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Caracterização anatômica da organogênese in vitro e transformação genética via Agrobacterium tumefaciens em Citrus sp. / Anatomical analysis of in vitro organogenesis and Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation in Citrus sp.

Almeida, Weliton Antonio Bastos de 28 October 2002 (has links)
A transformação genética vem sendo, cada vez mais, incorporada em programas de melhoramento genético de diversas espécies. Esta técnica permite a incorporação de gene(s) exógeno(s) no genoma das plantas, modificando características específicas. Assim, apresenta-se como uma importante ferramenta de auxílio ao melhoramento convencional de citros, que possui uma série de limitações impostas pela sua biologia reprodutiva. Entretanto, a transformação genética requer o estabelecimento prévio de sistemas de regeneração de plantas in vitro como requisito essencial para sua execução. Portanto, o objetivo deste trabalho foi estabelecer as condições de cultivo in vitro para organogênese e transformação genética de laranja 'Hamlin', laranja 'Pera', laranja 'Valência', laranja 'Natal' (Citrus sinenis L. Osbeck) e limão 'Cravo' (Citrus limonia L. Osbeck), realizando-se a caracterização anatômica do processo. Buscou-se, inicialmente, otimizar o processo de organogênese e regeneração de plantas in vitro, a partir de segmentos de epicótilo. Explantes foram introduzidos em meio de cultura MT suplementado com BAP, nas concentrações 0,0; 0,5; 1,0; 1,5; 2,0; 2,5; 3,0; 3,5; 4,0 ou 4,5 mg.L -1 . Avaliaram-se o percentual de explantes responsivos e o número de brotações maiores ou iguais a 1,0 cm por explante responsivo. As brotações obtidas foram transferidas para meios de enraizamento, que se constituíram do MT + 1,0 mg.L -1 de NAA, MT + 1,0 mg.L -1 de IBA e MT na ausência de auxina. A concentração de BAP que melhor favoreceu a indução da organogênese foi 1,0 mg.L -1 para as laranjas doces e 0,5-2,5 mg.L -1 para o limão 'Cravo'. O meio de enraizamento com melhor resposta foi o MT + 1,0 mg.L -1 de IBA, para todos os cultivares estudados. Procedeu-se análise anatômica da organogênese in vitro, nas condições ótimas obtidas no trabalho anterior. As gemas adventícias tiveram origem endógena, formando-se a partir de zonas meristemáticas do câmbio vascular, caracterizando-se em organogênese direta. Desenvolveram-se, também, experimentos para estudar a transformação genética, via Agrobacterium, em segmentos de epicótilo de laranja 'Natal', laranja 'Valência' e limão 'Cravo'. Neste caso, estudou-se o tempo de inoculação com Agrobacterium, o período de co-cultivo, a utilização de acetoseringona e a temperatura de incubação durante o co-cultivo e o seccionamento do explante. Plantas transgênicas foram obtidas utilizando-se um período de inoculação de 20 minutos com Agrobacterium tumefaciens (EHA-105), co-cultivo por 3 dias na ausência de acetoseringona no meio de cultura e temperatura de co-cultivo de 23-27 °C. Finalmente, desenvolveu-se um estudo da indução da organogênese, análise histológica e transformação genética, a partir de segmentos internodais de plantas adultas das laranjas 'Hamlin', 'Pera', 'Valência' e 'Natal'. A organogênese foi induzida em meio de cultura DBA3, modificado, suplementado com 1,0 mg.L -1 de BAP e 0,5 mg.L -1 de NAA. Em função dos cortes histológicos concluiu-se que as gemas adventícias formaram-se na superfície do calo, o qual originou-se de sucessivas divisões celulares do câmbio, caracterizando-se em organogênese indireta. Plantas transgênicas de tecido adulto de laranja 'Hamlin' e laranja 'Valência' foram obtidas utilizando-se um dia de co-cultivo a 24 ºC, com ou sem o seccionamento do explante para Hamlin e apenas com o seccionamento do explante para Valência. / Genetic transformation has been more frequently associated with conventional genetic breeding programs of different species. It allows for the introduction of exogenous gene(s) into the plant genome, with the possibility of altering specific characteristics. Thus, it can be an important tool for Citrus conventional breeding programs, which present several limitations imposed by the characteristics of the reproductive biology of this genus. For the success of the transformation system, however, the previous establishment of an efficient in vitro regeneration system is required. The objective of this research was to define in vitro culture conditions for the organogenesis and genetic transformation of Hamlin, Pera, Valencia and Natal sweet oranges (Citrus sinensis L. Osbeck) and Rangpur lime (Citrus limonia L. Osbeck) with the anatomical characterization of the process. Initially, the optimization of the in vitro organogenesis process and plant recovery was attempted using epicotyl segments as explants. For organogenesis induction, the explants were placed in MT culture medium supplemented with BAP (0.0; 0.5; 1.0; 1.5; 2.0; 2.5; 3.0; 3.5; 4.0 or 4.5 mg.L -1 ). The percent of responsive explants and the number of adventitious shoots per explant (> 1.0 cm) were evaluated. The shoots were transferred to rooting media, consisting of MT medium supplemented with NAA or IBA, or absence of auxin. The best BAP concentration for organogenesis induction was 1.0 mg.L -1 for the sweet oranges and between 0.5 and 2.5 mg.L -1 for Rangpur lime. The best rooting medium was MT with 1.0 mg.L -1 IBA for all the cultivars. Anatomical analysis was done to describe the optimized culture conditions. Adventitious buds originated endogenously from meristematic regions of the vascular cambium, characterizing a direct organogenesis. Studies were also done to analyze the genetic transformation of the sweet orange cultivars Natal and Valencia and Rangpur lime via Agrobacterium. Several experiments were installed to define the period of Agrobacterium inoculation and co-cultivation, the presence or absence of acetoseryngone, the temperature of incubation and the explant condition (with or without a longitudinal cut). Transgenic plants were obtained using an inoculation period of 20 minutes and co-cultivation for 3 days at 23-27 °C in absence of acetoseryngone in the culture medium. Finally, a study of organogenesis induction, histological characterization and genetic transformation from internodal segments of mature plants of sweet orange cultivars Hamlin, Pera, Valencia and Natal was conducted. Organogenesis was induced in DBA3 modified medium supplemented with 1.0 mg.L -1 BAP and 0.5 mg.L -1 NAA. Histological analysis showed that the adventitious buds formed indirectly from the callus formed by successive cell divisions from the vascular cambium. Transgenic plants from mature tissue of Hamlin and Valencia sweet oranges were obtained using one day of co-cultivation at 24°C with or without the longitudinal sectioning of the explant for Hamlin and only when the explant was longitudinally sectioned for Valencia.
