Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-08-13T15:19:40Z No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-15T14:04:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-15T14:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LeydyLorenaMendozaTobar.pdf: 2616918 bytes, checksum: 6590982254752b2aa82977414720ad55 (MD5) / A cultura de tomate no Brasil é uma das mais importantes do ponto de vista econômico e social. Estudos publicados pela FAO em 2011 posicionam o Brasil no oitavo lugar do ranking mundial de produção. O cultivo de tomateiro no Brasil é feito em diferentes estados e durante grande parte dos meses do ano, favorecendo a ocorrência de diferentes doenças de importância econômica, dentre elas, destacam-se aquelas causadas por espécies do gênero Begomovirus. O gênero Begomovirus encontra-se composto por espécies com partículas geminadas formadas por dois icosaedros incompletos e ácido nucleico do tipo ssDNA encapsidado em um componente ou dois componentes genômicos (DNA A e B), denominadas de monopartidas ou bipartidas, respectivamente. Até o presente momento no Brasil, em tomateiro, não foram relatadas espécies de begomovírus de genoma monopartido. Espécies de Begomovirus são transmitidas com grande eficiência pelo vetor Bemisia tabaci. Para controle das doenças causadas por espécies de Begomovirus esforços vêm sendo concentrados no desenvolvimento de materiais elite através da introgressão de genes de resistência, muitas vezes, provenientes de acessos selvagens do gênero Solanum. Um exemplo é a linhagem LAM 144R que contém o gene dominante Ty-1 caracterizado por conferir resistência a diferentes espécies de Begomovirus. Neste trabalho a linhagem LAM 144R foi avaliada com o objetivo de elucidar os mecanismos virais da resistência conferida pelo Ty-1 e a amplitude da resistência deste gene frente às espécies de Begomovirus bipartidos encontrados no Brasil: Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV), Tomato rugose mosaic virus (ToRMV), Tomato severe rugose virus (ToSRV) e Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). A avaliação da replicação viral foi realizada mediante experimentos de agroinfiltação do componente A de ToCMoV na linhagem resistente LAM 144R e na isolinha suscetível LAM 144S. A quantificação da carga viral foi realizada por PCR quantitativa em tempo real (qPCR), usando primers específicos para capa proteica (CP1). Os dados foram analisados pelo teste não paramétrico Kruskal-Wallis. O título viral foi significativamente menor nas plantas da isolinha LAM 144R em comparação com LAM 144S, mostrando uma quantidade duas vezes menor de carga viral na linhagem resistente no décimo dia após a infiltração. Para avaliar o efeito deste gene no movimento a longa distância de Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) na linhagem LAM 144R duplas enxertias foram realizadas. Plantas LAM 144S (suscetível) foram inoculadas com ToCMoV. Duplas enxertias foram realizadas utilizando como enxerto segmentos de LAM 144R ou LAM144S e como sobre-enxerto, LAM 144S. Amostras foram coletadas em diferentes tempos após as enxertias e a detecção de ToCMoV por PCR e Southern blot mostraram uma restrição no movimento viral a longa distância quando foram usadas as plantas LAM 144R contendo o gene Ty-1 como enxerto Para o estudo da amplitude da resistência conferida pelo gene Ty-1 na linhagem LAM 144R, plantas foram inoculadas via biobalística com DNA das quatro espécies de Begomovirus mencionadas acima. Como controle positivo utilizou-se plantas de LAM 144S. As avaliações de sintomas foram realizadas aos 21 e 40 dias após inoculação (dai) e a acumulação viral foi avaliada aos 30 (dai) mediante Southern Blot usando sondas para o componente A de Begomovirus. Como resultado as plantas de LAM 144R inoculadas com ToCMoV apresentaram sintomas leves e baixa acumulação viral. Para ToSRV observou-se ausência de sintomas ou sintomas leves e baixa acumulação viral. Para ToRMV poucas plantas apresentaram sintomas leves e não foi detectada acumulação viral. Para ToYVSV observou-se sintomas leves em algumas plantas, um baixa acumulação viral em cinco delas e uma forte acumulação em duas amostras. Os resultados encontrados neste estudo demonstram que LAM 144R pode ser considerada promissora para uso em programas de melhoramento no desenvolvimento de diferentes cultivares comerciais. _____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The tomato crop in Brazil is important economically and socially. FAO placed, Brazil in the 8th position in the world rank of tomato production. Tomatoes in Brazil are grown in different states and during most months of the year, what favors the appearance of different diseases of economic importance, such as those caused by begomoviruses. Begomoviruses are transmitted very efficiently by the vector Bemisia tabaci. The genome can be either monopartite or bipartite (DNA A and DNA B). So far, only bipartite tomato begomoviruses have been reported in Brazil. To control diseases caused by begomovirus include the development of elite materials through introgression of resistance genes from wild Solanum accessions. An example is the line LAM 144R that contains the dominant gene Ty-1 which confer resistance to different Begomovirus species. This line LAM 144R was here evaluated in order to elucidate the mechanisms of viral resistance conferred by Ty-1. The breadth of this resistance was tested by inoculation with four bipartite Begomovirus-especies found in Brazil: Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV), Tomato rugose mosaic virus (ToRMV), Tomato severe rugose virus (ToSRV), and Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). As