Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-24Bitstream added on 2014-06-13T19:09:10Z : No. of bitstreams: 1 pretti_t_me_arafcf.pdf: 649581 bytes, checksum: 01a43b71b827a486ed71045fb400a33b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Visando ampliar o aproveitamento nutricional e tecnológico do amendoim realizou-se este trabalho, com o objetivo de elaborar extrato aquoso, com diferentes processamentos, e verificar a aceitação do extrato fermentado com Streptococcus thermophilus e Lactobacillus delbrueckii ssp bulgaricus e com adição de leite em pó desnatado. O procedimento para obtenção do extrato consistiu no aquecimento dos grãos em solução de bicarbonato de sódio a 0,5% (1:4, p/v) até ebulição, com posterior drenagem, lavagem, desintegração e filtração. Foram avaliadas duas temperaturas (75 ºC e 97 ºC) e duas proporções de grão: água (1:5 e 1:8, p/v) para a desintegração dos grãos. Os produtos fermentados, com 0%, 2% e 4% de leite em pó, foram avaliados sensorialmente. Água a 75 ºC produziu extrato com o menor conteúdo de lipídeos (5,87%) e maior de carboidratos (2,31%). Os componentes dos extratos foram significativamente diluídos com a maior proporção de água (1:8 p/v), que permitiu o maior rendimento (1:6,92 kg), a maior extração de sólidos totais e proteína e a menor perda de sólidos no resíduo, sendo este procedimento selecionado para elaboração do extrato fermentado. O aquecimento dos grãos a 97 ºC propiciou proteína com maior digestibilidade (80,6%). Os resultados mostraram a possibilidade de se elaborar um produto adequado, fermentando-se o extrato de amendoim adicionado de leite em pó. Apresentou pH 4,5, 0,5% de ácido lático, 4,86% proteína e 2,36% de lipídeos e características sensoriais aceitáveis. A adição de leite em pó desnatado favoreceu a fermentação (4 horas e meia), melhorou a consistência e a aceitação geral do produto fermentado. O extrato aquoso fermentado de grãos de amendoim é uma alternativa tecnológica viável à elaboração de alimentos para a população, pela qualidade nutricional de seus componentes e a sua fácil disponibilidade. / Aiming to increase nutritional and technological utilization of the peanut, this research was realized to produce an aqueous extract, with variations in processing, and to check the acceptance of the fermented extract with Streptococcus thermophilus and Lactobacillus delbrueckii ssp bulgaricus and with the addition of powder milk. The procedure to obtain the extract consisted of heating the beans until boiling (1:4 w/v) 0.5% of sodium bicarbonate, draining, washing, disintegration and filtration. It was evaluated two temperatures (75 ºC and 97 ºC) and two amounts of grain: water (1:5 and 1:8, w/v) in disintegration of the grains. Fermented products, with 0%, 2% and 4% of powder milk, were evaluated. Water at 75 ºC produced extract with lower content of lipids (5.87%), and higher of carbohydrates (2.31%). The extracts components of the were significantly diluted with the proportion 1:8 w/v, that permited the highest yield of process (1:6.92 kg) and better total solids and protein extraction and lower loss of solids in the waste. It was therefore selected for preparation of the fermented extract. The heating of the grains at 97 ºC, due to better digestibility of protein (80.6%). The results showed that is possible to obtain a fermented product with peanut extract added at milk powder. It presented pH 4.5, 0.5% lactic acid, 4.86% protein and 2.36% lipids and sensorial quality. The addition of powder milk favored fermentation (4 hours) and improved the consistency and general acceptance of the fermented product. The aqueous extract fermented of peanut grains represents a viable technological alternative in the preparation of food for population, due to nutritional quality of its components and its easy availability.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:56:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2321.pdf: 2212590 bytes, checksum: e03a838bd999bce0488998d98b12479f (MD5) Previous issue date: 2009-02-20 / Universidade Federal de Sao Carlos / Arachis hipogae L. peanut is an orthodox seed that must go through a drying process to become free from aflatoxin. The fruit is formed by a system made up by a nucleus and a resistant involucre that constitutes a heterogeneous mixture. So as to contribute to the improvement of those seeds drying, the objective of this study is to analyze the drying of the compound system and its subsystems in relation to moisture transport and shrinkage, as well as the influence on physiological and physical characteristics. In order to do so, the fruit, the seeds with and without endocarp, as well as the pericarp were placed in a forced convection dryer. To approach the problem, the idea of fluid flow on submerged bodies was adopted. The experiments were conducted based on a 32 experimental planning with temperatures of 30, 40 e 50°C and velocities of 0,5; 1,0 e 1,5 m/s. The intermittent method was used to measure the samples mass and to obtain the images. Analysis of the physical and physiological characteristics was performed from observations during the experiments. The results showed that the diffusive transport of moisture was predominant when the fruit and seed with and without the endocarp are concerned. The convective mechanism was also observed for the pericarp. As far as the physical barriers effect is concerned, it was verified that the pericarp and the endocarp