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Understanding the dynamics of rhythmic gene expression in mammalian cells

Unruh, Benjamin Alex 16 June 2023 (has links)
In mammals, circadian rhythms are driven by a cell-autonomous core-clock mechanism consisting of over a dozen core-clock genes forming transcription-translation feedback loops. The core-clock mechanism also drives the rhythmic expression of downstream genes called clock-controlled genes, which are thought to be important for driving rhythmic biochemical and physiological processes. Mathematical models predict that for a gene to be rhythmically expressed, synthesis, degradation, or a combination of the two must be rhythmic. The purpose of this project was to investigate the contribution of synthesis and degradation of RNA to rhythmic gene expression. To systematically understand the contribution of synthesis, degradation, and other RNA dynamics to rhythmic gene expression, I used metabolic labeling and a novel computational pipeline to analyze transcriptomic data in synchronized NIH3T3 cells. I identified 685 rhythmically expressed RNAs with a period of 24-hour in my dataset, of those 389 were rhythmically synthesized and 24 were rhythmically degraded. Low amplitude degradation rhythms were detected more broadly in the 685 rhythmically expressed RNAs, but these were not statistically significant. Although synthesis was the primary driver of rhythmic 24-hour RNA expression, core-clock gene RNAs were regulated by both synthesis and degradation, presumably to sustain high amplitude of rhythmic expression. I also identified rhythmic RNA expression with a period of 12 and 8 hours; interestingly, degradation primarily drove rhythmic expression of these RNAs. Overall this dissertation revealed RNA dynamics that drive rhythmic gene expression. This will provide insights into how diverse circadian clock mechanisms ultimately drive tissue-specific rhythmic gene expression. / Doctor of Philosophy / Almost all organisms on Earth have an internal timekeeping system, called a circadian clock, that enables them to anticipate and respond to the day/night cycle. The circadian clock regulates diverse body processes such as the sleep/wake cycle, eating and digestion, body temperature, and blood pressure. Disruptions to the circadian clock are detrimental to health and wellbeing. Many organisms, including humans, have a core circadian clock mechanism that drives rhythmic gene expression in thousands of genes that are thought to be ultimately responsible for rhythmic biological and physiological processes. My project investigates how the core clock mechanism drives rhythmic gene expression. I found that rhythmic synthesis of RNA was a primary driver of rhythmic gene expression, but the genes involved in the core circadian clock mechanism itself was regulated by multiple rhythmic processes. Understanding rhythmic gene expression control points is integral for understanding how circadian gene expression can be changed or interrupted.
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Tempos escolares: os horários escolares e o cotidiano docente / School times: school hours and daily teacher

Silva, Robson Ferreira da 15 February 2019 (has links)
INTRODUÇÃO Este é um estudo sobre os horários escolares e sua relação com o cotidiano dos professores e os possíveis impactos que a homogeneização de horários e a realização das atividades podem exercer sobre seus ritmos biológicos. Os horários escolares podem afetar as rotinas diárias dos professores, induzindo a dessincronização dos ritmos biológicos e consequentes problemas de saúde. Entre esses problemas, as alterações no ciclo vigília/sono são as mais conhecidas. HIPÓTESE Esses conflitos podem levá-los a privações de sono e uma dessincronização de seus ritmos biológicos, obrigando-os a uma espécie de enquadramento dentro do sistema imposto, mas com riscos à sua saúde. OBJETIVO Avaliar a adaptação dos professores aos horários escolares, associando suas preferências de tolerância à maturidade ao grau de satisfação com suas condições de trabalho. MÉTODOS Foram estudados 25 professores (4 homens e 21 mulheres) com idades entre 28 e 49 anos, que trabalham em duas escolas públicas da região metropolitana de São Paulo. Foram aplicados os seguintes instrumentos: diário de atividades diárias (23 dias consecutivos), Escala de Sonolência de Karolinska (dois pontos, início da tarde e início da noite), preferências de matutinidade-vespertinidade com questionário de Horne e Östberg, Questionário Satisfação no Trabalho e entrevistas com grupos focais. RESULTADOS: A análise dos dados da Escala de Karolinska mostrou que nos finais de semana houve uma variação da sonolência ao longo do dia [F(3,66) = 5,1; p < 0,01]. As comparações mostraram que a sonolência média dos professores avaliada às 13:33 ± 1,4 horas (KSS=4,2 ±1,95) e às 17:40 ± 1,25 horas (KSS=4,6±1,32) foi menor em relação às 21:35 ± 1,14 horas (KSS=5,9 ± 2). Nos dias de semana não foi observada nenhuma diferença [F(3,66) - 2,01; p>0,05]. Com os resultados do Questionário OSI, podemos perceber que o índice de insatisfação foi mais acentuado nos quesitos remuneração, participação nas decisões e quantidade de tarefas; e o de