Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-10-14T12:43:53Z No. of bitstreams: 1 Josenaldo Silva Macedo.pdf: 689898 bytes, checksum: 3215e2e1e0646d554d6f16686dd6361d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-14T12:43:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Josenaldo Silva Macedo.pdf: 689898 bytes, checksum: 3215e2e1e0646d554d6f16686dd6361d (MD5) Previous issue date: 2011-02-24 / The present work was designed to investigate the incidence of the bacterium Helicobacter spp. In cats from the Recife city, Pernambuco State. The stomach samples were collected from 119 cats, without distinction between race or age, being 56 males and 63 females originated from the Environmental Survey Center (CVA), captured in the city of Recife.. The urease quick test and the histopathological examination using both the Hematoxilin-Eosin (HE) and Giemsa stains were performed. The urease quick test showed that 83,92% of the male (47/56) and 80,95% of the female (51/63) samples were positive for Helicobacter, with a total of 82,35% (98/119) of the population being positive. The Giemsa analysis demonstrated that in 73,21% of the males (41/56) and 74,60% of the females (47/63) samples the Helicobacter spp. Bacteria was found, and the total positive sample in the tested population was 73,94% (88/119). During the analysis performed using the HE stain, was observed that 59,66% (71/119) of the samples showed histopathological alterations, such as: lymphoplasmocitic infiltration with a lymphoid foliculum, microabscess, necrosis, hypotrophy, and in 40,34% of the samples(48/119) no alterations were observed. Since the Helicobacter spp. Microorganisms are able to cause gastric inflammation in cats, having showed , the research studies concerning the clinical importance and elucidate the gastric neoplasic genesis in these animals. It coud conclude that cats originated from Recife city, Pernambuco state, shows high incidence of helicobacteriosis. / O presente trabalho foi delineado para investigar a incidência da bactéria Helicobacter spp. em gatos oriundos da cidade do Recife do estado de Pernambuco. As amostras de estômagos analisadas, foram coletados de 119 gatos sem raça definida e idade, sendo 56 machos e 63 fêmeas provenientes do Centro de Vigilância Ambiental (CVA), capturados na cidade do Recife. Foram realizados para pesquisa de Helicobacter spp., os métodos de teste rápido da urease, o exame histopatológico corado pela técnica hematoxilina-eosina (HE) e pelo método de coloração Giemsa. As análises pelo teste rápido da urease mostraram que em 83,92% das amostras dos machos (47/56) e em 80,95% das amostras das fêmeas (51/63), foi detectada reação positiva para Helicobacter, sendo 82,35% (98/119) na totalidade das amostras. As análises pelo método de coloração pelo Giemsa mostraram que em 73,21% das amostras dos machos (41/56) e em 74,60% das amostras das fêmeas (47/63), foi encontrada a bactéria Helicobacter spp. , sendo 73,94% (88/119) na totalidade das amostras. Na análise das amostras coradas pela técnica de coloração hematoxilia-eosina (HE), verificou-se que em 59,66% das amostras (71/119) apresentaram alterações histopatológicas como: infiltrado linfoplasmocitário com folículo linfóide, microabcesso, necrose, hipotrofia; e em 40,34% das amostras (48/119) não apresentaram alterações histológicas. Dessa forma, os microorganismos do gênero Helicobacter spp. são capazes de gerar inflamação gástrica no gato, sendo necessário cada vez mais aprofundar as pesquisas a respeito da importância clínica e da gênese de neoplasias gástricas nesses animais. Concluiu-se neste trabalho que gatos oriundos da cidade do Recife, estado de Pernambuco apresentam alta incidência de helicobacteriose.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-10-20T14:50:29Z No. of bitstreams: 1 Monique Monteiro Pinto.pdf: 848527 bytes, checksum: 1b2bc1d9050d7a02d03c3c3faf35a485 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T14:50:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Monique Monteiro Pinto.pdf: 848527 bytes, checksum: 1b2bc1d9050d7a02d03c3c3faf35a485 (MD5) Previous issue date: 2013-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Probiotics are responsible for a new idea of using preventive in aquaculture, aiming at sustainable farming, environmental balance and of its products generated. However, there are few knowledge on the subject, despite its widespread use in shrimp farming, randomly in the most of times. Because of large demand from the sector for new alternatives, to maintain animal health, reduce the chance of having disease problems that the study aimed to identify and test bacteria with potential probiotic isolated from the intestinal tract of cultured shrimp (Litopenaeus vannamei) in salt water coming from commercial farm in the state of Pernambuco. Has been collected 90 animals, 50 in rainy season and 40 in dry season. The shrimps collected during the rainy season had weight of 9.50 ± 0.52 g and length of 6.72 ± 0.84 cm, while the animals from the dry period had weight of 9.76 ± 0.24 g and a length of 6, 54 ± 0.42 cm. Were obtained 72 bacterial isolates then performed the Gram 31 were tested in vitro against dual-known pathogenic species, Vibrio parahaemolyticus (ATCC 17802) and Vibrio vulnificus (ATCC 27562). Eight isolates (28.81%) showed antibacterial activity to at least one pathogen. There was no significant difference (P <0.05) in the proportion of isolates potential probiotics obtained in