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Bactérias láticas produtoras de bacteriocinas em salame: isolamento, caracterização, encapsulação e aplicação no controle de Listeria monocytogenes em salame experimentalmente contaminado / Bacteriocin-producing lactic acid bacteria in salami: isolation, characterization, encapsulation and application for the control of listeria monocytogenes in experimentally contaminated salami

Barbosa, Matheus de Souza 20 September 2013 (has links)
A tecnologia da microencapsulação apresenta várias aplicações na indústria de alimentos. Sabendo-se que diferentes fatores intrínsecos e extrínsecos dos alimentos podem influenciar a produção e atividade antimicrobiana das bacteriocinas produzidas pelas bactérias láticas, este estudo teve como principal objetivo avaliar a funcionalidade da encapsulação de bactérias láticas (BAL) bacteriocinogênicas em alginato de cálcio no controle de Listeria monocytogenes em salame experimentalmente contaminado. Para atingir este objetivo, foram isoladas novas cepas de BAL a partir de salame, que foram identificadas e caracterizadas quanto às propriedades das bacteriocinas produzidas, avaliando-se a influência do processo de encapsulação na produção de bacteriocinas. Foram isoladas quatro cepas produtoras de bacteriocinas, identificadas como Lactobacillus sakei (uma cepa), Lactobacillus curvatus (duas cepas) e Lactobacillus plantarum (uma cepa), nomeadas MBSa1, MBSa2, MBSa3 e MBSa4, respectivamente. As bacteriocinas produzidas pelas quatro cepas foram termoestáveis e com exceção da cepa MBSa2, sensíveis a pH acima de 8. Todas inibiram todas as cepas de Listeria monocytogenes testadas e várias espécies de BAL, mas foram inativas contra bactérias Gram negativas. As bacteriocinas foram purificadas por cromatografia de troca iônica seguida de cromatografia de interação hidrofóbica sequencial e cromatografia de fase reversa, observando-se que L. sakei MBSa1 produz um peptídeo de 4303 Da, com uma sequência parcial de aminoacidos idêntica à sequência presente em sakacina A. As cepas MBSa2 e MBSa3 produzem dois peptídeos ativos cada, idênticos nas duas cepas, um de 4457 Da e outro de 4360 Da, que apresentam sequências parciais idênticas às presentes na sakacina P e na sakacina X, respectivamente. Aparentemente, a cepa L. plantarum MBSa4 produz uma bacteriocina composta por duas sub-unidades. O DNA genômico da cepa L. sakei MBSa1 contém os genes da sakacina A e curvacina A, enquanto o DNA da cepa L. plantarum MBSa4 foi positivo para o gene da plantaricina W. A cepa L. curvatus MBSa2 foi encapsulada em alginato de cálcio e testada quanto à produção de bacteriocinas in vitro, observando-se que o processo de encapsulação não influenciou a produção de bacteriocina. Quando testada in situ, ou seja, no salame experimentalmente contaminado com Listeria monocytogenes, não foi observada ação anti-Listeria por L. curvatus MBSa2 encapsulado e não encapsulado, durante o 30 dias de fabricação do salame. / The microencapsulation technology has several applications in the food industry. Knowing that different intrinsic and extrinsic factors can influence production and antimicrobial activity of bacteriocins produced by lactic acid bacteria in foods, this study aimed at evaluating the functionality of the encapsulation of bacteriocinogenic lactic acid bacteria (LAB) in calcium alginate in the control of Listeria monocytogenes in experimentally contaminated salami. To achieve this goal, new strains of LAB were isolated from salami, identified and characterized for the properties of the produced bacteriocins, evaluating the influence of the encapsulation process in the bacteriocins production. Four bacteriocin producing strains were isolated and identified as Lactobacillus sakei (one strain), Lactobacillus curvatus (two strains) and Lactobacillus plantarum (one strain), named MBSa1, MBSa2, MBSa3 and MBSa4 respectively. The bacteriocins produced by the four strains were thermostable and with the exception of strain MBSa2, sensitive to pH above 8. All inhibited all tested Listeria monocytogenes strains and various species of LAB but were inactive against Gram-negative bacteria. The bacteriocins were purified by cation-exchange followed by sequential hydrophobic-interaction and reversed-phase chromatography, indicating that L. sakei MBSa1 produces a peptide of 4303 Da, with a partial amino acid sequence identical to the sequence present in sakacin A. L. curvatus MBSa2 and MBSa3 produce two active peptides, identical in the two strains, one of 4457 Da and the other of 4360 Da, with partial aminoacid sequences identical to those present in sakacin X and sakacin P, respectively. Apparently, L. plantarum MBSa4 produces a bacteriocin composed of two subunits. Genomic DNA of L. sakei MBSa1indicated that this strain contains genes for sakacin A and curvacin A, while the DNA of L. plantarum MBSa4 was positive for the plantaricin W gene. The strain L. curvatus MBSa2 was encapsulated in calcium alginate and tested for bacteriocin production in vitro, observing that the encapsulation process did not affect the production of bacteriocin. When tested in situ, i.e. in the salami experimentally contaminated with L. monocytogenes was not observed anti-Listeria<i/> action by L. curvatus MBSa2 encapsulated and non-encapsulated during the 30 day manufacture of salami.