satisfação, os mais significativos foram relacionamento e conteúdo. Ficaram evidenciados ainda, má qualidade do sono nos professores caracterizados como vespertinos, devido ao horário de trabalho em relação com os matutinos. Ficou relatada alimentação inadequada devido aos deslocamentos e horários irregulares de trabalho, além da dificuldade em ajustar os horários de trabalho com suas relações sociais. CONCLUSÃO Os horários escolares influenciam na organização temporal dos professores, afetando seu sono, saúde e qualidade de vida / INTRODUCTION This is a study about the school schedules and their relationship with teachers\' daily life and the possible impacts that the homogenization of schedules and the accomplishment of activities can influence their biological rhythms. School schedules may affect daily routines of teachers, inducing desynchronization of biological rhythms and consequent health problems. Among these problems, changes in the sleep/wake cycle are the best known. HYPOTHESIS These conflicts can lead to sleep deprivation and a desynchronization of their biological rhythms, forcing an adaptation to the work schedule in turn may compromise their heal condition. OBJECTIVE Evaluate adaptation of teachers to school schedules linking their morningness-eveningness preferences to degree of satisfaction with their work conditions. METHODS We studied 25 teachers (4 males and 21 females) aged 28-49 years old, working at two public school in the metropolitan area of São Paulo. The following instruments were applied : daily activities diary (23 consecutive days), Karolinska Sleepiness Scale (at two ponts, early afternoon and early evening), Morningness-eveningness preferences with the Horne and Östbergs questionnaire, Satisfaction at work questionnaire and focal group interviews. RESULTS Data analysis of the Karolinska Scale showed that at weekends there was a variation of sleepiness throughout the day [F (3.66) = 5.1; p <0.01]. The Comparisons showed that the mean teacher drowsiness assessed at 13:33 ± 1,4 hours (KSS = 4,2 ± 1,95) and at 17:40 ± 1.25 hours (KSS = 4,6 ± 1,32 ) was lower in relation to 21:35 ± 1,14 hours (KSS = 5,9 ± 2). On weekdays no difference was observed [F (3,66) = 2,01; p> 0,05]. The OSI Questionnaire showed that the dissatisfaction was more pronounced in terms of remuneration, participation in decisions and quantity of tasks; and satisfaction, the most significant were relationship, content, poor quality of sleep was still evident in the teachers characterized as evening because of the morning work schedule in relation to the morning ones. Evening oriented teachers show worse sleep quality than their morning-oriented colleagues. Inadequate feeding routines linked to irregular working schedules as well as compromised social relations have been found in our sample. CONCLUSION: School schedules influence temporal organization of teachers affecting their sleep, health and quality of life
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Ciclo vigília/sono em portadores de diabetes mellitus tipo 1. / Sleep/wake cycle in individuals with type 1 diabetes mellitus.

Barone, Mark Thomaz Ugliara 18 August 2011 (has links)
O objetivo do presente estudo foi avaliar possíveis relações entre o diabetes mellitus tipo 1 (DM1) e controle glicêmico, e o ciclo vigília/sono. Participaram 18 voluntários com DM1 (idade: 26,3±5,1), sem complicações, não obesos, sem alterações no sono; e 9 no grupo controle (idade: 28,8±5,3). Os dados foram coletados através de: diário de sono e de glicemia, actímetria (Tempatilumi), polissonografia, 6-sulfatoximelatonina, questionário de Epworth, e sensor de glicose durante a polissonografia nos DM1. A associação entre controle glicêmico e o ciclo vigília/sono foi evidenciada. A duração inadequada, a baixa qualidade, a fragmentação do sono e a secreção reduzida de melatonina, possivelmente, favoreceram um pior controle glicêmico em DM1. Por outro lado, indivíduos DM1, com melhor controle glicêmico, podem se beneficiar de maior secreção de melatonina noturna e menor fragmentação e latência do sono. O controle mais adequado, potencialmente, regulariza o ciclo vigília/sono e previne ou retarda o desenvolvimento de complicações crônicas. / The aim of the present study was to evaluate the association of type 1 diabetes mellitus (T1DM) and glycemic control with the sleep/wake cycle. Eighteen T1DM volunteers and 9 control subjects, non-obese, without chronic complications, and no sleep disorders participated. Data were collected with sleep and glycemia log, actigraphy (Tempatilumi), polysomnography, 6-sulphatoxymelatonin, Epworth questionnaire, and glucose sensor during the polysomnography night for T1DM. The association between glycemic control and sleep/wake cycle was observed. The inadequate duration, poor quality, and fragmented sleep besides the reduced melatonin secretion possibly favored a worse glycemic control in T1DM. On the other hand, we understand that T1DM individuals with better glycemic control may benefit from increased melatonin secretion and less sleep fragmentation and latency. Therefore, a better glycemic control potentially regulates the sleep/wake cycle and prevents or delays the development of chronic complications.
