Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:33Z : No. of bitstreams: 1 000828585.pdf: 1546652 bytes, checksum: 96c7297cbf5b7d6eec63385274ddf1ad (MD5) / Este estudo procurou avaliar alterações na qualidade das águas subterrâneas do aquífero Bauru no município de Bastos, interior do Estado de São Paulo, principalmente quanto ao aumento das concentrações do parâmetro nitrato com base em dados do Departamento de Águas e Energia Elétrica de São Paulo - DAee. A avaliação baseou-se em informações sobre as captações de águas subterrâneas, realizadas através de poços profundos, como localização, posição dos níveis estáticos e dados de qualidade nos anos de 2009 e 2013. Posteriormente, foram elaboradas mapas de distribuição das captações subterrâneas na área do município e identificação das concentrações de nitrato por classe de valores, além de identificação de áreas com atividade de avicultura. Numa avaliação preliminar dos dados relativos ao ano de 2009, constatou-se que 32% das captações subterrâneas apresentaram concentrações de nitrato acima e até cinco vezes maiores do que o valor máximo permitido e estipulado pelo Ministério da Saúde em amostras de água potável. Os dados referentes ao ano de 2013 confirman que as elevadas concentrações de nitrato persistem e em alguns casos indicam aumento nas concontrações de tal parâmetro. Os demais parâmetros de qualidade que foram considerados no estudo não ultrapassaram os limites de concentração estipulados pela legislação. Tais dados sugerem que a intensa atividade de avicultura, principal setor econômico do município, está provocando alterações na qualidade das águas subterrâneas, principalmente devido aos elevados teores de nitrato verificados / The aim of this study is to evaluate the changes in groundwater quality in Bauru aquifer in city of Bastos, inlaud of São Paulo state, mainly the increase on concentrations of the parameter nitrate based on data of Department of Water and Energy of State of São Paulo. The preliminary assessment was based on information about groundwater extraction via deep wells. The information are position, static levels and of quality in the period of 2009 and 2013. Maps with the distribution of wells were elabored including concentrations of nitrate for class rate and identification of the areas with intense aviculture. The preliminary data assessment for the year 2009 show that 32%f wells have concentration of nitrate higher than the limit allowed by law from the Ministry of Health in samples of drinking water. The data from the year 2013 confirm that the high concentrations of nitrate persists and, in some cases, it shows increase in concentrations comparing to 2009. The other parameters assessed do not exceed the limits defined by law. This information suggests that the high aviculture activity, main economic sector in the city, are causing the changes in the groundwater quality, mainly because the high concentrations of nitrate which were observed

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-23. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:49:16Z : No. of bitstreams: 1 000832909.pdf: 2007426 bytes, checksum: 3830e39fe6ea73eceded08eb3fe680d8 (MD5) / Frente ao aquecimento global e ao iminente aumento da produção animal nos países tropicais, o estudo acerca do equilíbrio térmico dos animais de produção torna-se imprescindível, uma vez que o estresse térmico influencia diretamente a produtividade dos animais. Devido a importância da Avicultura no cenário agrícola nacional, destaca-se a importância de se desenvolver técnicas aplicáveis nas condições de criação das aves, para a predição da condição de conforto térmico. Baseado nessas informações, o principal objetivo deste trabalho foi propor modelos para o equilíbrio térmico de frangos de corte. Os objetivos específicos foram: estudar as variáveis fisiológicas (temperatura retal, temperatura da epiderme, temperatura das penas, temperatura do ar expirado e temperatura da pata) de frangos de corte ao longo do ciclo de criação em diferentes condições ambientais; estudar o fluxo de calor sensível de frangos de corte ao longo do ciclo de criação em diferentes condições ambientais; descrever e validar um modelo para a predição das temperaturas corporais de frangos de corte; determinar a quantidade necessária de radiação a ser fornecida para pintos de corte para manutenção da temperatura corporal; propor uma metodologia para a mensuração do metabolismo e das variáveis respiratórias de frangos de corte ao longo do ciclo de criação em condições de campo; estudar as variáveis respiratórias (volume respiratório corrente, frequência respiratória, ventilação) de frangos de corte durante todo o ciclo de criação; aplicar as medidas fisiológicas e variáveis respiratórias mensuradas ao longo do ciclo de criação para sustentar um modelo de transferência de calor para frangos de corte. O estudo foi realizado a partir da coleta de dados em diferentes experimentos e lotes de animais, com as aves em distintas condições ambientais