different seasons, rainy and dry. Isolates that showed the best results in the antagonism test in vitro were identified as Lactobacillus paracasei, Bacillus cereus, Lactococcus lactis subsp. lactis, Lactobacillus crispatus and Lactobacillus brevis. The largest zone of inhibition observed in the antagonism test was produced by Lactobacillus crispatus opposite V. vulnificus. All bacteria tested against the pathogens studied produced inhibition zone, however it is suggested the testing of antagonism in vivo to be proven the effectiveness of probiotic bacteria for marine shrimp. / Os probióticos são responsáveis por uma nova ideia de utilização de preventivos na aquicultura, visando a sustentabilidade do cultivo, equilíbrio do meio ambiente e dos seus produtos gerados. Entretanto, ainda são poucos os conhecimentos a respeito do tema, apesar da sua vasta utilização na carcinicultura, muitas vezes de forma aleatória. Em virtude da grande demanda do setor por novas alternativas para manter a saúde animal, que se objetivou identificar e testar bactérias, com potencial probiótico, isoladas do trato intestinal de camarões cultivados (Litopenaeus vannamei) em água salgada, oriundos de fazenda comercial do estado de Pernambuco.Foram coletados 90 animais, sendo 50 em período chuvoso e 40 em período de estiagem, todos apresentando-se saudáveis. Os camarões coletados no período chuvoso apresentaram peso de 9,50 ± 0,52g e comprimento de 6,72 ± 0,84cm, enquanto os animais analisados no período de estiagem o peso de 9,76 ± 0,24g e comprimento de 6,54 ± 0,42cm. Foram obtidos 72 isolados bacterianos, que foram reduzidos para 31 após a análise do Gram, os quais foram testados in vitro frente as espécies patogênicas, Vibrio parahaemolyticus (ATCC 17802) e Vibrio vulnificus (ATCC 27562). Oito isolados (28,81%) apresentaram atividade antibacteriana a pelo menos um patógeno. Não houve diferença significativa (P<0,05) na proporção de isolados potenciais probióticos obtidos nas distintas épocas do ano, chuvosa e seca. Os isolados que apresentaram os melhores resultados no teste de antagonismo in vitro foram identificados como Lactobacillus paracasei, Bacillus cereus, Lactococcus lactis subsp. lactis, Lactobacillus crispatus e Lactobacillus brevis. O maior halo de inibição observado no teste de antagonismo foi produzido por Lactobacillus crispatus frente ao V. vulnificus. Todas as bactérias testadas contra os patógenos estudados produziram halo de inibição, contudo sugere-se a realização de testes de antagonismo in vivo para que seja comprovada a efetividade das bactérias como probióticas para camarão marinho

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-11-07T15:54:23Z No. of bitstreams: 1 Thiciane Carvalho de Albuquerque.pdf: 461700 bytes, checksum: a5dec4d0c1023c838fd185f90ab1ad6c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-07T15:54:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thiciane Carvalho de Albuquerque.pdf: 461700 bytes, checksum: a5dec4d0c1023c838fd185f90ab1ad6c (MD5) Previous issue date: 2010-02-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This paper deals the characterization of lactic microflora of artisanal “coalho” cheese produced in the city of Cachoeirinha, semi arid of Pernambuco - Brazil. Were analyzed four samples collected in dates with differents rainfall. The lactic microflora was assessed by isolation in APT and MRS culture medias, both incubated at temperatures of 30 and 42 ° C, followed by two purifications. Was considered lactic acid bacteria (LAB) only the gram-positive, catalase negative, in the form of coccus and bacillus, and producing acid in litmus milk. The differentiation of the genus was performed by testing for growth based on the physiology of the isolates. From a total of 320 isolates, 295 were confirmed as LAB. The mean genera of LAB isolated by the four samples were: Enterococcus (36.27%), Streptococcus (25.12%), Lactococcus (23.03%), Lactobacillus (13.55%) and Leuconostoc(2.3%). The constant presence and distribution of the genera isolated in different periods indicate that, in the samples analyzed, there is no apparent correlation between the distribution of the genera isolated and different rainfall occurred in the sampling dates, indicating the product standardization. / O presente trabalho trata da caracterização da microbiota lática do queijo de coalho artesanal produzido no Município de Cachoeirinha, Agreste de Pernambuco, Brasil. Foram analisadas quatro amostras coletadas em épocas do ano com diferentes índices pluviométricos. A microbiota lática foi avaliada através do isolamento em meios APT e MRS, ambos incubados em temperaturas de 30 e 42°C; seguida de duas purificações. Foram consideradas BAL apenas os microrganismos Gram positivos, catalase negativa, na forma de cocos ou bastões e produtores de ácido em leite tornassolado. A diferenciação dos gêneros foi realizada através de testes de crescimento com base na fisiologia dos isolados. De um total de 320 isolados, 295 foram confirmados como BAL. As médias dos gêneros de BAL isolados nas quatro coletasforam: Enterococcus (36,27%), Streptococcus (25,12%), Lactococcus (23,03%), Lactobacillus (13,55%) e Leuconostoc (2,3%). A presença e distribuição constante dos gêneros isolados em diferentes períodos indicam que, nas amostras analisadas, não há correlação aparente entre a distribuição dos gêneros isolados e os diferentes índices pluviométricos ocorridos nas datas de coleta, indicando padronização do produto.

