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Construção de uma ferramenta para análise de enriquecimento funcional gênico multiespécie entre amostras comparativas

Molan, André Luiz. January 2018 (has links)
Orientador: José Luiz Rybarczyk Filho / Resumo: Sequenciar um organismo, atualmente, pode ser financeiramente custoso. A quantidade de dados gerada por uma única corrida é grande. Analisá-los não é trivial, exigindo, cada vez mais, técnicas computacionais e métodos estatísticos robustos, capazes de extrair o máximo possível de informações. Normalmente, alguns estudos visam à busca por genes diferencialmente expressos mediante diferentes condições experimentais. É importante conhecer perfis de expressão, porém, faz-se necessário entender como os genes relacionam-se entre si funcionalmente, o que só é possível por meio de uma análise de enriquecimento funcional. Dessa forma, desenvolvemos um pacote em ambiente de programação R chamado EntropyClusterGenes. Ele é capaz de enriquecer conjuntos amostrais comparativos sob o ponto de vista da atividade e diversidade gênica utilizando a teoria da informação de Shannon. A ferramenta apresenta uma nova perspectiva de enriquecimento funcional, buscando por grupos de genes funcionalmente associados (GFAGs) através do conceito de entropia relacionado à ontologias e KEGG pathways. Para cada GFAG encontrado, através da técnica de bootstrap, calcula-se um p-valor, que é validado via FDR (False Discovery Rate) para determinar se o grupo encontrado é ou não significativo em uma dada comparação amostral (controle versus experimento). Através de uma nova análise de RNA-seq com o protocolo Tuxedo, quantificamos os transcritos de forma bruta e diferencial em 46 amostras de Aedes aegypti e 8 amos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: An organism sequencing is still expensive. The amount of data generated by a single run is massive. Analyzing them is not trivial, requiring computational techniques and robust statistical methods capable of extracting as much information as possible. Usually, some studies aim to search for genes differentially expressed by different experimental conditions. It is important to know the expression profiles, however, it is necessary to understand how the genes are functionally related to each other, which is only possible through a functional enrichment analysis. In this context, we have developed a package in the R programming environment called EntropyClusterGenes. It is able to enrich comparative sample sets from the perspective of gene activity and gene diversity using Shannon’s information theory. The tool presents a new approach of functional enrichment, searching for groups of functionally associated genes (GFAGs) related to ontologies and KEGG pathways classifying them according to their entropy. For each GFAG found, by means of the bootstrap technique, a p-value is calculated, which is validated by FDR (False Discovery Rate) to determine if the group found is significant or not in a given sample comparison (control vs. experiment). Using a new analysis of RNA-seq with the Tuxedo protocol, we quantified the raw and differential transcripts in 46 samples of Aedes aegypti and 8 samples of Drosophila melanogaster, later regrouped in 40 combinations (control and experiment)... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Fatores associados à internação hospitalar por tuberculose / Factors associated with hospitalization for tuberculosis

Silva, Daiane Alves da 30 March 2016 (has links)
Submitted by Caroline Periotto (carol@ufscar.br) on 2016-09-26T19:36:09Z No. of bitstreams: 1 DissDASfa.pdf: 2729340 bytes, checksum: bbe4bf346112bdc26153f7c73b66c9bc (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T20:14:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissDASfa.pdf: 2729340 bytes, checksum: bbe4bf346112bdc26153f7c73b66c9bc (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-27T20:14:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissDASfa.pdf: 2729340 bytes, checksum: bbe4bf346112bdc26153f7c73b66c9bc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T20:14:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissDASfa.pdf: 2729340 bytes, checksum: bbe4bf346112bdc26153f7c73b66c9bc (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Não recebi financiamento / Even after 50 years of knowledge of the diagnosis and treatment of tuberculosis (TB) disease still remains one of the major health problems globally. Treatment occurs in home or hospital level and although there is the first advantage over the second, the hospitalization rate is still high in Brazil. This scenario reflects the often difficult access to health services, since the Primary Health should be the gateway of those TB patients, to diagnose and treat these individuals, the hospital would be indicated only in special cases. The literature suggests that in developed countries the reasons for hospitalization of patients with TB are more related to the failure or drug intolerance, while in developing countries the poor condition and cachexia. Knowing the factors that determine admissions for TB can act early in the main groups vulnerable to hospitalization, avoiding complications of the disease and unnecessary hospitalizations. Therefore, this study aims to identify the factors associated with hospitalization of patients with TB. We carried out an epidemiological, observational and retrospective of cases reported in GVE XII Araraquara, in 2009-2013 and recorded in the TB-web information system, comparing patients who were hospitalized for TB with those who underwent treatment on an outpatient basis. The following variables were analysed: sex, age, education, occupation, date of notification, date of start of treatment, type of treatment, type of event, type of closure, classification, discovery, date of first symptoms, smear, associated