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Associação entre Azospirillum brasilense e milho na tolerância ao estresse salino : uma abordagem antioxidante /

Checchio, Mirela Vantini. January 2019 (has links)
Orientador: Priscila Lupino Gratão / Resumo: Devido às intensas mudanças climáticas globais e atividades antropogênicas, a salinidade tornou-se uma das principais problemáticas limitantes à produção agrícola. Para lidar com essa problemática, o estudo de genótipos e cultivares que sejam tolerantes ao sal, bem como alternativas através de inoculantes torna-se cada vez mais necessário. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a resposta antioxidante através da inoculação de Azospirillum brasilense em milho, e correlacionar a atividade destas enzimas ao aumento na capacidade da planta em tolerar o estresse ocasionado pela salinidade. Os tratamentos foram formados pela combinação de cloreto de sódio (0 e 100 mM de NaCl) via água de irrigação e ausência e presença do inóculo de A. brasilense, sendo o experimento conduzido inteiramente casualizado, com quatro repetições Os resultados demonstraram diferentes respostas de acordo com as análises de peroxidação lipídica (MDA), quantificação de nitrogênio (N) e sódio (Na+), massa seca (MS) e atividades enzimáticas, como superóxido dismutase (SOD, EC 1.15.1.1), glutationa redutase (GR, EC 1.6.4.2), guaiacol peroxidase (GPOX, EC 1.11.1.7) e glutationa peroxidase (GSH-PX, EC. 1.11.1.9). Os resultados mostraram que 100 mM de NaCl ocasionou peroxidação lipídica, com consequente aumento do teor de MDA. Entretanto, com a presença da bactéria nesta condição, o teor de MDA foi reduzido, houve aumento do acúmulo de N e as enzimas apresentaram diferenças significativas entre si, com aument... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Due to intense global climate change and anthropogenic activities, salinity has become one of the main problems limiting agricultural production. To deal with this problem, the study of genotypes and cultivars that are salt tolerant and also alternatives through inoculants becomes increasingly necessary. The main of this work was to characterize an antioxidant response through the inoculation of Azospirillum brasilense in maize and to correlate the activity of the enzymes with the salt-stress tolerance. The experiment was carried out in a completely randomized design with four replications. The treatments were performed by combination of sodium chloride (0 and 100 mM NaCl) through irrigation water and absence and presence of A. brasilense inoculation. Overall results showed different responses according to lipid peroxidation (MDA), nitrogen (N) and Na+ contents, dry mass (DM) and enzymatic activities, such as superoxide dismutase (SOD, EC 1.15.1.1), glutathione reductase (GR, EC 1.6.4.2), guaiacol peroxidase (GPOX, EC 1.11.1.7) and glutathione peroxidase (GSH-PX, EC 1.11.1.9). The results showed were that 100 mM NaCl caused lipid peroxidation with consequent increases in MDA content. However, MDA content was reduced and antioxidant enzymes demonstrated significant differences in the presence of the bacteria. Our data suggest that A. brasilense may confer plant tolerance in maize to salt stress and acquired tolerance can be related to the antioxidant system, mainly GSH-PX and ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Avaliação do potencial bacterívoro de três espécies de cladocera de ocorrência tropical e subtropical

Hayashi, Luciana Hitomi 19 November 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4841.pdf: 3194348 bytes, checksum: a8688ceb426964afd650a13ef65be763 (MD5) Previous issue date: 2012-11-19 / Universidade Federal de Sao Carlos / Cladocerans occupy an important position in freshwater food webs, acting like a bacteria consumer; being relatively non-selective filter feeders they can exert a strong impact on reducing microbial population. This study aimed to analyze the microbial community structure and evaluate the grazing potential in different life stages of three species of cladoceran socurring in tropical and subtropical climate (Ceriodaphnia silvestrii, Ceriodaphnia cornuta and Daphnia gessneri), using a microscopic study of their filter structures and quantifying the grazing rates, the latter experiments were performed in vitro and in situ using fluorescently labeled bacteria (FLB). The in situ experiments were performed in a predominantly mesotrophic subtropical