Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-01T14:00:04Z No. of bitstreams: 1 PGPV17MA223.pdf: 188914 bytes, checksum: 40f42384c685cd1e290ca430e4ced46a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-01T14:00:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV17MA223.pdf: 188914 bytes, checksum: 40f42384c685cd1e290ca430e4ced46a (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / Capes / The foliar diseases of wheat reduce the area of the photosynthetic plant of the plant, compromising the yield of grains. The objective of this work was to obtain the intensity of foliar diseases, yield and hectoliter of grains in plants of the cultivars: i) TBIO Mestre sprayed with foliar fertilizers (FF) isolated and mixed with fungicides (harvest 2014); ii) TBIO Sinuelo sprayed with fungicides triazole, triazole + strobilurin and morpholine (harvest 2015); iii) the incidence and severity of the fungus Blumeria graminis f.sp tritici on plants sprayed with fungicides in the mode acton preventive and curative. Data were submitted to ANOVA and subsequent comparison of means by the Scott-Knott test or analysis of contrasts (p <0.05). Leaf rust and yellow spot were the predominant diseases in the cultivar TBIO Mestre. The mixture of FF and fungicides didn´t increase the control of rust and leaf spots, the yield and the hectoliter weight of the grains in relation to the isolated use of fungicides. Leaf rust and powdery mildew were the predominant diseases in the trial with the cultivar TBIO Sinuelo. The control of powdery mildew was verified in 40% with the morpholine spray, 41% with triazole and 56% with the triazole + strobilurin mixture. The rust control was 47% with triazoles, 93% with morpholine and 94% with the triazole + strobilurin mixtures. Powdery mildew was the predominant disease in the experiment with Marfim in Muitos Capões. Was detected 32% control of the mildew with the strobilurin + carboxamide mixture, 35% with dithiocarbamates, 68% with triazole + strobilurin and 74% with morpholine. The yellow spot was the predominant disease in the experiment conducted with wheat cultivar TBIO Toruk in Lages. The average control among the 13 fungicides with the greatest reduction of yellow spots AACPDS was 51%. In greenhouse, the pulverized fungicides presented average control of 68 % in preventive action and 56 % curative. It is suggested the control of powdery mildew with triazole + strobilurin, triazole + strobilurin + carboxamide or morpholine. The fungicides of the dithiocarbamate group and the strobilurin + carboxamide mixture don´t have effective control of powdery mildew. The spraying of fungicides resulted in higher grain yield in the four trials conducted in the 2014, 2015 and 2016 crops, with a mean of 669.75 kg ha-1 (18%), with a variation of 413 kg ha-1 (10%) in the cultivar TBIO Mestre in 2014, up to 1,027 kg ha-1 (31%) in the TBIO Sinuelo cultivar in 2015. The wheat grains harvested from the controls of the four field trials obtained 72 hectoliter compared to 76 in the pulverized fungicide / As doenças foliares do trigo reduzem a área foliar fotossintetizante da planta comprometendo o rendimento de grãos. Os objetivos deste trabalho foram obter a intensidade de doenças foliares, rendimento e peso hectolitro de grãos em plantas dos cultivares: i) TBIO Mestre pulverizadas com fertilizantes foliares (FF) isolados e em mistura com fungicidas (safra 2014); ii) TBIO Sinuelo pulverizadas com fungicidas triazol, triazol + estrobilurina e morfolina (safra 2015); iii) Marfim e TBIO Toruk pulverizadas com triazol + estrobilurina, triazol + estrobilurina + carboxamida, estrobilurina + carboxamida e ditiocarbamato (safra 2016) e iv) a incidência e severidade do fungo Blumeria graminis f.sp tritici em planats pulverizadas com fungicidas em modo de ação preventivo e curativo. Os dados foram submetidos à ANOVA e posterior comparação de médias pelo teste Scott-Knott ou análise de contrastes (p<0,05). A ferrugem da folha e mancha amarela foram as doenças predominantes no cultivar TBIO Mestre. A mistura de FF e fungicidas não aumentou o controle de ferrugem e manchas foliares, o rendimento e peso hectolitro de grãos em comparação ao uso isolado de fungicidas. A ferrugem da folha e oídio foram as doenças predominantes no ensaio com o cultivar TBIO Sinuelo. Foi verificado controle de oídio em 40 % com a pulverização de morfolina, 41 % com triazois e 56 % com a mistura de triazol + estrobilurina. O controle de ferrugem foi de 47 % com triazóis, 93 % com morfolina e 94 % com as misturas de triazol + estrobilurina. O oídio foi a doença predominante no experimento com o cultivar Marfim em Muitos Capões. Foi detectado 32 % de controle do oídio com a mistura de estrobilurina + carboxamida, 35 % com ditiocarbamatos, 68 % com a mistura