Tese(doutorado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós–Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2013. / Submitted by Cristiane Gomides (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-10-15T11:55:34Z No. of bitstreams: 1 NG.pdf: 3593852 bytes, checksum: 4c20bdc4282f3f36ffe2b4772a93b1cb (MD5) / Approved for entry into archive by Sabrina Andrade (sabrinabeatriz@ibest.com.br) on 2013-10-17T17:34:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 NG.pdf: 3593852 bytes, checksum: 4c20bdc4282f3f36ffe2b4772a93b1cb (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-17T17:34:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NG.pdf: 3593852 bytes, checksum: 4c20bdc4282f3f36ffe2b4772a93b1cb (MD5) Previous issue date: 2013 / A composição (CCB) e a atividade (perfil fisiológico - PFCB) da comunidade bacteriana foram investigadas no estuário da Lagoa dos Patos e região costeira adjacente através de amostragem tipo-Lagrangiana, Euleriana e ao longo de um transecto para responder três perguntas: i) existe um padrão de recorrência (estabilidade) da CCB e PFCB em diferentes faixas de salinidade? ii) a CCB e PFCB respondem a diferentes escalas temporais e espaciais, inclusive a fenômenos climáticos globais que afetam a hidrodinâmica do estuário, tais como o “El Niño Southern Oscillation” (ENSO) ? iii) que fatores, além da salinidade, afetam a CCB e a PFCB? A CCB e a PFCB estiveram associadas à hidrodinâmica do estuário, tanto em escalas curtas (entrada de cunha salina), médias (sazonal) e largas (ENSO). Isto porquê a hidrodinâmica condiciona a variabilidade da salinidade e secundariamente o seston, nutrientes inorgânicos dissolvidos e substratos orgânicos, que afetam as bactérias. A CCB foi primariamente estruturada pela salinidade, seguindo o padrão normalmente encontrado na literatura para estuários, com comunidades características de água salgada e doce. Já a PFCB teve maior influência da quantidade de nutrientes e substratos e de maneira indireta da salinidade. De maneira geral, a atividade bacteriana foi menor em águas salgadas mais oligotróficas. Entretanto, grande atividade bacteriana foi observada em água salgada rica em nutrientes que penetrava no estuário. A maior concentração de nutrientes na água salgada pode ter sido resultado de ressuspensão de sedimento, ou ingresso de água costeira previamente enriquecida com água estuarina. / The composition (BCC) and activity (community level physiological profiles, CLPP) of the bacterial community were investigated in the Patos Lagoon estuary and adjacent coastal region through Lagrangian-like, Eulerian and transect samplings in order to answer three questions: i) is there a pattern of recurrence (stability) of the BCC and CLPP in different salinity ranges? ii) does the BCC and CLPP respond to different temporal and spatial scales, including global climate phenomena that affect the estuary hydrodynamics like El Niño Southern Oscillation (ENSO)? iii) which factors apart from salinity affect the BCC and CLPP? The BCC and CLPP were associated to the estuary hydrodynamics, at short- (salt wedge entrance), meso- (seasonal) and largescales (ENSO). This is because the hydrodynamics conditions the variability of salinity and secondarily the seston, dissolved inorganic nutrients and organic substrates, which in turn affect bacteria. The BCC was primarily structured by salinity, following the pattern commonly found in the literature for estuaries, with characteristic fresh- and saltwater communities. The CLPP had higher influence of the amount of nutrients and substrates and indirectly of salinity. In general the bacterial activity was lower in oligotrophic, saltier waters. However, high bacterial activity was observed in nutrient-rich saltwater that entered the estuary. The higher concentration of nutrients in saltwater is likely the result of ressuspension of the sediment or ingress of coastal water previously enriched with estuarine water.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-27T12:44:53Z No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-27T12:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study focused on selecting wild shrimp Bacillus for a probiotics use in shrimp farming. Bacillus circulans and Bacillus subtilis were isolated from the Farfantepenaeus subtilis intestine and have showed antagonism against Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio mimicus in in vitro tests. Afterwards, these bacteria inhibited Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) in a wide pH and salinity range and produced lipase, amylase and protease in vitro showing that these Bacillus had the needed requirements for in vivo experiments. Thus, juveniles of Litopenaeus vannamei were grown according to the following diet: feed + B. subtilis (BS); feed + B. circulans (BC) and feed without bacteria (Control). Every 15 days samples were collected in order to quantify the bacteria and enzyme activity. After 45 days, the shrimp’s weight fed with BS and BC was significantly higher when compared to the control group. There was a significant increase in Bacillus spp. and a Vibrio spp. reduction in the intestine and hepatopancreas, especially after the 30th and 45th day mark. The trypsin, chymotrypsin, lipase and amylase also had significant increase in shrimp fed with BC and BS, especially after the 30th day mark. After 60 days, the immune system gene expression (proPO, LGBP and HEM) increased significantly in the shrimp fed with BS and BC. In addition to these experiments, the shrimp were infected (by injection) and challenged (water) against VP. The shrimp fed with BC diet had significantly higher survival rates after the injection and there were no differences after the challenge. The proPO expression did not differ between diets after infection or challenge. There was a Vibrio spp. reduction and a significant Bacillus spp. increase in the shrimps’ intestines which were fed with BC and BS diets after the challenge. The Bacillus spp. increase in shrimp fed with BC and BS diets suggest that there was colonization in the gastrointestinal tract during all the experimental period. This may have increased the enzyme activity improving digestion and weight gain, reduced the Vibrio spp. and increased the immune system gene expression, making the shrimp more resistant to infection (BC diet). Thus, B. circulans and B. subtilis have showed the potential for its application as probiotics in shrimp farming. / O objetivo desse estudo foi selecionar Bacillus de camarões selvagens para uso como probiótico na carcinicultura. Bacillus circulans e Bacillus subtilis foram isolados do intestino de Farfantepenaeus subtilis e demonstraram antagonismo contra Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus e Vibrio mimicus em testes in vitro. Posteriormente, essas bactérias inibiram Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) em uma ampla faixa de pH e salinidade e produziram lipase, amilase e protease in vitro, demonstrando que esses Bacillus possuíam características requeridas para experimentos in vivo. Então, juvenis de Litopenaeus vannamei foram cultivados com as dietas: ração + B. subtilis (BS); ração + B. circulans (BC) e ração sem bactérias (Controle). A cada 15 dias, amostras foram coletados para quantificação bacteriana e de atividade enzimática. Ao final de 45 dias, o peso dos camarões alimentados com BS e BC foi significativamente maior comparados ao grupo controle. Houve um significativo aumento de Bacillus spp. e redução de Vibrio spp. no intestino e hepatopâncreas, sobretudo após 30 e 45 dias. As atividades da tripsina, quimotripsina, lipase e amilase aumentaram significativamente nos camarões alimentados com BC e BS, principalmente após 30 dias. Após 60 dias, a expressão de genes do sistema imunológico (proPO, LGBP e HEM) aumentou significativamente nos camarões alimentados com BS e BC. Adicionalmente, os camarões foram infectados (injeção) e desafiados (água) com VP. A sobrevivência dos camarões alimentados com BC foi significativamente maior após infecção e não houve diferenças após desafio. A expressão da proPO não diferiu entre as dietas após infecção e desafio. Houve uma redução de Vibrio spp. e significativo aumento de Bacillus spp. no intestino dos camarões alimentados com BC e BS após desafio. Durante todo o período experimental, o aumento de Bacillus nos camarões alimentados com BC e BS sugere que houve colonização no trato digetório de B. circulans e B. subtilis. Isso pode ter incrementado a atividade enzimática, melhorando a digestão e ganho de peso, reduzido Vibrio spp. e aumentado a expressão de genes do sitema imunológico, tornando os camarões mais resistentes ao VP (dieta BC). Assim, B. circulans e B. subtilis apresentam potencial para utilização como probiótico na carcinicultura.