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Ecologia populacional e comportamento de peixes subterrâneos, Rhamdia sp. n. e Ancistrus sp. n., da área cárstica da Serra da Bodoquena, Mato Grosso do Sul (Siluriformes: Heptapteridae, Loricariidae) / Population ecology and behaviour of subterranean fishes, Rhamdia sp. n. e Ancistrus sp. n. from Serra da Bodoquena karstic area, Mato Grosso do Sul (Siluriformes: Heptapteridae, Loricariidae)

Borghezan, Rodrigo 12 March 2013 (has links)
O presente projeto estudou aspectos da ecologia populacional de duas novas espécies troglomórficas de Siluriformes dos gêneros Rhamdia e Ancistrus, sintópicas em um riacho subterrâneo da área cárstica da Serra da Bodoquena, Mato Grosso do Sul. Foram investigados os tamanhos e as densidades populacionais com base em censo visual e marcação e recaptura, as taxas de sobrevivência, a taxa de crescimento individual, a frequência de comprimento-padrão, de peso e de fator de condição, e os deslocamentos. Adicionalmente, foi estudado o comportamento de Rhamdia sp. n., com foco na ritmicidade locomotora e na reação à luz. Foram realizados seis eventos de coleta entre 2010 e 2011 para tomada de dados populacionais, além de prospecções por novas localidades com ocorrência dessas espécies. O tamanho populacional estimado para Rhamdia sp. n. foi de 391 indivíduos na Gruta das Fadas e 104, na Gruta Cinco de Ouros. Com base nos resultados de densidade, a população de Ancistrus parece ser menor do que a de Rhamdia sp. n., com tamanho populacional na ordem de 100 indivíduos. A densidade populacional média estimada através do censo visual para Rhamdia sp. n. foi de 0,09 ind/ m² na Gruta das Fadas e 0,1 ind./ m² na Gruta Cinco de Ouros, valores inferiores ao calculado com base nos resultados de marcação e recaptura, 0,76 ind./ m² e 1,48 ind./m², respectivamente. Em Ancistrus sp. n., a densidade populacional média foi de 0,018 ind/ m². Foi observado que Rhamdia sp. n. se concentra mais em poções, enquanto que Ancistrus sp. n., em corredeira. A pequena variação ao longo do ano nas densidades, no peso, e no fator de condição de ambas as espécies na Gruta das Fadas, indica maior estabilidade ambiental nessa caverna em comparação com a Gruta Cinco de Ouros. Em Rhamdia sp. n., indivíduos sem olhos externamente visíveis (anoftálmicos) apresentaram maior taxa de sobrevivência quando comparados com aqueles com olhos assimétricos ou dois olhos normais. O crescimento individual de Rhamdia sp. n. foi heterogêneo, sem relação com o tamanho do indivíduos e apresentou, pelo modelo de von Bertalanffy, comprimento máximo médio de 170 mm CP e constante de crescimento (K) de 0,241 A longevidade máxima média foi de aproximadamente 15 anos. Com a maior parte das recapturas ocorridas no mesmo setor da captura anterior, indivíduos de Rhamdia sp. n. apresentam filopatria, enquanto que Ancistrus sp. n. se deslocou mais, com somente um registro de recaptura no mesmo setor da captura anterior. Quanto ao comportamento de Rhamdia sp n., os exemplares apresentaram ritmicidade circadiana significante, com diferenças intra-específicas nos valores de potência espectral. No estudo de reação à luz, observou-se variação intra-específica no grau de fotofobia relacionado com a morfologia dos olhos. Prospecções realizadas em 24 cavernas do Assentamento Campina revelam que Rhamdia sp. n. ocorre até o momento somente nas cavernas Fadas, Cinco de Ouros, Manoel Cardoso e Dona Benedita, enquanto que ncistrus sp. n. somente na Gruta das Fadas. O mosaico de variações morfológicas observado em Rhamdia sp. n. e em Ancistrus sp. n., a forte ritmicidade circadiana da atividade locomotora e o elevado grau de fotofobia observado em Rhamdia sp. n., sugere que estas espécies estão em estágio inicial de fixação de caracteres troglomórficos, indicando um isolamento recente no hábitat subterrâneo / This project studied aspects of the population ecology of two troglomorphic Siluriformes of genera Rhamdia and Ancistrus, which are syntopics in a subterranean stream of Serra da Bodoquena karst area, Mato Grosso do Sul. The research comprised the investigation of the population sizes and densities, survival rates, individual growth rate, frequency of standard length, weight and condition factor, and displacements. Adicionally, the behavior of Rhamdia sp. n. was investigated with focus on locomotor rhythmicity and reaction to light. Six collections were made between 2010 and 2011 to gather population data, based on visual census and mark-recapture, as well as search for other localities to investigate the distribution range of these species. The population size estimated to Rhamdia sp. n. was 391 individuals in Fadas Cave and 104 individuals in the Cinco de Ouros Cave. The population densities of Ancistrus sp. n. suggests a lower population size compared to Rhamdia sp. n., possibly with less than 100 individuals in the studied area. The average population density estimated through visual census to Rhamdia sp. n. was 0.09 ind / m² in the Fadas Cave and 0.1 ind. / m² in the Cinco de Ouros Cave, lower than the results estimated by mark-recapture, 0. 76 ind. / m² and 1.48 ind. / m², for each cave, respectively. To Ancistrus sp. n., the average population density was 0.018 ind / m². The low variability throughout the year in population densities, weight, and in condition factor for both species in Fadas Cave, indicate and higher environmental stability in this cave compared to Cinco de Ouros Cave. In Rhamdia sp. n., individuals without externally visible eyes (anophthalmics) showed higher survival rate compared to those with asymmetric or two normal eyes. The individual growth of Rhamdia sp. n. was heterogeneous with no relation to individuals\' size and through the von Bertalanffy model estimate the maximum length (L &infin;) of 170 mm and growth constant (K) of 0.241. The median maximum longevity was 15 years. With little movement between sectors, individuals of Rhamdia sp. n. exhibited philopatry, while Ancistrus sp. n. moved around, with only one individual recaptured in the same cave sector. In relation do behavior Rhamdia sp n. showed significant circadian rhythmicity, with intra-specific differences in the spectral power values. In the study of light reduction, the intra-specific variation was observed in the degree of photophobia related to eyes morphology. Surveys conducted in 24 caves in the Campina settlement revealed that Rhamdia sp. n. occurs in the Fadas, Cinco de Ouros, Manoel Cardoso and Dona Benedita caves, while Ancistrus sp. n. occurs only in the Fadas Cave. The mosaic of morphological variations observed in Rhamdia sp. n. and Ancistrus sp. n., the strong circadian locomotor activity and the high degree of photophobia observed in Rhamdia sp. n. suggests that these species are in early stages of setting troglomorphic characters, indicating a recent isolation in subterranean environment