e épocas do ano. As temperaturas corporais de frangos de ... / Due to global warming and the imminent increase of animal production in tropical areas, the study about thermal equilibrium of the animals becomes essential, once that thermal stress influences directly their productivity. Poultry has a major importance in the Brazilian agricultural scene, so there is a great importance to the development of techniques applicable to birds' husbandry conditions, to predict their condition of thermal comfort. Based on these information, the main objective was to propose a model of the thermal equilibrium of broiler chickens. The specific objectives were: to study the physiological variables (rectal temperature, skin temperature, feather temperature, exhaled air temperature and foot temperature) of broiler chickens during the rearing period in different environmental conditions; to study the sensible heat flow of broilers chickens in the rearing period in different environmental conditions; to develop and to validate a mathematical model to the prediction of body temperatures of broiler chickens; to determine the amount of radiation to broiler chicks to the maintenance of body temperature; to propose a methodology to measure the metabolic heat production and respiratory functions of broiler chickens (tidal volume, respiratory rate, ventilation) in the rearing period; to apply physiological and respiratory variables measured during the rearing period to sustain a mathematical model to study the heat transference in broiler chickens. The study was performed with the data collection in several trials and flocks of animals, and the birds were exposed to different environmental conditions and seasons. The body temperatures of broiler chickens were studied during the rearing period in July and December. These variables were influenced by the age (live weight) and by environmental variables (P<0.05). The sensible heat flow in the body covered by the feathers and in the foot was also different in accordance ...

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-06. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:42Z : No. of bitstreams: 1 000843989.pdf: 1193243 bytes, checksum: 4367029f15750a8b0b1144af943e8f5e (MD5) / Uma doença metabólica que acomete as poedeiras é o distúrbio acidobásico. Este distúrbio, que é agravado pelo estresse calórico, consiste em um aumento do pH sanguíneo, levando a uma alcalose respiratória, comprometendo assim o desempenho e a qualidade dos ovos. Para minimizar esse problema é possível manipular a dieta das aves favorecendo o balanço e a relação eletrolítica e, consequentemente, diminuir as perdas, principalmente relacionadas à mortalidade e fragilidade de casca do ovo, eventos facilmente observados em aves em declínio de produção. Sendo assim, o presente estudo avaliou-se os efeitos da manipulação de eletrólitos na dieta sobre o desempenho, a qualidade de ovos de poedeiras e a viabilidade econômica na fase de declínio de produção, em condições de altas temperaturas. Na manipulação de eletrólitos considerou-se diferentes balanços eletrolíticos (Na + + K + - Cl - ) e diferentes relações eletrolíticas [(K + + Cl - ) / Na + ]. Foram utilizadas 288 poedeiras distribuídas por um delineamento em blocos casualisados e esquema fatorial 4 x 3 (4 balanços eletrolíticos (140, 210, 280 e 310 mEq / kg) x 3 relações eletrolíticas (2:1; 2,5:1 e 3:1) totalizando 12 tratamentos com 4 repetições de 6 aves cada. As dietas experimentais foram formuladas por programação não linear em software livre. O experimento teve duração de 3 ciclos de 28 dias cada e os resultados obtidos foram submetidos à análise de variância. No caso de significância as médias foram comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Para o desempenho das poedeiras e a viabilidade econômica não foram encontrados efeitos para balanço eletrolítico e relação eletrolítica, porém o BE de 280 mEq/kg demostrou os melhores valores. Para qualidade dos ovos observamos diferenças significativas para a relação eletrolítica nos parâmetros de porcentagem de gema e unidade Haugh,... / One metabolic disease that affects the layers hens is the acid-base disturbance. This disorder, which is aggravated by heat stress, consisting of an increase in blood pH, leading to respiratory alkalosis, thus compromising the performance and egg quality. To minimize this problem it is possible to manipulate the diet of the poultry, favoring balance and electrolyte ratio and hence reduce losses, mainly related mortality and fragility of the eggshell, events easily observed decline in layers hens production. Thus, the present study evaluated the effects of manipulation of electrolytes in the diet on the performance, egg quality and economic viability of laying hens in the decline phase of production in high temperature conditions. In the handling of electrolytes considered different electrolyte balance (Na + + K + - Cl - ) and different electrolytic relations [(K + + Cl - ) / Na + ]. 