou-se testar diferentes fertilizantes de liberação controlada com um fertilizante convencional no estabelecimento de mudas a campo de Anadenanthera colubrina e Tabebuia avellanedae. As mudas foram adquiridas no viveiro municipal de Palotina-Pr, e plantadas em uma área de domínio ciliar, mediante adubação na cova, com Basacote 3M, Basacote 6M, Basacote 9M, adubo mineral na formulação 16-8-12 (N, P2O5, K2O), com dose de 55 gramas por cova e testemunha. O experimento foi conduzido delineamento blocos casualizados, com parcelas subdivididas, sendo os fatores constituídos por três tratamentos de Basacote, um de adubo mineral e testemunha. Foram avaliadas as seguintes características: diâmetro do coleto, comprimento, número de folhas, área foliar, biomassa seca da raiz, biomassa seca aérea, comprimento de raiz, e índice de Dickson. Ao longo de 90 dias do cultivo, a fertilização Basacote 3M testada influenciou no incremento do diâmetro do coleto de Anadenanthera colubrina. Com os incrementos de comprimento houve diferença estatística entre espécies, com maior média (58,96 cm) para mudas de Tabebuia avellanedae e menor média (48,70 cm) para Anadenanthera colubrina. Para número de folhas, mudas de Anadenanthera colubrina apresentaram melhor médias (150,30). Após 180 dias do plantio, mudas que receberam o tratamento Basacote 9M obtiveram maior média (113,37). Enquanto que aos 270 dias após o plantio, a espécie Tabebuia avellanedae, obteve maiores respostas ao Basacote 3M em incrementos de comprimento. Aos 360 dias após o plantio, a diferenças foram entre as espécies com maiores incrementos de coleto (7,48mm) para mudas de Tabebuia avellanedae. A biomassa seca da raiz, não respondeu aos tratamentos, apresentando diferença entre as espécies com maior média para Tabebuia avellanedae. Biomassa seca da parte aérea, ambas as espécies não responderam aos tratamentos. O comprimento de raiz respondeu negativamente aos tratamentos, havendo diferenças apenas entre as espécies com maior média para mudas de Anadenanthera colubrina. Para variável área foliar, somente após os 360 dias do plantio, mudas de Tabebuia avellanedae, apresentaram maior média, sem interferência dos tratamentos. O índice de Dickson de ambas as espécies resultaram em ausência de efeitos significativos Esse resultado indica não existir alteração na alocação proporcional do crescimento entre os sistemas aéreos e radiculares das espécies estudadas em função dos tipos e dos tempos de liberação dos fertilizantes testados. Portanto a mortalidade de mudas após o plantio com fertilizantes de liberação lenta não induziu maior sobrevivência, os maiores incrementos para comprimento da muda, número de folhas e diâmetro do coleto foram aos 180 dias após o plantio, para o fertilizante (Basacote 3M) avaliado aos 90 dias após o plantio de mudas de Anadenanthera colubrina expressaram maior diâmetro de coleto e maior número de folhas. E as mudas de Anadenanthera colubrina foram mais responsivas aos fertilizantes de liberação lenta

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2017-05-04T17:34:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertação-31 05 2016 correções da biblioteca (atualizada).pdf: 2843933 bytes, checksum: 1003152372d1c305370bd514f8eae798 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-04T17:34:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertação-31 05 2016 correções da biblioteca (atualizada).pdf: 2843933 bytes, checksum: 1003152372d1c305370bd514f8eae798 (MD5) Previous issue date: 2016-03-09 / A β-lapachona é uma naftoquinona (3,4-dihidro-2,2-dimetil-2H-naftol[1,2-b]pirano-5,6-diona) de peso molecular 243,3 g.mol-1 presente na Tabebuia avellanedae Lor, árvore conhecida como ipê roxo ou pau d’arco roxo. Esta naftoquinona é uma substância que pode ser obtida por uma semi-síntese a partir do lapachol bem como do lomatiol. Este bioativo apresenta múltiplos efeitos farmacológicos, como antibacteriano, antifúngico, antiviral, anti-inflamatório e anti-proliferativo. Segundo o sistema de classificação biofarmacêutica, a β-lapachona (BL ou β-lap) é classificada como classe II apresentando baixa solubilidade e alta permeabilidade. Desta forma, faz necessário um estudo de incremento de solubilidade aquosa. O objetivo deste trabalho foi caracterizar físico-quimicamente os complexos propostos utilizando dois polímeros: o dendrímero bis-MPA (DEN) e a cucurbit[6]urila (CUC). O presente estudo mostra duas metodologias para a formação de complexos entre a β-lapachona /dendrímero (BLD) e β-lapachona /cucurbiturila (BLC), visando o aumento da solubilidade deste fármaco através de interações intermoleculares e suas respectivas caracterizações físico-químicas. O complexo com o dendrímero foi preparado a partir de uma relação massa/massa de 