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-07-13T12:46:58Z No. of bitstreams: 1 Patricia Carla Batista de Andrade.pdf: 2555637 bytes, checksum: c2201632f1465d0fffc6c49040788de9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-13T12:46:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Patricia Carla Batista de Andrade.pdf: 2555637 bytes, checksum: c2201632f1465d0fffc6c49040788de9 (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Nitrogen fertilization in sugarcane in the first crop cycle has been widely used to maintain adequate productivity. This fertilization impacts the environment and costs the production costs of the crop. Thus, it is necessary to find alternatives to minimize this problem, such as biological fixation, which can be associated with organic residues of the sugarcane agribusiness, such filter cake and/or vinasse, can supply nitrogen (N) by potentiating the residue on the bacteria, without deleterious effect on them. These residues are important sources of phosphorus and potassium, but relatively poor in N. Other, they need to be decomposed, a process of mineralization of organic matter by microorganisms. Therefore, diazotrophic bacteria can exert this role of accelerating the decomposition, aiding the nutrition of the sugarcane. The objective of this study was to evaluate the effect of the inoculation of diazotrophic bacteria combined with the application of filter cake (TF) in the second cycle of sugarcane cultivation in different varieties and to study the decomposition of agroindustrial residues inoculated with these bacteria in Solos of contrasting textures. An experiment was conducted with two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579) inoculated with two bacterial genera (Pantoea sp. and Stenotrophomonas sp.) isolated as well as the mixture of these two genera, and three controls (without and with nitrogen and residual control of inoculation in the cane plant). Four evaluations were made at 180, 240, 300 and 360 days after regrowth (DAR), where were evaluated the nitrogenase activity (AN), the contribution of biological N fixation (FBN) by the natural abundance method of 15N. Chlorophyll a and b in the diagnostic leaf, vegetative growth (diameter, height and number of leaves). At 240 DAR was determined the nutritional status and at 360 DAR was measured the agricultural and industrial productivity. Other experiment was carried in a greenhouse with eight treatments: compost, filter cake (TF), (TF + vinasse), (compound + vinasse), inoculated and not inoculated with a mixture of the Pantoea sp. and Stenotrophomonas sp. In the soils, sandy and clayey with four replicates. The residues were packed in litter bags and evaluated at 0, 20, 40, 60, 80 and 100 days after the start of the study. The decomposition constant (k) of the remaining mass, the N, C and C/N ratio of the residues were evaluated. AN was influenced by inoculation and addition of TF. FBN contributed 25% of the sugarcane N, not influenced by TF, but inhibited by mineral N. The application of TF potentiated the absorption of N, independent of the variety. It favored photosynthetic pigmentation only in variety RB92579. The productivity of the fertilized plants did not differ from those inoculated, regardless of the TF. A k decreased with time and TF decomposition was enhanced when combined with vinasse and/or inoculated. The N mineralization rate at the beginning of the waste decomposition was higher than that of the C, mainly in the vinasse and inoculated treatments, increasing the C/N ratio, which only decreased in the second half of the decomposition period. / A adubação nitrogenada em cana-de-açúcar no primeiro ciclo de cultivo tem sido muito utilizada para manter adequada a produtividade. Essa fertilização impacta o ambiente e onera os custos de produção da cultura. Assim, é necessário encontrar alternativas para minimizar essa problemática, como a fixação biológica, que se associada a resíduos orgânicos da própria agroindústria canavieira, como a torta de filtro e/ou vinhaça, pode fornecer nitrogênio (N) pela potencialização do resíduo sobre as bactérias sem causar efeito deletério nestas. Estes resíduos são importantes fontes de fósforo e potássio, mas relativamente pobres em N. Por outro lado, precisam ser decompostos, processo de mineralização da matéria orgânica realizado por micro-organismos. Portanto, bactérias diazotróficas podem exercer esse papel de acelerar a decomposição, auxiliando a nutrição da cana-de-açúcar. Assim, o objetivo foi avaliar o efeito da inoculação de bactérias diazotróficas combinadas com aplicação de torta de filtro (TF) no segundo ciclo de cultivo da cana-de-açúcar em diferentes variedades e estudar a decomposição de resíduos da agroindústria inoculados com essas bactérias em solos de texturas contrastantes. Foi conduzido um experimento com duas variedades de cana-de-açúcar (RB867515 e RB92579) inoculadas com dois gêneros bacterianos (Pantoea sp. e Stenotrophomonas sp.) isoladas bem como a mistura destes dois gêneros, e três testemunhas (sem e com nitrogênio e testemunha residual de inoculação na cana planta). Foram realizadas quatro avaliações aos 180, 240, 300 e 360 dias após a rebrota (DAR), onde foi avaliada a atividade da nitrogenase (AN), a contribuição da fixação biológica de N (FBN) pelo método da abundância natural do 15N, os teores de clorofila a e b, e N na folha diagnóstica, o crescimento vegetativo (diâmetro, altura e número de folhas). Aos 240 DAR foi determinado o estado nutricional e aos 360 DAR foi mensurada a produtividade agrícola e industrial. Outro ensaio foi montado em casa-de-vegetação com oito tratamentos: composto, torta de filtro (TF), (TF + vinhaça), (composto + vinhaça), inoculado e não inoculado com uma mistura das estirpes Pantoea sp. e Stenotrophomonas sp. nos solos, arenoso e argiloso com quatro repetições. Os resíduos foram acondicionados em litter bags e avaliados aos 0, 20, 40, 60, 80 e 100 dias após o início do ensaio. Foram avaliados a constante de decomposição (k) da massa remanescente, os teores de N, C e relação C/N dos resíduos. A AN foi influenciada pela inoculação e adição de TF. A FBN contribuiu com 25% do N da cana-de-açúcar, não sendo influenciada pela TF, porém inibida pelo N mineral. A aplicação de TF potencializou a absorção de N, independente da variedade. Favoreceu a pigmentação fotossintética apenas na variedade RB92579. As produtividades das plantas adubadas não se diferenciaram das inoculadas, independente da TF. A k diminuiu com o tempo e a decomposição da TF foi intensificada quando combinada com vinhaça e/ou inoculados. A taxa de mineralização do N no início da decomposição dos resíduos foi maior do que a do C, principalmente nos tratamentos com vinhaça e inoculados, incrementando a relação C/N, que só se reduziu na segunda metade do período de decomposição.

