Cette thèse est consacrée à l'étude des objets binaires du Système solaire selon deux axes principaux. Premièrement, nous examinons les paramètres physiques, tels que la taille et l'albédo des binaires transneptuniens, obtenus à partir des mesures de flux thermique en infrarouge par les télescopes spatiaux Herschel et Spitzer. Avec ces paramètres, nous comparons les objets binaires avec les transneptuniens sans satellite. Cette analyse montre que les distributions de tailles dans les deux populations sont différentes. Nous supposons que cette tendance est liée à la prépondérance des petits binaires dans le groupe des objets \og froide \fg{}, qui est plus favorable à la survie des binaires, parmi les autre groupes.De plus, nous étudions les corrélations entre la taille et l'albédo et d'autres paramètres physiques et orbitaux pour la population des binaires. Cette étude montre les fortes corrélations suivantes: entre la taille et la masse, la taille et l'inclinaison héliocentrique, la taille et la différence de magnitudes des composantes. L'étude trouve également deux corrélations moins significatives -- la densité avec la taille et la densité avec l'albédo -- qui nécessitent des vérifications ultérieures avec des données complémentaires. Nous donnons une interprétation possible des résultats du point de vue des différents modèles de formation de tels objets.Deuxièmement, nous présentons une nouvelle méthode de détermination d'orbite mutuelle d'un système binaire. Cette méthode est basée sur la technique de Monte-Carlo par chaînes de Markov avec une approche bayésienne. L'algorithme, développé dans cette thèse, permet de déterminer où d'ajuster les paramètres d'une orbite képlérienne ou d'une orbite perturbée à partir des observations simulées et réelles. Nous montrons que la méthode peut être efficace même pour un petit nombre d'observations et sans condition initiale particulière. / This thesis is devoted to the study of binary objects in the Solar System and explores two main themes. First, we examined physical parameters, such as size and albedo of trans-Neptunian binaries, obtained from thermal flux measurements by the Herschel and Spitzer space telescopes. Within these parameters, we compared binary objects with simple trans-Neptunian objects without satellites. This analysis showed that the size distributions of two populations are different. We assume that this trend is related to the predominance of small binaries of cold classical group, which may be more favourable for the survival of binaries, among other groups.In addition, we studied the correlations between the size and albedo and other physical and orbital parameters of the binaries population. This study obtained the following strong correlation: size vs. system mass, size vs. heliocentric inclination, size vs. magnitude difference of components. We also found two less significant correlations -- bulk density vs. size and bulk density vs. albedo -- which require further verification with additional data. We then set out a possible interpretations of the results from the perspective of different formation models of such objects. Secondly, we have presented a new method of binary system mutual orbit determination. This method is based on the Monte Carlo Markov chain techniques with a Bayesian approach. The algorithm developed in this thesis is used for Keplerian or perturbed orbit fitting to simulated or real observations. We show that the method can be effective even for a small number of observations and without regard to particular initial conditions.

This thesis explores the zooarchaeology of cattle management and production at the 19th-century Hacienda El Progreso, on San Cristóbal Island, Galápagos, Ecuador. Many cattle products were exported, including salted meat, leather, and fat. In order to examine cattle commodification, comparative literature was reviewed, and the sequential steps that were undertaken to turn cattle into a product were assessed. The results were then compared to the faunal analysis of the Carpintero assemblage from Hacienda El Progreso using the chaîne opératoire framework in order to examine the possibility of interpreting the sequential production of cattle commodification from zooarchaeological specimens. Historical cattle from Hacienda El Progreso were a likely small bodied Criollo variety. While there was evidence of cattle management and production, there was limited opportunity to identify the hacienda’s operational sequence of cattle production for export as the Carpintero assemblage likely represented locally consumed animals. / Graduate

