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Parâmetros genéticos, índices de seleção e diversidade genética de genótipos de cevada irrigada no Cerrado

Sayd, Ricardo Meneses 13 March 2018 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-08-22T19:33:34Z No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-27T20:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_RicardoMenesesSayd.pdf: 2343312 bytes, checksum: 8f083e0c024f093820a0aa626c23e89d (MD5) Previous issue date: 2018-08-22 / A demanda por cultivares de cevada cervejeira adaptadas ao cultivo irrigado no Cerrado tem crescido de forma constante. Cultivares oriundas da região Sul do país têm sido introduzidas e avaliadas na região a fim de suprir essa demanda instantânea. Com o objetivo de fornecer melhores condições de cultivo ao sistema produtivo do Cerrado, esse trabalho propôs estimar os parâmetros genéticos em diferentes anos e locais a fim de subsidiar uma seleção criteriosa dos genótipos mais aptos a essas condições e analisar a variabilidade genética existente entre eles com base em dados agronômicos e moleculares. Primeiramente foram avaliadas seis características agronômicas (rendimento de grãos, classificação comercial de grãos, peso de mil sementes, altura de plantas, grau de acamamento e ciclo de espigamento) de 113 genótipos de cevada cervejeira em dois ambientes no Cerrado do Distrito Federal com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos (valores de F, herdabilidade em sentido amplo, coeficiente de variação ambiental, genotípico e relativo e as correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais). A partir dos dados desse primeiro trabalho, foram selecionados 69 genótipos utilizando as características avaliadas. Em um segundo momento, foram avaliados os parâmetros genéticos dos 69 genótipos considerando três anos de avaliações utilizando as mesmas características agronômicas com intuito de verificar a influência dos anos agrícolas no comportamento dos genótipos. Baseado nos dados obtidos nos cinco ensaios realizados, os genótipos foram selecionados por um método proposto pelo melhorista (Seleção Combinada) que foi comparado a quatro índices de seleção (índice livre de pesos e parâmetros, índice dos ganhos desejados, soma de ranks e genótipoideótipo). Foram gerados índices de frequência de seleção e os métodos foram comparados em relação ao ganho de seleção em % para cada experimento. Foram selecionados 20 genótipos de alto rendimento agronômico além de quatro genótipos a serem utilizados como genitores em blocos de cruzamentos por apresentarem uma ou duas características importantes para o melhoramento de cevada. Foram realizados estudos de diversidade genética agronômica e molecular dos 24 genótipos selecionados acrescidos de cinco cultivares de cevada recomendadas para o Cerrado. Os dados agronômicos foram obtidos em dois locais do Distrito Federal utilizando a distância de Mahalanobis. Para a análise de diversidade genética molecular os dados foram obtidos utilizando marcadores moleculares RAPD, SSR e ISSR. A partir dos dados obtidos foram gerados dendrogramas e gráficos de dispersão tanto para a diversidade agronômica como para os dados moleculares, possibilitando através das análises indicar os cruzamentos que possam ter maior efeito heterótico. Os resultados indicaram a existência de variabilidade entre os acessos avaliados, assim como efeito da interação G x A tanto na comparação de locais como em anos. Os genótipos de origem colombiana mostraram-se mais aptos em relação aos demais. Verificou-se que é possível a seleção de acessos de cevada com alto rendimento e ciclo de espigamento precoce simultaneamente, fator decisivo no processo de escolha de genótipos a seguirem em futuros experimentos. No estudo de diversidade observouse a baixa correlação entre as distâncias genéticas, e que os marcadores ISSR correlacionouse positivamente com as distâncias agronômicas. É necessário a realização de estudo de diversidade complementar entre características agronômicas e marcadores moleculares para indicação dos melhores cruzamentos através de genótipos com a maior variabilidade possível. / A demand for breeding barley cultivars adapted as irrigated Cerrado conditions is constant. Cultivars from the southern area of the country have been tested in the Cerrado region aiming to supply this immediate demand. With the purpose of providing better conditions for this production system, this work proposes to estimate genetic parameters in different years and environments in order to promote a careful selection of more suitable genotypes to these conditions and to analyze the existing genetic variability among them based on agronomic and molecular data. First, six agronomic characteristics (grain yield, plumpness kernel, thousand seed weight, plant height, lodging degree and days to heading) of 113 brewery barley genotypes were evaluated in two environments in the Cerrado of the Distrito Federal, focusing on estimating the genetic parameters (F values, heritability in broad sense, environmental, genotypic and relative variation coefficients). Based on the data from the first trial, 69 genotypes were selected based on the evaluated characteristics. In a second experiment, the genetic parameters of the 69 genotypes were evaluated considering three years of evaluations using the same agronomic characteristics. Based on the data obtained in the five experiments, the genotypes were selected by a method proposed by the breeder and compared to four selection indices (free index of weights and parameters, desired earnings index, rankings sum and genotype-ideotype) that served as basis for the accomplished selection. Frequency indices of selection were generated, and methods were compared to the selection gain for each experiment. Twenty genotypes of high agronomic yield were selected, as well as four genotypes to be used as parents in crossbred blocks since they presented one or two important traits for barley breeding. Genetic diversity studies were carried out for the 24 selected genotypes plus five barley cultivars recommended for the Cerrado, based on agronomic data from two locations in the Federal District, using Mahalanobis distance. For the analysis of molecular genetic diversity, the data was obtained using molecular markers RAPD, ISSR and SSR. From the obtained data were generated dendrograms and dispersion graphs for both agronomic diversity and for the molecular data, allowing, through the analysis, to indicate the crosses that could have greater heterotic effect. The results indicated the existence of variability among the accessions, as well as the interaction effect G x E in both location and year comparisons. The genotypes of Colombian origins were more apt in relation to the others. It was verified that the selection of accessions of barley with high yield and early breeding cycle simultaneously is possible, which is a decisive factor in the process of choosing genotypes to survey in future experiments. The diversity study detected a low correlation between genetic distances, and that ISSR markers correlated positively with the agronomic distances. It is necessary to carry out a study of complementary diversity between agronomic traits and molecular markers to indicate the best crosses through genotypes with the greater variability.
