Made available in DSpace on 2016-04-04T12:45:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 liana_pereira_ioc_mest_2014.pdf: 4702231 bytes, checksum: 2246716c6d5dbccb2563a99addb4684d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A síndrome pulmonar por hantavírus (SPH) tem sido registrada no Brasil desde 1993 e a transmissão para o homem ocorre através da inalação de partículas virais presentes em aerossóis de excretas de roedores infectados. No Brasil, nove genótipos virais caracterizados a partir de roedores e/ou humanos foram descritos, sendo seis comprovadamente patogênicos. Desde os primeiros registros, mais de 1600 casos humanos foram confirmados, com ampla distribuição entre a maioria dos estados brasileiros e alta taxa de letalidade. A SPH apresenta-se como doença febril aguda caracterizada pelo grave comprometimento cardiovascular e respiratório. Os pacientes podem exibir uma ampla variedade de manifestações clínicas, onde os sinais e sintomas podem ser confundidos com os de outras doenças. Assim é necessário o diagnóstico diferencial separando casos de SPH de outros agravos com manifestações clínicas semelhantes, como é o caso da dengue. Embora não existam relatos de casos humanos no estado do Rio de Janeiro, foram encontradas evidências sorológicas em humanos e confirmação de circulação de hantavírus patogênico entre roedores silvestres, mais especificamente, na espécie Oligoryzomys nigripes, no Parque Nacional da Serra dos Órgãos, em Teresópolis Neste cenário, este estudo teve como objetivos avaliar a infecção por hantavírus em amostras humanas e em amostras de roedores silvestres e sinantrópicos provenientes de diversos municípios fluminenses. Um total de 497 amostras de soro de pacientes negativos para dengue pelos testes sorológicos, cedidas pelo LACEN/RJ, provenientes de 25 municípios, e de 235 amostras de roedores provenientes de sete municípios, foram analisadas através do ensaio imunoenzimático para detecção de anticorpos anti-hantavírus da classe IgM e IgG (ELISA IgM e IgG) e de testes moleculares. Cinco amostras de pacientes (1%) procedentes dos municípios de Valença, Vassouras e Nova Friburgo foram ELISA-IgM reativas. Um roedor (0,42%) da espécie Oligoryzomys nigripes ELISA-IgG foi reativo no município de Valença. A ausência de RNA nas amostras humanas impossibilitou a realização de testes moleculares para caracterização e identificação do vírus, porém na amostra do roedor reativo foi possível detectar a variante viral Juquitiba como responsável pela infecção deste espécime Em conclusão, a identificação do hantavírus patogênico Juquitiba em roedores silvestres e a evidência sorológica de infecção em amostras humanas neste estudo reforçam a importância e a necessidade de vigilância da SPH no estado do Rio de Janeiro / Toxoplasma gondii usually causes an asymptomatic infection, but it can present severity during pregnancy and in immunocompromised patients . Current therapies for toxoplasmosis are restricted only against tachyzoites, and have little or no effect on bradyzoites, which are kept in tissue cysts like source of the infection recrudescent. Consequently, new therapeutic alternatives have been proposed, as the use of Atovaquone that showed some effica cy against tachyzoites and bradyzoites in tissue cysts. In this work, we propose to study the effect of 3 - BrPA, a compound that is being tested against cancer cells, on the infection of LLC - MK 2 cells with tachyzoites of T. gondii (RH strain) . N o effect of 3 - BrPA on host cell proliferation and viability was observed. Evaluation of 3 - BrPA interference on in vitro growth of T. gondii showed a reduction in intracellular parasite proliferation about 55% after 24 h of treatment, and 61% after 48 h. Intracellular d evelopment of parasite, analyzed by SEM, showed morphological characteristics commonly found in tissue cysts. Incubation of cultures with DBA lectin confirmed the development of cysts and TEM showed the presence of bradyzoites. Moreover, we revealed the pr esence of degraded parasites and the influence of compound on endodyogeny. Another approach used was the treatment of infected cultures with combination of 3 - BrPA and Atovaquone. This r esulted in the reduction of intracellular parasites of 73% after 24 h o f treatment and 71% after 48 h, compared to control, besides the absence of cyst wall formation in these cultures. The refore, it is concluded that use of 3 - BrPA may pres ent as an important tool for study of: (i) in vitro c ystogenesis , (ii) the metabolism o f the parasite, requiring deeper understanding of the target of action of the compound in T. gondii , (iii) the alternatives metabolic pathways of the parasite, and (iv) the molecular / cellular triggered that led to death of the parasites mechanisms.

