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DIVERSIDADE GENÉTICA E CONSERVAÇÃO DE Tabebuia aurea (SILVA MANSO) BENTH & HOOK. F. EX S. MOORE (BIGNONIACEAE), UMA ESPÉCIE ARBÓREA DO CERRADO

Rosa, Fernanda Fraga 12 August 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FERNANDA FRAGA ROSA.pdf: 781807 bytes, checksum: c1ba382ad100630630a5f0f78ae880f8 (MD5) Previous issue date: 2011-08-12 / Tabebuia aurea is a tree widely distributed in the Cerrado and that is subject to the deleterious effects of fragmentation of this biome. In this work, were studied 237 samples from 12 populations of Tabebuia aurea based on the variation of 11 microsatellite loci, in order to analyze the genetic diversity and structure and test the causes of differentiation of populations. Tabebuia aurea has high genetic diversity in all populations with 379 alleles found an average of 34.4 alleles per locus, the population had an overall average of 11.89 alleles revealing a high information content associated with microsatellite markers. The average values of expected heterozygosity (He) and observed (Ho) found for the loci were 0.894 and 0.692 respectively. The inbreeding coefficient within populations ranged from 0.075 to 0.337 at the EGM in PAN, all figures are significant, P <0.00038 with a confidence interval of 95%, indicating that the allele frequencies are not following the expected proportions for balance Hardy- Weinberg equilibrium, namely, what is occurring mating between related individuals. The population of the Ecological Station of Águas Emendadas (AGE), in permanent preservation area, showed the greatest genetic diversity. The other populations in areas of permanent preservation, Emas National Park (ENP) and the APA Rio Pandeiros (PAN), did not show greater genetic diversity than other areas in the agricultural matrix fragments. However, the inbreeding coefficient was higher in areas most affected by human disturbances when compared to the conservation area. The differentiation between populations is low, but significant (&#952; = 0.061, P = 0.0005), (F = 0.264, P = 0.0005) (f = 0.216, P = 0.0005). &#920; values were lower than those of values RST, indicating that the alleles are more likely to be identical by descent by state. The pattern of genetic isolation by distance was tested by correlating the genetic distance matrix with the matrix of geographical distance and was inefficient for the discrepancy found between populations. The non-random mating tooth and between populations, the distribution pattern of T. aurea in groups and pollination at short distance, probably are the factors responsible for genetic structure in T. aurea. / Tabebuia aurea é uma espécie arbórea de ampla distribuição no Cerrado que está sujeita aos efeitos deletérios da fragmentação deste bioma. Neste trabalho, foram estudadas 237 amostras de 12 populações de Tabebuia aurea com base na variação de 11 locos microssatélites, com o objetivo de analisar a diversidade e estrutura genética e testar as causas da diferenciação das populações. Tabebuia aurea possui alta diversidade genética em todas as populações com 379 alelos encontrados, uma média de 34,4 alelos por loco, as populações apresentaram uma média geral de 11,89 alelos revelando um elevado conteúdo informativo associado aos marcadores microssatélites. Os valores médios de heterozigosidade esperada (He) e observada (Ho) encontrados para os locos foram de 0,894 e 0,692 respectivamente. O coeficiente de endogamia dentro das populações variou de 0,075 em AGE a 0,337 em PAN, todos os valores são significativos, P < 0,00038 com intervalo de confiança de 95%, indicando que as frequências alélicas não estão seguindo as proporções esperadas para o equilíbrio de Hardy-Weinberg, ou seja, que está ocorrendo o acasalamento entre indivíduos aparentados. A população da Estação Ecológica de Águas Emendadas (AGE), em área de preservação permanente, apresentou a maior diversidade genética. As outras populações em áreas de preservação permanente, Parque Nacional das Emas (PNE) e APA do Rio Pandeiros (PAN), não apresentaram maior diversidade genética que as demais áreas em fragmentos de matriz agrícola. Entretanto, o coeficiente de endogamia foi maior nas áreas mais afetadas por distúrbios antrópicos quando comparado à área de conservação. A diferenciação entre populações é baixa, porém significativa ( q = 0,061; P = 0,0005), (F = 0,264, P = 0,0005) (f = 0,216; P = 0,0005). Os valores de q foram inferiores aos valore de RST, indicando que os alelos são mais propensos a serem idênticos por estado que por descendência. O modelo de isolamento genético por distância foi testado, correlacionando a matriz de distância genética com a matriz de distância geográfica e se mostrou ineficiente para a divergência encontrada entre as populações. Os acasalamentos não aleatórios dentro e entre as populações, o padrão de distribuição de T. aurea em grupos e a polinização a curta distância, provavelmente são os fatores responsáveis pela estrutura genética em T. aurea.