positive control LAM 144S were used plants. Symptoms were scored at 21 and 40 days after inoculation (dai) and viral accumulation was evaluated at 30 (dai) by Southern blot. As a result LAM 144R mild symptoms and low or no viral accumulation was observed with ToCMoV, ToSRV, ToRMV and ToYVSV. The evaluation of virus replication was carried out by agronfiltration experiments of ToCMoV DNA-A in the resistance LAM 144R and susceptible LAM 144S isolines. Quantification of the viral load was performed by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using primers specific for coat protein (CP1). Data were analyzed by nonparametric Kruskal-Wallis test. The viral titer was significantly lower in plants LAM 144R compared to the isoline LAM 144S, showing 2 times lower viral load in the resistant lineage ten days after agroinfiltration. To avaluate the effect of this gene on the long-distance movement of Tomato chlorotic mottel virus , in near isogening lines LAM 144R and LAM 144S, double grafts were performed. Plants LAM 144S (susceptible) were inoculated with ToCMoV. Double grafts were performed using graft segments of LAM 144R and LAM 144S and as overgraft, LAM 144S plants. Samples were collected at different times after grafting and ToCMoV was detected by PCR, Southern blot, and tissue blott showing a restriction in long-distance viral movement when plants LAM 144R containing the Ty-1 gene was used as graft. The results of this study demonstrate that LAM 144R can be considered promising for the use in breeding programs for the development of new resistent cultivars. The evaluation of virus replication was carried out by agronfiltration of ToCMoV DNA-A in the resistant LAM 144R and susceptible LAM 144S isolines. Quantification of viral load was performed by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using primers specific for the coat protein (CP1). Data was analyzed by nonparametric Kruskal-Wallis test. The viral titer was significantly lower in plants LAM 144R compared to the LAM 144S, showing 2 times lower viral load in the resistant line at tenth day after agroinfiltration. To evaluate the effect of this gene on the long-distance movement of Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) in the near isogenig lines LAM 144R and LAM 144S, double grafts were performed. Plants LAM 144S (susceptible) were inoculated with ToCMoV. Double grafts were performed using as grafts LAM 144R or LAM 144S segments and as overgrafts, LAM 144S plants. Samples were collected at different times ToCMoV was detected by PCR and Southern blot showing a restriction in long-distance viral movement when plants LAM 144R containing the Ty-1 gene was used as grafts. The results of this study demonstrate that LAM 144-R can be considered promising for the use in breeding programs for the development of new resistent cultivars to different Begomovirus species.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Molecular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-08-12T14:05:17Z No. of bitstreams: 1 2013_LigiaMoreiradeAlmeida.pdf: 1709399 bytes, checksum: 799e962d60dcfee21c8420ba47ada14d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-15T14:38:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LigiaMoreiradeAlmeida.pdf: 1709399 bytes, checksum: 799e962d60dcfee21c8420ba47ada14d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-15T14:38:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LigiaMoreiradeAlmeida.pdf: 1709399 bytes, checksum: 799e962d60dcfee21c8420ba47ada14d (MD5) / Os begomovírus pertencem à família Geminiviridae e são transmitidos eficientemente pelo vetor Bemisia tabaci, conhecido como mosca-branca. Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) é um dos principais begomovírus que afetam a cultura do tomateiro no Brasil. Plantas infectadas com ToCMoV geralmente desenvolvem sintomas de clorose internerval, manchas cloróticas e mosqueado amarelo. ToCMoV e outros begomovírus do Novo Mundo são compostos por dois componentes de DNA circular de fita simples (conhecidos como DNA-A e DNA-B) que se replicam no núcleo das células infectadas. Uma das melhores estratégias para controle da dispersão da doença é o emprego de cultivares resistentes. Recentemente, uma linha quase isogênica de ‘Santa Clara’ (SC) chamada ‘LAM 157’, carregando o gene de resistência tcm-1, foi obtida pela Embrapa Hortaliças. O gene tcm-1 confere resistência a diferentes espécies de begomovírus e é caracterizado pela redução ou ausência de sintomas e restrição do acúmulo viral em plantas infectadas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a resistência conferida na linhagem LAM 157 em resposta à infecção causada pelo begomovírus ToCMoV. Os mecanismos de replicação e movimento viral a longa distância foram avaliados na linhagem LAM 157 e na linhagem suscetível ‘Santa Clara’. A replicação viral foi analisada por meio de agroinfiltração de folíolos com o DNA-A de ToCMoV seguida de quantificação absoluta do acúmulo viral resultante por qPCR no segundo, sexto e décimo dias após a agroinfiltração. A quantidade de DNA viral aumentou com o tempo em todas as plantas infectadas, evidenciando a replicação viral. No entanto, essa quantidade foi estatisticamente menor em LAM 157. O movimento viral a longa distância foi avaliado por meio de dupla-enxertia sobre porta enxerto ‘Santa Clara’ infectado com ToCMoV e posterior análise por PCR, para determinar se a resistência conferida pela linhagem LAM 157 impediria a movimentação do vírus a longa distância. Foi possível detectar a presença de ToCMoV por PCR nos folíolos apicais do grupo controle, 10 dias após a primeira enxertia. Neste