Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-18T20:46:06Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-12-18T20:46:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T20:46:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Reprodução Não Autorizada.pdf: 47716 bytes, checksum: 0353d988c60b584cfc9978721c498a11 (MD5) Previous issue date: 2017-06-12 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Women in the gestation period undergo several physiological, immunological, hormonal and anatomical changes in their body, changes that leave them vulnerable to some infections. One of the pathogens that frequently infects women and which may have a considerable impact on pregnant women is the bacterium Chlamydia trachomatis (CT), whose infection is generally silent and can have serious consequences for the mother and fetus, such as premature birth, tubal pregnancy, and spontaneous abortion. The routine screening of this bacterium in women of childbearing age and in pregnant women has been carried out in some developed countries, but not yet in Brazil. The objective of this study was to study CT infection in pregnant women attended at the Basic Health Units of the Municipality of Coari, Amazonas, Brazil, and to verify possible associations between the presence of CT and clinical-epidemiological variables. It is a descriptive and cross-sectional study, with pregnant women attended at these units during the prenatal visit between July 2016 and March 2017. The pregnant women answered a questionnaire containing socio-demographic, behavioral and clinical data. The diagnosis of CT was performed using the polymerase chain reaction (PCR) technique in urine and cervix-vaginal samples. Of a total of 164 pregnant women selected, 100 were included in the study. The mean age was 22.87 years (SD = 6.24). The prevalence rate of CT infection was 18% (18/100). The prevalence of CT in the urine samples was 15% (95% CI: 8.65 - 23.53) and in the cervix-vaginal samples was 11% (95% CI: 5.62 - 18.83). The prevalence of CT was found in pregnant women with a mean age of 21.15 years (SD = 4.65), and was higher in those who started sexual activity before 15 years of age, and in the primigravida, but it was only Associated with those who had more than two partners in the last 12 months (p = 0.022) and those with gynecological complaint of "pain after intercourse" (p = 0.05). This study showed a high prevalence (18%) of CT infection among pregnant women in the municipality of Coari/AM, and reinforces the need to screen for this infection during prenatal care in this population. / As mulheres, no período da gestação, passam por diversas alterações fisiológicas, imunológicas, hormonais e anatômicas em seu corpo, alterações estas que as deixam vulneráveis a algumas infecções. Um dos patógenos que frequentemente infecta mulheres e que pode ter considerável impacto sobre gestantes é a bactéria Chlamydia trachomatis (CT), cuja infecção é geralmente silenciosa e pode trazer sérias consequências para a mãe e o feto, tais como o parto prematuro, gravidez tubária e aborto espontâneo. O rastreamento rotineiro dessa bactéria em mulheres em idade fértil e em gestantes tem sido realizado em alguns países desenvolvidos, mas ainda não no Brasil. O objetivo desta pesquisa foi estudar a infecção por CT em gestantes atendidas nas Unidades Básicas de Saúde do Município de Coari, Amazonas, Brasil, e verificar possíveis associações entre a presença de CT e variáveis clínico-epidemiológicas. Trata-se de um estudo descritivo e transversal, com gestantes atendidas nessas unidades durante a consulta de pré-natal, entre julho de 2016 e março de 2017. As gestantes responderam um questionário contendo dados sócio-demográficos, comportamentais e clínicos. O diagnóstico da CT foi realizado pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) em amostras de urina e cérvico-vaginais. De um total de 164 gestantes selecionadas, 100 foram incluídas no estudo. A média de idade foi de 22,87 anos (DP= 6,24). A taxa de prevalência da infecção por CT encontrada foi de 18% (18/100). A prevalência da CT nas amostras de urina foi de 15% (IC95%: 8,65 – 23,53) e nas amostras cérvico-vaginais foi de 11% (IC95%: 5,62 – 18,83). A prevalência da CT foi encontrada nas gestantes com média de idade de 21,15 anos (DP=4,65), e foi maior nas que tiveram o início da atividade sexual antes dos 15 anos de idade, e nas primigesta, no entanto, somente associada com as que tiveram mais de dois parceiros nos últimos 12 meses (p= 0,022) e as que apresentaram queixa ginecológica “dor após a relação sexual” (p= 0,05). Este estudo mostrou uma alta prevalência (18%) da infecção causada por CT entre gestantes do município de Coari/AM, e reforça a necessidade do rastreio dessa infecção durante o pré-natal nessa população.