Made available in DSpace on 2016-05-11T12:57:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 jessica_sousa_ioc_mest_2015.pdf: 4813874 bytes, checksum: 22603f64a7a8f0a10fe891cf269bcb52 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Este trabalho trata da segunda fase de um estudo de intervenção tipo ensaios de campo de nível agregado, cujo objetivo foi avaliar o uso e retenção de mosquiteiros impregnados com inseticidas de longa duração (MILDs) e as ações de educação em saúde dentro de uma estratégia integrada para ao controle da malária implementada no ano de 2009 no rio Padauiri. Foram escolhidas uma área de intervenção (rio Padauiri) e outra área controle (Bacabal, no rio Aracá e São Sebastião, bairro de Barcelos). No estudo retrospectivo foi encontrado que todas as áreas de estudo são de alto risco epidemiológico, com uma IPA acima de 50. No município de Barcelos foi visto que há uma sazonalidade na infecção por malária, tendo um incremento no número de casos na época das chuvas e também foi observado que as crianças vêm se infectando mais que os adultos. No que diz respeito ao uso dos MILDs, foi encontrado que 80% dos domicílios no grupo de intervenção possuíam ao menos um MILD na casa, enquanto que no controle, 66% possuíam. Comparando com o estudo de linha de base realizado em 2008, antes da implementação da estratégia integrada, observou-se que o uso do mosquiteiro no grupo de intervenção aumentou em 5%, de 9,9% em 2008 para 14,9% em 2014 e o contrário foi visto no grupo controle no qual houve uma diminuição de 7% no uso do mosquiteiro (de 37,8% em 2008 para 30,8% em 2014). De 48,5% dos indivíduos do grupo de intervenção que receberam o mosquiteiro do projeto, 83,7% destes ainda o possuía Todos os indivíduos do estudo relataram já terem ouvido falar de malária e a grande maioria (>90%) teve malária pelo ao menos uma vez. Mais de 70% dos indivíduos de ambos os grupos souberam dizer como ocorre a transmissão da malária e um pouco mais da metade dos indivíduos de ambos os grupos conheciam como evitar a doença, porém ainda foram verificados conceitos errôneos, onde muitos aspectos particulares da dengue foram atribuídos à malária. Houve impacto da estratégia no ano de sua implementação (2009), mas não houve impacto no ano seguinte (2010), apesar do aumento no uso dos mosquiteiros neste ano em relação ao ano de 2008. Estes achados indicam que as ações da estratégia integrada foram parcialmente efetivas, tendo diminuído a incidência da doença no ano da implementação, mas nos anos seguintes não tendo impacto sobre esta incidência. Conclui-se pelos resultados que as estratégias de controle devem ser permanentes nessas áreas de alto risco epidemiológico, de difícil acesso geográfico onde moram pessoas com baixo nível socioeducativo e que é preciso a busca de novas estratégias para que os conhecimentos adquiridos se convertam em modificação de atitudes e comportamentos / This survey is the second phase of an interventional field-based study at the community level, whose objective was to evaluate the use and retention of long-lasting insecticidal nets (LLINs) and health education activities within an integrated strategy for the control of malaria implemented in 2009 in Padauiri river. Were chosen an Intervention area (Padauiri river) and another control area (Bacabal, in the Aracá river and São Sebastião district, in Barcelos). In the retrospective study found that all areas of study are of high epidemiological risk, with an API above 50. In the municipality of Barcelos was observed that there is a seasonality on malaria infection, with an increase in the number of cases in the rainy season and it was also noticed that children have been infecting more than adults. As regards the use of the LLINs it was found that 80% of households in the intervention group had at least one LLIN at home, while in the control, had 66%. Compared to the baseline study conducted in 2008, before the implementation of the integrated strategy, it was observed that the net use in the intervention group increased by 5%, from 9.9% in 2008 to 14.9% in 2014 and the opposite was seen in the control group there was a 7% decrease in the use of mosquito nets (37.8% in 2008 to 30.8% in 2014). Of 48.5% of individuals in the intervention group that received the project mosquito net, 83.7% of these still possessed All study individuals reported having heard of malaria and the vast majority (> 90%) had malaria at least once. More than 70% of individuals of both groups know how malaria transmission occurs and a little more than half of the individuals in both groups knew how to avoid the disease, but still were verified erroneous concepts, where many particular aspects of dengue were attributed to malaria. There was Impact of the strategy in the year of its implementation (2009), but there was no impact on the next year (2010), despite the increase in the use of mosquito nets this year compared to the year 2008. These findings indicate that the actions of the integrated strategy were partially effective, having decreased the incidence of the disease in the year of implementation, but in the following years having no impact on this incidence. The results concluded that control strategies must be permanent in these high risk areas epidemiological, geographical access is difficult where live people with low educational level and the search for new strategies so that the knowledge gained into changes in attitudes and behaviours

Made available in DSpace on 2016-06-28T12:18:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 felipe_murta_ioc_mest_2016.pdf: 2506895 bytes, checksum: a765e8bfa364a8d6c5a32fe6f7ac1e1c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2016 / Made available in DSpace on 2016-07-05T23:52:46Z (GMT). No. of bitstreams: 3 felipe_murta_ioc_mest_2016.pdf.txt: 181778 bytes, checksum: bfd1ea2c9fd92c06e8ce0ebe372f6b38 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) felipe_murta_ioc_mest_2016.pdf: 2506895 bytes, checksum: a765e8bfa364a8d6c5a32fe6f7ac1e1c (MD5) Previous issue date: 2016 / Introdução: A esquistossomose mansônica é endêmica no Brasil. As crianças em idade escolar detêm as maiores prevalências e cargas parasitárias. Estudos que avaliaram os limites e possibilidades das abordagens educativas para o controle da endemia sugerem que os programas devem investir em estratégias que levem em conta a realidade local, o empoderamento e a integração dos profissionais da saúde e educação e o desenvolvimento de ações com os grupos mais vulneráveis, como os escolares. Objetivos: Este trabalho visa: (a) estimar as taxas de infecção por Schistosoma mansoni entre os profissionais de educação no município de Malacacheta, área endêmica de Minas Gerais; (b) formar professores multiplicadores do conhecimento sobre esquistossomose