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Utilização de melaço como fonte de carbono em cultivo do camarão branco do Pacífico Litopenaeus vannamei (Boone,1931) sem renovação de água e sob diferentes relações carbono/nitrogênio

LIMA, João Paulo Viana de 27 April 2007 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-14T15:59:47Z No. of bitstreams: 1 Joao Paulo Viana de Lima.pdf: 751024 bytes, checksum: 12aea5280a52c50190be7cbe5d4985dc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T15:59:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joao Paulo Viana de Lima.pdf: 751024 bytes, checksum: 12aea5280a52c50190be7cbe5d4985dc (MD5) Previous issue date: 2007-04-27 / The accumulation of toxic nitrogenous compounds in the water is a common problem to aquaculture systems. Recent works have showed good results in terms of production and nitrogen retention efficiency, through the addition of organic carbon source (sugar, molasses, etc). This work investigated the effect of molasses addition in different C:N ratios on the water quality, microbial activity and production, in semi-intensive experimental culture tanks of Litopenaeus vannamei with no water exchange. Four treatments and three replicates were adopted, which three with daily molasses addition in 5, 10 and 15:1 C:N ratio and one control with no carbon source addition. Twelve 500 L fiber glass tanks were stocked with 25 shrimps.m-2 (1.90±0.37 g). Shrimps were fed with a 35% crude protein commercial diet offered in feeding trays at 08:00 and 16:00. Phytoplankton, bacteria and water samples were collected fortnightly during the culture. The 15:1 and 10:1 C:N ratios showed lower (P<0.05) oxygen dissolved levels (4.64 and 4.76 mg L-1, respectively) which is related with the major organic carbon supply in these ratios. Molasses addition resulted in lower (P<0.05) nitrogenous compounds levels (nitrite and nitrate), as well reducing in the cianobacteria densities in the C:N 10 and 15:1 treatments. No significant differences (P≥0.05) were found in Vibrio spp, autotrophic and heterotrophic bacterial densities. Shrimp final weight (~12.3 g)and weigth gain (~1.04 g.week-1) in high C:N ratios (10:1 and 15:1) were higher (P<0.05) than in the others treatments. Specific growth rate was high in all treatments (2.53 to 2.69 % day-1), but the 10:1 ratio was higher than the control. Yield values ranged from 267.4 to 301.0 g m-2 with no significant difference (P≥0.05) among treatments. This study shows that the molasses can be used as carbon source in order to increase C:N ratio, improving the water quality and the L. vannamei semi-intensive culture performance with no water exchange. / O acúmulo de formas tóxicas de compostos nitrogenados na água é um grande problema para os sistemas aqüícolas. Pesquisas recentes têm demonstrado resultados satisfatórios em termos de produção e eficiência de retenção do nitrogênio, através da adição de fontes de carbono orgânico (açúcar, melaço, etc.). O presente estudo investigou o efeito da adição de melaço em diferentes relações C:N sobre a qualidade da água, atividade microbiana e a produção semi-intensiva do camarão Litopenaeus vannamei, em tanques de cultivo experimental sem renovação de água. Foram adotados quatro tratamentos e três réplicas, sendo três com aplicação diária de melaço nas relações C:N 5, 10 e 15:1, e um controle, sem aplicação desta fonte de carbono. Foram utilizados 12 tanques em fibra de vidro (500 L), estocados com 25 camarões.m-2 (1,90±0,37 g). A alimentação constou de ração comercial com 35% de proteína bruta e foi ofertada diariamente em bandejas às 8 e 16h. Coletas de água para análise química e de material biológico (fitoplâncton e bactérias) foram realizadas quinzenalmente ao longo do cultivo. As relações 15:1 e 10:1 apresentaram os menores (P<0,05) níveis de oxigênio dissolvido (4,64 e 4,76 mg L-1, respectivamente) que está relacionado ao maior aporte de carbono orgânico nestas relações. O melaço reduziu significativamente (P<0,05) as concentrações dos compostos nitrogenados, nitrito e nitrato, bem como reduziu as densidadesde cianobactérias nos ambientes com relações C:N de 10 e 15:1. Nenhum efeito (P≥0,05) foi observado em relação às bactérias autotróficas, heterotróficas e Vibrio spp. O peso final dos camarões (~12,3 g) e o ganho de peso individual (~1,04 g.semana-1), nas relações C:N mais altas (10:1 e 15:1), foram superiores (P<0,05) aos demais tratamentos. A taxa de crescimento específico foi elevada em todos os tratamentos (2,53 a 2,69 % dia-1), entretanto os indivíduos na relação 10:1 foi superior (P<0,05) ao controle. Os valores de produção variaram de 267,4 a 301,0 g m-2, e não foram diferentes estatisticamente (P≥0,05) entre os tratamentos. O melaço pode ser utilizado como fonte de carbono para incrementar a relação C:N, melhorando a qualidade da água e os níveis de produtividade em cultivo semi-intensivo de L. vannamei sem renovação de água.
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Morfofisiologia de isolados de rizóbios de fabáceas forrageiras do semiárido pernambucano

DIAS, Suelane de Melo 27 February 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-02-20T12:53:49Z No. of bitstreams: 1 Suelane de Melo Dias.pdf: 1653730 bytes, checksum: 9a680e841961b44f37985e8341a0bd0a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T12:53:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Suelane de Melo Dias.pdf: 1653730 bytes, checksum: 9a680e841961b44f37985e8341a0bd0a (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study aimed to characterize Morphophysiologically native Rhizobia of Fabaceae forage Caatinga, Mimosa tenuiflora (Willd) Poiret, (Jurema preta), Macroptilium atropurpureum (OC.) Urb (Siratro) and Desmanthus pernambucanus (L.) Thellung (jureminha) in selected soils in areas of Caatinga located in the municipalities of Sertânia, Arcoverde and São Bento do Una- Pernambuco. Soil samples were collected at random in three areas in profile 0 to 20 cm depth, designed for the planting of Fabaceae, with the purpose of producing nodules. After obtaining the nodules and replication of the bacteria in the laboratory colonies were characterized as the time of growth and cultural characteristics of Rhizobia isolates. Tests were also made in vitro tolerance of Rhizobia isolated in different variations in salinity, temperature and pH. Based on physiological data we calculated the diversity indices, evenness, dominance and species richness, then dendrograms generated by the UPGMA algorithm. In cultural evaluation revealed that the isolates showed the hallmarks of flat lifting colonies, low to moderate production of exopolysaccharides, color ranging from white to cream and smooth surface in accordance with each individual. Physiological tests of the abiotic stress resistance showed that the natives isolated from Mimosa tenuiflora were more resistant when grown in soils from the municipality of Sertânia and isolates Macroptilium atropurpureum and Desmanthus pernambucanus had high resistance to high temperatures, regardless of place of farming. For Species diversity analysis can be seen that the Caatinga area evaluated in São Bento do Una showed lower species diversity. Native rhizobia in the areas of collections in Pernambuco semiarid feature high resistance to abiotic stress caused by temperatures up to 40 °C, variations in salinity and pH. / Objetivou-se caracterizar morfofisiologicamente rizóbios nativos das fabáceas forrageiras, Mimosa tenuiflora (Willd) Poiret, (Jurema preta), Macroptilium atropurpureum (OC.) Urb (Siratro) e Desmanthus pernambucanus (L.) Thellung (Jureminha), em áreas de Caatinga localizadas nos municípios de Sertânia, Arcoverde e São Bento do Una no Estado de Pernambuco. Foram coletadas amostras de solo nas três áreas no perfil de 0 a 20 cm de profundidade, destinadas para o plantio das fabáceas, com o propósito de produção de nódulos. Após a obtenção dos nódulos e replicação das bactérias em laboratório as colônias foram caracterizadas quanto ao tempo de crescimento e características culturais dos isolados. Também foram feitos testes de tolerância, in vitro, com diferentes variações de salinidade, temperatura e pH. Baseados nos dados fisiológicos foram calculados os índices de diversidade, equitabilidade, dominância e riqueza de espécies, em seguida gerados dendrogramas pelo algoritmo UPGMA. Na avaliação cultural observou-se que os isolados formaram colônias com elevação plana, moderada produção de exopolissacarídeos, coloração variando de creme a branca e superfície lisa de acordo com cada isolado. Os testes fisiológicos de resistência a estresses abióticos mostraram que os isolados nativos de Mimosa tenuiflora foram mais resistentes quando cultivados nos solos provenientes do município de Sertânia e que os isolados de Macroptilium atropurpureum e Desmanthus pernambucanus tiveram elevada resistência a altas temperaturas, independente do local de cultivo. A área de Caatinga avaliada em São Bento do Una apresentou menor diversidade de espécies em relação às demais áreas. Os rizóbios nativos das áreas de coletas no Semiárido pernambucano apresentam elevada resistência ao estresse abiótico causado por temperaturas até 40 °C, variação na salinidade e pH.