diseases (HIV, diabetes, alcoholism, mental illness, drugs, immunosuppression, smoking, other.), strength, length and reason for it. We used univariate analysis and logistic regression multivariate analysis, adjusted odds ratio as a measure of association and 95% confidence interval. They studied 982 individuals, 298 hospitalized (30.34%) and 684 with outpatient treatment (69.65%); in the multivariate analysis was a higher chance of interaction between males (OR: 2.350; p = 0.001), lower education (OR: 1.793; p = 0.014), with comorbidity (OR: 1.811; p = 0.006) wherein the type of breakthrough did not occur in outpatient (OR: 6.941; p = 0.000), between which lacked occupation (OR: 1.797; p = 0.007) and those in the form of the disease was extrapulmonary (OR: 0.510; p = 0.013).It was concluded that there is evidence that socio-demographic, clinical and operational factors are associated with hospitalization for TB. Actions to these factors as well as these most vulnerable groups become essential to fewer hospitalizations for TB. / Mesmo após 50 anos de conhecimento do diagnóstico e tratamento da Tuberculose (TB) a doença ainda permanece como um dos principais agravos à saúde em âmbito global. Seu tratamento ocorre em nível domiciliar ou hospitalar e apesar de haver vantagem do primeiro em relação ao segundo, a taxa de internação ainda é alta no Brasil. Tal cenário reflete muitas vezes as dificuldades de acesso aos serviços de saúde, uma vez que a Atenção Primária a Saúde deveria ser a porta de entrada desses doentes com TB, para diagnosticar e tratar estes indivíduos, sendo as internações indicadas somente em casos especiais. A literatura aponta que em países desenvolvidos os motivos das internações de pacientes com TB estão mais relacionados à falha ou a intolerância medicamentosa, enquanto nos países em desenvolvimento ao mau estado geral e a caquexia. Conhecendo-se os fatores que determinam as internações por TB pode-se atuar precocemente nos principais grupos vulneráveis à hospitalização, evitando-se complicações da doença e internações desnecessárias. Portanto, este estudo tem por objetivo identificar os fatores associados à internação hospitalar de pacientes com TB. Realizou-se estudo epidemiológico, observacional e retrospectivo, dos casos notificados na GVE XIIAraraquara, entre 2009-2013, comparando pacientes que internaram por TB com aqueles que realizaram tratamento em nível ambulatorial. As seguintes variáveis foram analisadas: sexo, idade, escolaridade, ocupação, data da notificação, data do início do tratamento, tipo de tratamento, tipo de caso, tipo de encerramento, classificação, descoberta, data dos primeiros sintomas, baciloscopia, agravos associados (HIV, diabetes, alcoolismo, doença mental, drogas, imunossupressão, tabagismo e outras), resistência, internação e motivo da mesma. Utilizou-se análise univariada e regressão logística múltipla, com odds ratio ajustado como medida de associação e intervalo de confiança de 95%. Foram estudados 982 indivíduos, 298 hospitalizados (30,34%) e 684 com tratamento ambulatorial (69,65%) na análise múltipla foi observada maior chance de internação entre indivíduos do sexo masculino (OR: 2,350; p= 0,001), baixa escolaridade (OR: 1,793; p= 0,014), com comorbidade (OR: 1,811; p= 0,006), com o tipo de descoberta ambulatorial (OR: 6,941; p= 0,000), entre os que não possuíam ocupação (OR: 1,797; p=0,007) e aqueles em que a forma da doença era extrapulmonar (OR: 0,510; p=0,013). Concluiu-se que há evidências de que fatores sociodemográficos, clínicos e operacionais estão associados à internação hospitalar por TB. Ações voltadas a estes fatores, bem como a estes grupos mais vulneráveis, se tornam imprescindíveis para diminuição das internações por TB.
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Calcretes pedog?nicos ao longo de sistemas de fraturas e acamamentos em carbonatos neoproteroz?icos da Bacia de Irec?, Estado da Bahia

Borges, S?rgio Vieira Freire 19 August 2016 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-02-10T16:44:41Z No. of bitstreams: 1 SergioVieiraFreireBorges_TESE.pdf: 7086873 bytes, checksum: 8a52c6c1ff325db416f723593fd8f762 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-02-10T21:45:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 SergioVieiraFreireBorges_TESE.pdf: 7086873 bytes, checksum: 8a52c6c1ff325db416f723593fd8f762 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T21:45:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 SergioVieiraFreireBorges_TESE.pdf: 7086873 bytes, checksum: 8a52c6c1ff325db416f723593fd8f762 (MD5) Previous issue date: 2016-08-19 / Calcretes ou caliches s?o calc?rios continentais gerados pelos processos de intemperismo que ocorrem principalmente em regi?es ?ridas e semi-?ridas. Na Bacia de Irec?, localizada no norte do estado da Bahia, al?m da ocorr?ncia regular de calcretes pedog?nicos, um tipo peculiar de calcretes ocorre dentro dos calc?rios neoproteroz?icos da bacia. Estes calcretes desenvolveram-se perto da superf?cie e (1) entre as camadas sedimentares dos calc?rios, (2) dentro dos sistemas de fraturas e (3) dentro das principais falhas de empurr?o. Trabalhos de campo em afloramentos selecionados foram integrados com an?lises petrogr?ficas, mineral?gicas, geoqu?micas, c?lculos de densidade e porosidade por intrus?o de merc?rio para entender seu ambiente de forma??o e suas propriedades petrof?sicas. Os resultados revelaram que este tipo de calcrete ? o produto de eventos multiepis?dicos de dissolu??o e precipita??o ocorridos durante as esta??es secas e chuvosas na regi?o. Os estudos petrof?sicos sugerem que estes calcretes t?m um papel importante na migra??o de fluidos atrav?s de uma rocha hospedeira carbon?tica imperme?vel e que atuam como condutos para o fluxo de fluido, como revelado pela sua alta porosidade (valor m?dio de 26%) e not?vel conectividade de poros.