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Avaliação da influência do turno escolar e dos componentes circadianos do sono no comportamento de crianças e adolescentes

Carissimi, Alicia January 2016 (has links)
Objetivo: Avaliar a relação do turno escolar e o ritmo circadiano de crianças e adolescentes sob a expressão de sintomas comportamentais e de níveis de cortisol e melatonina. Métodos: Estudo transversal envolvendo 639 estudantes do ensino fundamental e médio (idade média de 13,03 anos, variando de 8–18; 58,5% meninas) recrutados em cidades localizadas na região do Vale do Taquari, Rio Grande do Sul, Brasil. Na segunda fase, 80 participantes foram selecionados aleatoriamente para coleta de saliva para análise de melatonina e cortisol. Os parâmetros circadianos do sono foram acessados pelo auto-relato de duração do sono nos dias de semana e fins de semana, diferenças no horário de acordar e dormir, déficit de sono, ponto médio do sono nos dias de semana e fins de semana, jetlag social e pela versão em português do Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) para avaliação do cronotipo. Os desfechos, níveis de melatonina e cortisol salivares, foram medidos através de amostras de saliva pela manhã, tarde e noite, e problemas de comportamento (sintomas psiquiátricos), foram avaliados usando a Lista de verificação comportamental para crianças e adolescentes (em inglês, Child Behavior Checklist, CBCL). O estudo foi realizado de acordo com as diretrizes éticas internacionais (número de aprovação no comitê de ética: 12-0386 GPPG/HCPA). Resultados: No primeiro artigo, estudantes do turno da manhã eram significativamente mais velhos, apresentavam maior diferença entre os horários de acordar e dormir, maior déficit de sono e jetlag social. O déficit de sono apresentado por meninas foi maior do que o observado em meninos da mesma idade. regressão multivariada, utilizando o método passo-a-passo, identificou jetlag social, diferença nos horários de acordar nos dias de semana e fins de semana e ponto médio nos fins de semana como preditores significativos de déficit de sono. O segundo artigo demonstrou que o turno escolar influenciou a secreção de melatonina, a qual se correlacionou com os parâmetros do sono circadianos, diferentemente para o grupo não-clínico e clínico. Os níveis de melatonina foram positivamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da manhã, e negativamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da tarde. No terceiro artigo, identificou-se idade, horário de início da escola, ponto médio de sono e duração do sono nos dias de semana como preditores de sintomas psiquiátricos, avaliados pelo CBCL. Os estudantes do turno da manhã, classificados como cronotipo do tipo vespertino, apresentaram menor duração do sono durante a semana e maior jetlag social do que estudantes do tipo matutino. Além disso, os alunos do turno da manhã com sintomas psiquiátricos apresentaram menor duração do sono e padrão circadiano de sono mais cedo. Conclusões: Os achados do presente estudo mostram que o turno escolar influencia os parâmetros circadianos de sono, fatores fisiológicos e sintomas psiquiátricos em crianças e adolescentes. Nossos resultados reforçam a importância de redirecionar crianças e adolescentes para um turno escolar que contemple as preferências individuais de sono, prevenindo as consequências negativas à saúde, tanto no sono quanto em sintomas psiquiátricos. / Objective: To evaluate the relationship of the school schedules and the circadian rhythm of children and adolescents under the expression of behavioral symptoms and cortisol and melatonin levels. Methods: This cross-sectional study involved 639 elementary and high school students (mean age 13.03 years, range 8–18, 58.5% female) recruited from the cities located in the Vale do Taquari region, Rio Grande do Sul, Brazil. In the second phase, 80 participants were randomly selected for saliva collection to analyze melatonin and cortisol. Circadian sleep parameters were assessed by self-reported sleep duration on weekdays and weekends, bedtime and wake time differences, sleep deficit, midpoint of sleep on weekdays and weekends, social jetlag, and the Portuguese version of Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) for assessment of chronotype. The outcomes, salivary melatonin and cortisol levels, were measured in morning, afternoon, and night saliva samples, and behavior problems (psychiatric symptoms) were assessed using the Child Behavior Checklist (CBCL). This study was performed according to international ethical guidelines (ethics committee approval number: 12–0386 GPPG/HCPA). Results: In the first article, the morning-school-time students presented significantly higher age, bedtime and wake up differences, sleep deficits, and social jetlag. The sleep deficit presented by girls was greater than that observed in boys of the same age. A step-by-step multivariate logistic regression identified social jetlag, the difference between waking times on weekdays and weekends, and the mid-point of sleep on weekends as significant predictors of sleep deficit. In the second article, school start time influenced the melatonin secretion, which correlated with circadian sleep parameters, although differently for non-clinical and clinical groups. Melatonin levels were positively correlated with sleep midpoint in morning students, and negatively correlated with sleep midpoint in afternoon students. In the third article, we identified age, school start time, midpoint of sleep on weekdays, and sleep duration on weekdays as predictors of psychiatric symptoms, as evaluated by the CBCL. Students with a morning school start time whose chronotype was classified as evening had shorter sleep duration on weekdays and higher social jetlag than morning-type participants. Moreover, students with a morning school start time and psychiatric symptoms had shorter duration of sleep and earlier circadian sleep patterns. Conclusion: The findings of the present study showed that school start time influences on the circadian sleep patterns, physiological factors and psychiatric symptoms in children and adolescents. Our findings emphasize the importance to redirect children and adolescents for a school start time that includes the individual preferences of sleep, preventing the negative health consequences, both in sleep and in psychiatric symptoms.