3(fármaco):1 (carreador) variando o tempo de adsorção de 1, 3 e 7 dias. Para os complexos com a cucurbiturila uma relação molar 1:1 foi estabelecida para a formação dos complexos de inclusão com BL, variando o período de adsorção em 1, 3 e 7 dias. Após o período de agitação, os complexos BLD e BLC foram evaporados e secos a temperatura ambiente para posterior caracterização. Os complexos obtidos foram caracterizados por cromatografia líquida de alta eficiência, ultravioleta na região do visível, espectroscopia de absorção vibracional na região do infravermelho, espectrometria de ressonância magnética nuclear de hidrogênio, análise termogravimétrica, análise calorimétrica diferencial, difratometria de raio-X e microscopia eletrônica de varredura. Para o complexo BLD ficou evidente que a variação no tempo de adsorção não interferiu na quantidade de produto formado ou nas propriedades do complexo obtido. Os resultados das caracterizações mostram que o BLDD1 e o BLCD1 foram formados de acordo com os dados espectroscópicos e espectrométricos que demonstram variações nos sinais de BL quando complexado. Houve uma mudança na cristalinidade da BL, a qual era bastante cristalina, para um material mais amorfo com morfologia distinta do fármaco isolado. Os resultados das caracterizações térmicas exibiram, para os complexos, uma maior estabilidade térmica da β-lap complexada (BLDD e BLCD) e menor energia de fusão, quando comparado com β-lapachona livre. Essas informações também sugerem uma diminuição na cristalinidade do complexo o que é indicativo para o incremento de solubilidade. Desta forma propôs-se a caracterização físico-química como um indício de melhoria na solubilidade da β-lapachona através da formação de complexos entre BL e dois carreadores distintos e suas contribuições para estudos de uma possível formulação farmacêutica futura. / The β-naphthoquinone lapachol is a (3,4-dihydro-2,2-dimethyl-2H-naphthol [1,2-b] pyran-5,6-dione) molecular weight of 243,3g / mol present in Tabebuia avellanedae Lor, tree known as purple ipe or pau d'purple bow. This naphthoquinone is a substance that can be obtained by semi-synthesis from lapachol well as lomatiol. This bioactive has multiple pharmacological effects such as antibacterial, antifungal, antiviral, anti-inflammatory and anti-proliferative. According to biopharmaceutical classification system, the β-lapachone (BL or β-LAP) is classified as class II presenting low solubility and high permeability. Thus, an increase aqueous solubility study is necessary. The aim of this study was to characterize chemically-physical proposed complexes using two polymers: the bis-MPA dendrimer (DEN) and cucurbit[6]uril (CUC). This study shows two methods for the formation of complexes between β-lapachone / dendrimer (BLD) and β-lapachone / cucurbituril (BLC), in order to increase the solubility of the drug through intermolecular interactions and their physicochemical characterizations. The complex with the dendrimer was prepared from a mass / mass 3 (drug): 1 (carrier) varying the time for adsorption of 1, 3 and 7 days. For cucurbituril complexes with a molar ratio of 1: 1 was established for the formation of inclusion complexes with BL varying the adsorption period at 1, 3 and 7 days. After the stirring period, the BLC and BLD complexes were evaporated and dried at room temperature for further characterization. The obtained compounds were characterized by high-performance liquid chromatography, ultraviolet into the visible region spectroscopy, vibrational absorption in the infrared, nuclear magnetic resonance spectrometry of hydrogen, thermogravimetric analysis, differential scanning calorimetry, X-ray diffraction and electron microscopy scanning. For BLD complex it was evident that the variation in the adsorption time not interfere in the amount of complex formed or the product properties obtained. The results of the characterizations show that BLDD1 and BLCD1 were formed in accordance with spectroscopic and spectrometric data showing variations in signals when complexed BL. There was a change in the crystallinity of the BL, which was very clear, to a more amorphous material with distinct morphology of the drug alone. The results showed the thermal characterizations for the complex, greater thermal stability of the complexed β-LAP (BLDD and BLCD) and less fusion energy, compared with β-lapachone free. This information also suggests a decrease in crystallinity of the complex which is an indication to increase solubility. Thus it was proposed to physicochemical characterization as a better indication of the solubility of β-lapachone by forming complexes between BL and two different carriers and their contributions to studies of possible future pharmaceutical formulation.