288 laying hens were distributed by a design in random blocks in a factorial 4 x 3 (4 electrolyte balance 140, 210, 280 and 310 mEq/kg x 3 electrolytic relations 2:1, 2.5:1 and 3:1) totaling 12 treatments with four replicates of six poultry each. Experimental diets were formulated by nonlinear programming free software. The experiment lasted for 3 cycles of 28 days each and the results were submitted to analysis of variance. In case of significance, the Tukey test at 5 % probability, compared the means. For the performance of laying and economic viability no effect on electrolyte balance and electrolyte ratio were found, but the BE of 280 mEq / kg demonstrated best values. For egg quality observed significant differences in electrolyte ratio in the parameters of yolk percentage and Haugh unit, and cycle, all parameters where the balance of 140 mEq / kg and 2 compared to 2.5, independent of interactions, demonstrated best indices of egg quality

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-06. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:46:24Z : No. of bitstreams: 1 000845411.pdf: 3451364 bytes, checksum: 80e865130ecdaad0f2b3fd5d563d2863 (MD5) / Salmonella Enteritidis (SE) é responsável pela maioria dos casos de infecções alimentares em seres humanos e, geralmente, está associada ao consumo de produtos de origem avícola. Nas aves, SE coloniza o intestino, podendo sobreviver utilizando como substrato o 1,2 propanodiol (1,2-Pd) disponível neste ambiente, cujo metabolismo é viabilizado pela ação da enzima propanodiol desidratase, codificada por genes do operon pdu. A enzima propanodiol desidratase necessita de cianocobalamina como cofator enzimático, a qual é codificada pelos genes cobS e cbiA. Neste estudo, utilizou-se uma estirpe de SE e duas mutantes, sendo uma com os genes pduC, pduD, pduE defectivos (SE ΔpduCDE) e outra com os genes pduC, pduD, pduE, cobS e cbiA (SE ΔcobSΔcbiAΔpduCDE) inativados, na tentativa de avaliar a importância do 1,2-Pd para a colonização intestinal e invasão de órgãos durante a infecção de aves por SE. No primeiro experimento, estimou-se as quantidades das estirpes em baço, fígado e conteúdo cecal de aves de postura de variedades vermelha e branca. Um segundo ensaio foi realizado para verificação da excreção fecal, por meio de suabes cloacais. Aliado a isso, caracterizou-se a resposta imunológica em aves SPF desafiadas com estirpes de SE acima descritas por meio da avaliação das populações de linfócitos T CD4+ e TCD8+ em fígado e tonsilas cecais e também pela quantificação de genes responsáveis pela expressão das citocinas IL-6, CCL4, CXCLi2 e IL-22 em tonsilas cecais e IL-6 e IL-18 em baço. Observou-se que as estirpes mutantes foram capazes de colonizar o intestino e invadir o baço e fígado da mesma forma que a estirpe selvagem, sendo que as aves de postura de variedade vermelha foram mais susceptíveis a infecção sistêmica. Tanto a estirpe selvagem como as mutantes estimularam o mesmo perfil de resposta imune nas aves SPF. Portanto, os genes pduC, pduD, pduE, cobS e cbiA não são necessários para... / Salmonella Enteritidis (SE) is responsible for majority of the cases of foodborne diseases in humans and usually is associated with the consumption of poultry origin products. In birds, SE colonizes the intestine and can survive using 1,2 propanodiol (1,2-Pd) as substrate. The metabolisation of the 1,2-Pd is possible by the action of propanodiol dehydratase enzyme, encoded by genes pdu operon. Cyanocobalamin, which is encoded by genes cobS and cbiA, is the cofactor required by propanodiol dehydratase. In this study, we used one SE wild type strain and two mutants, one with mutations in pduC, pduD and pduE genes (SE ΔpduCDE) and another with mutations of pduC, pduD, pduE, cobS and cbiA genes (ΔcobSΔcbiAΔpduCDE) in attempt to evaluate the importance of 1,2-Pd for intestinal colonization and invasion of organs during infection of birds. In the first experiment, bacterial counts for all strains were obtained from spleen, liver and cecal content of white and brown varieties of commercial egg-layers. In the second assay, faecal shedding of the strains was assessed by cloacal swabs. Additionaly, immunological responses were characterised by the assessment of T CD4+ and T CD8+ cell populations in liver and cecal tonsils from SPF (Specific Pathogen Free) chicks challenged with the three strains. Complementary transcripts of genes encoding the cytokines IL-6, CCL4, CXCLi2 and IL-22 in cecal tonsils, and IL-6 and IL-18 in liver were obtained for relative quantification by qRT-PCR. It was observed that SE mutant strains were able to colonise the intestine and invade spleen and liver in the same way as the wild type strain. Brown variety of birds was more susceptible to systemic infection than white birds. Furthermore, the immune response profiles triggered by the SE wild type and the two mutants in SPF chicks were very similar. Therefore, data for the present study suggest that pduC, pduD, pduE, cobS e cbiA genes would not be essencial to ...