momento, não foi detectado vírus no grupo com enxertos de plantas resistentes, evidenciando um atraso no movimento viral. Trinta dias após a segunda enxertia, todas as plantas do grupo controle encontravam-se infectadas, enquanto no grupo com plantas LAM 157, em apenas duas de seis plantas foi detectada a presença do vírus. Os resultados sugerem que a resistência apresentada pela isolinha LAM 157 se deve a restrição na replicação viral aliada a uma menor eficiência no movimento viral. Os MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs endógenos que regulam a expressão de diversos genes que estão envolvidos com muitos processos biológicos fundamentais. Para verificar uma possível expressão diferencial de miRNAs em tomateiros inoculados com ToCMoV, foram analisados o acúmulo de miRNAs previamente associados com o desenvolvimento da planta e miRNAs relacionados com as respostas à estresse. Plantas suscetíveis de SC e de plantas resistentes da linhagem 'LAM 157' foram inoculados por bombardeamento de partículas com clone infeccioso de ToCMoV. Ácidos nucleicos totais foram isolados a partir de folhas apicais com infecção sistêmica, 17 dias após a inoculação, e separados em gel desnaturante de poliacrilamida. Foram realizados Northern blots utilizando como sondas oligonucleótidos complementares aos miRNAs, marcados com γ32P-ATP na extremidade 5’. A quantidade de miRNAs 159, 164, 168 e 172 (previamente associados com o desenvolvimento da planta) acumulada pelas plantas controle, foi comparada nas plantas SC e ‘LAM 157’ infectadas com ToCMoV. Os resultados mostraram um acúmulo diferencial de miRNAs entre plantas resistentes e suscetíveis, infectados e controles inoculados. Estes resultados sugerem que a expressão dos miRNAs da planta hospedeira pode ser afetada em consequência da infecção por ToCMoV e podem refletir diferenças na intensidade da expressão de sintomas, bem como nos níveis de resistência ao vírus. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Begomoviruses belong to the Family Geminiviridae and are efficiently transmitted by the vector Bemisia tabaci, also known as whitefly. Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) is one of the main begomovirus species affecting tomatoes in Brazil. Plants infected with ToCMoV generally develop symptoms of vein chlorosis, chlorotic spots, and mottling. ToCMoV and other begomoviruses from New World are composed by two circular single stranded DNA components (known as DNA-A and DNA-B) that replicate in the nucleus of infected cells. One of the best strategies to control the disease spread is the use of resistant cultivars. Recently, a ‘Santa Clara’ (SC) near-isogenic line named ‘LAM 157’ carrying the resistance locus tcm-1 was obtained by Embrapa. The broad tcm-1 locus resistance to different begomovirus species is characterized by the reduction or absence of symptoms and restriction of virus accumulation in infected plants. This work aimed to describe the resistance conferred by the tcm-1 locus in ‘LAM 157’ in response to the infection caused by the begomovirus ToCMoV. The mechanisms of viral replication and movement were evaluated in resistant line LAM 157 and in susceptible line ‘Santa Clara’. Viral replication was analyzed in leaves vacuum-agroinfiltrated with the ToCMoV DNA-A, followed by the absolute quantification of viral accumulation by qPCR two, six and ten days after agroinfiltration. The amount of viral DNA increased with time in all the infiltrated plants reflecting viral replication, but it was significantly lower in ‘LAM 157’. For evaluation of viral long distance movement, a double grafting experiment was performed. ToCMoV infected SC plants were used as rootstock in two groups where scions of susceptible SC and resistant LAM 157 were grafted. In both, final scions were SC plants. ToCMoV was detected by PCR in apical leaves from control group 10 days after the first grafting. At this time, no virus was detected in resistant grafts confirming a delay in virus movement. Thirty days after the second grafting, all plants from the control groups were infected, while in the group of LAM 157 intergraft only in two of six plants were detected the presence of virus. The results indicated that the resistant response in “LAM 157” is due the restriction of viral replication, in addition to a lower efficiency of viral movement in these resistant plants. MicroRNAs (miRNAs) are small endogenous RNAs that regulate the expression of several genes that are involved in many important biological processes. To verify a possible differential expression of miRNAs in tomato inoculated with ToCMoV, the accumulation of miRNAs previously reported to be related to plant development and with stress responses was studied. Susceptible ‘Santa Clara’ (SC) plants and resistant ‘LAM 157’ plants were inoculated by particle bombardment with infectious clone of ToCMoV. Total nucleic acids were isolated from systemically infected leaves 17 days post inoculation and loaded in denaturing polyacrylamide gel. Northern blots were performed using as probes gamma32P-γATP end-labeled oligonucleotides complementary to miRNAs. The amount of miRNAs 159, 164, 168 and 172 (previously related with plant development) accumulated by control plants of SC and ‘LAM 157’ was compared with those in ToCMoV-infected plants. The results showed differential accumulation of miRNAs between infected susceptible and resistant plants and mock-inoculated controls. These results suggest that the expression of host miRNAs can be affected as a result of ToCMoV infection and may reflect differences in symptom expression intensity as well as in the levels of virus resistance.