A Mata Atlântica representa um dos Biomas mais diversos do Planeta. No entanto, ainda pouco se sabe sobre os processos que levaram à alta diversidade de plantas nesta região. A maior parte dos estudos na Mata Atlântica trata este Bioma de forma ampla, sem considerar os diversos tipos vegetacionais encontrados na região. Apesar de ser dominado pela Floresta Pluvial Montana, este Bioma ainda inclui outros tipos vegetacionais periféricos, tais como: as Florestas Pluviais Baixo Montanas, Florestas Pluviais de Altitude, Florestas Pluviais Ripária, Florestas Pluviais em Manchas e as Florestas Paludosas Litorâneas, popularmente conhecidas como \"caxetais\". O nome \"caxetal\" foi dado devido à predominância da espécie Tabebuia Cassinoides (Lam.) DC., a qual é popularmente conhecida como \"caxeta\". Esta formação vegetal tem distribuição restrita a áreas com solos permanentemente encharcados do norte de Santa Catarina até o norte do Espírito Santo, onde ocorre de forma naturalmente fragmentada, formando ilhas ao longo de sua extensão de ocorrência. Populações com distribuição fragmentada são modelos em potencial para estudos de genética de populações, visto que a delimitação geográfica de populações naturais é um dos maiores problemas para estudos dessa natureza. Diante desse cenário, a presente tese teve como objetivo: (1) verificar como a distribuição geográfica da espécie arbórea T. cassinoides, agregada, bem delimitada e fragmentada na paisagem, pode influenciar na estruturação da diversidade genética em nível local; (2) caracterizar o grau de variabilidade genética inter e intrapopulacional em populações naturais de T. cassinoides ao longo da Mata Atlântica; e, (3) determinar a estrutura filogeográfica de T. cassinoides. Para tanto foram analisados dados de oito marcadores de microssatélites nucleares, além do sequenciamento da região trnC-ycf6 do DNA plastidial (cpDNA). Os dados genéticos obtidos foram primeiramente utilizados para o conhecimento da diversidade genética e estruturação da população em nível local, na região de Iguape (SP). Nossos resultados sugerem que a fragmentação dessas populações é somente geográfica, devido a suas necessidades edáficas, bem como que o modo de distribuição agregada e naturalmente fragmentada não indica a subdivisão genética das mesmas. A caracterização da variabilidade genética inter e intra-populacional em populações naturais de T. cassinoides ao longo de toda sua área de distribuição, com base nos marcadores de microssatélites nucleares indicou que a espécie possui baixos níveis de diversidade genética, e que 61% dessa diversidade é encontrada dentro das populações e 39% entre elas. Além disso, estes resultados evidenciaram significativos níveis de correlação entre distância genética e distância geográfica, sugerindo assim a presença de isolamento por distância. Nossos resultados indicam ainda a região geográfica do Rio de Janeiro como centro de diversidade para T. cassinoides. Uma forte estruturação genética foi encontrada para os dados de DNA nuclear e plastidial. Os resultados da análise de cpDNA, sugerem que a espécie T. cassinoides está dividida em três grupos filogeográficos: Norte, Central e Sul. Já os resultados de DNA nuclear apenas se diferenciam dos anteriores por considerar os grupos filogeográficos Norte e Central como um único grupo. Dados de modelagem de nicho ecológico foram gerados e associados com análises demográficas e de estruturação populacional visando um melhor entendimento dos padrões filogeográficos da espécie e inferências sobre a ocorrência de possíveis alterações populacionais ocorridas nos últimos 21 mil anos (Last Glacial Maximum - LGM) e 6 mil anos (Holocene Optimum - HO). Os resultados destas análises sugerem a estabilidade do tamanho populacional e das possíveis áreas de ocorrência de T. cassinoides no LGM e no HO. Assim, aventamos a hipótese de que a quebra de fluxo gênico entre as regiões filogeográficas propostas no presente estudo sejam anteriores ao LGM. Esse padrão converge com resultados encontrados para outras espécies de comunidades vegetais periféricas e diverge daqueles encontrados para espécies do núcleo principal da Floresta Ombrófila Densa, evidenciando a importância de estudos com espécies de diferentes comunidades vegetais da Floresta Atlântica para um melhor entendimento dos processos que moldaram a evolução das espécies nesse complexo bioma / The Atlantic Forest is one of the most biodiverse biomes on the planet. Nevertheless, little is known about the processes that have engendered such highly diverse plantlife in this region. Most studies on the Atlantic Forest approach the biome from an ample scope, without considering the various vegetational types that are found therein. Though broadly termed Montane Rain Forest, this biome also contains other peripheral forms of vegetation, such as Submontane Rain Forest, Cloud Forest, Riparian Rainforest, Rainforest Patches and Coastal Swamp Forest, commonly known as \"caxetais\" (plur). The term \"caxetal\" (sing) derives from the overwhelming predominance of Tabebuia cassinoides (Lam.) DC., the \"caxeta\". This naturally fragmented vegetational formation is found in patches on permanently waterlogged soils all the way from the north of Santa Catarina state up to northern most Espírito Santo. Populations with fragmented distribution are potential models for populational genetics studies, seen as the geographical delimitation of natural populations is one of the biggest problems facing research of this kind. In the light of this, the present thesis aims to: (1) verify how the aggregated, well-delimited and fragmented geographical distribution of the tree species T. cassinoides might influence the structuring of genetic diversity on a local level; (2) ascertain the degree of inter and intra-populational genetic variability in natural T. cassinoides populations