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Estimativa de variabilidade genética em acessos crioulos e cultivares comerciais de tomates (Lycopersicon esculentum Mill.) do sul do Brasil e avaliação da presença do Gene Mi.

Carelli, Bernardete Primieri 18 December 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseBPC.pdf: 597791 bytes, checksum: cb6991d45b1e69e3a67491404df82f2a (MD5) Previous issue date: 2003-12-18 / Universidade Federal de Minas Gerais / Cultivated tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) is one of the most important horticultural crops. Although original from the Andes region, this crop was officially introduced in Brazil by the European immigrants during the last half of the XIX century. Today, old varieties and new improved cultivars are planted in the different Brazilian regions. In the last 20 years the Ecological Center of Ipê proceeded a rescue of old tomato varieties maintained by small agriculturists in the Northeast region of Rio Grande do Sul State. The present work had the objective to estimate the variability among 35 tomato accessions, 12 commercial cultivars and 23 Brazilian landraces using morphological descriptors and molecular traits (proteins and DNA), and to verify the Meloidogyne resistance/susceptibility status of these genotypes, as well as the presence of the Mi genes. The landraces were separate in five groups by their fruit characteristics: large oblate, cherry, heart-shape, large cylindrical, and rounded, whereas the commercial cultivars were restricted to the most common groups in the market. Both the quantitative evaluation of seed protein electrophoretic profiles, and RAPD markers allowed identifying all the accessions. The cluster analysis of RAPD data allowed to separate the genotypes in seven similarity groups that were not related with those formed by the protein analysis. Conversely, a discriminant analysis showed a relation between RAPD markers and fruit morphology. Landraces exhibited higher levels of protein and genetic (RAPD) variations compared with the commercial cultivars confirming the genetic variability reduction caused by the limited number of genotypes used in breeding programs. Experimental results showed that all the landraces and commercial cultivars, with the exception of the cultivars Polka Baixo and Gaucho (Feltrin) were susceptible to M. javanica, M. incognita, and M. arenaria. PCR data showed that the Mi1.2 gene was present only in the Polka Baixo cultivar, whereas the Mi1.1 was found in 26 accessions, most of which susceptible to root-knot nematodes, confirming the gene Mi1.2 as the nematode resistant determinant, and the inefficiency of the Mi1.1. Considering the high incidence of Meloidogyne in South Brazil, the low frequency of resistant accessions point-out the necessity of a special effort of breeding programs on the transfer of root-knot nematode resistance genes to Brazilian tomato varieties and cultivars. / O tomate (Lycopersicon esculentum) é uma das mais importantes hortaliças. Apesar, de ser nativo da região dos Andes, esta hortaliça foi oficialmente introduzida no Brasil pelos imigrantes europeus durante a última metade do século XIX. Hoje, variedades antigas e cultivares melhorados, são cultivados em diferentes regiões brasileiras. Nos últimos 20 anos, o Centro Ecológico de Ipê realizou um resgate das antigas variedades de tomate mantidas por pequenos agricultores da região Nordeste do Rio Grande do Sul. O presente trabalho teve como objetivo estimar o grau de variabilidade entre 35 acessos de tomate, 12 comerciais e 23 acessos crioulos, utilizando marcadores morfológicos e moleculares (protéicos e DNA), além de verificar a resistência e/ou susceptibilidade a Meloidogynes destes genótipos, bem como a presença do gene de resistência Mi através de PCR. A variabilidade morfológica dos frutos apresentada pelos acessos crioulos formou cinco grupos: os tipo Cereja, Pimentão, Coração de Boi, Gaúcho e Paulista, enquanto que os materiais comerciais restringiram-se aos grupos mais comuns no mercado, Gaúcho e Paulista. Os perfis eletroforéticos de proteínas totais solúveis de sementes mostraram a ocorrência de baixa variabilidade qualitativa, mas variações quantitativas permitiram a identificação de todos os materiais avaliados. A análise da variabilidade através de marcadores de RAPD permitiu a identificação de todos os genótipos avaliados, confirmando a eficiência deste tipo de marcadores na caracterização de materiais. A análise de agrupamentos permitiu a separação em sete grupos, os quais não apresentaram relação com aqueles formados com base nos perfis protéicos. Por outro lado, análise discriminante mostrou a existência de relação entre os marcadores de RAPD e os grupos de morfologia de fruto. De um modo geral, os materiais crioulos apresentaram maior variação nas proteínas de sementes e marcadores de RAPD o que pode ser tomado como indicativo de estreitamento da base genética nos materiais comerciais. Os resultados obtidos no teste de resistência mostraram que todos os materiais crioulos e comerciais, com exceção dos cultivares Polka Baixo e Gaúcho (Feltrin) são suscetíveis a Meloidogyne javanica, M. incognita e M. arenaria. Considerando a alta incidência de Meloidogyne no Sul do Brasil, a baixa freqüência de acessos resistentes, apontam a necessidade de um esforço especial na transferência dos genes de resistência aos nematóides das galhas da raiz para os acessos crioulos e cultivares do tomate comerciais do Brasil.