environment (Lobo-Broa Reservoir, Brazil) on two sampling points with different trophic degrees.In parallel, physical, chemical and biological water variables were also evaluated. The bacterial densities and biomass were similar to those found in freshwater environments. For the morphotypes, there was a dominance of coccobacilli and cocci (78.5% of total). In thein vitro experiments, the lowest values found for individual ingestion rates (IIR) and removal (RR) were respectively 1,1 x 105 Bact.ind -1 h-1 and 0,1 mL.ind -1 h-1 in primiparous C. silvestrii, and the highest values were, respectively, 4,4 x 105 Bact.ind -1 h-1 e 0,4 mL.ind-1 h-1, observed in adult D. gessneri. Neonate sof all species showed relatively high ingestionand removal rates. During the in situ experiments, C.silvestrii, had the highest individual ingestion rates (IIR) 27, 7 x 104 bact ind-1 h-1. In populational terms, the studied daphnids distinguished themselves by consuming large amounts of bacteria in the rainy season. The daphnids grazing for this environment may have contributed to induce changes in the structure of bacterial communities, such as increasing the size and amount of bacterial filaments. Therefore, we noted that the bottom-up control had greater importance during the dry season and the top-down control larges timportance in the rainy season; the availability of resources and predationare also importantin the regulation of bacterial abundancein the Lobo reservoir. The studied species showed a sufficiently narrow mesh network to retain bacteria, the largest average distance between setulaewas found in primiparous C.cornuta (0.39&#956;m), and the smallest in neonate D.gessneri (0.11&#956;m). Although the three species have thinmeshes, the changes in its meshes occur differently for each species. / Dentre os diversos consumidores de bactérias nas teias alimentares de ambientes dulcícolas, os cladóceros ocupam uma posição relevante, sendo filtradores relativamente não seletivos, podendo exercer forte impacto na redução populacional microbiana. Este estudo teve como propósito analisar a estrutura da comunidade microbiana e avaliar o potencial bacterívoro em diferentes fases de vida de três espécies de cladóceros de ocorrência tropical e subtropical (Ceriodaphnia silvestrii; Ceriodaphnia cornuta e Daphnia gessneri) através do estudo microscópico de suas estruturas filtradoras e da quantificação de suas taxas de ingestão em experimentos de bacterivoría in vitro e in situ, utilizando-se bactérias marcadas fluorescentemente (FLB). Os experimentos in situ foram realizados em um ambiente subtropical predominantemente mesotrófico (reservatório do Lobo-Broa, Brasil) em 2 pontos de coleta que apresentam graus de trofia diferentes. Em paralelo foram avaliadas variáveis físicas, químicas e biológicas da água. Os valores de densidade e de biomassa bacteriana obtidos foram semelhantes aos encontrados em outros ambientes de água doce. Quanto aos morfotipos, houve a dominância de cocobacilos e de cocos (78,5% do total bacterioplanctônico). Nos experimentos in vitro, os valores obtidos para as taxas de ingestão individual (TII) variaram de 1,1 x 105 Bact.ind-1 h-1 a 4,4 x 105 Bact.ind-1 h-1 e para as taxas de remoção (TR) de 0,1 mL.ind-1 h-1 a 0,4 mL.ind-1 h-1. Neonatas de todas as espécies estudadas apresentaram taxas relativamente altas de ingestão e remoção. Nos experimentos in situ, C. silvestrii, apresentou a maior taxa de ingestão individual (TII) média. Em termos populacionais, os dafinídeos estudados se destacaram por consumirem grande quantidade de bactérias no período chuvoso. A bacterivoría por dafinídeos neste ambiente pode ter contribuído para a indução de modificações na estrutura da comunidade bacteriana, como o aumento do tamanho e da quantidade de filamentos bacterianos. Deste modo, nota-se que o controle bottom-up teve maior importância no período seco e o controle top-down maior importância no período chuvoso; a disponibilidade de recursos e a predação são igualmente importantes na regulação da abundância bacteriana no reservatório do Lobo. As espécies estudadas mostraram ter uma rede de malhas suficientemente estreitas para reter bactérias, a maior distância média entre cérdulas foi encontrada em primíparas de C. cornuta (0,39 &#956;m), e a menor em neonatas de D. gessneri (0,11 &#956;m). Embora as três espécies apresentem malhas finas, as mudanças em suas malhas ocorrem de forma diferente para cada espécie.