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Fatores associados à positividade da intradermorreação de Montenegro em Teresina, Piauí / Factors associated to the positivity of the Montenegro skin test in Teresina, Piauí

Marcus Vinicius Gouvêa 26 April 2006 (has links)
A leishmaniose visceral americana (LVA) ou Calazar é um exemplo de doença infecciosa reemergente, cuja urbanização a uma das principais marcas da alteração de seu padrão epidemiológico de ocorrência. No Brasil, a infecção por L. chagasi tem se comportado de forma epidêmica em diversas regiões e as estratégias de controle não tem sido efetivas na contenção da propagação da doença. Para melhor compreensão deste processo, estudaram-se associações da imunidade tardia, medida por meio do teste de intradermorreação de Montenegro (IDRM), com fatores demográficos, sociais, econômicos e ambientais em área urbana com alta forca de transmissão. A análise dos dados foi feita tendo como base o modelo de regressão de Poisson ajustado pelo qui-quadrado, onde foram calculadas as razões de prevalência (RP) e seus respectivos intervalos de 95% de confiança (IC). Foi detectada maior prevalência da positividade a IDRM para o sexo masculino (RP = 1,32 IC: 1,11 1,56), com o aumento da idade (RP = 1,18 IC: 1,10 1,26), com a posse de cao por período de três anos ou mais (RP = 1,26 IC: 1,01 1,56) e com presença de fossa rudimentar no domicilio (RP = 1,33 IC: 0,99 1,77). Indivíduos com maior escolaridade (RP = 0,81 IC; 0,66 0,99), convivendo com três ou mais pessoas no domicilio (RP = 0,66 IC; 0,47 0,93), com história de Calazar no domicílio (RP = 0,40 IC: 0,16 0,99) e com parede com tijolo sem reboco (RP= 0,79 IC: 0,64 0,98) apresentaram prevalências mais baixas mostrando possível proteção infecção anterior. Os resultados obtidos podem contribuir para o melhor entendimento do dinamismo da doença em contexto urbano, permitindo melhor direcionamento das estratégias de intervenção. / The American visceral leishmaniasis (AVL) or kalazar is an example of reemerging infectious disease, its urbanization being one of the most typical feature of its new epidemiologic pattern of occurrence. In Brazil, epidemics of infection by L. chagasi have occurred in several regions and control strategies have not been effective to contain the spread of the disease. To better understand this process, we have studied the association between cellular immunity, measured by the Montenegro Skin Test (MST), and demographic, social, economic and environmental factors in an urban area with high force of transmission. Statistical analysis was performed using Poisson regression models adjusted by the chi-square. Associations between variables were expressed by prevalence ratios (PR) and their respective 95% confidence intervals (CI). Higher prevalence of positivity to MST was detected among male participants (PR = 1.32 CI: 1.11 1.56), for each ten years increase of age (PR = 1.18 CI: 1.10 1.26), among subjects who owned dogs for three or more years (PR = 1.26 CI: 1.01 1.56) and for those who lived in households with precarious sewage system (PR = 1.33 CI: 0.99 1.77). Individuals with higher literacy (PR = 0.81 CI: 0.66 0.99), living in households where a case of AVL had occurred before (PR = 0.40 CI: 0.16 0.99), or in houses with walls made of bricks without finishing (PR = 0.79 CI: 0.64 0.98), or with three or more persons (PR = 0.66 CI: 0.47 0.93), showed lower prevalence of positivity to MST, indicating that these factors might have protected for earlier infection. These results might contribute to a better understanding of the behavior of the infection in urban context, and maybe useful for directing intervention to high-risk groups.