Actuellement, les polyuréthanes (PUs) sont produits industriellement par polyaddition entre un diisocyanate et un polyol. Le caractère fortement sensibilisant des isocyanates, mettent ces composés sous forte pression réglementaire au niveau européen (REACH) et ont créé le besoin d'obtenir des PUs ne provenant pas d'isocyanates, lesquels sont plus communément appelés Non-Isocyanate PolyUréthanes (NIPUs). Les travaux de cette thèse visent ainsi à établir de nouvelles voies d'accès à des NIPUs. Des pré-polymères téléchéliques ont été synthétisés via la réaction de métathèse. Plusieurs groupements terminaux (jusqu'à 16), réagissant à température ambiante avec une amine primaire, ont été greffés avec succès à ces pré-polymères. La réaction avec plusieurs diamines a conduit à la synthèse de nouveaux matériaux NIPUs entièrement caractérisés. Les stratégies de synthèses développées au cours de ces travaux de thèse ouvrent de nouvelles perspectives quant à l'industrialisation de NIPUs. / Conventional polyurethanes (PUs) involve the use of isocyanates, which are considerably toxic and require phosgene for their manufacture. To tackle environmental issues, it is necessary to elaborate different routes to PUs. In this context, two isocyanate-free strategies towards the preparation of polythiourethanes (PTUs), i.e. non-isocyanate polyurethanes (NIPUs), have being developed. The first way involves the synthesis of α,ω-di(dithiocyclocarbonate) telechelic poly(propylene glycol) (bis(5DTCC)-PPG), poly(tetrahydrofurane diglycidyl ether) (bis(5DTCC)-PTG), upon chemical modification of the corresponding α,ω-diepoxide telechelic polymers (PPG, PTG, respectively) through cycloaddition of carbon disulfide. The second approach involves the ring-opening metathesis polymerization (ROMP), using Grubbs’ 2nd generation ruthenium catalyst, of cycloolefins using 16 differents chain-transfer agents. Bis(5DTCC) telechelic copolyolefins are thus synthesized. Reaction of the end-capping 5DTCC moieties with a diamine by ring-opening polyaddition ultimately affords at room temperature the corresponding NIPTU.

Pour développer des biomarqueurs permettant d'estimer l'état de santé des animaux et de prévoir les effets des contaminants sur les niveaux d'organisation biologique supérieurs, le métabolisme énergétique apparaît comme un candidat de choix. En effet, il participe à la mise en place de grandes fonctions comme par exemple la reproduction ou la croissance. L'altération des processus d'allocation énergétique par la contamination peut avoir des conséquences sur le devenir des individus et de leurs populations. L'objectif de ce travail est d'analyser en laboratoire les impacts potentiels de xénobiotiques (cuivre et éthofumésate) sur le métabolisme énergétique d'un cyprinidé, le gardon Rutilus rutilus, à travers l'étude des processus participant à la formation d'énergie cellulaire(ATP). L'effet des xénobiotiques sur l'état de santé général des juvéniles de gardons a d'abord été appréhendé, et peu d'impacts ont pu être observés sur les indices généraux mesurés. L'effet des contaminants sur la formation aérobie et anaérobie de l'énergie (glycolyse, ses substrats et produits) a ensuite été évalué. Si des différences d'effet des deux contaminants ont été observées au niveau moléculaire, ils ont tous deux induit une augmentation du métabolisme anaérobie au niveau biochimique. Enfin, l'impact des contaminants sur les fonctions mitochondriales a été appréhendé.Des atteintes ont été observées au niveau de la chaîne respiratoire et des ultra-structures des mitochondries, impliquant un effet sur l'énergie cellulaire disponible. Ce travail constitue la base du développement de nouveaux marqueurs précoces de troubles physiologiques des organismes utilisables en biosurveillance. / The energy metabolism constitutes an appropriate approach for the development of biomarkers allowing to estimate the health status of animals and to predict the effects of contaminants on higher levels of biological organization. Indeed, it participates in the establishment of key functions such as reproduction or growth. Alterations of energy allocation process by the contamination can affect the fate of individuals and populations. The aim of this study was to determine in laboratory the potentials effects of chemicals (copper and ethofumaste) on energy metabolism of a cyprinid species, the roach Rutilus rutilus, through the study of processes involved in the synthesis of cellular energy (ATP). The effect of chemicals was first performed on general health status of juvenile roach, and few impacts were found on general indexes measured. Secondly, the study of aerobic and anaerobic energy production (glycolysis, substrates and products) was performed. Significant differences were observed at the molecular regulation level, depending on chemicals. However, at the biochemical level, an increase in anaerobic metabolism was observed with both contaminants. Finally, the effects of contaminants on mitochondrial functions were assessed. Mitochondrial alterations were observed either in the respiratory chain and in the ultra-structure of mitochondria;these results involved an effect on the availability of cellular energy. This work constitutes the basis for the development of new early markers of physiological disorders in organisms used in biomonitoring studies.