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Lesões anatomopatológicas associadas à ocorrência de bacterioses em tilápias (Oreochromis niloticus) de diferentes sistemas de cultivo em Pernambuco/Brasil

PEDROSA, Virgínia Fonseca 27 August 2009 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-22T16:50:48Z No. of bitstreams: 1 Virgina Fonseca Pedrosa.pdf: 303865 bytes, checksum: 420df1fdf37bd4dee6c57213ba1e8f55 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T16:50:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Virgina Fonseca Pedrosa.pdf: 303865 bytes, checksum: 420df1fdf37bd4dee6c57213ba1e8f55 (MD5) Previous issue date: 2009-08-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The use of methods for identification of agents etiológicos represents an important tool to diagnose illnesses and consequently, to try to minimize the losses caused by the agent's permanence in the fish farmings. In this sense, it was aimed at to associate the lesions anatomopathological with the diversity of bacterias found in collected tilápias of different cultivation systems in Pernambuco. 58 tilápias samples were collected in the summertime period and rainy, that were submitted to analyses anatomopathological and bacteriological, having been observed the occurrence of Aeromonas spp. (29,3%), Vibrio spp. (41,4%) and enterobactérias of the goods Klebsiella spp. (17,2%), Leminorella spp. (1,7%), Obesumbacterium spp. (5,2%), Proteus spp. (1,7%), Providencia spp. (19%), Salmonella spp. (1,7%), Shigella spp. (1,7%) and Taturnella spp. (14%). A significant dependence was detected (p <0,05) of the lesions anatomopathological, with the identified bacterias, as anemic gills, necrosis in the liver and infiltrated eosinofílico in the liver in the animals with Aeromonas spp, lesions in the corporal surface and he/she atrophies in the spleen in the cases with víbrios, lesions in the fins, myocarditis, necrosis in the liver and in the pancreas and infiltrated inflammatory in the liver they were observed in the cases in that enterobactérias of different genders were involved, could be attributed to the unbalance in the atmosphere, contributing in the susceptibilidade of the animals front to these agents opportunists, also existing the possibility of they be associated to the concomitant presence of Aeromonas spp, once there was a significant correlation (p <0,05) in the enterobactérias occurrence and Aeromonas spp. It was verified, through mathematical modelling, that the coming animals of cultivation farms in tank-net, as well as the ones that possess larger corporal total lengths, they presented a better weight earnings. / A utilização de métodos, para identificação de agentes etiológicos, representa uma importante ferramenta para diagnosticar enfermidades e, consequentemente, tentar minimizar as perdas nas pisciculturas. Neste sentido, objetivou-se associar as lesões anatomopatológicas com a diversidade de bactérias encontradas em tilápias coletadas de diferentes sistemas de cultivo em Pernambuco. Foram coletadas 58 amostras de tilápias no período de estio e chuvoso, que foram submetidas à análises anatomopatológicas e bacteriológicas, tendo sido observada a ocorrência de Aeromonas spp. (29,3%), Vibrio spp. (41,4%) e enterobactérias dos gêneros Klebsiella spp. (17,2%), Leminorella spp. (1,7%), Obesumbacterium spp. (5,2%), Proteus spp. (1,7%), Providencia spp. (19%), Salmonella spp. (1,7%), Shigella spp. (1,7%) e Taturnella spp. (14%). Detectou-se uma dependência significativa (p < 0,05) das lesões anatomopatológicas, com as bactérias identificadas, como brânquias anêmicas, necrose no fígado e infiltrado eosinofílico no fígado nos animais com Aeromonas spp, lesões na superficie corporal e atrofia no baço nos casos com víbrios. Nos casos em que estiveram envolvidas enterobactérias de diferentes gêneros, observaram-se lesões nas nadadeiras, miocardite, necrose no fígado e no pâncreas e infiltrados inflamatórios nos fígado, podendo estar atribuídas ao desequilíbrio no ambiente. Esse desequilíbrio pode ter contribuído para a susceptibilidade dos animais frente aos agentes oportunistas, existindo também a possibilidade de estarem associadas à presença concomitante de Aeromonas spp, uma vez que houve uma correlação significativa (p < 0,05) na ocorrência de enterobactérias e Aeromonas spp. Verificou-se por meio de modelagem matemática, que os animais provenientes de fazendas de cultivo em tanques-rede, assim como os que possuem maiores comprimentos corporais, apresentaram melhor ganho de peso.