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-01-14T14:45:50Z No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Balduino Soares Neves - 2015.pdf: 3774564 bytes, checksum: eb9b5dc9c1e9f4f480f018147b1f98f3 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-01-15T09:47:31Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Balduino Soares Neves - 2015.pdf: 3774564 bytes, checksum: eb9b5dc9c1e9f4f480f018147b1f98f3 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-15T09:47:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Rodrigo Balduino Soares Neves - 2015.pdf: 3774564 bytes, checksum: eb9b5dc9c1e9f4f480f018147b1f98f3 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-09-17 / Fundação de Apoio à Pesquisa - FUNAPE / O uso de parâmetros como a contagem bacteriana total (CBT) e a contagem celular somática (CCS) permite monitorar as condições higiênicas da produção de leite, além da sanidade da glândula mamária dos rebanhos. O presente estudo foi desenvolvido com objetivo de identificar clusters para o perfil higiênico-sanitário do leite, representado pela CBT e pela CCS, em rebanhos bovinos localizados em mesorregiões do Estado de Goiás. Trata-se de um estudo coorte retrospectivo de rebanhos bovinos leiteiros. Foram avaliados 1.600 rebanhos, que possuíam registro regular de análise do leite no Laboratório de Qualidade do Leite do CPA/EVZ/UFG de Goiânia, GO, Brasil ao longo dos anos de 2012, 2013 e 2014. Para análise estatística empregou-se o teste de Scott Knott ao nível de significância de 5%. Para espacialização dos dados, foi utilizado o método Krigagem do Sistema de Informações Geográficas (SIG) ArcGIS 10.1®. Para identificar os clusters utilizou-se a ferramenta Cluster and Outlier Analysis. A média da CBT no ano de 2014 foi de 102.000 UFC/mL. Enquanto a média de CCS, em 2014, foi de 295.000 Céls/mL. As médias geométricas de CBT e CCS no período de 2012, 2013 e 2014 atenderam o limite legal de 300.000 UFC/mL e 500.000 Cels/mL, mas parcelas de 23% e 21% dos rebanhos, respectivamente, estão acima desse limite legal. Foram identificados clusters que apresentaram contagem alta-alta em todas as mesorregiões avaliadas nos diferentes períodos (chuva e seca) dos anos de 2012, 2013 e 2014. Embora as médias dos indicadores higiênicos sanitários, CBT e CCS estejam em acordo com os limites legais, ao utilizar a ferramenta espacial verificou-se que existem clusters de qualidade que não atendem os padrões legais. / O uso de parâmetros como a contagem bacteriana total (CBT) e a contagem celular somática (CCS) permite monitorar as condições higiênicas da produção de leite, além da sanidade da glândula mamária dos rebanhos. O presente estudo foi desenvolvido com objetivo de identificar clusters para o perfil higiênico-sanitário do leite, representado pela CBT e pela CCS, em rebanhos bovinos localizados em mesorregiões do Estado de Goiás. Trata-se de um estudo coorte retrospectivo de rebanhos bovinos leiteiros. Foram avaliados 1.600 rebanhos, que possuíam registro regular de análise do leite no Laboratório de Qualidade do Leite do CPA/EVZ/UFG de Goiânia, GO, Brasil ao longo dos anos de 2012, 2013 e 2014. Para análise estatística empregou-se o teste de Scott Knott ao nível de significância de 5%. Para espacialização dos dados, foi utilizado o método Krigagem do Sistema de Informações Geográficas (SIG) ArcGIS 10.1®. Para identificar os clusters utilizou-se a ferramenta Cluster and Outlier Analysis. A média da CBT no ano de 2014 foi de 102.000 UFC/mL. Enquanto a média de CCS, em 2014, foi de 295.000 Céls/mL. As médias geométricas de CBT e CCS no período de 2012, 2013 e 2014 atenderam o limite legal de 300.000 UFC/mL e 500.000 Cels/mL, mas parcelas de 23% e 21% dos rebanhos, respectivamente, estão acima desse limite legal. Foram identificados clusters que apresentaram contagem alta-alta em todas as mesorregiões avaliadas nos diferentes períodos (chuva e seca) dos anos de 2012, 2013 e 2014. Embora as médias dos indicadores higiênicos sanitários, CBT e CCS estejam em acordo com os limites legais, ao utilizar a ferramenta espacial verificou-se que existem clusters de qualidade que não atendem os padrões legais.

Submitted by Cristiane Cunha Guimarães (cristiane_c_guimaraes@hotmail.com) on 2018-09-26T19:50:36Z No. of bitstreams: 3 Ata de defesa.jpg: 323992 bytes, checksum: 07db65a3446ffd679e88c4c15e7ca402 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 291328 bytes, checksum: 6b041928e3526b18982f978a05efcd43 (MD5) Cristiane Cunha Guimarães-DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL.pdf: 1526233 bytes, checksum: c79b2f93789c5784cb7aed7841056023 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGCAN Ciência Animal (ppgcan.ufam@gmail.com) on 2018-09-26T20:40:48Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Ata de defesa.jpg: 323992 bytes, checksum: 07db65a3446ffd679e88c4c15e7ca402 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 291328 bytes, checksum: 6b041928e3526b18982f978a05efcd43 (MD5) Cristiane Cunha Guimarães-DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL.pdf: 1526233 bytes, checksum: c79b2f93789c5784cb7aed7841056023 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-09-26T20:55:15Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Ata