Un dysfonctionnement mitochondrial est impliqué dans plusieurs maladies neurodégénératives, corrélé avec une augmentation des niveaux de stress oxydant. Les anomalies mitochondriales observées dans les tissus des patients, les modèles animaux et cellulaires des maladies de Huntington et de Parkinson, suggèrent l'implication de la mitochondrie dans leur pathogénie.Les deux projets discutés dans ce manuscrit se focalisent sur le rôle des aspects particuliers de la physiologie mitochondriale au cours des deux maladies. / Mitochondrial dysfunction has been implicated in several neurodegenerative diseases and is correlated with augmented levels of intracellular oxydant stress. The mitochondrial defects observed in tissues from patients, as well as in animal and cellular models of Huntington’s and Parkinson’s diseases, suggest the implication of mitochondria in the pathogenesis of these diseases. The two projects discussed in this manuscript focus on the role of particular aspects of mitochondrial physiology in these diseases. By the first project we show the role of defective mitochondrial respiratory chain compex II in several rodent models of Huntington’s disease. By using a lentivirus-based gene transfert strategy we highlight the neuroprotective potential of the striatal overexpression of the subunits of complex II. The second project focus on Parkin and PINK1, two proteins implicated in the autosomal recessive, hereditary forms of Parkinson’s disease and in mitochondrial quality control mechanisms, such as mitophagy. In a cellular model we show that the two proteins facilitate Drp1-dependent mitochondrial fission. We show that Parkin may facilitate the signaling pathways controlling the activity of the pro-fission protein Drp1. This effect is probably indirect and mostly PINK1-independent. On the contrary, in mitochondrial depolarization conditions, by FRET (Förster Resonance Energy Transfer) a direct spatial coordination of Parkin, PINK1 and Drp1 is observed, which seems to be determinant for the efficiency of mitophagy. My projects shed new light on pathogenic mechanisms and open new perspectives in the research on these diseases.

La chaîne du Rif (Nord du Maroc) constitue, avec les Cordillères des Bétiques (Sud de l’Espagne), la terminaison occidentale de la ceinture alpine. C’est un secteur clé pour la compréhension des mouvements verticaux associés aux processus orogéniques. Jusqu’à présent, aucune étude n’a permis de contraindre les mouvements verticaux postérieurs au Miocène inférieur, malgré la présence de dépôts marins pliocènes surélevés. L’objectif de ce travail est d’apporter des arguments permettant de discuter des mécanismes géochronologiques et cinématiques impliqués dans les mouvements verticaux de la marge du Rif depuis le Néogène. Une comparaison des déplacements identifiés dans les zones internes, a pu être effectuée, avec ceux estimés dans le domaine des flyschs (Sud de l’accident de Jebha), grâce aux données AHe. Les corrélations entre mouvements verticaux et évolution du champ de déformation mettent en évidence le lien existant entre les périodes de mouvements verticaux majeurs et les phases d’extension radiale. 1-Les derniers stades d’exhumation des unités métamorphiques, depuis près de 12-10 km de profondeur, résultent d’un stade d’extension radiale affectant ces formations. Le domaine de collapse s’étend depuis le faciès Schiste Vert jusqu’au domaine fragile durant l’Aquitano-Burdigalien. Les mouvements extensifs sont limités aux parties superficielles de l’orogène tandis que les parties plus profondes et situées en avant-chaîne sont en compression. 2-Une période de surrection lente associée à de l’extension radiale, affecte l’intégralité des zones internes, au moins depuis le Pliocène inférieur. La zone des flyschs se surélève à plus grande vitesse. / The Rif chain (Northern Morocco) belongs, with the Betic Cordillera (Southern Spain), to the westernmost part of the Alpine belt. This sector is one of the main targets for the comprehension of vertical movements linked to orogenic processes. Despite the numerous investigations lead on the Pliocene uplifted deposits in the Rif Chain, the timing and amplitude of the vertical motions subsequent to the period of cooling have never been constrained. This work aims to discuss the geodynamical processes involved in the vertical motion of the Rif margin since the Neogene. A comparison between the vertical movements determined in the internal zones and estimated in the flyschs domain (South of Jebha fault), has been realized on the basis of AHe data. Correlations reported between the vertical movements and the evolution of the stress field highlighted the linkage between the main stages of vertical motion and extension period with a radial pattern. 1-The latest exhumation stages of the deep-seated metamorphic rocks, from 12-10 km of depth, were triggered by the radial extension of these units. The collapse extended from the low grade metamorphism (Greenschists facies) to the brittle strata during the Aquitano-Burdigalian times. This extension is expressed in the superficial units, whereas deepest parts and sectors at the front of the Rif chain underwent a compression. 2-A second uplift stage proceeds at a very slow raising pace and is associated to radial extension in throughout the internal zones since the Lower Pliocene. Le flyschs sector was uplifted faster since the Late Miocene.

