Foi realizado um estudo epidemiológico da epidemia de encefalite por arbovírus na região do Vale do Ribeira, São Paulo, Brasil, durante o período de março de 1975 a julho de 1978. A epidemia, iniciada em 1975, atingiu o pico em 1976. A partir de 1978 a moléstia se manteve em níveis baixos sob presumível endemicidade. A letalidade nos anos epidêmicos de 1976 e 1977 variou em sentido inverso ao da morbidade, que apresentou picos nas épocas de maior temperatura e pluviosidade. Ao que parece, a epidemia teria se deslocado em onda em direção leste-oeste e leste-sudoeste tendo atingido a região litorânea vizinha. A cadeia montanhosa situada ao norte e noroeste teria atuado como barreira à propagação da moléstia. Considerou-se a hipótese que o agente etiológico, arbovírus Rocio, só recentemente deva ter começado a infectar a população humana, tendo sido veiculado ao homem a partir de reservatórios silvestres, aves e pequenos mamíferos, por culicídeos silvestres. Discutiram-se também prováveis formas de transmissão domiciliar da arbovirose ocorrida em número bem menor de casos. Verificou-se que os grupos populacionais que apresentaram as formas mais graves da doença foram os das idades extremas e os de piores condições de vida. Considerou-se que a perspectiva epidemiológica desta arbovirose é que ela persista na região, uma vez que existem condições ótimas para o desenvolvimento dO agente etiológico, de reservatórios e de vetores biológicos, além do contínuo afluxo de população suscetível, constituída por migrantes ou por turistas. / An epidemiological study of the encephalitis epidemic by arbovirus was carried out in Ribeira River Valley, State of São Paulo, Brazil, from March 1975 to July 1978. The epidemic began in 1975 and reached its peak in 1976. From 1978 onwards the disease maintained low levels in a presurnable endemicity. The lethality of the disease in the epidemic years of 1976 and 1977 varied in the opposite direction of its morbility, which presented peaks when the temperature and pluvial levels were higher. It seems that the epidemic swept from east to west and from east to southwest in a wave towards the neighbouring coastland region. The mountain chain situated towards the north and northwest acted as a barrier to the spreading of the disease. The hypothesis that the etiological agent, arbovirus Rocio, must have infected the human population recently, having been veiculated to man from forest reservoirs, birds and small mammals, by wild mosquitoes, was considered. Probable forms of domiciliar transmission of the arbovirosis which ocurred in a significantly smaller number of cases were also discussed. It was verified that the population groups which presented the worst forms of the disease were those at extreme ages and those under worst living conditions. It was considered that the epidemiological perspective of the arbovirosis is that it ought to persist in the area, as it presents excellent conditions for the development of the etiological agent, reservoirs and biological vectors, besides continuously receiving susceptible people, migrants or tourists.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-12T13:44:06Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Joel da Silva Cordeiro.pdf: 3200673 bytes, checksum: 312bd542cfc04a8d008964edbf17a151 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-12T13:44:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Joel da Silva Cordeiro.pdf: 3200673 bytes, checksum: 312bd542cfc04a8d008964edbf17a151 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2010-09-21 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Dengue virus (DENV) are the etiologic agent of the most important arbovirosis from Tropical and Subtropical region. They are classified as flaviviruses following their genetic and antigenic properties into four groups: DENV1, DENV2, DENV3 and DENV4. In the last decades, dengue fever has increased its virulence and several factors had been associated to this increasing. Secondary infection and viral factors are the main one implicated to increase of severe form of dengue fever. In this study, were analysed 80 samples of serum from patients with suspect of dengue infection from Boa Vista. We aim to identify the DENV serotypes and genotypes circulating in this city. Eighty samples were inoculated in C6/36 cells. The RNAs were extracted and viral identity was archieved using by Reverse Transcription – Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) method developed by Lanciotti et al. (1992). After viral type identification, cDNA was used to PCR with specific primers to gene E. The sequencing was performed on MEGABACE1000 platform. Maximum Likelihood dendrograms were constructed by PhyML 3.0. Branch confidences were calculated using approximated Likelihood Ratio Test (aLRT). Thirty four samples were isolated and identified: 23 DENV1 strains and 11 DENV2 strains, three of them were coinfection. After edition of sequences, 15 fragments with 962nt large of DENV1 and three fragments with 825nt large of DENV2 were used to analysis. DENV1 strains isolated in this study grouped with strains of genotype V, together with strains from Venezuela and Brazil, previously described. DENV2 strains were classified as american/asian genotype, together to Cuba and Taiwan strains. Data obtained shown strong relantionship between Roraima strains and Venezuelan and Caribbean strains. The results help future analysis about DENV evolution and gene flow in Brasil and its relationship with DENV isolated in other regions of American Continent. / Vírus Dengue (DENV) são agentes etiológicos da mais importante arbovirose das regiões tropical e subtropical do planeta. São flavivírus classificados, segundo suas propriedades genéticas e antigênicas, em quatro tipos virais: DENV1, DENV2, DENV3 e DENV4. Nas últimas décadas, o dengue tem aumentado sua virulência e muitos fatores têm sido associados a esse aumento. Infecção secundária e fatores virais são os principais apontados para aumento da ocorrência das formas graves do Dengue. Neste estudo foram analisadas 80 amostras de soros de pacientes com suspeita de infecção pelos vírus dengue, provenientes da cidade de Boa Vista, com intuito de identificar os sorotipos e genótipos circulantes. Oitenta amostras foram inoculadas em células C6/36 de Aedes albopictus. O RNA foi extraído e a identificação do tipo viral foi realizada por transcrição reversa seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) desenvolvida por Lanciotti et al. (1992). Após identificar o tipo viral, o cDNA viral foi submetido à PCR com primers específicos para o gene E. O seqüenciamento das amostras foi realizado na plataforma MEGABACE1000. A reconstrução filogenética foi realizada no programa PhyML 3.0 utilizando o método de Máxima Verossimilhança. A confiabilidade dos ramos foi calculada pelo Teste de Razão de Verossimilhança (aLRT).Do total, 34 amostras foram isoladas e identificadas. Foram 23 cepas de DENV1 e 11 DENV2, sendo 03 casos de co-infecção. Após o seqüenciamento e edição das seqüências, foram obtidos 15 fragmentos de 962nt para DENV1 e 03 fragmentos de 825nt para DENV2. As cepas de DENV1 isoladas neste trabalho formaram clado com o genótipo V, junto com cepas da Venezuela, Brasil, previamente descritas. As cepas de DENV2 foram classificadas como genótipo “Americano/Asiático”, formando um clado com as cepas isoladas de Cuba e de Taiwan. Os dados demonstram uma forte relação entre as cepas isoladas em Roraima e cepas isoladas no Caribe e Venezuela. Os resultados obtidos abrem caminho para novas análises da evolução e fluxo gênico do DENV no Brasil e suas relações com DENV isolados em outras regiões do Continente Americano.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-04-27T11:50:57Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1098371 bytes, checksum: c10e5cfb5ddc01352ee2d610856b7265 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T11:50:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1098371 bytes, checksum: c10e5cfb5ddc01352ee2d610856b7265 (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os flavivirus West Nile (WNV), Dengue (DENV) e Zika (ZIKV) são causadores de doenças de importância epidemiológica global. Cerca de 50-100 milhões de novas infecções por DENV são estimadas para ocorrer anualmente em mais de 100 países endêmicos, com uma maior propagação documentada para áreas anteriormente não afetadas. WNV é atualmente a causa mais comum de doença neurológica causada por um arbovírus no mundo. ZIKV está associado com um aumento significativo do número de crianças nascidas com microcefalia e distúrbios neurológicos, como a síndrome de Guillain-Barré. Apesar de alguns flavivirus já apresentarem vacinas disponíveis, DENV, WNV e ZIKV ainda não apresentam vacinação eficiente e global. Diante dos desafios para o desenvolvimento de uma vacina, pesquisas para terapias antivirais têm se tornado relevantes, principalmente para casos graves das três doenças. As proteínas virais NS3 e E são alvos moleculares particularmente interessante para compostos antiflavivirais devido aos seus papéis centrais no ciclo de vida viral. Neste trabalho, derivados da indan-1,3-diona foram testados contra esses alvos. Foi realizado ensaio enzimático com a protease de WNV; ensaios virucida, pré-tratamento e pós-tratamento em células Vero com os vírus DENV e ZIKV; além de estudo de docking para a proteína E do DENV e ZIKV e protease de WNV. A indan-1,3-diona (12) se destacou apresentando alta taxa de inibição viral e baixa toxicidade contra WNV, DENV e ZIKV, atuando como inibidor alostérico da protease de WNV e por neutralização direta do DENV e ZIKV. Sendo uma molécula obtida por um novo e mais eficiente processo sintético, é promissora e sua avaliação e aprimoramento devem ser continuadas na cadeia de etapas de validação para uma nova droga antiviral. / The flaviviruses West Nile (WNV), Dengue (DENV) and Zika (ZIKV) cause diseases of global epidemiological importance. About 50-100 million of new DENV infections are estimated for a yearly total of 100 endemic countries, with a further documented spread to previously unaffected areas. WNV is currently the most common cause of neurological disease caused by an arbovirus in the world. ZIKV is associated with a significant increase in the number of children born with microcephaly and neurological disorders, such as Guillain-Barré syndrome. Although some flaviviruses already have available vaccines, DENV, WNV and ZIKV still do not have efficient and global vaccination. Facing the challenges for the development of a vaccine, the trials for antiviral therapies has made relevant, especially for the severe cases of the three diseases. The NS3 and E viral proteins are interesting molecular target for antiflaviviral compounds due to their central roles on the viral life cycle. In this work, indan-1,3-dione derivatives were tested against these targets. An enzymatic assay was performed with a WNV protease; virucidal, pre-treatment and post-treatment assays in Vero cells with the DENV and ZIKV viruses was performed; in addition to molecular docking for an E protein of DENV and ZIKV and WNV protease. Indan-1,3-dione (12) has been shown to have high viral inhibition rate and low toxicity against WNV, DENV and ZIKV, acting as an allosteric inhibitor of WNV protease and by direct neutralization of DENV and ZIKV. Being a molecule obtained by a new and more efficient synthetic process, it is promising and its evaluation and improvement should be continued in the chain of validation steps for a new antiviral drug.