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Le système circadien : cible pharmacologique pour prévenir ou améliorer les symptômes associés au cancer et à ses traitements / The circadian timing system : therapeutic target for preventing or improving the symptoms associated with cancer and its treatments

Innominato, Pasquale Fabio 04 November 2011 (has links)
L'objectif principal de ma thèse est l’exploration de l’impact clinique d’une perturbation du système circadien chez les patients cancéreux. J’ai démontré une relation robuste entre le rythme d'activité-repos et survie, symptômes et qualité de vie. J’ai mis en évidence et caractérisé la dynamique du système circadien des patients sous chimiothérapie. J’ai montré qu’une bonne tolérance conditionnait l’efficacité de la chronothérapie. Ces résultats me conduisent à proposer de cibler le système circadien pour améliorer les symptômes des patients et l’efficacité des traitements anticancéreux. / The circadian timing system controls several temporal aspects of physiology and behaviour in laboratory animals and humans. The disruption of the circadian timing system results in the occurrence of alterations at various levels of organisation: central coordination, circadian physiology, molecular clocks and signalling pathways. In particular, a circadian disruption induced by long-haul flights across several time-zones or by shift work is associated with the appearance of systemic symptoms, such as fatigue, mood disorders and appetite loss. These symptoms, related to circadian disruption, are also frequently found in cancer patients, as a consequence of their neoplastic disease or its treatment. My PhD work is part of the research regarding the role of the circadian timing system in the development of the symptoms associated with cancer and its treatment, in tumor progression and in patients’ survival. Its perspective is to identify novel therapeutic options. In particular, the general objectives of this thesis consist in the definition of the relationships between symptoms and circadian function of patients before and during chemotherapy, and in the quantification of the clinical impact of circadian disruption on quality of life and survival. I have focused in particular on patients with metastatic colorectal cancer, third cancer for incidence and mortality. These studies confirm the role of the circadian timing system in the occurrence of systemic symptoms in cancer patients, without treatment or during it. This study is currently ongoing in collaboration with the NIH in the United States. In conclusion, this work leads me to propose an innovative therapeutic approach aimed at shielding and/or restoring the integrity of the circadian timing system. This novel strategy should improve the therapeutic index of chemotherapy, by increasing its efficacy and decreasing its toxicity, still reducing the occurrence of symptoms, preserving the quality of life and prolonging the survival of cancer patients. The implementation of this strategy relies on the non-invasive monitoring of biomarkers of the circadian timing system and on the personalization of chronotherapy delivery.
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Rendimento, qualidade e conservação pós-colheita de cenoura (Daucus carota L.), sob cultivo biodinâmico, em função dos ritmos lunares /

Jovchelevich, Pedro, 1968- January 2007 (has links)
Orientador: Francisco Luiz Araújo Câmara / Banca: Antônio Ismael Inácio Cardoso / Banca: Roberto Boczko / Resumo: O presente trabalho teve como objetivo avaliar a influência dos diversos ritmos da Lua (sinódico, sideral, anomalístico, tropical e draconiano) sobre o rendimento, a qualidade e a conservação pós-colheita de cenoura, quando semeada em diferentes datas, sob as mesmas condições de manejo, em uma propriedade familiar com manejo biodinâmico no município de Botucatu-SP. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com 31 tratamentos em 2005, e 14 tratamentos em 2006. A diferença entre tratamentos foi a data de semeadura, que variou de 5 de maio a 4 de junho em 2005, e de 25 de abril a 25 de maio em 2006, sempre entre 13 e 15hs. A colheita foi feita 82 dias depois de cada semeadura, equivalente a três ciclos da lua sideral, e no ponto que o consumidor de produtos orgânicos e biodinâmicos valoriza, segundo experiência do produtor. Para retirar o efeito da tendência dos dados na avaliação dos tratamentos, foi utilizada a metodologia de avaliação estatística do cálculo do Índice Estacional (IE). Foram avaliadas as seguintes características: massa fresca de raízes e folhas, massa seca, diâmetro, comprimento, teor de nitrogênio, fósforo e boro das raízes e perecibilidade das raízes com 30, 60 e 90 dias póscolheita. Nos dois períodos avaliados, a massa seca de raízes foi a única que, no contraste entre médias, apresentou diferença significativa nos ritmos sinódico tradicional e sinódico caboclo. No ritmo sinódico tradicional, a fase nova foi superior às fases crescente e cheia. No sinódico caboclo, a fase cheia foi inferior às demais. No contraste entre médias, o ritmo sinódico foi o que mais apresentou resultados significativos, e em menor proporção, os ritmos anomalístico, draconiano e sideral; O ritmo tropical (ascendente X descendente) e teor de nitrogênio não apresentaram resultados significativos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The purpose of this work was to evaluate the influence of moon rhythms (synodic, sidereal, anomalistic, tropical and draconic) on yield, quality and postharvest storage of Daucus carota L. roots under biodynamic management sowed in different dates. The experiment was carried out over a two period on a biodynamic farm, in Botucatu, São Paulo State, Brazil. Rhythms were tested observing the effects of seeding at different planting dates. The experiment was performed with four randomized blocks and 31 treatments (different dates) in 2005 and fourteen treatments in 2006. The harvest occurred 82 days after the sowing, when carrot roots show the most desirable aspect for the organic and biodynamic consumers. The magnitudes of effects associated with planting at a specific lunar position were measured by the deviations from the trend curve. The following characteristics were evaluated: fresh mass of roots and leaves, dry mass, diameter, length, nitrogen, phosphorus and boron content of the roots and perishability of the roots at 30, 60 and 90 days post-harvest. Dry mass was the only one that in the contrast between averages showed significant results in the two periods of the experiment. Result was that the synodic new phase was superior to the first quarter, and full phases and in the "caboclo" synodic rhythm, the full phase was inferior to the other. It was clear that the synodic "caboclo" rhythm had the most significant influence followed by the traditional synodic one. The draconic, sideral and anomalistic had less influence and the tropical rhythm had no influence at all considering studied aspects. Nitrogen and tropical rhythm did not present any lunar influence. The two evaluated periods are still not conclusive related... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Avaliação da influência do turno escolar e dos componentes circadianos do sono no comportamento de crianças e adolescentes