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Avaliação de enxaguatório bucais na atividade biológica do biofilme formado em braquetes ortodônticos / Evaluation of oral Rinses in biological activity of biofilm formed in orthodontic brackets

Celene Marques Bussadori 25 September 2013 (has links)
Na Odontologia, existe uma grande preocupação com a formação de placa bacteriana ou biofilme devido ao seu potencial cariogênico. Essa atenção se estende à ortodontia, devido ao acúmulo de biofilme formado nos aparelhos ortodônticos, tanto nos aparelhos removíveis quanto nos aparelhos fixos. É muito comum a presença de lesões brancas após a remoção dos bráquetes, em torno de 50 a 75% dos pacientes, provocadas pela presença do biofilme. É necessário um controle químico e mecânico rigoroso, a fim de se evitar alterações irreversíveis nos dentes e periodonto. O controle mecânico se dá pela escovação adequada, pelo correto uso de fio dental e pela frequência desses hábitos, além, claro, de um acompanhamento profissional periódico. O controle químico pode ser viabilizado pelo uso de enxaguatórios bucais, nos quais residem alguns efeitos indesejáveis e contraindicações relacionadas ao uso e à idade dos pacientes. Este estudo tem como objetivo avaliar comparativamente dois enxaguatórios bucais, um de natureza comercial (Cepacol®), e outro não comercial, elaborado com extratos hidroalcoólicos das plantas Nasturtium officinale (agrião), Rosmarinus offinalis (alecrim), Tabebuia impetiginosa (ipê roxo), Achillea millefolium (mil folhas) e Plantago major (tanchagem), desenvolvido na Faculdade de Ciências Farmacêuticas/UNESP Araraquara. Foram selecionados 40 pacientes, jovens e adultos, entre 18 e 45 anos, usuários de aparelho ortodôntico corretivo (fixo), divididos em dois grupos, o grupo do Cepacol e o grupo do Enxaguatório base de plantas. Foram coletadas amostras nos períodos de 0, 7, 15 e 21 dias e analisadas observando-se as Unidades Formadoras de Colônia (UFC) de cada amostra. Houve uma queda significativa da quantidade de bactérias após o uso do Enxaguatório à base de plantas, revelando um produto de extrema utilidade no auxílio do controle do biofilme bacteriano nas superfícies dentárias. / In dentistry, there is a great concern with the formation of plaque or biofilm, due to its cariogenic potential. This attention extends to orthodontics due to the accumulation of biofilm on orthodontic appliances, removable appliances as much in the brackets. It is very common the presence of white spots after removal of the brackets, around 50 to 75% of patients, which are caused by biofilms. It takes a rigorous mechanical and chemical control in order to avoid irreversible changes in the teeth and periodontium. The mechanical control is by proper brushing, correct flossing and also the frequency of these habits, besides, of course, a periodical professional monitoring. Chemical control can be achieved by the use of mouthwashes, home to some undesirable effects and contraindications related to the use and age of patients. This study aimed to assess two mouthwashes, a commercial type (Cepacol ®) and other non-commercial, made with hydroalcoholic extracts of plants Nasturtium officinale (watercress), offinalis Rosmarinus (rosemary), Tabebuia impetiginosa ( purple ipe), Achillea millefolium (thousand leaves) and Plantago major (plantain), developed at the Faculty of Pharmaceutical Sciences / UNESP Araraquara. We selected 40 patients, young and adults between 18 and 45 years, users of orthodontic appliance (fixed), divided into two groups, the Cepacol group and the group of herbal mouthwash. Samples were collected during periods of 0, 7,15 and 21 days and analyzed by observing the Colony Forming Units (CFU) of each sample. There was a significant decrease in the amount of bacteria after using herbal mouthwash, revealing a product of the utmost use in aiding the control of bacterial biofilms on tooth surfaces.
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Cultivo de Haematococcus pluvialis sob condições de estresse e em consórcio microbiano visando obter maior rendimento de astaxantina

Nunes, Moira [UNESP] 27 October 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-10-27Bitstream added on 2014-06-13T20:24:21Z : No. of bitstreams: 1 nunes_m_dr_jabo.pdf: 789915 bytes, checksum: d33780e723c4af1036139660c9582f18 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-10-27T11:27:29Z: 000681810.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-10-27T11:28:04Z : No. of bitstreams: 1 000681810.pdf: 562297 bytes, checksum: 2a5bb2ece78e1bfaa1bd6aca60814546 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A microalga Haematococcus pluvialis é conhecida como o microrganismo que apresenta maior rendimento final de astaxantina em sua biomassa, quando submetida a fatores de estresse celular eficientes. Contudo ainda apresenta uma característica de crescimento desfavorável quando comparada a outras espécies de microalgas cultivadas em escala comercial, visto que possui uma taxa de crescimento intrínseca, resultando em baixa densidade celular ao final dos cultivos. Assim, o rendimento final do pigmento é relativamente baixo. Neste sentido, este estudo teve por objetivo avaliar a resposta de Haematococcus pluvialis ao processo de indução à carotenogênese por meio de estresse luminoso e nutricional, e promover o aumento de biomassa vegetativa da microalga através da adição da rizobactéria promotora de crescimento em plantas, Azospirillum brasilense V6, estirpe produtora do fito hormônio AIA (ácido