de defesa.jpg: 323992 bytes, checksum: 07db65a3446ffd679e88c4c15e7ca402 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 291328 bytes, checksum: 6b041928e3526b18982f978a05efcd43 (MD5) Cristiane Cunha Guimarães-DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL.pdf: 1526233 bytes, checksum: c79b2f93789c5784cb7aed7841056023 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-26T20:55:15Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Ata de defesa.jpg: 323992 bytes, checksum: 07db65a3446ffd679e88c4c15e7ca402 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 291328 bytes, checksum: 6b041928e3526b18982f978a05efcd43 (MD5) Cristiane Cunha Guimarães-DISSERTAÇÃO DE MESTRADO EM CIÊNCIA ANIMAL.pdf: 1526233 bytes, checksum: c79b2f93789c5784cb7aed7841056023 (MD5) Previous issue date: 2018-08-31 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this study was to evaluate the potential for production of silage from the waste from the processing of the tambaqui, evaluating the chemical and nutritional characteristics and the same use in the diet of laying hens for light commercial verification of apparent digestibility and energy metabolism. Treatments for production of silage if differentiated as the amount of inoculum (pure cultures of Lactobacillus plantarum). In the digestibility assay were used 72 layers of White Hisex with 62 weeks of age. For the treatments are designed to control feed and the feed with inclusion of 5% of the residual biological silage tambaqui. The biological method for preparation of silage from the residue of tambaqui obtained positive results in the conservation of the residual mass in clamped all percentages of inoculum. During the evaluation of the centesimal composition of organic wet silage tambaqui residue, the treatments were no significant difference and remained close in relation to residue in natura. In the dehydration of the product held with 14 days of inoculation, the centesimal composition of the product in their treatments presented promising results. Treatment with 2,5% of inoculum excelled the other treatments with regard to nutritional parameters for use in feed of layers, showing concentration of crude protein (CP)-33,29%, lipídieo (L)-33,65% and minerals Ca-21,26 g/Kg-¹ and P-11,98 g/ Kg-¹. The dehydrated product with 35 days of inoculation also presented excellent results for analysis of centesimal composition. The inclusion of 5% biological silage of tambaqui on light commercial layer diet showed good performance in the metabolism of protein and lipid, can be considered as a protein food or energy for use in power layers. The preparation of organic fish silage becomes an alternative to the fishing industry, promoting a sustainable and profitable destination, waste generated during processing, with potential for use in animal feed. / O objetivo deste estudo foi avaliar o potencial de produção de silagem a partir dos resíduos provenientes do beneficiamento do tambaqui, avaliando as suas características químicas e nutricionais e uso da mesma na dieta de poedeiras comerciais leves para verificação da digestibilidade aparente e metabolização energética. Os tratamentos para produção do ensilado se diferenciaram quanto a quantidade de inóculo (culturas puras da bactéria Lactobacillus plantarum). No ensaio de digestibilidade foram utilizadas 72 poedeiras da linhagem Hisex White com 62 semanas de idade. Para os tratamentos foram elaboradas a ração controle e a ração com inclusão de 5% da silagem biológica de resíduo de tambaqui. O método biológico para elaboração de silagem a partir do resíduo de tambaqui obteve resultados positivos na conservação da massa residual ensilada, em todos os percentuais de inóculo avaliados. Durante a avaliação da composição centesimal da silagem biológica úmida de resíduo de tambaqui, os tratamentos mostraram-se sem diferença significativa e se mantiveram próximos em relação ao resíduo in natura. Na desidratação do produto realizada com 14 dias de inoculação, a composição centesimal do produto nos respectivos tratamentos apresentou resultados promissores. O tratamento com 2,5% de inóculo se destacou aos demais tratamentos quanto aos parâmetros nutricionais para uso na alimentação das poedeiras, apresentando concentração de proteína bruta (PB)-33,29%, lipídieo (L)-33,65% e minerais Ca-21,26 g/Kg-¹ e P-11,98 g/Kg-¹. O produto desidratado com 35 dias de inoculação também apresentou ótimos resultados para análise de composição centesimal. A inclusão de 5% da silagem biológico de resíduos de tambaqui na dieta de poedeiras comerciais leves apresentou bom desempenho na metabolização de proteína e lipídeo, podendo este ser considerado como um alimento proteico ou energético para fins de uso na alimentação de poedeiras. A elaboração da silagem biológica de pescado torna-se uma alternativa para a indústria pesqueira, promovendo um destino sustentável e lucrativo, aos resíduos gerados durante o processamento, com potencial para utilização na alimentação de animal.

