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Diversidade dos Cyclopoida (Copepoda, Crustácea) de água doce do estado de São Paulo: taxonomia, ecologia e genética.Silva, William Marcos da 30 July 2003 (has links)
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Previous issue date: 2003-07-30 / Universidade Federal de Minas Gerais / In the present work, the diversity of the Copepoda Cyclopoida from Sao Paulo State was studied. Samples of zooplankton were collected along with water samples were collected in 22 Hydrographic Management Units (UHGRH) of the State. Different environments, such as Reservoirs, Ponds, and Rivers were sampled totalizing 207 water bodies. All of them were positioned by using GPS. Samples of zooplankton were collected using net with 68µm of mesh size. Vertical hauls were performed in limnetic zone, while in littoral zone horizontal hauls and bucket were used. The plankton samples were preserved in formaldehyde 4%. Identifications of Cyclopoida were achieved using adult females forms. The data thus obtained were submitted to the SinBiota World Web Site where Geographical distribution of Cyclopoida was plotted to the map of the Sao Paulo State using the geographic coordinates obtained from GPS. It was compared the biodiversity and abundance of Cyclopoida in Reservoirs with different trophic degrees located in the Basins of rivers Tietê, Ribeira do Iguape, and Grande. ITS 2 sequence of DNA of the Cyclopoida was obtained for the following species: Thermcyclops decipiens, Thermocyclops inversus, Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops longisetus longisetus. Number of chromosomes Mesocyclops longisetus longisetus was counted and a chromatin diminution observed. New Cyclopoida species, Thermocyclops n. sp., was first described and five species, Acanthocyclops robustus, Eucyclops elegans, Eucyclops cf. prinophorus, Microcyclops alius, and Mesocyclops aspericornis, were newly registered in the São Paulo State. With this, there are now 10 genera and 26 species recorded in the Sao Paulo State. A key to genres and species in the São Paulo State was proposed based on morphological differences, including draws from the anatomical characteristics which are important for taxonomy. It was proved that species identified earlier in the São Paulo State as Mesocyclops kieferi and Mesocyclops brasilianus were actually confused with species Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops meridianus, respectively. It was found that Pacyclops fimbriatus, recorded earlier in the Broa Reservoir, is actually Pacyclops chiltoni inhabiting Sao Paulo water bodies. Thermocyclops decipiens was found to be the most broadly distributed species of the Cyclopoid recorded in 20 of 22 hydrographic units followed by Mesocyclops longisetus longisetus recorded in 16 units and Thermocyclops mintus, Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops meridianus recorded in 15 units. Based on our observations, we concluded that, in contrast to the common opinion, highly eutrophicated Reservoirs present the highest species richness and distribution equitability as compared to oligotrophic ones. It was found that Acanthocyclops robustus, Mesocyclops ogunnus, and Thermocyclops inversus present the high abundance in eutrophic systems, along with Thermocyclops decipiens. On the other hand, Thermocyclops n. sp., as well as Thermocyclops minutus, have presented the high abundance in systems less eutrophicated streams. We found that the newly described species Thermocyclops n. sp is distributed specifically in the Basins of Ribeira do Iguape and Paraíba do Sul. ITS 2 sequence of DNA varied greatly between different species, while no significantly variation was observed between specimens of the same species. Mesocyclops longisetus longisetus was found to possess 2n = 14 chromosomes and presented the chromatin diminution in 4th egg cleavage. The present study clearly shows that the exhaustive study of the biodiversity needs the use complex approaches as taxonomy, ecology and genetics.