Orientador: Adriana Zerlotti Mercadante / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-16T15:01:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mandelli_Fernanda_M.pdf: 677502 bytes, checksum: 40f71e5be548712e1d9c40d24476ba1b (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Os carotenoides pertencem a um grupo de pigmentos naturais amplamente distribuídos na natureza, com grande diversidade de estruturas e funções. O interesse pelos carotenoides tem aumentado consideravelmente nos últimos anos pela evidência dos seus já conhecidos benefícios à saúde humana, devido às suas propriedades antioxidantes, anticarcinogênicas e imunomodulatórias. As principais fontes industriais de carotenoides são a síntese química e a extração a partir de plantas. Porém, são poucos os carotenoides que possuem métodos economicamente eficientes de produção. Uma alternativa para a obtenção natural destes pigmentos é a sua produção por micro-organismos, sendo uma das fontes as bactérias termófilas que, em sua maioria, possuem carotenoides com estrutura específica para fortalecimento da membrana celular. Assim sendo, o presente estudo tem como objetivos: identificar os carotenoides da linhagem Thermus filiformis ATCC 43280, avaliar o crescimento de massa celular, produção de carotenóides e porcentagem de proteção contra o oxigênio singlete através de diferentes condições de cultivo e verificar a atividade antioxidante do extrato rico em carotenoides na desativação do radical ABTS¿+ (2,2¿- azinobis-(3-etilbenzotiazolina-6-ácido sulfônico)) e do peróxido de hidrogênio. Para atingir os objetivos, os carotenoides foram caracterizados por cromatografia líquida de alta eficiência conectada aos detectores de arranjo de diodos e espectrômetro de massas (HPLCDAD-MS/MS), e as condições de cultivo e a interação entre as variáveis foram estudadas através de planejamento estatístico fatorial. Foram identificados nove carotenoides sintetizados pela bactéria Thermus filiformis, todos apresentando o mesmo comprimento de onda máximo a 449 ± 1 nm, que é um indicativo de um cromóforo de 11 ligações duplas conjugadas, sendo duas em anel ?. O carotenoide majoritário identificado em T. filiformis foi termozeaxantina-15 que consiste do carotenoide zeaxantina ligada a uma glicose acilada com ácido graxo ramificado de 15 carbonos ((3R,3'R)-3'-[(6-O-13-metiltetradecanoil-ß-Dglucopiranosil) oxi]-ß,ß-caroten-3-ol) o que representa 35,3 % do conteúdo total de carotenóides. Foram também identificados os carotenoides: zeaxantina (14,4 %), zeaxantina monoglicosilada (4,7 %) e termozeaxantinas com ácidos graxos ramificados, com cadeia de cadeia de 11 (2,3 %), 12 (5,2 %), 13 (25,4 %) e 14 (9,0 %) carbonos, além de derivados dos carotenoides termozeaxantina-13 (0,8 %) e termozeaxantina-15 (2,8 %). Dentre as variáveis estudadas no planejamento experimental (temperatura, pH, quantidade de triptona, extrato de levedura e elementos traços de Nitsch¿s), a temperatura foi a que mais influenciou a quantidade de biomassa, carotenoides totais e proteção proporcionada pelos carotenoides contra oxigênio singlete. Com a utilização desta ferramenta foi possível atingir valores de 658 mg/L de biomassa seca, 1517 µg/g de carotenoides totais e porcentagem de proteção conferida ao DMA (dimetilantraceno) frente a oxidação por oxigênio singlete na ordem de 85 %. O extrato rico em carotenoides de T. filfiormis apresentou capacidade de desativar o radical ABTS¿+ com valor de capacidade antioxidante equivalente a Trolox (TEAC) de 2,87, valor este superior aos relatados para outros carotenoides como ß-caroteno (1,9) e zeaxantina (1,4). / Abstract: Carotenoids are a group of natural pigments widely distributed in the nature with great diversity of structures and functions. The interest on carotenoids has considerably increased in recent years by the evidence of its known benefits to human health, due to its antioxidant, anticarcinogenic and immunomodulatory properties. The main industrial sources of carotenoids are chemical synthesis and extraction from plants. However, there are few carotenoids which production is economically feasible. An alternative to obtain these natural pigments is their production by microorganisms, and one of the sources is the thermophilic bacterium that produces carotenoids with specific structure for the strength of cell membrane. Therefore the aims of this work were to evaluate the biomass, carotenoid production and quenching of singlet oxygen by the strain Thermus filiformis ATCC 43280 through different cultivation conditions and to verify the antioxidant activity by scavenging of the ABTS¿+ (2,2'-azino-bis(3-ethylbenzthiazoline-6-Sulfonic Acid)) radical and hydroxy peroxide deactivation. In order to achieve these aims, the carotenoids were characterized by high-performance liquid chromatography connected to a photodiode array and mass spectrometry detectors (HPLC-DAD-MS/MS), and the cultivation conditions and the interactions between the variables were studied using a fractionated factorial design. Nine carotenoids synthesized by Thermus filiformis, were identified, all showing the same maximum absorbance wavelength, indicating the presence of a chromophore of 11 conjugated double bounds, being two in the ?-ring. The major carotenoid identified in T. filiformis was thermozeaxanthin-15 which is the carotenoid zeaxanthin linked to a glucose, acylated with a branched fatty acid of 15 carbons ((3R, 3'R) -3'- [(6-O-13- methyltetradecanoyl-ß-D-gluycopiranosyl) oxy]-ß,ß-carotene-3-ol) what represents 35.3 % of the total content of carotenoides. Zeaxanthin (14.4 %), zeaxanthin monoglucoside (4.7 %) and thermozeaxanthins with branched fatty acids chain with 11 (2.3 %), 12 (5.2 %), 13 (25.4 %) and 14 (90 %) carbons, besides thermozeaxanthin-13 (0,8 %) and thermozeaxanthina-15 (2,8 %) derivatives were also identified. Among the studied variables in the experimental design (temperature, pH, tryptone, yeast extract and Nitsch¿s trace elements) the temperature was the one that most influenced the biomass amount, total carotenoids and percentage of protection against singlet oxygen. Using this tool, it was possible to achieve values of 658 mg/L of dry biomass, 1517 µg/g of total carotenoids and percentage of protection of DMA (dimethylanthracene) against the oxidation by singlet oxygen about 85 %. The extract rich in carotenoids from T. filiformis showed capacity of scavenging ABTS¿+ radical