de triazol + estrobilurina e 74 % com morfolina. A mancha amarela foi a doença predominante no experimento conduzido com o cultivar de trigo TBIO Toruk em Lages. A média de controle entre os 13 fungicidas de maior redução da AACPDS de mancha amarela foi de 51 %. Em casa de vegetação, os fungicidas pulverizados apresentaram controle médio de 68 em ação preventiva e 56 % curativa. Sugere-se para controle de oídio fungicidas formulados com triazol + estrobilurina, triazol + estrobilurina + carboxamida ou morfolina. Fungicidas do grupo dos ditiocarbamatos e a mistura de estrobilurina + carboxamida não tem controle eficiente de oídio. A pulverização de fungicidas resultou em maior rendimento de grãos nos quatro ensaios realizados nas safras 2014, 2015 e 2016, com média de 669,75 kg ha-1 (18 %), com variação de 413 kg ha-1 (10 %) no cultivar TBIO Mestre em 2014, até 1.027 kg ha-1 (31 %) no cultivar TBIO Sinuelo em 2015. Os grãos de trigos colhidos nas testemunhas dos quatro ensaios de campo obtiveram 72 de PH médio em comparação a 76 nas parcelas pulverizadas com fungicidas

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV13MA124.pdf: 862800 bytes, checksum: 52145904b06c7b90decb7d1ef575d2ff (MD5) Previous issue date: 2013-04-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The fungicide application on the control of wheat foliar diseases increase the cost production and contribute to contaminate the environment, if unnecessary sprays would be made. The aim of this work was to analyse the available criteria to the technical assistance concerning to the decisive making about the moment of the fungicide application. The experiments were carried out at field, in the 2011 and 2012 growing seasons in Lages, Santa Catarina State, with the Mirante cultivar wheat. Were tested the following criteria: 1) witness (without fungicide spraying); 2) 1% of incidence of plants; 3) 10% of incidence of plants; 4) 5% of foliar severity; 5) main stem with from five to six tillers; 6) first visible node; 7) third visible node; 8) Economic Damage Threshold (EDT). The reapplications were made based on the period of fungicide mixture protection of azoxystrobin + cyproconazol (60g + 24g a.i. ha-1) + propiconazol (125g a.i. ha-1). The experimental unities were composed by 1.5 x 5 m plots arranged in a randomized blocks design with four replications. The applications were made with a coastal sprayer with pressure generated by CO2 gas delivering 200 L ha-1. In the economic analysis was taken in account the cost of applications, the number of applications, the price of wheat, the disease intensity (area under the disease progress curve AUDPC), control effectiveness based on the intensity disease and components of yield (productivity, mass of one thousand grains and weight of the hectoliter). The data were submitted to ANOVA with means compared by the Tukey`s test. In the two growing seasons, leaf rust, yellow spot and powdery mildew were the predominant diseases. The AUDPC values showed that the criteria 1% and 10% of incidence of plants and from five to six tillers presented lower intensities of disease, with higher control and higher yields, however, they received from three to four applications. The EDT criteria received two to three applications and obtained intermediate values, as well as, the criteria of first visible node that presented intermediate values for the means of incidence and severity and also for the productivity. The criteria of third visible node and 5% of foliar severity began the chemical control later, receiving from one to two applications and showed higher means of incidence and severity, lower control, as well as, a lower productivity of grains / A aplicação de fungicidas no controle de doenças foliares do trigo aumenta o custo de produção e pode contribuir para contaminar o meio ambiente caso sejam feitas aplicações desnecessárias. O objetivo deste trabalho foi analisar os critérios disponíveis para a assistência técnica sobre a tomada de decisão para o momento da aplicação de fungicida. Os experimentos foram conduzidos no campo nas safras agrícolas de 2011 e 2012, em Lages, Santa Catarina, com a cultivar de trigo Mirante. Foram testados os seguintes critérios: 1) Testemunha (sem aplicação de fungicida); 2) 1% de incidência de plantas; 3) 10% de incidência de plantas; 4) 5% de severidade foliar; 5) Colmo principal com cinco a seis afilhos; 6) Primeiro nó visível; 7) Terceiro nó visível; e 8) Limiar de Dano Econômico (LDE). As reaplicações foram feitas com base no período de proteção da mistura dos fungicidas azoxistrobina + ciproconazole (60g + 24g de i.a. ha-1) + propiconazole (125g de i.a. ha-1). As unidades experimentais constaram de parcelas de 1,5 x 5 m arranjadas em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições. As