Resumo não disponível

Submitted by Lucelia Lucena (lucelia.lucena@ufpe.br) on 2015-03-10T17:42:27Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação de Mestrado em Nutrição UFPE (2012) - Daline Araújo.pdf: 1574398 bytes, checksum: 2857add62bab55c81e5b0f1f8efa8d63 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-10T17:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação de Mestrado em Nutrição UFPE (2012) - Daline Araújo.pdf: 1574398 bytes, checksum: 2857add62bab55c81e5b0f1f8efa8d63 (MD5) Previous issue date: 2012 / O cultivo orgânico vem se expandindo ao longo dos anos devido à procura por alimentos mais saudáveis, por serem associados com melhores propriedades nutricionais, e pela ausência de resíduos de agrotóxicos. A composição nutricional dos alimentos orgânicos tem sido bastante explorada pela comunidade científica e de interesse para a população. Os minerais contidos nos alimentos apresentam funções importantes no organismo como constituintes estruturais dos tecidos corpóreos, reguladores orgânicos, componentes de enzimas, além de estarem envolvidos no crescimento e desenvolvimento. Por outro lado, os metais pesados fazem parte dos componentes ativos de muitos agrotóxicos e sua ingestão excessiva pode provocar desde intoxicação química até alguns tipos de cânceres. O objetivo deste estudo foi analisar comparativamente a composição físico-química e resíduos de agrotóxicos em alfaces, pimentões e tomates cultivados em sistemas orgânicos e convencionais. Amostras dos três vegetais foram adquiridas no Centro de Abastecimento Alimentar de Pernambuco. A composição físico química foi determinada de acordo com os procedimentos analíticos da AOAC, sendo os minerais (Cu, Cr, Fe, K, Mn, Mg, Na, Zn) e metais pesados (Cd, Ni, Pb) determinados por espectrometria de absorção atômica em chama e os resíduos de agrotóxico por cromatografia gasosa e líquida associada a detectores específicos por classe. Os resultados foram comparados pelo teste t de Student (p<0,05). Análise de Componente Principal foi realizada para obter correlações entre os minerais e metais pesados. Para as três hortaliças medidas de peso, comprimento e largura foram maiores para os convencionais. Na composição centesimal alface e pimentão apresentaram diferenças significativas (p<0,05) entre os cultivos. A fibra alimentar total apresentou valores superiores para os cultivos orgânicos nas três hortaliças. Verificou-se variação na composição de minerais e metais pesados para alface, pimentão e tomate e contaminação de resíduos de agrotóxicos nos pimentões convencionais e tomates orgânicos. Através da ACP os tomate orgânico e convencional apresentaram valores de escores mais positivos para Cr e Zn, por outro lado, alface orgânica e pimentão convencional escores negativos para K, Mg, Na, Cd e Pb, representados pela componente principal 1 e 2, respectivamente.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Engenharia e Ciência de Alimentos, Escola que Química e Alimentos, 2010. / Submitted by Caroline Silva (krol_bilhar@hotmail.com) on 2012-08-13T20:09:02Z No. of bitstreams: 1 karen.pdf: 1201665 bytes, checksum: 029db9988527cfe9b943b9a5f0b24c2f (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2012-12-06T04:50:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 karen.pdf: 1201665 bytes, checksum: 029db9988527cfe9b943b9a5f0b24c2f (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-06T04:50:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 karen.pdf: 1201665 bytes, checksum: 029db9988527cfe9b943b9a5f0b24c2f (MD5) Previous issue date: 2010 / O tomate (Lycopersicon esculentum Mill) constitui um alimento rico em vitaminas dos complexos A e B e minerais importantes, além de ácido fólico, cálcio e frutose. Ainda o tomate contém licopeno, que é um poderoso antioxidante, capaz de neutralizar a ação dos radicais livres, responsáveis pelo envelhecimento e degeneração das células Poucos produtos in natura têm um conteúdo de umidade tão alto quanto o tomate (cerca de 95%, b.u.) e a sua desidratação tem sido um desafio. A secagem é uma importante operação unitária na conservação de alimentos, pois tem a finalidade de reduzir a atividade de água e conseqüentemente a ação microbiana, reações enzimáticas, oxidativas e hidrolíticas do produto e aumentar sua vida útil. Este trabalho teve como objetivo principal analisar as condições operacionais da secagem de tomate em camada delgada, com escoamento paralelo do ar de secagem, avaliando as características do produto final. Os objetivos específicos foram caracterizar a secagem através de curvas características experimentais, determinar a constante de secagem, difusividade efetiva de umidade e energia de ativação e definir a condição mais adequada para a secagem em camada delgada de tomate utilizando a metodologia de superfície de resposta. As variáveis estudadas foram temperatura (60, 70 e 80°C) e espessura da fatia de tomate (3, 5 e 7mm), buscando como resposta o teor de licopeno, cor, através do ângulo de Hue, e capacidade de produção. Os resultados mostraram que a secagem de tomate em camada delgada, com escoamento paralelo do ar, apresentou o período de taxa constante e primeiro e segundo períodos de taxa decrescente. A difusividade efetiva ficou entre 1,56.10-10 e 2,67.10-10 m²/s para o primeiro período de taxa decrescente e entre 4,21.10-11 e 8,35.10-11 m²/s para o segundo período de taxa decrescente. A energia de ativação apresentou valores médios de 16,99 e 30,64 kJ.mol-1 