with Trolox equivalent antioxidant capacity (TEAC) of 2.87, being this value higher than those reported in the literature for ß-carotene (1.9) and zeaxanthin (1.4) / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Given the concern for environmental preservation, by cause of human activities and its profound impacts, research works have led to a shift from conventional said agriculture using agrochemicals and fertilizers to agriculture that pursues ways less harmful to the environment management. The objective was to prospect and also isolate the bacteria with proper characteristics for growth benefits from the rhizosphere sugarcane soil and its subsequent use in production of microbial inoculants. As to reach this purpose, 24 soil samples from sugarcane mills in the state of Alagoas were collected and isolated for qualification and quantification of soluble phosphorus, production of exopolysaccharides (EPS), verification of biofilm formation, production of indole acetic acid (IAA), cytokinins and gibberellins production, rooting induction and sugarcane budding. The used methodology for phosphate solubilization was performed according to the recommendations of the authors referenced in the bibliography. According to the results obtained for phosphate solubilizing growth medium (Nbrip) showed that 17% had high capacity and inorganic phosphate solubilizing growth medium capacity Reached 67%. The others results stayed between low or absence of solubilization. Of the isolates tested, 75 % Were able to grow in medium with low water activity Aw 0919 at 30 °C and the appearance of colonies was Observed five days after inoculation. Results for EPS production at room temperature showed that 4% of the isolates surveyed achieved a hight production, followed by 42% which has achieved average production and the remaining 54% of low production. Analysing biofilm production capacity in TSB medium in absorbance of 540 nm were observed that 4% of the isolates had a higher frequency for biofilm formation, 83% achieved average production and 13% of isolates with low frequency output. Larger quantity for production of IAA in the presence precursor L-tryptophan was observed at the end of 72 hours despite significant differences among the isolates, except for isolate 7 which was considered high 51.62194 μg.mL-1 and isolated 6 to lower production 14.98113 μg.mL-1, all other isolates were classified as high producers. Among the isolates tested 25% were able to synthesize cytokines and 83.33% synthesized gibberellin compared to the control. All isolates, compared in control, increased in size which suggested the action of one or both hormones in question at the same time. The sprouting of inoculated buds compared in control to those without inoculation, the RB72454 variety of sugarcane, in end of the evaluation, in the presence of isolated samples 4, 16, 21 and 24 demonstrated that only 25% of the buds had sprouted and grew roots, not differing significantly from the control. As the result inoculation significantly increased a sprouting rate up to 83.33% of the isolates, and the best results obtained were in samples 7, 12, 19 and 20 (94.5, 100, 95 and 94.5% respectively) in both the number of sprouted buds as for speed emission of shoots and roots. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Tendo em vista a preocupação com a preservação ambiental, devido à constatação de que as atividades antrópicas podem causar profundos impactos, os trabalhos de pesquisa têm levado a uma mudança da agricultura dita convencional, que utiliza produtos agroquímicos e fertilizantes, para uma agricultura que busca formas de manejo menos nocivos ao ambiente. Objetivou-se a prospecção e o isolamento de bactérias com a características para promoção de crescimento a partir do solo rizosfera de cana – de – açúcar para serem utilizados na produção de inoculantes microbianos. Foram coletadas 24 amostras de solos provenientes de usinas sucroalcooleiras do Estado de Alagoas, de onde foram retirados os isolados para qualificação e quantificação de fósforo solúvel, produção de Exopolissacarídeos (EPS) e a verificação da formação de biofilme, produção de ácido indolacético (AIA), Produção de citocininas e giberelinas, Indução de enraizamento e brotação de gemas de cana-de-açúcar. A metodologia utilizada para solubilização de fosfato foi realizada de acordo com as recomendações dos autores. Os resultados obtidos para solubilização de fosfato em meio Nbrip demonstraram que 17% apresentaram alta capacidade de solubilização de fosfato inorgânico e 67% alcançaram média capacidade. Os demais estão entre baixa e ausência de solubilização. Dos isolados testados, 75% foram capazes de crescer em meio com atividade de água reduzida 0,919 Aw, a 30°C, o aparecimento de colônias foi observado cinco dias após a inoculação.Os resultados para produção de EPS em temperatura ambiente demonstraram que 4% dos isolados pesquisados atingiram uma ótima produção, seguido de 42% que obtiveram média produção e os demais, 54%. Quanto à capacidade de produção de biofilme em meio TSB em absorbância de 540 nm, 4% dos isolados obtiveram maior freqüência para formação de biofilme, 83% atingiram média produção e 13% dos isolados com baixa frequência de produção. As maiores quantidades para produção de AIA, na presença do precursor L-triptofano foi evidenciada ao final de 72 horas, apesar das diferenças significativas entre os isolados estudados, exceto o isolado sete que foi considerado elevado 51,62194 μg.mL-1 e o isolado seis com a produção mais baixa 14,98113 μg.mL-1, os demais isolados foram classificados altos produtores. Dentre os isolados testados 25% foram capazes de sintetizar citocininas e 83,33% sintetizaram giberelinas comparados ao controle. Todos os isolados, comparados a testemunha, aumentaram em tamanho, sugerindo a ação de um ou dos dois hormônios em questão. Na brotação das gemas inoculadas comparados ao controle sem inoculação da variedade RB72454 de cana-de-açúcar, ao final da avaliação, na presença dos isolados 4, 16, 21 e 24, apenas 25% das gemas haviam brotado e emitido raízes, não diferindo significativamente do controle. A inoculação aumentou significativamente a velocidade de brotação para 83,33% dos isolados, sendo os melhores resultados obtidos para 7, 12, 19 e 20 (94.5, 100, 95 e 94.5% respectivamente) tanto para o número de gemas brotadas como para velocidade de emissão de brotos e raizes.