This work is part of Biota/FAPESP program, the virtual institute of biodiversity. / Com o objetivo de conhecer a biodiversidade de Copepoda Cyclopoida do Estado de São Paulo foi realizado coletas de água em suas 22 unidades hidrográficas de gerenciamento de recursos hídricos (UHGRH). As coletas foram realizadas em diversos sistemas incluído represas, lagoas e rios, totalizando 207 corpos de água e todos georeferenciados com GPS. As amostras de Cyclopoida foram coletadas com rede de 68 µm de poro em arrastos verticais na zona limnética e coletados com equipamentos apropriados na região litorânea. As amostras foram preservadas em formol 4%. A identificação das espécies de Cyclopoida foi realizada analisando as fêmeas adultas. A distribuição das espécies foi realizada por submissão dos dados georreferenciados para plataforma do SinBiota/FAPESP. A biodiversidade e abundância das espécies em reservatórios de diferentes graus de trofia foi realizado para as represas do Rio Tietê, da Unidade Ribeira do Iguape e da Unidade Pardo Grande. Foi realizado pela primeira vez no Brasil a extração e sequenciamento do DNA de Cyclopoida. Foi seqüenciado o DNA do ITS 2 das espécies: Thermocyclops decipiens, Thermocyclops inversus, Mesocyclops ogunnus e Mesocyclops longisetus longisetus. Foi realizado também pela primeira vez no Brazil a citogenética para Cyclopoida, sendo utilizada a espécie Mesocyclops longisetus longisetus. Foi registrado para o Estado de São Paulo mais 6 espécies, sendo uma espécie nova Thermocyclops n. sp. e 5 novos registros, Acanthocyclops robustus, Eucyclops elegans, Eucyclops cf. prinophorus, Microcyclops alius e Mesocyclops aspericornis. Totalizando para o Estado de São Paulo 10 gêneros e 26 espécies. Com base nas diferenças morfológicas foi elaborado uma chave de identificação para gêneros e espécies do Estado de São Paulo com ilustrações das partes anatômicas de interesse. Foi constatado que as espécies Mesocyclops ogunnus e Mesocyclops meridianus são respectivamente M. kieferi e M. brasilianus anteriormente identificadas no Estado de São Paulo. Do gênero Paracyclops a espécie P. chiltoni encontrada nos corpos de água do Estado é a mesma encontrada na represa do Broa identificada como P. fimbiratus. As espécies mais amplamente distribuídas nas 22 UHGRHs foi Thermocyclops decipiens presente em 20 UHGRH seguida por Mesocyclops longisetus longisetus presente em 16 UHGRHs e Thermvocyclops minutus, Mesocyclops ogunnus, Mesocyclops meridianus e com presença em 15 UHGRHs. As represas mais eutrofizadas apresentaram uma maior riqueza e densidades similares de distribuição das espécies de Cyclopoida do que as represas menos eutrofizadas. As espécies Thermocyclops decipiens, Mesocyclops ogunnus, Acantocyclops robustus e Thermocyclops inversus foram mais abundantes em sistemas eutrofizados enquanto que as espéices Thermocyclops minutus e Thermocyclops n. sp. apresentaram maior abundância nos sistemas menos eutrofizados. A espécie Thermocyclops igaupensis n.sp. teve sua distribuição geográfica restrita as Unidades Ribeira do Iguape e Paraíba do Sul. As seqüências do DNA do ITS2 apresentou alta variação entre as diferentes espécies e baixa ou nenhuma variação entre as mesmas espécies. A análise citogenética feita na espécie Mesocyclops longisetus longisetus mostrou que a espécie possui 2n = 14 cromossomos e apresenta perda de cromatina a partir da 4a clivagem do ovo. Os estudos mostraram que a biodiversidade é melhor conhecida se estudada em diversos aspectos tais como taxonômico, ecológico e genético. Esta tese fez parte do Programa BIOTA/FAPESP o instituto virtual da biodiversidade.
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O gênero Inga (Leguminosoe, Mimosoideae) no Nordeste do Brasil: citogenética, taxonomia e tecnologia de sementesFigueirêdo, Marlene Feliciano 27 February 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-02-27 / Inga striata Benth. is a native Brazilian tree that grows in tropical and gallery forests and is
distributed in the Antilles, and tropical South America and Bolivia. In Brazil this species
occurs in the Amazon, in the northeastern region, and in Minas Gerais State. It is used in
the recuperation of soils in degraded areas, as a fruit tree, and in urban landscaping. The
present work sought to determine the best indices of seed maturity and the ideal time to
harvest them by evaluating their physiological quality during maturation. The experiments
were performed between Novembro/2006 and Abril/2007 and in Novembro/2007 and
May/2008 in an altitudinal forest on Campus II of the Federal University of Paraíba
(UFPB), in Areia, Paraíba State, Brazil. The treatments consisted of six different times of
fruit harvesting after anthesis (95, 110, 125, 140, 155 and 170 days after anthesis), during
two different periods of observations, utilizing all of the possible combinations (a 2 x 6
factorial scheme). During each harvest the dimensions of the fruits and seeds were
evaluated, as well as their water content, seed dry weight, and germination and vigor (first
germination count, germination velocity index, and the length and dry weight of the
primary root and aerial shoot). The results indicated that, for the study area, I. striata
demonstrated same periods of fruiting not differing periods of fruit maturation during the
two study periods, with the seeds reaching physiological maturity in 156 days after
anthesis in the first assessment s periods and after 155 days in the second year. The
principal indices of maturity were seed size, water content, dry weight, germination
capacity of seeds, and the dry weight of the aerial portion of the seedlings. Harvesting of
the fruits should be performed 155 days after anthesis, with fruits having a green color and
only beginning to initiate seed dispersal. / Inga striata Benth. é uma espécie arbórea nativa de ocorrência nas florestas tropicais e
matas ciliares, distribuindo-se nas Antilhas, Sul da América tropical e Bolívia. No Brasil