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Desenvolvimento de cinco linhagens de Agaricus Bisporus Lange (Imbach) (“champignon de Paris”) em diferentes formulações de composto e meios de cultura

Jesus, João Paulo Furlan de [UNESP] 04 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-04Bitstream added on 2014-06-13T19:31:25Z : No. of bitstreams: 1 jesus_jpf_me_botfca.pdf: 3440463 bytes, checksum: 00f6075a78b0f618ecce7156da2019da (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A produção de composto de qualidade para Agaricus bisporus e a pesquisa por linhagens produtivas são alguns dos principais fatores relacionados à produtividades elevadas. Desta forma, foram realizados dois experimentos: 1. a campo, avaliou-se o efeito da suplementação nitrogenada na formulação de dois tipos de compostos, clássico e sintético, para o cultivo de cinco linhagens de A. bisporus: ABI-05/03, ABI-04/02, ABI-06/05, ABI-09/10 e ABI-09/11; 2. avaliou-se a influência de cinco linhagens de A. bisporus no desenvolvimento micelial em dois meios de cultura sólidos (CA, composto ágar; e BDA, batata dextrose ágar). No experimento 1, constatou-se durante o processo de compostagem, pasteurização e condicionamento o composto clássico obteve temperatura média e perda de massa 10,56 e 13,29% superiores ao composto sintético, respectivamente. O composto clássico obteve as maiores eficiências biológicas ao final de 25 dias de produção, pelas linhagens ABI-05/03, ABI-06/05 e ABI-04/02 com valores de 83,95, 79,45 e 77,49%, respectivamente. Além da eficiência biológica, houve uma tendencia de maior produtividade, número e massa de fresca de basidiomas quando as linhagens foram cultivadas em composto clássico. No experimento II as maiores velocidades de desenvolvimento micelial das linhagens de A. bisporus foram observadas nos meios de cultura CA. Concluiu-se que não houve ligação entre os resultados observados nos experimentos I e II em relação ao potencial genético das... / The production of quality compost for Agaricus bisporus and the research for high productivity strains are some important factors involving high yields. Were carried out two expiriments: 1. at field, the effect of the type of nitrogen supplementation was evaluated, elaborating two types of compost, classic and synthetic, cultivating five strains of A. bisporus ABI-05/03, ABI-04/02, ABI-06/05, ABI-09/10 e ABI-09/11; 2. was evaluated the influence of five A. bisporus strains on the rate of micelial growth in different type of culture media (MC, compost media; BDA, potato-dextrose-agar). In the first experiment, the data showed that during the composting process, pasteurization and conditioning, the averages temperatures and weight loss 10,56 and 13,29% higher in the classic compost than the synthetic compost . The classic compost had the higher biological efficiency in the end of the crop (25 days), for the strains ABI-05/03, ABI-06/05 e ABI-04/02 with values of 83,95, 79,45 e 77,49, respectively. Moreover, there was a tendency for higher yields, number and fresh weight of mushrooms when the strains were cultivated in the classic compost. In the second experiment the highest micelial growth rate by the A. bisporus strains were observed in the compost agar media. It was observed that were no relation between the data in experiments I and II, by the genetic potential of the strains
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Análises genéticas de carcaças de atobá marrom, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), da região centro-norte do Estado do Rio de Janeiro / Genetic analysis of carcasses of brown booby, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), from the North-Central region of Rio de Janeiro State

Rafaela Magalhães Aires 28 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A região da Bacia de Campos está exposta a diversas atividades antrópicas, que interferem diretamente no funcionamento do ecossistêmico marinho. O estudo da fauna marinha na costa centro-norte fluminense mostra grande relevância, diversas aves marinhas residem ou passam grande parte de seu período migratório ao longo da Bacia de Campos, entre elas está Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Embora essas aves sejam altamente móveis, suas populações apresentam uma estrutura populacional genética robusta. Com o intuito de verificar a estruturação e as relações evolutivas da população de Sula leucogaster na Bacia de Campos foram recolhidas 91 amostras de encalhe e os dados gerados para esta região foram comparados com dados já publicados de outras bacias oceânicas. A partir da região controle do DNA mitocondrial foram gerados 26 haplótipos, todos exclusivos da Bacia de Campos, muitos raros e apenas oito possuíram frequência comum. As análises mostraram que a população da Bacia de Campos é um estoque genético de Sula leucogaster. Tal fato pode ser atribuído ao comportamento filopátrico e ao hábito costeiro dessa espécie que impede o fluxo gênico entre populações. Além disso, a população da Bacia de Campos detém baixa variabilidade genética e possivelmente está sofrendo efeito gargalo ou seleção purificadora, corroborados por valores do teste Fu, o que é comum para espécies que se dividem em subpopulações. Os dados filogenéticos demonstram um contato recente entre as populações da Bacia de Campos e da ilha de Ascensão. As condições oceanográficas também têm influência na estruturação de populações de Sula leucogaster, visto que a ausência de barreiras e a proximidade geográfica poderiam favorecer contato secundário com o Mar do Caribe, fato não