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Seleção de bactérias para controle da meloidoginose e atividade isoenzimática de meloeiro parasitado por Meloidogyne incognita

MEDEIROS, Jeane Émili de 26 February 2007 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T12:33:28Z No. of bitstreams: 1 Jeane Emili de Medeiros.pdf: 394630 bytes, checksum: 1eb59fc3e8a4ae913b395a21c71fbe51 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T12:33:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jeane Emili de Medeiros.pdf: 394630 bytes, checksum: 1eb59fc3e8a4ae913b395a21c71fbe51 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work was to isolate and select bacteria for the control of Meloidogyne incognita and to evaluate the isozymatic activity of melon plants parasitized. Sixty-one rhizobacterium isolates obtained from rhizosphere soil and 56 endophytic obtained from the Culture Collection of Plant Bacteriology Laboratory - Federal Rural University of Pernambuco were tested. Melon seedlings yellow type 10 days old had their soil infested with 1000 eggs of Meloidogyne incognita race 2. Two days before soil infestation 20 mL of bacterial suspension (0,7 OD) were deposited in each pot. After 60 days fresh biomass of shoot and root , gall index, egg mass index and nematode reproduction factor were determined. Among 117 isolates the endophytic ENM7, ENM10 and ENM51 were selected because they significantly reduced egg mass index and/or gall index. However when tested again, separately or in mixtures, these isolates did not maintain their efficiency and besides they did not affect egg hatching in vitro. In order to study the activity of the isozymes α and β-esterase, peroxidase, acid phosphatase and malate dehydrogenase, plants of melon with 10 days old, had their soil infested with 500 nematode eggs per plant, and maintained in greenhouse. At 2, 4, 6, 8, 16, 24 e 32 days after soil infestation the third leaf of each plant was collected and processed for electrophoresis of isozymes in polyacrilamide gel. Only β-esterase and malate dehydrogenase showed polymorphism between bands expressed by plants parasitized by nematodes when compared to the control plants. The nematode inhibited the expression of some β-esterase genes and activated the expression of other malate dehydrogenase genes. / O objetivo dessa pesquisa foi isolar e selecionar bactérias para o controle da meloidoginose e avaliar a atividade isoenzimática de plantas de meloeiro parasitadas por Meloidogyne incognita raça 2. A partir de solo rizosférico de meloeiro foram obtidos 61 isolados de rizobactérias que juntamente com 56 isolados endofíticos pertencentes à Coleção de Culturas do Laboratório de Fitobacteriologia da UFRPE foram testados. Plântulas de meloeiro Amarelo com 10 dias tiveram o solo infestado com 1000 ovos de M. incognita raça 2. Dois dias antes da infestação do solo foram depositados 20 mL da suspensão bacteriana (0,7 A) por vaso. Decorridos 60 dias, foram determinadas as biomassas frescas da parte aérea e das raízes, os índices de galhas e de massa de ovos e o fator de reprodução do nematóide. Dos 117 isolados testados, foram selecionados inicialmente os endofíticos ENM7, ENM10 e ENM51 que reduziram significativamente o índice de massa de ovos e/ou o índice de galhas. Contudo, quando testados novamente, separadamente ou em misturas, esses isolados não mantiveram a eficiência na redução dessas variáveis e in vitro também não afetaram a eclosão dos juvenis. Para o estudo da atividade das isoenzimas α e β-esterase, peroxidase, fosfatase ácida e malato desidrogenase, plantas de meloeiro com dez dias de idade, tiveram o solo infestado com 500 ovos do nematóide por planta, sendo mantidas em casa de vegetação. Aos 2, 4, 6, 8, 16, 24 e 32 dias após a infestação do solo a terceira folha das plantas foi coletada e submetida à eletroforese de isoenzimas em gel de poliacrilamida. Apenas a β-esterase e a malato desidrogenase mostraram polimorfismo entre as bandas expressas pelas amostras das plantas parasitadas por nematóides, quando comparadas às plantas testemunhas. A presença do nematóide inibiu a expressão de alguns genes β-esterase e ativou a expressão de outros da malato desidrogenase.
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Diversidade microbiana do trato genital feminino

Lira, Évelyn Costa, 991286357, https://orcid.org/0000-0003-1863-7416 30 November 2017 (has links)
Submitted by Évelyn Lira (costa_eve@yahoo.com.br) on 2018-11-03T15:34:17Z No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 120410 bytes, checksum: d948e19f5bae8bee2cb485c166efda6d (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGBIOTEC Biotecnologia (ppg_biotec.ufam@yahoo.com.br) on 2018-11-06T20:43:46Z (GMT) No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 120410 bytes, checksum: d948e19f5bae8bee2cb485c166efda6d (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) / Rejected by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: A carta anexada deve ser a "Carta de Encaminhamento para o Autodepósito" disponível em http://biblioteca.ufam.edu.br/servicos/teses-e-dissertacoes Dúvidas? ddbc@ufam.edu.br on 2018-11-07T12:20:35Z (GMT) / Submitted by Évelyn Lira (costa_eve@yahoo.com.br) on 2018-11-07T13:48:25Z No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 146139 bytes, checksum: 0b1a55433f2ef8e007ce7d6045af2443 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGBIOTEC Biotecnologia (ppg_biotec.ufam@yahoo.com.br) on 2018-11-07T14:13:03Z (GMT) No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 146139 bytes, checksum: 0b1a55433f2ef8e007ce7d6045af2443 (MD5) / Rejected by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: O Documento anexado como "Carta de Autodepósito" não é o documento exigido. O documento que deve ser anexado é a "Carta de Encaminhamento para o Autodepósito" disponível em http://biblioteca.ufam.edu.br/servicos/teses-e-dissertacoes Dúvidas? ddbc@ufam.edu.br on 2018-11-07T14:56:48Z (GMT) / Submitted by Évelyn Lira (costa_eve@yahoo.com.br) on 2018-11-07T15:22:23Z No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 33896 bytes, checksum: cbb2fa1f7645982868cec33dd021fd5d (MD5) / Approved for entry into archive by PPGBIOTEC Biotecnologia (ppg_biotec.ufam@yahoo.com.br) on 2018-11-12T19:17:48Z (GMT) No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 33896 bytes, checksum: cbb2fa1f7645982868cec33dd021fd5d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-11-12T20:47:54Z (GMT) No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 33896 bytes, checksum: cbb2fa1f7645982868cec33dd021fd5d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-12T20:47:54Z (GMT). No. of bitstreams: 3 TESE_Évelyn Costa Lira.pdf: 5199119 bytes, checksum: 