ocorre na Amazônia e região Nordeste até Minas Gerais, sendo utilizada na recuperação de
solos de áreas degradadas, como frutífera e na arborização urbana. O objetivo deste
trabalho foi determinar os melhores índices de maturidade e o ponto ideal de colheita das
sementes, avaliando sua qualidade fisiológica, durante o processo de maturação. O
experimento foi conduzido entre novembro de 2006 a abril de 2007 e em novembro de
2007 a maio de 2008 em floresta de brejo de altitude no Campus II da Universidade
Federal da Paraíba (UFPB), em Areia-Paraíba. Os tratamentos constituíram-se de seis
épocas de colheitas de frutos após a antese (95, 110, 125, 140, 155 e 170 D.A.A) e dois
períodos de observações. O delineamento utilizado foi o inteiramente casualizado seguindo
um esquema fatorial 2 x 6. Em cada colheita foram avaliadas as dimensões de frutos e
sementes, teor de água e massa seca das sementes, bem como a germinação e o vigor
(primeira contagem de germinação, índice de velocidade de germinação, comprimento e
massa seca da raiz primária e parte aérea). Os resultados permitiram constatar que para a
área em estudo, I. striata apresentou os períodos de frutificação e a duração da maturação
em épocas distintas para os dois períodos estudados. As sementes atingem a maturação
fisiológica aos 156 dias após a antese no primeiro período de avaliação e aos 155 dias no
segundo ano e que, os principais índices de maturidade foram o tamanho, teor de água,
peso da massa seca, capacidade germinativa das sementes e ainda a massa seca da parte
aérea da plântula. A colheita de frutos deve ser feita a partir dos 155 dias após a antese,
estando os frutos com coloração verde e em início de dispersão.
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Caracterização morfológica, citogenética e molecular de Mazama nemorivaga (Cuvier, 1817) a partir de um topótipo atual / Morphological, cytogenetics and molecular characterization of Mazama nemorivaga (Cuvier, 1817) from a current topotypeMorales-Donoso, Jorge Alfonso [UNESP] 26 April 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-04-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A espécie M. nemorivaga corresponde a uma espécie de veado cinza que ocupa a região Amazônica. Com base em estudos anteriores, a atual classificação taxonômica da espécie apresenta inconsistências, que sugerem a presença de mais de uma espécie dentro do que hoje é classificado como M. nemorivaga. Desta forma, o presente trabalho tem como objetivo contribuir com a taxonomia do gênero Mazama, mediante a coleta de um exemplar em sua localidade tipo (Caiena, Guiana Francesa), caracterizando-o morfológica, citogenética e molecularmente, permitindo a comparação da espécie em estudo com outros espécimes utilizados em publicações, a fim de conhecer diferenças entre eles e revisar a taxonomia da espécie. Para tanto, foi coletado um exemplar na localidade tipo da espécie (Guiana Francesa), o qual foi caraterizado por técnicas de morfologia tradicional (medidas crânio-mandibulares, medidas biométricas, coloração da pele), morfologia geométrica, assim como análises citogenéticas (Banda G, Banda C, coloração convencional de Giemsa e coloração Ag-NOR, FISH telomérica) e moleculares (análises filogenéticas de genes mitocôndrias Cyt b de 920 pb, COI I de 658 pb, D-loop 610 pb). Os resultados da caracterização citogenética e molecular, mostraram um claro agrupamento do topótipo de M. nemorivaga com exemplares da região do Amapá, constituindo o clado Norte (Guiana Francesa e Amapá). Além disso, sugere-se a existência de três espécies distintas, com base no nível de diferenças em relação ao topótipo da espécie, uma ocorrendo na Amazônia oriental, acima do rio Amazonas (Amapá e Guiana Francesa), outra na Amazônia central (Mato Grosso, Pará e Maranhão) e uma outra na Amazônia ocidental (Acre e Rondônia). Além disso, foi identificada a presença de pelos na região tarsal como um dos carácteres morfológicos que pode ser utilizado na diagnose da espécie em relação ao outros membros do gênero. / The species M. nemorivaga corresponds to the grey brocket deer that occupies the Amazon region. Based on previous studies, the current taxonomic classification of the species presents inconsistencies, which suggest the presence of more than one species within what is now classified as M. nemorivaga. In this way, the present research project aims to contribute with the taxonomy of the Mazama genus, by collecting a specimen in its type locality (Cayenne, French Guiana). Characterizing the morphological specimen, Cytogenetic and molecular, allowing the comparison of the species under study with other specimens used in publications, in order to know the differences between them and to review the taxonomy of the species. For this, a specimen was collected in the locality of the species (French Guiana), characterized by traditional morphology techniques. (craniomandibular measurements, biometric measurements, skin coloration), geometric morphology, as well as by cytogenetic analyzes (Band G, C-band, conventional Giemsa staining and Ag-NOR staining, telomeric FISH) and molecular (phylogenetic analyzes of mitochondrial genes Cyt b of 920 bp, IOC I of 658 bp, D-loop 610 bp). The results of the cytogenetic and molecular characterization showed a clear grouping of M. nemorivaga topotype along with specimens from the Amapá region, constituting the northern clade (French Guiana and Amapá). In addition, it is suggested the existence of three distinct species, based on differences in relation to the topotype of the species. One occurred in the eastern Amazon, above the Amazon River (Amapá and French Guiana), another in central Amazonia (Mato Grosso, Pará and Maranhão) and another one in western Amazonia (Acre and Rondônia). The presence of hairs in the tarsal region was identified as one of the morphological characters that can be used to diagnose the species in relation to other members of the genus.