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Genômica populacional de Handroanthus serratifolius e Tabebuia aurea / Population genomics of Handroanthus serratifolius and Tabebuia aurea

Vieira, Lucas Donizetti 09 March 2018 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-09T14:42:24Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-09T14:44:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-09T14:44:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Donizetti Vieira - 2018.pdf: 2934046 bytes, checksum: 50730e1b6711826aafed66d22a56852f (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Population genomics studies in Neotropical species are scarce, however, they are of great importance for the understanding of the neutral and adaptive variations, in order to develop strategies of management and conservation for the species. In this context our objective was to verify the role of natural selection in the distribution of populations diversity in Handroanthus serratifolius and Tabebuia aurea. Here, we study population genomics based in sequence capture using 24,751 pre-developed probes. For H serratifolius were sampled c. 64,000 SNPs in 144 individuals from 16 populations. For T aurea were sampled c. 18,000 SNPs in 48 individuals from 6 populations. Genetic differentiation was high (FST = 0.194, p <0.001) in H. serratifolius and intermediate (FST = 0.144, p <0.001) in T. aurea. The inbreeding coefficient was low in both species, however, in three populations of H. serratifolius it was intermediate or high. The genetic structure of populations presented two genetic groups for the populations sampled in the two species. H. serratifolius with high genetic differentiation and T. aurea with admixture in all populations. We did not find SNPs outliers in the distribution of FST values, due to the wide distribution of values found for the populations of the two species. In the search for correlation between environmental variables and changes in allelic frequency H. serratifolius presented only three SNPs, inside six genes and T. aurea presented 16 SNPs, inside 25 genes. The functional annotation of these genes showed relationship with molecular processes, transposable elements and one in T. aurea related to resistance to diseases. In conclusion, our data show a selection signal in H. serratifolius for only three loci with local adaptation signal. In T. aurea our data show a greater number of locos (16 locos) with local adaptation signal. / Estudos de genômica de populações em espécies Neotropicais são escassos, no entanto, apresentam grande importância para o entendimento das variações neutras e adaptativas, a fim de desenvolver estratégias de manejo e conservação das espécies. Nesse contexto nosso objetivo foi verificar o papel da seleção natural na distribuição da diversidade de populações de Handroanthus serratifolius e Tabebuia aurea. Aqui, nós estudamos a genômica de populações baseado em sequence capture utilizando 24.751 sondas previamente desenvolvidas. Para H serratifolius foram amostrados c. 64.000 SNPs em 144 indivíduos de 16 populações. Para T aurea foram amostrados c. 18.000 SNPs em 48 indivíduos de 6 populações. A diferenciação genética foi alta (FST = 0,194, p < 0,001) em H. serratifolius e intermediária (FST = 0,144, p < 0,001) em T. aurea. O coeficiente de endogamia foi baixo nas duas espécies, no entanto, em três populações de H. serratifolius foi intermediária ou alta. A estrutura genética das populações apresentou dois grupos genéticos para as populações amostradas nas duas espécies. H. serratifolius com alta diferenciação genética e T. aurea com mistura em todas as populações. Nós não encontramos SNPs outliers na distribuição de valores de FST, devido a ampla distribuição de valores encontrada para as populações das duas espécies. Na busca por correlação entre variáveis ambientais e mudanças na frequência alélica H. serratifolius apresentou apenas três SNPs, presentes em seis genes e T. aurea apresentou 16 SNPs, presentes em 25 genes. A anotação funcional desses genes mostrou relação com processos moleculares, elementos transponíveis e um em T. aurea ligado a resistência a doenças. Concluindo, nossos dados apresentam sinal de seleção em H. serratifolius para apenas três locos com sinal de adaptação local. Em T. aurea nossos dados mostram maior número de locos (16 locos) com sinal de adaptação local.
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Avaliação do potencial biológico de Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. f. ex. S. Moore / Evaluation of the biological potential of Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. F. ex. S. Moore

Santos, Raissa Fernanda Evangelista Pires dos 17 December 2014 (has links)
Brazil is considered a holder country of a great biodiversity, which the popular use of medicinal plants contributes an important source to discovery the new active compounds. Plants of the family Bignoniaceae and Tabebuia genus are widely used in traditional medicine in several countries for the treatment of various diseases and have an excellent potential for scientific studies, which may result in the discovery of new compounds having therapeutic interest. In this context, evidence the need to assess the biological potential of Tabebuia aurea, investigate their cytotoxic, antimicrobial activity, antiradical, antiedematogenic and lead the phytochemical screening to identify classes of bioactive compounds. We evaluated two ethanolic extracts from flowers and leaves, both subject to cell viability assay Metiltetrazólio by the colorimetric method for assessing the presence of cytotoxicity. The antimicrobial activity was evaluated using the broth microdilution assay, which provided the minimum inhibitory concentration (MIC) of the extracts against microbial growth. We performed the test ear edema induced by capsaicin to determine the antiedematogenic action and the evaluation of antiradical activity, the test verifies that the scavenging capacity of free radical opposite to 2,2-difenil-1-picrilidazila (DPPH) radical. The cell viability assay showed that the leaves ethanolic extract showed no cytotoxicity, since the LC50 value was greater than the maximum concentration used (≥ 1,0 mg ml-1), while the flowers ethanolic extract had no cytotoxicity at concentrations ≤ 0,5 mg mL-1. The ethanol extracts of flowers and leaves of T. aurea showed antibacterial activity, especially toward those Gram-positive bacteria. The flowers ethanol extract proved to be active with bactericidal action against the strain of S. epidermidis at MIC of 0,06 mg mL-1 and the leaves ethanol extract moderately active against S. epidermidis (CIM: 0,25 mg ml-1) and S. aureus (MIC: 0,50 mg mL-1) with bacteriostatic action to both strains. Both extracts inhibited edema formation induced by capsaicin. Treatment with flowers ethanol extract showed a significant inhibition of edema of 40,50% and the ethanol extract of leaves of 41,73%. The ethanol extracts of T. aurea showed no antiradical activity against the DPPH radical. The plant species used was identified by the presence of organic acids, naphthoquinones, anthraquinones and saponins. These results scientifically prove the antiedematogenic potential of the species and its promising antibacterial activity, with no cytotoxicity. Representing security evidence on the therapeutic use of plant species in preclinical in vivo tests. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Brasil é considerado um país detentor de uma grande biodiversidade, no qual o uso popular de plantas medicinais contribui como importante fonte para a descoberta de novos compostos ativos. As plantas da família Bignoniaceae e do gênero Tabebuia são amplamente utilizadas na medicina tradicional de vários países, para o tratamento de diversas doenças e possuem um excelente potencial para estudos científicos, que podem resultar na descoberta de novos compostos com interesse terapêutico. Nesse contexto, evidenciou-se a necessidade de avaliar o potencial biológico de Tabebuia aurea, investigando sua atividade citotóxica, antimicrobiana, antirradicalar, antiedematogênica e conduzindo a prospecção fitoquímica para identificar as classes de compostos bioativos. Foram avaliados dois extratos etanólicos, um proveniente de flores e outro de folhas, ambos submetidos ao ensaio de viabilidade celular pelo método colorimétrico de Metiltetrazólio, para avaliar a presença de citotoxicidade. O potencial antimicrobiano foi avaliado com o teste de microdiluição em caldo, o qual forneceu a concentração inibitória mínima (CIM) dos extratos frente ao crescimento microbiano. Para determinar a ação antiedematogênica, realizou-se o teste de edema de orelha induzido por capsaicina e para a avaliação da atividade antirradicalar, o ensaio que verifica a capacidade sequestradora de radicais livres frente ao radical 2,2-difenil- 1-picrilidazila (DPPH). O ensaio de viabilidade celular revelou que o extrato etanólico das folhas não evidenciou citotoxidade, uma vez que a CL50 foi superior a concentração máxima utilizada (≥ 1,0 mg mL-1), enquanto que o extrato etanólico de flores não teve citotoxidade nas concentrações ≤ 0,5 mg mL-1. Os extratos etanólicos de flores e de folhas de T. aurea apresentaram atividade antibacteriana, principalmente, frente às bactérias Gram-positivas. O extrato etanólico de flores demonstrou-se ativo, com ação bactericida, frente à linhagem de S. epidermidis na CIM de 0,06 mg mL-1 e o extrato etanólico de folhas moderadamente ativo frente a S. epidermidis (CIM: 0,25 mg mL-1) e S. aureus (CIM: 0,50 mg mL-1), com ação bacteriostática para ambas as linhagens. Ambos os extratos inibiram a formação do edema induzido por capsaicina. O tratamento com o extrato etanólico de flores apresentou uma porcentagem de inibição do edema de 40,50% e o extrato etanólico de folhas de 41,73%. Os extratos etanólicos de T. aurea não apresentaram atividade antirradicalar frente ao radical DPPH. Foram idenficados na espécie vegetal avaliada a presença de ácidos orgânicos, naftoquinonas, antraquinonas e saponinas. Esses resultados comprovam cientificamente o potencial antiedematogênico da espécie e sua promissora atividade antibacteriana, com ausência de citotoxidade. Representando indícios de segurança na utilização terapêutica da espécie vegetal nos testes pré-clínicos in vivo.
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Influência de substratos e recipientes na qualidade das mudas de Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook.f. Ex S.Moore / Influence of substrates and containers of quality seedlings of Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook.f.Ex S.Moore.

BOTELHO, Andréa Vasconcelos Freitas 16 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-23T12:24:45Z No. of bitstreams: 1 Andrea de Vasconcelos Freitas Botelho.pdf: 914895 bytes, checksum: 7ad87dbf4d913c2c11b7f65baaa05678 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-23T12:24:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrea de Vasconcelos Freitas Botelho.pdf: 914895 bytes, checksum: 7ad87dbf4d913c2c11b7f65baaa05678 (MD5) Previous issue date: 2011-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook.f. ex S. Mo., Known as Tabebuia aurea, is seen as regular-sized tree that can reach 20 feet tall when in good soil and moisture and is naturally occurring in the caatinga and cerrado, are found in the Northeast, especially in areas of vegetation riparian, alluvial soils, is of great importance to study the best methods of seedling production of species studied. Thus, this study aimed to evaluate the effect different types of substrates and different types of containers as seedlings of that species. The experiment was conducted in a glasshouse of the Department of Agronomy, Federal Rural University of Pernambuco. The seeds of Tabebuia aurea, used in the experiment were collected in the municipality of Piranhas - AL. The development of seedlings of Tabebuia aurea was assessed by morphological and physiological parameters, testing 12 types of substrates with different combinations, the raw material to be used for the composition of the substrates were: coconut powder (CP) of bagacilho cane (B), compost (C), soil (S), cattle (EB) and horse manure (EE). We utilized two types of containers: a small tube with a volume capacity of 0.3 dm ³, and the rubber vessel with a volume capacity of 1.8 dm ³. The statistical design was completely randomized design with six replicates. Means were compared by Scott-Knott test at 5% level of probability. It can be concluded that among the substrates, which showed in its combination manure gave the seedlings a higher growth in all characteristics. At 90 days, the seedlings had ideal size to be deployed in the field. The plastic tube, associated with soil + manure + equine bagacilho, cane seedlings showed inferior to others. For the production of seedlings of Tabebuia aurea, is recommended to use large containers, in case the vessel rubberized with undertreated: soil + cattle manure and soil + manure + coconut fiber as substrate, so that we can obtain seedlings with better quality. / Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook.f. ex S. Mo., conhecida como craibeira, é tida como árvore de porte regular que pode atingir até 20 m de altura quando em boas condições de solo e umidade, sendo de ocorrência natural na caatinga e cerrados, é encontrada no Nordeste, principalmente em áreas de vegetação ciliar, em solos aluvionais, sendo de grande importância o conhecimento sobre os melhores métodos de produção de mudas da espécie avaliada. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo avaliar o efeito e diferentes tipos de substratos e diferentes tipos de recipientes na qualidade de mudas desta espécie. O experimento foi conduzido na Casa de Vegetação do Departamento de Agronomia da Universidade Federal Rural de Pernambuco. As sementes de craibeira, utilizadas no experimento foram coletadas no Município de Piranhas - AL. O desenvolvimento das mudas de craibeira foi avaliado por meio de parâmetros morfológico, testando-se 12 tipos de substratos com diferentes combinações, a matéria-prima utilizada para a composição dos substratos foi: pó de coco (PC), bagacilho de cana (B), compostagem (C), solo (S), esterco bovino (EB) e esterco de equino (EE). Foram empregados dois tipos de recipientes: o tubete, com capacidade volumétrica de 0,3 dm³; e o vaso emborrachado, com capacidade volumétrica de 1,8 dm³. O delineamento estatístico utilizado foi o inteiramente ao acaso, com esquema fatorial 2 x 12, com seis repetições por tratamento. As médias foram comparadas pelo Teste de Scott-Knott, em nível de 5% de probabilidade. Foram avaliadas as características: Altura da muda (cm), diâmetro (mm), número de folhas, matéria seca da raiz, matéria seca da parte aérea, razão altura/ diâmetro, razão peso seca da parte aérea/ peso seco da raiz e índice de qualidade de Dickson. Pode-se concluir que, entre os substratos avaliados, o que apresentou em sua combinação esterco bovino proporcionou às mudas um crescimento superior em todas as características analisadas. Aos 90 dias, as mudas apresentaram tamanho ideal para ser implantada em campo. O tubete, associado ao substrato solo+ esterco eqüino+ bagacilho de cana, apresentou mudas de qualidade inferior as demais. Para a produção de mudas de craibeira, recomenda-se utilizar recipientes grandes, no caso, o vaso emborrachado com os substratos: solo+esterco bovino e solo+ esterco bovino + pó de coco como substrato, para que se possa obter mudas com melhor qualidade.