3542649866fd36a1d250872b70b7f22e (MD5) Diploma de Doutorado ou Ata de Defesa.pdf: 129558 bytes, checksum: 3cdafbe7ae427bf6a30e4dd767a402e5 (MD5) Carta de Encaminhamento para Autodepósito.pdf: 33896 bytes, checksum: cbb2fa1f7645982868cec33dd021fd5d (MD5) Previous issue date: 2017-11-30 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The role of the human microbiota in health and disease processes has received increased attention due to the ease of characterization of microbial communities using independent culture methods, which are based on the analysis of hypervariable regions of the gene 16S rRNA. The vaginal microbiota is inhabited by microbial communities that play a very important role in the maintenance of vaginal homeostasis and in the presence of colonization by pathogenic microorganisms, but the mechanisms by which they exert this influence are not yet so well defined. in this context, an understanding of their relative abundance and variations is necessary for the recognition of potential pathogenic microorganisms and the physiological processes of protection of this microbiota. This study evaluated the vaginal microbial diversity in four different conditions: I Microbiota Normal II Vaginal Candidosis Microbiota III Bacterial vaginosis microbiota IV microbiota presenting pre-malignant and malignant lesions of the cervix. Cervical samples from 187 women were collected, characterized and diagnosed at the molecular level for the presence of HPV, C. trachomatis, T. vaginalis e N. gonorrhoeae. HPV positive samples were genotyped at ABI 3500 and HPV co-infection were related to the presence of other pathogens and socio-economic and clinical factors obtained through the questionnaire filled out by the volunteers. Significance and association analyzes were performed using the Chi-square Test of Pearson, exact of Fischer’s Test and Kruskal-Wallis test using R 2.9.0. After the groups were composed, four libraries of amplicons of the regions V1-V2 of the gene 16S rRNA and, later sequenced on Ion PGM platform. The sequences generated were analyzed using the QIIME and classified by comparison in the Greengenes database. the prevalence found for HPV was 51.33%, and the most prevalent types were HPV 16, 58 and 33. The prevalence found for CT and TV were 6.42% and 12.83%, respectively, with co- HPV / CT infection in 5.20% and HPV / VT in 6.25% of the women. The DNA of N. gonorrhoeae were not found in samples. as to the estimation of microbial diversity, the number of samples sequenced was enough to guarantee coverage of the total diversity found. Overall abundancy revealed a predominance of the genus lactobacillus on the four study groups, followed by the genres Ureaplasma, Prevotella and Shuttleworthia, followed by the study groups. the greatest microbial diversity was found in the vaginosis group, with the most abundant genera Prevotella, Shuttleworthia and Megasphaera, followed by the lesion group, abundance of genders Ureaplasma, Prevotella e Shuttleworthia. The differences at the species level are extremely necessary for the understanding of the physiological role of the vaginal microbial in the maintenance of autochthonous balance and of pathogenic mechanisms in the development of diseases related to vaginal microbiota. In addition, an understanding of the functionality of the types of CST is necessary to complement what we already know about its structure. Studies are needed to investigate the changes and stability of this microbiota. / O papel da microbiota humana nos processos de saúde e doença tem recebido maior atenção devido à facilidade para a caracterização das comunidades microbianas utilizando os métodos independentes de cultivo, que se baseiam na análise das regiões hipervariáveis do gene 16S rRNA. A microbiota vaginal é habitada por comunidades microbianas que exercem papel importantíssimo para a manutenção da homeostase vaginal e prevenção da colonização por microrganismos patogênicos, mas os mecanismos pelos quais exercem essa influência ainda não são tão bem definidos. Neste contexto, uma compreensão quanto a sua abundância relativa e variações é necessária para o reconhecimento de microrganismos patogênicos potenciais e de processos fisiológicos de proteção dessa microbiota. Este estudo avaliou a diversidade microbiana vaginal em quatro condições distintas: I. microbiota autóctone; II. Microbiota apresentando candidose vaginal; III. microbiota apresentando vaginose bacteriana e; IV. microbiota apresentando lesões pré-malignas e malignas do colo do útero. Amostras cervicais de 187 mulheres foram coletadas, caracterizadas e diagnosticadas a nível molecular quanto à presença de HPV, C. trachomatis, T. vaginalis e N. gonorrhoeae. Amostras HPV+ foram genotipadas em ABI 3500 e a co-infecção do HPV foi relacionada à presença dos outros patógenos e fatores sócio-econômicos e clínicos obtidos através do questionário preenchido pelas voluntárias. Análises de significância e associação foram realizadas através dos Testes Qui-Quadrado de Pearson, Exato de Fischer e Kruskal-Wallis utilizando o R 2.9.0. Após a composição dos grupos, foram montadas quatro bibliotecas de amplicons das regiões V1-V2 do gene 16S rRNA e, posteriormente sequenciadas em plataforma Ion PGM. As sequências geradas foram analisadas utilizando o QIIME e classificadas por comparação no banco Greengenes. A prevalência encontrada para HPV foi de 51,33% sendo que os tipos mais prevalentes foram HPV 16, 58 e 33. As prevalências encontradas para CT e TV foram de 6,42% e 12,83%, respectivamente, sendo observadas co-infecção HPV/CT em 5,20% e HPV/TV em 6,25% das mulheres. O DNA de N. gonorrhoeae não foi encontrado nas amostras. Quanto à estimativa da diversidade microbiana, o número de amostras sequenciado foi suficiente para garantir a cobertura da diversidade total encontrada. A abundância geral revelou predominância do gênero Lactobacillus nos quatro grupos de estudo, seguido pelos gêneros Ureaplasma, Prevotella e Shuttleworthia entre os grupos estudados. A maior diversidade microbiana foi encontrada no grupo Vaginose, tendo como gêneros mais abundantes Prevotella, Shuttleworthia e Megasphaera, seguido pelo grupo Lesão, com abundância dos gêneros Ureaplasma, Prevotella e Shuttleworthia. As diferenças a nível de espécie são extremamente necessárias para o entendimento do papel fisiológico da microbiota vaginal na manutenção do equilíbrio autóctone e de mecanismos patogênicos no desenvolvimento de doenças relacionadas à microbiota vaginal. Além disso, uma compreensão da funcionalidade dos tipos de CST é necessária para complementar o que já sabemos sobre sua estrutura. Estudos são necessários para investigar as mudanças e a estabilidade desta microbiota.