throughout the Atlantic Forest, and (3) determine the phylogeographical structure of T. cassinoides. In order to achieve this we analyzed data for eight nuclear microsatellite markers and sequencing for the trnC-ycf6 region of plastidial DNA (cpDNA). The genetic data obtained was first used to generate knowledge concerning genetic diversity and populational structuring on a local level, in the Iguape (São Paulo state) region. Our results suggest that the fragmentation of these populations is geographical only, due to their edaphic needs, and that this locally aggregated and naturally fragmented mode of distribution does not indicate genetic subdivision. The characterization of inter and intra-populational genetic variability for T. cassinoides throughout its range of distribution, based on nuclear microsatellite markers, showed that the species has low levels of genetic diversity and that 61% of this diversity is encountered within, and 39% among, the populations. Furthermore, the results evince high and significant levels of correlation between genetic and geographic distance, thus suggesting that this isolation is distance-related. Our findings also indicate that the geographical region of Rio de Janeiro is the center of T. cassinoides diversity. Considerable genetic structuring was identified from the nuclear and plastidial DNA, though with partial distinctions. Results for cpDNA analysis suggest that T. cassinoides is divided into three phylogeographical groups: North, Central and South. Nuclear DNA analysis, however, took the Central and North phylogeographical groups to be one and the same. Ecological niche modeling data were generated and associated with demographic analyses and findings on populational structuring so that we could determine the species\' phylogeographical patterns and infer the occurrence of possible populational alterations during two distinct periods: 21 thousand years ago (the Last Glacial Minimum) and over the last 6 thousand years (Holocene Optimum - HO). The results of these analyses suggest that population sizes remained stable in possible areas of occurrence during the LGM and HO. Based on these findings we suggest the hypotheses that the stemming of gene flow among the phylogeographical regions proposed by this study predates the LGM. This pattern converges with results found for other species of peripheral vegetal communities but diverges from those for species from the Dense Coastal Hydrophilic Forest nucleus. As such, our research underscores the importance of further studies with different vegetal communities that comprise the Atlantic Forest in order to foster a better understanding of the processes that shaped the evolution of species in this complex biome

A Mata Atlântica representa um dos Biomas mais diversos do Planeta. No entanto, ainda pouco se sabe sobre os processos que levaram à alta diversidade de plantas nesta região. A maior parte dos estudos na Mata Atlântica trata este Bioma de forma ampla, sem considerar os diversos tipos vegetacionais encontrados na região. Apesar de ser dominado pela Floresta Pluvial Montana, este Bioma ainda inclui outros tipos vegetacionais periféricos, tais como: as Florestas Pluviais Baixo Montanas, Florestas Pluviais de Altitude, Florestas Pluviais Ripária, Florestas Pluviais em Manchas e as Florestas Paludosas Litorâneas, popularmente conhecidas como \"caxetais\". O nome \"caxetal\" foi dado devido à predominância da espécie Tabebuia Cassinoides (Lam.) DC., a qual é popularmente conhecida como \"caxeta\". Esta formação vegetal tem distribuição restrita a áreas com solos permanentemente encharcados do norte de Santa Catarina até o norte do Espírito Santo, onde ocorre de forma naturalmente fragmentada, formando ilhas ao longo de sua extensão de ocorrência. Populações com distribuição fragmentada são modelos em potencial para estudos de genética de populações, visto que a delimitação geográfica de populações naturais é um dos maiores problemas para estudos dessa natureza. Diante desse cenário, a presente tese teve como objetivo: (1) verificar como a distribuição geográfica da espécie arbórea T. cassinoides, agregada, bem delimitada e fragmentada na paisagem, pode influenciar na estruturação da diversidade genética em nível local; (2) caracterizar o grau de variabilidade genética inter e intrapopulacional em populações naturais de T. cassinoides ao longo da Mata Atlântica; e, (3) determinar a estrutura filogeográfica de T. cassinoides. Para tanto foram analisados dados de oito marcadores de microssatélites nucleares, além do sequenciamento da região trnC-ycf6 do DNA plastidial (cpDNA). Os dados genéticos obtidos foram primeiramente utilizados para o conhecimento da diversidade genética e estruturação da população em nível local, na região de Iguape (SP). Nossos resultados sugerem que a fragmentação dessas populações é somente geográfica, devido a suas necessidades edáficas, bem como que o modo de distribuição agregada e naturalmente fragmentada não indica a subdivisão genética das mesmas. A caracterização da variabilidade genética inter e intra-populacional em populações naturais de T. cassinoides ao longo de toda sua área de distribuição, com base nos marcadores de microssatélites nucleares indicou que a espécie possui baixos níveis de diversidade genética, e que 61% dessa diversidade é encontrada dentro das populações e 39% entre elas. Além disso, estes resultados evidenciaram significativos níveis de correlação entre distância genética e distância geográfica, sugerindo assim a presença de isolamento por distância. Nossos resultados indicam ainda a região geográfica do Rio de Janeiro como centro de diversidade para T. cassinoides. Uma forte estruturação genética foi encontrada para os dados de DNA nuclear e plastidial. Os resultados da análise de cpDNA, sugerem que a espécie T. cassinoides está dividida em