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Fatores associados à recaída do tabagismo em pacientes assistidos em unidades de saúde da zona oeste do município do Rio de Janeiro / Factors associated with relapse to smoking in patients treated at health units in the west of the municipality of Rio de Janeiro

Cláudia Christina Sobrinho do Nascimento 13 March 2014 (has links)
Essa dissertação de mestrado avaliou os fatores associados à recaída do tabagismo de pacientes assistidos em unidades básicas de saúde. Avaliou-se o índice de recaída do tratamento do fumante no Programa Nacional de Controle de Tabagismo, e a associação entre tempo de recaída e preocupação com peso, depressão e/ou ansiedade. Trata-se de um estudo de coorte prospectivo, composta por 135 pacientes, sendo 95 mulheres e 40 homens, que pararam de fumar após 4 semanas de adesão ao tratamento, sendo acompanhados até 6 meses. O índice de recaída encontrado foi semelhantes em ambos os sexos, sendo próximo de 30% aos 3 meses e 50% aos 6 meses. O tempo de sobrevivência mediano também foi semelhante, em torno de 130 dias. A média de ganho de peso foi maior entre os homens aos 3 e 6 meses. Para avaliar os fatores associados ao tempo de recaída foram calculadas as Hazard Ratios (HR) e respectivos intervalos de confiança de 95% (IC 95%), através do modelo semiparamétrico de riscos proporcionais de Cox. Na análise bivariada, as mulheres que achavam que fumar emagrece ou que faziam dieta apresentaram um risco maior de recaída, porém não estatisticamente significante. Entre as que referiram fazer acompanhamento psicológico e/ou psiquiátrico, o tempo de recaída foi 2,62 vezes menor se comparado àquelas que não o faziam. O risco também mostrou-se aumentado com o uso de álcool (HR=2,11, IC 95%1,15-3,89). Entre os homens, os dois pacientes que faziam uso de medicamentos para depressão e/ou ansiedade tiveram recaída. As demais variáveis analisadas não se mostraram associadas ao risco de recaída por apresentarem HR com intervalos não estatisticamente significativos. Os fumantes poderiam se beneficiar de tratamentos que oferecessem de forma complementar atendimentos para nutrição e saúde mental. O aprimoramento das estratégias de cessação do tabagismo devem levar em conta as diferenças de gênero, a necessidade de assistência a problemas psicológicos e psiquiátricos e o controle de peso para os pacientes com maior dificuldade; passos essenciais para o sucesso das políticas públicas de controle do tabagismo no país. / This dissertation evaluated the factors associated with smoking relapse of patients treated at primary health factors. We evaluated the relapse rate of the treatment of smokers in the National Tobacco Control Program, and the association between time to relapse and concern with weight, depression and / or anxiety. This is a prospective cohort study, comprising 135 patients, 95 women and 40 men, who stopped smoking after 4 weeks of treatment adherence and were followed up to 6 months. The relapse rate was found to be similar in both sexes, with close to 30% at 3 months and 50% at 6 months. The median survival time was similar, about 130 days. The average weight gain was higher among males at 3 and 6 months. To assess factors associated with time to relapse factors were calculated hazard ratios (HR) and confidence intervals of 95% (95% CI), through the semi-parametric proportional hazards model of Cox. In bivariate analysis, women who thought smoking or lose weight dieted had a higher risk of relapse, but not statistically significant. Among those who reported psychological counseling and / or psychiatric, time to relapse was 2.62 times lower compared to those who did not. The risk also was increased with alcohol use (HR = 2.11, 95% CI 1.15 to 3.89). Among men, the two patients who were taking medication for depression and / or anxiety have relapsed. The remaining variables were not associated with risk of relapse by presenting HR with no statistically significant intervals. Smokers could benefit from treatments that offered a complementary way calls for nutrition and mental health. The improvement of smoking cessation strategies should take into account gender differences, the need to care for psychiatric and psychological problems and weight control for patients with greater difficulty; essential steps to successful public policies for tobacco control in the country.
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Características e fatores associados dos corredores de rua de Aracaju

Oliveira, Eduardo Teles de 31 August 2015 (has links)
Não informado / A Corrida de Rua no Brasil apresenta um crescimento significativo no número de praticantes e isso pode ser refletido no aumento da quantidade de provas realizadas em todo país. Observa-se que uma variedade de eventos tem atraído os mais diversos públicos para esse esporte. Esse crescimento pode ser verificado pela quantidade de inscritos nas principais provas a exemplo da Corrida de São Silvestre, a mais tradicional corrida da América Latina, que no ano de 2014 contou com a presença aproximada de 30 mil inscritos envolvendo corredores profissionais, amadores e recreacionais. Entre os grandes eventos, destacam-se a Meia-Maratona Internacional do Rio de Janeiro e a Meia-Maratona Internacional de São Paulo, ambas com a quantidade de inscritos superior a 15 mil em 2014.
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Perfil sociodemográfico e fatores associados à gravidez na adolescência em Goiás / Sociodemografic profile and associated factors with adolescente pregnancy