evidenciado nas análises. Sendo assim, a divergência de populações nessa espécie e a baixa variabilidade genética são fatores preocupantes para a manutenção da população de atobás marrons em uma área de grande impacto ambiental / The region of Campos Basin is exposed to various anthropogenic activities that affect directly the behavior of marine ecosystem. The study of marine fauna in North-Central coast of Rio de Janeiro is of great importance, several marine and coastal birds live or spend most of their migratory period along the Campos Basin, between them is Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Although these birds are highly mobile, their populations have a robust genetic population structure. In order to check the structure and evolutionary relationships of the population of Sula leucogaster in the Campos Basin, 91 stranding samples were collected, and the data of this region were compared with the published data. From the control region of mitochondrial DNA, 26 haplotypes were identified, all of them being unique to the Campos Basin. Most of these haplotypes were rare, only eight have common frequencies. The analyses show that the population of the Campos Basin is a genetic stock of Sula leucogaster. This fact can be attributed to the filopatric behavior and coastal habit of this species that prevents the gene flow between populations. Moreover, the population of the Campos Basin has low genetic variability and is possibly suffering a bottleneck effect or purifying selection, supported by Fu test values, which is common for species divided into subpopulations. The phylogenetic data demonstrates a recent contact between the populations of the Campos Basin and Ascensão island. The oceanographic conditions also influence the structuring of populations of Sula leucogaster populations, as the absence of barriers and geographical proximity could favor secondary contact with the Caribbean Sea, which was not evident in the analyzes. Thus, the low amount of gene flow and the low genetic variability are worrying factors for the maintenance of the population of brown boobies in this area of high environmental impact
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Variabilidade genética de progênies de polinização aberta de Eucalyptus Grandis Hill ex Maiden e correlações entre caracteres juvenil-adulto

Brizolla, Thiago Fernandes [UNESP] 04 September 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-04Bitstream added on 2014-06-13T19:18:58Z : No. of bitstreams: 1 brizolla_tf_me_botfca.pdf: 254524 bytes, checksum: 7729f6929f3138aa2ec6cbf4147cd6b8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie Eucalyptus grandis Hill ex Maiden é a mais cultivada em estandes comerciais no Brasil e no mundo. A espécie é plantada como cultivar e também na forma de plantios clonais de seus híbridos interespecíficos. O trabalho é um estudo da variabilidade genética em progênies de polinização livre de Eucalyptus grandis de árvores selecionadas fenotipicamente em pomar de sementes por muda, cuja procedência é originária de Coff’s Harbour – Austrália. Este pomar, de propriedade da empresa Duratex S.A. encontra-se na Fazenda Morro D’Ouro, no Município de Botucatu. Tem também como objetivo analisar as correlações entre os diferentes caracteres nas diferentes idades e estudar as correlações entre as idades juvenis e de final de rotação da cultura, visando subsidiar a seleção precoce em programas de melhoramento com espécie. Os ensaios foram instalados em três experimentos em cada um dos dois locais, Angatuba-SP e Lençóis Paulista-SP, em fevereiro de 1988. O delineamento experimental utilizado foi o blocos casualizados, com 10 repetições, 6 plantas por parcela, ao espaçamento de 3 x 2 metros e totalizando 75 progênies. Os caracteres avaliados foram o diâmetro a altura do peito (DAP); altura de planta e volume de madeira. As avaliações foram feitas em quatro anos consecutivos (02, 03, 04 e 05 anos) em Lençóis Paulista (local 2), sendo que em Angatuba (local 1) foram realizadas avaliações anuais do segundo ao sexto ano. Os resultados mostraram haver variabilidade genética suficiente para avançar as gerações de melhoramento com a espécie... / The species Eucalyptus grandis Hill ex Maiden is the most commonly cultivated in commercial stands in Brazil and throughout the world. The species is planted as a cultivar, by seed, e also by clonal plantings of its interspecific hybrids. The research is a study of genetic variability in open pollinated progenies of Eucalyptus grandis of phenotipically selected trees in Seedling Seed Orchard of Coff’s Harbour – Australia provenance. The orchard is of Duratex S.A. company located in Morro D’Ouro Experimental Station, in Botucatu city, S.P., Brazil. The study also have as objective to analyze the correlations between different traits in different ages and to study the correlations between juvenile and final of culture rotation, aiming to get support for procedures of early selection in forest tree breeding programs of Eucalyptus grandis. The experiments were set up by three trails in each one of two localities, Angatuba and Lençois Paulista, both in São Paulo State, Brazil, in February of 1988. The experimental design was the randomized blocks, with 10 replications, 06 plants per plot, 3 x 2 spacing, and totalizing 75 progenies. The diameter of breast height (dbh), plant height, and wood volume were the studied traits. The evaluations were made through the consecutive years (02, 03, 04, and 05 years old) in Lençois Paulista (Locality 2), and in Angatuba (Locality 1) were made annual evaluations from de second to the sixth years old. The results have shown sufficient genetic variability to advance breeding generations of species... (Complete abstract click electronic access below)