entre os escolares; (c) avaliar o uso, no ensino fundamental, de duas abordagens educacionais sobre prevenção e controle da esquistossomose; e (d) verificar se as abordagens educacionais contribuem para promover mudanças no nível do conhecimento que aproxime o saber popular e o científico dos professores e alunos de forma sustentável no tempo Metodologia: A positividade para S. mansoni nos profissionais da educação do município foi estimada através de inquérito parasitológico de fezes (n=522), usando o método de Kato-Katz. Dois cursos de atualização sobre a doença, com abordagens distintas, foram ministrados para professores de diferentes disciplinas do município endêmico de Malacacheta, Minas Gerais. Questionários semiestruturados foram aplicados aos professores e seus alunos, antes e após as ações educativas, para levantar os conhecimentos prévios e adquiridos. Resultados: A prevalência da esquistossomose no grupo estudado foi de 5,9% e os resultados das análises dos questionários/entrevistas apontam para mudança significativa no conhecimento sobre a doença, tanto nos professores que participaram dos cursos, quanto de seus alunos. As ações educativas contribuíram para aumentar o conhecimento sobre a doença de um modo geral, que foi multiplicado e sustentável mesmo após um ano das ações educativas / Schistosomiasis mansoni is endemic in Brazil. The highest prevalences and parasite loads are among school-age children. Studies to evaluate the limitations and potential of educational approaches to its control suggest that programmes should invest in strategies that address the local situation and the empowerment and integration of health and education personnel and provide for actions with the most vulnerable groups, such as schoolchildren. Objectives: This study aims: (a) to assess infection rates by Schistosoma mansoni among education personnel in Malacacheta, a municipality in the endemic area of Minas Gerais; (b) to train teachers as multipliers of knowledge of schistosomiasis among schoolchildren; (c) to evaluate the use, with primary and middle-school teachers, of two educational approaches on schistosomiasis prevention and control; and (d) to ascertain whether the educational approaches contributed to knowledge rearrangement that approximates the popular and scientific know-how of teachers and their pupils and whether that knowledge is sustainable in time Methodology: S. mansoni infection among education personnel in the municipality was estimated by parasitology stool test (n=522), using the Kato-Katz method. Two refresher courses using different, but complementary, educational approaches (critical pedagogy and pedagogy of creative play) to the disease were given to teachers of various different subjects. Semi-structured questionnaires were applied to teachers and their pupils, before and after the educational actions, in order to survey prior and acquired knowledge. Results: Prevalence of schistosomiasis in the study group was 5.9%, while the results of analysis of the questionnaires/interviews pointed to significant changes in knowledge of the disease among teachers who took the course and their pupils. The educational actions contributed to improve the knowledge about the disease in general, which was multiplied and sustained even after one year the educational actions

Introdução: A demência é um dos principais problemas de saúde devido ao rápido crescimento populacional de idosos, com prevalência estimada de 8,5% em estudos latino-americanos. Comprometimento cognitivo leve e Comprometimento Cognitivo sem Demência (CCSD) são designações utilizadas para a condição clínica entre o envelhecimento normal e demência com prevalência ainda insuficientemente determinada em estudos populacionais, particularmente no Brasil. Objetivos: Estabelecer a prevalência de CCSD e de demência em idosos que vivem na comunidade no município de Tremembé, estado de São Paulo, e avaliar a influência de variáveis sociodemográficas. Verificar se a prevalência de demência foi mais elevada entre sexagenários do que em países desenvolvidos. Secundariamente, verificar a adequação dos instrumentos: Questionário de Mudança Cognitiva (QMC), Addenbrooke\'s Cognitive Examination-Revised (ACE-R) e Montreal Cognitive Assessment (MoCA) para estudos populacionais. Métodos: O estudo populacional foi realizado em fase única com os idosos com 60 anos ou mais residentes no município de Tremembé. Foram selecionados, de forma aleatória, 20% dos domicílios dos idosos de cada setor censitário do município. Além da avaliação clínica e neurológica, questionários foram aplicados aos informantes para avaliar atividade funcional (Informant Questionnaire on Cognitive Decline in the Elderly [IQCODE] e o Questionário de Atividades Funcionais de Pfeffer), e testes neuropsicológicos foram aplicados aos participantes (Bateria Breve do Rastreio Cognitivo, Mini Exame do Estado Mental, teste de fluência verbal e teste do desenho do relógio) juntamente com escalas de avaliação psiquiátrica. Os diagnósticos de CCSD e de demência foram estabelecidos em reunião de consenso entre dois especialistas em neurologia cognitiva, com base no conjunto dos dados obtidos. / Introduction: Dementia is one of the major health issues due to the rapidly growing elderly population, with an estimated prevalence of 8.5% in Latin American studies. Mild cognitive impairment and Cognitive impairment no dementia (CIND) are designations for a clinical condition that lies between normal aging and dementia, and its prevalence is insufficiently determined in population studies, particularly in Brazil. Objectives: To determine the prevalences of CIND and dementia in the communitydwelling elderly living in the municipality of Tremembé, São Paulo state and to evaluate the influence of socio-demographic variables. To verify whether the prevalence of dementia was higher among sexagenarians than in developed countries. Secondarily, to investigate the suitability of the use of Questionnaire of Cognitive Change (QCC), Addenbrooke\'s Cognitive Examination-Revised (ACE-R) and Montreal Cognitive Assessment (MoCA) in epidemiological studies. Methods: The population study was conducted in a single phase with the elderly aged 60 years or more living in municipality of Tremembé. Twenty percent of the households with elderly were randomly selected from each city\'s census tract. In addition to clinical and neurological evaluations, questionnaires were applied to informants to assess functional activities (Informant Questionnaire on Cognitive Decline in the Elderly [IQCODE] and Pfeffer Functional Activities Questionnaire); and neuropsychological tests were administered to participants (Brief Cognitive Screening Battery, Mini-Mental State Examination, verbal fluency test and clock drawing test) along