Carissimi, Alicia January 2016 (has links)
Objetivo: Avaliar a relação do turno escolar e o ritmo circadiano de crianças e adolescentes sob a expressão de sintomas comportamentais e de níveis de cortisol e melatonina. Métodos: Estudo transversal envolvendo 639 estudantes do ensino fundamental e médio (idade média de 13,03 anos, variando de 8–18; 58,5% meninas) recrutados em cidades localizadas na região do Vale do Taquari, Rio Grande do Sul, Brasil. Na segunda fase, 80 participantes foram selecionados aleatoriamente para coleta de saliva para análise de melatonina e cortisol. Os parâmetros circadianos do sono foram acessados pelo auto-relato de duração do sono nos dias de semana e fins de semana, diferenças no horário de acordar e dormir, déficit de sono, ponto médio do sono nos dias de semana e fins de semana, jetlag social e pela versão em português do Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) para avaliação do cronotipo. Os desfechos, níveis de melatonina e cortisol salivares, foram medidos através de amostras de saliva pela manhã, tarde e noite, e problemas de comportamento (sintomas psiquiátricos), foram avaliados usando a Lista de verificação comportamental para crianças e adolescentes (em inglês, Child Behavior Checklist, CBCL). O estudo foi realizado de acordo com as diretrizes éticas internacionais (número de aprovação no comitê de ética: 12-0386 GPPG/HCPA). Resultados: No primeiro artigo, estudantes do turno da manhã eram significativamente mais velhos, apresentavam maior diferença entre os horários de acordar e dormir, maior déficit de sono e jetlag social. O déficit de sono apresentado por meninas foi maior do que o observado em meninos da mesma idade. regressão multivariada, utilizando o método passo-a-passo, identificou jetlag social, diferença nos horários de acordar nos dias de semana e fins de semana e ponto médio nos fins de semana como preditores significativos de déficit de sono. O segundo artigo demonstrou que o turno escolar influenciou a secreção de melatonina, a qual se correlacionou com os parâmetros do sono circadianos, diferentemente para o grupo não-clínico e clínico. Os níveis de melatonina foram positivamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da manhã, e negativamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da tarde. No terceiro artigo, identificou-se idade, horário de início da escola, ponto médio de sono e duração do sono nos dias de semana como preditores de sintomas psiquiátricos, avaliados pelo CBCL. Os estudantes do turno da manhã, classificados como cronotipo do tipo vespertino, apresentaram menor duração do sono durante a semana e maior jetlag social do que estudantes do tipo matutino. Além disso, os alunos do turno da manhã com sintomas psiquiátricos apresentaram menor duração do sono e padrão circadiano de sono mais cedo. Conclusões: Os achados do presente estudo mostram que o turno escolar influencia os parâmetros circadianos de sono, fatores fisiológicos e sintomas psiquiátricos em crianças e adolescentes. Nossos resultados reforçam a importância de redirecionar crianças e adolescentes para um turno escolar que contemple as preferências individuais de sono, prevenindo as consequências negativas à saúde, tanto no sono quanto em sintomas psiquiátricos. / Objective: To evaluate the relationship of the school schedules and the circadian rhythm of children and adolescents under the expression of behavioral symptoms and cortisol and melatonin levels. Methods: This cross-sectional study involved 639 elementary and high school students (mean age 13.03 years, range 8–18, 58.5% female) recruited from the cities located in the Vale do Taquari region, Rio Grande do Sul, Brazil. In the second phase, 80 participants were randomly selected for saliva collection to analyze melatonin and cortisol. Circadian sleep parameters were assessed by self-reported sleep duration on weekdays and weekends, bedtime and wake time differences, sleep deficit, midpoint of sleep on weekdays and weekends, social jetlag, and the Portuguese version of Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) for assessment of chronotype. The outcomes, salivary melatonin and cortisol levels, were measured in morning, afternoon, and night saliva samples, and behavior problems (psychiatric symptoms) were assessed using the Child Behavior Checklist (CBCL). This study was performed according to international ethical guidelines (ethics committee approval number: 12–0386 GPPG/HCPA). Results: In the first article, the morning-school-time students presented significantly higher age, bedtime and wake up differences, sleep deficits, and social jetlag. The sleep deficit presented by girls was greater than that observed in boys of the same age. A step-by-step multivariate logistic regression identified social jetlag, the difference between waking times on weekdays and weekends, and the mid-point of sleep on weekends as significant predictors of sleep deficit. In the second article, school start time influenced the melatonin secretion, which correlated with circadian sleep parameters, although differently for non-clinical and clinical groups. Melatonin levels were positively correlated with sleep midpoint in morning students, and negatively correlated with sleep midpoint in afternoon students. In the third article, we identified age, school start time, midpoint of sleep on weekdays, and sleep duration on weekdays as predictors of psychiatric symptoms, as evaluated by the CBCL. Students with a morning school start time whose chronotype was classified as evening had shorter sleep duration on weekdays and higher social jetlag than morning-type participants. Moreover, students with a morning school start time and psychiatric symptoms had shorter duration of sleep and earlier circadian sleep patterns. Conclusion: The findings of the present study showed that school start time influences on the circadian sleep patterns, physiological factors and psychiatric symptoms in children and adolescents. Our findings emphasize the importance to redirect children and adolescents for a school start time that includes the individual preferences of sleep, preventing the negative health consequences, both in sleep and in psychiatric symptoms.