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Expressão gênica diferencial de quatro espécies da Aliança Tabebuia em resposta ao deficit hídrico / Differential gene expression of four Tabebuia Alliance species in response to water deficit

Sobreiro, Mariane Brom 10 March 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-25T15:11:49Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariane Brom Sobreiro - 2017.pdf: 16013047 bytes, checksum: 6d41859718e06adc6294f5de038bc631 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-25T15:12:31Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariane Brom Sobreiro - 2017.pdf: 16013047 bytes, checksum: 6d41859718e06adc6294f5de038bc631 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-25T15:12:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariane Brom Sobreiro - 2017.pdf: 16013047 bytes, checksum: 6d41859718e06adc6294f5de038bc631 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Considering the rate of increase in average annual temperature and the seasonality of rainfall in several regions of the country, investigations on the mechanisms of plant’s response to low water availability become relevant. Tabebuia Alliance species - monophyletic clade of the Bignoniaceae family are commonly known as ipe – are distribuited in areas with different soil and climatic conditions. This feature makes them an interesting model to understand mechanisms tolerance’s to abiotic stresses. For each species there were two groups: control group, which had maintained irrigation; low water availability group, which irrigation was stopped and the experiment continued until the subtrate reached 40% of field capacity. The main objective of this work was to identify differentially expressed genes (DEG) in four species - two from the Brazilian savannah (T. aurea and Handroanthus ochraceus) and two from seasonally dry forests (H. impetiginosus and H. serratifolius). Then, RNA was extracted from the plants for sequencing on the Illumina platform with paired-end sequences of 100 base pairs (bp). Sequences were evaluated for quality control and mapped onto the genome of H. impetiginosus to identify DEG using the R software. The DGEs obtained by DESeq2 were subjected to functional enrichment analysis and potential changes in the level of expression of genes encoding enzymes of particular metabolic pathways. In all tools, H. serratifolius species showed the highest number of DGE (4908 noDESeq2), while H. ochraceus had the lowest number of DGE (6 in DESeq2). Functional enrichment analyzes demonstrated that the species presented, individually or collectively, typical responses of low water availability such as decrease of photosynthetic rate, increase of proline and increase of starch degradation. Although species share some responses, the complexity of organisms does not allow them to exhibit identical behaviors. / Considerando-se o aumento crescente da temperatura média anual e a sazonalidade das chuvas em diversas regiões do país, investigações acerca dos mecanismos de resposta vegetais à baixa disponibilidade hídrica tornam-se pertinentes. Espécies da Aliança Tabebuia – clado monofilético da família Bignoniaceae são comumente conhecidas como ipê – possuem uma ampla distribuição, ocupando áreas com diferentes condições edafoclimáticas. Esta característica torna-as um modelo interessante para se entender os mecanismos de tolerância a estresses abióticos. Sob este cenário, o presente trabalho teve como principal objetivo a identificação de genes diferencialmente expressos (GDE) em quatro espécies – das quais duas são de cerrado stricto sensu (T. aurea e Handroanthus ochraceus) e duas de floresta estacional (H. impetiginosus e H. serratifolius). Para cada espécie houve dois grupos experimentais: grupo controle, o qual teve a irrigação mantida; grupo de baixa disponibilidade hídrica, o qual a irrigação foi interrompida e o experimento mantido até que o subtrato atingisse 40% da capacidade de campo. Em seguida, extraiu-se o RNA das plantas para sequencimento em plataforma Illumina com sequências do tipo “paired-end” de 100 pares de base (pb). As sequências foram avaliadas para o controle de qualidade e alinhadas no genoma de H. impetiginosus para identificação de genes diferencialmente expressos (GDEs) com o uso de pacotes do R. Os GDEs obtidos pelo DESeq2 foram submetidos a análise de enriquecimento funcional e potenciais alterações no nível de expressão de genes que codificam enzimas de determinadas vias metabólicas. Em todas as ferramentas, a espécie H. serratifolius apresentou o maior número de GDEs (4908 noDESeq2), enquanto H. ochraceus apresentou o menor número de GDEs (6 no DESeq2). As análises de enriquecimento funcional demonstraram que as espécies apresentaram, individual ou coletivamente, respostas típicas de baixa disponibilidade hídrica como diminuição de taxa fotossintética, aumento de prolina e aumento da degradação de amido. Ainda que as espécies compartilhem algumas respostas, a complexidade dos organismos não permite que exibam comportamentos idênticos.