O Brasil é um dos três maiores produtores mundiais de frutas, com uma produção que supera os 39 milhões de toneladas, com grande participação no mercado externo e crescente participação no mercado interno. Entretanto, não basta apenas ter quantidade, a qualidade e inocuidade do alimento são quesitos cada vez mais exigidos pelos consumidores. Tem-se conhecimento que produtos in natura podem apresentar contaminantes microbiológicos e a refrigeração é tipicamente utilizada para retardar o desenvolvimento microbiano nos produtos frescos. Microrganismos psicrotróficos, como Listeria monocytogenes, são capazes de se desenvolverem sob refrigeração. Esta bactéria é um importante patógeno causador de doenças transmitidas por alimentos e, devido a gravidade da doença e a elevada taxa de mortalidade em indivíduos suscetíveis, vem merecendo a atenção de microbiologistas de alimentos e profissionais da área da saúde. Nas frutas de baixa acidez, dentre as quais está o caqui (Diospyros kaki), L. monocytogenes pode ainda ter condições para sobreviver e se multiplicar, pois esta fruta não é submetida a tratamentos fitossanitários pós-colheita. Em muitos países, incluindo o Brasil, o caqui é consumido com a casca, logo, uma provável contaminação externa torna a situação ainda mais crítica com relação a inocuidade do produto. Assim sendo, este estudo teve como objetivos: (1) verificar a incidência de L. monocytogenes na casca de caquis (Diospyros kaki) \'Fuyu\' e \'Rama Forte\'; (2) estudar a sobrevivência e multiplicação daquele patógeno na casca e na polpa dessa fruta em diferentes tempos e temperaturas de incubação; (3) e obter parâmetros de crescimento (a duração da fase lag, o tempo de geração e a taxa de crescimento exponencial). A pesquisa de incidência de L. monocytogenes na superfície dos caquis foi realizada durante os meses de março a julho nos anos de 2005 e 2006. As amostras foram coletadas no comércio varejista na região de Campinas, interior do Estado de São Paulo, e no atacado, sendo o CEAGESP o local escolhido para esse último tipo de coleta. Um total de 582 frutos foram analisados pelo sistema Bax®, que é um método baseado na Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). A habilidade desse patógeno se desenvolver nas duas variedades de caqui estudadas também foi verificada na polpa e na casca das frutas em diferentes tempos de incubação e a temperaturas de 10ºC, 20ºC e 30ºC. Os parâmetros de crescimento de L. monocytogenes (duração da fase lag, taxa de crescimento exponencial e tempo de geração) foram obtidos a partir dos dados experimentais. A pesquisa de incidência revelou ausência de L. monocytogenes nas cascas das frutas. Os dados de crescimento obtidos para o patógeno indicam que este pode sobreviver e se multiplicar tanto na polpa quanto na casca dos caquis \'Fuyu\' e \'Rama Forte\', e que a baixa temperatura pode retardar o seu crescimento, mas não evitá-lo. / Brazil is among of the three biggest fruit producer in the world, with a production that is over 39 million tons, a relevant participation in the international market and an increasing participation in the domestic market. However, beyond quantity the quality and safety of food are issues equally demanded by consumers. It has been known that in natura products can contain microbiological contaminants and cooling is normally used to retard microbial development in fresh produce. Psychotrophic microorganisms, such as Listeria monocytogenes, are able to develop under refrigeration. This bacterium has been recognized as an important foodborne pathogen and, due to the severity of the disease and the high mortality in susceptible individuals, it has been deserving the attention of food microbiologists and health professionals. In fruits of low acidity, in which persimmon fruit is included, L. monocytogenes can have conditions to survive and to multiply, because it is not submitted to post harvest treatments. In many countries, including Brazil, persimmon is consumed with its skin, so an external contamination may make the situation even more critical with respect to the product safety. So the objectives of the present study were: (1) to verify the incidence of L. monocytogenes on the skin of \'Fuyu\' and \'Rama Forte\' persimmons (Diospyros kaki) fruits; (2) to study the survival and multiplication of that pathogen on the skin and in the pulp of this fruit at different times and temperatures of incubation; (3) to obtain kinetic values (lag phase duration, generation time and exponential growth). The incidence of L. monocytogenes on the skin of persimmon was verified from March to July in the years of 2005 and 2006. Samples were collected from retail in the city of Campinas, State of Sao Paulo, and from wholesale CEAGESP. A total of 582 fruits were analyzed using the Bax® System, which is a method based on Polymerase Chain Reaction (PCR). The ability of this pathogen to develop in both varieties of persimmons studied was also verified on the surface and in the pulp of the fruits at different times of incubation and at 10ºC, 20ºC and 30ºC. Kinetic values of L. monocytogenes (lag phase duration, generation time and exponential growth) were obtained from experimental data. The incidence survey showed the absence of L. monocytogenes on the skin of the fruit. The growth data showed that this pathogen can grow on the surface as well in the pulp of the \'Fuyu\' and \'Rama Forte\' persimmon fruits and that low temperatures can reduce the generation rate but does not inhibit its growth.

Spodoptera frugiperda é um inseto-praga responsável por altos níveis de desfolhamento em gramíneas cultivadas, sendo que, dentre os métodos de controle, o biológico pode vir a tornar-se uma alternativa. Foi feita uma revisão de literatura sobre parasitóides de S. frugiperda. A ocorrência de parasitóides desse inseto, em áreas de cultivo de milho da EEA/IRGA, foi avaliada em Cachoeirinha, RS. Verificou-se a presença de Chelonus sp., Cotesia sp. e Exaticolus sp. (Hym., Braconidae), Campoletis flavicincta e Ophion sp. (Hym., Ichneumonidae) e de Archytas incertus e Lespesia archippivora (Dip., Tachinidae), com predomínio de C. flavicincta. Em função da dificuldade de obtenção de fêmeas deste inseto em laboratório, foram avaliadas diferentes condições de criação. Desta forma, registrou-se uma razão sexual de 0,41 quando foram expostas lagartas de segundo ínstar de S. frugiperda, as fêmeas do parasitóide apresentavam idade entre 3 e 6 dias e os casais foram formados no momento da exposição. Por fim, aspectos referentes à interação entre C. flavicincta/S. frugiperda/B. thuringiensis aizawai, em laboratório, foram avaliados A partir de análise do consumo alimentar de folhas de milho, observou-se que lagartas parasitadas e infectadas apresentaram um menor consumo, apesar do mesmo não ter diferido daquele de lagartas apenas parasitadas. A mortalidade das lagartas parasitadas e infectadas foi superior tanto das infectadas quanto das parasitadas. Lagartas infectadas mostraram um período de alimentação que não diferiu das sadias, apesar de terem apresentado maior duração da fase larval. Indivíduos descendentes de casais que emergiram de lagartas infectadas não tiveram alteradas suas características biológicas. A análise histológica de lagartas parasitadas e infectadas indicou não ter havido alteração no ovo e larva do parasitóide, resultante da ação do bacilo. Pode-se, portanto, inferir que o uso conjunto do parasitóide e da bactéria não resulta em prejuízo para o parasitóide.