cause resistance to mass transport. It was possible to verify the development of the seed s (with and without the endocarp) superficial concavity through image analyses with the aid of IMAGE PRO PLUS® software. However this deformation was not observed for the fruit or for the pericarp. The dimension reductions demonstrate the presence of the shrinkage phenomenon for the seed with and without the endocarp. The results regarding the physiological and physical characteristics showed dependency on operational conditions used when the seeds are processed outside the pericarp. Analysis concerning the process interaction with the product characteristics demonstrated that convective drying is a promising technique having a better relation between the process and quality for the product. Due to the results obtained, the discrimination of the equations that represent drying kinetics with focus on the improvement of seeds production was performed. The advancements obtained contribute to the drying studies of seeds that present protective cover under the perspective of seeds drying engineering. / O amendoim (Arachis hipogae L.) é uma semente ortodoxa que precisa passar pelo processo de secagem para se tornar livre da aflatoxina. O fruto é formado por um sistema composto por um núcleo e um invólucro resistente que constitui uma mistura heterogênea. Visando contribuir com a melhoria da secagem destas sementes o objetivo deste estudo é analisar a secagem do sistema composto e seus subsistemas em relação ao transporte de umidade e encolhimento, assim como, a influência sobre as qualidades físicas e fisiológicas. Para tanto, o fruto, as sementes com e sem endocarpo, bem como, o pericarpo, foram submetidos em um secador de convecção forçada com reciclo de ar. Para a abordagem do problema adotou-se a visão de escoamento de fluido sobre corpos submersos. Os experimentos foram conduzidos com base em um planejamento experimental 32 com temperaturas de 30, 40 e 50°C e velocidades de 0,5; 1,0 e 1,5 m/s. Para medida da massa das amostras e a tomada de imagens foi utilizado o método intermitente. As qualidades físicas e fisiologias foram realizadas a partir de observações durante os experimentos. Os resultados obtidos mostraram que o mecanismo predominante no transporte de umidade é o difusivo, quando se tem o fruto, a semente com e sem endocarpo. Para o pericarpo foi verificada também a presença do mecanismo convectivo. Quanto ao efeito das barreiras físicas, foi constatado que o pericarpo e o endocarpo causam resistência ao transporte de massa. Através da análise das imagens, com auxílio do software IMAGE PRO PLUS® foi possível constatar o desenvolvimento da concavidade na superfície da semente com e sem endocarpo. Entretanto, esta deformação não foi observada para o fruto nem para o pericarpo. As reduções das dimensões demonstram a ocorrência do fenômeno de encolhimento para a semente com e sem endocarpo. Os resultados referentes às qualidades fisiológicas e físicas mostraram dependência com as condições operacionais utilizadas quando as sementes são processadas fora do pericarpo. A análise referente à interação do processo com as qualidades do produto demonstrou que a secagem convectiva é promissora tendo a melhor relação entre o processo e qualidade para o fruto. Diante dos resultados obtidos, foi realizada a discriminação das equações que representam a cinética de secagem com enfoque na melhoria da produção de sementes. Os avanços obtidos contribuem com os estudos da secagem de sementes que apresentam capa protetora sob o ponto de vista de engenharia de secagem de sementes.

Submitted by PAULA ANDRÉA SAMPAIO DE VASCONCELOS CARVALHO null (paulasvasconcelos@hotmail.com) on 2017-10-06T14:46:03Z No. of bitstreams: 1 tese pos defesa Paula Andréa Sampaio de Vasconcelos Carvalho.pdf1.pdf: 1988306 bytes, checksum: 46c0925bf8ca00155c63f2c83d48acac (MD5) / Rejected by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-10-09T17:38:04Z (GMT) / Submitted by PAULA ANDRÉA SAMPAIO DE VASCONCELOS CARVALHO null (paulasvasconcelos@hotmail.com) on 2017-10-18T21:09:07Z No. of bitstreams: 1 tese Paula Andréa Sampaio de Vasconcelos Carvalho.pdf com ficha.pdf: 2023210 bytes, checksum: 0f11f1ef3d125e88872b67188fcfff93 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-10-23T13:23:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 carvalho_pasv_dr_bot.pdf: 2023210 bytes, checksum: 0f11f1ef3d125e88872b67188fcfff93 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-23T13:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 carvalho_pasv_dr_bot.pdf: 2023210 bytes, checksum: 0f11f1ef3d125e88872b67188fcfff93 (MD5) Previous issue date: 2017-08-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O gênero Arachis possui 81, espécies distribuídas em nove seções taxonômicas, sendo o amendoim (A. hypogaea L.) a principal espécie, devido ao seu alto valor nutricional. O gênero possui também outras espécies de interesse econômico, que têm sido utilizadas em programas de melhoramento do amendoim (espécies da seção Arachis) e espécies forrageiras de outras seções do gênero. Com relação às demais espécies, o germoplasma da grande maioria está disponível para a caracterização e pode, sem dúvida, contribuir para seu uso futuro. O gênero Arachis é um dos poucos que produzem o resveratrol, uma fitoalexina que, além de ser uma resposta da planta contra estresses, também tem ação antioxidante, sendo indicado para prevenção de cânceres