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Diversidade genética, sistema de reprodução, estrutura genética espacial e fluxo gênico em Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. f. ex S. Moore no Cerrado / Genetic diversity, mating system, spatial genetic structure and gene flow in Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. f. ex S. Moore in the Cerrado

Silva, Maria Carolina 14 February 2011 (has links)
O bioma Cerrado é considerado atualmente área crítica para a conservação mundial em decorrência do seu endemismo e da atual velocidade de devastação. Quanto mais fragmentadas e perturbadas as paisagens naturais, maiores são os desafios para a manutenção da sua variabilidade genética, que possui hoje um papel de destaque na definição das estratégias de conservação e manejo de populações naturais. Visando a propor recomendações para estratégias de conservação in situ com base em indicadores genéticos, este trabalho objetivou estudar, por meio de oito locos microssatélites nucleares, a diversidade genética, o sistema de reprodução, a estrutura genética espacial e o fluxo gênico de Tabebuia aurea (Bignoniaceae) em remanescentes de Cerrado do Estado de São Paulo e do Mato Grosso do Sul. Foram mapeadas oito populações de T. aurea representadas por 290 árvores adultas. Além disso, foram produzidas 750 progênies (25 plântulas de 30 matrizes), totalizando 1040 genotipagens. Os resultados indicaram que os adultos nem sempre detêm maior heterozigosidade que as progênies, e os índices de fixação de suas populações mostraram-se altos e significativos. Os locos analisados indicaram que existe estruturação da variabilidade genética intrapopulacional de T. aurea na maioria das populações. Apesar de haver semelhanças entre regiões e populações, não há um padrão espacial claro da variabilidade genética. Os correlogramas, entretanto, apoiaram a hipótese de dispersão de sementes espacialmente restrita. Detectou-se, no entanto, uma alta taxa de imigração de pólen nas populações de Assis (74%) e de Pedregulho (87%), e as distâncias de dispersão contemporânea de pólen variaram de 0 a 167m para Assis e de 0 a 7002m para Pedregulho, sugerindo intenso movimento de genes nas populações. De acordo com as estimativas das taxas de cruzamento, as populações apresentaram um sistema de reprodução de cruzamentos em Assis e Pedregulho ( m t = 0,997; m t = 1,000, respectivamente), indicando a presença de mecanismos de autoincompatibilidade para a espécie. Verificou-se que a divergência genética populacional não se distribuiu igualmente entre as populações e que ocorre o fenômeno de isolamento pela distância. Os tamanhos efetivos populacionais dos adultos indicaram que a maioria dos remanescentes estudados possui áreas de tamanhos inferiores às encontradas pelas estimativas de área mínima viável para a conservação. Apenas o Parque Estadual das Furnas do Bom Jesus, Pedregulho-SP, contém área suficiente para a conservação do potencial evolutivo das populações de T. aurea. Visando à coleta de sementes para estratégias de conservação, os resultados sugeriram que a coleta deve ser realizada em, no mínimo, 18 e 20 matrizes, para Assis e Pedregulho, respectivamente, para a retenção de tamanhos efetivos de 50. / The Cerrado biome is considered a critical area for worldwide conservation due to its endemism and the current devastation speed. The fragmented and disturbed natural landscapes are the biggest challenges for the maintenance of genetic variability, which today has a leading role in defining conservation and management strategies of natural populations. This work intends to propose recommendations for in situ conservation strategies based on genetic markers. With the help of eight nuclear microsatellite loci, the study will verify the genetic diversity, the breeding system, the spatial genetic structure and the gene flow of Tabebuia aurea (Bignoniaceae) in Cerrado remnants of the State of São Paulo and Mato Grosso do Sul. Eight populations of T. aurea with 290 adult trees were mapped. In addition, 750 progeny were produced (25 seedlings of 30 mother-trees), totaling 1040 genotyping. The results indicated that adult trees occasionally have higher heterozygosity than seedlings and the fixation index in the populations were high and significant. The loci analyzed indicated that most populations of T. aurea had structuring of the genetic variability. There are similarities between regions and populations, but there is no clear pattern of spatial genetic structure, although the correlogram supported the hypothesis of spatially restricted seed dispersal. In turn, high immigration rates of pollen were found on populations of Assis (74%) and Pedregulho (87%) and the distances of the pollen contemporary distribution had been variating between 0 and 167m to Assis and between 0 and 7002m to Pedregulho, what suggests an intense movement of genes in the populations. According to the outcrossing rates estimated, the populations showed an outcrossing breeding system in Assis and Pedregulho ( = 0.997, = 1.000, respectively), indicating the presence of self-incompatibility mechanisms in this species. It was found that the population genetic divergence was not equally distributed among the population, and so, isolation by distance phenomena may be occuring. The minimum viable area for conservation estimates of adults trees indicated that most part of the areas have sizes below of recommended. Only the State Park Furnas do Bom Jesus, Pedregulho, SP, contains sufficient area for the conservation of evolutionary potential of populations of T. aurea. The results suggest that the seed collected for conservation strategies, must come from a minimum of 18 and 20 mother-trees, respectively, from Assis and Pedregulho.