aplicações foram feitas com pulverizador costal com pressão gerada por gás CO2 para equivaler uma vazão de 200 L ha-1. Na análise econômica considerou-se o custo das aplicações, o número de aplicações, o preço do trigo, a intensidade de doenças (área abaixo da curva de progresso de doença - AACPD), a eficácia de controle com base na intensidade de doença e os componentes de rendimento (produtividade, massa de mil grãos e peso do hectolitro). Os dados foram submetidos à ANOVA e as médias comparadas pelo teste de Tukey. Nas duas safras as doenças predominantes foram ferrugem da folha, mancha amarela e oídio. Os valores da AACPD demonstraram que os critérios 1% e 10% de incidência em planta e cinco a seis afilhos apresentaram menores intensidades de doença, com maior controle e maiores produtividades, porém receberam de três a quatro aplicações. Os critérios do primeiro nó visível e LDE receberam de duas a três aplicações e apresentaram valores intermediários para incidência, 8 severidade e produtividade. Os critérios do terceiro nó visível e 5% de severidade foliar iniciaram o controle químico mais tardiamente, recebendo de uma a duas aplicações e demonstraram maiores médias de incidência e severidade, menor controle, bem como menor produtividade de grãos

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-07-22T13:02:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Flávia Thuane Duarte do Monte (PDF).pdf: 1029138 bytes, checksum: ded4d1bd5809aa8f26493c20c0169546 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-22T13:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Flávia Thuane Duarte do Monte (PDF).pdf: 1029138 bytes, checksum: ded4d1bd5809aa8f26493c20c0169546 (MD5) Previous issue date: 2016-02-22 / FACEPE / O colágeno é a proteína fibrosa de origem animal mais abundante, que representa 30% de proteína total e 6% em peso no corpo humano. A pele e os ossos de bovinos e suínos geralmente são as principais fontes de colágeno e gelatina. No entanto, devido ao risco de transferência de zoonoses, existe uma necessidade de obtenção desta proteína por meio de outras fontes. A pescada amarela (Cynoscion acoupa) é um importante representante da pesca nacional e possui grande valor comercial. O objetivo deste estudo foi utilizar resíduos do processamento de pescada amarela para obter colágeno e sugerir sua utilização como fonte alternativa para o colágeno mamífero. Colágeno pepsino solúvel (PSC) foi isolado a partir de escamas de pescada amarela e caracterizado com sucesso. O rendimento da extração de PSC foi de 8,3% (baseado no peso seco). A SDS-PAGE (7,5%) mostrou que o padrão de bandas do PSC consistiu de uma cadeia α1 e α2 na proporção de 2:1, bem como cadeias β e γ, sendo caracterizado como colágeno do tipo I. O espectro de absorção ultravioleta (UV) mostrou uma máxima absorção em 222 nm. PSC foi solúvel na faixa de pH de 1 à 4, com a máxima solubilidade em pH 1. O colágeno também demonstrou maior solubilidade na faixa de concentração de 0 à 2% (w/v) de NaCl. A temperatura máxima de transição (Tmax) para PSC foi de 30,4°C, tal como determinado por calorimetria exploratória diferencial (DSC). Os resultados obtidos neste estudo indicam a possibilidade do uso de escamas de pescada amarela como uma fonte de colágeno do tipo I, com grande potencial para aplicações biotecnológicas. / Collagen is the most abundant fibrous protein of animal origin, representing 30% of the total protein and 6% in weight of the human body. The skin and bones of bovines and pigs usually are the main sources of collagen. However, due to the risk of transfer of diseases, there is a need for obtaining this protein form other sources. The acoupa weakfish (Cynoscion acoupa) is an important representative of the national fishing and has great commercial value. The aim of this study was to use acoupa weakfish waste processing for obtain collagen and suggest its use as an alternative source mammal collagen. Pepsin soluble collagen (PSC) from scales of acoupa weakfish was isolated and characterized. The yield of PSC was 8.3% (based on dry weight). SDS-PAGE (7.5%) pattern showed that both PSC consisted of one α1 and one α2 chains in proportion 2:1, as well as β and  chains, and were characterized to be type I collagen. The PSC ultraviolet (UV) absorption spectrum showed a maximum absorption at 222 nm. The PSC was soluble at pH between 1 and 4, with maximum solubility at pH 1. He have also shown solubility majority at NaCl concentration from 0 to 2% (w/v). The maximum transition temperature (Tmax) for PSC was 30.4°C, as determined by differential scanning calorimetry (DSC). The results obtained in this study indicate the possibility of using acoupa weakfish scales as a source of type I collagen with great potential for biotechnological application.