para o primeiro e segundo período de taxa decrescente, respectivamente. A condição mais adequada de operação encontrada foi temperatura do ar de secagem de 60°C e espessura da fatia de tomate de 3 mm, onde apresentou cor de 47,70°, teor de licopeno de 301,69 μg/g e capacidade de produção de 1,65 kg/m²h. / Tomato (Lycopersicon esculentum Mill) is a product rich in vitamins from complex A and B, and important minerals, besides folic acid, calcium and fructose. Tomato has also lycopene, that is a powerful antioxidant, able to neutralize radicals action, which causes the cell’s aging and degeneracy. Few in natura products have moisture content as high as tomato (about 95%, w.b.) and its dehydration has been a challenge. Drying is an important unit operation for food conservation, because its aim is to reduce the water activity and therefore the microbian action, enzymatic reactions, oxidative and hydrolytic of the product and raise its expiration date. The main purpose of the present work is analyze the operational conditions of tomato thin layer drying, using parallel flow of drying air, evaluating the final product characteristics. The specific purposes were to characterize drying through characteristics experimental curves, to determine the drying constant, moisture effective diffusivity and activation energy and also define the more suitable condition to dry tomato in thin layer based on surface response methodology. The studied variables were temperature (60, 70 and 80°C) and tomato thickness (3, 5 and 7mm), searching as responses the lycopene percentage, color though the Hue’s angle, and manufacture capacity. The results showed that tomato’s thin layer drying, using a parallel flow, reveals the constant rate period and the first and second periods of decreasing rates. The effective diffusivity was between 1,56.10-10 and 2,67.10-10 m²/s for the second period of decreasing rate. The activation energy has shown average values of 16,99 and 30,64 kJ.mol-1 for the first and second periods of decreasing rates, respectively. The best operational condition found was 60°C of drying temperature and 3 mm of tomato thickness, where reveals 47,70° of color, 301,69 μg/g of lycopene percentage and manufacturing capacity of 1,65 kg/m²h.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-09-18T14:11:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1374908 bytes, checksum: fdd5dbffd013f92a4375592a131835fd (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-18T14:11:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1374908 bytes, checksum: fdd5dbffd013f92a4375592a131835fd (MD5) Previous issue date: 2018-03-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Clonostachys rosea é eficaz no biocontrole de várias doenças fúngicas. Ao longo dos anos, constatou-se a eficiência de isolados obtidos no Brasil no biocontrole do mofo cinzento do tomateiro, causado por Botrytis cinerea. Há evidências de que o isolado NCR61/F produza compostos supressivos ao patógeno, mas desconhecia-se a bioatividade e a natureza desses compostos. Assim, estudou-se a bioatividade de compostos de filtrados e extratos do cultivo de C. rosea em meio líquido a B. cinerea e se caracterizaram os metabólitos secundários produzidos. Filtrados e extratos do crescimento do isolado inibiram o crescimento micelial e a germinação de conídios de B. cinerea. O antagonista produziu 51 metabólitos, como peptaibols, glisopreninas e bissorbicilinoides e alguns inderterminados, principalmente após 10 dias de cultivo. Clonostachys rosea é adaptado a diferentes ecossistemas e pode colonizar tecidos de raízes e folhas, mas a dinâmica de sobrevivência nesses tecidos é pouco compreendida. Estudou-se a sobrevivência do isolado NCR61/F como epífita em folhas, na rizosfera e no rizoplano de tomateiros, até 48 dias após a aplicação. A sobrevivência do antagonista diminuiu ao longo do tempo nas superfícies foliares e radiculares, mas sua população permaneceu estável na rizosfera de tomateiros. Um aspecto fundamental e inédito quanto a aplicações de C. rosea é seu efeito na microbiota de folhas de tomateiro, o que foi, também, estudado. O efeito deletério de C. rosea no microbiota foi de curta duração e transiente. O efeito foi maior nas comunidades epifítica e endofítica de fungos, com maior redução em diversidade e riqueza de comunidades até 3 dias após a aplicação. A abundância de filos e alguns gêneros, como Cladosporium e Alternaria, e Cercospora foi menor nas plantas tratadas com o antagonista que nas não tratadas. Em bactérias epifíticas, houve maiores alterações na diversidade aos 3 e 12 dias, e gêneros como Bacillus, Arthrobacter and Enterobacter foram menos abundantes nos dias iniciais após a aplicação. Ao final das avaliações (24 dias), houve resiliência da microbiota foliar de plantas tratadas com o antagonista e aumento gradual das populações. Em conclusão, constatou-se que C. rosea produz compostos inibitórios a B. cinerea, pode sobreviver em folhas e raízes e rizosfera de tomateiro e altera de forma transitória as comunidades fúngicas e bacterianas da solanácea. As informações aqui geradas são relevantes para compreender os mecanismos de antagonismo de C. rosea NCR61/F, sua capacidade de sobrevivência e o efeito perturbador da sua aplicação no microbiota do tomateiro. O conhecimento gerado é importante para traçar estratégias de uso do antagonista e, até mesmo, para validar o seu uso sustentável como agente de biocontrole. / Clonostachys rosea is