e cardiopatias. A avaliação do potencial de produção de resveratrol foi realizada somente em algumas espécies da seção Arachis, faltando avaliação em outras espécies do gênero e nos tetraploides sintéticos que estão sendo utilizados para facilitar a transferência de alelos de espécies silvestres para a cultivada. Assim, o objetivo desse trabalho foi ampliar o conhecimento sobre resveratrol no gênero Arachis. Para tanto foram analisados 21 acessos de espécies silvestres de cinco diferentes seções do gênero Arachis, oito poliploides sintéticos e três cultivares de amendoim. A produção de resveratrol em um conjunto menor de cinco espécies foi acompanhada também de avaliação da expressão do gene que codifica a enzima resveratrol sintase, RS, para entender a variação observada no teor de resveratrol entre as espécies. Tendo em vista que cada experimento foi realizado em uma época diferente do ano e de modo separado, não foi possível reunir todos os dados e fazer uma comparação entre eles. Em todos os experimentos foram avaliadas folhas submetidas a estresse abiótico por raios ultravioleta (UV), que foi o melhor indutor de síntese em dados de literatura. Os resultados mostraram que 21 acessos de 17 espécies das cinco seções são capazes de produzir resveratrol, sendo o maior teor detectado em A. lignosa, da seção Procumbentes. Em relação ao potencial de produção dos híbridos, foi verificado que a concentração de resveratrol na maioria dos anfidiploides sintéticos é significativamente maior em relação aos parentais silvestres diploides. Além disso, a concentração de resveratrol nos híbridos resultantes do cruzamento entre anfidiploides e A. hypogaea foi significativamente maior que nos anfidiploides, sugerindo que a combinação entre alelos de silvestres e do cultivado tem um efeito positivo no aumento do resveratrol. Em relação às análises moleculares, notou-se que a expressão do gene é imediata ao término da indução, seguindo de forma decrescente. Por outro lado, as concentrações de resveratrol são crescentes em relação ao passar do tempo de coleta após a indução por UV. Os resultados demonstram o potencial do gênero como fonte de resveratrol, seja via amendoim cultivado, por meio de introgressão de alelos silvestres utilizando-se anfidiploides, ou pelo uso per se dos acessos de espécies silvestres, incluindo de outras seções distantes do amendoim, como é a Procumbentes, da qual faz parte A. lignosa, que apresentou o maior teor de resveratrol no estudo. / The Arachis genus comprises 81 species divided into nine taxonomic sections, being peanut (A. hypogaea L.) the main species due to its high nutritional value. The genus also has other species of economic interest, which have been used in breeding programs for peanut (species of Arachis section) and to forage production. Regarding the other species of Arachis, germplasm of most of them is available and their characterization could undoubtedly contribute to their future use. Arachis genus is one of the few that produces resveratrol, a phytoalexin that is synthesized by the plant due to a stress and it is also a antioxidant that has been used to prevention of cancers and heart diseases. The resveratrol evaluation in Arachis was carried out mainly in Arachis hypogaea and in some species of the section Arachis, lacking the evaluation in other species of the genus and in the synthetic tetraploids that have been used to facilitate the transfer of alleles from wild species to the cultivated one. Therefore, the objective of this study was to increase the knowledge about resveratrol in the genus Arachis. Twenty one accessions of wild species from five different sections of the genus Arachis, eight synthetic polyploids and three peanut cultivars were analyzed. The production of resveratrol in a smaller set of five species was also accompanied of evaluation of resveratrol synthase to try to understand the variation observed in the resveratrol content among the species. Since each experiment was performed at a different time of year and separately, it was not possible to gather all the data and make a comparison between them. In all experiments, leaves treated with ultraviolet radiation (UV) were evaluated, which was the best inducer of synthesis in literature data. The results showed that 21 accessions of 17 species of the 5 sections are able to produce resveratrol, being the highest content detected in A. lignosa from Procumbentes section. It was verified that the concentration of resveratrol in the majority of the synthetic amphidiploids is significantly higher in relation to the diploid wild parents. In addition, the concentration of resveratrol in the hybrids resulting from the crossing between amphidiploids and A. hypogaea was significantly higher than in amphidiploids, suggesting that the combination of wild and cultivated alleles has a positive effect on the increase of resveratrol. It was noticed that the expression of the gene is immediate at the end of the induction, following in a decreasing way. On the other hand, the concentrations of resveratrol are increasing in relation to the time of collection after the induction of the material. The results demonstrate the potential of wild species of genus Arachis as a 10 source of resveratrol, either via cultivated peanuts, through introgression of wild alleles using amphidiploids, or through the use of wild species accesses, including from other sections distant from peanut, such as A. lignosa.