Submitted by Rosangela Silva (rosangela.silva3@unioeste.br) on 2018-06-25T13:50:49Z No. of bitstreams: 2 IVAIR MALAGI.pdf: 884398 bytes, checksum: 2a11b4469ff506f41317eea546df7e21 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-25T13:50:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 IVAIR MALAGI.pdf: 884398 bytes, checksum: 2a11b4469ff506f41317eea546df7e21 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aquatic ecosystems of urban rivers are affected by the disposal of waste from the sewage network. In the present research, the water quality of six rivers of the city of Cascavel - PR, being the rivers Cascavel, Quati, Bezerra, Antas, Lageado Clarito and Amambay. The collections conducted from March to November 2017 were used microbiological, physico-chemical and susceptibility/resistance of strains of Escherichia coli to antimicrobials. For coliforms it was followed the methodology described by Silva et al. (1997), the physical-chemical parameters performed with the Horiba manual probe end the susceptibility antimicrobial was evaluate accoording with the recomendations of Clinical and Laboratory Standards Institute (2015). There were significant differences between the months evaluated for the physico-chemical, microbiological and resistance parameters. Among the parameters evaluated just oxygen dissolved, solid total and biochemical oxygen demand, don't were significant. All the six rivers evaluated exceed the limit (<10MNP/mL) for coliforms thermotolerant. Was observed that 55.5% of strains of Escherichia coli were resistent at least one antimicrobial and 14.4% presented multiresistence. The major resistances were to ampicillin, amoxicillin and tetracycline with 21.1, 16.6 and 20% respectively. The result of this search contributing for an evaluation of caution associated with contamination of the waters by sewage, with bacterias highly resistant to antimicrobial on the urban center rivers. / Os ecossistemas aquáticos de rios urbanos são afetados pelo descarte de resíduos da rede de esgoto. Na presente pesquisa, foi avaliada a qualidade da água de seis rios da cidade de Cascavel – PR, sendo eles: Rio Cascavel, Rio Quati, Córrego Bezerra, Rio das Antas, Lageado Clarito e Sanga Amambay. As coletas realizadas no período de março a novembro de 2017 utilizaram-se indicadores microbiológicos, físico-químicos e a suscetibilidade/resistência das cepas de Escherichia coli a antimicrobianos. Para coliformes seguiu-se a metodologia descrita por Silva et al. (1997), os parâmetros físico-químicos realizados com a sonda manual Horiba e a suscetibilidade antimicrobiana foi avaliada de acordo com as recomendações de Clinical and Laboratory Standards Institute (2015). Houve diferenças significativas em entre os meses avaliados para os parâmetros físico-químicos, microbiológicos e para resistência. Dentre os parâmetros avaliados apenas oxigênio dissolvido, sólidos totais e demanda bioquímica de oxigênio, não foram significativos. Todos os seis rios analisados excedem o limite (<10 NMP/mL) para coliformes termotolerantes. Foi observado que 55,5% das cepas de Escherichia coli foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano e 14,4% apresentaram multirresistência. As maiores resistências foram para ampicilina, amoxicilina e tetraciclina com 21,1, 16,6 e 20%, respectivamente. Os resultados dessa pesquisa contribuem para uma avalição dos perigos associados com a contaminação das águas por esgoto juntamente com bactérias resistentes aos antimicrobianos em rios de centros urbanos.

Um dos principais fatores limitantes da produção de algodão é a ocorrência de doenças e, entre os patógenos mais importantes estão às bactérias, que causam danos significativos à cultura. A doença conhecida como mancha angular, causada pela bactéria Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam), é uma doença grave, que tem gerado grande preocupação dos produtores. Porém, muitos cultivares com boas características agronômicas apresentam suscetibilidade ao patógeno e, poucos são aqueles que apresentam resistência à doença. O controle da mancha angular é realizado basicamente com uso de resistência genética ao patógeno. Uma das principais fontes de inóculo para esta bactéria é a semente infectada. Este trabalho objetivou o desenvolvimento de um meio semi-seletivo para o isolamento de Xam em sementes de algodão, visando a utilização em análises de rotina em laboratórios de patologia de sementes. O meio de cultura semi-seletivo possuí a seguinte constituição: 3 g de extrato de carne; 5 g de peptona; 10 g de amido solúvel; 10 mL de Tween 80; 0,25 g de cloreto de cálcio; 150 µL de solução de cristal violeta a 1%; 50 mg de cefalexina; 10 mg de clorothalonil; 10 mg de tiofanato metílico e água destilada por 1000 mL. Este meio de cultura possui baixa repressividade a Xam e permite isolar este patógeno de sementes de algodão. / One of the main limiting factors of the cotton production is the occurrence of diseases. The bacteria are among the most important pathogens causing significant losses in the production. Cotton bacterial blight is caused by the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam). Is a serious disease that affects cotton and has worried world producers. The main source of inoculum for this bacterium is the infected seed. This work had as objective the development of a semi-selective medium to detect Xanthomonas axonopodis pv malvacearum in cotton seeds for routine tests in seed pathology laboratories. By fungitoxicity tests, basead on qualitative and quantitative antibiograms, it was idealized a semi-selective medium with the folloing composition: peptone (5.0 g/L); agar (15.0 g/L); meat extract (3.0 g); starch (10.0 g/L); violet crystal (150.0 µL violet crystal solution at 1%); water (1,000 mL); CaCl2 (0.25 g); Tween 80 (10.0 mL/L). This medium has small effect on Xam and allows to isolate cotton seeds pathogens.