effective in biocontrol of several fungal diseases. Over the years, we studied the efficiency of isolates obtained in Brazil in the biocontrol of gray mold of tomato, caused by Botrytis cinerea. There is evidence that the C. rosea isolate NCR61/F produces compounds suppressive to the pathogen, but the bioactivity and nature of these compounds was unknown. Thus, the bioactivity of filtrate compounds and extracts of C. rosea culture in liquid medium against B. cinerea was studied and the secondary metabolites produced were characterized. Filtratess and extracts from the growth of the isolate inhibited the mycelial growth and conidial germination of B. cinerea. The antagonist produced 51 metabolites, such as peptaibols, glisoprenins and bissorbicilinoids and some undetermined, mostly after 10 days of culture. Clonostachys rosea is adapted to different ecosystems and can colonize tissues of roots and leaves, but the dynamics of survival in these tissues is little understood. The survival of the isolate NCR61/F isolate was studied as epiphyte in leaves, rhizosphere and rizoplane of tomato plants, up to 48 days after application. The survival of the antagonist decreased over time on leaf and root surfaces, but its population remained stable in the tomato rhizosphere. A fundamental and new aspect of the applications of C. rosea is its effect on the microbiota of tomato leaves, which was also studied. The deleterious effect of C. rosea on the microbiota was transient. The effect was higher in the epiphytic and endophytic communities of fungi, with greater reduction in diversity and richness of communities until 3 days after application. The abundance of phyllum and some genera, such as Cladosporium, Alternaria and Cercospora was lower in plants treated with the antagonist than in plants not treated. Regarding epiphytic bacteria, there were major changes in diversity at 3 and 12 days, and genera such as Bacillus, Arthrobacter and Enterobacter were less abundant in the initial days after application. At the end of the evaluations (24 days), there was resilience of the foliar microbiota of plants treated with the antagonist and gradual increase of the populations. In conclusion, it was found that C. rosea produces inhibitory compounds to B. cinerea, can survive in leaves, roots and rhizosphere of tomato and transiently changes the fungal and bacterial communities of tomato plants. The information generated here is relevant to understand the mechanism of antagonism of C. rosea NCR61/F, its ability to survive and the disturbing effect of its application on the tomato microorganism. The generated knowledge is important to draw strategies of antagonist use and even to validate its sustainable use as biocontrol agent.

Orientador: Marcos David Ferreira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-07T02:04:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferrari_PauloRoberto_M.pdf: 2682736 bytes, checksum: 1234e4cfee02d4d64bcd7f8c5707982f (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: A tomaticultura de mesa nos últimos seis anos evoluiu com a implantação de unidades de beneficiamento, classificando os tomates através de equipamentos com sistema eletrônico e mecânico de classificação. A avaliação da classificação foi desenvolvida em duas unidades de beneficiamento de tomates de mesa, sistema de classificação eletrônica e mecânica, e em dois períodos de produção, safras de verão e inverno. O cultivar utilizado foi Carmen. Para cada safra foram realizadas três etapas: (1) Avaliar a conformidade de classificação por diâmetro e coloração dos equipamentos com sistema eletrônico e mecânico de classificação com o PROGRAMA BRASILEIRO PARA A MODERNIZAÇÃO DA HORTICULTURA (2003), (2) Verificar a conformidade de classificação por diâmetro obtida dos equipamentos, com a regulagem programada pela unidade de beneficiamento e (3) Acompanhamento da vida pós-colheita dos tomates provenientes da classificação nesses equipamentos em laboratório da Faculdade de Engenharia Agrícola ¿ UNICAMP, onde os tomates ficaram armazenados em câmara de refrigeração a temperatura ambiente de 24 ± 1ºC e umidade relativa de 75 ± 5% por um período de 20 dias. Foram realizadas análises como, perda de massa, qualidade visual, evolução da coloração, firmeza e químicas (pH, sólido solúvel, acidez titulável) e cálculo da relação sólido solúvel/acidez titulável. Dentre os resultados, não houve conformidade de classificação por diâmetro e coloração, dos equipamentos, com a norma de classificação do Programa. A conformidade de classificação obtida com a programada apresentou somente para classe de maior diâmetro, em ambos os equipamentos. Na avaliação da qualidade visual, os frutos sadios após armazenamento por 20 dias não apresentaram diferença significativa entre os equipamentos. Como razão de descarte, na safra de verão, enrugamento foi mais freqüente no equipamento eletrônico e a podridão no mecânico, na safra de inverno os descartes foram mais freqüentes no equipamento mecânico. A perda de massa foi maior no equipamento mecânico em ambas as safras. A evolução da coloração dos tomates foi mais intensa na safra de verão no equipamento mecânico e menor intensidade no inverno para o mesmo equipamento. Não houve diferenças significativas para a variação do índice de firmeza entre os equipamentos. As análises das características químicas, não foram significativas. O equipamento eletrônico apresentou melhor desempenho sobre o equipamento