with psychiatric rating scales. The diagnoses of dementia and CIND were established in consensus meetings by two neurologists specialized in cognitive neurology, based on the available set of data. Results: Six hundred and thirty subjects (63% women) were examined with mean age of 71.28 (±7.99) and mean years of schooling of 4.90 (±4.54). The prevalence of dementia was 17.5%, higher than in developed countries in all age groups, but the prevalence was even higher among individuals aged between 60 and 69 years. The prevalence of CIND was 19.5%. These prevalences were influenced by age (p< 0.001) and by educational level (p < 0.001). There was no significant gender difference among diagnostic groups (p= 0.166). In multiple comparisons analysis, age was significantly different among the three groups, being higher in the dementia group, lower in the cognitively normal group and intermediate in the CIND group; and education was higher in the normal group compared to the mean years of schooling in the other two groups. Diagnosis of dementia was significantly associated with low socioeconomic status, stroke, previous psychiatric disorder, alcoholism, and epilepsy, while diagnosis of CIND was only associated with stroke. Conclusions: The prevalence of dementia in this study was higher than those reported by other studies, particularly among sexagenarians elderly. The prevalences of dementia and CIND were influenced by age and by educational attainment. The QCC was a suitable instrument for the diagnosis of dementia but the ACE-R and MoCA did not show good accuracies in this population with heterogeneous educational background

Submitted by Alessandra Portugal (alessandradf@ioc.fiocruz.br) on 2013-09-24T15:13:22Z No. of bitstreams: 1 PRISCILA CONRADO GUERRA NUNES-DISSERTAÇÃO.pdf: 1825528 bytes, checksum: 74a07fe69f134aaa45b25831d5e80a3b (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-24T15:13:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PRISCILA CONRADO GUERRA NUNES-DISSERTAÇÃO.pdf: 1825528 bytes, checksum: 74a07fe69f134aaa45b25831d5e80a3b (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Desde a introdução do dengue sorotipo 2 (DENV-2) em 1990, o estado do Rio de Janeiro registrou mais duas epidemias associadas a este sorotipo em 1998 e 2008 respectivamente. A epidemia de 2008 foi considerada a de maior magnitude não apenas em número de casos notificados, como também em número de casos graves e fatais. Durante essa epidemia, o número de casos reportados em todo o país foi de 806.036, ultrapassando em número de casos da epidemia de dengue 3 (DENV-3), até então considerada a maior já registrada no país. A análise filogenética das cepas de DENV-2 isoladas no Rio de Janeiro durante as epidemias de 1990, 1998 e 2008, demonstrou que apesar de pertencerem ao mesmo genótipo (Americano/Asiático), os vírus isolados em 2008 são geneticamente distintos e, agrupados em uma linhagem distinta classificada como linhagem II, dos vírus de 1990 e 1998 pertencentes à linhagem I. Considerando-se que a epidemia de 2008 foi a mais grave já descrita no Brasil em número de casos e óbitos, o objetivo principal desse estudo é investigar se esta nova linhagem pode ter contribuído para este perfil patogênico. Para tal, utilizando o PCR em tempo real quantificamos a viremia produzida pelas duas linhagens a partir de amostras de soros agudos de 102 casos de DENV-2, confirmados por Isolamento viral e/ou RT-PCR e, selecionados de acordo com o período de circulação de cada linhagem. A quantificação do RNA viral foi realizada de acordo com o protocolo descrito Poersch, 2005. A carga viral obtida nas amostras correspondentes às duas linhagens foi correlacionada com a gravidade da doença utilizando-se como critério a classificação clínica de casos de dengue segundo a OMS, com a idade, sexo, dias de doença e tipo de infecção (primária ou secundária). Os títulos da carga viral da linhagem II foram mais elevados do que os da linhagem I (p=0,001). A viremia foi mais elevada nas amostras da linhagem II, com significancia quando correlacionada com a forma grave da doença (p=0,001). Este estudo demonstrou que o vírus é um fator importante na complexa dinâmica da gravidade da doença. O fato de não encontramos associação entre tipo de infecção, idade, sexo e dias de doença com gravidade e carga viral durante o período em que circulou apenas a linhagem I, confirma a nossa hipótese de que a linhagem II era mais virulenta e foi um fator importante para a gravidade dos casos ocorridos na epidemia de 2008. / Since the introduction of dengue serotype 2 (DENV-2) in 1990, two additional epidemics associated with this serotype occurred in 1998 and 2008 respectively. The epidemic of 2008 was considered to be of greater magnitude not only in number of reported cases, but also in number of severe and fatal cases. During this epidemic, the number of reported cases in country was 806,036, exceeding the number of DENV-3 cases reported in the 2002 epidemic, hitherto considered the largest ever recorded in the country. Phylogenetic analysis of DENV-2 strains isolated during the epidemics of 1990, 1998 and 2008 in the state of Rio de Janeiro, showed that despite belonging to the same genotype (American / Asian), the viruses isolated in 2008 are genetically distinct and grouped into a distinct lineage of viruses from 1990 and 1998. Considering that the epidemic of 2008 was the most severe reported in Brazil in number of cases and deaths, the main objective of this study was to investigate whether this new strain may have contributed to this severity observed in cases occurred during the 2008 epidemic. To this end, using real time PCR the viral load produced by the two lineages was quantified in sera of 102 DENV-2 cases previously confirmed by virus isolation and/or RT-PCR selected according the period of lineages circulation. The viral RNA quantification was performed according to the protocol described by Poersch (2005). The viral load obtained in samples corresponding to the two lineages was correlated with disease severity following WHO clinical classification criteria, with age, gender, immunological status (primary and secondary dengue infection) and day of illness. The viral load observed in lineage II were higher than those from lineage I (p = 0.001). Higher viraemia was observed in severe cases from lineage II when those were compared to those cases from lineage I (p = 0.001). This study demonstrated that the virus is an important factor in the complex dynamic of the disease severity and the fact that we found no association between type of infection, age, gender and day of disease severity suggests that the lineage II was more virulent and was an important factor in the severity of cases occurred in 2008 epidemic.