Foi realizado um estudo epidemiológico da epidemia de encefalite por arbovírus na região do Vale do Ribeira, São Paulo, Brasil, durante o período de março de 1975 a julho de 1978. A epidemia, iniciada em 1975, atingiu o pico em 1976. A partir de 1978 a moléstia se manteve em níveis baixos sob presumível endemicidade. A letalidade nos anos epidêmicos de 1976 e 1977 variou em sentido inverso ao da morbidade, que apresentou picos nas épocas de maior temperatura e pluviosidade. Ao que parece, a epidemia teria se deslocado em onda em direção leste-oeste e leste-sudoeste tendo atingido a região litorânea vizinha. A cadeia montanhosa situada ao norte e noroeste teria atuado como barreira à propagação da moléstia. Considerou-se a hipótese que o agente etiológico, arbovírus Rocio, só recentemente deva ter começado a infectar a população humana, tendo sido veiculado ao homem a partir de reservatórios silvestres, aves e pequenos mamíferos, por culicídeos silvestres. Discutiram-se também prováveis formas de transmissão domiciliar da arbovirose ocorrida em número bem menor de casos. Verificou-se que os grupos populacionais que apresentaram as formas mais graves da doença foram os das idades extremas e os de piores condições de vida. Considerou-se que a perspectiva epidemiológica desta arbovirose é que ela persista na região, uma vez que existem condições ótimas para o desenvolvimento dO agente etiológico, de reservatórios e de vetores biológicos, além do contínuo afluxo de população suscetível, constituída por migrantes ou por turistas. / An epidemiological study of the encephalitis epidemic by arbovirus was carried out in Ribeira River Valley, State of São Paulo, Brazil, from March 1975 to July 1978. The epidemic began in 1975 and reached its peak in 1976. From 1978 onwards the disease maintained low levels in a presurnable endemicity. The lethality of the disease in the epidemic years of 1976 and 1977 varied in the opposite direction of its morbility, which presented peaks when the temperature and pluvial levels were higher. It seems that the epidemic swept from east to west and from east to southwest in a wave towards the neighbouring coastland region. The mountain chain situated towards the north and northwest acted as a barrier to the spreading of the disease. The hypothesis that the etiological agent, arbovirus Rocio, must have infected the human population recently, having been veiculated to man from forest reservoirs, birds and small mammals, by wild mosquitoes, was considered. Probable forms of domiciliar transmission of the arbovirosis which ocurred in a significantly smaller number of cases were also discussed. It was verified that the population groups which presented the worst forms of the disease were those at extreme ages and those under worst living conditions. It was considered that the epidemiological perspective of the arbovirosis is that it ought to persist in the area, as it presents excellent conditions for the development of the etiological agent, reservoirs and biological vectors, besides continuously receiving susceptible people, migrants or tourists.