três grupos filogeográficos: Norte, Central e Sul. Já os resultados de DNA nuclear apenas se diferenciam dos anteriores por considerar os grupos filogeográficos Norte e Central como um único grupo. Dados de modelagem de nicho ecológico foram gerados e associados com análises demográficas e de estruturação populacional visando um melhor entendimento dos padrões filogeográficos da espécie e inferências sobre a ocorrência de possíveis alterações populacionais ocorridas nos últimos 21 mil anos (Last Glacial Maximum - LGM) e 6 mil anos (Holocene Optimum - HO). Os resultados destas análises sugerem a estabilidade do tamanho populacional e das possíveis áreas de ocorrência de T. cassinoides no LGM e no HO. Assim, aventamos a hipótese de que a quebra de fluxo gênico entre as regiões filogeográficas propostas no presente estudo sejam anteriores ao LGM. Esse padrão converge com resultados encontrados para outras espécies de comunidades vegetais periféricas e diverge daqueles encontrados para espécies do núcleo principal da Floresta Ombrófila Densa, evidenciando a importância de estudos com espécies de diferentes comunidades vegetais da Floresta Atlântica para um melhor entendimento dos processos que moldaram a evolução das espécies nesse complexo bioma / The Atlantic Forest is one of the most biodiverse biomes on the planet. Nevertheless, little is known about the processes that have engendered such highly diverse plantlife in this region. Most studies on the Atlantic Forest approach the biome from an ample scope, without considering the various vegetational types that are found therein. Though broadly termed Montane Rain Forest, this biome also contains other peripheral forms of vegetation, such as Submontane Rain Forest, Cloud Forest, Riparian Rainforest, Rainforest Patches and Coastal Swamp Forest, commonly known as \"caxetais\" (plur). The term \"caxetal\" (sing) derives from the overwhelming predominance of Tabebuia cassinoides (Lam.) DC., the \"caxeta\". This naturally fragmented vegetational formation is found in patches on permanently waterlogged soils all the way from the north of Santa Catarina state up to northern most Espírito Santo. Populations with fragmented distribution are potential models for populational genetics studies, seen as the geographical delimitation of natural populations is one of the biggest problems facing research of this kind. In the light of this, the present thesis aims to: (1) verify how the aggregated, well-delimited and fragmented geographical distribution of the tree species T. cassinoides might influence the structuring of genetic diversity on a local level; (2) ascertain the degree of inter and intra-populational genetic variability in natural T. cassinoides populations throughout the Atlantic Forest, and (3) determine the phylogeographical structure of T. cassinoides. In order to achieve this we analyzed data for eight nuclear microsatellite markers and sequencing for the trnC-ycf6 region of plastidial DNA (cpDNA). The genetic data obtained was first used to generate knowledge concerning genetic diversity and populational structuring on a local level, in the Iguape (São Paulo state) region. Our results suggest that the fragmentation of these populations is geographical only, due to their edaphic needs, and that this locally aggregated and naturally fragmented mode of distribution does not indicate genetic subdivision. The characterization of inter and intra-populational genetic variability for T. cassinoides throughout its range of distribution, based on nuclear microsatellite markers, showed that the species has low levels of genetic diversity and that 61% of this diversity is encountered within, and 39% among, the populations. Furthermore, the results evince high and significant levels of correlation between genetic and geographic distance, thus suggesting that this isolation is distance-related. Our findings also indicate that the geographical region of Rio de Janeiro is the center of T. cassinoides diversity. Considerable genetic structuring was identified from the nuclear and plastidial DNA, though with partial distinctions. Results for cpDNA analysis suggest that T. cassinoides is divided into three phylogeographical groups: North, Central and South. Nuclear DNA analysis, however, took the Central and North phylogeographical groups to be one and the same. Ecological niche modeling data were generated and associated with demographic analyses and findings on populational structuring so that we could determine the species\' phylogeographical patterns and infer the occurrence of possible populational alterations during two distinct periods: 21 thousand years ago (the Last Glacial Minimum) and over the last 6 thousand years (Holocene Optimum - HO). The results of these analyses suggest that population sizes remained stable in possible areas of occurrence during the LGM and HO. Based on these findings we suggest the hypotheses that the stemming of gene flow among the phylogeographical regions proposed by this study predates the LGM. This pattern converges with results found for other species of peripheral vegetal communities but diverges from those for species from the Dense Coastal Hydrophilic Forest nucleus. As such, our research underscores the importance of further studies with different vegetal communities that comprise the Atlantic Forest in order to foster a better understanding of the processes that shaped the evolution of species in this complex biome