indol – acético), em cultivos estanques, visando obter maior rendimento final de astaxantina. O trabalho foi dividido em duas fases. Primeiramente, no cultivo referente ao controle (contendo apenas H. pluvialis) foram aplicadas duas combinações de fatores de estresse celular para indução a síntese de astaxantina pela microalga, visando a escolha do método de estresse a ser aplicado na fase seguinte. As células de H. pluvialis foram submetidas ao estresse por alta intensidade luminosa (350 μmol photons m-2 s-1) ou ao mesmo estresse luminoso aliado a suplementação com CO2 (4%) na aeração fornecida na fase exponencial de crescimento. Avaliou-se, entre outros fatores de resposta celular, a concentração final de astaxantina na biomassa após 10 dias de estresse. As concentrações do pigmento foram 4,15 e 17,66 mg g-1, respectivamente, para as culturas submetidas ao estresse luminoso e para... / The microalgae Haematococcus pluvialis is known as the microorganism that has a highest final yield of astaxanthin in its biomass, when induced by efficient stress factors. However, still presents a characteristic of unfavorable growth when compared to other species of microalgae grown on a commercial scale, once it has an intrinsic growth rate that provides low cell density in the culture. Thus, the final yield of the pigment is relatively low. Thus, this study aimed to evaluate the response of Haematococcus pluvialis submitted to carotenogenesis induction process through light and nutrient stress, and promotion of vegetative microalgae biomass increase through the addition of the growth promoter bacteria in plants, Azospirillum brasilense V6, a strain that produce the phyto hormone IAA (indole - acetic acid). The experiments were performed in “batch” systems, aiming to obtain higher final yield of astaxanthin. The work was divided into two phases. First, to the control (containing only H. pluvialis) it was applied two combinations of stress factors to induce cellular synthesis of astaxanthin by the microalgae, to define the method of stress to be applied in the next phase. The cells of H. pluvialis were submitted to stress by high light intensity (seven times the original) or the same light stress combined with CO2 supplementation (4%) in the aeration provided in the exponential growth phase. We evaluated, among other factors of cellular response, the final concentration of astaxanthin in the biomass after 10 days of stress. The pigment concentrations were 4.15 and 17.66 mg g-1, respectively, for cultures submitted to light stress and to those who received the same light stress add with the increase of C / N ratio in the culture medium. So, for the next experimental phase, the combination... (Complete abstract click electronic access below)
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Isolamento e seleção de bactérias lipolíticas provenientes de água residual de abatedouro / Isolation and selection of lipolytic bacteria from wastewater slaughterhouse

Ferreira, Camila Míryan de Oliveira 26 August 2015 (has links)
Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2017-01-11T16:15:33Z No. of bitstreams: 1 CamilaMOF_DISSERT.pdf: 1583672 bytes, checksum: f6ff4ec9fa18027cf6529ec82d5a0fac (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-01-24T14:44:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CamilaMOF_DISSERT.pdf: 1583672 bytes, checksum: f6ff4ec9fa18027cf6529ec82d5a0fac (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-02-15T15:03:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CamilaMOF_DISSERT.pdf: 1583672 bytes, checksum: f6ff4ec9fa18027cf6529ec82d5a0fac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:47:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CamilaMOF_DISSERT.pdf: 1583672 bytes, checksum: f6ff4ec9fa18027cf6529ec82d5a0fac (MD5) Previous issue date: 2015-08-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The growing interest in the production of lipases relates especially to the great biotechnological potential that these enzymes have. Lipases are enzymes that catalyze the hydrolysis of long chain triglyceride transforming them into glycerides and fatty acids. Microbial lipases have been addressed in constituting one of the most important groups of enzymes for biotechnological applications in several industrial sectors. Because of the promising potential of these enzymes and knowing that microorganisms use oils and fats as a carbon source for the production of lipases, this study aimed the isolation of lipase-producing bacteria from wastewater samples slaughterhouse through enrichment and growth in culture medium. A total of 68 morphologically distinct strains were recovered throughout the experiment. Subsequently, the lipase producing strains were selected by enzyme assay with the fluorescent dye Rhodamine B, which results in a fluorescent complex by the production of lipases in the plates. The results showed nine promising strains in the enzymatic test: ABAD01, ABAD05, ABAD07, ABAD09, ABAD12, ABAD17, ABAD20, ABAD21 and ABAD23. Likewise, reflecting the importance of studying the biotechnological potential of the microbial community associated to environments with high lipid content for the study of strains that produce lipases, with applications in the industry and in animal production / O crescente interesse na produção de lipases está especialmente relacionado ao grande potencial biotecnológico que estas enzimas apresentam. As lipases são enzimas que catalisam a hidrólise de longas cadeias de triglicerídeos transformando-os em