Les travaux présentés dans ce mémoire traitent de la conception des chaînes éditoriales Numériques XML : des logiciels de production documentaire qui outillent la rédaction de et l'assemblage de ces fragments pour former des documents. fragments La publication des documents s'opère par transformation de fragments XML en documents numériques aux formats standards. La composition des fragments permet d'instrumenter la rééditorialisation documentaire soit l'usage de contenus existants dans la rédaction de documents originaux. La production de documents rééditorialisés implique une modification de la représentation logique des documents de la forme classique d'arbre à celle de graphe de fragments liés entre eux. Ces travaux s'intéressent aux limites rencontrées lorsque la complexité du graphe devient un frein à la production de documents cohérents.Nous avons élaboré une théorie pour la conception des chaînes éditoriales qui s'appuie sur deux approches complémentaires s'articulant autour de la figure de l'atelier - soit l'environnement d'écriture des fragments - pour accompagner les rédacteurs dans l'édition de graphes complexes.La première approche est une articulation interne à l'atelier. Nous proposons de modéliser des fragments pragmatiques dont l'enjeu est d'assister les rédacteurs dans la gestion des fragments tout en enregistrant l'activité sur le graphe. Ces fragments participent à la documentarisation de l'activité puisqu'ils produisent et mettent à jour une documentation des actions opérées sur le graphe.La seconde approche est une articulation externe à l'atelier. Nous proposons de structure rle graphe documentaire dans plusieurs ateliers en fonction des projets éditoriaux (projets de documents à publier) et auctoriaux (projets d'organisation de la production). L'enjeu est d'éclater le graphe dans plusieurs ateliers afin d'en simplifier la perception et donc la manipulation.Nous avons participé aux développements de la suite Scenari afin d'expérimenter notre approche théorique. Les modèles de fragments pragmatiques de la tâche, du fragment commenté, et les responsabilités et cycles de vie sur les fragments ont été développés afin de documentariser l'activité. Les ateliers calques et fragments proxys ont été conçus afin de structurer le graphe. Nos expérimentations nous ont permis de synthétiser une méthodologie pour la conception de chaînes éditoriales exploitant des graphes complexes. Nos travaux se concluent sur une réflexion épistémologique sur la recherche technologique et plus particulièrement sur ses modalités de validité. / This thesis deals with the design of digital XML publishing chains : document production software which allows writing fragments and composing them in order to publish documents. Document publication is computed by transforming XML fragments into digital documents in standard formats. The composition of the fragments allows the repurposing of existing contents into new documents.The writing of repurposed documents involves a change in the logical representation ofdocuments from the classical form of the tree to a graph of linked fragments. This work is dedicated to the limitations encountered when the complexity of the graph becomes an obstacleto the writing of consistent documents.We developed a theory for the design of publishing chains which is based on two complementary approaches around the concept of the writing workspace - the space where the authors write the fragments - to assist writers in the editing of complex graphs.The first approach is internal to the workspace. We propose to model pragmatic fragments intended to assist authors in fragment management while recording graph activity.These fragments are involved in the activity documentarisation since they produce and maintaina documentation of the actions performed on the graph.The second approach is external to the workspace. We propose to structure the graph asseveral workspaces based on publishing and authorial projects. The challenge is to distribute the graph over several workspaces in order to simplify their perception and handling.We participated in the development of Scenari in order to experiment our theoretical approach. The pragmatic fragment models of the task, of the commented fragment, and of there sponsibilities and life cycles on fragments were developed to document the activity. The layerworkspaces and proxy fragments were designed to structure the graph. Our experiments allowed us to summarize a methodology for designing publishing chains which handle complex graphs. Our work is concluded with an epistemological approach in order to qualify and evaluate this technological research.