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-06-04T18:27:54Z No. of bitstreams: 1 ludmila_n_rocha_ioc_bp_0020_2010.pdf: 2174715 bytes, checksum: ebf8bfd1505512fa4a3904c3dc6b97f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-04T18:27:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ludmila_n_rocha_ioc_bp_0020_2010.pdf: 2174715 bytes, checksum: ebf8bfd1505512fa4a3904c3dc6b97f6 (MD5) Previous issue date: 2010 / Instituto Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Em todo o mundo as gastroenterites infantis agudas causadas por rotavírus do grupo A (RV-A) estão associadas a cerca de 611.000 mortes por ano. RV-A pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, e são constituídos de onze segmentos de RNA dupla-fita que codificam para seis proteínas estruturais (VPs) e seis proteínas não-estruturais (NSPs). Os genótipos de RV-A são definidos por dois genes que codificam para as duas proteínas do capsídeo externo, VP4 (P) e VP7 (G). Estudos epidemiológicos demonstraram que mundialmente cinco genótipos G são mais frequentes: G1-G4 e G9; em associação com os genótipos P [8], P [4] ou P [6]. Em 2005 houve a re-emergência do genótipo G3 em crianças internadas em um hospital público no Rio de Janeiro, em concordância com a emergência desse genótipo em diversas partes do mundo, principalmente nos países asiáticos. O objetivo do presente estudo é determinar a relação entre os genes VP4, VP7 e NSP4 de RV-A genótipo G3 isoladas no Rio de Janeiro entre 1996 e 2009. A análise filogenética realizada a partir das seqüências de nucleotídeos dos genes do VP7, VP4 e NSP4 demonstrou que as amostras que circularam em 1996 e 1997 no Rio de Janeiro são distintas daquelas que foram isoladas em 2005 e 2006, sugerindo uma possível introdução deste genótipo no Rio de Janeiro. Em 2009, mais amostras de RV-A G3 foram detectadas no Rio Grande do Sul. A análise dos três genes estudados demonstrou estreita relação genética com as amostras isoladas em 2005. Recentemente, um novo sistema de classificação de rotavírus foi proposto, em que todos os 11 segmentos do genoma de RNA são utilizados e valores de cut-off foram determinados para diferenciar os genótipos. Segundo essa nova classificação, todas as amostras desse estudo foram classificadas como pertencentes aos genótipos G3 – P[8] – E1 para VP7, VP4 e NSP4, respectivamente. Em todos os genes estudados foram observadas mutações pontuais em regiões antigênicas, porém são necessários mais estudos para avaliar a importância na estrutura e função das proteínas. Foram evidenciados eventos de reestruturação genômica entre amostras humanas para o gene que codifica para VP4 (VP8*), os quais podem estar relacionados a uma vantagem adaptativa para o vírus. Os resultados do presente estudo confirmam a importância do monitoramento contínuo e da caracterização molecular das amostras de RV-A a fim de obter melhor entendimento da epidemiologia e a evolução dos RV-A genótipo G3. / Acute gastroenteritis caused by group A rotaviruses (RV-A) are associated to nearly 611,000 deaths of children worldwide per year. RV-A belong to the family Reoviridae, genus Rotavirus, and are characterized by having a segmented genome, composed of 11 segments of double-stranded RNA that encodes six structural proteins (VPs) and six non-structural proteins (NSPs). The genotypes of RV-A are defined by two genes that codify the two outer proteins, VP4 (P) and VP7 (G). Epidemiological studies in several parts of the world have indicated that there are five most common G genotypes: G1-G4 and G9; in association with P [8], P [4] or P [6] genotypes. In 2005, genotype G3 has emerged in hospitalized children in a public hospital in Rio de Janeiro, corroborating the global emergence of this genotype, especially in Asian countries. The present study aims to determine the relationship between the genes VP4, VP7 and NSP4 of stool samples positive for RV-A genotype G3 isolated in Rio de Janeiro between 1996 and 2006. Phylogenetic analyses carried out on the VP7, VP4 and NSP4 genes demonstrated that the samples that circulated in 1996 and 1997 in Rio de Janeiro are distinct from those that were detected in 2005 and 2006, which suggests a possible entering of a new G3 variant in Rio de Janeiro. In 2009, new samples of G3 were detected in Rio Grande do Sul. The analysis of the three studied genes demonstrated a straight genetic relation with the samples identified in 2005. A new rotavirus classification system has been recently proposed, in which all the 11 RNA genome segments are utilized and cut-off values were determinated to differ the genotypes. According to this new classification, all the samples in this study were characterized as genotypes G3 – P[8] – E1 to VP7, VP4 and NSP4, respectively. In all studied genes there were amino acids substitutions in antigenic regions, although more studies are necessary to evaluate the importance in the structure and protein functions. Genomic restructuration events in the VP4 (VP8*) codifying gene between human samples have been been described, which might be related to an adaptive advantage for the virus. The results of the current study confirm the importance of continuous monitoring and molecular characterization of RV-A samples with the purpose of a better understanding of RV epidemiology and evolution.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-07-25T17:26:02Z No. of bitstreams: 1 victor_f_pimentel_ioc_bp_0046_2011.pdf: 6548395 bytes, checksum: afd0212363a49798d97d8d29fe0dc360 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-25T17:26:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 victor_f_pimentel_ioc_bp_0046_2011.pdf: 6548395 bytes, checksum: afd0212363a49798d97d8d29fe0dc360 (MD5) Previous issue date: 2011 / Universidade de São Paulo. Instituto de Ciências Biomédicas. São Paulo, SP, Brasil / Estudos de epidemiologia molecular do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV-1) realizados no Rio de Janeiro permitiram identificar predominantemente a cocirculação dos subtipos B, da variante B” do subtipo B, F1 e formas recombinantes 20 BF1. Sendo assim, o objetivo desse estudo era traçar a dinâmica temporal dos subtipos e formas recombinantes de HIV-1 em diferentes categorias de exposição ao risco: heterossexuais (HET), bissexuais (BIS) e usuário de drogas injetáveis (UDI) em dois distintos períodos [(1990-92) e (2006-2010)] da epidemia de Aids no Rio de Janeiro. A casuística deste trabalho era composta por indivíduos HIV-1 soropositivos de dois distintos períodos da epidemia de HIV/AIDS, sendo o primeiro de amostras coletas entre 1990-92 (n=130) e o segundo composto por amostras de pacientes diagnosticados entre 2006-2010 (n=88). A subtipagem das amostras foi realizada através da filogenia pelo método de NJ com correção K2p (MEGA 4.0) e a recombinação avaliada pelo bootscan (Simplot 