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Produção e caracterização da xilanase de Bacillus pumilus e potencial uso na extração de xilana do bagaço de cana-de-açúcar pré-tratado / Production and characterization of Bacillus pumilus xylanase and potential use in the extraction of xylan from pre-treated sugarcane bagasse

Maiara Paparele dos Santos 20 October 2017 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo a caracterização da xilanase presente no extrato bruto de Bacillus pumilus, com a finalidade de usá-la na extração de xilana do bagaço de cana-de-açúcar. Foram testados dois meios de cultura em pHs 8,5 e 9,5 com diferentes substratos. As maiores atividades de xilanase foram produzidas em xilana comercial de oat spelts (228 U/mL) e em farelo de trigo (220 U/mL), no pH 8,5. Independentemente das condições de cultivo empregada, não foi detectada atividades de &szlig;-xilosidase, &szlig;-glicosidase e arabinofuranosidase e a produção de endoglucanase foi baixa (< 0,7 U/mL). O perfil de proteínas em eletroforese foi amplo, e a banda com 23 kDa correspondeu a uma xilanase. A xilanase apresentou pH ótimo na faixa de 7-8, temperatura ótima entre 45-50 ºC e se apresentou mais estável a 40 ºC (pH8,0). A hidrólise de xilanas comerciais produziu xilotriose, xilotetraose, xilopentaose e xilo-oligossacarídeos (XOS) com massas maiores, que não foram identificados por cromatografia em camada fina (TLC). A influência de vários fatores, tais como a carga de xilanase, tipo de substrato, temperatura e a adição de vários compostos foi avaliada no rendimento de extração de xilanas desde o bagaço de cana-de-açúcar prétratado. O extrato bruto de B. pumilus, rico em xilanases, foi aplicado em um bagaço pré-tratado com sulfito/álcali, e em um bagaço deslignificado por clorito em meio ácido, evidenciando que a menor quantidade de lignina residual como principal fator para aumentar a extração de xilana, aumentando a extração de 4,2 para 42,5%. A lavagem extensiva do material pré-tratado com sulfito alcalino também auxiliou no aumento do rendimento de xilana, de 18,5 para 25,1 %. Foram testadas outras alternativas para aumentar o rendimento de hidrólise da xilana do bagaço pré-tratado, sem a necessidade da lavagem do material. A reutilização do licor sulfito alcalino, a adição de tween 80, polietileno glicol, albumina não favoreceram a extração de xilanas, enquanto que a adição de MgSO4 teve um pequeno efeito positivo na extração da xilana (de 18% para 20,9 %). A extração alcalina a frio, realizada após a extração enzimática, influenciou positivamente o rendimento de extração da xilana do bagaço pré-tratado com 10% Na2SO3/5%NaOH. A extração de xilana obtido pela aplicação de xilanase (20 U/g) seguida da extração com 20% de NaOH produziu o mesmo resultado que utilizando apenas NaOH (70%), de 24,1 e 24,9 %, respectivamente. A extração enzimática da xilana permitiu a obtenção de um resíduo com características favoráveis para a completa sacarificação, com Cellic CTec2 na carga de 10 FPU/g de material. / The present work aimed to characterize the xylanase present in the crude extract of Bacillus pumilus, with the purpose of using it in the xylan extraction of the sugarcane bagasse. Two culture media were tested at pHs 8.5 and 9.5 with different substrates. The highest xylanase activities were produced in commercial xylan oat spelled (228 U / mL) and wheat bran (220 U / mL) at pH 8.5. Regardless of the culture conditions employed, &szlig;xylosidase, &szlig;-glycosidase and arabinofuranosidase activities were not detected and endoglucanase production was low (<0.7 U/mL). The protein profile on electrophoresis was extensive, and the 23 kDa band corresponded to a xylanase. The xylanase presented optimum pH in the range of 7-8, optimal temperature between 45-50ºC and was more stable at 40 ºC (pH8.0). Hydrolysis of commercial xylanes produced xylotriose, xylotetraose, xylopentaose and xylooligosaccharides (XOS) with larger masses, which were not identified by thin layer chromatography (TLC). The influence of various factors, such as xylanase loading, substrate type, temperature and the addition of various compounds was evaluated in the xylan extraction yield from the pretreated sugarcane bagasse. The crude extract of B. pumilus, rich in xylanases, was applied to a bagasse pretreated with sulfite/alkali, and to a bagasse delignified by chlorite in acid medium, showing that the lower amount of residual lignin as the main factor to increase the extracting xylan, increasing the extraction from 4.2 to 42.5%. Extensive washing of the alkaline sulfite pretreated material also assisted in increasing xylan yield, from 18.5 to 25.1%. Further alternatives were tested to increase the hydrolysis yield of pretreated bagasse xylan without the need for material washing. The reuse of the alkali sulfite liquor, the addition of tween 80, polyethylene glycol, albumin did not favor xylan extraction, while addition of MgSO4 had a small positive effect on xylan extraction (from 18% to 20.9%). The cold alkaline extraction, after enzymatic extraction, positively influenced the xylan extraction yield of the pretreated bagasse with 10% Na2SO3/5% NaOH. Extraction of xylan obtained by applying xylanase (20 U / g) followed by extraction with 20% NaOH produced the same result as using only NaOH (70%), 24.1 and 24.9%, respectively. The enzymatic extraction of xylan allowed to obtain a residue with favorable characteristics for the complete saccharification, with Cellic CTec2 in the load of 10 FPU / g of material.
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O exercício aeróbio atenua a inflamação pulmonar induzida pelo Streptococcus pneumoniae / Aerobic exercise attenuates pulmonary inflammation induced by Streptococcus pneumoniae

Clarice Rosa Olivo 09 April 2015 (has links)
O treinamento aeróbio moderado tem sido reconhecido como um importante estimulador do sistema imune, no entanto o efeito deste na infecção bacteriana não tem sido extensivamente estudado. Nosso objetivo foi avaliar se o exercício aeróbio moderado prévio à infecção por S. pneumoniae influencia a resposta inflamatória pulmonar. Camundongos BALB/C foram divididos em 4 grupos: Controle (animais sedentários; não infectados); S. pneumoniae (animais sedentários e posteriormente infectados); Exercício (animais treinados; não infectados); Exercício + S. pneumoniae (animais treinados e posteriormente infectados). Os animais foram submetidos a um programa de treinamento físico aeróbio durante 4 semanas, e 72 horas após a última sessão de exercício, os animais receberam instilação nasal de S. pneumoniae (linhagem M10) e foram avaliados 12 horas (fase aguda) ou 10 dias (fase tardia) após a instilação. Na fase aguda, o grupo S. pneumoniae apresentou um aumento de: resistência e elastância do sistema respiratório, número total de células, neutrófilos, linfócitos e macrófagos no lavado broncoalveolar (BAL), células polimorfonucleares no parênquima pulmonar e TNF-alfa e IL-1beta no homogenato pulmonar. O exercício físico atenuou significantemente esses parâmentros. Além disso, o exercício físico resultou em aumento da expressão de enzimas antioxidantes no pulmão (CuZnSOD and MnSOD). Na fase tardia, o grupo Exercício + S. pneumoniae apresentou redução no número total de células e macrófagos no BAL, células polimorfonucleares no parênquima pulmonar e IL-6 no homogenato pulmonar comparado ao grupo S. pneumoniae. Nossos resultados sugerem um efeito protetor do exercício aeróbio moderado contra a infecção bacteriana pulmonar. Esse efeito é provavelmente secundário ao efeito do exercício no balanço oxidante-antioxidante / Moderate aerobic exercise training has been recognized as an important stimulator of the immune system, but its effect on bacterial infection has not been extensively studied. Our aim was to determine whether moderate aerobic exercise training prior to S. pneumoniae infection influences pulmonary inflammatory responses. BALB/c mice were divided into 4 groups: Control (sedentary without infection); S. pneumoniae (sedentary with infection); Exercise (aerobic training without infection); Exercise + S. pneumoniae (aerobic training with infection). Animals underwent aerobic exercise training for 4 weeks. 