Pfrimer, Elisa Oliveira Dafico 26 May 2011 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-02T14:21:54Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elisa Oliveira Dafico Pfrimer - 2011.pdf: 2293469 bytes, checksum: c814f7d636001193b48ec116faaf59ae (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-02T14:22:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elisa Oliveira Dafico Pfrimer - 2011.pdf: 2293469 bytes, checksum: c814f7d636001193b48ec116faaf59ae (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-02T14:22:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elisa Oliveira Dafico Pfrimer - 2011.pdf: 2293469 bytes, checksum: c814f7d636001193b48ec116faaf59ae (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2011-05-26 / Adolescent pregnancy is a multifactorial event that needs to be analyzed within different sociocultural and biological contexts. OBJECTIVE: To estimate the prevalence and to investigate social, demographic and behavioral factors associated with pregnancy among adolescents in Goiás State. METHODOLOGY: It is a cross-sectional study. We used the database records of Projeto Adolescer com Saúde, a research project conducted in four cities of Goiás State: Goiânia, (2002 to 2003) and Ceres, Catalão and Inhumas (2007 to 2009), at public health units (Family Health Program). The two databases were standardized and merged: Goiânia (n = 468) and other cities (n = 969), resulting in a sample of 1437 female participants, being selected 1036 adolescents from 15 to 19 years old. Adolescents with history of pregnancy were compared to those who did not become pregnant to identify the factors associated with pregnancy. Univariate and Multivariate not conditional analysis was performed to investigate socio demographic variables potentially associated with adolescent pregnancy, calculating odds ratios and 95 % confidence interval (95%CI). P value <0.05 was considered significant. Epi-Info 3.5.1 and SPSS 13.0 programs were used for statistical analysis. RESULTS: 1036 adolescents were interviewed, of which 769 (74.2%) were sexually active. Sexually active adolescent girls had inferior schooling and lower income compared with adolescents who had not yet started sexual activity. 271 teenagers referred early pregnancy (95%CI 35.5%: 32.1-39.1). After adjustment for potential confounding variables, were identified as independently associated factors with pregnancy in adolescence: stable union, age over 17 years, sexual activity before 16 years old, inadequate schooling for age and family income lower than two minimum wages. CONCLUSION: Low socioeconomic conditions, inadequate schooling combined with sexual activity before 16 years old represent situations of vulnerability to teenage pregnancy in Goiânia and others cities in Goiás. / A gravidez na adolescência é um evento multifatorial que precisa ser compreendido de forma abrangente, dentro de diferentes contextos socioculturais e biológicos. OBJETIVO: Estimar a prevalência e investigar fatores sociais, demográficos e comportamentais associados à gravidez na adolescência em Goiás. METODOLOGIA: É um estudo transversal que utilizou os registros dos bancos de dados do Projeto Adolescer com Saúde, projeto de pesquisa conduzido em quatro cidades do Estado de Goiás: Goiânia (2002 e 2003), e em Ceres, Catalão e Inhumas (2007 a 2009), em Unidades do Programa da Saúde da Família. Foi feita a padronização dos dados e a união dos dois bancos: Goiânia (n=468) e interior goiano (n=969), resultando em uma amostra de 1437 participantes femininas, sendo selecionadas 1036 adolescentes com idade de 15 a 19 anos. Realizou-se a comparação entre as que tiveram história de gravidez e as que nunca engravidaram, identificando os fatores associados à gravidez. Foi realizada análise univariada e multivariada não condicional e calculado o Odds Ratio bruto e ajustado, com respectivos Intervalos de Confiança de 95% (IC95%). O nível de significância foi estabelecido em p <0.05. Os programas Epi-Info 3.5.1 e SPSS 13.0 foram utilizados para as análises estatísticas. RESULTADOS: Foram entrevistadas 1036 adolescentes, das quais 769 (74,2%) eram sexualmente ativas. As adolescentes sexualmente ativas apresentavam menor escolaridade e menor renda quando comparadas com as adolescentes que ainda não haviam iniciado vida sexual. Gravidez pregressa foi referida por 270 adolescentes (35,5% IC95%: 32,1-39,1). Após ajuste para potenciais variáveis de confusão, foram identificados como fatores independentemente associados com gravidez na adolescência: união estável, idade superior a 17 anos, início da atividade sexual abaixo de 16 anos, escolaridade inadequada para idade e renda familiar inferior a dois salários-mínimos. CONCLUSÃO: Baixas condições socioeconômicas, escolaridade inadequada e início da atividade sexual em menores de 16 anos, representam situações de vulnerabilidade para gravidez na adolescência, em Goiânia e nas outras cidades de Goiás.
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Estudo dos metabólitos de Aspergillus fumigatus visando o isolamento de uma substância bioativa contra

Silva, Emily Marcele Soares 10 July 2014 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-07T14:13:22Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Emily M. S. Silva.pdf: 2118553 bytes, checksum: fb456947468dd022b648c7c49c3b3a0a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-07T14:13:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Emily M. S. Silva.pdf: 2118553 bytes, checksum: fb456947468dd022b648c7c49c3b3a0a (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-12-07T14:14:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Emily M. S. Silva.pdf: 2118553 bytes, checksum: fb456947468dd022b648c7c49c3b3a0a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-07T14:14:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Emily M. S. Silva.pdf: 2118553 bytes, checksum: fb456947468dd022b648c7c49c3b3a0a (MD5) Previous issue date: 2014-07-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Tuberculosis (TB) caused by Mycobacterium tuberculosisis