glicerídeos e ácidos graxos. As lipases microbianas têm recebido grande atenção, constituindo um dos mais importantes grupos de enzimas para a aplicação biotecnológica nos mais variados setores industriais. Diante do potencial promissor destas enzimas e sabendo-se que micro-organismos fazem uso de óleos e gorduras como fonte de carbono para a produção de lipase, este trabalho teve como objetivo o isolamento de bactérias produtoras de lipase, a partir de amostras de águas residuais de abatedouro, por meio de enriquecimento e crescimento em meio de cultura. Foram recuperadas 68 linhagens morfologicamente distintas ao longo do experimento. Posteriormente, as linhagens produtoras de lipase foram selecionadas por meio do teste enzimático com corante fluorescente de Rodamina B, a qual resulta na produção de um complexo fluorescente pela produção de lipases nas placas. Os resultados mostraram nove linhagens promissoras no teste enzimático: ABAD01, ABAD05, ABAD07, ABAD09, ABAD12, ABAD17, ABAD20, ABAD21 e ABAD23. Os resultados obtidos refletem a importância em se estudar o potencial biotecnológico da microbiota associada aos ambientes com alto teor lipídico para a prospecção de linhagens produtoras de lipases, e suas futuras aplicações industriais e na produção animal / 2017-01-11
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Isolamento e seleção de bactérias lipolíticas / Isolation and selection of lipolytic bacteria

Souza, Camila Michele Pereira de 25 February 2016 (has links)
Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2017-01-11T16:29:41Z No. of bitstreams: 1 CarlaMPS_DISSERT.pdf: 1086600 bytes, checksum: 49317ae6809eaa5cf0c66b69c7c2370a (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-01-24T14:44:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarlaMPS_DISSERT.pdf: 1086600 bytes, checksum: 49317ae6809eaa5cf0c66b69c7c2370a (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-02-15T14:56:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarlaMPS_DISSERT.pdf: 1086600 bytes, checksum: 49317ae6809eaa5cf0c66b69c7c2370a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:54:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarlaMPS_DISSERT.pdf: 1086600 bytes, checksum: 49317ae6809eaa5cf0c66b69c7c2370a (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The production of enzymes by microorganisms is advantageous that the vegetable and animal origin due to the ease in obtaining and handling them. The processes catalyzed by microbial enzymes are generally faster, more efficient, less costly and environmentally sustainable than those that are made with chemical catalysts. This fact directly influences the increased use of these enzymes in industrial environment. Lipases are enzymes that catalyze the hydrolysis of long chain triglyceride transforming them into glycerides and fatty acids. Microbial lipases are part of one of the most important groups of enzymes for industrial application. Besides being involved in certain processes in the food, pharmaceutical, cosmetics, textile, paper and leather, these enzymes are also used in supplementation of animal feed that have deficiency in processing lipids. On the promising potential of these enzymes, this work had as main objective the isolation of bacteria producing lipase from samples from hot springs with temperatures ranging from 37-54 ° C. The most promising lines for lipase production were selected by testing the Rhodamine B and p-nitrophenyl palmitate (pNPP). Of the 51 isolated bacterial strains, 17 demonstrated the potential lipolytic Rhodamine test. Of these, nine were selected in the enzyme activity test (pNPP) verifying that the cultivation temperature influences the production of enzymes. The temperature of 30 ° C was the most favorable to growth and production of the enzymes. For the enzymatic activity temperature, it was found that one of the lines has greater activity at 70 ° C, thereby increasing interest in the use of same in the industrial environment the thermostable enzyme production. The results reflect the importance of studying the biotechnological potential of the microbiota associated with thermal environments for prospecting producing strains of lipases, and future agro-industrial applications / A produção de enzimas por microrganismos é mais vantajosa que as de origem vegetal e animal devido à maior facilidade na obtenção e manipulação dos mesmos. Os processos catalisados por enzimas microbianas são geralmente mais rápidos, mais eficientes, de menor custo e ambientalmente sustentáveis do que aqueles que são realizados com catalisadores químicos. Esse fato influencia diretamente no aumento da utilização dessas enzimas no ambiente industrial. As lipases são enzimas que catalisam a hidrólise de longas cadeias de triglicerídeos transformando-os em glicerídeos e ácidos graxos. As lipases microbianas fazem parte de um dos mais importantes grupos de enzimas para a aplicação industrial. Além de estar envolvida em determinados processos dos setores alimentício, farmacêutico, cosméticos, têxtil, de papel e couro, essas enzimas também são utilizadas na suplementação de ração para animais que possuem deficiência no processamento de lipídeos. Diante do potencial promissor destas enzimas, este trabalho teve como objetivo principal o isolamento de bactérias produtoras de lipase a partir de amostras provenientes de águas termais com temperaturas variando entre 37 a 54 °C. As linhagens mais promissoras para produção de lipase foram selecionadas por meio do teste da Rodamina B e do p-nitrofenil palmitato (pNPP). Das 51 linhagens bacterianas isoladas, 17 demonstraram potencial lipolítico no teste de Rodamina. Destas, nove foram selecionadas no teste de atividade enzimática (pNPP) verificando que a temperatura de cultivo influencia na produção das enzimas. A temperatura de 30 °C foi a mais favorável para crescimento e produção das enzimas. Quanto à temperatura de atividade enzimática, verificou-se que uma das linhagens possui maior atividade à 70 °C, aumentando assim, o interesse da utilização da mesma no meio industrial pela produção enzimática termoestável. Os resultados obtidos refletem a importância em se estudar o potencial biotecnológico da microbiota associada aos ambientes térmicos para a prospecção de linhagens produtoras de lipases, e suas futuras aplicações agroindustriais / 2017-01-11