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Dans cette thèse nous essayons de comprendre pourquoi le Principe de Maximisation de Production d'Entropie (MEP) donne de très bons résultats dans de nombreux domaines de la physique hors équilibre et notamment en climatologie. Pour ce faire nous étudions ce principe sur des systèmes jouets de la physique statistique qui reproduisent les comportements des modèles climatiques. Nous avons notamment travaillé sur l'Asymmetric Simple Exclusion Process (ASEP) et le Zero Range Process (ZRP). Ceci nous a permis tout d'abord de relier MEP à un autre principe qui est le principe de maximisation d'entropie de Kolmogorov-Sinai (MKS). De plus, l'application de MEP à ces systèmes jouets donne des résultats physiquement cohérents. Nous avons ensuite voulu étendre le lien entre MEP et MKS dans des systèmes plus compliqués avant de montrer que, pour les chaines de Markov, maximiser l'entropie de KS revenait à minimiser le temps que le système prend pour atteindre son état stationnaire (mixing time). En fin nous avons appliqué MEP à la convection atmosphérique. / In this thesis we try to understand why the maximum entropy production principlegives really good results in a wide range of Physics fields and notably in climatology. Thus we study this principle on classical toy models which mimic the behaviour of climat models. In particular we worked on the Asymmetric Simple Exclusion Process(ASEP) and on the Zero Range Process (ZRP). This enabled us first to connect MEP to an other principle which is the maximum Kolmogorov-Sinaï entropy principle (MKS). Moreover the application of MEP on these systems gives results that are physically coherent. We then wanted to extend this link between MEP and MKS in more complicated systems, before showing that, for Markov Chains, maximise the KS entropy is the same as minimise the time the system takes to reach its stationnary state (mixing time). Thus, we applied MEP to the atmospheric convection.

Le dendroctone des pins du sud ou « Southern Pine Beetle » (Dendroctonus frontalis) est un coléoptère xylophage nuisible et ravageur des forêts d’Amérique du Nord qui a déjà causé plus de 900 millions de dollars de dégâts entre 1960 et 1990 et dont son surdéveloppement est de plus accéléré par le réchauffement climatique. Cet insecte vit en symbiose avec le champignon Entomocorticium sp. qui lui permet d’assimiler la lignine contenue dans le bois. Une particularité supplémentaire de ces dendroctones a été la découverte récente d’un deuxième symbiote d’origine bactérienne (Streptomyces sp. SPB74) qui a un rôle de protecteur chimique face aux antagonistes fongiques du dendroctone. La principale substance protectrice produite par ce symbiote est la mycangimycine, un acide gras polyènique contenant un cycle 1,2-dioxolane 3,5-disubstitué. Ce composé affecte peu le champignon vital du dendroctone mais a montré des activités antifongiques exceptionnelles, égales ou supérieures à l’amphotéricine B sur des champignons pathogènes de souche résistante ou non ainsi qu’une excellente activité anti-malarique sur Plasmodium falciparum.Dans ce manuscrit, nous avons rapporté quelques tentatives vers la synthèse de la mycangimycine, en particulier la formation du motif 1,2-dioxolane 3,5-disubstitué qui pourrait contribuer de manière prometteuse à de nombreuses activités biologiques comme antipaludique et antifongique, etc. Le premier travail a porté sur la synthèse du 1,2-dioxolane en utilisant des cyclopropanols comme intermédiaires, par un processus d'ouverture de cycle par oxydation. À la suite de cela, certains analogues saturés de la mycangimycine ont été préparés avec un rendement relativement élevé. Dans la deuxième partie de ce manuscrit, nous avons développé une méthodologie de synthèse sur l'addition nucléophile sur des peroxyketal cycliques via la formation d’un ion peroxycarbenium par l’action d’un acide Lewis. Différents analogues synthétiques et intermédiaires de synthèse ont été évalués in vitro dans les domaines antiparasitaires. / The southern pine beetle (Dendroctonus frontalis) ecosystem has been strongly studied because of the economic losses of conifer production in North America. From these researches, it has emerged that this pine beetle possesses a very complex natural associations with trees, fungi, mites. Recently some reports indicated that a bacterian symbiont (Streptomyces sp. SPB74) produces an unprecedent polyene peroxide, named mycangimycin, which plays a role of antifungal and antiparasitic. This molecule is a polyenic fatty acid containing a 3,5-disubstituted 1,2-dioxolane ring which exhibits exceptional antifungal activity against a wide variety of fungi and activities as antimalarial agent against Plasmodium falciparum.In this manuscript, we reported some attempts towards the synthesis of mycangimycin, especially for the formation of 3,5-disubstituted-1,2-dioxolane moiety which could contribute promisingly to many biological activities as antimalarial and antifungal. The first work focused on the synthesis of the 3,5-disubsituted-1,2-dioxolane ring using cyclopropanols as intermediates, through an oxidative ring opening process. As a result of that, some saturated analogues of mycangimycin were prepared in relatively high yield. In the second part of this manuscript, we have developed an available methodology of nucleophile addition to the peroxycarbenium ions derived from Lewis acid-mediated ionization of 3-alkoxy-1,2-dioxolanes providing 3,5-disubstituted-1,2-dioxolane compounds. Various synthetic analogues or intermediates have been evaluated in in vitro in antiparasitic domains.