Resumo: O presente estudo foi conduzido no Núcleo de Pesquisas Avançadas em Matologia - NUPAM, do Departamento de Agricultura e Melhoramento Vegetal da Faculdade de Ciências Agronômicas - Campus de Botucatu - UNESP, localizada na Fazenda Experimental Lageado, no município de Botucatu, São Paulo, Brasil. O objetivo foi identificar os efeitos alelopáticos de três espécies do gênero Arachis (Arachis pintoi, Arachis repens e Arachis repens miúda), utilizando solo e a solução de solo, avaliando a germinação e o crescimento de alface (Lactuca sativa L.) e arroz (Oryza sativa L.) espécies sensíveis a testes de alelopátia, sendo adotadas como indicadoras; braquiária (Brachiaria decumbens Stapf) e corda-de-viola (Ipomoea grandifolia) espécies adotadas como plantas daninhas. Para tanto, utilizaram-se três distintos procedimentos experimentais. Os estudos envolveram a utilização de solo e solução de solo retirada de uma área cultivada com as espécies do gênero Arachis. Os experimentos foram instalados no delineamento experimental inteiramente casualizados e o numero de tratamentos e de repetições seguiram as particularidades de cada estudo. No estudo de crescimento em solo com e sem o cultivo das espécies do gênero Arachis, avaliou-se o crescimento em centímetros (cm), matéria seca em gramas (g) e o número de folhas. Ocorreram efeitos inibitórios dos solos cultivados com as espécies de gênero Arachis em O. sativa e I. grandifolia, sendo o uso da metodologia de crescimento em solo a que mais se aproxima das condições encontradas campo, devendo ser priorizada em futuros estudos. Nos estudos de germinação em solução de solo e, em solo com e sem o cultivo de espécies do gênero Arachis avaliou-se a germinação em porcentagem (%), matéria seca em gramas (g), índice de velocidade de emergência (IVG) e o tempo médio de germinação (t). Os efeitos encontrados foram... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study was conducted at the Center for Advanced Research in Matologia - NUPAM, Department of Agriculture and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Sciences - Campus of Botucatu - UNESP, in the Experimental Farm Lageado, in Botucatu, São Paulo, Brazil. The objective was to identify the allelopathic effects of three species of the genus Arachis (Arachis pintoi, Arachis repens and Arachis repens small), using soil and soil solution, evaluating the germination and growth of lettuce (Lactuca sativa L.) and rice (Oryza sativa L.) susceptible to tests of allelopathy, being used as indicators; (Brachiaria decumbens) and morningglory (Ipomoea grandifolia) species taken as weed. To this end, we used three different experimental procedures. The studies involved the use of soil and soil solutions taken from the area cultivated with the species of the genus Arachis. The experiments were conducted in randomized experimental design and number of treatments and replications followed the particularities of each study. In the study of growth in soil with and without the cultivation of species of the genus Arachis was evaluated on the growth in centimeters (cm), dry weight in grams (g) and number of leaves. There were inhibitory effects of soils the species of the genus Arachis in O. sativa and I. grandifolia, and using the methodology of growth in soil that most closely approximates the conditions encountered in the field and should be prioritized in future studies. In studies of germination in soil solutions and in soil with and without the cultivation of species of the genus Arachis evaluated the germination percentage (%), dry weight in grams (g) emergency speed index (GSI) and average germination time (t). The effects found was weak or inconsistent impossible to complete by the presence of stimulatory or inhibitory allelopathic effects of three clones of Arachis studied / Orientador: Edivaldo Domingues Velini / Coorientador: Catalina Romero Lopes / Coorientador: Eduardo Negrisoli / Banca: Elza Alves / Banca: Regildo Márcio Gonçalves da Silva / Mestre

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T13:54:02Z No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T13:54:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciane de Nazare Almeida dos Reis.pdf: 1286764 bytes, checksum: e8ebbda7828d562331b43505ce6da593 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / The peanut (Arachis hypogaea L.) is an important source of protein and oil, and considered one of the most cultivated plants in Brazil and worldwide, that provide products consumed in different ways. It is the fourth world largest oleaginous in seed production, cultivated in over 30 countries, where China leads with 40.8%, followed by India with 14% and Nigeria with 7.5%. Brazil occupies the 17th position, concentrated in the Southeast and South regions, and the State of São Paulo accounts for 91.4% of national production. Among the factors that limit the development of this crop, there are several viruses, which cause reduction on productivity and the value of the product for marketing. Up to now, 31 viral species, classified in the following genera and respective families have been recorded naturally infecting peanut: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Of these genera, Potyvirus has more species. The advent of metagenomics, combined with high-performance technologies (Next Generation Sequencing - NGS) provides the exploration of micro-universe in various areas of science, including the Plant Virology. These techniques, together with bioinformatics, act as excellent tools for detection and characterization of novel viruses, as well as, all the viral genomes of different species or strains present in certain samples. The objective of this work was to study the virome of peanut plants exhibiting typical virus symptoms, obtained from producing areas of 10 counties of the State of São Paulo by NGS. The viral isolates were maintained by successive passages to peanut plants by grafting, under greenhouse conditions at the University of Brasilia (UnB). To perform the NGN, samples were semipurified aiming enrichment of virus particles, followed by total RNA extraction and sequencing carried out by Illumina platform. The metagenomic analysis permitted the detection the complete genome of Peanut mottle virus virus - PeMoV (Potyvirus) and Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Biological (indicator plants), serological (Dot-ELISA) and molecular (RT-PCR) tests were performed in order to characterize some GRSV isolates from peanut, which sequences were identified by metagenomic. Molecular analysis of the gene encoding the N protein, used for species taxonomy within Tospovirus genus, was also carried out with the selected isolates A1, N1 and O1. These three isolates induced symptomatic response in at least one of the indicator species (Datura stramonium L.) used in this work and widely cited in the literature. Positive results for these isolates were also confirmed by serology, indicating the presence of GRSV in peanut producing counties in the State of São Paulo. Phylogenetic analyzes of the segments L, M and S of tospoviruses revealed that the peanut GRSV isolates studied in this work grouped with sequences of GRSV isolate from watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) and a recombinant isolate of GRSV and Tomato chlorotic spot virus - TCSV obtained from tomato (Solanum lycopersicum L.). However, the phylogenetic analysis using the N protein sequence, demonstrated that the present peanut isolate grouped with sequences of GRSV isolates previously studied in Brazil. After phylogenetic analysis for proteins of all GRSV segments, it is believed that the species GRSV and TCSV share the same M segment. The comparison of PeMoV coat protein sequences revealed that the Brazilian peanut isolate reported in this work is more phylogenetically related with the isolate from South Korea, obtained from soybean (Glycine max L.) with 98% identity. This is the first report in Brazil and in the world of the complete genome sequences of PeMoV and GRSV in peanuts, by using NGS. / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma importante fonte de proteína e óleo, sendo considerada uma das plantas mais cultivadas no Brasil e no mundo, com grande diversidade de formas de consumo de seus produtos. É a quarta oleaginosa com maior produção mundial, cultivada em mais de 30 países, em que a China lidera com 40,8%, seguida pela Índia com 14% e Nigéria com 7,5%. O Brasil ocupa a 17ª posição, concentrada nas regiões Sudeste e Sul, sendo o Estado de São Paulo responsável por 91,4% da produção nacional. Dentre os fatores que limitam o desenvolvimento dessa cultura, encontram-se diversos vírus, os quais ocasionam a redução da produtividade e valor do produto para comercialização. Até o momento, já foram registradas, infectando naturalmente o amendoim, 31 espécies virais, classificadas nos seguintes gêneros e respectivas famílias: Begomovirus (Geminiviridae), Bromovirus (Bromoviridae), Carlavirus (Betaflexiviridae), Cucumovirus (Bromoviridae), Irlavirus (Bromoviridae), Luteovirus (Luteoviridae), Pecluvirus (Virgaviridae), Potexvirus (Alphafleviridae), Potyvirus (Potyviridae), Rhabdovirus (Rhabdoviridae), Soymovirus (Caulimoviridae), Tospovirus (Bunyaviridae), Tymovirus (Tymoviridae) e Umbravirus (Tombusviridae). Destes, o gênero Potyvirus é o que agrega maior número de espécies. O advento da metagenômica, aliada às tecnologias de alto desempenho (Next Generation Sequencing - NGS) vêm propiciando a exploração do universo de microrganismos em várias áreas das ciências, inclusive na Virologia Vegetal. Estas técnicas, juntamente com a bioinformática, atuam como excelentes ferramentas para detecção e caracterização de novos vírus e de todos os genomas virais presentes em determinadas amostras, sejam de diferentes espécies ou estirpes. O objetivo desse trabalho foi realizar estudo de viroma de plantas de amendoim exibindo sintomas típicos de viroses, obtidas de áreas produtoras de 10 municípios do Estado de São Paulo por NGS. Os isolados virais foram mantidos por sucessivas passagens para plantas de amendoim por meio de enxertia, em casa de vegetação da Universidade de Brasília (UnB). Para a realização do NGS, as amostras foram semipurificadas objetivando um enriquecimento de partículas virais seguido de extração de RNA total e o sequenciamento, realizado pela Plataforma Illumina Miseq. A análise metagenômica permitiu a detecção do genoma completo do Peanut mottle virus - PeMoV (Potyvirus) e do Groundnut ringspot virus - GRSV (Tospovirus). Análises biológicas (plantas indicadoras), sorológicas (Dot-ELISA) e moleculares (RT-PCR) foram realizadas com intuito de caracterizar alguns isolados de GRSV de amendoim cuja sequência foi identificada por metagenômica. Análises moleculares do gene que codifica a proteína N, amplamente utilizado em trabalhos de taxonomia no gênero Tospovirus, foram também realizadas com os isolados selecionados A1, N1 e O1. Estes três isolados induziram reação sintomatológica em pelo menos uma das espécies indicadoras (Datura stramonium L.) utilizadas nesse trabalho e amplamente citada na literatura. Resultados positivos para estes isolados foram também confirmados por sorologia, evidenciando a presença de GRSV em municípios produtores de amendoim no Estado de São Paulo. Análises filogenéticas para os segmentos L, M e S de tospovírus revelaram que o isolado de GRSV de amendoim estudado neste trabalho agrupou-se com sequências de um isolado de GRSV de melancia (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai) e um isolado recombinante de GRSV e Tomato chlorotic spot virus - TCSV, obtido de tomate (Solanum lycopersicum L.). Entretanto, com a análise filogenética feita com a sequência da proteína N, ficou demonstrado que o presente isolado de amendoim se agrupou com sequências de isolados de GRSV previamente estudado no Brasil. Após análises filogenéticas para as proteínas de todos os segmentos de GRSV, acredita-se que as espécies de GRSV e TCSV compartilham o mesmo segmento M. Comparação das sequências da capa proteica de PeMoV, revelaram que o isolado brasileiro de amendoim relatado neste trabalho está mais relacionado filogeneticamente com um isolado obtido de soja (Glycine max L.), encontrado na Coréia do Sul, apresentando 98% de identidade. Este é o primeiro relato no Brasil e no Mundo das sequências do genoma completo de PeMoV e GRSV em amendoim, por meio do uso de NGS.