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Campoletis flavicincta (Hym., Ichneumonidae) : ocorrência, criação e interação com Spodoptera frugiperda (Lep., Noctuidae) e Bacillus thuringiensis aizawai

Dequech, Sonia Thereza Bastos January 2002 (has links)
Spodoptera frugiperda é um inseto-praga responsável por altos níveis de desfolhamento em gramíneas cultivadas, sendo que, dentre os métodos de controle, o biológico pode vir a tornar-se uma alternativa. Foi feita uma revisão de literatura sobre parasitóides de S. frugiperda. A ocorrência de parasitóides desse inseto, em áreas de cultivo de milho da EEA/IRGA, foi avaliada em Cachoeirinha, RS. Verificou-se a presença de Chelonus sp., Cotesia sp. e Exaticolus sp. (Hym., Braconidae), Campoletis flavicincta e Ophion sp. (Hym., Ichneumonidae) e de Archytas incertus e Lespesia archippivora (Dip., Tachinidae), com predomínio de C. flavicincta. Em função da dificuldade de obtenção de fêmeas deste inseto em laboratório, foram avaliadas diferentes condições de criação. Desta forma, registrou-se uma razão sexual de 0,41 quando foram expostas lagartas de segundo ínstar de S. frugiperda, as fêmeas do parasitóide apresentavam idade entre 3 e 6 dias e os casais foram formados no momento da exposição. Por fim, aspectos referentes à interação entre C. flavicincta/S. frugiperda/B. thuringiensis aizawai, em laboratório, foram avaliados A partir de análise do consumo alimentar de folhas de milho, observou-se que lagartas parasitadas e infectadas apresentaram um menor consumo, apesar do mesmo não ter diferido daquele de lagartas apenas parasitadas. A mortalidade das lagartas parasitadas e infectadas foi superior tanto das infectadas quanto das parasitadas. Lagartas infectadas mostraram um período de alimentação que não diferiu das sadias, apesar de terem apresentado maior duração da fase larval. Indivíduos descendentes de casais que emergiram de lagartas infectadas não tiveram alteradas suas características biológicas. A análise histológica de lagartas parasitadas e infectadas indicou não ter havido alteração no ovo e larva do parasitóide, resultante da ação do bacilo. Pode-se, portanto, inferir que o uso conjunto do parasitóide e da bactéria não resulta em prejuízo para o parasitóide.
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Estudo de comunidade microbiana de bactérias redutoras de sulfato in vitro com água produzida de petróleo

Batista, Luiz Lázaro Franco 31 July 2013 (has links)
Submitted by Programa de Pós-graduação em Biotecnologia (mebiotec.ufba@gmail.com) on 2017-04-04T12:27:38Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Final - Luiz Lázaro.pdf: 1338858 bytes, checksum: 269d38d39fa68af0cd603b45d636eb6a (MD5) / Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2017-06-29T14:32:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Final - Luiz Lázaro.pdf: 1338858 bytes, checksum: 269d38d39fa68af0cd603b45d636eb6a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T14:32:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Final - Luiz Lázaro.pdf: 1338858 bytes, checksum: 269d38d39fa68af0cd603b45d636eb6a (MD5) / As Bactérias redutoras de sulfato (BRS) são responsáveis pela corrosão de tubos de metal e estruturas de transporte de óleo em estações de petróleo (corrosão induzida por micro-organismos – CIM). Além da corrosão, a produção de sulfeto de hidrogênio por estas bactérias produz um fenômeno denominado de acidificação do óleo (souring). Para inibir a ação das BRS, o glutaraldeído tem sido utilizado em poços de petróleo como biocida, mas seu uso apresenta determinados inconvenientes, tais como contaminação das águas subterrâneas, bem como os efeitos adversos da exposição ocupacional. Como uma alternativa para a utilização de biocidas, a utilização de micro-organismos e/ou os seus bioprodutos para tentar inibir a ação das BRS mostrou-se como uma alternativa ambientalmente mais segura em vários processos industriais, por exemplo, na indústria do petróleo, na qual os micro-organismos e seus bioprodutos (biossurfactantes) podem ser usados na recuperação melhorada de petróleo e como agentes de inibição microbiana. A detecção e quantificação de bactérias redutoras de sulfato (BRS), em poços de petróleo, utilizando-se hibridação fluorescente in situ (FISH) e DAPI (4,6-dicloroamino fenol indol) são ferramentas muito úteis para o controle destas comunidades ao longo de um período de tempo, a fim de avaliar a sua distribuição temporal e espacial. O presente trabalho teve como finalidades: a detecção e quantificação de BRS em amostras de água produzida de petróleo, de modo a avaliar a influência de micro-organismos que produzem biossurfactantes na inibição do crescimento de BRS e, assim, inibir a produção de sulfeto de hidrogênio.