one of the most lethal diseases in the world, causing millions of deaths every year. Due to the inadequate treatment and the emergence of multidrug-resistant strains, the search for new antimicrobial compounds have been often reported in the scientific literature. Drugs developed from natural products have been a frequent research target and promising results have been obtained with the discovery of antimicrobial compounds synthesized by endophytic microorganisms. Previous work demonstrated that an endophytic Aspergillus fumigatusspecies,isolated from Copaifera multijugaHayne (copaíba), produces antimicrobial compounds, which are released into the growth substrate. The direct use of this substrate (fermentation broth) in antibiosis assaysagainst M. tuberculosisin vitro allowed detectingantimicrobial activity against the pathogen when compared to the negative control. So, the objective of this work was the analysis and purification of these compounds by the fractionation of A. fumigatusmutant and non-mutantfermentation broth, aiming the selection of fractions with higher capacityfor inhibitM. tuberculosis. Mutants were obtained by the induction of the fungal culture to ultraviolet lightexposition. The wild and mutant derivatives isolateswere tested for antibiosis against the indicator organism, Staphylococcusaureusandthe antimicrobial activity has been evaluated by comparing in vitro antibiosis assaysand fungal extractson n-butanol by High Performance Liquid Chromatography (HPLC). After, n-butanolextracts of wild isolates were subjected to fractionation by Medium PressureLiquid Chromatography (MPLC), and the fractions were evaluated against M. smegmatis. After this test, the fractions that showed antagonistic activity were selected for testing against M. tuberculosis, and analyzed in analyticalHPLC. Among 18 mutants selected, eight showed antagonismagainst S. aureus. A peak with less than a minute of retention was correlated with the antimicrobial activity. On the fractionation, 30 fractions were obtained and among these, only two (F4 and F13) showed activity against M. smegmatisandonly F4 showed antagonism against M. tuberculosiswith an MIC of 256µg/mL. The chromatograms of both F4 andF13 showedpeaks atthe beginning of the analysis. The F4chromatogram showedtwo peaks with retention times of 2.1 and 2.4 minutes. These data will be useful in future optimization and purification of compounds / A tuberculose (TB), causada por Mycobacterium tuberculosisé uma das enfermidades mais letais do mundo, causando milhões demortes todos os anos. Devido aos tratamentos inadequados e ao surgimento de cepas multirresistentes aos fármacos utilizados nos tratamentos, a busca por novos compostos antimicrobianos tem sido reportada com freqüência na literatura científica. Fármacos desenvolvidos a partir de produtos naturais têm sido um alvo frequente de pesquisa e dentre as perspectivas, resultados promissores têm sido obtidos com a descoberta de compostos antimicrobianos sintetizados por micro-organismos endofíticos. Trabalhos anteriores demonstraram que um fungo endofítico da espécie Aspergillus fumigatusisolado de Copaifera multijuga Hayne (copaíba), produz compostos antimicrobianos, os quais são secretadospara o substrato de crescimento. A utilização direta desse substrato (caldo de fermentação) em testes de antibiose in vitro contra M. tuberculosispermitiram detectar sua atividade antimicrobiana contra o patógeno, quando comparadaao controle negativo. Partindo desse resultado, foi objetivo do presentetrabalhoproceder à análise e purificação desses compostos, através do fracionamento do caldo de fermentação de A. fumigatusmutantes e não mutantes, visando à seleção de frações que apresentem maiorcapacidade de inibição contra M. tuberculosis.Induziu-sea mutação do isolado selvagempor meio da exposição da cultura fúngica à luz ultravioleta. O isolado selvagem e os mutantes derivados desse isolado foram testados quanto à antibiose contrao micro-organismoindicador,Staphylococccusaureus, tendo sido a atividade antimicrobianaavaliada por meio de comparações entre os testes de antibiose in vitroe os cromatogramas dos extratos fúngicos fracionados em n-butanolpor Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE). Após isso, extratos em n-butanolde isolados selvagens foram submetidos ao fracionamento químico por Cromatografia Líquida de Média Pressão (MPLC)e as frações obtidas foram avaliadas contra M. smegmatis. Após este ensaio, as frações que apresentaram antagonismo foram selecionadas para o ensaio contra M. tuberculosis, além de serem analisadasem CLAEAnalítica. Foram selecionadas 18 colônias mutantes e destas, oito apresentaram antagonismo contra S. aureus. A partir da análise dos cromatogramas dos isolados, correlacionou-se à atividade antimicrobiana um pico com menos de um minuto de retenção.No fracionamento químico, foram obtidas 30 frações e destas,apenas duas (F4 e F13)apresentaram atividade contra M. smegmatis.Das duas frações, apenas F4 apresentou antagonismo frente a M. tuberculosiscom CIM de 256µg/mL. Os cromatogramas, tanto de F4 quanto de F13, apresentampicos no início da análise. O cromatograma de F4 mostra dois picos, com tempos de retenção de 2,1 e 2,4 minutos. Esses dados iniciais auxiliarão na otimização e futurapurificação dos compostos.
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ABELHAS E COLEÓPTEROS VISITANTES DE Guizotia abyssinica (L. f.) Cass (COMPOSITAE) ASSOCIADOS ÀS VARIÁVEIS AMBIENTAIS / BEES AND VISITING COLLECTIBLES OF Guizotia abyssinica (L. f.) Cass (COMPOSITAE) ASSOCIATED WITH ENVIRONMENTAL VARIABLES

Teixeira, Marcelo Mendes 08 July 2013 (has links)
Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2017-01-26T16:48:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) MARCELOTEIXEIRA.pdf: 360426 bytes, checksum: b8cddf946011696b5c5628c5bdf7bbc3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T16:48:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) MARCELOTEIXEIRA.pdf: 360426 bytes, checksum: b8cddf946011696b5c5628c5bdf7bbc3 (MD5) Previous issue date: 2013-07-08 / Niger (Guizotia abyssinica (L. f.) Cass is an oleaginous originally from Africa, which has aroused the interest of producers due to its use for the production of oil, mainly to produce biodiesel. The plant is also an alternative to compose the crop rotation system, with an excellent alternative for the winter season. this work aimed to study the fauna of bees and beetles associated with Niger (Guizotia abyssinica (L. f.) Cass (COMPOSITAE)).The study was conducted at the Experimental Farm of Agricultural Sciences, Universidade Federal da Grande Dourados in Dourados, MS, Brazil. The culture was mechanically sown in May 2010, it has began its flowering in July and remained blooming until the month of September of the same year, resulting in eleven weeks of collections. Samples were collected with entomological net by scanning method, once a week, in ten different points in the area, every two hours from 07:00 to 17:00 for eleven weeks of flowering, totaling six daily sampling, from July to September 2010. We evaluated the dominance parameters, abundance, frequency, constancy and performed a correlation analysis considering the presence and absence of individuals of the species in the sample as a function of temperature, relative humidity and wind speed, for this was taken from the effect of time and period and the quantity of subjects were not evaluated. They were counted 1,095 individuals between bees and beetles. Bees represented 46.21% of the total, and Coleoptera 53.79%. The Order Hymenoptera, superfamily Apoidea, Apis mellifera and Geotrigona sp. They accounted for 93.48% of all honeybees culture. The times of highest visitation Apoidea was between 09:00 and 15:00 occurring in fewer 11:00 hours. The eudominantes Coleoptera were Diabrotica speciosa and Astylus variegatus, together accounted for 61.29% of all Coleoptera collected in culture. Beetles were found in greater numbers at 17:00 hours and fewer at the times of 11:00 am. Dominance analysis revealed that Geotrigona sp., A. mellifera, D. speciosa and A. variegatus were eudominantes and plentiful and Nitidulide sp.1 dominant. The evaluation of constancy identified A. mellifera, Phanomalopsis sp., Trigona spinipes and Geotrigona sp. as contained in schedules and in the weeks to collect and Halictini was constant in all collection times. Chrysomelinae sp.1, D. speciosa, Nitidulidae sp.1, Chrysopidae sp.1 and A. variegatus showed constancy in time and weeks of collection. The correlation analysis of environmental factors with the two bee species and two species of Coleoptera with greater abundance indicated that none of the environmental factors interfere with the activity of the four species analyzed. / O Níger (Guizotia abyssinica (L. f.) Cass é uma oleaginosa originária da África, que vem despertando o interesse dos produtores em função de sua utilização para a produção de óleo, principalmente para produzir biodiesel. A planta é também uma alternativa para compor o sistema de rotação de culturas, sendo uma excelente alternativa para a safra de inverno. O presente trabalho teve por objetivo estudar a fauna das abelhas e coleópteros associada ao Níger (Guizotia abyssinica (L. f.) Cass (COMPOSITAE)). O trabalho foi realizado na Fazenda Experimental de Ciências Agrárias da Universidade Federal da Grande Dourados, em Dourados, MS, Brasil. A cultura foi semeada mecanicamente em maio de 2010, iniciou sua floração em julho e permaneceu florindo até o mês de setembro do mesmo ano, resultando em onze semanas de coletas. As coletas foram realizadas com rede entomológica, pelo método de varredura, uma vez por semana, em dez diferentes pontos na área, a cada duas horas das 07:00 às 17:00 horas, durante onze semanas de florescimento, totalizando seis amostragens diárias, no período de julho a setembro de 2010. Foram avaliados os parâmetros de dominância, abundância, freqüência, constância e realizada uma análise de correlação considerando presença e ausência dos indivíduos das espécies na amostragem em função da temperatura, umidade relativa e velocidade do vento, para isso foi retirado o efeito do horário e o do período e as quantidades de indivíduos não foram avaliadas. Foram computados 1.095 indivíduos, entre abelhas e coleópteros. As abelhas representaram 46,21% do total, e coleópteros 53,79%. A Ordem Hymenoptera, superfamília Apoidea, Apis mellifera e Geotrigona sp. corresponderam a 93,48% de todas as abelhas coletadas na cultura. Os horários de maior visitação de Apoidea foi entre 09:00 e 15:00 horas ocorrendo em menor número as 11:00 horas. Os Coleoptera eudominantes foram Diabrotica speciosa e Astylus variegatus, juntos corresponderam a 61,29% de todos os Coleoptera coletados na cultura. Os coleópteros foram encontrados em maior número às 17:00 horas e em menor número nos horários de 11:00 horas. A análise de dominância revelou que Geotrigona sp., A. mellifera, D. speciosa e A. variegatus foram eudominantes e abundantes e Nitidulide sp.1 dominante. A avaliação da constância identificou A. mellifera, Phanomalopsis sp., Trigona spinipes e Geotrigona sp. como constantes nos horários e nas semanas de coleta e Halictini foi constante em todos os horários de coleta. Chrysomelinae sp.1, D. speciosa, Nitidulidae sp.1, Coccinelidae sp.1 e A. variegatus apresentaram constância nos horários e semanas de coleta. A análise de correlação dos fatores ambientais com as duas espécies abelhas e as duas espécies de coleópteros com maior abundância indicou que nenhum dos fatores ambientais interferiu na atividade das quatro espécies analisadas.