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Estudo da atividade antimicrobiana e cicatrizante de feridas em ratos utilizando o extrato etanólico de folhas de Tabebuia aurea (Ipê Amarelo) / Study of antimicrobial activity and woun healing in rats using ethanolic extract of leaves of Tabebuia aurea (Yellou-Ipe)

Póvoas, Fabiani Tenório Xavier 16 December 2015 (has links)
The research aimed to evaluate the antimicrobial potential and healing of wounds of the ethanol extract of leaves of Tabebuia aurea. The government stimulus to scientific research to seek new treatment options based on medicinal plants; the need for proof of efficacy and safety for the use of plant material by the population; and Tabebuia genus plants have scientifically proven biological activities and in addition, are present in large numbers on Brazilian soil justify this study. To achieve the proposed objectives was carried out the preparation of the ethanol extract of leaves of Tabebuia aurea (EETA), and then held its fractionation, obtaining the fractions hexane, chloroform, ethyl acetate and methanol. Phytochemical tests were conducted assessing cell viability in vitro by Methyl tetrazolium method of determining the minimum inhibitory concentration (MIC) for bacteria and fungi and evaluation of the healing activity of skin wounds in rats from topical application of EETA 5%. The phytochemical screening was positive for some secondary metabolites of the class of phenolic compounds and steroids. The cytotoxicity test J774.A1 lineage cells showed cytotoxicity at concentrations of 500, 100 and 10 µg/mL and cell viability at the concentration of 1 µg/mL. In assessing the MIC, the EETA did not inhibit the growth of microorganisms tested, although the hexane fractions and chloroform the EETA showed activity at 1000 µg/mL for Escherichia coli bacteria. None of the fractions inhibited the fungus Candida albicans. In the study of healing activity healing, the macroscopic assessment of wounds, the EETA group had lower redness close to the lesion and inflammation in the initial process of wound healing and formation of a thick crust adhering to the wound, which interfere with the retraction of the edges, with the percentage of negative contraction until the 11th day of treatment (-35.40%, -8.85% and -1.18%) and positive in 14th (22.71%). The positive and negative control groups showed similarity in the evolution of healing, with the percentage of contraction of 85.54% and 80.23%, respectively, on the 14th day. The histopathology of the wounds showed no statistical significance in healing between groups at 3 and 7 days, and significance to the EETA group on the 14th day, showing reepitelization below the positive and negative groups, related to the formation of crust. Macroscopic and histopathological evaluation of liver and kidney, showed no signs of toxicity and no change in biochemical evaluation, indicating that the EETA used topically for 14 days does not promote damage to the animal model used. Concludes that the EETA not have antimicrobial activity and hexane fractions and chloroform have weak activity to the bacterium E. coli; demonstrated cytotoxicity in vitro at concentrations from 10 µg/mL and no in vivo toxicity; his healing activity was not superior to controls in this study. It is suggested invest in studies evaluating the anti-inflammatory activity EETA. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A pesquisa objetivou avaliar o potencial antimicrobiano e cicatrizante de feridas do extrato etanólico de folhas de Tabebuia aurea. O estímulo governamental às pesquisas científicas que busquem novas opções de tratamento à base de plantas medicinais, a necessidade de comprovação de eficácia e segurança terapêutica para a utilização do material vegetal pela população e que plantas do gênero Tabebuia, que possuem atividades biológicas cientificamente comprovadas e ademais, estão presentes em grande número em solo brasileiro justificam este estudo. Para a concretização dos objetivos propostos, foi realizado o preparo do extrato etanólico de folhas de Tabebuia aurea (EETA), em seguida, realizou-se seu fracionamento obtendo as frações hexânica, clorofórmica, acetato de etila e metanólica. Foram realizados testes de prospecção fitoquímica, avaliação da viabilidade celular in vitro pelo método de Metiltetrazólio, determinação da concentração inibitória mínima (CIM) para bactérias e fungos e avaliação da atividade cicatrizante de feridas cutâneas em ratos a partir da aplicação tópica do EETA a 5%. A prospecção fitoquímica foi positiva para alguns metabólitos secundários da classe dos compostos fenólicos e esteroides. O teste de citotoxidade em células da linhagem J774.A1 demonstrou citotoxidade nas concentrações de 500, 100 e 10 µg/mL e viabilidade celular na concentração de 1 µg/mL. Na avaliação da CIM, o EETA não inibiu o crescimento dos microrganismos testados, muito embora as frações hexânica e clorofórmica do EETA demonstraram atividade na concentração de 1000 µg/mL para a bactéria Escherichia coli. Nenhuma das frações inibiu o fungo Candida albicans. No estudo da atividade cicatrizante de feridas na avaliação macroscópica das feridas, o grupo EETA apresentou menor rubor perilesional e inflamação no processo inicial da cicatrização e formação de crosta espessa aderida à ferida, o que interferiu na retração das bordas apresentando percentual de contração negativo até o 11º dia de tratamento (-35,40%, -8,85% e - 1,18%) e positivo no 14º (22,71%). Os grupos controles positivo e negativo demonstraram semelhança na evolução da cicatrização, apresentando percentual de contração de 85,54% e 80,23%, respectivamente, no 14º dia. A análise histopatológica das feridas não demonstrou significância estatística na cicatrização entre os grupos no 3º e 7º dias, e significância para o grupo EETA no 14º dia, mostrando reepitelização inferior aos grupos positivo e negativo relacionado à formação de crosta. A avaliação macroscópica e histopatológica do fígado e dos rins não apresentou sinais de toxicidade assim como não houve alteração na avaliação bioquímica, indicando que o EETA utilizado topicamente por 14 dias não promove danos no modelo animal utilizado. Conclui-se que o EETA não possui atividade antimicrobiana e as frações hexânica e clorofórmica possuem fraca atividade para a bactéria E. coli; demonstrou citotoxicidade in vitro em concentração a partir de 10 µg/mL e ausência de toxicidade in vivo; sua atividade cicatrizante não foi superior aos controles avaliados neste estudo. Sugere-se investir em estudos que avaliem a atividade anti-inflamatória do EETA.