3.2), análise de pontos e árvore de fragmentos. Para entendermos a dinâmica das assinaturas moleculares do subtipo B no topo da alça v3 e a sua distribuição nas distintas categorias exposição de risco realizamos a análise Bayesiana (MrBayes). A análise filogenética da região da gp120 foi realizada para o primeiro período e evidenciou uma prevalência do subtipo B (90%) seguida pelo subtipo F1 (8%) e BF1 (2%). No segundo período do estudo identificamos a seguinte prevalência: (84%) do subtipo B, (9%) F1, (3.5%) C, (2.3%) BF1 e (1.2%) subtipo A. Em geral, das amostras 95 de HET e BIS caracterizadas como subtipo B no primeiro período, 40% tinham a assinatura GPG, 43% GWG e 17% GXG. Na segunda coorte, o subtipo B foi detectado em 74 amostras sendo: 62% GPG, 23% GWG e 15% GXG. A distribuição das variantes do subtipo B do HIV-1 nos dois períodos foi respectivamente: HET (GPG) [60%-69%], (GWG) [20%-13%] e (GXG) [20%-19%] e BIS (GPG) [25%-57%], (GWG) [61%-31%], (GXG) [14%-12%]. O estudo das redes de transmissão dos subtipo B realizado com as amostras do primeiro do estudo que nos permitiu detectar uma distribuição não aleatória destas segundo a categoria de exposição ao risco e assinaturas do topo do v3. De um subconjunto de 79 amostras de ambas coortes, que foram caracterizadas na região da polimerase, 8% apresentaram um perfil de recombinação, sendo estas caracterizadas majoritariamente como URFs e apenas uma amostra CRF40_BF-like. Nossos achados indicam uma redução na frequência da variante B” ao longo do tempo, e sugere que a introdução da variante B” no Rio de Janeiro estava relacionado ao grupo dos BIS. / Human Immunodeficiency virus (HIV-1) molecular epidemiology studies carried out in Rio de Janeiro, Brazil, have identified the predominance of the co-circulation of subtypes B, B” variant, F1 and BF1 recombinants. Thus, the aim of this study was trace the temporal dynamic of subtypes and recombinants forms of the HIV-1 in different exposure categories: heterosexuals (HET), bisexuals (BIS) and injecting drug users (IDU) in two distinct periods [(1990-1992) and (2006-2010)] of the AIDS epidemic in Rio de Janeiro. The subjects of this study were composed of HIV-1 seropositive individuals from two distinct periods of the HIV/AIDS epidemic. The first samples were collected from 1990-1992 (n = 130) and the second batch of samples from patients diagnosed between 2006-2010 (n = 88). The subtyping of the samples was performed by the method of phylogeny NJ with K2p correction (MEGA 4.0) and the recombination was evaluated by bootscan (Simplot 3.2), point analysis and tree fragments. To understand the dynamics of molecular signatures of subtype B on the motif at the tip of the V3 loop, and its distribution in the different exposure categories, we applied the Bayesian analysis (MrBayes). Phylogenetic analysis of gp120 region was performed for the first period and a prevalence of subtype B (90%)was observed, followed by subtype F1 (8%) and BF1 (2%). In the second period of the study we identified the following prevalence: (84%) subtype B, (9%) F1, (3.5%) C, (2.3%) BF1 and (1.2%) of subtype A. Overall, 95 samples 22 from HET and BIS were characterized as subtype B in the first period, 40% were GPG, 43% GWG and 17% GXG. In the second cohort, subtype B was detected in 74 samples: GPGR (62%), GWGR (23%), and GXGR (15%). The distribution of the HIV-1 subtype B variants in the two periods were, respectively: HET (GPG) [60%-69%], (GWG) [20%-13%] e (GXG) [20%-19%] e BIS (GPG) [25%-57%], (GWG) [61%-31%], (GXG) [14%-12%].The study of subtype B transmission network carried out within the samples from the first period of this study allowed us to detect a non random distribution, such as the category exposure and signatures from the top of v3. From a subset of 79 samples from both cohorts, which were analyzed in the polymerase region, 8% showed a recombination profile and were characterized mostly as URFs, with only one sample characterized as CRF40_BF-like. Our findings indicate a reduction of the frequency for the B” variant over time and suggest that the introduction of the B” variant in Rio Janeiro was possibly related to the BIS group.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-10-15T13:16:58Z No. of bitstreams: 1 allan_j_guimaraes_ioc_bcm_0029_2006.pdf: 1714817 bytes, checksum: d2edc214a8508b65add7f8db0b664ce0 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-15T13:16:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 allan_j_guimaraes_ioc_bcm_0029_2006.pdf: 1714817 bytes, checksum: d2edc214a8508b65add7f8db0b664ce0 (MD5) Previous issue date: 2006 / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A histoplasmose é causada pelo fungo dimórfico Histoplasma capsulatum. A infecção por este organismo é freqüentemente diagnosticada pela determinação da presence de anticorpos para a proteína M, imunodominante, mas o papel deste antígeno na patogênese da histoplasmose permanence obscuro. A função do antígeno M não é conhecida, mas geneticamente esta proteína é homologa catalases fúngicas. Em nosso estudo, nós procuramos determinar regiões imunodominantes do antígeno M, produzir um painel de anticorpos monoclonais contra esta proteína, caracterizá-los, usá-los para o mapeamento de epítopos, mostrar a localização do antígeno M na levedura do H. capsulatum, demonstrar a atividade de catalase desta proteína e desenvolver imunoensaios para a detecção de anticorpos contra esta proteína e entígeno M circulante nos fluidos corporais. Foi possível determinar peptídeos com maior atividade antigênica e suas localizações na molécula e caracterizá-los de acordo com as suas propriedades bioquímicas. Nós geramos três fragmentos que continham estes peptídeos e os utilizamos para avaliar a ligação dos anticorpos monoclonais e reconhecimento a cada fragmento separadamente. Um dos fragmentos, F3, mostrou maior ligação aos anticorpos monoclonais que os outros avaliados, entretanto estudos adicionais devem ser avaliados para um complete mapeamento. Para avaliar o papel do antígeno M na patogênese da histoplasmose, usando análise por imunoblot de um extrato de parede celular e membrana (CW/M) obtido de levedura, provamos que os mAbs gerados contra o antígeno M recombinante puderam reconhecer este antígeno no extrato utilizado. Estudos de imunofluorescencia também revelaram que os mAbs reconheciam proteínas na superfície da levedura. Adicionalmente, avaliamos a atividade de catalase usando diferentes frações celulares para sugerir a localização da enzima e confirmamos que a maior atividade de catalase estava presente nos extratos incluindo antígenos de superfície. A capacidade do antígeno M em funcionar como catalase sugere que esta enzima está provavelmente envolvida na proteção pelas leveduras contra o stress oxidativo na interior do