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Estudo da estruturacromossômica de Astyanax bockmanni (Teleostei, Characiformes) em diferentes populações : enfoque em cromossomos B /Daniel, Sandro Natal. January 2014 (has links)
Orientador: Fábio Porto-Foresti / Coorientador: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Orlando Moreira Filho / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: Daniela Cristina Ferreira / Banca: Patricia Elda Sobrinho Scudeler / Resumo: Dentre os peixes da região Neotropical, temos a família Characidae, cujo gênero Astyanax é o mais comum e diversificado, contando com 141 espécies validadas. Estudos com diversas espécies do grupo têm demonstrado um dinamismo populacional particular, que leva à formação de populações geneticamente muito variáveis, além da ocorrência de cromossomos B, que neste gênero apresentam intensos polimorfismos. Estes cromossomos são classificados como elementos adicionais e dispensáveis, e estão presentes em plantas, fungos e animais, de diferentes morfologias e frequência variada. Frente a isso, foram analisadas seis populações distintas de Astyanax bockmanni coletadas nas bacias do rio Tietê e Paranapanema, além de exemplares das espécies A. fasciatus e A. paranae portadores de cromossomos supranumerários. Os estudos se basearam em técnicas citogenéticas clássicas (coloração com Giemsa, impregnação com nitrato de Prata, e bandamento C) e moleculares (hibridação in situ fluorescente e Zoo-FISH, por meio de sondas de DNAr 5S e 18S; genes para as histonas H1, H3; e elementos transponíveis Rex1, Rex3 e Rex6). Também realizamos a microdissecção, amplificação, marcação e hibridação de uma sonda B-específica do cromossomo B acrocêntrico de A. bockmanni, nomeada Babock. Os resultados indicaram que todos os exemplares de A. bockmanni e A. paranae apresentaram de 2n=50 cromossomos. Já A. fasciatus evidenciou 2n=46 cromossomos padrão. Todos os cariótipos das três espécies foram constituídos de cromossomos dos tipos metacêntricos, submetacêntricos, subtelocêntricos e acrocêntricos. Na espécie A. bockmanni (população Alambari), foram observados microcromossomos B acro e metacêntricos. Supranumerários meta, acro e subtelocêntricos observados na espécie A. fasciatus, e cromossomos B do tipo metacêntricos em A. paranae. As seis populações de A. bockmanni apresentaram divergências da heterocromatina ... / Abstract: Among the fish of the Neotropical region, we have the Characidae family whose genus Astyanax is the most common and diverse, with 141 species validated. Studies with several species of the group have shown a particular population dynamics, leading to the formation of genetically variable populations, besides the occurrence of B chromosomes, which in this genus exhibit intense polymorphisms. These chromosomes are classified as additional elements dispensable, and are present in plants, fungi and animals of varying frequencies and morphologies. So, six distinct populations of Astyanax bockmanni collected in the basins of the Tietê and Paranapanema were analyzed, beyond samples of the species A. fasciatus and A. paranae carriers of supernumerary chromosomes. The studies were based on classical cytogenetic techniques (Giemsa staining, impregnation with silver nitrate, and C-banding), and molecular (fluorescence in situ hybridization FISH and animal by means of 18S and 5S rRNA probes; genes for histones H1, H3, and transposable elements Rex1, Rex3 and Rex6). We also performed microdissection, amplification, marking and hybridization of a B-specific probe acrocentric B chromosome of A. bockmanni, named Babock. The results indicated that all specimens of A. bockmanni and A. paranae presented 2n=50 chromosomes. A. fasciatus showed 2n=46 chromosomes default. All karyotypes of the three species were made up of chromosomes metacentric, submetacentric, subtelocentric and acrocentric types. The species A. bockmanni (Alambari population) were observed B microchromosomes metacentric and acro Supernumerary, were acro and subtelocentric observed in the species A. fasciatus, and the metacentric B chromosomes in type A. paranae. The six populations of A. bockmanni showed differences in the constitutive heterochromatin and multiple NOR except the population Capivara river, which indicated a simple NOR system. Additionally, the 18S rRNA gene revealed ... / Mestre