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Variabilidade genética, estrutura populacional e relações evolutivas de cabras crespas com base em marcadores moleculares microssatélites e DNA mitocondrial

Lopes, Darlise Dias January 2012 (has links)
As cabras Crespas constituem-se em um ecótipo caprino encontrado no extremo Sul do Brasil, fenotipicamente similar à raça Angorá. Cruzamentos com outras raças, pressões seletivas de manejo e do ambiente, conferem a estes indivíduos características fenotípicas diferenciadas. O principal objetivo deste trabalho foi estimar a variabilidade genética nas populações de cabras Crespas do Rio Grande do Sul, e a relação destas com outras raças caprinas criadas na região e com a raça Angorá (proveniente da Argentina), através de marcadores moleculares de DNA nuclear e mitocondrial. A amostra (n=162) foi composta por indivíduos provenientes das raças Alpina (n=10), Anglo Nubiana (n=21), Boer (n=19), Saanen (n=20), e Angorá (n=28), além de 64 indivíduos de Crespas (cinco rebanhos). Foram analisados fragmentos de 696 pb da região controladora de mtDNA, além de 11 loci de microssatélites. Para o locus mitocondrial, as análises indicaram a existência de 61 sítios variáveis, a partir dos quais foram definidos 37 haplótipos (Hd=0,930 e Pi=0,0124). Com relação aos loci de microssatélites, encontrou-se um número médio de alelos de 9,6 e heterozigosidade média observada de 0,52. Ao que se refere a fluxo gênico entre as raças, o menor valor de RST foi verificado entre a raça Crespa e a Saanen (0,13) enquanto que o maior valor de FST (0,42) foi verificado entre Crespa e Angorá. Uma AMOVA foi realizada nas populações do ecótipo Crespa onde a maior parte da variação total corresponde a diferenças entre indivíduos (89,04%) e somente 10,96% é resultante de diferenças entre as populações. Análises de estrutura populacional (STRUCTURE) mostraram uma diferenciação genética significativa entre as raças, bem como em relação ao ecótipo Crespa. O padrão de diferenciação genética foi representado por uma análise de componentes principais (PCA) baseada na frequência dos alelos das seis raças caprinas, o PC1 resultou em 29,47% da diversidade genética total e o PC2 em 23,94% (p>0,05). O eixo PC1 demonstrou a grande proximidade entre as raças Angorá e Boer e a maior distância destas com relação à Crespa. Assim, os resultados sugerem que além de características morfológicas (fenotípicas) diferenciadas, a cabra Crespa apresenta também diferenciação genética das outras raças criadas hoje no Sul do Brasil, não tendo sua origem confirmada na raça Angorá. Essas informações, aliadas a continuidade deste estudo, serão de grande importância na tomada de decisão quanto à conservação deste ecótipo em isolamento reprodutivo, assim como na determinação de sua posição filogenética dentre os caprinos, com vistas à proposição de uma nova raça nativa para o sul do Brasil. / Crespas goats are an ecotype found in Southern Brazil, phenotypically similar to the Angora breed. Crosses with other breeds, selective pressures and environmental management, make these individuals phenotypically differentiated. The main objectives of this research were to estimate the genetic variability in populations of Crespas goats, and their relationship to other goat breeds created in this region, even as the Angora (from Argentina), using molecular markers of nuclear and mitochondrial DNA. The total sample (n = 162) comprised individuals from the Alpine race (n = 10), Anglo-Nubian (n = 21), Boer (n = 19), Saanen (n = 20) and Angora (n = 28), and 64 individuals of Crespas goats (five livestock). We analyzed 696 bp fragments of control region mtDNA, as well as 11 microsatellite loci. Analyses showed the existence of the 61 variable site, from which were defined 37 haplotypes (Hd = 0.930 and π= 0.0124). Concernig to microsatellite loci, we found a mean number of alleles of 9.6 and average observed heterozygosity of 0.52. For the gene flow estimates between races, the lowest value of RST was found between Crespa and Saanen (0.133) while the highest value of FST (0.422) was found between Crespa and Angora. An AMOVA was performed on populations of the ecotype Crespa where most of the total variation corresponds to differences between individuals (89.04%) and only 10.96% from differences between populations. Analysis of population structure (STRUCTURE) showed a significant genetic divergence between races, as well as in relation to the ecotype Crespa. The pattern of genetic differentiation was represented by a principal component analysis (PCA) based on the frequency of alleles of six goat breeds. The PC1 resulted in 29.47% of the total genetic diversity in 23.94% and PC2 (p>0.05). The PC1 axis showed a great similarity between the Angora and Boer breeds and greater distance from the Crespa. Thus, the complete results suggest that, in addition the morphological (phenotypic) differentiation, the goat Crespa also presents genetic differentiation from other races raised today in southern Brazil, and has not confirmed its origin from the Angora breed. This information, combined with the continuity of this study will be of great importance in decision making regarding the conservation of this ecotype in reproductive isolation, as well as in determining its phylogenetic position among the goats, with a view to the proposition of a new breed native to southern Brazil.