fagolisossomo e escape dos mecanismos fungicidas nos macrófagos. A localização do antígeno M na superfície do Hc tem importantes implicações na antigenicidade da proteína já que está acessível ao sistema imunológico do hospedeiro e interações com os anticorpos. Adicionalmente, a ELISA para a detecção de anticorpos utilizando histoplasmina purificada e tratada (ptHMIN) mostrou uma sensibilidade de 92% e uma especificidade de 96%, enquanto a ELISA para a detecção de antígenos mostrou uma sensibilidade de 80% e uma especificidade de 91%, provando que estas duas metodologias poderiam ser utilizadas no diagnóstico da histoplasmose. / Histoplasmosis is caused by the dimorphic fungus Histoplasma capsulatum. Infection with this organism is often diagnosed by determining the presence of antibody to the immunodominant M antigen, but the role of the M antigen in the pathogenesis of histoplasmosis has previously not been elucidated. The function of the M protein is not known, but genetically it is homologous to fungal catalases. In our work, we sought to determine immunodominant regions of the M antigen, create a monoclonal antibodies panel, characterize them, use them for epitope mapping, show that the M antigen was located on the cell surface of H. capsulatum yeasts, demonstrate the catalase activity of the protein and developed an immunoassay to detect antibodies against this protein and another one to detect the circulating M antigen in body fluids. We could determine the peptides that have the most antigenic activity and their localization on the molecule, and characterize according to biochemical properties. We generated three fragments containing these peptides and used to evaluate the monoclonal antibodies binding and recognition to each fragment. We could see that one fragment, the F3, showed more binding to the mAbs than the other two, but additional studies have to be done to complete the epitope mapping. To evaluate the role of the M antigen on the pathognesis of histoplasmosis, using Western blot analysis of a detergent extract of cell walls and cell membranes (CW/M) from yeast cells, we found that mAbs generated to recombinant M antigen reacted with the CW/M preparations. Immunofluorescence studies also revealed that the mAbs to the M antigen labeled the yeast cell surface. Also, we assayed the catalase activity using different cell extract fractions for the localization of the enzyme and confirmed that the major activity was present in extracts including fungal surface antigens. The ability of the M antigen to function as a catalase suggests that this enzyme is probably involved in protecting the yeast cells against the oxidative stress within the phagolisossome and escaping of the fungicidal mechanisms in the macrophages. Localization of the M antigen to the cell surface of Hc has important implications for the antigenicity of the protein since it demonstrates that it is accessible to host immune cells and for antibody interactions. Also, the ELISA for antibody detection using purified and treated histoplasmin (ptHMIN) showed a sensitivity of 92% and a specificity of 96%, while the ELISA for antigen detection showed a sensitivity of 80% and a specificity of 91%, proving that these two methodologies could be used in the diagnosis of histoplasmosis.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2013-02-21T18:56:04Z No. of bitstreams: 1 Bruno Carvalho - Dissertacao - Flebotomineos Ilha Grande.pdf: 31960935 bytes, checksum: 7d2a61ddef236c6040a511427f1344a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-21T18:56:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruno Carvalho - Dissertacao - Flebotomineos Ilha Grande.pdf: 31960935 bytes, checksum: 7d2a61ddef236c6040a511427f1344a5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Biologia, Laboratório de Vertebrados, RJ, Brasil / Evidências sugerem que a ecoepidemiologia das leishmanioses vem sendo impactada por alterações ambientais, causadas pelo homem ou por eventos naturais. Neste processo, algumas espécies de flebotomíneos, vetores das leishmanioses, já foram reportadas em ambientes modificados. A Ilha Grande apresenta casos esporádicos de Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) desde a ocorrência do primeiro surto, em 1975, bem como um caso autóctone de Leishmaniose Visceral Americana (LVA). A ilha apresenta características ambientais interessantes para estudos ecológicos que busquem entender como espécies de flebotomíneos, vivendo em condições naturais, podem se adaptar a ambientes que sofreram alterações de origem antrópica, principalmente causados pelo aumento das atividades relacionadas ao turismo. O presente trabalho pretendeu explorar aspectos ecológicos da fauna de flebotomíneos da Ilha Grande, área de Mata Atlântica pertencente ao município de Angra dos Reis, no litoral sul do estado do Rio de Janeiro. Foram realizadas capturas mensais utilizando armadilhas luminosas em três Estações de Monitoramento (EM) com diferentes características ambientais: Vila do Abraão, Enseada das Estrelas e Praia Vermelha. Após 13 meses de monitoramento, 931 flebotomíneos foram capturados, pertencentes a 17 espécies. Cinco espécies foram descritas pela primeira vez na Ilha Grande: Lutzomyia microps, L. termitophila, L. firmatoi, L. rupicola e L. ayrozai. Destacaram-se como vetores de leishmanioses: L. intermedia, L. migonei, L. flaviscutellata e L. longipalpis. A Vila do Abraão, EM com ambiente mais modificado por ações de origem antrópica, apresentou valores de riqueza e diversidade de espécies menores, quando em comparação à Enseada das Estrelas, EM cujo ambiente sofreu menos impacto. Porém, espécies de vetores foram capturadas em todas as EMs. A Praia Vermelha, mais de 30 anos após o surto de LTA, não sofreu grandes mudanças em seu ambiente, e mesmo após a ocorrência de recentes desastres naturais, continua apresentando altos valores de abundância relativa dos vetores L. intermedia e L. migonei. Dentre os vetores, foram capturadas no intradomicílio as espécies L. intermedia, L. migonei e L. longipalpis. Não foi observada correlação estatisticamente significativa entre a frequência de vetores e dados climáticos (temperatura e umidade relativa do ar). L. intermedia e L. migonei foram mais frequentes em peridomicílios com criação de animais (galinhas, cães e gatos), árvores frutíferas (principalmente bananeiras) e mata secundária. As evidências sugerem L. intermedia como principal vetor de LTA na Ilha Grande. O achado de fêmeas de L. migonei naturalmente infectadas por Leishmania (Viannia) sp. e sua presença no peridomicílio associada a galinheiros sugere sua participação na transmissão local de LTA. Após o registro do primeiro caso de Leishmaniose Tegumentar Anérgica Difusa no estado do Rio de Janeiro, a ocorrência de L. flaviscutellata na Vila