Hipótese do estudo: Esse estudo hipotetizou que o fator idade e a condição periodontal pessoal e/ou materna favorecem a ocorrência de patógenos periodontais, enquanto o tabagismo não a influencia. Objetivo: Avaliar a relação do fator idade, status periodontal e tabagismo sobre a presença de A. actinomycetemcomitans, P. gingivalis, P. intermedia, T. forsythia e C. rectus. E, o impacto do status periodontal materno sobre a ocorrência destas mesmas espécies em recém-nascidos.Metodologia: Para responder à questão relativa à idade, na primeira fase do estudo, independente da condição periodontal foram incluídos 330 indivíduos alocados em seis faixas etárias: recém-nascidos, crianças de 2,5 a 5 anos, crianças de 6 a 12 anos, adolescentes de 13 a 18 anos, adultos de 19 a 44 anos e adultos acima de 55 anos. Na segunda fase do estudo, na qual os fatores status periodontal e tabagismo foram considerados, selecionaram-se mais 76 pares mães/recém-nascidos (33 filhos de mães com periodontite e 43 de mães sem periodontite), adicionando-se ainda 112 crianças periodontalmente saudáveis, 109 crianças com gengivite, 40 adultos periodontalmente saudável (21 fumantes e 19 não fumantes) e 111 indivíduos com periodontite (53 fumantes e 58 não fumantes). Os parâmetros clínicos periodontais avaliados foram profundidade de sondagem e nível clínico de inserção (adolescentes e adultos), e, índice de placa e sangramento gengival (adultos, adolescentes e crianças). Amostras subgengivais foram coletadas dos participantes dentados enquanto amostras não dentárias foram coletadas de todos os grupos e todas processadas por PCR. Resultados: Considerando-se todos os grupos C. rectus foi a bactéria mais freqüente chegando a atingir prevalências de 98%. A ocorrência de P. gingivalis, P.intermedia, A. actinomycetemcomitans e T. forsythia foi mais elevada dentre os recém-nascidos filhos de mães com periodontite. Crianças com gengivite alocaram mais P. gingivalis no sulco (99,1%) e mucosa (97,2%) do que crianças periodontalmente saudáveis (67,5% e 64,8%, respectivamente). A análise intra-grupo de adultos periodontalmente saudáveis ou doentes não revelou diferenças estatisticamente significativas em relação a presença bacteriana comparando-se fumantes e não fumantes. Conclusões: A colonização bucal por patógenos periodontais ocorre precocemente e se altera ao longo da vida, sendo muitas vezes direcionada pela presença dos elementos dentários que no presente estudo influenciou sobretudo a ocorrência de P. gingivalis, P. intermedia e T. forsythia. Outra observação importante foi a de que a condição periodontal materna influenciou a colonização por patógenos periodontais em recém-nascidos. Similarmente, o status periodontal infantil acarretou aumento nas freqüências bacterianas. Finalmente, o tabagismo não alterou os perfis microbiológicos observados. / Study hypothesis: The current study hypothesized that age and personal and/or maternal periodontal status favor the occurrence of periodontal pathogens, whereas tobacco use does not. Aim: To evaluate the relation between age, periodontal status and smoking and the presence of A. actinomycetemcomitans, P. gingivalis, P. intermedia, T. forsythia and C. rectus. Also, the impact of the mothers periodontal status on the occurrence of the same species in newborns. Methodology: In order to elucidate whats the age contribution, in the first stage of the study, regardless of periodontal status, 330 individuals were allocated in six age groups: newborns, children from 2.5 to 5 years, children from 6 to 12 years, adolescents from 13 to 18 years, adults from 19 to 44 years and adults over 55 years. In the second stage of the study, in which periodontal status and smoking were considered, another 76 mother/newborn pairs were chosen (33 sons of periodontitis mothers and 43 of no periodontitis mothers), another 112 periodontally healthy children, 109 gingivitis children, 40 periodontally healthy adults (21 smokers and 19 non-smokers) and 111 periodontitis subjects (53 smokers and 58 non-smokers) were added. The periodontal clinical parameters evaluated were probing depth and clinical attachment level (adolescents and adults), and, plaque index and gingival bleeding index (adults, adolescents and children). Subgingival samples were collected from dentate participants whereas non dental samples were collected from each group and were PCR-processed. Results: C. rectus was the most frequent bacterium for all groups, reaching 98% prevalence. The occurrence of P. gingivalis, P. intermedia, A. actinomycetemcomitans and T. forsythia was higher among newborns that are sons of mothers with periodontitis. Children with gingivitis allocated more P. gingivalis in the sulcus (99.1%) and mucosa (97.2%) than periodontally healthy children (67.5% and 64.8%, respectively). The intra-group analysis of periodontally healthy or diseased adults did not reveal statistically significant differences, when smokers and non-smokers were compared. Conclusions: Oral colonization by periodontal pathogens happens early in life and alters overtime, being many times guided tooth presence that, in the current study, influenced, above all, the occurrence of P. gingivalis, P. intermedia and T. forsythia. Another relevant finding was that the maternal periodontal status did influence the occurrence of periodontal pathogens in newborns. Similarly, the childhood periodontal status allowed increased bacterial frequencies. Finally, tobacco use did not alter the observed microbiological profiles.