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-27T19:37:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Katianne B.A.Sousa.pdf: 1701891 bytes, checksum: 5aeafe40b9a9abf7a64c229073d28651 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-27T19:47:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Katianne B.A.Sousa.pdf: 1701891 bytes, checksum: 5aeafe40b9a9abf7a64c229073d28651 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-07-27T19:48:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Katianne B.A.Sousa.pdf: 1701891 bytes, checksum: 5aeafe40b9a9abf7a64c229073d28651 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-27T19:48:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Katianne B.A.Sousa.pdf: 1701891 bytes, checksum: 5aeafe40b9a9abf7a64c229073d28651 (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The arbovirus are virus group with a complex life cycle, once vertebrate hosts as well as arthropod vectors are involved. The Phlebovirus are arboviruses of the Bunyaviridae family transmitted mainly by Lutzomyia insects in the new world and Phlebotomus in the old world. These insects are important vectors of tropical diseases, such as leishamaniasis, causing outbreaks of febrile syndromes worldwide. A large fauna of phlebotomus is observed in the Amazon region and a few studies aimed to detect virus at those vectors. The present study aimed to the detection of arboviruses in phlebotomus collected in the Reserva Florestal Adolpho Ducke, Manaus and at the Ramal Nova Esperança, Manacapuru, Amazonas. The phlebotomus were collected using adapted CDC light traps, including parallel collections with manual aspirators. Speciemens were grouped in pools by sex and trap, and subsequently macerated. The macerated samples were inoculated into VERO cells, following by indirect immunofluorescence. The positives samples by flow cytometry were submitted to molecular assays, in order to amplify segments S and L of the Bunyavirus. Among the collected pools, 17 out of 243 were positive by flow cytometry, those samples presented displacement of positive cells within a range 1.19 – 71.6%. Also, molecular methods were applied for detection of Bunyavirus, following capillary and next generation sequencing. However, no virus was identified with this techniques. The samples are stored for futures studies, in order elucidate questions related to the presence of medical important arbovirus infecting phlebotomus at the Brazilian Western Amazon. / Arbovírus são um grupo de vírus que apresenta um ciclo biológico bastante complexo, que envolve hospedeiros vertebrados suscetíveis e um ou mais vetor artrópode. Os Phlebovirus são arbovírus da família Bunyaviridae transmitidos por insetos do gênero Lutzomyia no novo mundo e Phlebotomus no velho mundo. Estes insetos são importantes vetores de doenças tropicais, como a leishmaniose e vem causando surtos de síndromes febris pelo mundo. Mesmo com uma vasta fauna de flebotomíneos na região Amazônica poucos estudos tiveram como objetivo principal detectar vírus nestes vetores. Em função do descrito anteriormente o presente trabalho teve como objetivo a detecção de Bunyavirus em flebotomíneos coletados na Reserva Florestal Adolpho Ducke, Manaus e no Ramal Nova Esperança, Manacapuru, Amazonas. Os flebotomíneos foram coletados em armadilhas de luz do tipo CDC adaptadas, além de coletas paralelas com aspiradores manuais. Os espécimes foram agrupados em pools, por sexo e armadilha, sendo posteriormente macerados. O material macerado foi inoculado em culturas de células VERO, seguido por técnicas de imunofluorescência indireta para família Bunyaviridae. As amostras positivas pela citometria de fluxo foram submetidas a ensaios moleculares, na tentativa de amplificação dos segmentos S e L de Bunyavirus. Dos 243 pools coletados foi identificada a presença de vírus da família Bunyaviridae em 17 pools através dos resultados obtidos pela citometria de fluxo, com base no deslocamento de células positivas que variaram entre 1,19 - 71,6%. Nesse projeto foi utilizado pela primeira vez um protocolo para Citometria de fluxo para Bunyavirus. Foram aplicadas também metodologias moleculares para detecção de Bunyavirus, seguidos de sequenciamento capilar e de Nova Geração. Entretanto, não foi possível a identificação viral por técnicas moleculares. As amostras estão armazenadas para experimentos futuros, na tentativa de elucidar questões como: a circulação de arbovírus de importância médica em flebotomíneos na Amazônia Ocidental Brasileira.

A análise espaço-temporal da transmissão é um recurso fundamental para abordagem de doenças que acometem a população. Este estudo teve por objetivo descrever e analisar espacialmente e temporalmente a transmissão de dengue no município de São Sebastião - SP, entre os anos de 2001 a 2015, buscando elucidar aspectos da transmissão de dengue no município. Dados de casos de dengue e variáveis de características da população foram obtidos no Centro de Vigilância Epidemiológica \"Prof. Alexandre Vranjac\" e na Secretaria da Saúde de São Sebastião do banco Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN) e dados da infestação do vetor Aedes aegypti, nos arquivos dos sistemas de informação SISAEDES e SISAWEB, bem como de projetos desenvolvidos anteriormente pelo Laboratório de Biologia e Ecologia de Culicídeos da SUCEN. Foi realizada a análise descritiva dos dados de incidência e do índice de infestação predial (IP). Observou-se o registro da positividade do vetor em 1998, na região central, com crescente expansão para os bairros próximos. A ocorrência dos casos de dengue mostrou um possível maior registro no sexo feminino. Anos com baixos índices anuais pluviométricos demonstraram provável aumento no número de casos de dengue e de imóveis positivos para o vetor. Anos com temperaturas médias anuais entre 20 a 31ºC mostraram uma possível elevação no número de casos e de infestação de Aedes aegypti. / The spatial-temporal analysis of transmission is a base resource on approaching of population diseases. The objective of this study is to describe and analyze the spatial-temporal transmission of dengue in the municipality of São Sebastião - SP, between 2001 and 2015 aiming to elucidate aspects of dengue transmission. The data of cases of Dengue and variables characteristic of population were obtained from the center of epidemiological vigilance \"Prof. Alexandre Vranjac\", the notification database (SINAN) of health secretary from São Sebastião, the database of vector Aedes aegypti infestation in information system SISAEDES and SISAWEB and previous projects developed by laboratory of culicid biology and ecology from Superintendência de Controle de Endemias (SUCEN). It was observed the vector positivity in 1998 on central region with a growing expansion to near neighborhoods. The occurrence of dengue cases has shown a possible higher level on female gender. The years with low annual precipitation levels had a possible increasing on number of dengue cases and houses with vector. The years with annual temperature ranging from 20 to 31°C have shown a possible increasing on number of cases and infestation of Aedes aegypti.