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-03-14T13:35:25Z No. of bitstreams: 1 Valeska Silva Lucena.pdf: 1217437 bytes, checksum: 33855731b5ae335ab1a9f3ba06e27101 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-14T13:35:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valeska Silva Lucena.pdf: 1217437 bytes, checksum: 33855731b5ae335ab1a9f3ba06e27101 (MD5) Previous issue date: 2016-08-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Climate changes are affecting the productivity of various crops; among these, the peanut (Arachis hypogaea L.) stands out for its great socio-economic value in tropical and sub-tropical regions to be the fifth most grown oilseed in the world. Water stress is one of the abiotic factors that affect productivity. Although the ecophysiological responses of this species are studied, little is known about the molecular events and their metabolic relationships. This study initially examined the physiological, biochemistry and agronomy response, using the method of canonical variables (VCA) and UPGMA in peanut genotypes subjected to water deficit, contributing to identify tolerant genotypes to drought. Physiological changes and activity of enzymes SOD, CAT and APX were measured in the vegetative stage eight peanut genotypes subjected to six days of total water suspension. From which waterings were re-established and analyzed the agronomic damage of stress. It was found that UPGMA method was more contributory to separate genotypes, especially the CNPA 166 AM early lineage, as the most promising for improvement work. Among the trailing lines to BR1xLViPE-06 (B) showed moderate behavior when subjected to water deficit. At the proteomic level, peptides differentially expressed by 1DE and 2DE, involved in several metabolic routes such as photosynthesis, energy metabolism, antioxidative defense and involved in the response to the water deficit present in different cell compartments were identified. Through the sequencing by MS of the peptides by 1DE the peptides ATP synthase, peroxidase, taraxerol synthase and clathrin involved in the response to the damage suffered in the sensitive genotype LViPE-06 and peptidyl-prolyl-cis trans isomerase, beta-1,3-galactosyltransferase , Phosphatase, cytochrome p450 involved in increased tolerance to drought in Senegal-55437. The tolerant genotype Senegal-55437 was chosen for identification of differentially expressed proteins related to drought tolerance through 2DE. A total of 52 differentially expressed proteins were found, of which 32 were identified in treatment with water stress and six were directly involved in drought tolerance routes. Proteins were involved in redox homeostasis, photosynthesis, beta-oxidation and osmoprotection. Seven proteins were found, all involved in several biotic and abiotic processes, including drought tolerance: kinesin, enoyl-CoA hydratase, photosystem I subunit, AP2 / ERF transcription factor, helicase and defensin-like protein. Pioneering studies for these peanut genotypes contributed to the knowledge and evaluation of the adaptive responses that led to metabolic changes in the identification of promising genotypes. At the same time, it opens perspectives for the validation of new markers that can be used in peanut breeding populations aiming at drought tolerance and maintenance of peanut productivity contributing to food stability in the face of climate change and meeting global demands. / As mudanças climáticas vêm afetando a produtividade de diversas culturas; dentre estas, a do amendoim (Arachis hypogaea L.) que se destaca pelo seu grande valor socioeconômico em regiões tropicais e sub-tropicais por ser a quinta oleaginosa mais cultivada no mundo. O estresse hídrico é um dos fatores abióticos que mais afetam sua produtividade. Embora as respostas ecofisiológicas desta espécie sejam estudadas, pouco se sabe sobre os eventos moleculares e suas relações metabólicas. Neste estudo inicialmente examinou-se a resposta fisiológica, bioquímica, agronômica, utilizando o método de variáveis canônicas (VCA) e UPGMA, em genótipos de amendoim submetidos a déficit hídrico, contribuindo na identificação de genótipos tolerantes a seca. A partir de experimentos com condições controladas as mudanças fisiológicas e da atividade das enzimas antioxidativas SOD, CAT e APX foram mensuradas na fase vegetativa de oito genótipos de amendoim submetidos a seis dias de suspensão hídrica total. A partir do qual as regas foram reestabelecidas e analisadas os danos agronômicos do estresse. Verificou-se que o método de UPGMA foi o mais contributivo na separação dos genótipos, destacando-se a linhagem CNPA 166 AM, precoce, como a mais promissora para trabalhos de melhoramento. Dentre as linhagens rasteiras a BR1 x LViPE-06(B) revelou comportamento moderado quando submetida ao déficit hídrico. Em nível proteômico foram identificados peptídeos diferencialmente expressos por 1DE e 2DE, envolvidos em diversas rotas metabólicas como fotossíntese, metabolismo energético, defesa antioxidativas e envolvidos na resposta ao déficit hídrico presentes em diferentes compartimentos celulares. Através do sequenciamento via MS dos peptídeos por 1DE foram identificados os peptídeos ATP sintase, peroxidase, taraxerol sintase e clatrina envolvidos na resposta ao dano sofrido no genótipo sensível LViPE-06 e peptidil-prolil-cis trans isomerase, beta-1,3-galactosiltransferase, fosfatase, citocromo p450 envolvidos no aumento da tolerância a seca em Senegal-55437. O genótipo tolerante Senegal-55437 foi escolhido para identificação das proteínas diferencialmente expressas relacionadas com tolerância a seca através do 2DE. Um total de 52 proteínas diferencialmente expressas foram encontradas, dentre as quais, 32 foram identificadas em tratamento com estresse hídrico e seis foram diretamente envolvidas em rotas de tolerância à seca. As proteínas estavam envolvidas na homeostase redox, na fotossíntese, na beta-oxidação e na osmoproteção. Sete proteínas foram encontradas, todas envolvidas em vários processos bióticos e abióticos, incluindo a tolerância à seca: kinesina, enoyl-CoA hidratase, subunidade do fotossistema I, fator de transcrição AP2 / ERF, helicase e proteína do tipo defensina. Os estudos pioneiros para estes genótipos de amendoim contribuíram para conhecer e avaliar as respostas adaptativas que culminaram em alterações metabólicas na identificação de genótipos promissores. Ao mesmo tempo, abre perspectivas para validação de novos marcadores que poderão ser utilizados em populações de melhoramento do amendoim visando à tolerância a seca e manutenção da produtividade de amendoim contribuindo para a estabilidade alimentar frente às mudanças climáticas e atendendo as demandas mundiais.