A transformação genética vem sendo, cada vez mais, incorporada em programas de melhoramento genético de diversas espécies. Esta técnica permite a incorporação de gene(s) exógeno(s) no genoma das plantas, modificando características específicas. Assim, apresenta-se como uma importante ferramenta de auxílio ao melhoramento convencional de citros, que possui uma série de limitações impostas pela sua biologia reprodutiva. Entretanto, a transformação genética requer o estabelecimento prévio de sistemas de regeneração de plantas in vitro como requisito essencial para sua execução. Portanto, o objetivo deste trabalho foi estabelecer as condições de cultivo in vitro para organogênese e transformação genética de laranja 'Hamlin', laranja 'Pera', laranja 'Valência', laranja 'Natal' (Citrus sinenis L. Osbeck) e limão 'Cravo' (Citrus limonia L. Osbeck), realizando-se a caracterização anatômica do processo. Buscou-se, inicialmente, otimizar o processo de organogênese e regeneração de plantas in vitro, a partir de segmentos de epicótilo. Explantes foram introduzidos em meio de cultura MT suplementado com BAP, nas concentrações 0,0; 0,5; 1,0; 1,5; 2,0; 2,5; 3,0; 3,5; 4,0 ou 4,5 mg.L -1 . Avaliaram-se o percentual de explantes responsivos e o número de brotações maiores ou iguais a 1,0 cm por explante responsivo. As brotações obtidas foram transferidas para meios de enraizamento, que se constituíram do MT + 1,0 mg.L -1 de NAA, MT + 1,0 mg.L -1 de IBA e MT na ausência de auxina. A concentração de BAP que melhor favoreceu a indução da organogênese foi 1,0 mg.L -1 para as laranjas doces e 0,5-2,5 mg.L -1 para o limão 'Cravo'. O meio de enraizamento com melhor resposta foi o MT + 1,0 mg.L -1 de IBA, para todos os cultivares estudados. Procedeu-se análise anatômica da organogênese in vitro, nas condições ótimas obtidas no trabalho anterior. As gemas adventícias tiveram origem endógena, formando-se a partir de zonas meristemáticas do câmbio vascular, caracterizando-se em organogênese direta. Desenvolveram-se, também, experimentos para estudar a transformação genética, via Agrobacterium, em segmentos de epicótilo de laranja 'Natal', laranja 'Valência' e limão 'Cravo'. Neste caso, estudou-se o tempo de inoculação com Agrobacterium, o período de co-cultivo, a utilização de acetoseringona e a temperatura de incubação durante o co-cultivo e o seccionamento do explante. Plantas transgênicas foram obtidas utilizando-se um período de inoculação de 20 minutos com Agrobacterium tumefaciens (EHA-105), co-cultivo por 3 dias na ausência de acetoseringona no meio de cultura e temperatura de co-cultivo de 23-27 °C. Finalmente, desenvolveu-se um estudo da indução da organogênese, análise histológica e transformação genética, a partir de segmentos internodais de plantas adultas das laranjas 'Hamlin', 'Pera', 'Valência' e 'Natal'. A organogênese foi induzida em meio de cultura DBA3, modificado, suplementado com 1,0 mg.L -1 de BAP e 0,5 mg.L -1 de NAA. Em função dos cortes histológicos concluiu-se que as gemas adventícias formaram-se na superfície do calo, o qual originou-se de sucessivas divisões celulares do câmbio, caracterizando-se em organogênese indireta. Plantas transgênicas de tecido adulto de laranja 'Hamlin' e laranja 'Valência' foram obtidas utilizando-se um dia de co-cultivo a 24 ºC, com ou sem o seccionamento do explante para Hamlin e apenas com o seccionamento do explante para Valência. / Genetic transformation has been more frequently associated with conventional genetic breeding programs of different species. It allows for the introduction of exogenous gene(s) into the plant genome, with the possibility of altering specific characteristics. Thus, it can be an important tool for Citrus conventional breeding programs, which present several limitations imposed by the characteristics of the reproductive biology of this genus. For the success of the transformation system, however, the previous establishment of an efficient in vitro regeneration system is required. The objective of this research was to define in vitro culture conditions for the organogenesis and genetic transformation of Hamlin, Pera, Valencia and Natal sweet oranges (Citrus sinensis L. Osbeck) and Rangpur lime (Citrus limonia L. Osbeck) with the anatomical characterization of the process. Initially, the optimization of the in vitro organogenesis process and plant recovery was attempted using epicotyl segments as explants. For organogenesis induction, the explants were placed in MT culture medium supplemented with BAP (0.0; 0.5; 1.0; 1.5; 2.0; 2.5; 3.0; 3.5; 4.0 or 4.5 mg.L -1 ). The percent of responsive explants and the number of adventitious shoots per explant (> 1.0 cm) were evaluated. The shoots were transferred to rooting media, consisting of MT medium supplemented with NAA or IBA, or absence of auxin. The best BAP concentration for organogenesis induction was 1.0 mg.L -1 for the sweet oranges and between 0.5 and 2.5 mg.L -1 for Rangpur lime. The best rooting medium was MT with 1.0 mg.L -1 IBA for all the cultivars. Anatomical analysis was done to describe the optimized culture conditions. Adventitious buds originated endogenously from meristematic regions of the vascular cambium, characterizing a direct organogenesis. Studies were also done to analyze the genetic transformation of the sweet orange cultivars Natal and Valencia and Rangpur lime via Agrobacterium. Several experiments were installed