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Genética de caracteres agronômicos e de qualidade em milho doce / Genetic of agronomic and quality traits in sweet corn

Cardoso, Elbio Treicha January 2001 (has links)
A cultura do milho doce poderá ser uma excelente opção para os agricultores, especialmente nas pequenas propriedades, devido o seu manejo não ser distinto da cultura do milho comum e pelo maior valor do produto. No entanto, as variedades disponíveis atualmente apresentam inúmeros problemas, tanto em caracteres agronômicos, como de qualidade de grão, o que dificulta a viabilização desta cultura. Deste modo, as populações BR 400, BR 401 e BR 402 foram avaliadas para estimar a capacidade combinatória, bem como os efeitos diretos e indiretos da seleção recorrente sobre caracteres adaptativos. Também foram estimados parâmetros genéticos importantes para realização eficiente da seleção em caracteres relacionados à qualidade de grão e espiga. Os experimentos foram conduzidos durante três anos agrícolas (1998/1999 a 2000/2001) na Estação Experimental Agronômica da UFRGS (Eldorado do Sul). Os resultados obtidos indicaram a existência de variabilidade genética para os caracteres avaliados, com predominância de efeitos gênicos aditivos sobre os não aditivos. A seleção para estatura, altura de inserção de espiga, florescimento masculino e feminino foi eficiente e não provocou alteração expressiva nos caracteres de qualidade de grão e espiga. As estimativas de variância aditiva e herdabilidade para os caracteres espessura de pericarpo, teor de sólidos solúveis e percentagem de espigas descobertas indicaram que a possibilidade da obtenção de ganhos genéticos através de seleção para estes caracteres. Por outro lado, as correlações genotípicas observadas entre caracteres importantes da cultura foram baixas, requerendo a seleção simultânea para estes caracteres; sendo que para este fim o emprego do índice de seleção de Williams apresentou resultados superiores às demais metodologias avaliadas. / Sweet corn can be an excellent option, particularly for small farmers. Its product is valuable on the international market and its cultural practices are similar to those used in field corn. However, available varieties in southern Brazil present problems, especially in agronomic and quality traits. This way, the populations BR 400, BR 401, and BR 402 were tested for combining ability and selected for adaptative traits, using direct and selection indexes approaches. Genetic parameters were also estimated for grain and ear quality. The experiments were conducted in three seasons (1998/1999 to 2000/2001) in Estação Experimental AgronômicalUFRGS (Eldorado do Sul, RS). The obtained results indicated the existence of genetic variability for all the evaluated traits, with predominance of additive effects. The selection for plant height, ear height, pollen shedding and silking was efficient and it did not provoke significant alteration in quality traits. The estimates of additive variance and heritability for pericarp thickness, total soluble solids, and ear tip indicated the possibility to obtain significant genetic gains through selection. On the other hand, genotypic correlations among traits were low, requiring simultaneous selection. As a result, Williams selection index was suggested as a superior alternative for sweet corn breeding in southern Brazil.
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Caracterização genética e química e atividade biológica do óleo essencial de populações naturais de Elionurus muticus Humb. & Bompl Ex Willd / Genetic and chemical characterization and biological Activity of essential oil of natural populations of Elionurus Muticus Humb. & Bompl Ex Willd

Füller, Thanise Nogueira January 2013 (has links)
O mercado mundial de óleos essenciais vem apresentando um crescimento aproximado de 11% ao ano, sendo que o Brasil está entre os 15 maiores exportadores, correspondendo a 1% das exportações mundiais. Um dos compostos de óleos essenciais mais comercializados é o citral, que apresenta um forte odor cítrico e é empregado nas indústrias de perfumarias, alimentos e cosméticos. Elionurus muticus é uma gramínea nativa do bioma Pampa e tem se destacado pela produção de um óleo essencial rico em citral; entretanto, poucos trabalhos têm sido realizados com esta espécie. Os objetivos desse trabalho foram caracterizar morfologica, química e geneticamente populações naturais de E. muticus coletadas no RS, bem como avaliar a atividade biológica do óleo essencial e do extrato etanólico destas populações. As populações coletadas foram cultivadas em vasos e mantidas ao ar livre. As amostras de folhas, colmos e inflorescências para todas as análises foram obtidas destas plantas. A caracterização genética usou marcadores do tipo AFLP e a citogenética avaliou mitose, meiose e grãos de pólen. As análises químicas foram realizadas com as técnicas de cromatografia gasosa e espectrometria de massas. A atividade biológica foi avaliada com os fungos Botrytis cinerea, B. allii e Penicillium expansum; com o microcrustáceo Artemia salina e com diásporos de cebola e alface. A atividade de captura de radicais livre foi baseada no método DPPH. Os resultados demonstraram que as populações estudadas têm variabilidade genética para diferentes caracteres, apontando para a possibilidade de seleção de plantas com caracteres relevantes, como alto rendimento de óleo essencial e de citral. A alta variabilidade também sugere a ocorrência preferencial de alogamia nas populações naturais. Através de análises citogenéticas foi possível concluir que a meiose na espécie é regular e que o número cromossômico é de 2n=20. O óleo essencial de E. muticus pode ser utilizado no controle de fungos fitopatogênicos e no controle da germinação e desenvolvimento de outras plantas. Testes preliminares sugerem uma possível atividade citotóxica. Além disso, o extrato metanólico de E. muticus apresenta grande potencial como antioxidante. / The world market for essential oil is increasing about 11% per year, where Brazil is among the 15 largest exporters, accounting for 1% of world exports. One of the essential oil compounds most commercialized is the citral, which has a strong citrus odor and is used in perfumery, food and cosmetics industries. Elionurus muticus is a native grass of the Pampa biome and has been highlighted by the production of an essential oil rich in citral. However, few studies have been done on this species. The aims of this study were to characterize morphologically, chemically, and genetically natural populations of E. muticus collected in RS, as well as to evaluate the biological activity of the essential oil and the ethanol