72 h after last exercise training, animals received a challenge with S. pneumoniae (strain M10) and were evaluated either 12 h (acute phase) or 10 days (late phase) after instillation. In acute phase, S. pneumoniae group had an increase in respiratory system resistance and elastance; number of total cells, neutrophils, lymphocytes and macrophages in bronchoalveolar lavage fluid (BAL); polymorphonuclear cells in lung parenchyma; and levels of TNF-alfa and IL-1beta in lung homogenates. Exercise training significantly attenuated the increase in all of these parameters. In addition, exercise induced an increase in expression of antioxidant enzymes (CuZnSOD and MnSOD) in lungs. In late phase, Exercise + S. pneumoniae group exhibited a reduction in number of total cells and macrophages in BAL, in polymorphonuclear cells in lung parenchyma and in levels of IL-6 in lung homogenates compared to S. pneumoniae group. Our results suggest a protective effect of moderate exercise training against respiratory infection with S. pneumoniae. This effect is most likely secondary to an effect of exercise on oxidant-antioxidant balance
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Efeito do déficit hídrico em duas variedades de trigo (Triticum aestivum L.) em associação com bactérias promotoras do crescimento vegetal / Effect of water stress in two varieties of wheat (Triticum aestivum L.) in association with bacteria growth promoting the vegetable

Furlan, Fernando 01 March 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-10T17:36:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_Fernando_Furlan.pdf: 1612229 bytes, checksum: 5342ce4ea289e48d9a0692559c9fcb71 (MD5) Previous issue date: 2013-03-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The wheat crop and bacteria Azospirillum brasilense and Herbaspirillum seropedicae has been the subject of research. However, it requires more research involving wheat under the condition of association with these bacteria and conjugated to water deficit in relation to physiological parameters and productive. The objectives of this study was to evaluate the association of Herbaspirillum seropediceae SMR1 and Azospirillum brasilense Ab-V5, inoculated in two wheat cultivars (CD 120 and Frontana) and whether this association is effective to confer tolerance to Decit water. Eight conditions combining the inoculation (s) bacterium (s) and Hs Az with and without addition of nitrogen (N) have been proposed. The experimental design was a randomized block design in a factorial 2 x 8 x 3. The results were subjected to analysis of variance - ANOVA and means were compared by Tukey test at 5% probability GENES program. Deficits were applied at flowering and samples were collected at the beginning of the heading stage, growth stage Zadock 45. Samples were collected at 0 days, 8 days for severe deficit condition and 16 days for partial deficit. Were quantified using the Relative Water Content (TRA), Membrane Stability Index (AEI), total nitrogen (TN) in the leaves, root anatomy and productive parameters (fresh and dry biomass, tiller number, ear number / plant , grain yield / plant and weight of 1000 grains). The partial deficit condition was not perceived in different conditions of inoculation and / or fertilization applied, demonstrating that these cultivars are partially adapted to a water restriction progressive. Conditions containing bacteria (Hs) and (Az and Hs), (Az and N) had TRA similar to plants irrigated control, showing that managed to maintain cell turgor by presenting IEM high (90%). Molecular analysis could confirm the presence of bacteria in inoculated plants, but no differences were observed in root anatomy induced by the presence of bacteria. Plants of cv CD 120 generally showed higher levels of NT in the leaves when subjected to severe deficit and cv Frontana there was a decrease in these levels. In relation to production parameters, plants inoculated with 120 hp CD H. seropedicae showed 52% increase in their fresh biomass compared to the control irrigated, but in severe deficit this increase was 3%. The presence of A. brasilense promoted a 31% reduction in fresh weight compared to the control, but in severe deficit in an improvement of 11% in fresh weight. The association between H. seropedicae, A. brasilense and nitrogen provided a 2% increase in biomass (irrigated) and 101% severe deficit. For hp Frontana values were 0.6%, -12%, -21%, 28%, -18% and -8% in the same conditions. The same trends were observed for dry matter. Regarding NT contents of the leaves, it is noted that the CD 120 hp showed increased levels in the presence of a fluid restriction and cv Frontana, these values had decreased in all conditions. The variable number of tillers did not differ between conditions, cultivate or water condition applied. Plants inoculated with 120 hp CD H. seropedicae had 46% more spikes / plant compared to the control irrigated, and 40% in severe deficit. In cv Frontana no differences were observed. Comparing the data obtained for grain yield per plant between conditions applied (severe deficit irrigated x), the values were proportionally lower in deficit condition, due to less dry, but the plants were capable of maintaining mass values 1000 irrigated grain similar to control in both cultivars / A cultura do trigo e as bactérias Azospirillum brasilense e Herbaspirillum seropedicae tem sido alvo de pesquisas. No entanto, necessita-se de mais pesquisas envolvendo o trigo sob condição de associação com estas bactérias e conjugados ao déficit hídrico em relação aos parâmetros fisiológicos e produtivos. Os objetivos deste trabalho foi avaliar a associação de bactérias Herbaspirillum seropediceae SmR1 e Azospirillum brasilense Ab-V5, inoculadas em duas cultivares de trigo (CD 120 e Frontana) e se esta associação é eficiente para conferir tolerância ao décit hídrico. Oito condições combinando inoculação com a(s) bactéria(s) Hs e Az, com e sem adição de nitrogênio (N) foram propostos. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso em esquema fatorial 2 x 8 x 3. Os resultados foram submetidos a análise de variância ANOVA e as médias comparadas pelo teste de Tukey 5% de probabilidade pelo programa GENES. Os déficits foram aplicados no florescimento e as coletas foram realizadas no início do espigamento, estádio fenológico Zadock 45. As coletas foram realizadas aos 0 dias, 8 dias para a condição de déficit severo e 16 dias para déficit parcial. Foi quantificado o Teor Relativo de Água (TRA), Índice de Estabilidade de Membrana (IEM), teores de nitrogênio total (NT) nas folhas, anatomia radicular e parâmetros produtivos (biomassa fresca e seca, número de perfilhos, número de espiga/planta, massa de grãos /planta e massa de 1000 grãos). A condição de déficit parcial não foi percebida nas diferentes condições de inoculação e/ou fertilização aplicadas, demonstrando que estas cultivares são parcialmente adaptadas a uma restrição hídrica progressiva. As condições contendo bactérias (Hs) e (Az e Hs), (Az e N) apresentaram TRA similares às plantas do controle irrigado, mostrando que conseguiram manter o turgor celular por apresentarem IEM altos (90%). Análises moleculares puderam comprovar a presença das bactérias nas plantas inoculadas, mas, não foram observadas diferenças na anatomia radicular induzidas pela presença das bactérias. Plantas da cv CD 120 em geral apresentaram maiores teores de NT nas folhas quando submetidas ao déficit severo e na cv Frontana houve um decréscimo nestes