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-03Bitstream added on 2014-08-13T18:00:25Z : No. of bitstreams: 1 000759978.pdf: 3044978 bytes, checksum: 9f473a1b86cb80664b6c1dbec2f5f431 (MD5) / O tifo aviário é uma doença sistêmica provocada por Salmonella enterica subsp. enterica sorovar Gallinarum biovar Gallinarum (SG), bactéria que não possui flagelos. Acredita-se que por não produzir flagelos, SG seria pouco reconhecido pelo sistema imune. Deste modo provocaria inflamação de menor intensidade na mucosa, atravessando as barreiras intestinais com mais facilidade e assim desencadeando enfermidade sistêmica severa. Com intuito de investigar essa hipótese, em estudo prévio, construiu-se um mutante de SG capaz de produzir flagelos (SG Fla+) o qual desencadeou resposta imune pro-inflamatória em células de cultivo, além de ter sido menos patogênico para as aves que a estirpe selvagem de SG. No entanto, notou-se que SG Fla+ tende a interromper a produção de flagelos após dois ou mais cultivos consecutivos em meio sólido, tornando-se fenotipicamente aflagelado (SG Fla-). O presente estudo teve por objetivo comparar a patogenicidade de SG Fla+, SG Fla- e SG para aves susceptíveis ao tifo aviário. No primeiro experimento, as taxas de mortalidade provocadas pelas estirpes e excreção fecal das mesmas foram avaliadas. Enquanto que no segundo ensaio, avaliou-se a capacidade de colonização cecal, invasão das estirpes em fígado e baço e ainda a presença e intensidade de lesões macro e microscópicas em órgãos. SG Fla+ provocou mortalidade inferior às estirpes aflageladas, quando utilizou-se o inóculo diluído (106 UFC). Os resultados da excreção fecal demonstram que SG Fla+ foi a estirpe mais excretada. Pôde-se observar que SG e SG Fla- foram recuperadas do conteúdo cecal em quantidades mais elevadas que SG Fla+. SG e SG Fla- foram isoladas mais cedo e em maiores quantidades que SG Fla+ em fígado e baço. No fígado verificou-se hepatomegalia, degeneração, congestão, alterações na coloração (amarelo-esverdeado a esverdeado), reatividade linfoide ... / The fowl typhoid is a systemic disease of chickens caused by Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum biovar Gallinarum (SG), a microorganism that does not produce flagella. It is suggested that due to the absence of flagella SG is poorly recognized by the bird immune system. As a result, just a mild inflammation is induced in the gut mucosa, favoring the development of a severe systemic infection. In order to investigate this hypothesis, in a previous study, a mutant of SG capable of producing flagella (SG Fla+) was constructed. This mutant was able to trigger mRNA pro-inflammatory cytokines e chemokines in cultured cells and was less pathogenic to birds than the wild type strain. However, it was noticed that SG Fla+ trends to stop flagella production after culturing two or more times on solid medium, becoming non-flagelated (SG Fla-). The present study aimed at comparing the pathogenicity of SG Fla+, SG Fla- and SG to birds. In the first experiment, mortality rates caused by strains and fecal excretion were evaluated. In the second assay, the ability of strains in colonizing the ceca and invading liver and spleen were compared. In addition to this, the presence and intensity of macroscopic and microscopic lesions in organs were evaluated. When inoculated in the lower amount (106 CFU) SG Fla+ provoked less mortality than the non-flagellate strains. The results of fecal excretion indicate that SG Fla+ was more excreted than the other strains. It was observed that SG and SG Fla- were recovered from cecal contents in higher amounts than SG Fla+. SG Fla- and SG were isolated earlier and in higher amounts from liver and spleen. In the liver degeneration, congestion, changes in color (greenish-yellow to greenish), lymphoid reactivity and multifocal areas of necrosis were noticed. Spleen was enlarged and congested; foci of necrosis in the white