extract of these populations. Collected populations were cultivated in pots and maintained outdoors. Leaf, stem, and flower samples for all analyzes were obtained from these plants. Genetic characterization used AFLP markers and cytogenetics assessed mitosis, meiosis and pollen. Chemical analyzes were performed using the techniques of gas chromatography and mass spectrometry. The biological activity was evaluated with the phytopathogenic fungus Botrytis cinerea, B. allii, and Penicillium expansum, with the shrimp Artemia salina, and with onion and lettuce seeds. The scavenging of free radicals was based on DPPH. The results showed that the studied populations have genetic variability for several traits, indicating the possibility of plant selection for high essential oil’s yield and citral content. The high varibility also suggests the occurrence of allogamy in natural populations. Through cytogenetic analysis it was concluded that the species meiosis is regular and that the chromosome number is 2n = 20. The essential oil of E. muticus can be used for controlling pathogenic fungi and to supress germination and growth of other plants. Preliminary tests suggest a possible cytotoxic activity. Moreover, the methanol extract of E. muticus can be used to scavenge free radicals.
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Caracterização do progresso da doença e herança da resistência à mancha negra (Pyrenophora chaetomioides Speg.) em aveia branca (Avena sativa L.) / Characterization of disease progress and inheritance of the resistance to black spot (Pyrenophora chaetomioides Speg.) on oats (Avena sativa L.)

Nunes, Sibila Trojahn January 2014 (has links)
A mancha negra das folhas, causada pelo fungo Pyrenophora chaetomioides, é uma das principais doenças da cultura da aveia branca. Os sintomas da mancha negra das folhas caracterizam-se por lesões escuras que se expandem com o decorrer do tempo. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar o progresso da doença, estimar a herança da resistência à mancha negra e analisar três metodologias de avaliação da resistência à esta doença. Os experimentos foram realizados durante os anos de 2012 e 2013, na Estação Experimental Agronômica da UFRGS. Em 2012, o progresso da doença foi avaliado em duas populações segregantes F2, através da análise de imagens digitais de um segmento de seis cm de comprimento da região central da lâmina da folha bandeira-1. A severidade de mancha negra foi estimada através do software ASSESS. No ano de 2013, o progresso da doença foi estimado em 34 genótipos de aveia, utilizando-se três metodologias de avaliação: análise visual da severidade de toda a folha bandeira-1, análise visual de um segmento central da lâmina da folha bandeira-1 e análise de imagens digitais do mesmo segmento central. Nos dois anos foram realizadas avaliações semanais da severidade da mancha negra e, a partir destes dados, a área sob a curva de progresso da doença (ASCPD) foi estimada. Em 2012, para as populações segregantes F2 e genitores, também foi estimada a curva de progresso da severidade e a taxa de infecção. Nas duas populações segregantes, foi verificada a presença de variabilidade genética para os caracteres ASCPD e taxa de infecção. O controle genético do caráter ASCPD foi estimado como devido a dois locos dominantes epistáticos, na população 1, enquanto que, na população 2, o controle do caráter taxa de infecção foi estimado em um loco dominante. As estimativas da herdabilidade no sentido amplo foram de 0,40 para o caráter ASPCD, na população 1, e de 0,76 para o caráter taxa de infecção, na população 2. Com base nos resultados do experimento realizado em 2013, foi verificada elevada associação entre os valores de ASCPD obtidos pelas duas metodologias que analisaram o segmento central da lâmina foliar. Desta forma, a avaliação visual da severidade é uma metodologia adequada, além de rápida e de fácil execução. Também verificou-se que a análise de somente um segmento central tende a subestimar a severidade que ocorreu sobre toda a lâmina foliar. Além disso, a diferença na classificação dos genótipos quanto à resistência, sugere que a severidade deve ser estimada para toda a lâmina da folha e não apenas para um segmento central. / Black leaf spot, caused by the fungus Pyrenophora chaetomioides, is one of the major diseases on oats. Black leaf spots symptoms are characterized by dark lesions which expand over time. This study aimed to characterize the disease progress, to estimate the inheritance of the resistance to black leaf spot and analyze three methodologies for assessing resistance to this disease. The experiments were conducted in 2012 and 2013, at the Agronomic Experiment Station of UFRGS. In 2012, the progress of the disease was evaluated in two F2 segregating populations, through the analysis of digital images of a six cm long segment at the central area of the of flag leaf-1 laminae. The severity of black spots was estimated through the software ASSESS. In 2013, the disease progress was estimated on 34 oat genotypes, using three evaluation methodologies: by visual estimation of the disease severity on all flag leaf-1 laminae, visual evaluation of a central segment of the flag leaf-1 laminae and by the analysis of digital images of the same central segment. In the two years, black leaf spot severity was assessed weekly and, from these data, the area under the disease progress curve (AUDPC) was estimated. In 2012, for the parental genotypes and F2 populations the severity progress curve and infection rate were also estimated. In the two segregating populations, genetic variability for the characters AUDPC and rate of infection was shown. The genetic control of the trait AUDPC was estimated as due to two dominant epistatic loci in the population 1. Whereas, in population 2, the control of the trait infection rate was estimated as due to a dominant locus. Broad sense heritabilities were estimated as 0.40 for the ASPCD trait, in population 1, and as 0.76 for the infection rate trait, in population 2. Based on the results from the experiment conducted in 2013, it was verified a strong association between AUDPC values obtained from the two methodologies of evaluation of the central segment of the leaf laminae. Therefore, visual evaluation of severity is an adequate methodology, besides of being a quick and easy one to carry out. It was also verified that the analysis of only a central segment tends to underestimate the severity that occurred on the whole leaf laminae. In addition, the difference in the classification of genotypes for the resistance suggests that severity must be estimated for the whole leaf laminae and not just for a central segment.