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Diversidade genética, sistema de reprodução, estrutura genética espacial e fluxo gênico em Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. f. ex S. Moore no Cerrado / Genetic diversity, mating system, spatial genetic structure and gene flow in Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. f. ex S. Moore in the Cerrado

Maria Carolina Silva 14 February 2011 (has links)
O bioma Cerrado é considerado atualmente área crítica para a conservação mundial em decorrência do seu endemismo e da atual velocidade de devastação. Quanto mais fragmentadas e perturbadas as paisagens naturais, maiores são os desafios para a manutenção da sua variabilidade genética, que possui hoje um papel de destaque na definição das estratégias de conservação e manejo de populações naturais. Visando a propor recomendações para estratégias de conservação in situ com base em indicadores genéticos, este trabalho objetivou estudar, por meio de oito locos microssatélites nucleares, a diversidade genética, o sistema de reprodução, a estrutura genética espacial e o fluxo gênico de Tabebuia aurea (Bignoniaceae) em remanescentes de Cerrado do Estado de São Paulo e do Mato Grosso do Sul. Foram mapeadas oito populações de T. aurea representadas por 290 árvores adultas. Além disso, foram produzidas 750 progênies (25 plântulas de 30 matrizes), totalizando 1040 genotipagens. Os resultados indicaram que os adultos nem sempre detêm maior heterozigosidade que as progênies, e os índices de fixação de suas populações mostraram-se altos e significativos. Os locos analisados indicaram que existe estruturação da variabilidade genética intrapopulacional de T. aurea na maioria das populações. Apesar de haver semelhanças entre regiões e populações, não há um padrão espacial claro da variabilidade genética. Os correlogramas, entretanto, apoiaram a hipótese de dispersão de sementes espacialmente restrita. Detectou-se, no entanto, uma alta taxa de imigração de pólen nas populações de Assis (74%) e de Pedregulho (87%), e as distâncias de dispersão contemporânea de pólen variaram de 0 a 167m para Assis e de 0 a 7002m para Pedregulho, sugerindo intenso movimento de genes nas populações. De acordo com as estimativas das taxas de cruzamento, as populações apresentaram um sistema de reprodução de cruzamentos em Assis e Pedregulho ( m t = 0,997; m t = 1,000, respectivamente), indicando a presença de mecanismos de autoincompatibilidade para a espécie. Verificou-se que a divergência genética populacional não se distribuiu igualmente entre as populações e que ocorre o fenômeno de isolamento pela distância. Os tamanhos efetivos populacionais dos adultos indicaram que a maioria dos remanescentes estudados possui áreas de tamanhos inferiores às encontradas pelas estimativas de área mínima viável para a conservação. Apenas o Parque Estadual das Furnas do Bom Jesus, Pedregulho-SP, contém área suficiente para a conservação do potencial evolutivo das populações de T. aurea. Visando à coleta de sementes para estratégias de conservação, os resultados sugeriram que a coleta deve ser realizada em, no mínimo, 18 e 20 matrizes, para Assis e Pedregulho, respectivamente, para a retenção de tamanhos efetivos de 50. / The Cerrado biome is considered a critical area for worldwide conservation due to its endemism and the current devastation speed. The fragmented and disturbed natural landscapes are the biggest challenges for the maintenance of genetic variability, which today has a leading role in defining conservation and management strategies of natural populations. This work intends to propose recommendations for in situ conservation strategies based on genetic markers. With the help of eight nuclear microsatellite loci, the study will verify the genetic diversity, the breeding system, the spatial genetic structure and the gene flow of Tabebuia aurea (Bignoniaceae) in Cerrado remnants of the State of São Paulo and Mato Grosso do Sul. Eight populations of T. aurea with 290 adult trees were mapped. In addition, 750 progeny were produced (25 seedlings of 30 mother-trees), totaling 1040 genotyping. The results indicated that adult trees occasionally have higher heterozygosity than seedlings and the fixation index in the populations were high and significant. The loci analyzed indicated that most populations of T. aurea had structuring of the genetic variability. There are similarities between regions and populations, but there is no clear pattern of spatial genetic structure, although the correlogram supported the hypothesis of spatially restricted seed dispersal. In turn, high immigration rates of pollen were found on populations of Assis (74%) and Pedregulho (87%) and the distances of the pollen contemporary distribution had been variating between 0 and 167m to Assis and between 0 and 7002m to Pedregulho, what suggests an intense movement of genes in the populations. According to the outcrossing rates estimated, the populations showed an outcrossing breeding system in Assis and Pedregulho ( = 0.997, = 1.000, respectively), indicating the presence of self-incompatibility mechanisms in this species. It was found that the population genetic divergence was not equally distributed among the population, and so, isolation by distance phenomena may be occuring. The minimum viable area for conservation estimates of adults trees indicated that most part of the areas have sizes below of recommended. Only the State Park Furnas do Bom Jesus, Pedregulho, SP, contains sufficient area for the conservation of evolutionary potential of populations of T. aurea. The results suggest that the seed collected for conservation strategies, must come from a minimum of 18 and 20 mother-trees, respectively, from Assis and Pedregulho.