Os fungos endofíticos têm sido cada vez mais pesquisados como fonte de moléculas bioativas. Neste trabalho, foram isolados fungos endofíticos de uma árvore produtora de compostos medicinais, Handroanthus impetiginosus, com o objetivo de verificar se produziam metabólitos com atividade biológica e de identificar as espécies fornecedoras de princípios bioativos. Todas as 148 cepas isoladas foram triadas segundo a atividade antimicrobiana contra Staphylococcus aureus ATCC 6538, Candida albicans ATCC 10231 e Escherichia coli ATCC 25922 pelo método do ágar em bloco. Dentre essas, cinco fungos foram submetidos a fermentação em pequena escala, em caldo Czapek, durante 15 dias, a 28°C, tanto sob agitação quanto em modo estático. Ao final desse período, as culturas foram filtradas e submetidas a extração líquido-líquido. Os extratos obtidos foram avaliados quanto à capacidade de inibir o crescimento dos micro-organismos patogênicos citados anteriormente, por teste de difusão em ágar e determinação da concentração inibitória mínima (CIM). As menores faixas de CIM observadas foram 125-250 μg.mL-¹, de Alternaria alternata, e 250-500 μg.mL-¹, de Lasiodiplodia sp. Também avaliou-se o efeito sobre a viabilidade de linhagens celulares derivadas de câncer humano de mama (MCF-7), fígado (HepG2) e pulmão (A549). Os extratos de A. alternata e de Lasiodiplodia sp. reduziram a menos que 10% a viabilidade das células tumorais MCF-7 e HepG2. O primeiro também reduziu a menos que 5% a viabilidade de células A549. Por isso, tais fungos endofíticos foram submetidos a fermentação submersa em maior escala. O extrato de Alternaria alternata e algumas de suas frações reduziram expressivamente a viabilidade das três linhagens celulares testadas. Dentre tais frações, a F3 se destacou por apresentar menores valores de IC50 para MCF-7 e HepG2 (10,28±5,22 e 9,75±1,31 μg.mL-¹, respectivamente) do que o fármaco cisplatina (21,12±1,56 e 27,15±1,73 μg.ml-¹, respectivamente). O fracionamento dos extratos por cromatografia em coluna e cromatografia líquida de alta eficiência permitiram o isolamento de dois compostos, provenientes de A. alternata, e de um produzido por Lasiodiplodia sp. Tais amostras foram analisadas por ressonância magnética nuclear, e foi identificado o composto 4-hidróxi-benzaldeído no extrato de A. alternata. Ficou comprovado que os extratos de fermentação de fungos endofíticos isolados de H. impetiginosus exerceram importante atividade biológica, reduzindo a viabilidade de células derivadas de câncer de mama, fígado e pulmão. / Endophytic fungi have been prospected as source of active metabolites. In this work, endophytic fungi had been isolated from a tree that produces medicinal compounds, Handroanthus impetiginosus, in order to check if they produce biological active metabolites and to identify the biologically active species. All the 148 strains isolated were screened by agar piece method to investigate their antibiotic activity against Staphylococcus aureus ATCC 6538, Candida albicans ATCC 10231 e Escherichia coli ATCC 25922 . Among them, five endophytic fungi were fermented on small scale. The fermentation was performed in a Czapek broth, for 15 days, 28oC, under either stirring or static conditions. After this period, the cultures were filtered and subjected to liquid-liquid extraction. The obtained extracts were tested against the microorganisms mentioned above and the cancer cells MCF-7, HepG2 and A549. The lowest minimum inhibitory concentrations (MIC) exhibited were 125-250 μg.mL-¹ (from Alternaria alternata) and 250-500 μg.mL-¹ (from Lasiodiplodia sp.) both against S. aureus . Two extracts appreciably reduced tumor cells viability and, therefore, these endophytic fungi were fermented on large scale. The extract from A. alternata significantly reduced the viability of all three cell lines tested to less than 10% and its chemical study was biomonitored. One of its fractions, F3, exhibited lower IC50 against MCF-7 and HepG2 (10.28±5.22 and 9.75±1.31 μg.mL-¹, respectively) than cisplatin, a pharmaceutical compound commercially available (21.12±1.56 and 27.15±1.73 μg.mL-¹, respectively). The extract from Lasiodiplodia sp. diminished the viability of MCF-7 and HepG2 cells to less than 10%. The partitioning of the extracts by column chromatography and high performance liquid chromatography provided two isolated compounds from A. alternata and one from Lasiodiplodia sp. The samples were analyzed by nuclear magnetic resonance technique and the compound 4-hydroxybenzaldehyde was identified for A. alternata extract. The fermentation extracts of endophytic fungi from H. impetiginosus exhibited relevant biologic activity reducing the viability of cells derived from breast, liver and lung cancer. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Objective: To evaluate the susceptibility of Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) in vitro to the ethanolic extracts obtained from five different Peruvian medicinal plants. Methods: The plants were chopped and soaked in absolute ethanol (1:2, w/v). The antibacterial activity of compounds against P. aeruginosa was evaluated using the cupplate agar diffusion method. Results: The extracts from Maytenus macrocarpa (“Chuchuhuasi”), Dracontium loretense Krause (“Jergon Sacha”), Tabebuia impetiginosa (“Tahuari”), Eucalyptus camaldulensis Dehn (eucalyptus), Uncaria tomentosa (“Uña de gato”) exhibited favorable antibacterial activity against P. aeruginosa. The inhibitory effect of the extracts on the strains of P. aeruginosa tested demonstrated that Tabebuia impetiginosa and Maytenus macrocarpa possess higher antibacterial activity. Conclusions: The results of the present study scientifically validate the inhibitory capacity of the five medicinal plants attributed by their common use in folk medicine and contribute towards the development of new treatment options based on natural products. / This work has been partially supported by Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas and Nutrition Research Institute, Lima, Peru. / Peer review