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Caracterização parcial de análogos de genes de resistência em duas espécies de eucalipto / Partial characterization of resistance gene analogs from two Eucalyptus species

Gomes, Luana Mahé Costa 10 August 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T19:13:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1057121 bytes, checksum: bf75cf6f735caaf7d72e5ad8a513b28f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T19:13:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1057121 bytes, checksum: bf75cf6f735caaf7d72e5ad8a513b28f (MD5) Previous issue date: 2005-08-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A maioria dos genes de resistência (genes R) clonados codifica para proteínas R que contêm um domínio C-terminal rico em repetições do aminoácido leucina (domínio LRR), um domínio central conservado contendo sítios de ligação a nucleotídeos trifosfatados (domínio NBS) e um domínio N-terminal variável (TIR ou não-TIR). O domínio LRR provavelmente está envolvido no reconhecimento de proteínas do patógeno produzidas durante o processo de infecção. O domínio NBS está relacionado com a hidrólise de nucleotídeos trifosfatados e participa de uma sinalização celular necessária à resposta de resistência da planta. A região N-terminal variável pode conter um domínio com similaridade com a proteína ao Toll de Drosophila e Interleucina de mamíferos (TIR) ou ainda um domínio não-TIR, como coiled-coil (CC), ambos aparentemente envolvidos com sinalização celular. Ao contrário do observado em culturas agronômicas, existem poucos trabalhos de caracterização de genes de resistência em árvores, especialmente em Eucalyptus. Estudos de caracterização do transcriptoma desta planta, como parte do projeto Genolyptus (http://genolyptus.ucb.br), resultaram na identificação de várias etiquetas de sequências de genes expressos (ESTs) com similaridade a genes R e genes envolvidos em resposta de defesa. Desta forma, este trabalho teve por objetivos: 1) sequenciar completamente oito cDNAs de eucalyptus pré- selecionados por possuírem similaridade com genes envolvidos em resistência a doenças em diferentes espécies vegetais, como linho e Populus e ao gene Rar1 envolvido em resposta de defesa; 2) identificar clones BACs de E. grandis vcorrespondentes a cada um desses cDNAs, visando a futura determinação desses genes; e 3) sequenciar parcialmente pelo menos um clone BAC visando determinar a estrutura completa de pelo menos um gene similar a gene R. A caracterização dos cDNAs revelou que a maioria dos clones possuem sequências incompletas de genes R. Foram identificados onze clones BACs (insertos variando de 20 a 280 kb) correspondentes a esses genes e um deles foi selecionado (BAC 143 F-12, inserto de 90 kb) para construção de uma biblioteca shotgun, visando a caracterização parcial de seu inserto. As sequências parciais de 917 subclones desta biblioteca foram agrupadas em 14 contíguos sendo que nove apresentaram similaridade com genes conhecidos. Dois contíguos mostraram similaridade com genes que codificam proteínas da classe TIR-NBS-LRR e os demais a genes que codificam para fosfatidilinositol 3-quinases putativas, poligalacturonase e a poliproteínas putativas (retrotransposons do grupo Ty1-copia). Análises mais detalhadas dos contíguos com sequências similares a genes R revelaram que um deles contém a ORF completa de um gene da classe TIR-NBS-LRR e o outro contém um gene truncado com domínios TIR-NBS e parte de um domínio LRR. Esses resultados sugerem que este BAC seja derivado de uma região genômica de E. grandis que contém um agrupamento de genes TIR-NBS-LRR. Futuros estudos de mapeamento genético poderão determinar se a sequência desse BAC co- localiza com genes de resistência em E. grandis. / Several resistance genes (R genes) have been isolated from various plant species in the last decade. These R genes can be categorized into several distinct classes based on their predicted protein structures. The largest class falls into the NBS-LRR class, which encodes a nucleotide site domain and a leucine-rich repeat (LRR) domain. NBS-LRR R genes can be further subdivided into toll and interleukin-1 (TIR) and non-TIR classes based on the presence of a TIR domain at the N-terminus of the protein. In contrast to agronomic cultures, there are few resistance genes characterized in woody plants, especially in Eucalyptus. Transcript characterization studies of this tree, as part of Genolyptus Project (http://genolyptus.ucb.br), have identified several expressed sequence tags (ESTs) similar to R genes and disease resistance response genes. Therefore, this work aimed to: (1) completely sequence eight pre- selected eucalyptus cDNAs with similarity to R genes from flax and Populus and to resistance response Rar1 gene from barley; (2) identify E. grandis BAC clones corresponding to these cDNAs, seeking future R gene genomic organization studies; and (3) partially sequence at least one BAC clone to determine the complete structure of al least one resistance gene analog. The sequencing results showed that the majority of the cDNAs analyzed are truncated, representing incomplete sequences of R genes analogs. Eleven BAC clones were identified (inserts varying from 20 to 280 kb) that correspond to these cDNAs and one (BAC 143F12, 90 kb insert) was characterized by shotgun sequencing. Partial sequences obtained from 917 BAC subclones were viigrouped in 14 contigs. Nine contigs showed similarity to known genes. Two contigs were similar to TIR-NBS-LRR genes and the others to putative phosphatidylinositol 3-kinase, polygalacturonase and putative polyproteins (Ty1-copia group retrotransposons). Detailed analysis of the contigs similar to R genes demonstrated that one has a complete ORF of a TIR-NBS-LRR gene and the other has one TIR-NBS pseudogene with truncated LRR domain. These results suggest that the insert of this BAC is derived from a Eucalyptus grandis genomic region that contains a cluster of TIR-NBS-LRR genes. Future genetic mapping studies will elucidate if these BAC inserts co-localize with known R genes in Eucalyptus.

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