No Brasil os vírus Zika e Chikungunya vem causando enormes epidemias com grande morbidade e significante mortalidade, tornou-se importante desenvolver métodos diagnósticos eficazes para discrimar suas infecções. No presente trabalho, desenvolvemos ensaios imunoenzimáticos utilizando células de cultura, aedes albopictus pseudo C6/36, infectadas e utilizadas como antígeno viral (EIA-ICC), para diagnósticos de infecções provocadas pelos vírus Zika (ZIKV) e Chikungunya (CHIKV). As placas contendo células infectadas tiveram suas antigenicidades verificadas nos ensaios utilizando anticorpos policlonais oriundo de camundongos hiperimunizados com ZIKV, CHIKV e outros flavivirus e alphavirus. O EIAICC ZIKV detectou anticorpos murinos de forma homotípica, porém reações cruzadas foram encontradas com Dengue 1 (DENV 1), Saint Louis Vírus (SLEV), Rocio Vírus (ROCV) e West Nilo Vírus (WNV). O EIA-ICC CHIKV também detectou anticorpos murinos de forma homotípica e reações cruzadas foram observadas com os Mayaro Vírus (MAYV) e Mucambo Vírus (MUCV). Resultados comparativos de 39 amostras foram realizados no EIA-ICC ZIKV, que demonstrou sensibilidade de 87,5% (IgM) e 100% (IgG) e especificidade de 95,65% (IgM) e 83,33% (IgG). O EIA-ICC CHIKV, teste comparativos entre 59 amostras, demostrou sensibilidade de 64,7% (IgM) e 92,3% (IgG) e especificidade de 40% (IgM) e 96,96% (IgG). Os EIA-ICCs também foram usados para diagnósticos das arboviroses ZIKV e CHIKV em 174 soros de pacientes com doença febril aguda, no EIA-ICC ZIKV foi encontrado 8,13% de IgM, 20,34% IgG e 6,97% de IgG e IgM na mesmo soro, no EIA-ICC CHIKV encontramos IgG em 8,13% dos soros e IgG em 16,86%, soros com anticorpos IgG e IgM nos mesmos foram vistos em 1,74%. Também encontramos em 11 soros anticorpos tanto para ZIKV quanto para CHIKV. Portanto o EIA-ICC ZIKV mostrou para detecção de IgM e IgG, adequadamente sensível e específico para ser validado em estudos com maiores números de amostras e ser aplicados no diagnóstico. O EIA-ICC CHIKV mostrou para detecção de IgG, adequadamente sensível e específico para ser validado em estudos com maiores números de amostras e ser aplicados no diagnóstico. Porém não é indicado para a detecção de IgM / In Brazil, Zika and Chikungunya viruses have been causing huge epidemics with great morbidity and significant mortality. It\'s important to develop effective diagnostic methods to discriminate against their infections. In the present study, we developed immunoenzymatic assays using cultured cells from aedes albopictus C6 / 36 infected and used as viral antigen (EIA-ICC), for diagnosis of infections caused by the Zika (ZIKV) and Chikungunya (CHIKV) viruses. Plates containing infected cells had their antigenicities verified in the assays using polyclonal antibodies from mice hyperimmunized with ZIKV, CHIKV and other flaviviruses and alphaviruses. The EIA-ICC ZIKV detected murine antibodies in a homotypic manner, but cross-reactions were found with Dengue 1 virus (DENV 1), Saint Louis virus (SLEV), Rocio virus (ROCV) and West Nile virus (WNV). The EIA-ICC CHIKV also detected murine antibodies in a homotypic manner and cross-reactions were observed with the Mayaro virus (MAYV) and Mucambo virus (MUCV). Comparative results of 39 samples were performed in the EIA-ICC ZIKV, which showed sensitivity of 87.5% (IgM) and 100% (IgG) and specificity of 95.65% (IgM) and 83.33% (IgG). The EIA-ICC CHIKV, a comparative test among 59 samples, showed a sensitivity of 64.7% (IgM) and 92.3% (IgG) and a specificity of 40% (IgM) and 96.96% (IgG). The EIA-ICCs were also used for diagnosis of ZIKV and CHIKV arboviruses in 174 sera from patients with acute febrile illness. In the EIA-ICC, ZIKV found 8.13% IgM, 20.34% IgG and 6.97% IgG and IgM in the same serum, in the EIA-ICC CHIKV we found IgG in 8.13% of the sera and IgG in 16.86%, sera with IgG and IgM antibodies in them were seen in 1.74%. We also found 11 samples positive for both ZIKV and CHIKV. Therefore, the EIA-ICC ZIKV showed for detection of IgM and IgG, adequately sensitive and specific to be validated in studies with larger numbers of samples and to be applied in the diagnosis. The EIA-ICC CHIKV showed for IgG detection, adequately sensitive and specific to be validated in studies with larger numbers of samples and to be applied in the diagnosis. However, it is not indicated for the detection of IgM