teores. Em relação aos parâmetros produtivos, plantas da cv CD 120 inoculadas com H. seropedicae apresentaram 52% de aumento em sua biomassa fresca comparada ao controle irrigado, porém em déficit severo este incremento foi de 3%. A presença de A. brasilense promoveu uma redução de 31 % na biomassa fresca quando comparada ao controle, porém em déficit severo promoveu um acréscimo de 11% na massa fresca. A associação entre H. seropedicae, A. brasilense e nitrogênio proporcionou um acréscimo na biomassa 2% (irrigado) e 101% déficit severo. Para a cv Frontana os valores foram de 0,6%; -12%; -21%; 28%; -18% e -8% nas mesmas condições. As mesmas tendências foram observadas para massa seca. Em relação aos teores de NT das folhas, observa-se que a cv CD 120 demonstrou níveis aumentados em presença de uma restrição hídrica e a cv Frontana, apresentou a diminuição destes valores em todas as condições. A variável número de perfilhos não apresentou diferenças entre condições, cultivar ou condição hídrica aplicada. Plantas da cv CD 120 inoculadas com H. seropedicae apresentaram 46% mais espigas/planta comparada ao controle irrigado, e 40% no déficit severo. Na cv Frontana não foram observadas diferenças. Ao compararmos os dados obtidos para massa de grãos por plantas entre condições aplicadas (irrigada x déficit severo), os valores obtidos foram proporcionalmente menores na condição de déficit, em virtude da menor massa seca, mas as plantas foram capazes de manter os valores de massa de 1000 grãos similares ao controle irrigado em ambas as cultivares
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Levantamento de espécies de cigarrinhas (Hemiptera: Auchenorrhyncha) com ênfase em possíveis vetores de Xylella fastidiosa em pomares de oliveira na Serra da Mantiqueira / Survey of Auchenorrhyncha species with emphasis on possible vectors of Xylella fastidiosa in olive orchards in the Mantiqueira Mountain Range

Froza, Joyce Adriana 26 September 2017 (has links)
Xylella fastidiosa é uma bactéria gram-negativa que coloniza os vasos de xilema das plantas, podendo ser patogênica para algumas culturas de importância econômica. Esta bactéria é transmitida por cigarrinhas (Hemiptera: Auchenorrhyncha) da superfamília Cercopoidea (Aphrophoridae, Cercopidae e Clastopteridae) e família Cicadellidae (subfamília Cicadellinae). Na Itália este fitopatógeno esta causando uma nova doença em plantas de oliveira, denominada síndrome do declínio rápido da oliveira. Recentemente também foi detectada a ocorrência desta bactéria associada a sintomas de requeima foliar na Argentina e no Brasil. Sendo assim, surgiu a necessidade de realizar levantamentos de espécies de cigarrinhas que ocorrem nas regiões onde estão localizados os pomares de oliveira na Serra da Mantiqueira, nos estados de São Paulo e Minas Gerais, na faixa de 800 a 1800 m de altitude. O objetivo deste trabalho foi realizar a análise faunística das espécies de cigarrinhas, como também mensurar a similaridade da comunidade de espécies encontradas entre os pomares, e indicar possíveis vetores de Xylella fastidiosa para a cultura da oliveira. Foram selecionadas sete pomares de oliveira localizados na Serra da Mantiqueira, seguindo um gradiente altitudinal, sendo estes: Wenceslau Braz (MG-1780 m), São Bento do Sapucaí (Entre Vilas) (SP-1602 m), São Bento do Sapucaí (São José) (SP-1512 m), Maria da Fé (MG), com três pomares (área do Lago-1329 m, área da Suíça-1318 m, área da Atemoia-1310 m) e Cabreúva (SP-883 m). Para a captura de cigarrinhas, foram instalados em cada pomar nove cartões adesivos amarelos, em duas alturas, 0,8 m e 1,6 m do nível do solo, totalizando 18 cartões por pomar, que foram trocados a cada 15 dias no período de junho de 2015 a maio de 2017. Coletaram-se 40.324 indivíduos de 270 espécies incluídos em Auchenorrhyncha, distribuídos em 12 famílias, com maior frequência de indivíduos do grupo Cicadellidae (68%), e Cicadellinae (43% de todos os cicadelídeos coletados). A análise faunística indicou 44 espécies predominantes, sendo 20 pertencentes a grupos de potenciais vetores. Dentre elas, Clastoptera sp. 1 (Clastopteridae), Macugonalia cavifrons e Scopogonalia sp. 1 (Cicadellinae) foram predominantes em todos os pomares, exceto no pomar de Cabreúva, sendo que a primeira coloniza a oliveira. Os maiores índices de diversidade, riqueza e equitabiliade foram obtidos para os pomares de Wenceslau Braz, São Bento do Sapucaí (São José) e São Bento do Sapucaí (Entre Vilas) (0,87), respectivamente. A maior similaridade de Jaccard foi encontrada entre os pomares de Maria da Fé (55%). A maior similaridade de Morisita foi encontrada entre os pomares de São Bento do Sapucaí (São José) e Maria da Fé (área da Suíça) (91%) e a menor entre os pomares de Cabreúva e São Bento do Sapucaí (Entre Vilas) (6%). Para algumas espécies predominantes de Cicadellinae e Cercopoidea, houve diferença na eficiência de captura por armadilhas adesivas posicionadas em alturas distintas na copa das oliveiras. / Xylella fastidiosa is a gram-negative bacterium that colonizes the xylem vessels of plants and may be pathogenic to some crops. This bacterium is transmitted by leafhoppers (Hemiptera: Auchenorrhyncha) from the superfamily Cercopoidea (Aphrophoridae, Cercopidae and Clastopteridae) and family Cicadellidae (subfamily Cicadellinae). In Italy this phytopathogen is causing a new disease in olive trees, named \'olive quick decline syndrome\'. Recently, the occurrence of this bacterium associated to a \'leaf scorch\' was also detected in Argentina and Brazil. Thus, it is necessary to carry out surveys of Auchenorrhyncha species in olive orchards in the region of the Mantiqueira Mountain Range, where the olives are grown in the states of São Paulo and Minas Gerais, at 800 to 1800 m altitude range. The objectives of this work were to do faunistic analysis of Auchenorrhyncha species, to measure species similarity of the community of Auchenorrhyncha among orchards, and to indicate possible vectors of Xylella fastidiosa in olives. Seven olive orchards located in the Mantiqueira Mountain Range were selected, following an altitudinal gradient: Wenceslau Braz (MG-1780 m), São Bento do Sapuccaí (EntreVilas) (SP-1602 m), São Bento do Sapucaí (São José) (SP-1512 m), Maria da Fé (MG), with three orchards (area of Lago-1329 m, area of Suíça-1318 m, area of Atemoia-1310 m) e Cabreúva (SP-883 m). Nine yellow stick traps were installed in each orchard at two heights, 0.8 m and 1.6 m above soil level, totaling 18 cards per orchard, which were replaced fortnightly from June/2015 to May/2017. A total of 40,324 individuals from 270 species included in Auchenorrhyncha were collected, distributed in 12 families, with the highest frequency of individuals in the group Cicadellidae (68%) and group Cicadellinae (43% of all Cicadellidae). The faunistic analyses classified 44 species as predominant, 20 belonging to groups of possible vectors of X. fastidiosa. Among them, the species Clastoptera sp. 1 (family Clastopteridae), Macugonalia cavifrons and Scopogonalia sp. 1 (subfamily Cicadellinae) are predominant in all orchards, except in the Cabreúva orchard. Nymphs of Clastoptera sp. 1 were observed developing on young olive branches. Higher diversity, richness and equitability indices were observed in Wenceslau Braz, São Bento do Sapucaí (São José) and São Bento do Sapucaí (Entre Vilas) orchards, respectively. Jaccard\'s greatest similarity was found between Maria da Fé orchards (55%). The greatest similarity of Morisita was found between the orchards of São Bento do Sapucaí (São José) and Maria da Fé (91%) and the lowest one between orchards of Cabreúva and São Bento do Sapucaí (Entre Vilas) (6%). For some predominant species of Cicadellinae and Cercopoidea, capture efficiency was influenced by trap height on the olive tree canopy.

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