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A relevância da cronobiologia no processo saúde-doença : relação do cronotipo com o estilo de vida e saúde

Alam, Marilene Farias January 2012 (has links)
Os indivíduos diferem em suas preferências quanto ao horário para alocar períodos de sono e de atividade. Essas diferenças inter-individuais se devem, parcialmente, ao relógio biológico que controla funções relacionadas à expressão gênica, secreção hormonal, temperatura corporal, funções cognitivas e comportamentais como o ciclo sono-vigília. O presente estudo cronobiológico teve como objetivo principal avaliar em uma amostra populacional de estudantes universitários da região sul do Brasil, a distribuição dos cronotipos e estudar a relação entre cronotipo e as seguintes variáveis: ponto médio de sono nos dias livres e nos dias de atividade (estudo), bem como avaliar a consistência interna, confiabilidade e concordância entre o Munich Chronotype Questionnaire (MCTQ) e o Questionário de Cronotipo de Horne e Östberg (HO) para identificar cronotipos. Com a análise discriminante dos parâmetros de sono para o cronotipo vespertino destaca-se a importância de se obter preditores mais fáceis para a tipologia vespertina visto que essa característica tem sido associada a alguns riscos de transtornos comportamentais e mentais. Duzentos e quarenta e quatro estudantes universitários (59.0% mulheres), com idade de 17-35 anos, foram analisados através de um estudo transvesal. O Munich ChronoType Questionnaire (MCTQ) foi usado para avaliar os parâmetros de sono nos dias livres e de trabalho (estudo) e o Morningness/Eveningness Questionnaire (MEQ) para avaliar os cronotipos. Os dados foram analisados através da curva ROC (Receiver Operating Characteristic curve) e de uma análise discriminante. As variáveis que apresentaram os mais altos coeficientes discriminantes foram: o ponto médio de sono nos dias livres (0.89) e o início do sono nos dias livres (0.86). Testando os valores de diagnóstico da fase do ponto médio de sono para identificar o tipo vespertino observou-se que a área sob a curva ROC foi de 76%. Este estudo mostrou uma boa sensibilidade e especificidade para identificar o cronotipo vespertino com esses parâmetros de sono. Conclui-se, portanto, que estes parâmetros sejam úteis para identificar o cronotipo vespertino podendo ser usados para propósitos de pesquisa e na prática clínica. / Individuals differ in their preferences to allocate the time periods of sleep and activity. These inter-individual differences are due partly to the biological clock that controls functions related to gene expression, hormone secretion, body temperature, cognitive and behavioral functions such as sleep-wake cycle. This chronobiological study aimed to evaluate a sample of university students in southern Brazil, the distribution of chronotypes and to study the relationship between chronotype and the following variables: mid- sleep on free days and days of activity (study), and to assess the internal consistency, reliability and agreement between the Munich Chronotype Questionnaire (MCTQ) and the Morningness/Eveningness Questionnaire (MEQ) of Horne and Östberg (HO) to identify chronotypes. By discriminant analysis of sleep parameters for the evening chronotype highlights the importance of obtaining easier predictors to the evening typology since such characteristic has been associated with some risks of mental and behavioral disorders.Two hundred and forty four undergraduate students (59.0% women), 17- 35 years old, were assessed in a cross-sectional study. The Munich ChronoType Questionnaire (MCTQ) was used to evaluate sleep parameters on free days and work days and the Morningness/Eveningness Questionnaire (MEQ) to assess chronotypes. The data were analyzed by the Receiver Operating Characteristic (ROC) curve and a discriminant analysis. The variables that presented the highest discriminant coefficients were mid-sleep on free days (0.89) and sleep onset on free days (0.86). Testing the diagnostic values of mid-sleep phase to identify eveningtype it was observed that the area under the ROC curve was 76%. This study showed a good sensitivity and specificity to identify the evening chronotype with these sleep parameters. We conclude that these parameters are useful to identify evening typology and can be used both to research purposes and clinical practice.