to define the period of Agrobacterium inoculation and co-cultivation, the presence or absence of acetoseryngone, the temperature of incubation and the explant condition (with or without a longitudinal cut). Transgenic plants were obtained using an inoculation period of 20 minutes and co-cultivation for 3 days at 23-27 °C in absence of acetoseryngone in the culture medium. Finally, a study of organogenesis induction, histological characterization and genetic transformation from internodal segments of mature plants of sweet orange cultivars Hamlin, Pera, Valencia and Natal was conducted. Organogenesis was induced in DBA3 modified medium supplemented with 1.0 mg.L -1 BAP and 0.5 mg.L -1 NAA. Histological analysis showed that the adventitious buds formed indirectly from the callus formed by successive cell divisions from the vascular cambium. Transgenic plants from mature tissue of Hamlin and Valencia sweet oranges were obtained using one day of co-cultivation at 24°C with or without the longitudinal sectioning of the explant for Hamlin and only when the explant was longitudinally sectioned for Valencia.

Os biofilmes, especialmente de bactérias patogênicas como Listeria monocytogenes, têm chamado a atenção nos laticínios pelos riscos que implicam ao consumidor, devido aos repetidos surtos causados por ingestão de lácteos contaminados. A legislação brasileira apenas especifica L. monocytogenes em queijos. Além disso, os biofilmes geram problemas econômicos para a indústria e diminuem a eficiência dos agentes sanificantes empregados. O objetivo do trabalho foi avaliar a formação de biofilmes de L. monocytogenes em diferentes tempos, temperaturas, superfícies e resíduos lácteos, bem como a presença de Lactobacillus plantarum como competidor, assim como analisar a eficiência do processo CIP (Clean In Place) de um pasteurizador de leite com quaternário de amônia. As populações bacterianas dos biofilmes foram avaliadas através da técnica do suabe e Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV). O modelo experimental foi baseado na formação de biofilmes de L. monocytogenes em cupons de aço inoxidável 304, silicone e borracha. Os cupons permaneceram imersos por 10 horas, a 5ºC e 35ºC, em leite UHT integral, desnatado e creme de leite UHT, seguido da incubação em diferentes tempos (0, 18 e 114 horas) e temperaturas (5ºC e 35ºC) para a formação do biofilme. A competição foi realizada em aço inoxidável a 35ºC, nos tempos 0 e 18 horas. O processo CIP teve sua eficiência avaliada na remoção de biofilmes de L. monocytogenes na presença de leite integral e desnatado, simulando a limpeza e sanificação de um pasteurizador de leite. A formação de biofilmes pro L. monocytogenes foi influenciada pela baixa temperatura (5ºC), podendo ocorrer em áreas de refrigeração dos laticínios. O microrganismo é capaz de sobreviver e formar biofilmes por longos períodos nas superfícies de aço inoxidável, silicone e borracha na presença de resíduos de leite integral, desnatado e creme de leite. O crescimento em competição por Lactobacillus plantarum não inibiu a formação de biofilmes por L. monocytogenes e crescimento de células planctônicas. O processo CIP foi eficiente em todas as condições estudadas, eliminando as células de L. monocytogenes. / The biofilm, especially of pathogenic bacteria Listeria monocytogenes, have been getting the attention in the dairy products for the risks that implicate the consumer, due to the repeated outbreaks caused by ingestion of milky polluted. The Brazilian legislation just specifies L. monocytogenes in cheeses. Besides, the biofilm generate economical problems for the industry and they reduce the agents used sanitizers efficiency. The objective of the work was to evaluate the formation of biofilms of L. monocytogenes in different times, temperatures, surfaces and milky residues, as well as the presence of Lactobacillus plantarum as competitor, as well as analyzing the efficiency of the process CIP (Clean In Place) of a milk pasteurize whit quaternary of ammonium. The bacterial populations of the biofilms were appraised through the technique of the swab and Scanning Electron Microscopy (SEM).The experimental model was based on the formation of biofilms of L. monocytogenes in coupons of stainless steel 304, silicon and rubber. The coupons stayed immersed by 10 hours, to 5ºC and 35ºC, in skim milk UHT, skimmed and cream of milk UHT, following by the incubation in different times (0, 18 and 114 hours) and temperatures (5ºC and 35ºC) for the formation of the biofilm. The competition was accomplished in stainless steel to 35ºC, in the times 0 and 18 hours. The process CIP had his efficiency appraised in the removal of biofilms of L. monocytogenes in presence of skim milk and skimmed, simulating the cleaning and sanitation of a milk pasteurizer. The biofilmes formation for L. monocytogenes was influenced by the low temperature (5ºC), could happen in areas of cooling of the dairy products. The microorganism is capable of to survive and to form biofilmes for long periods in the surfaces of stainless steel, silicon and eraser in the presence of residues of integral milk, skimmed and cream of milk. The growth in competition for Lactobacillus plantarum didn\'t inhibit the biofilms formation for L. monocytogenes and growth of cells. The process CIP it was efficient in all of the studied conditions, eliminating the cells of L. monocytogenes.