A tecnologia da microencapsulação apresenta várias aplicações na indústria de alimentos. Sabendo-se que diferentes fatores intrínsecos e extrínsecos dos alimentos podem influenciar a produção e atividade antimicrobiana das bacteriocinas produzidas pelas bactérias láticas, este estudo teve como principal objetivo avaliar a funcionalidade da encapsulação de bactérias láticas (BAL) bacteriocinogênicas em alginato de cálcio no controle de Listeria monocytogenes em salame experimentalmente contaminado. Para atingir este objetivo, foram isoladas novas cepas de BAL a partir de salame, que foram identificadas e caracterizadas quanto às propriedades das bacteriocinas produzidas, avaliando-se a influência do processo de encapsulação na produção de bacteriocinas. Foram isoladas quatro cepas produtoras de bacteriocinas, identificadas como Lactobacillus sakei (uma cepa), Lactobacillus curvatus (duas cepas) e Lactobacillus plantarum (uma cepa), nomeadas MBSa1, MBSa2, MBSa3 e MBSa4, respectivamente. As bacteriocinas produzidas pelas quatro cepas foram termoestáveis e com exceção da cepa MBSa2, sensíveis a pH acima de 8. Todas inibiram todas as cepas de Listeria monocytogenes testadas e várias espécies de BAL, mas foram inativas contra bactérias Gram negativas. As bacteriocinas foram purificadas por cromatografia de troca iônica seguida de cromatografia de interação hidrofóbica sequencial e cromatografia de fase reversa, observando-se que L. sakei MBSa1 produz um peptídeo de 4303 Da, com uma sequência parcial de aminoacidos idêntica à sequência presente em sakacina A. As cepas MBSa2 e MBSa3 produzem dois peptídeos ativos cada, idênticos nas duas cepas, um de 4457 Da e outro de 4360 Da, que apresentam sequências parciais idênticas às presentes na sakacina P e na sakacina X, respectivamente. Aparentemente, a cepa L. plantarum MBSa4 produz uma bacteriocina composta por duas sub-unidades. O DNA genômico da cepa L. sakei MBSa1 contém os genes da sakacina A e curvacina A, enquanto o DNA da cepa L. plantarum MBSa4 foi positivo para o gene da plantaricina W. A cepa L. curvatus MBSa2 foi encapsulada em alginato de cálcio e testada quanto à produção de bacteriocinas in vitro, observando-se que o processo de encapsulação não influenciou a produção de bacteriocina. Quando testada in situ, ou seja, no salame experimentalmente contaminado com Listeria monocytogenes, não foi observada ação anti-Listeria por L. curvatus MBSa2 encapsulado e não encapsulado, durante o 30 dias de fabricação do salame. / The microencapsulation technology has several applications in the food industry. Knowing that different intrinsic and extrinsic factors can influence production and antimicrobial activity of bacteriocins produced by lactic acid bacteria in foods, this study aimed at evaluating the functionality of the encapsulation of bacteriocinogenic lactic acid bacteria (LAB) in calcium alginate in the control of Listeria monocytogenes in experimentally contaminated salami. To achieve this goal, new strains of LAB were isolated from salami, identified and characterized for the properties of the produced bacteriocins, evaluating the influence of the encapsulation process in the bacteriocins production. Four bacteriocin producing strains were isolated and identified as Lactobacillus sakei (one strain), Lactobacillus curvatus (two strains) and Lactobacillus plantarum (one strain), named MBSa1, MBSa2, MBSa3 and MBSa4 respectively. The bacteriocins produced by the four strains were thermostable and with the exception of strain MBSa2, sensitive to pH above 8. All inhibited all tested Listeria monocytogenes strains and various species of LAB but were inactive against Gram-negative bacteria. The bacteriocins were purified by cation-exchange followed by sequential hydrophobic-interaction and reversed-phase chromatography, indicating that L. sakei MBSa1 produces a peptide of 4303 Da, with a partial amino acid sequence identical to the sequence present in sakacin A. L. curvatus MBSa2 and MBSa3 produce two active peptides, identical in the two strains, one of 4457 Da and the other of 4360 Da, with partial aminoacid sequences identical to those present in sakacin X and sakacin P, respectively. Apparently, L. plantarum MBSa4 produces a bacteriocin composed of two subunits. Genomic DNA of L. sakei MBSa1indicated that this strain contains genes for sakacin A and curvacin A, while the DNA of L. plantarum MBSa4 was positive for the plantaricin W gene. The strain L. curvatus MBSa2 was encapsulated in calcium alginate and tested for bacteriocin production in vitro, observing that the encapsulation process did not affect the production of bacteriocin. When tested in situ, i.e. in the salami experimentally contaminated with L. monocytogenes was not observed anti-Listeria<i/> action by L. curvatus MBSa2 encapsulated and non-encapsulated during the 30 day manufacture of salami.