pulp and lymphoid depletion were also ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:53Z : No. of bitstreams: 1 000791427.pdf: 858212 bytes, checksum: 73468dc580b32c2569a024a91ace55d2 (MD5) / O objetivo do presente trabalho foi avaliar a acurácia de predição dos valores genéticos genômicos para características de diferentes herdabilidades, em populações simuladas de aves com diferentes níveis de endogamia. Os dados fenotípicos e genotípicos foram simulados com base na estrutura populacional de uma população experimental de aves poedeiras. Foram simulados os fenótipos e os genótipos de aves para características de taxa de postura total de ovos (PTO) e peso dos ovos as 32 semanas de idade (PO), com herdabilidades de 0,15 e 0,37 respectivamente. Foi simulada uma população histórica a fim de gerar desequilíbrio de ligação na população e esta deu origem as populações recentes em que foram simulados três cenários populacionais, visando maximizar (REC1), minimizar (REC2) e aleatorizar (REC3) os acasalamentos endogâmicos. Ao longo de 10 gerações recentes, os animais foram selecionados com base nos maiores valores genéticos preditos (VGP), utilizando o BLUP (best linear unbiased prediction) tradicional. O genoma das aves foi simulado ao longo dos 958 Mb do genoma Gallus gallus 4.0 com 3.747 QTL (loci de caracteres quantitativos) aleatoriamente distribuídos e 49.978 marcadores SNP uniformemente distribuídos. A fim de alterar as frequências alélicas e gerar variabilidade genética ao longo das gerações, foram simulados eventos de deriva genética, taxa de recombinação e mutação recorrente. Para avaliar os efeitos da endogamia nas populações recentes, foram calculados os desequilíbrios de ligação (DL), o tamanho efetivo da população (Ne) e as tendências genéticas em todos os cenários de populações recentes em ambas as características simuladas. Para predizer os valores genéticos genômicos preditos (VGGP), as populações recentes foram subdivididas em populações de treinamento e validação. Nas subpopulações de treinamento, os 960 animais ... / The objective of this study was to evaluate the prediction accuracy of genomic breeding values for traits of different heritability in simulated populations with different inbreeding. Phenotypic and genotypic data were simulated based on the population structure of an experimental population of White Leghorn hens at Embrapa Suínos e Aves. The phenotypes and genotypes were simulated for the rate of total egg production (PTO) and egg weight to 32 weeks of age (PO) with heritability of 0.15 and 0.37, respectively. The historical population was simulated to generate linkage disequilibrium in the population. Three scenarios in recent populations were simulated for each trait: REC1, REC2 and REC3 to maximize inbreeding, minimize inbreeding and random mating, respectively. The animals were selected based on the largest breeding values along 10 generations. The genome of the birds was simulated with eight macro-chromosomes and 19 micro-chromosomes with 3.747 QTL randomly distributed and 49.978 SNPs markers evenly spaced along the 958 cM. Recombination, random drift and recurrent mutation were simulated in order to generate genetic variability. The linkage disequilibrium (LD), effective population (Ne) and genetic trends were calculated for all scenarios. Each recent population was divided in training and validation sets In order to predict the genomic breeding values. The training set included the genotypes and phenotypes of 960 animals, which had higher breeding values’ accuracy. The validation set had 1120 animals of the last generation of the recent population. The average inbreeding ranged from 0.06 ± 0.30 to 0.22 ± 0.12 for PTO and 0.05 ± 0.03 to 0.20 ± 0.12 for PO. The REC1 populations had higher inbreeding along generations compared, both for PTO and PO, compared to REC2 and REC 3, and consequently higher level of LD. The highest accuracy for PTO and PO were ...

Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-23Bitstream added on 2015-01-26T13:30:32Z : No. of bitstreams: 1 000797009.pdf: 866532 bytes, checksum: b5f097eddd5228ec546977ffbbc583aa (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como “Criticamente em Perigo” no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ... / Small populations are more susceptible to genetic drift and inbreeding effects which, generally, can be associated to loss of genetic variability. Low levels of genetic diversity can result in severe effects in the individuals, as fertility alterations and capability of adaption to environmental changes. Although these factors can, in turn, increase the risk of extinction, gene flow may balance these effects, maintaining the genetic variability and reducing genetic divergences among populations. Therefore, it is essential to understand intra and inter population genetic data, in order to conserve threatened species. Molecular markers, such as microsatellites and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), are reliable tools for assessing levels of genetic variability and patterns of gene flow in populations and have been widely used to analyze target species on conservation programs. The São Paulo marsh antwren (Formicivora paludicola) is a small bird restricted to marshes of Atlantic Forest that was recently described in the metropolitan region of São Paulo city. It occurs in 15 isolated localities spread on High Tietê and Paraíba do Sul River basins and, especially due to its habitat destruction, it is already considered as Critically Endangered in São Paulo State. Priorities actions for this species' conservation include genetic studies to establish the monitoring and management of natural populations. Therefore, the present study aimed to evaluate the genetic variability levels and the gene flow patterns of two populations of F. paludicola in order to support future conservation strategies for the species. As so, we analyzed 9 species-specific microsatellite loci and 8 additional heterologous loci, and also 1.227 SNPs loci that were developed by a RAD-seq (Restriction-site Associated DNA sequencing) approach. A total of 44 animals were collected in two marsh areas near Mogi das Cruzes city (MC) (N = 26) and Salesópolis city (SL) ... / FAPESP: 12/09105-7

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2017. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-03-16T16:08:57Z No. of bitstreams: 1 2017_MarcelaCostaFerreira.pdf: 1843650 bytes, checksum: c132a340b8476e032d0959eca1cae9c6 (MD5) / Approved for entry into archive by Ruthléa Nascimento(ruthleanascimento@bce.unb.br) on 2017-03-27T16:11:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_MarcelaCostaFerreira.pdf: 1843650 bytes, checksum: c132a340b8476e032d0959eca1cae9c6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-27T16:11:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_MarcelaCostaFerreira.pdf: 1843650 bytes, checksum: c132a340b8476e032d0959eca1cae9c6 (MD5) / No presente estudo, a ocorrência do pardal Passer domesticus (Linnaeus, 1758) e dois dos seus parâmetros reprodutivos foram avaliados com dois objetivos principais: i) preencher algumas lacunas existentes no que refere à ocorrência do P. domesticus nos municípios brasileiros; ii) avaliar como a variação latitudinal e o fato de ser exótico ou nativo, interfere nos parâmetros reprodutivos (tamanho de ninhada e data da postura) do pardal em escala mundial. Todos os dados obtidos foram checados e georreferenciados em software adequado. No capítulo 1, o mapa de ocorrência da espécie no Brasil apontou uma ocupação superior do P. domesticus nos dias atuais, comparado aos estudos de ocupação da década de 90 e aos limites estabelecidos atualmente pela IUCN Red List. No capítulo 2 foi testada a hipótese de que as aves alteram seus parâmetros reprodutivos em resposta às características ambientais dos locais invadidos. Em áreas nativas, o tamanho de ninhada em regiões temperadas (4,6±0,04; n=766) foi maior do que o tamanho de ninhada em regiões tropicais (3,5±0,14; n=71). O mesmo padrão ocorreu entre regiões introduzidas temperadas do norte (4,8±0,03; n=1003) e regiões introduzidas tropicais (3,3±0,22; n=24). Tamanho de ninhada foi semelhante entre regiões temperadas nativas e introduzidas, assim como entre regiões tropicais nativas e introduzidas. Para os registros do hemisfério norte, foi observada uma tendência latitudinal de tamanho de ninhada que independe da espécie ser nativa ou introduzida (p=0,203). Portanto, as diferenças climáticas entre regiões temperadas e tropicais tiveram um efeito maior sobre o tamanho de ninhada do que o local (nativo vs. introduzido). Quando data da postura foi a variável resposta do modelo, foi encontrado um gradiente latitudinal de data da postura, porém não foi possível avaliar o efeito de ser exótico ou nativo sobre o período reprodutivo, devido à insuficiência de registros de data da postura na região tropical. / In the present study, the occurrence of the House Sparrow Passer domesticus (Linnaeus, 1758) and two of its reproductive parameters were evaluated with two main objectives: i) to fill some existing gaps regarding the occurrence of P. domesticus in Brazilian municipalities; ii) to evaluate how