Made available in DSpace on 2015-09-25T12:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Alexson Filgueiras Dutra Parte 1.pdf: 2087975 bytes, checksum: 2055934b6c0c736555edb2a1eac2271d (MD5) Previous issue date: 2012-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The castor bean has great importance to the brazilian semiarid region and it can be easy to grow, tolerant to drought and has beneficial features to production associated with other cultures. Thus, the objective of this study was to evaluate agricultural economic aspects intercropping castor and peanut under irrigated conditions in semiarid. The experiment was accomplished at the experimental Sector Fruit and Plant Ecophysiology, IV Campus, State University of Paraiba (UEPB), located in the municipality of Catolé do Rocha, PB. The study period was from June to December 2011, using the cultivation of castor bean BRS Energy and peanuts 'BR-1', in intercropping systems and isolated. The experimental design was in randomized blocks with four replications and eight treatments: T1- Single castor bean spaced in 2,0 m x 0,5 m, T2- Single peanut in spacing of 2,0 m x 0,2 m, T3- Single peanut spaced in 1,0 m x 0,2 m, T4- Consortium castor bean and peanuts sown on the same day, T5- Consortium castor bean and peanuts sown 10 days after the castor bean (M + A10), T6- Consortium castor bean and peanut, sown 15 days after castor bean (M + A15), T7- Consortium castor bean and peanut sown 20 days after the castor bean (M + A20), T8- Consortium castor bean and peanut sown 25 days after the castor bean (M + A25). The best growth rates and leaf area of the castor bean BRS Energy are obtained when the peanuts BR-1 was sown from 20 to 25 days after the castor bean. The production of peanut pods increased when was sown between 10 and 15 days after the castor bean. The later periods of sowing of peanuts will provide better yields of castor bean in intercropping system. In the consortium, the peanut is biologically more efficient and higher yields are obtained when sown 20 days after the castor bean. / A mamoneira é de grande importância à agricultura do semiárido brasileiro por ser de fácil cultivo, tolerante à seca e possuir características benéficas para cultivo associado a outras culturas. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar os aspectos agroeconômicos da consorciação mamona e amendoim sob irrigação em condições de Semiárido. O estudo foi realizado na área experimental do Setor de Fruticultura e Ecofisiologia Vegetal, Campus IV, da Universidade Estadual da Paraíba, localizado no município de Catolé do Rocha, PB. O período de estudo foi de junho a dezembro de 2011, envolvendo as culturas de mamona BRS Energia e amendoim BR-1 , em sistemas consorciados e isolados. O delineamento utilizado foi em blocos ao acaso com quatro repetições e oito tratamentos, sendo: T1 Mamona solteira no espaçamento de 2,0 m x 0,5 m; T2 Amendoim solteiro no espaçamento de 2,0 m x 0,2 m; T3 Amendoim solteiro no espaçamento de 1,0 m x 0,2 m; T4 Consórcio mamona e amendoim semeados no mesmo dia; T5 Consórcio mamona e amendoim semeado 10 dias após (M + A10); T6 Consórcio mamona e amendoim, este semeado 15 dias após a mamona (M + A15); T7 Consórcio mamona e amendoim semeado 20 dias após (M + A20); e T8 Consórcio mamona e amendoim semeado 25 dias após (M + A25). As melhores taxas de crescimento e área foliar da mamoneira BRS Energia são obtidas ao semear o amendoim BR-1 em intervalo de 20 a 25 dias após a mamona. Há maior produção de vagens de amendoim quando a semeadura é feita entre 10 e 15 dias após a da mamona. As épocas mais tardias de semeadura do amendoim permite alcançar melhores rendimentos de grãos de mamona em sistema consorciado. Em consórcio, o amendoim é mais eficiente biologicamente e maiores rendimentos são obtidos quando semeado 20 dias após a mamona.