mecânico, em relação à classificação e na qualidade da vida pós-colheita dos frutos provenientes desta classificação. Embora utilize alta tecnologia, este equipamento deverá ser monitorado constantemente em suas atividades visando sua eficiência e viabilização do seu investimento. Pelos resultados apresentados, recomenda-se para o sistema mecânico, rever o sistema de classificação de correia de lona furada para que atenda a legislação de classificação do Programa Brasileiro para a Modernização da Horticultura, e garanta melhor desempenho nas etapas de lavagem, secagem e polimento / Abstract: The fresh market tomato industry has been evolved, in the last six years, with the implantation of tomato grade machines, electronical and mechanical equipments. Evaluation of the grading performance electronical and mechanical equipments was done at summer and winter seasons. The cultivar studied was Carmen. For each season, three main points were studied: (1) Evolution of the size and color grading conformity with the BRAZILIAN PROGRAM FOR HORTICULTURE MODERNIZATION standards. (2) Evaluation of size grading conformity with the one established by the packer. (3) Post harvest shelf life and grading quality of tomatoes during for 20 days in controlled environment at 24ºC ± 1ºC and 75% ± 5% RH, FEAGRI/UNICAMP. During storage, visual quality evaluation and physical and physical chemical analysis were done: weight loss, color evolution, firmness, pH, soluble solids, tritratable acidity and ratio. There was no grade conformity with the fresh tomato quality standards of the BRAZILIAN PROGRAM FOR HORTICULTURE MODERNIZATION. There was conformity with the grading programmed by the packer, only for large size, in both equipments. After storage for 20 days, there were not any significant statistic difference on fruit quality sorted by electronical and mechanical equipments. For summer season, the major cause for fruit discharge was shrunken fruits in electronical equipment and decay in mechanical equipment. For winter season there were high post harvest losses at the mechanical equipment. The highest weight loss was found on fruits sorted at the mechanical equipment at the two seasons. The mechanical equipment showed the most intense color evolution at summer season and the less intense at winter season. There were not statistical differences between the equipments for firmness loss. There were also not statistical differences, between the equipments for chemical analyses. The electronical equipment has presented better performance, compared to the mechanical equipment, considering grading performance and post-harvest fruits quality. Despite of its high technology the electronical equipment must be constantly monitored to achieve efficiency and return of the investment. The mechanical system must review its size grading, to achieve grade standards stablished by the BRAZILIAN PROGRAM FOR HORTICULTURE MODERNIZATION and must improve its cleaning operation / Mestrado / Tecnologia Pós-Colheita / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador: Lucia Maria Valente Soares / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-21T11:12:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Motta_Silvanada_D.pdf: 3489806 bytes, checksum: fe860b40e6c623f431c8b287dc0293aa (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: No presente trabalho foram desenvolvidos e avaliados dois métodos, sendo um para determinação de alternariol (AOH) e alternaria! monometil éter (AME) e outro para determinação de ácido cíclopiazônico (CpA) e ácido tenuazôiúco (TeA), em produtos de tomate por cromatografia líquida de alia eficiência utilizando detector espectrofotométrico de arranjo de diodos para quantificação e confirmação da identidade das toxinas. No método para AOH e AME os limites de detecção foram de 5,0 e 2,0 ng/g e as recuperações médias foram de 84,1 e 98,7%, respectivamente. Os desvios padrões relativos de diferentes preparações da mesma amostra variou de 0,1 a 14,6% para AOH e de 0,2 a 1,8% para AME. No método para CpA e TeA os limites de detecção foram de 8,0 e 11,0 ng/g e as recuperações médias foram 75,7 e 83,3%, respectivamente. Os desvios padrões relativos de diferentes preparações da mesma amostra variou de 1,1 a 23,9% para TeA e de 3,9 a 20,0% CpA. Oitenta amostras de produtos de tomate foram adquiridas no comércio varejista de Campinas , S.P. e analisadas para as quatro toxinas empregando os métodos desenvolvidos. Onze marcas nacionais foram avaliadas e todas comercializadas a nível nacional. As amostras de suco de tomate (onze), extrato de tomate (vinte quatro) e tomates pelados (um) não apresentaram contaminação por nenhuma das quatro micotoxinas. Das 22 amostras de polpa de tomate, seis estavam contaminadas com CpA (64 a 178 ng/g) e sete estavam contaminadas com TeA (45 a 129 ng/g). Nas 22 amostras de purê de tomate a contaminação por TeA (34 a 88 ng/g) e CpA (37 a 117 ng/g) foi detectada em quatro e duas amostras, respectivamente. AME e AOH não foram detectados em nenhuma das amostras. A confirmação da identidade foi obtida pela comparação do espectro dos compostos puros com o espectro dos picos suspeitos na amostra / Abstract: In the present work two methods for the analysis of tomato products for mycotoxins were developed and evaluated. The first one aimed to determine alternariol (AOH) and alternariol monomethyl ether (AME) and the second one cyclopiazonic acid (CpA) and tenuazonic acid (TeA) by liquid chromatography