latitudinal variation and the fact of being exotic or native, interferes in the reproductive parameters (clutch size and laying date) of the House Sparrow worldwide. All data was checked and georeferenced in suitable software. In chapter 1, the occurrence map of the specie in Brazil indicated a higher occupation of P. domesticus nowadays compared to the occupation studies of the 1990s and the limits established nowadays by the IUCN Red List. In chapter 2 it was tested the hypothesis that birds change their reproductive parameters in response to environmental characteristics of the invaded sites. In native areas, clutch size in temperate regions (4.6±0.04; n=766) was greater than clutch size in tropical regions (3.5±0.14; n=71). The same pattern occurred between north temperate introduced regions (4.8±0.03; n=1,003) and tropical introduced regions (3.3±0.22; n=24). Clutch size was similar between native and introduced temperate regions, as well as between native and introduced tropical regions. For north hemisphere records, a latitudinal trend of clutch size was observed regardless of whether the species was native or introduced (p = 0.203). Therefore, climatic differences between temperate and tropical regions had a greater effect on clutch size than locality (native vs. introduced). When laying date was the response variable of the model, a latitudinal gradient of laying date was found, but it was not possible to evaluate the effect of being exotic or native over the reproductive period, due to insufficient records of laying date in tropical region.

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais. / In the southern state of Santa Catarina, the native forests are extremely fragmented mainly due to farming activities and disordered urbanization, which resulted in increasing isolation of remnants. The effects of anthropic pressure and forest fragmentation on avifauna are alarming and result in an increased vulnerability of birds to become extinct. This study was conducted in a forest remnant of rainy dense forest from lowlands, in the city of São João do Sul, southern Santa Catarina, with the aim to identify the birds species present in the fragment and their food behavior. Observations were carried out fortnightly in five transects of 12 meters in length at the edge and five transects of 12 meters inside the fragment (seven hectares), randomly in a radius of 200 meters which was set in the surroundings of the remnant and during the checking of mist nets, summarising 184 hours of observations during 12 months. It has been recorded 112 species belonging to 95 genera and 39 families, ten endemic species of the Atlantic Rainforest, four endemic in Brazil and five migratory species. The families Tyrannidae (21 species), Icteridae (6 species) and Falconidae, Columbidae, Cuculidae, Picidae and Embezidae, all of them with five species, were the most representative in the remnant. The trophic structure of the avifauna observed has demonstrated prevalence of the insectivorous guild (48 species) and frugivorours had the lowest number of species (two species). The environment mostly used by species was the forest edge with 69 species. The studied area has a great importance for the regional avifauna, due to the presence of endemic species of the Atlantic Rainforest, country's endemic species and migratory species, which makes it conservation extremely important. / No sul do Estado de Santa Catarina, as florestas nativas encontram-se extremamente fragmentadas devido, principalmente, às atividades de agricultura e a urbanização desordenada, que vem acarretando no crescente isolamento dos remanescentes. Os efeitos da pressão antrópica e da fragmentação florestal sobre a avifauna são alarmantes, tornando muitas espécies ameaçadas de extinção. Este estudo foi realizado em um fragmento florestal de Floresta Ombrófila Densa das Terras Baixas, no município de São João do Sul, sul de Santa Catarina, com o objetivo de identificar as espécies de aves presentes no fragmento e seus hábitos alimentares. Foram realizadas observações quinzenais em cinco transectos de 12 metros de comprimento na borda e cinco transectos de 12 metros de comprimento no interior do fragmento (sete hectares), juntamente com as observações ao acaso em um raio de 200 metros que foi estipulado no entorno do fragmento e com as observações feitas durante as checagens das redes, totalizando 184 horas de observações durante 12 meses. Foram registradas 112 espécies pertencentes a 95 gêneros e 39 famílias, dez espécies endêmicas da Mata Atlântica, quatro endêmicas do Brasil e cinco espécies migratórias. As famílias Tyrannidae (21 espécies), Icteridae (seis espécies) e Falconidae, Columbidae, Cuculidae, Picidae e Embezidae, todas com cinco espécies cada, foram as mais representativas no fragmento. Os insetívoros representaram à categoria trófica mais representativa (48 espécies) e os frugívoros tiveram o menor número de espécies registradas (duas espécies). O ambiente mais utilizado pelas espécies foi a borda do fragmento com 69 espécies. A área estudada tem uma grande importância para a avifauna regional, devido à presença de espécies endêmicas da Mata Atlântica, espécies endêmicas do país e espécies migratórias, sendo de suma importância sua conservação.