Orientador: Ana Cláudia Ruggieri / Resumo: A inclusão de leguminosas em sistemas de gramíneas têm sido utilizadas com o objetivo de reduzir ou substituir a adubação nitrogenada, por meio da fixação biológica de nitrogênio atmosférico, via simbiose entre leguminosas-bactérias. Além disso, melhoras no aproveitamento do alimento pelo animal podem ocorrer, diminuindo a quantidade de nitrogênio excretado ao ambiente, pela urina e fezes. A volatilização de amônia nas excretas bovinas provenientes de pastos tropicais é pouco conhecida, e menos ainda sobre pastos tropicais em consórcio com leguminosa. Diante do exposto, esta tese teve como objetivo avaliar o uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov. & W.C. Greg) em consórcio com capim-marandu [Urochloa brizantha (Hochst. Ex A. Rich.) R. D. Webster cv. 'Marandu'] como estratégia de substituição ao uso do adubo nitrogenado ureia em sistemas de produção de forragem. Para isso, três estudos foram realizados. O primeiro estudo avaliou respostas da forragem à diferentes entradas de N e tipos de forragem durante o estabelecimento sob lotação rotacionada. Os tratamentos incluíram o amendoim forrageiro em consórcio com capim-marandu, capim-marandu sem adubação nitrogenada e capim-marandu adubado com ureia (150 kg N ha-1 ano-1). O segundo estudo avaliou como as estratégias de manejo de pastos de capim-marandu afetam as taxas de deposição e decomposição da serapilheira, bem como a composição química da serapilheira dois anos após a semeadura. Os tratamentos foram os mesmos aval... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Legume inclusion in grass systems may reduce or replace the nitrogen fertilization, through the biological fixation of atmospheric nitrogen by the legume-bacterial symbiosis. Furthermore, improvement in animal nutrition can occur, decreasing the amount of nitrogen excreted into the environment via urine and dung. There have been few studies to quantify ammonia emissions from bovine excreta deposited in tropical pastures, and even fewer in warm-season grass-legume mixtures. Therefore, this thesis aimed to evaluate the use of forage peanut (Arachis pintoi Krapov. & W.C. Greg) mixed with palisadegrass [Urochloa brizantha (Hochst. ex A. Rich.) R. D. Webster cv. ‘Marandu’] as a strategy to replace nitrogen fertilizer in forage production systems. Three studies were performed. The first study evaluated herbage responses to N inputs and forage types during establishment under rotational stocking. Treatments included palisadegrass-forage peanut mixture, unfertilized palisadegrass, and palisadegrass fertilized with urea (150 kg N ha-1 yr-1). The second study evaluated how sward management strategies of palisadegrass pastures affected the litter deposition and decomposition rates, as well as litter chemical composition two years after seeding. The treatments were the same as those evaluated in the first study. In the third study, we conducted three field trials (wet, transition, and dry season) to quantify the ammonia (NH3) emissions, simulating application of heifer urine, dung, and u... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Herbicide resistance development among weed populations in cotton and peanut is becoming increasingly difficult to manage. If resistant populations continue to persist, weed control practices for producers will become less efficient and more costly. The objective of this research was to evaluate alternative weed control techniques designed to mitigate herbicide resistance development for their agronomic and economic impact on weed management systems. Studies were conducted in 2019, 2020, and 2021 at multiple locations in Mississippi and Arkansas investigating multiple techniques including the addition of soil surfactants in herbicide tank mixtures, increasing SOAs utilized in peanut herbicide programs, applying non-labeled herbicides to cotton with post-directed spray placement, and applying complete residual herbicide programs in cotton. Our results suggests that some novel strategies incorporated into existing weed management programs, can provide sufficient control of troublesome weed species and conserve crop yield and profit returns. For example, the use of post-directed application placement allowed for non-labeled herbicides to be applied to cotton without detrimental effects, thus increasing potential options for POST weed control within that crop. Additionally, weed control, seed cotton yield, and net returns were not affected when only residual herbicides were applied in season-long weed control programs as opposed to the standard of mixed, foliar and residual programs. This indicates that high selection pressure associated with foliar chemistries which leads to resistance development, can be alleviated through the adoption of alternative strategies.

The southern corn rootworm (Diabrotica undecimpunctata howardi Barber) is the primary soil insect pest to peanuts (A rachis hypogaea L.) in Virginia and North Carolina. The newer cultivars, which are planted on the majority of the acreage, have not been extensively screened for rootworm resistance. The objective of this study was to evaluate 5 new Virginia-type cultivars (NC-V 11, VA-C 92R, VA 93B, NC 10C, and AgraTech VC1) and 18 breeding lines (N90013E, VA 861101, VA 9211920, VA 9211289, VA 891438, VA 901072, VA 9010343, VA 8911115, VA 9109213, VA 9109235, VA 9109237, VA 9111309, N93007L, N92066L, N92074L, PI 121067, GP-NC 343, N92064L and N93003L) for resistance to southern corn rootworm in the laboratory and in the field. NC 7 and NC 9 were used as susceptible checks. NC 6 was used as a known resistant check. Rootworm mortality and feeding were measured from bioassays in the lab. Pod damage data were obtained from field plots. NC 6 caused some significant differences with more rootworm mortality at both the pupal and adult stages than NC 7, NC 9, NC 10C, NC-V11, N90013E, PI 121067, AgraTech VC-1, VA 93B, VA 861101, and VA 9211290 when feeding on peanut seedlings. In addition, NC 6 also caused significantly higher mortality at pupa and adult stages than NC 7, AgraTech VC-1, VA 861101, and VA 93B when larvae fed on the peg and immature pod tissue from field plantings. NC 6 also had less total pod damage than NC 7 in natural infestations of southern corn rootworm. Results from this study indicate that NC 61s are still the only cultivar that demonstrates resistance to rootworm. / Master of Science