A presente pesquisa investiga as epidemias de febre amarela - em 1897 e 1900 - e de gripe espanhola - em 1918 - ocorridas em Sorocaba e a atuação do médico Álvaro César da Cunha Soares no seu combate, a fim de revelar as condições sanitárias de uma cidade que passava por grandes transformações, como o crescimento urbano e a industrialização, em um contexto de consolidação da medicina oficial e de acirrados debates em torno das questões relacionadas à saúde pública. Para tanto, traça-se um panorama das condições sanitárias e de saúde pública de Sorocaba entre o final do século XIX e o início do século XX, apontando o agravamento dos problemas sociais e o aumento do número de casos de determinadas enfermidades. Desse modo, pretende-se demonstrar como a condição de vida da população pobre sorocabana foi se deteriorando cada vez mais enquanto a cidade apresentava um relativo crescimento urbano e industrial. As epidemias de febre amarela são reconstituídas, abordando-se questões políticas, sociais e científicas que se desenrolaram no decorrer dos surtos epidêmicos, em um contexto de disputa entre o poder estadual, representado pelo Serviço Sanitário do Estado de São Paulo, e os poderes locais, representados por médicos e autoridades públicas municipais, na condução das medidas de combate às epidemias. A epidemia de gripe espanhola na cidade representou um desafio às autoridades públicas locais e uma ameaça à estabilidade econômica local - em um momento em que o crescimento industrial da cidade era colocado em evidência. Desse modo, estudando as epidemias que assolaram Sorocaba na virada do século XIX para o XX e acompanhando a atuação de Álvaro Soares nesse contexto, pretende-se compreender melhor a relação entre a consolidação da medicina oficial no Estado de São Paulo e suas implicações nas práticas em saúde pública / This research investigates epidemics of yellow fever - in 1897 and 1900 - and the Spanish flu - in 1918 - occurred in Sorocaba and the performance of the medical Álvaro César Soares da Cunha in combating them, in order to reveal the sanitary conditions of a city passing through major transformations, such as urban growth and industrialization, in a context of consolidation of official medicine and heated debates on issues related to public health. To this end, draws up an overview of public health and sanitary conditions of Sorocaba in the late nineteenth and the early twentieth century, pointing to the worsening of social problems and the increasing number of cases of certain diseases. Thus, it is intended to demonstrate how the living conditions of the poor in Sorocaba was deteriorating more and more as the city had a relative urban and industrial growth. The yellow fever epidemics are reconstituted, addressing political, social and scientific issues that unfolded over the outbreaks, in a dispute context between state power, represented by the State Sanitation Service of São Paulo, and local authorities, represented by physicians and municipal authorities, in the conduct of measures to combat epidemics. The Spanish flu epidemic in the city was a challenge to local public authorities and a threat to local economic stability - at a time when the industrial growth of the city was placed in evidence. Thus, studying the epidemics that ravaged Sorocaba in the late nineteenth century to the twentieth and monitoring the performance of Alvaro Soares in this context, it is intended to better understand the relationship between the consolidation of official medicine in the State of São Paulo and its implications for practice in public health

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-03-06T17:46:11Z No. of bitstreams: 1 carlarezendebarbosabonin.pdf: 3328861 bytes, checksum: 72bd85d272ff7cf9ee9d0cfb275e0d7e (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-03-06T20:26:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carlarezendebarbosabonin.pdf: 3328861 bytes, checksum: 72bd85d272ff7cf9ee9d0cfb275e0d7e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-06T20:26:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carlarezendebarbosabonin.pdf: 3328861 bytes, checksum: 72bd85d272ff7cf9ee9d0cfb275e0d7e (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Desde 1937 está disponível uma vacina eficaz contra febre amarela. Ainda assim, questões relativas a seu uso permanecem pouco entendidas, como, por exemplo, a necessidade da dose reforço a cada dez anos. O objetivo deste trabalho é demonstrar que ferramentas matemático-computacionais podem ser utilizadas para simular diferentes cenários referentes à vacinação e aos indivíduos a fim de auxiliar a busca pelas respostas de algumas destas questões em aberto. Neste contexto, este trabalho apresenta um modelo matemático-computacional da resposta imune humana à vacinação contra febre amarela. O modelo leva em conta importantes células dos sistemas inato e adaptativo, como células apresentadoras de antígeno, anticorpos, células B e células T (CD4+ e CD8+). Também são consideradas populações de células de memória, importantes na aquisição da imunidade conferida pela vacina. O modelo foi capaz de gerar curvas de anticorpos que estão de acordo com dados experimentais, além de representar o comportamento de diversas populações importantes do sistema imune de acordo com o que é esperado pela literatura. Este é o início de um caminho que, em um cenário ideal, permitirá simular diferentes situações relacionadas ao emprego da vacina