As arboviroses acometem centenas de milhares de pessoas anualmente no Brasil, levando, muitas delas, à morte. O Brasil apresenta uma das maiores biodiversidades em arbovírus do planeta, tendo mais de uma centena de espécies já isoladas e documentadas. Estudos prévios revelaram que espécies de arbovírus estão circulando no país de modo velado em áreas urbanas, rurais e florestais. O conhecimento de aspectos da epidemiologia e biologia viral como ciclo silvestre mantenedor, gama de hospedeiros, sazonalidade, disseminação, área de ocorrência, história evolutiva e diversidade genética, são fundamentais para a definição de estratégias de prevenção e controle pelos órgãos públicos de saúde e vigilância epidemiológica. Nesse sentido, tivemos como objetivo pesquisar a ocorrência de flavivírus em pequenos roedores silvestres. Para tal finalidade, capturamos esses animais em fragmentos de Cerrado e propriedades rurais localizadas nas cidades de Ribeirão Preto, Batatais, Cajuru e Luiz Antônio, no nordeste do estado de São Paulo. Amostras de sangue foram coletadas e submetidas ao ensaio sorológico ELISA indireto para detectar anticorpos IgG contra os flavivírus Rocio, Oeste do Nilo e da Encefalite de Saint Louis. Nosso método utilizou peptídeos recombinantes correspondentes ao domínio III da proteína de envelope de cada um desses 3 vírus. Adicionalmente, realizamos RT-PCR com primers gênero-específicos e espécie-específicos para a detecção de genoma de flavivírus. Altas soroprevalências foram encontradas nas diversas espécies de roedores capturadas, para um ou mais dos vírus testados. Esse achado sustenta a hipótese de que esses vírus são capazes de infectar também pequenos mamíferos selvagens, o que, por sua vez, pode indicar a existência de novos atores em um ciclo silvestre mantenedor. / Arboviruses affect hundreds of thousands of people annually in Brazil, leading, many of them, to death. Brazil has one of the largest arbovirus biodiversities in the world, with more than 100 species already isolated and documented. Previous studies have revealed that arbovirus species are circulating in the country veiled in urban, rural and forest areas. The knowledge of aspects of epidemiology and viral biology such as silvatic cycle, range of hosts, seasonality, dissemination, area of occurrence, evolutionary history and genetic diversity, are fundamental for the definition of strategies of prevention and control by public health and epidemiological surveillance agencies. In this sense, we aimed to investigate the occurrence of flavivirus in small wild rodents. For this purpose, we captured these animals in fragments of Cerrado and rural properties located in the cities of Ribeirão Preto, Batatais, Cajuru and Luiz Antônio, in the northeast of the state of São Paulo. Blood samples were collected and subjected to the ELISA-indirect serological assay to detect IgG antibodies against flaviviruses Rocio, West Nile, and Saint Louis Encephalitis. Our method used recombinant peptides corresponding to domain III of the envelope protein of each of these 3 viruses. In addition, we performed RT-PCR with genus-specific and speciesspecific primers for the detection of the flavivirus genome. High seroprevalences were found in several species of rodents captured, for one or more of the viruses tested. This finding supports the hypothesis that these viruses are also capable of infecting small wild mammals, which, in turn, may indicate the existence of new actors in a sustaining silvatic cycle.