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Alterações cromossômicas estruturais e evolução caritotípica em Astyanax fasciatus (Teleostei, Characiformes, Characidae) /Ferreira Neto, Maressa. January 2012 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Orlando Moreira Filho / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: daniela Cristina Ferreira / Banca: Tatiana Aparecida Voltolin / Resumo: Neste estudo, espécimens de Astyanax fasciatus capturados no ribeirão Água de Madalena (bacia do alto rio Paraná) foram analisados citogeneticamente, revelando diferentes números diplóides em indivíduos convivendo em simpatria e sintopia, com números cromossômicos de 46, 48 e 50 cromossomos, sendo identificado ainda um cromossomo B acessório em todos os exemplares portadores da fórmula cariotípica com 46 cromossomos. Os exemplares analisados desta espécie foram submetidos às técnicas citogenéticas básicas de coloração com Giemsa, bandamento C e impregnação por nitrato de Prata e técnicas de citogenética molecular, com marcação por fluorocromos base-específicos, hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S, 5S e As51, com sondas teloméricas (TTAGGG)n e também com a microdissecção cromossômica, que resultou da hibridação in situ fluorescente (FISH) utilizando sondas produzidas a partir dos cromossomos B. A região organizadora de nucléolo (NOR) e os sítios de rDNA 18S e 5S mostraram uma distribuição conservada entre os citótipos 2n=46 e 2n=48 cromossomos, sendo que o citótipo de 2n=50 cromossomos apresentou-se de forma diferente com relação aos sítios de rDNA 18S, os quais se apresentaram localizados em cromossomos diferentes. A distribuição da heterocromatina foi pouco variável entre os três citótipos e a região da NOR mostrou-se CG rica quando submetida ao tratamento com Cromomicina A3. Os resultados obtidos com os marcadores moleculares e de citogenética básica mostraram que parece não ocorrer intercruzamentos envolvendo os exemplares dos diferentes citótipos, uma vez que não foram encontradas fórmulas cromossômicas híbridas entre estes citótipos até o presente. Porém, se estes citótipos compartilham uma série de homologias, como evidenciado na análise dos marcadores cromossômicos, também são encontradas diferenças... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this study, specimens of Astyanax fasciatus were collected at Água da Madalena stream (Botucatu, São Paulo, Brazil) and analyzed cytogenetically, revealing different diploid numbers of individuals living in sympatry and sintopy with chromosome numbers of 46, 48 and 50 chromosomes, still being identified a chromosome B accessory on all copies bearing the karyotype formula with 46 chromosomes. The specimens of this species analyzed were submitted to cytogenetic techniques basic of Giemsa staining, C-banding and Silver nitrate impregnation and molecular cytogenetic techniques, marked by base-specific fluorochromes, fluorescence in situ hybridization with probes 18S rDNA and 5S As51, telomeric probe (TTAGGG)n and also with the chromosome microdissection, resulting in fluorescence in situ hybridization (FISH) using probes generated from chromosome B. The nucleolus organizer regions (NOR) and sites of 5S and 18S rDNA showed a distribution conserved between cytotypes 2n = 46 and 2n = 48 chromosomes, and the cytotype of 2n = 50 chromosomes presented differently with respect to 18S rDNA sites, which are located on different chromosomes presented. The distribution of heterochromatin was somewhat variable among the three cytotypes and NOR region proved CG rich when subjected to treatment with chromomycin A3. The results obtained with the markers and molecular cytogenetics basic showed that appears not to occur intercrosses involving specimens of different cytotypes since it was not found among these formulas chromosomal hybrid cytotypes to the present. However, if these cytotypes share a number of homologies, as evidenced in the analysis of chromosomal markers are also differences that could be a consequence of chromosomal rearrangements complementary, providing new locations of rDNA sites and causing a consequent differentiation and speciation among copies of different cytotypes... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Análise citogenética clássica, molecular e ultraestrutural em escorpiões da família Buthidae : um enfoque evolutivo /Mattos, Viviane Fagundes. January 2013 (has links)
Orientador: Marielle Cristina Schneider / Banca: Rodrigo Marques Lima dos Santos / Banca: Mateus Mondin / Resumo: A família Buthidae possui cerca de 900 espécies descritas taxonomicamente; porém, menos de 5% destas espécies foram analisadas sob o ponto de vista citogenético. O número diploide nos butídeos varia entre 2n=5 a 2n=56, e a presença de cromossomos holocêntricos com comportamento sináptico e aquiasmático durante a meiose I é uma característica comum a todas as espécies previamente estudadas. Neste trabalho, os cromossomos mitóticos e meióticos de 11 espécies de escorpiões Buthidae (Ananteris balzanii, Rhopalurus agamemnon, Rhopalurus rochai, Tityus bahiensis, Tityus confluens, Tityus costatus, Tityus fasciolatus, Tityus maranhensis, Tityus martinpaechi, Tityus paraguayensis e Tityus stigmurus) foram estudados através de técnicas de citogenética clássica, molecular e ultraestrutural, com o objetivo de estabelecer os mecanismos responsáveis pela diversidade inter e