contra febre amarela, como sua aplicação em indivíduos com imunodeficiências, diferentes estratégias de vacinação, duração da imunidade e necessidade de dose reforço. / An effective vaccine against yellow fever is available since 1937, but some issues regarding its use remain poorly understood, for example, the need for a booster dose every ten years. The objective of this study is to demonstrate that mathematical-computational tools can be used to simulate distinct scenarios related both to vaccination and individuals in order to assist the search for the answers to some of these open issues. In this context, this study presents a mathematical-computational model of the human immune response to vaccination against yellow fever. The model takes into account important cells of the innate and adaptive systems, such as antigen presenting cells, antibodies, B cells and T cells (CD4 + and CD8 +). Memory cell populations, important on the immunity induced by a vaccine, were also considered in the model. The model was able to generate antibodies curves which are in accordance with experimental data as well as to represent the behavior of several important populations of the immune system according to the results of the literature surveyed. This is the first step towards an ideal scenario where it will be possible to simulate distinct situations related to the use of yellow fever vaccine, as its application in immunodeficient individuals, different vaccination strategies, duration of immunity and the need for a booster dose.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:07:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_nixon_da_rosa_westendorff.pdf: 1164743 bytes, checksum: 0e98d540bb2c2b7a5450d35d0dfaf837 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Weeds are responsible for most part of the reduction in rice yield. The species Cyperus esculentus, a Cyperaceae plant, stands out by adaptation to the flooded environment. Little is known about the competitive ability of the specie rice and what is the extent of the economic loss caused. The economic thresholds (ET) has been an important tool to quantify weed damage to crops, in addition to supporting decision making of when the adoption of compensatory measure of control. The most obvious consequences of the use of ET in decision making are reduction of production costs, less use of herbicides and thereby benefitting the environment and man, and minimization of the selection pressure that select weeds resistant. The objectives of this research were to study the adaptive value, the competitive ability and the determination of ET for C. esculentus on flooded rice, using mathematical model for nonlinear regression derived from the rectangular hyperbolic, depending on the cycle of rice cultivars, irrigation timing and population of the weed. Studies were conducted for adaptation and competition in the field and greenhouse in the 2010/11 growing season. In general, the rice cultivars studied have superior adaptive value than C. esculentus. For rice, the intraspecific competition is more important, while for the weed interspecific competition is more pronounced. The hyperbolic model satisfactorily estimates the yield losses that C. esculentus causes in rice. The explanatory variable is the population of Cyperus esculentus that best fit the model. The reduction in the development cycle of rice cultivar and the anticipation of irrigation, increase the competitive potential of the culture and consequently increase the C. esculentus ET. / As plantas daninhas são responsáveis por grande parte da redução de produtividade das lavouras de arroz irrigado. A espécie Cyperus esculentus, pertencente à família Cyperaceae, destaca-se pela adaptação ao ambiente irrigado. Pouco se conhece sobre a habilidade competitiva da espécie com a cultura do arroz e qual é a dimensão do prejuízo econômico causado. O nível de dano econômico (NDE) tem sido importante ferramenta na quantificação de prejuízos às culturas, além de subsidiar a tomada de decisão de quando é compensatória a adoção de medida de controle. As vantagens mais evidentes do uso de NDE na tomada de decisão são diminuição dos custos de produção, menor uso de herbicidas e, com isso, menor contaminação do ambiente e do homem e minimização do processo de seleção que torna as plantas daninhas resistentes. Os objetivos dessa pesquisa foram o estudo do valor adaptativo, da habilidade competitiva e a determinação do NDE de C. esculentus na cultura do arroz irrigado, pelo uso do modelo matemático de regressão não linear derivado da hipérbole retangular, em função do ciclo das cultivares de arroz irrigado, época de irrigação e população da planta daninha. Para tal, foram conduzidos estudos de adaptação e competição a campo e em casa de vegetação no ano agrícola 2010/11. Em geral, as cultivares de arroz estudadas possuem valor adaptativo superior a C. esculentus. Para a cultura do arroz, a competição intraespecífica é mais importante, enquanto que para a planta daninha a competição interespecífica é a mais pronunciada. O modelo hiperbólico estima satisfatoriamente as perdas de produtividade que C. esculentus causa à cultura do arroz. A variável explicativa população de Cyperus esculentus é a que mais se ajustou ao modelo. A redução no ciclo de desenvolvimento da cultivar de arroz e a antecipação da irrigação incrementam o potencial competitivo da cultura e, consequentemente, aumentam os NDE de C. esculentus.