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Variabilidade genética em populações naturais de Petunia exserta Stehmann (Solanaceae)

Segatto, Ana Lúcia Anversa January 2010 (has links)
O gênero Petunia Juss. é caracterizado pela distribuição exclusivamente sulamericana e diversificação recente. Petunia exserta Stehmann é uma espécie endêmica da região fisiográfica da Serra do Sudeste (RS). Essa região faz parte do Bioma Pampa e apresenta um relevo muito característico com a presença de grandes torres de pedra. As plantas de Petunia exserta são encontradas nessas torres, em reentrâncias semelhantes a pequenas cavernas, um habitat muito restrito e inóspito para as outras espécies do gênero. Além de P. exserta, são descritas cerca de 30 espécies de plantas endêmicas dessa região, o que faz da Serra do Sudeste um local muito importante para a preservação da biodiversidade do Bioma Pampa. Este trabalho teve como objetivo principal caracterizar a estrutura populacional da espécie P. exserta através de marcadores moleculares plastidiais e nucleares. Dentro desse objetivo maior, também são objetivos desse trabalho: caracterizar as novas populações encontradas quanto ao modo de vida e variabilidade fenotípica; avaliar a presença de introgressão gênica a partir de P. axillaris; e fornecer subsídios que reforcem a necessidade da criação de uma unidade de conservação na Serra do Sudeste. Foram analisados 655 indivíduos para as sequências concatenadas dos espaçadores intergênicos plastidiais trnH/psbA e trnG/trnS e 487 indivíduos foram genotipados para cinco marcadores nucleares do tipo CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences). As populações de P. exserta estudadas se caracterizam por uma ampla variabilidade fenotípica na coloração das flores e posição do aparelho reprodutivo. A análise dos dados demonstrou que a introgressão entre P. exserta e P. axillaris é restrita, possivelmente devido à seleção adaptativa, o que sugere que o habitat diferenciado pode desempenhar um papel importante nesse aspecto. A Análise de Variância Molecular (AMOVA) demonstrou grande estruturação genética, indicando o endocruzamento como uma característica da espécie. O compartilhamento de haplótipos plastidiais e alelos nucleares juntamente com a distribuição geográfica simpátrica, a ocorrência de eventos de hibridação e a pouca variabilidade genética permitem sugerir que P. exserta é uma espécie derivada de P. axillaris. Assim, a manutenção dessa espécie é dependente da manutenção do seu habitat que é limitado aos pequenos abrigos das torres da Serra do Sudeste. / Petunia Juss. is a genus characterized by an exclusive South American distribution and by its recent diversification. Petunia exserta Stehmann is an endemic species from Serra do Sudeste (RS) phisiographic region, which is parte of the Pampa biome and has a characteristic landscape with the presence of stone towers. P. exserta plants grow in these towers, in shady cracks resembling small caves. Its habitat is very restrict and inhospitable for the other species of the genus. In addition to P. exserta, more than 30 endemic plant species are described for this region, making of the Serra do Sudeste a very important region for maintaining the biodiversity of the Pampa biome. The main goal of this study was characterizing P. exserta population structure using chloroplast and nuclear markers. Within this framework, other goals of this study are: characterizing the newly discovered populations regarding its habit and phenotypic variation; evaluating the occurrence of introgression from P. axillaris; and presenting evidences that reinforce the need of a conservation unit in the Serra do Sudeste region. Overall, 655 plants were analyzed for the plastidial intergenic spacers trnH/psbA and trnG/trnS, and five CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences) nuclear markers were used to genotype 487 individuals. The populations of P. exserta found were characterized by a wide phenotypic variation regarding flower color and position of the reproductive organs. Data analyses indicated low levels of introgression between P. exserta and P. axillaris, possibly due to natural selection, suggesting that the different habitat for these two species may influence this point. As shown by the Molecular Variance Analyze (AMOVA) the species presents strong genetic structure, indicating that inbreeding seems to be a characteristic of this species. The sharing of both cpDNA haplotypes and nuclear alleles, together with the sympatric geographical distribution, hybridization, and low genetic variability in P. exserta allow the suggestion that P. exserta is derived from P. axillaris. Thus, the maintenance of this species depends on the maintenance of its habitat, which is restricted to the small shelters on the towers in the Serra do Sudeste region.

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