Introdução: As arboviroses causam graves problemas de saúde pública no Brasil e em muitos dos países da América Latina. A epidemiologia molecular é um instrumento valioso na compreensão da dispersão, persistência e diversidade desses patógenos virais. Objetivos: Neste projeto, buscamos investigar a dinâmica epidemiológica molecular dos arbovíroses (com especial enfoque aos vírus da dengue-DENV, chikungunya - CHIKV e zika -ZIKV) que circularam no estado do Amapá entre os anos de 2013 e 2016. Métodos: 824 amostras de plasma humano foram coletadas pelos laboratórios de Saúde Publica (LACEN) no estado do Amapá entre os anos de 2013 e 2016; essas amostras foram obtidas de pacientes que apresentavam sintomas consistentes com uma das arboviroses. O material genético viral presente nestas amostras foi extraído e os ensaios de qPCR foram realizados. Todas as amostras foram submetidas inicialmente a um ensaio triplex (ZIKV/DENV/CHIKV), as amostras negativas foram posteriormente submetidas a um ensaio de pan-flavivírus. As amostras positivas para um dos ensaios foram submetidas a NGS (sequenciamento de nova geração). Resultados: Das 824 amostras testadas, 36 foram positivas para DENV, ZIKV ou CHIKV; desses 36 positivos, 24 foram para DENV, 11 para CHIKV e 1 para ZIKV. Foram obtidos 27 genomas completos: 16 de DENV (15 DENV1, genótipo V e 1 DENV2, genótipo III) e 11 de CHIKV (genótipo asiático / caribenho). Das 788 amostras testadas com o ensaio de pan-flavivírus, 22 amostras foram positivas; porem apenas uma amostra produziu genoma completo pela técnica de NGS. Este genoma foi relacionado com um flavivírus com semelhante em 76,81% com o vírus Long Pine Key - LPKV, que anteriormente só tinha sido descrito em mosquitos. Árvores de Maximum likelihood e Maximum clade credibility foram construídas utilizando os genomas do DENV1 obtidos neste estudo. Essas árvores exibiam duas linhagens distintas de DENV1, genótipo V presentes na América Latina. Uma destas linhagens tem um padrão de circulação que inclui países do Caribe, América Central e América do Sul (incluindo Brasil); a outra linhagem distinta circula dentro das fronteiras do Brasil. As árvores também indicam que o DENV1 presente no estado do Amapá é da linhagem que tem o padrão de circulação que inclui o Caribe e as Américas Central e do Sul e que essa linhagem surgiu no Amapá entre 2005 e 2010. Conclusão: Este estudo fornece dados importantes sobre as arboviroses no Amapá e os dados genômicos mais recentes disponíveis para a região, bem como o contexto brasileiro e latino-americano para esses dados. Dados dessa natureza são inestimáveis nos esforços das autoridades de saúde pública para a prevenção e controle de epidemias por estes agentes. / Introduction: Arboviral febrile illnesses plague the nation of Brazil and many of its surrounding Latin America countries. Molecular epidemiology is a growing and increasingly invaluable tool in the field of public health for understanding the dispersal, persistence, and diversity of these impactful viral pathogens. Objectives: In this project, the identities and molecular epidemiological dynamics of arboviruses circulating in the Brazilian state of Amapá between the years 2013 and 2016, with special focus on DENV, CHIKV and ZIKV, were investigated and given Brazilian and Latin American geographical and temporal context via molecular epidemiological analyses. Methods: 824 human blood plasma samples were collected from LACEN laboratories in the state of Amapá between the years 2013 and 2016; these samples originated from patients showing symptoms consistent with any of the common arboviral febrile illnesses. The viral genetic material present in these samples was extracted and qPCR diagnostics assays were performed; all samples first underwent a triplex assay (ZIKV/DENV/CHIKV - ZDC), then the samples yielding negative results for the triplex assay underwent a pan-flavivirus assay. The samples yielding positive results for either assay were submitted for NGS and all whole viral genomes subsequently obtained underwent phylogenetic molecular epidemiological analyses. Results: Of the 824 samples tested, 36 tested positive for the ZDC assay; of those positives, 24 tested positive for DENV, 11 for CHIKV, and 1 for ZIKV. 27 full genomes were obtained from these ZDC positives: 16 of DENV (15 DENV1, genotype V and 1 DENV2, genotype III) and 11 of CHIKV (Asian and Caribbean genotype). Of the 788 samples tested with the pan-flavivirus assay, 22 samples yielded positive results, from only one of which a genome was obtainable. This genome was found to be closely related to a flavivirus previously only found in mosquitoes (76.8% identity with Long Pine Key Virus - LPKV). Maximum likelihood and maximum clade credibility trees were constructed using the DENV1 genomes obtained from this study. These trees displayed two distinct lineages of DENV1, genotype V present in Latin America, one of which has a circulation pattern spanning widely across the Caribbean and Central and South America (including Brazil), while the other circulates within Brazilian borders. The trees also indicate that the DENV1 present in the state of Amapá is of the lineage having the wider circulation pattern and that this lineage emerged in Amapá between 2005 and 2010. Conclusion: This study provides important data concerning the range of the arboviral landscape in Amapá and the most recent genomic data available for the region as well as Brazilian and Latin American context to that data. Data of this nature are invaluable in the efforts of public health officials for the prevention and control of epidemics of these impactful arboviral pathogens.