intraespecífica de número cromossômico e/ou origem das complexas associações multivalentes observadas durante a meiose I, bem como, a evolução dos cromossomos holocêntricos. Nas 11 espécies examinadas, o número diploide variou de 2n=6 a 2n=28 e, em representantes dos três gêneros, associações cromossômicas multivalentes foram observadas em células paquitênicas e pós-paquitênicas. Além disso, uma variabilidade intraespecífica quanto à presença ou ausência de cadeias cromossômicas e ao número de cromossomos envolvidos nas complexas associações multivalentes foi observada em A. balzanii, R. agamemnon, R. rochai, T. bahiensis, T. maranhensis e T. paraguayensis. Células impregnadas pelo íon prata e submetidas à técnica de FISH revelaram certa constância quanto ao número e localização das RONs ativas e sítios de rDNA 45S, apesar da grande variação cromossômica verificada entre as espécies, visto que, RONs localizadas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Buthidae has about 900 species taxonomically described; however, less than 5% of these species were analyzed from the cytogenetic point of view. The diploid number in buthid ranges from 2n=5 to 2n=56, and the presence of holocentric chromosomes with synaptic and achiasmatic behavior during the meiosis I is a common feature for all previously studied species. In this work, the mitotic and meiotic chromosomes of 11 species of Buthidae scorpions (Ananteris balzanii, Rhopalurus agamemnon, Rhopalurus rochai, Tityus bahiensis, Tityus confluens, Tityus costatus, Tityus fasciolatus, Tityus maranhensis, Tityus martinpaechi, Tityus paraguayensis and Tityus stigmurus) were studied through classical, molecular and ultrastructural cytogenetic techniques, aiming to establish the responsible mechanisms for inter and intraspecific diversity of chromosomal number and/or origin of the multivalent complex associations observed during the meiosis I, as well as, the holocentric chromosome evolution. In the 11 species examined, the diploid number ranged from 2n=6 to 2n=28; multivalent chromosomal associations were observed in pachytene and postpachytene cells of species of the three genera. Moreover, an intraspecific variability regarding to the presence or absence of chromosome chains and the number of chromosomes involved in multivalent complex associations was observed in A. balzanii, R. agamemnon, R. rochai, T. bahiensis, T. maranhensis and T. paraguayensis. Silver-impregnated cells and nuclei submitted to the FISH technique revealed constancy in relation to the number and localization of the active NORs and rDNA 45S sites, respectively, despite of the high chromosomal variation verified among species, i.e., NORs located on terminal and subterminal region of two chromosomes were the common pattern for buthids... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Mecanismos de evolução cromossômica e diferenciação cariotípica em espécies das subfamílias Hylinae (tribos Cophomantini e Lophiohylini) e Phyllomedusinae (Hylidae, Anura, Amphibia) /Gruber, Simone Lilian. January 2013 (has links)
Orientador: Sanae Kasahara / Banca: Yatiko Yassuda / Banca: César Martins / Banca: Itamar Alves Martins / Banca: José Maurício Barbanti Duarte / Resumo: A classe Amphibia, especialmente a família Hylidae, passou por extensas modificações na taxonomia e sistemática, realizadas com base, principalmente, em dados moleculares, mas quase nenhuma contribuição das informações citogenéticas. Os hilídeos são os anuros mais abundantes em número de espécies, porém, a maioria delas foi sequer cariotipada e grande parte das informações disponíveis na literatura está restrita apenas ao número e morfologia dos cromossomos. No presente trabalho, foram cariotipadas 28 espécies da subfamília Hylinae, sendo da tribo Cophomantini Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; da tribo Lophiohylini, as espécies Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; e da subfamília Phyllomedusinae, duas espécies, Phyllomedusa distincta e P. tetraploidea, bem como seus híbridos triploides. A maioria das espécies da subfamília Hylinae compartilha cariótipo 2n=24, FN=48, bandas C majoritariamente centroméricas e RON em cromossomos pequenos do par 11 em Cophomantini e do par 10 em Lophiohylini. As exceções são as do gênero Phyllodytes, da tribo Lophyohylini, cujas espécies têm 2n=22, FN=44 e RON no par 2, e as do gênero Aplastodiscus, da tribo Cophomantini, cujas espécies têm diferentes números cromossômicos de 2n=24, 2n=22, 2n=20 e 2n=18, mas compartilham o mesmo padrão de bandamento C e o mesmo par marcador de RON. As bandas de replicação por incorporação de BrdU... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Amphibia class, especially the family Hylidae, went through extensive changes in taxonomy and systematics, based mainly on molecular data, but with almost no contribution of cytogenetic information. This family is the most speciose among the anurans, however, the great majority of the species was never karyotyped, and most of the cytogenetic information on hylids available in the literature is restricted to the number and morphology of the chromosomes. In the present work we karyotyped 28 representatives of the subfamily Hylinae, belonging to the tribe Cophomantini the species Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; to the tribe Lophiohylini the species Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; and two species of the subfamily Phyllomedusinae, Phyllomedusa distincta and P. tetraploidea, as well as their triploid hybrids. Most species of the subfamily Hylinae share the same karyotype with 2n=24, FN=48, C bands with predominantly centromeric distribution, and NOR located on small chromosomes belonging to the pair 11 in Cophomantini and to the pair 10 in Lophiohylini. The exceptions are the genus Phyllodytes, from the tribe Lophyohylini, whose species have 2n=22, FN=44 and NOR in the pair 2, and the genus Aplastodiscus, from the tribe Cophomantini, whose species have different chromosome numbers of 2n=24, 2n=22, 2n=20, Abstract and 2n=18, but sharing the same C-banding pattern and the same pair of NOR marker... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Comparação cariotípica entre Mazama gouazoubira e Mazama nemorivaga (Artiodactyla; Cervidae) por meio de marcadores citogenéticos clássicos, fish telomérica e pintura cromossômica /Resende, Juliana Pinho de Almeida. January 2012 (has links)
Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Coorientador: Vanessa Veltrini Abril / Banca: Jeffrey Frederico Lui / Banca: Diogo Cavalcanti Cabral de Mello / Resumo: As espécies Mazama gouazoubira e Mazama nemorivaga, por muito tempo trouxeram dúvidas quanto à sua classificação e atualmente são descritas como espécies diferentes. A constituição cariotípica de M. gouazoubira (2n=70 e NF=70) é similar à de M. nemorivaga (2n=67 a 69 e NF=69 a 72), o que as difere são o número de cromossomos B e o cromossomo X. O objetivo deste trabalho foi analisar as diferenças cariotípicas, identificando os rearranjos cromossômicos que diferenciaram as espécies. Amostras de sangue e pele foram coletadas de 23 animais (15 M. gouazoubira e 08 M. nemorivaga) e as preparações cromossômicas foram submetidas aos bandamentos (C, G e coloração Ag-RON) e a hibridização in situ fluorescente. Dos 15 M. gouazoubira 02 foram variantes e dos 8 M. nemorivaga 4 foram variantes. A banda C mostrou que nas duas espécies as regiões centroméricas e pericentroméricas de todos os cromossomos são heterocromáticas, exceto o Y que é eucromático. As regiões organizadoras do nucléolo ativas foram localizadas nos mesmos pares cromossômicos (1 e 2) nas duas espécies. Sinais teloméricos foram localizados nas extremidades de todos os cromossomos e na região mediana do X nas duas espécies foi detectado um sinal telomérico intersticial. Os machos M. nemorivaga apresentaram um cromossomo sem par homólogo a metade distal do braço q do cromossomo X. A pintura cromossômica mostrou total homeologia da sonda do cromossomo X de M. gouazoubira com o braço p e com a metade proximal do braço q do X de M. nemorivaga. A metade distal do cromossomo X não apresentou sinal de hibridização e foi originada por uma fusão em tandem de um autossomo acrocêntrico, diferenciando o sistema sexual de M. nemorivaga / Abstract: The taxonomic classification of Mazama gouazoubira and Mazama nemorivaga has been uncertain, but nowadays they are described as distinct species. The standard karyotype constitution of M. gouazoubira (2n=70 and FN=70) is similar to M. nemorivaga (2n=68 and FN=70) and the differences between them are the number of B chromosomes and the morphology of X chromosome. This study aimed to analyze the karyotypic differences between M. gouazoubira and M. nemorivaga species identifying the chromosomal rearrangements that distinguished them. Blood and skin samples were collected from 23 animals (15 M. gouazoubira and 08 M. nemorivaga) and chromosomal preparations were submitted to G and C banding, Ag-NOR staining and to fluorescent hybridization in situ. From 15 M. gouazoubira analyzed here, two of them showed variants karyotypes while from eight M. nemorivaga, 4 of them were variants. The analysis of C-bands showed all centromeric and pericetromeric regions were heterochromatic, except the Y chromosome. In both species the actives nucleolar organizer regions were observed in the terminal position of chromosome pairs 1 and 2. The telomeric sites were located at all the chromosomes ends and at the half of X-chromosome q arm in both species. The males of M. nemorivaga showed one acrocentric chromosome without its corresponding pair, but it was homologous to distal half of q arm of X-chromosome. The chromosome painting analysis showed total homeology of the X-chromosome M. gouazoubira probe with the whole p arm and proximal half of q arm of X-chromosome from M. nemorivaga. The distal half of X-chromosome did not show hybridization signal and it was originated by tandem fusion of a small acrocentric, resulting in a different sexual system for M. nemorivaga / Mestre