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Avaliação da influência do turno escolar e dos componentes circadianos do sono no comportamento de crianças e adolescentes

Carissimi, Alicia January 2016 (has links)
Objetivo: Avaliar a relação do turno escolar e o ritmo circadiano de crianças e adolescentes sob a expressão de sintomas comportamentais e de níveis de cortisol e melatonina. Métodos: Estudo transversal envolvendo 639 estudantes do ensino fundamental e médio (idade média de 13,03 anos, variando de 8–18; 58,5% meninas) recrutados em cidades localizadas na região do Vale do Taquari, Rio Grande do Sul, Brasil. Na segunda fase, 80 participantes foram selecionados aleatoriamente para coleta de saliva para análise de melatonina e cortisol. Os parâmetros circadianos do sono foram acessados pelo auto-relato de duração do sono nos dias de semana e fins de semana, diferenças no horário de acordar e dormir, déficit de sono, ponto médio do sono nos dias de semana e fins de semana, jetlag social e pela versão em português do Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) para avaliação do cronotipo. Os desfechos, níveis de melatonina e cortisol salivares, foram medidos através de amostras de saliva pela manhã, tarde e noite, e problemas de comportamento (sintomas psiquiátricos), foram avaliados usando a Lista de verificação comportamental para crianças e adolescentes (em inglês, Child Behavior Checklist, CBCL). O estudo foi realizado de acordo com as diretrizes éticas internacionais (número de aprovação no comitê de ética: 12-0386 GPPG/HCPA). Resultados: No primeiro artigo, estudantes do turno da manhã eram significativamente mais velhos, apresentavam maior diferença entre os horários de acordar e dormir, maior déficit de sono e jetlag social. O déficit de sono apresentado por meninas foi maior do que o observado em meninos da mesma idade. regressão multivariada, utilizando o método passo-a-passo, identificou jetlag social, diferença nos horários de acordar nos dias de semana e fins de semana e ponto médio nos fins de semana como preditores significativos de déficit de sono. O segundo artigo demonstrou que o turno escolar influenciou a secreção de melatonina, a qual se correlacionou com os parâmetros do sono circadianos, diferentemente para o grupo não-clínico e clínico. Os níveis de melatonina foram positivamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da manhã, e negativamente correlacionados com ponto médio do sono em estudantes do turno da tarde. No terceiro artigo, identificou-se idade, horário de início da escola, ponto médio de sono e duração do sono nos dias de semana como preditores de sintomas psiquiátricos, avaliados pelo CBCL. Os estudantes do turno da manhã, classificados como cronotipo do tipo vespertino, apresentaram menor duração do sono durante a semana e maior jetlag social do que estudantes do tipo matutino. Além disso, os alunos do turno da manhã com sintomas psiquiátricos apresentaram menor duração do sono e padrão circadiano de sono mais cedo. Conclusões: Os achados do presente estudo mostram que o turno escolar influencia os parâmetros circadianos de sono, fatores fisiológicos e sintomas psiquiátricos em crianças e adolescentes. Nossos resultados reforçam a importância de redirecionar crianças e adolescentes para um turno escolar que contemple as preferências individuais de sono, prevenindo as consequências negativas à saúde, tanto no sono quanto em sintomas psiquiátricos. / Objective: To evaluate the relationship of the school schedules and the circadian rhythm of children and adolescents under the expression of behavioral symptoms and cortisol and melatonin levels. Methods: This cross-sectional study involved 639 elementary and high school students (mean age 13.03 years, range 8–18, 58.5% female) recruited from the cities located in the Vale do Taquari region, Rio Grande do Sul, Brazil. In the second phase, 80 participants were randomly selected for saliva collection to analyze melatonin and cortisol. Circadian sleep parameters were assessed by self-reported sleep duration on weekdays and weekends, bedtime and wake time differences, sleep deficit, midpoint of sleep on weekdays and weekends, social jetlag, and the Portuguese version of Morningness-Eveningness Questionnaire (MEQ) for assessment of chronotype. The outcomes, salivary melatonin and cortisol levels, were measured in morning, afternoon, and night saliva samples, and behavior problems (psychiatric symptoms) were assessed using the Child Behavior Checklist (CBCL). This study was performed according to international ethical guidelines (ethics committee approval number: 12–0386 GPPG/HCPA). Results: In the first article, the morning-school-time students presented significantly higher age, bedtime and wake up differences, sleep deficits, and social jetlag. The sleep deficit presented by girls was greater than that observed in boys of the same age. A step-by-step multivariate logistic regression identified social jetlag, the difference between waking times on weekdays and weekends, and the mid-point of sleep on weekends as significant predictors of sleep deficit. In the second article, school start time influenced the melatonin secretion, which correlated with circadian sleep parameters, although differently for non-clinical and clinical groups. Melatonin levels were positively correlated with sleep midpoint in morning students, and negatively correlated with sleep midpoint in afternoon students. In the third article, we identified age, school start time, midpoint of sleep on weekdays, and sleep duration on weekdays as predictors of psychiatric symptoms, as evaluated by the CBCL. Students with a morning school start time whose chronotype was classified as evening had shorter sleep duration on weekdays and higher social jetlag than morning-type participants. Moreover, students with a morning school start time and psychiatric symptoms had shorter duration of sleep and earlier circadian sleep patterns. Conclusion: The findings of the present study showed that school start time influences on the circadian sleep patterns, physiological factors and psychiatric symptoms in children and adolescents. Our findings emphasize the importance to redirect children and adolescents for a school start time that includes the individual preferences of sleep, preventing the negative health consequences, both in sleep and in psychiatric symptoms.

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