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Características fisiológicas de mudas de craibeira sob condições de deficiência hídrica / Physiological characteristics of seedlings of craibeira under hydric deficiency conditions

Freire, Fátima Conceição de Jesus 23 May 2016 (has links)
Tabebuia aurea is a native species of the Caatinga biome, popularly called “craibeira”, able to grow and develop itself under adverse conditions. The objective of this study is to evaluate the physiological characteristics of this plant under hydric stress conditions. Thus, the experiment was conducted in pots in a greenhouse with seedlings of approximately three months which were submitted to 29 days at controlled environmental conditions applying nine replicates per each distinct treatment: controlled (irrigated), with soil hydric potential around-0.26 MPa and under stress, with hydric potential of -4.88 MPa. After this period of culture, morphological and physiological characteristics of the plants were evaluated. It was verified that under hydric stress, plants decrease the leaf area and accumulated dry mass in leaf and stem. Other reductions were presented in the hydric potential in leaves (during predawn and noon) SPAD index, stomatal conductance, transpiration, photosynthesis, effective quantum efficiency of photosystem II. In the other hand, there is an increase in the instantaneous and intrinsic water efficiencies, leaf proline content, besides the grown in activity of enzymes dismutase superoxide and ascorbate peroxidase. Considering these resu7lts, the conclusion is the hydric stress leads a limitation of the leaf dydric potential and the stomatal opening, causing injury in the photosynthesis process. As a consequence, Tabebuia aurea has damage in dry mass accumulation. Despite this species is under the effects of hydric defict, it occurred proline osmoregulatory activity and enzymatic antioxidant system protective activity against the harmful effects of oxygen reactive species; there was no cellmembrane degradation . the studied species has rusticity and phenotypic plasticity . Thus, it is probably recommended for reforestation processes once the drought resistance potential enables to support low levels of soil hydric potential , high levels of vapor pressure deficit and solar radiation, due to the adjustment of its metabolism under adverse conditions / Craibeira (Tabebuia aurea) é uma espécie nativa do bioma Caatinga, apresentando estratégias que lhe permite o seu crescimento e desenvolvimento frente às condições adversas deste bioma. O objetivo do presente trabalho foi avaliar as características fisiológicas de plantas Para isso, o experimento foi conduzido em vasos em casa de vegetação com mudas de aproximplementação de dois tratamentos, controle em torno de -0,26 MPa, e sob estresse (estressada) com potencial hídrico de -4,88 MPa, com nove repetições cada tratamento. Após 29 dias de estresse, foram avaliadas características morfológicas e fisiológicas das plantas. A craibeira sob deficiência hídrica apresentou redução na área foliar e no acúmulo de massa seca na folha e no caule; pôde-se observar também redução no potencial hídrico das folhas (antemanhã e meio-dia), índice SPAD, condutância estomática, transpiração, fotossíntese, eficiência quântica efetiva do fotossistema II. Por outro lado, a craibeira sob condições de estresse aumentou a eficiência instantânea no uso da água, eficiência intrínseca no uso da água, o teor de prolina foliar e aumento da atividade das enzimas superóxido dismutase e ascorbato peroxidase sob estresse. Diante dos resultados, chegou-se a conclusão que a deficiência hídrica em plantas de craibeira limitou o potencial hídrico foliar, e a abertura dos estômatos prejudicando a fotossíntese o que ocasionou prejuízo no acúmulo de massa seca. Apesar de esta espécie estar sob os efeitos do déficit hídrico, ocorreu a atividade osmorreguladora da prolina e atividade protetora do sistema antioxidante enzimático contra os efeitos deletérios das espécies reativas de oxigênio, não havendo comprometimento de membrana celular. A espécie estudada possui rusticidade e plasticidade fenotípica e, provavelmente é uma boa indicação para processos de reflorestamento, revelando um potencial de resistência à seca, suportando baixos níveis de potencial hídrico do solo, altos níveis de déficit de pressão de vapor e radiação solar, conseguindo ajustar o seu metabolismo em condições adversas.
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Armazenamento de sementes de craibeira (Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth & Hook. F. ex S. Moore) / Storage of craibeira (Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. F. ex. S. Moore) seeds.

BARBOSA, Mozart Duarte 21 June 2004 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-09-01T12:08:17Z No. of bitstreams: 1 Mozart Duarte Barbosa (1).pdf: 425228 bytes, checksum: 4f1c3a3dc00c3049007e624b85aea247 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-01T12:08:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mozart Duarte Barbosa (1).pdf: 425228 bytes, checksum: 4f1c3a3dc00c3049007e624b85aea247 (MD5) Previous issue date: 2004-06-21 / This work aimed to evaluate the conservation of the seeds of the craibeira (Tabebuia aurea (Silva Manso) Benth. & Hook. F. ex. S. Moore) in differents storage environment and packings. The craibeira seeds were collected from 20 trees located in the metropolitan area of city of Recife-PE. After the collection, seeds were submitted to selection and homogenization. The seeds of water 14,94% were conditioned in the packings Kraft paper bag, poliethylene bag and metal recipient in stored under environmental laboratory (25,68 °C and 63,83%), refrigerator (5,08 °C and 48,70%) and dry cold (20,48 and 41,73%) during nine month period. The experiment was completely ramdom, with 4 repetitions of 25 seeds. The physiologic quality of the seeds was evaluated at the beginning and at every 30 days of storage, through the germination and vigor (index of germination speed (IVG) and root length) determinate seed moisture content. The results showed that the seeds present the largest germination averages and vigor when conditioned in Kraft paper bag or metal recipient, in the dry cold / O presente trabalho teve como objetivo avaliar a conservação de sementes de craibeira (Tabebuia aurea) em diferentes ambientes de armazenamento e embalagens. As sementes de craibeira, oriundas de 20 árvores localizadas na região metropolitana do Recife-PE, após a coleta, foram submetidas à seleção e homogenização. Estas com 14,94% de água foram acondicionadas nas embalagens saco de papel Kraft, saco de polietileno e em recipiente metálico, em ambiente natural de laboratório (25,68°C e 63,83% UR), geladeira (5,08°C e 48,70 % UR) e em câmara seca (20,48°C e 41,73% UR) durante nove meses. O experimento foi instalado em delineamento inteiramente casualizado, em esquema de parcelas subdivididas, com 4 repetições de 25 sementes. A qualidade fisiológica das sementes foi avaliada no início e a cada 30 dias de armazenamento, através da germinação, vigor (índice de velocidade de germinação (IVG) e comprimento de raiz) determinando-se também o teor de água das sementes. Os resultados permitiram concluir que as sementes apresentaram as maiores médias de germinação e vigor quando foram acondicionadas em embalagens de papel Kraft ou em recipiente metálico, em ambiente de câmara seca

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