No verão 2007-2008, o Brasil registrou uma epidemia midiática de febre amarela, produzida a partir da cobertura jornalística da forma silvestre da doença, que, de acordo com a autoridade sanitária e a maioria dos especialistas, estava dentro da normalidade epidemiológica. Assentado fortemente em repertórios de risco em saúde, o noticiário deslocou discursivamente o evento de sua forma silvestre, espacialmente restrita e de gravidade limitada, para a urbana, de caráter epidêmico e potencialmente mais grave. Os sentidos produzidos pela mídia impactaram todo o sistema nacional de imunização e expôs a riscos desnecessários pessoas que se vacinaram contra a febre amarela incentivadas pelo discurso jornalístico e contrariando as recomendações do Ministério da Saúde, o que levou a quatro óbitos por vírus vacinal. Ancorada nos referenciais teórico-metodológicos dos estudos de comunicação e saúde, com ênfase na teoria social da mídia, especificamente em sua vertente jornalística, e das práticas discursivas e produção de sentidos no cotidiano, esta tese buscou compreender o processo de produção dessa epidemia midiática e alguns de seus desdobramentos no cotidiano dos atores envolvidos no fenômeno (gestores e profissionais de saúde; profissionais de imprensa e usuários dos serviços de imunização). Para tanto, foram realizadas análises de documentos de domínio público (textos jornalísticos e comunicações ministeriais) e 14 entrevistas com atores envolvidos diretamente no/pelo noticiário (gestores; profissionais de saúde; assessores imprensa; jornalistas da imprensa generalista; e usuários vacinados). A análise foi feita sob quatro grandes eixos temáticos: o processo de produção da narrativa, o uso de repertórios de risco, a fabulação da vacina e a tradução do conhecimento técnico-científico. Concluiu-se que a epidemia midiática foi sobretudo resultado do modo de produção da notícia (newsmaking), tendo sido, ao longo de toda a cobertura, atravessada fortemente por duas forças ideológicas (a da objetividade e a do profissionalismo), em um esforço jornalístico para configurar a narrativa como espelho de uma realidade epidêmica inexistente. O modelo oligopolista de comunicação do país e as falhas nas estratégias de resposta do governo também contribuíram para a produção da epidemia midiática de febre amarela. Entendido como uma crise sem precedentes, o fenômeno é avaliado como uma oportunidade de abrir o debate sobre as relações entre a imprensa generalista e a saúde coletiva brasileira, sobretudo na perspectiva da construção de uma política pública de comunicação específica e contra-hegemônica para o Sistema Único de Saúde. / In the summer of 2007-2008, Brazil registered a \"media epidemic\" of yellow fever, produced from the media coverage of the wild form of the disease, which, according to health authorities and experts, was within the expected epidemiological patterns. Strongly seated in repertoires of health risk, the news shifted the event from its wild form, spatially restricted and limited risk to the urban form, with its epidemic character and potentially more serious. The meanings produced by the media impact throughout the national immunization system and exposed to unnecessary risk people who have been vaccinated against yellow fever, encouraged by the journalistic discourse and against the recommendations of the Ministry of Health, which led to four deaths from vaccine virus. Anchored in the theoretical and methodological frameworks of communication and health studies, with an emphasis on media social theory, specifically in its journalistic aspect, and discursive practices and production of meanings in everyday life, this thesis sought to understand the production process of this media epidemic and some of its developments in the daily lives of the actors involved in the phenomenon (managers and health professionals, media professionals and users of immunization services). To this end, public domain document analyzes were performed (newspaper articles and ministerial communications) and 14 interviews with actors directly involved in / with the news (managers, health professionals, press officers, journalists from the general press, and vaccinated users). The analysis was carried out under four major themes: the narrative production process, the use of risk repertoires, the fable of the vaccine and the translation of technical and scientific knowledge. It is concluded that media epidemic was primarily a result of news production mode (newsmaking), having been throughout the coverage, strongly crossed by two ideological forces (objectivity and professionalism), in an effort to set the journalistic narrative as a mirror of a nonexistent epidemic reality. The oligopolistic model of the country\'s communication and failures in government response strategies also contributed to the production of the media epidemic of yellow fever. Understood as an unprecedented crisis, the phenomenon is evaluated as an opportunity to open the debate on the relationship between the general press and the Brazilian public health, especially in a view of the construction of a public specific and counter-hegemonic communication policy to the Unified Health System (SUS).

A fragmentação e a invasão de florestas tropicais e a crescente concentração de assentamentos humanos aumentaram exponencialmente as chances de exposição a vírus emergentes e emergentes. Dado o grande potencial de espalhamento de patógenos em população humanas, a identificação e caracterização de agentes patogênicos circulantes podem melhorar a atenção primária e as capacidades de diagnóstico para um agente emergente futuro. As abordagens moleculares e metagenômicas que utilizam as tecnologias de sequenciação da próxima geração levaram a descoberta e caracterização de muitos vírus emergentes na última década. Além disso, as abordagens in silico também podem ajudar a identificar vírus emergentes usando apenas dados de sequenciamento publicamente disponíveis. Além disso, estimar a ascendência filogenética e até mesmo analisar as mudanças no uso de codons são ferramentas adicionais que podem melhorar a nossa compreensão de vírus emergentes ou reemergentes. Este projeto visou aplicar essas ferramentas em ambos os vírus que poderiam estar circulando no Brasil: Parvovírus B19 e vírus da Febre Amarela. Também exploramos as aplicações de modelos ocultos de Markov e índice de adaptação de codons usando dados publicamente disponíveis. Esperamos que este trabalho forneça uma prova de conceito para futuros projetos metagenômicos e demonstre a utilidade das várias técnicas moleculares e bioinformáticas no estudo de vírus emergentes. / Fragmentation and encroachment of tropical rainforests and the growing concentration of human settlements have exponentially increased chances of exposure to re-emerging and emerging viruses. Given the large potential for pathogens to spillover and spread in a population, identifying and characterizing circulating human pathogens could improve the readiness and diagnostic capabilities for a future emergence. Molecular and metagenomic approaches using next-generation sequencing technologies have led to the discovery and characterization of many emerging viruses over the last decade. In complement, in silico approaches can also help identify emerging viruses using only publicly available sequencing data. Moreover, estimating the phylogenetic ancestry and even analyzing changes in codon usage are additional tools that can improve our understanding of an emerging or re-emerging virus. This project aimed to apply these tools to two viruses that could be circulating in Brazil: Parvovirus B19 and Yellow Fever virus. We also explored the applications of Hidden Markov models and codon adaptation index using publicly available data. We expect this work to provide a proof-of-concept for future metagenomic projects, and demonstrate the utility for several molecular and bioinformatics techniques in the study of emerging viruses.