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Grupo especializado de produtores de abacaxi do município de Cruzeiro do Oeste: o caráter formativo-pedagógico das relações de trabalho entre 2004 e 2015 / Specialized group of pineapple producers in Cruzeiro do Oeste: the formation-pedagogical character of labor relations from 2004 to 2015

Moreira, Pedro Luiz 08 March 2016 (has links)
Submitted by Edineia Teixeira (edineia.teixeira@unioeste.br) on 2018-02-19T19:54:04Z No. of bitstreams: 2 Pedro_Moreira2016.pdf: 2231115 bytes, checksum: 3d0abea730f4011744d773c75cc69eb2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-19T19:54:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Pedro_Moreira2016.pdf: 2231115 bytes, checksum: 3d0abea730f4011744d773c75cc69eb2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-08 / The contradictions of the capitalist mode of production get evident in the most varied forms of social inequality. Those, by their turn, have put into more evidence the system limitations to promote mankind's development. Therefore, the overcoming of obstacles that hinder or limit human development depends on the transformation of production social relations. For the transformation of social relations of production it is essential the role of education, with a view to the continuous development of Socialist awareness. According to this perspective, beyond formal education, it is also important non-formal education which occurs in non-formal space, highlighting formative processes that happen in work spaces. Thus, what is inquired is whether work relations which occurs in the GEA (Pineapple Specialized Group) are a possibility of establishing new social relations which could point to the overcoming of capitalist contradictions? The overall objective of the research is to analyze the pedagogical-formative of work relations in the "Pineapple Specialized Group", in the northwest region of the Paraná state, in the city Cruzeiro do Oeste. This analysis track unfolds in four specific objectives; 1) summarize the emergence of capitalist social formation and work relations in Brazil; 2) analyze the macroeconomical context and its implications for Brazil, when the PSG was created; 3) discuss aspects of the relation between work and education using the capitalist production mode as a reference; and 4) systematize the knowledge of pedagogical-formative character in work relations that occur in PSG. We set out the hypothesis that the working relationships that occur in the PSG, points to the possibility of overcoming both the division between manual and intellectual work, as the exercise of power verticality, in the work relation. The methodological path indicated the need of Division of labour in four chapters thus formed: first briefly presents the emergence of capitalist social formation model and its impact on labor relations in Brazil. In the second analysis is about how it happened, within the context of development of capitalism, the insertion of international capital in the development of the economy of the country and the way it is in conditions of the creation of the PSG in the municipality of Cruzeiro do Oeste, Paraná northwestern region. The third chapter makes an approach on the relationship between work and education marked by internal contradictions of capitalist relations of production. In the fourth chapter is made a presentation of the internal regulations regulating labour relations in the PSG, as well as the development of some of its core activities, such as Division, planning and work execution. The results presented in the research allow us to say that the elements that constitute working practices in the PSG, have significant relevance for the training of its members in order to overcome common sense views. They point for a way of conceiving labor relationships that align to the Socialist perspective. According to discussions presented, work at the PSG is distinguished by three significant aspects of importance for the working class. The first relates to the fact that has ensured the survival of workers with relative autonomy. The second, such practices contribute to the formation of a worker who participates in making collective decisions concerning economic processes and work organization. And third, it contributes to the formation of a worker who has a less fragmented knowledge about their work and their output, since that both intellectual and manual work is performed by all workers. / As contradições do modo de produção capitalista se objetivam nas mais variadas formas de desigualdade social. Estas têm colocado cada vez mais em evidência as limitações do sistema para promover o desenvolvimento da humanidade. Portanto, o desenvolvimento humano depende da transformação das relações sociais de produção. Para a transformação das relações sociais de produção o papel da educação é o de desalienação. Nesta perspectiva, além da educação formal, também é importante aquela que acontece nos espaços não-formais, destacando os processos formativos que ocorre nos espaços de trabalho dos trabalhadores. Isso posto, o que se busca saber é se as relações de trabalho que ocorrem no GEA (Grupo Especializado de Abacaxi) constituem-se em possibilidade de se estabelecer novas relação sociais que apontem para superação das contradições do sistema capitalista? O objetivo geral da pesquisa é analisar o caráter formativo-pedagógico das relações de trabalho do GEA, de Cruzeiro do Oeste. O percurso desta análise desdobra-se em quatro objetivos específicos; 1) apresentar sumariamente a emergência da formação social do capitalismo e as relações de trabalho no Brasil; 2) analisar o contexto macroeconômico e suas implicações no Brasil, quando foi criado o GEA; 3) discutir aspectos da relação entre trabalho e educação tomando como referência o contexto do modo de produção capitalista; e 4) sistematizar os conhecimentos do caráter formativo-pedagógico das relações de trabalho e produção que ocorre no GEA. Partimos da hipótese de que as relações de trabalho que lá ocorrem são constituidas de elementos que contribuem para a emancipação dos trabalhadores. O primeiro capítulo apresenta sumariamente a emergência do modelo capitalista e seu impacto nas relações de trabalho no Brasil. No segundo é feita a análise da forma como se deu, a inserção do capital internacional no desenvolvimento da economia do país e a forma como isso se constitui em condicionantes da criação do GEA no município de Cruzeiro do Oeste, Paraná. O terceiro aborda a relação entre trabalho e educação marcada pelas contradições internas das relações de produção capitalista. O quarto apresenta o Regimento Interno do GEA e o desenvolvimento de algumas de suas atividades essenciais, como divisão, planejamento e execução do trabalho. Os resultados da pesquisa permite dizer que as práticas de trabalho no GEA, possuem relevância significativa para a formação dos seus membros no sentido de superar a visão do senso comum. Sinalizam para uma forma de conceber as relações de trabalho que se alinham a perspectiva socialista. De acordo com as discussões apresentadas o trabalho no GEA destaca-se por três aspectos de significativa importância para classe trabalhadora. O primeiro diz respeito ao fato de que tem garantido a sobrevivência dos trabalhadores com relativa autonomia. A segunda, que são práticas que contribuem para a formação de um trabalhador que participa na tomada de decisões coletivas referentes aos processos econômicos e de organização do trabalho. E terceiro, contribui para formação de um trabalhador que possui um conhecimento menos fragmentado sobre seu trabalho e sua produção, visto que tanto o trabalho material quanto o intelectual é realizado por todos os trabalhadores

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