utilizing a diode array detector for quantitation and confirmation of identity of the toxins. In the method for AOH and AME the detection limits were 5.0 and 2.0 ng/g, the average recoveries were 84.1 and 98.7%, respectively. The relative standard deviations (RSDs) of different preparations of the same sample ranged from 0.1 to 14.6% for AOH and from 0.2 to 1,8% for AME. In the method for CpA and TeA the detection limits were 8.0 and 11.0 ng/g, the average recoveries were 75.7 and 83.3%,respectively. RSDs of different preparations of the same ranged from 1.1 to 23.9% for TeA and from 3.9 to 20.0% for CpA. Eighty samples of tomato products were acquired in retail outlets of Campinas, S.P. and analyzed for the four toxins employing the developed methods. Eleven domestic brands were included and all are sold nation wide. No toxin was detected in eleven samples of tomato juice, twenty-four samples of tomato paste and one sample of whole stewed tomatoes . Six out of twenty-two of tomato pulp contained CpA (64 to 178 ng/g) and seven contained TeA (45 to 129 ng/g). TeA (34 to 88ng/g) and CpA (37 to 117 ng/g) were detected in four and two samples of out of twenty-two samples of puree, respectively. No AME or AOH were detected in the samples. Confirmation was obtained by comparing the spectra of pure compounds with spectra of suspected peak in the sample / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos

Orientador: Jose Tadeu Jorge / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-31T15:07:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcos_SissiKawai_D.pdf: 2253460 bytes, checksum: 0fc756db2e6342202027ce601bc5c7bb (MD5) Previous issue date: 2001 / Doutorado

Orientador: Susanne Rath / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-16T00:51:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barros_LeonardoAugustode_M.pdf: 2516979 bytes, checksum: 9e6340ca4d81c25d9929cae4417e6fbf (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Esse trabalho teve como objetivo principal sintetizar um polímero de impressão molecular (MIP) para ser empregado em processo de extração em fase sólida (SPE), visando a determinação de resíduos de fenitrotiona (FNT) em tomates. Os reagentes da síntese foram selecionados a partir de estudos de modelagem molecular, usando para tanto o programa computacional Gaussian 03. As energias eletrônicas de ligação para a interação entre o monômero funcional e a FNT, no vácuo e no solvente, foram calculadas através do método DFT, no nível B3LYP e conjunto de base 6-31G(d). Os reagentes de síntese foram: FNT (molde), ácido metacrílico (monômero funcional), etilenoglicol dimetacrilato (reagente de ligação cruzada), AIBN (iniciador radicalar) e tolueno (solvente porogênico). Também foi sintetizado um polímero não-impresso (NIP). Por meio de estudos de adsorção foi avaliado o meio de melhor reconhecimento molecular. Foram construídas as isotermas de adsorção para cada um dos polímeros impresso e não impresso e foi avaliada a seletividade do MIP frente a análogos da FNT. Os polímeros foram caracterizados por infravermelho com transformada de Fourier, ressonância magnética nuclear de C, microscopia de varredura eletrônica e porosimetria de sorção de nitrogênio (BET). O MIP foi empregado como fase estacionária em SPE. Foi desenvolvido e validado um método para a determinação de FNT em tomates, usando a cromatografia líquida de alta eficiência. A eficiência de extração foi de 96%. A faixa linear foi de 130 a 2000 ng g, com uma linearidade superior a 0,99. A precisão intra-ensaio e inter-ensaio foram inferiores a 7,0% e 8,1%, respectivamente (níveis de fortificação 250, 500 e 1000 ng g). A exatidão foi superior a 89% no nível de fortificação em torno do limite máximo de resíduo de 500 ng g / Abstract: This work aimed the synthesis of a molecularly imprinted polymer (MIP) to be employed in process of solid phase extraction (SPE), for the determination of residues of fenitrothion (FNT) in tomatoes. The synthesis reagents were selected from molecular modeling, using the Gaussian 03 software. The electronic binding energies for the interaction between the functional monomer and the FNT, in vacuum and in solvent, were calculated by the DFT method in B3LYP level and 6-31G(d) basis set. The reagents of the synthesis were: FNT (template), methacrylic acid (functional monomer), ethyleneglycol dimethacrylate (cross-linker), AIBN (initiator) and toluene (porogenic solvent). Also, was synthesized a non-imprinted polymer. Through batch rebinding studies were evaluated the medium of the best molecular recognition. The adsorption isotherms for each imprinted and non-imprinted polymer were constructed and the selectivity of the MIP in relation to FNT analogues evaluated. The polymers were characterized by Fourier transform infrared, C nuclear magnetic resonance, scanning electron microscopy and nitrogen sorption porosimetry (BET). The MIP was employed as stationary phase in SPE. A method for the determination of FNT in tomatoes was developed and validated, using high performance liquid chromatography. The extraction efficiency was 96%. The linear range was 130 to 2000 ng g, with a linearity greater than 0.99. The intra-day and inter-day precision were lower than 7.0% and 8.1%, respectively (fortification levels 250, 500 e 1000 ng g). The accuracy was higher than 89% for a concentration level around the maximum residue limit of 500 ng g / Mestrado / Quimica Analitica / Mestre em Química