do Abraão merece destaque. O registro de L. longipalpis na localidade de ocorrência do único caso humano de LVA permitiu o fechamento do caso, em aberto no Sistema de Informação de Agravos de Notificação do Ministério da Saúde desde 2005. / Evidences from previous works suggest that the ecoepidemiology of leishmaniases is highly susceptible to environmental changes, due to either human intervention or natural phenomena. Some species of phlebotomine sand flies, vectors of these diseases, have been reported on modified environments. Ilha Grande records sporadic cases of American Cutaneous Leishmaniasis (ACL) since the first outbreak, occurred in 1975, as well as one autochthonous case of American Visceral Leishmaniasis (AVL). The island has interesting environmental features that allow ecological studies to investigate how its sand fly fauna adapts to different environmental conditions, including areas impacted by tourism activities. The present work intends to study the sand fly fauna of Ilha Grande, an Atlantic Rainforest area of Angra dos Reis, south coast of Rio de Janeiro State. Monthly captures were conducted with light traps on three Monitoring Stations (MS): Vila do Abraão, Enseada das Estrelas and Praia Vermelha. After 13 months of monitoring, 931 sand flies from 17 species were collected. Five species were registered for the first time on Ilha Grande: Lutzomyia microps, L. termitophila, L. firmatoi, L. rupicola and L. ayrozai. The following vector species were found: L. intermedia, L. migonei, L. flaviscutellata and L. longipalpis. Vila do Abraão, the MS with most anthropogenic environmental changes, had lower values of species richness and diversity when compared to Enseada das Estrelas, MS with less environmental changes. Vector species were found on every MS. More than 30 years after the ACL outbreak on Praia Vermelha, the area remains without great environmental changes, and even after the occurrence of natural disasters, high values of relative abundance are still recorded for the vector species L. intermedia and L. migonei. Among the vector species, L. intermedia, L. migonei and L. longipalpis were collected inside houses. No statistically significant correlation was found between vector frequency and climatic data of temperature and relative air humidity. L. intermedia and L. migonei showed higher frequencies on peridomiciliary areas with animals (chickens, dogs and cats), fruit trees (mainly banana trees) and secondary forest. Evidences suggest L. intermedia as the main ACL vector on Ilha Grande. Considered secondary vector for ACL on Rio de Janeiro State, L. migonei was captured on sylvatic area, although the species showed evidences of association with chickens, which contributes to its approximation to the peridomicile. The same species was found naturally infected with Leishmania (Viannia) sp., which suggests its role on the local ACL transmission cycle. After the first record of Anergic Diffuse Cutaneous Leishmaniasis on Rio de Janeiro State, the occurrence of L. flaviscutellata on Vila do Abraão must be highlighted. The first encounter of L. longipalpis on Enseada das Estrelas, locality of the single recorded human case of Visceral Leishmaniasis from Ilha Grande, allowed the closure of the case that was open on SINAN (Information System of Disease Notification of the Health Ministry) since 2005.

Made available in DSpace on 2014-12-22T16:37:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 luciana_souza_ipec_mest_2011.pdf: 2545146 bytes, checksum: 15d941593f559b4406f7f190d6202c30 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2014-10-07 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O presente trabalho traça um panorama histórico das ações direcionadas à erradicação da Febre Aftosa no território brasileiro através da análise da documentação representada pelas normas, leis, recomendações e outras informações de caráter oficial. Baseiam-se também nos relatórios e outros documentos produzidos pela Organização Pan-americana da Saúde (OPAS), em especial, pelo Centro Pan-americano de Febre Aftosa (PANAFTOSA), estabelecendo correlações com a elaboração de controles de risco como subsídios para implemenrtação de políticas de Biossegurança. O estudo privilegia a reflexão sobre a eficácia dos procedimentos e proposições voltados para diminuição gradativa do número de focos da doença no país. A metodologia utilizada foi composta por pesquisa qualitativa e quantitativa da análise de documentos obtidos através do Sistema de Legislação Agrícola Federal do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento \2013 SISLEGIS \2013 e dos dados oficiais da Secretaria da Agricultura e do Abastecimento do Paraná referentes ao histórico dos números de focos de Febre Aftosa no Estado Os resultados obtidos através dessa análise evidenciaram a importância das políticas nacionais em Biossegurança para o processo de efetiva erradicação da Febre Aftosa do território brasileiro. Houve correlação do conteúdo dos documentos oficiais com os princípios de Biossegurança constituídos pela prevenção, controle, redução e eliminação de risco de introdução ou reintrodução do Aphthovirus no contexto da comercialização internacional e inter-regional de animais e de produtos de origem animal / This paper gives a historical overview of actions aimed at the eradication of Foot and Mouth Disease (FMD) in Brazil through the analysis of documents represented by rules, laws, recommendations and other official information. They are also based on reports and other documents from the Pan American Health Organization (PAHO), in particular from the Pan American Foot and Mouth Disease Center (PANAFTOSA), establishing correlations with the development of risk controls as a contribution to the implementation of Biosafety policies. The study focuses on reflection on the effectiveness of procedur es and proposals aimed at gradual reduction in the number of outbreaks in the country. The adopted methodology consisted of qualitative and quantitative research on documents which were obtained through the Federal Agricultural Legislation System from the Ministry of Agriculture, Livestock and Food - Supply – SISLEGIS - , as well as through the official data from Paraná Department of Agriculture and Food - Supply regarding the history of Foot and Mouth Disease sprouts outbreaks in the State. The achieved results from this analysis showed the importance of national policies on Biosafety for the effective process of Foot and Mouth Disease in Brazil. There was a correlation of the official documents content with Biosafety principles established by prevention, contro l, reduction and risk elimination of introduction or re - introduction of Aphtovirus in the context of international and interregional trade of animals and animal products