Neste trabalho foi feito uma investigação sorológica em moradores na região amazônica e moradores rurais do sudeste brasileiro, através do teste de inibição da hemaglutinação (HI) para a cepa vacinal da Febre Amarela mais 17 sorotipos diferentes de arbovírus, sendo quatro do gênero Alphavirus (ALP), nove do gênero Flavivirus (FLA) e cinco do gênero Orthobunyavirus (ORT), para verificar qual desses vírus estão circulando nessas regiões. Os resultados do HI foram divididos em quatro áreas: na cidade Machadinho dOeste (Rondônia) (N=285) tivemos para ALP=50 (17,54%), FLA=270 (94,74%), ORT=58 (20,35%) e negativos (NEG)=12 (4,20%). Nas pessoas que moram ao longo do Rio Machado (Rondônia) (N=343) tivemos ALP=99 (28,86%), FLA=229 (66,76%), ORT=41 (11,95%) e NEG=93 (27,10%). Na cidade Teodoro Sampaio (São Paulo) (N=78) tivemos FLA=55 (70,51%) e NEG=23 (29,5%). Na cidade Jacupiranga (São Paulo) (N=149) tivemos ALP=7 (4,7%), FLA=50 (33,56%), ORT=20 (13,42%) e NEG=84 (56,4%). Concluímos que os resultados obtidos sugerem a circulação desses vírus nas regiões estudadas. / In this work we performed a serological investigation in residents of Amazon region and country people who lives in Southeastern of Brazil, by hemagglutination inhibition (HI) for Yellow fever vaccine and 17 different serotype of arboviruses: four from the genus Alphavirus (ALP), nine from the genus Flavivirus (FLA), and five from the genus Orthobunyavirus (ORT), to try to ascertain which of these arboviruses are circulating in these areas. The results of HI were divided into four areas: In Machadinho dOeste city (Rondônia) (N=285) we had to ALP=50 (17,54%), FLA=270 (94,74%), ORT=58 (20,35%) and negatives (NEG)=12 (4,20%). In people who live along the Machado River (Rondônia) (N=343) we had to ALP=99 (28,86%), FLA=229 (66,76%), ORT=41 (11,95%) and NEG=93 (27,10%). In Teodoro Sampaio City (São Paulo) (N=78) we had to FLA=55 (70,51%) and NEG=23 (29,5%). In Jacupiranga City (São Paulo) (N=149) we had to ALP=7 (4,70%), FLA=50 (33,56%), ORT=20 (13,42%) and NEG=84 (56,4%). In conclusion, the obtained data suggest the circulation of these viruses in these regions.