Made available in DSpace on 2018-07-27T17:13:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-26. Added 1 bitstream(s) on 2018-07-27T17:16:50Z : No. of bitstreams: 1 000896530.pdf: 1247131 bytes, checksum: 90a809a7c96491236e1baee70a3e7161 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A regulação da temperatura corpórea dos endotérmicos envolve ajustes na taxa de troca de calor entre o animal e o ambiente. Um destes mecanismos consiste na modulação da temperatura superficial de áreas específicas do corpo via ajustes vasomotores para promover conservação ou dissipação do calor corpóreo. Este ajuste termorregulatório é fundamental para manutenção da temperatura corpórea ao longo de uma faixa de temperatura moderada, denominada Zona de Neutralidade Térmica (ZNT), sem aumento da taxa metabólica (TM). As janelas térmicas, regiões do corpo pouco isoladas e altamente vascularizadas, são muito eficientes na dissipação de calor corpóreo através desse mecanismo. O bico do tucano-toco (Ramphastos toco) foi descrito como uma janela térmica altamente eficiente, atuando de forma muito relevante na homeostase térmica dessa ave. Por isso, é possível que os ajustes na troca de calor através do bico desempenhem um papel central na delimitação da ZNT desta ave. Portanto, o objetivo do presente trabalho foi determinar a contribuição das trocas de calor através do bico de R. toco nos limites superior e inferior da ZNT. Para tal, medimos a taxa metabólica dos tucanos ao longo de uma faixa de temperatura ambiente de 0 a 35°C (a cada 5°C). As medições de TM foram feitas com o bico em sua condição intacta (grupo controle) e, posteriormente, com o bico isolado artificialmente (grupo experimental). O limites da ZNT, 9,5 - 25,0°C para o grupo controle e 10,8 - 23,3°C para o grupo experimental, não diferiram entre os tratamentos. A TM diferiu entre os tratamentos somente sob temperaturas elevadas (30 a 35°C), atingindo valores de 0,97 mlO2.g-1.h-1 (±0,06) para o grupo controle e 1,20 mlO2.g-1.h-1 (±0,07) para o grupo experimental a 35°C. Estes resultados indicam que, sob temperaturas elevadas, o isolamento do bico comprometeu as trocas de calor com ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Body temperature regulation in endotherms involves adjustments in heat exchange rates between the animal and the environment. One of those mechanisms include the modulation of the surface temperature of specific areas of the body through vasomotor adjustment promoting dissipation or conservation of body heat. This thermoregulatory adjustment is essential for maintenance of body temperature over a moderate temperature range, known as thermal neutral zone (TNZ), without increasing the metabolic rate (MR). Thermal windows are body regions poorly insulated and highly vascularized that are particularly efficient for heat dissipation through that mechanism. The beak of the toco-toucan (Ramphastos toco) was described as a highly efficient thermal window, assisting the thermal homeostasis of this bird. Therefore, is possible that the heat exchange adjustments through the beak have an important role on delimitation of TNZ. Hence, our goal in this study was to determinate the contribution of heat exchanges through de beak of R. toco on the amplitude and limits (lower and upper) of TNZ. For that, we measured metabolic rate, through oxygen consumption, over a range of ambient temperature from 0 to 35°C (every 5°C). MR measurements were made in birds with the beak intact (control group) and subsequently with the beak artificially insulated (experimental group). The limits of TNZ, 9.5-25.0°C for the control group and 10.8-23.3°C for the experimental group, did not differ between the treatments. MR differed among treatments only at elevated temperatures (30 and 35°C), reaching values of 0.97 mlO2.g -1.h-1 (± 0.06) for the control group and 1.20 mlO2.g -1.h-1 (± 0.07) for the experimental group at 35°C. These results indicate that under high temperatures, the insulation of the beak compromised the heat exchange with the environment, so the MR increased above normal to dissipate ... (Complete abstract click electronic access below)