Alguns ecossistemas chamam atenção devido à particular combinação de condições ambientais únicas, que resultam na evolução de espécies capazes de colonizar estes ambientes. Os manguezais compõem um bioma composto por espécies de plantas, animais e microrganismos que interagem neste ambiente, que tem como principal característica a interface entre o continente e o oceano em regiões intertropicais. Nosso objetivo foi acessar via sequenciamento massivo de DNA e RNA (via Illumina HiSeq 2000) o perfil taxonômico e funcional da comunidade microbiana de quatro manguezais com distintos níveis de contaminação. As sequências foram analisadas na plataforma MG-RAST, para a análise taxonômica foi utilizado BlastN contra a base de dados RDP ou M5NR, enquanto que a análise funcional foi baseada na comparação por BlastX das sequências obtidas com as disponíveis no banco de dados M5RNA e M5Nr. Na análise funcional, as sequências classificadas foram ainda integradas na classificação hierárquica SEED (subsystems), KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) e COG (Clusters of Orthologous Group). No total, foram obtidas 682 milhões de sequências válidas ( 88,2, 303,1 e 290,9 milhões a partir das análises de DNA, RNA total e RNA purificado, respetivamente). Estas indicaram como grupos taxonômicos mais abundantes as classes Gammaproteobacteria e Deltaproteobacteria (dentro do domínio Bacteria), e Methanomicrobia e Methanobacteria (dentro do domínio Archaea). Além destas observações, alterações na representação de determinados grupos quando as análises de DNA e RNA são comparadas. Em relação a classificação funcional das sequências, foi possível observar uma similaridade no número de funções encontradas nos diferentes manguezais, mas uma maior quantidade de sequências anotadas foi observada, como esperado, na análise de DNA. De maneira mais detalhada, o estudo das funções relacionadas a transformação de nitrogênio e enxofre indicou que há uma correlação entre a abundância de sequências de um referido gene na análise metagenômica, e sua correspondente quantidade dentro dos grupos de dados de metatranscriptômica. Os grupos microbianos mais representados nestes ciclos foram Deltaproteobacteria e Gammaproteobacteria, atuantes principalmente nos processos de fixação de nitrogênio atmosférico (N2), desnitrificação e redução de sulfato, enquanto que para oxidação do enxofre as classes mais frequentes foram Gammaproteobacteria, Betaproteobacteria e Epsilonproteobacteria. De maneira geral, este estudo fornece indícios sobre a atividade microbiana nos manguezais, e indica que as frequentemente correlações observadas entre os resultados da análise metagenômica e metatranscriptômica, porém essas correlações se tornam menos evidentes quando analisamos em nível de ordem ou em níveis mais específicos. / Some ecosystems call particular attention due to unique combination of environmental conditions that result in evolution of species capable of colonizing these environments. Mangroves constitute a biome composed of species of plants, animals and micro-organisms that interact in this environment, whose main characteristic is the interface between the continent and the ocean in tropical areas. Our goal was to access via massive sequencing of DNA and RNA (via Illumina HiSeq 2000) the taxonomic and functional profile of the microbial community four mangroves with different levels of contamination. The sequences were analyzed on MG-RAST platform for taxonomic analysis was performed using BLASTN against the RDP database or M5NR, while the functional analysis was based on comparison of the sequences obtained by BlastX available on M5RNA with the database and M5Nr . In functional analysis, the sequences were classified yet integrated into the hierarchical classification SEED (subsystems), KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) and COG (Clusters of Orthologous Group). A total of 682 million valid sequences were obtained (88.2, 303.1 and 290.9 million from DNA analyzes, purified total RNA and RNA, respectively). These indicated as the most abundant taxa Gammaproteproteobacteria and Deltaproteobacteria classes (within the domain Bacteria), and Methanomicrobia and Methanobacteria (within the domain Archaea). In addition to these observations, changes in the representation of particular groups when analyzes of DNA and RNA are compared. Regarding the functional classification of the sequences was observed in the number of a similarity functions found in different mangrove, but a greater amount of annotated sequences was observed, as expected, the analysis of DNA. In more detail, the study of the functions related to transformation of nitrogen and sulfur indicated that there is a correlation between the abundance of sequences of said gene in metagenomic analysis, and its corresponding quantity within the metatranscriptômica data groups. The microbial groups were over-represented in these cycles and Deltaproteobacteria Gammaproteobacteria mainly active in nitrogênioatmosférico fixation processes (N2), the denitrification and sulfate reduction, while for sulfur oxidation were the most frequent class Gammaproteobacteria, and Betaproteobacteria Epsilonproteobacteria. Overall, this study provides evidence of microbial activity in the mangroves, and often indicates that the correlations observed between the results of metagenomics and metatranscriptômica analysis, but these correlations become less evident when we look at order level or other specific levels.