Made available in DSpace on 2016-01-26T12:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mariacarolinaferrerisarkismadrid_dissert.pdf: 2834086 bytes, checksum: 6c83e7649397cb555812544b997d81d3 (MD5) Previous issue date: 2007-12-04 / Yellow fever is an infectious disease caused by the yellow fever virus (YFV), a Flavivirus transmitted to humans by Aedes aegypti mosquitoes. Despite the existence of the yellow fever vaccine, the disease is endemic in South America and Africa, causing public health problems such as dispersed outbreaks, epidemics with variable impact and the risk of re-emergency of the urban cycle due to the occurrence of sylvatic disease. Aim. The knowledge of the components of YFV replication complex is still incipient but it is known that there are interactions among viral RNA, viral proteins and host proteins and, due to evidences of the existence of protein-protein interactions related to the NS5 protein of other Flavivirus, the target of our study was YFV NS5 protein. Once protein-protein interactions present basic importance for the activation, the regulation and the control of diverse biologic functions related to these interactions, the identification and the characterization of them are essential for a better comprehension of the pathogenesis and for the rational design of drugs for YFV. Material and Method. The YFV NS5 gene was divided in its two domains, which were independently cloned in a GAL4 DNA-BD plasmid, generating the methyltransferase (MT) and RNA polymerase (RNApol) baits. A two-hybrid system screening in Saccharomyces cerevisiae AH109 strain was performed utilizing RNApol bait and cDNA library of Hela cells, which was cloned in a GAL4 AD plasmid. MT bait showed to be toxic for the yeast. Results. All 204 obtained transformants were tested for activation of reporter genes HIS3, ADE2 and lacZ from AH109 and only 35 samples indicated positivity to, at least, two of the reporter genes assessed. Thirty three distinct cellular protein partners of the RNApol NS5 were identified after the sequencing of the clones and the comparison of its sequences with GenBank. Proteins Snf5, p54NRB, HMG20B, U1A, eIF3S6IP, GIPC PDZ and MIF were chosen for next experiments. A plasmid linkage with these proteins was performed to exclude the possibility of false-positive clones and to confirm the protein-protein interactions identified in the initial screening. RNApol regions responsible for the Snf5 and eIF3S6IP interactions were mapped and a region of approximately 80 aminoacids was identified as the minimum domain requested for the interactions, called fragment A. Conclusion. The prominence of this YFV fragment as a determinant of protein interactions became more evident when its sequence was compared to the sequences of other Flavivirus, signalizing a homology from aminoacid 20 to 80, demonstrating that this fragment is a conserved region. Moreover, the production of a similarity model of RNA polymerase domain of YFV NS5 protein, using the known DENV NS5 protein structure, showed that the region of interaction is exposed and potentially capable of forming interactions. / A febre amarela é uma doença infecciosa causada pelo vírus da febre amarela (yellow fever virus YFV), um Flavivirus transmitido ao homem pela picada do mosquito Aedes aegypti. Mesmo com a existência de uma vacina anti-amarílica, a enfermidade conserva-se endêmica na América do Sul e na África, gerando problemas de saúde pública que incluem surtos isolados, epidemias de impactos variáveis e, principalmente, o risco da possível re-emergência da sua forma urbana a partir da ocorrência de surtos silvestres. Objetivo. Embora sejam mínimas as informações sobre os componentes do complexo de replicação do YFV, sabe-se que nele estão envolvidas interações entre o RNA viral, proteínas virais e proteínas do hospedeiro e, devido às evidências de interações proteína-proteína relacionadas à proteína NS5 de outros Flavivirus, o alvo principal do nosso trabalho foi NS5 do YFV. Como interações protéicas são de fundamental importância para ativação, regulação e controle de diversas funções biológicas a elas relacionadas fica evidente a relevância da identificação e caracterização das interações participantes desse processo para uma melhor compreensão da patogênese e para o desenho racional de drogas contra a febre amarela. Material e Método. O gene NS5 de YFV foi dividido em seus dois domínios, os quais foram clonados independentemente no plasmídeo com DNA-BD de GAL4, gerando as iscas metiltransferase e RNA polimerase. Em seguida, foi realizado um screening em sistema duplo-híbrido com a isca RNApol contra biblioteca de cDNA de células Hela clonada em vetor com AD de GAL4, uma vez que MT mostrou-se tóxica para a levedura hospedeira do experimento Saccharomyces cerevisiae, linhagem AH109. Resultados. Os 204 transformantes obtidos foram testados quanto à capacidade de ativação dos genes repórteres HIS3, ADE2 e lacZ de AH109 quando, então, apenas 35 amostras mostraram-se positivas para pelo menos dois dos repórteres testados. Após o seqüenciamento nucleotídico desses clones e comparação das seqüências com o GenBank, os resultados indicaram seqüências nucleotídicas codificadoras para 33 proteínas celulares diferentes como parceiras interativas de RNApol NS5, dentre as quais foram eleitas as proteínas Snf5, p54NRB, HMG20B, U1A, eIF3S6IP, GIPC PDZ e MIF para o prosseguimento dos experimentos. Para excluir a possibilidade de pertencerem a uma classe de clones falso-positivos e confirmar as interações proteína-proteína identificadas na triagem inicial, foi efetuado o plasmid linkage. Após tal confirmação, foram mapeadas as regiões em RNApol responsáveis pelas interações com Snf5 e eIF3S6IP, tendo sido descoberta uma mesma região de aproximadamente 80 resíduos aminoácidos como o domínio mínimo requerido para tais interações, a qual foi denominada fragmento A. Conclusões. A relevância do fragmento A de YFV como determinante das interações protéicas tornou-se mais evidente quando sua seqüência foi comparada à de outros Flavivirus, mostrando a presença de uma homologia principalmente entre os aminoácidos 20 a 80, demonstrando que esse fragmento se comporta como uma região conservada entre os Flavivirus considerados. Além disso, a geração de um modelo de similaridade do domínio RNA polimerase da proteína NS5 de YFV, a partir de NS5 de DENV, demonstrou que a região de interação está exposta ao solvente, sendo, portanto, potencialmente capaz de formar interações.