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-05-06Bitstream added on 2014-06-13T19:09:25Z : No. of bitstreams: 1 cordeiro_chg_me_arafcf.pdf: 668360 bytes, checksum: 6006843241d7fb47bcd17a5594004e3c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A utilização de produtos naturais na medicina popular é milenar e persiste até os dias atuais. Sua abrangência é vasta e engloba fins variados, inclusive em relação à saúde bucal. O controle do biofilme bacteriano dentro das diversas especialidades odontológicas é de grande importância, pois aponta para a prevenção de várias afecções bucais. Quando a remoção mecânica do biofilme é deficiente, podem ocorrer lesões de tecido duro (cáries) e/ou mole (doenças periodontais). A eficácia de plantas medicinais, tanto em dentifrícios como em enxagüatórios bucais, tem sido investigada. Os resultados têm sugerido que os componentes de origem vegetal podem ser empregados como apoio à terapia das doenças periodontais e como profilaxia de rotina. Este trabalho teve como objetivos avaliar a ação biológica de formulações para higiene bucal, contendo, em associação, extratos hidroalcoólicos das espécies vegetais Nasturtium officinale (agrião), Rosmarinus officinalis (alecrim), Tabebuia impetiginosa (ipê roxo), Achillea millefolium (mil-folhas) e Plantago major (tanchagem). Trabalhos anteriores sugerem possível efeito antiinflamatório e alteração da qualidade do biofilme dento-bacteriano, devido as substâncias ativas desses vegetais. Após os estudos de pré-formulação e obtenção do gel dentifrício e do enxagüatório bucal, foram realizadas avaliações da atividade antibacteriana (frente à Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli, Enterococcus faecalis e Pseudomonas aeruginosa), atividade antiinflamatória e imunológica, para os extratos vegetais e para as formulações. E foram ainda realizados estudos clínicos iniciais, considerando-se os parâmetros odontológicos para a avaliação do Índice de placa, Índice Gengival, Recessão Gengival e... . / The use of natural resources in popular medicine is a millenary practice and it persists until nowadays. This habit is embracing and wide and it conglomerates multiple purposes, included those related to oral health. It’s very important to control bacterial film in many odontologic specialties, because this control helps to prevent several oral diseases. When the mechanical removal of the bacterial film is inefficient, there can occur hard tissue lesions (carious lesions) and/or soft tissue lesions (periodontal diseases) The effectiveness of medicinal herbs in dentifrices, as well as in mouthwashs have been investigated. The results have suggested that the herbs components can be utilized as a support in the periodontal diseases therapies and in the routine prophylaxis. It was the purpose of the present study to evaluate the biological action of various formulations to bucal hygiene, containing, in association, hidroalcoholic extracts from the following species: Nasturtium officinale, Rosmarinus officinalis, Tabebuia impetiginosa, Achillea millefolium and Plantago major. Previous works suggested that there are possible anti-inflammatory effects and an alteration of the bacterial dental film quality, due to the active substances of these herbs. After studying a previous formulation and obtaining the dentifrice and the mouthrinse, it was evaluated the bacterial activity (related to Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Escherichia coli, Enterococcus faecalis and Pseudomonas aeruginosa), the antiinflammatory and the immunological activities, for the herbs extracts and for the formulations... (Complete abstract, click electronic address below).

Brazil is considered a holder country of a great biodiversity, which the popular use of medicinal plants contributes an important source to discovery the new active compounds. Plants of the family Bignoniaceae and Tabebuia genus are widely used in traditional medicine in several countries for the treatment of various diseases and have an excellent potential for scientific studies, which may result in the discovery of new compounds having therapeutic interest. In this context, evidence the need to assess the biological potential of Tabebuia aurea, investigate their cytotoxic, antimicrobial activity, antiradical, antiedematogenic and lead the phytochemical screening to identify classes of bioactive compounds. We evaluated two ethanolic extracts from flowers and leaves, both subject to cell viability assay Metiltetrazólio by the colorimetric method for assessing the presence of cytotoxicity. The antimicrobial activity was evaluated using the broth microdilution assay, which provided the minimum inhibitory concentration (MIC) of the extracts against microbial growth. We performed the test ear edema induced by capsaicin to determine the antiedematogenic action and the evaluation of antiradical activity, the test verifies that the scavenging capacity of free radical opposite to 2,2-difenil-1-picrilidazila (DPPH) radical. The cell viability assay showed that the leaves ethanolic extract showed no cytotoxicity, since the LC50 value was greater than the maximum concentration used (≥ 1,0 mg ml-1), while the flowers ethanolic extract had no cytotoxicity at concentrations ≤ 0,5 mg mL-1. The ethanol extracts of flowers and leaves of T. aurea showed antibacterial activity, especially toward those Gram-positive bacteria. The flowers ethanol extract proved to be active with bactericidal action against the strain of S. epidermidis at MIC of 0,06 mg mL-1 and the leaves ethanol extract moderately active against S. epidermidis (CIM: 0,25 mg ml-1) and S. aureus (MIC: 0,50 mg mL-1) with bacteriostatic action to both strains. Both extracts inhibited edema formation induced by capsaicin. Treatment with flowers ethanol extract showed a significant inhibition of edema of 40,50% and the ethanol extract of leaves of 41,73%. The ethanol extracts of T. aurea showed no antiradical activity against the DPPH radical. The plant species used was identified by the presence of organic acids, naphthoquinones, anthraquinones and saponins. These results scientifically prove the antiedematogenic potential of the species and its promising antibacterial activity, with no cytotoxicity. Representing security evidence on the therapeutic use of plant species in preclinical in vivo tests. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Brasil é considerado um país detentor de uma grande biodiversidade, no qual o uso popular de plantas medicinais contribui como importante fonte para a descoberta de novos compostos ativos. As plantas da família Bignoniaceae e do gênero Tabebuia são amplamente utilizadas na medicina tradicional de vários países, para o tratamento de diversas doenças e possuem um excelente potencial para estudos científicos, que podem resultar na descoberta de novos compostos com interesse terapêutico. Nesse contexto, evidenciou-se a necessidade de avaliar o potencial biológico de Tabebuia aurea, investigando sua atividade citotóxica, antimicrobiana, antirradicalar, antiedematogênica e conduzindo a prospecção fitoquímica para identificar as classes de compostos bioativos. Foram avaliados dois extratos etanólicos, um proveniente de flores e outro de folhas, ambos submetidos ao ensaio de viabilidade celular pelo método colorimétrico de Metiltetrazólio, para avaliar a presença de citotoxicidade. O potencial antimicrobiano foi avaliado com o teste de microdiluição em caldo, o qual forneceu a concentração inibitória mínima (CIM) dos extratos frente ao crescimento microbiano. Para determinar a ação antiedematogênica, realizou-se o teste de edema de orelha induzido por capsaicina e para a avaliação da atividade antirradicalar, o ensaio que verifica a capacidade sequestradora de radicais livres frente ao radical 2,2-difenil- 1-picrilidazila (DPPH). O ensaio de viabilidade celular revelou que o extrato etanólico das folhas não evidenciou citotoxidade, uma vez que a CL50 foi superior a concentração máxima utilizada (≥ 1,0 mg mL-1), enquanto que o extrato etanólico de flores não teve citotoxidade nas concentrações ≤ 0,5 mg mL-1. Os extratos etanólicos de flores e de folhas de T. aurea apresentaram atividade antibacteriana, principalmente, frente às bactérias Gram-positivas. O extrato etanólico de flores demonstrou-se ativo, com ação bactericida, frente à linhagem de S. epidermidis na CIM de 0,06 mg mL-1 e o extrato etanólico de folhas moderadamente ativo frente a S. epidermidis (CIM: 0,25 mg mL-1) e S. aureus (CIM: 0,50 mg mL-1), com ação bacteriostática para ambas as linhagens. Ambos os extratos inibiram a formação do edema induzido por capsaicina. O tratamento com o extrato etanólico de flores apresentou uma porcentagem de inibição do edema de 40,50% e o extrato etanólico de folhas de 41,73%. Os extratos etanólicos de T. aurea não apresentaram atividade antirradicalar frente ao radical DPPH. Foram idenficados na espécie vegetal avaliada a presença de ácidos orgânicos, naftoquinonas, antraquinonas e saponinas. Esses resultados comprovam cientificamente o potencial antiedematogênico da espécie e sua promissora atividade antibacteriana, com ausência de citotoxidade. Representando indícios de segurança na utilização terapêutica da espécie vegetal nos testes pré-clínicos in vivo.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-29Bitstream added on 2014-06-13T19:33:26Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_lz_me_jabo.pdf: 921703 bytes, checksum: a718a5abe40d58b514f5d9794b51f351 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo do presente trabalho foi estudar a divergência genética entre árvores matrizes de Tabebuia caraiba (Mart.) Bur. no município de Macapá, no Estado do Amapá, por meio de caracteres biométricos de flores, frutos, sementes e processo germinativo. A divergência genética foi avaliada pela análise de agrupamento, através do método de Ward, K-means e pelo algoritmo de Tocher, obtidos a partir da matriz de dissimilaridade pela Distância Euclidiana. Para verificação da importância relativa de cada variável para a divergência genética utilizou-se a análise de Componentes Principais. As 119 árvores matrizes foram distribuídas em 21 grupos no método de Ward e 23 grupos para o algoritmo de Tocher. O método K-means auxiliou na exclusão de 11 caracteres pouco discriminatórios. Dos caracteres mais importantes para a divergência genética, destacam-se o comprimento do fruto, largura do fruto, comprimento da ala maior da semente, massa de matéria seca da semente, largura do cotilédone, largura da folha e massa de matéria seca da plântula. Há variabilidade entre as árvores matrizes de T. caraiba quanto aos caracteres avaliados e o estudo da divergência possibilita a identificação de árvores matrizes para a colheita de sementes, que subsidiem programas de conservação genética / The objective of this work was to study the genetic diversity among trees of Tabebuia caraiba (Mart.) Bur. at city of Macapá, Amapá State, by means of biometric characters of flowers, fruits, seeds and germination process. Genetic divergence was assessed by cluster analysis by Ward method, K-means algorithm and the Tocher, obtained from the matrix of the Euclidean Distance. To verify the relative importance of each variable to the genetic divergence we used the Principal Component analysis. The 119 selected trees were divided into 21 groups in the method of Ward and 23 groups for the algorithm Tocher. The K-means method aided in the exclusion of 11 characters less discriminatory. Among the most important traits for genetic divergence, we highlight the fruit length, fruit width, length of greater wing of the seed dry weight of seed, cotyledon width, leaf width and dry weight of seedlings. There is variability among the trees of T. caraiba about the traits and the study of divergence allows the identification of mother trees for seed collection, programs that support conservation genetics