O vírus Oropouche pertence à família Bunyaviridae, gênero Orthobunyavirus, sorogrupo Simbu, e é segunda causa mais freqüente de arbovirose febril no Brasil. Estima-se que mais de meio milhão de casos de febre do Oropouche tenham ocorrido no Brasil nos últimos 30 anos, havendo também ocorrências no Panamá, Peru, Suriname e Trinidad. Epidemias de febre do Oropouche têm sido registradas quase que exclusivamente na Amazônia. Porém, com o aquecimento global do planeta, desmatamentos e conseqüente redistribuição de insetos vetores e animais reservatórios, há risco de disseminação de vírus Oropouche para outras regiões do Brasil e da América do Sul. A patogenia da infecção por Oropouche não é bem entendida. Modelo em roedores, usando inoculação intracerebral, tem sido descrito, mas não com uso da via subcutânea, que mais se assemelha à rota natural da infecção. O objetivo deste trabalho foi estabelecer e caracterizar um modelo experimental de infecção com Oropouche, usando inoculação subcutânea em hamster, a fim de contribuir para o entendimento da patogenia do mesmo. Oropouche da linhagem BeAn19991, passado em cérebro de camundongo recém-nascido, foi inoculado (106,25 TCID50/100?L) por via subcutânea na coxa de hamsters sírios com 2-3 semanas de idade. Em torno de 3 dias alguns animais desenvolveram doença com sinais clínicos brandos caracterizados por: eriçamento dos pêlos e agressividade, outros com características mais graves: perda de peso, tremores sugestivos de calafrios, letargia e paralisia. Os animais foram sacrificados 1, 3, 5, 8 e 11 dias pós-inoculação ou quando eram encontrados em estado agônico. Baço, cérebro, coração, fígado, músculo e sangue foram colhidos para titulação viral, histologia e imunohistoquímica. Infiltrado inflamatório estava presente no cérebro, principalmente em torno dos vasos, meninges e discretamente no coração. O vírus Oropouche foi detectado no tecido cerebral (107,23 TCID50/g), no fígado (106,67TCID50/g) e no sangue (106 TCID50/g). Antígeno de Oropouche foi encontrado, difusamente no fígado, associado com hepatócitos e em neurônios de diversos locais do cérebro. Este modelo reproduz uma infecção sistêmica por Oropouche e pode tornar-se útil no estudo da patogênese, bem como para testar drogas antivirais e possíveis candidatos à vacina. / Oropouche virus belongs to the family Bunyaviridae, genus Orthobunyavirus, serogroup Simbu and is the second most frequent arboviral febrile illness in Brazil. There are estimates of more than half million cases of Oropouche fever in Brazil in the past 30 years, with cases registered in Panama, Peru, Suriname and Trinidad. Oropouche fever has been registered almost exclusively in the Amazon, but with the global warming, deforestation and the consequent redistribution of vectors and reservoir animals, the risk of Oropouche virus dissemination to others areas of Brazil and South America increases. However, the pathogenesis of Oropouche infection is not well understood. Rodent models using intracerebral inoculation have been described, but no attempts to use a route that more closely resembles the natural route of infection have been published. This study was conducted to establish and characterize an experimental model of infection with Oropouche, using subcutaneous inoculation of hamsters, in order to contribute to the understanding of Oropouche pathogenesis. We have established an experimental model through subcutaneous inoculation of hamsters in order to study pathogenesis. Suckling mouse brain passaged Oropouche strain BeAn19991 was inoculated (106,25 TCID50/100?L) subcutaneously in the thigh of syrian hamsters 2-3 weeks old. Around day 3 animals developed disease characterized by lethargy, paralysis, chill-like shaking and ruffled fur. Animals were sacrificed on days 1, 3, 5, 8 and 11 post-inoculation or whenever found to be agonic. Brain, heart, liver, spleen, muscle and blood were harvested for virus titration, histology and Oropouche immunohistochemistry. Inflammatory infiltrate was present in the brain, mostly as perivascular cuffs, meninges and some in the heart. Oropouche titers were 107,23 TCID50/g of tissue in brain 106,67 TCID50/g in liver, and 106 TCID50/g in blood. Oropouche antigen was detected diffusely distributed in the liver in association with hepatocytes, and in neurons in several regions of the brain. This model reproduces systemic Oropouche infection and may become useful in pathogenesis studies, as well as to test antiviral drugs and possible vaccine candidates.