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Estudos citogenéticos em populações de Bryconamericus stramines, Eigenmann, 1908(Teleostei, Characidae) em rios das bacias do Tietê e ParanapanemaPescatori, Gustavo Luiz Rossetto [UNESP] 30 September 2008 (has links) (PDF)
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pescatori_glr_me_botib.pdf: 4605839 bytes, checksum: 2106e160ab7fd297cb6969f1094d5339 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A família Characidae é a maior e mais complexa dentre as famílias de peixes da ordem Characiformes e grande parte dos peixes do Brasil encontra-se na família Characidae. A maioria dos peixes desta família é conhecida popularmente como lambaris, piracanjubas, peixes-cachorros, pacus, piranhas e dourados. Distribuemse no continente americano – desde a fronteira do México com os Estados Unidos até o sul da Argentina. O gênero Bryconamericus possui aproximadamente 51 espécies identificadas e destas, cerca de 30 que vivem em distintas regiões do Brasil, possuem um número diplóide relativamente estável de 2n=52 cromossomos, mas há muito pouca informação citogenética sobre os representantes deste. No presente projeto, foi realizada a análise citogenética em representantes de cinco populações de Bryconamericus stramineus, Eigenmann, 1908, em rios das bacias do Tietê e Paranapanema, região de Botucatu, SP. Para tanto, foram caracterizados seus cariótipos através de coloração convencional com Giemsa, a qual evidenciou um cariótipo padrão de 2n=52 cromossomos; foram identificados os padrões de distribuição de heterocromatina constitutiva (Bandas C) que revelaram blocos heterocromáticos centroméricos, intersticiais e teloméricos; foram identificadas as regiões organizadoras de nucléolos (RONs) através de impregnação com nitrato de prata, evidenciando-se RONs simple e múltiplas; foram identificadas as regiões cromossômicas ricas em GC através de coloração com o fluorocromo cromomicina (CMA3) que também se mostraram simples e múltiplas, mostrando correspondência com as Ag-RONs; foram identificados ainda os cístrons ribossômicos através de hibridação in situ fluorescente (FISH) com a sonda de DNAr 18S, que revelou de duas e seis marcações e com a sonda de DNAr 5S que revelou de três... / The Characidae family is the largest and more complex among the fish families of Characiform order and most part of Brazilian fishes are in this family. The majority of fishes from this family are popularly known as lambaris, piracanjubas, peixes-cachorros, pacus, piranhas e dourados. They are spread over great part of the American continent - since the border of Mexico with United 8tates until the southern limit of Argentina. The gender Bryconamericus has proximately 51 identified species and about 30 of them live in distinct regions of Brazil. There are very few cytogenetic information about them beyond the relatively stable diploid number of 2n=52 chromosomes. In the present project cytogenetic analysis were accomplished in representative species of five populations of Bryconamericus stramineus, Eigenmann, 1908, from rivers that belong to Tietê and Parapanema basins, in the Botucatu town, state of 8ão Paulo. For that, the karyotypes were characterized by conventional Giemsa staining, which showed a karyotype of 2n= 52 chromosomes; the pattern of distribution of the constitutive heterochromatin were identified by C Banding and revealed centromeric, interstitial and telomeric heterochromatic blocks; the nucleoli organizer regions (NORs) were identified through silver nitrate impregnation and evidenced simple and multiple RONs; the GC rich chromosomic regions were identified through the f1uorochrome chromomycin (CMAJ) which appeared as simple and multiple marks, showing correspondence to Ag-NORs; the ribosomal cistrons were identified through f1uorescentin situ hybridization (FI8H) with 188 rDNA as probe, which revealed from two to six marks and, with 58 rDNA as probe, revealed from two to five marks. The obtained data, besides revealing... (Complete abstract click electronic access below)
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Citogenética de populações de Piabina argentea(Teleostei, Characiformes, Characidae) das bacias dos rios Paranapanema e TietêPazian, Marlon Felix [UNESP] 30 September 2008 (has links) (PDF)
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pazian_mf_me_botib.pdf: 586728 bytes, checksum: ee9c1b3e254811f66a8a7cf904e2114b (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Foi realizada a análise citogenética de duas espécies do Gênero Piabina, P. anhembi e P. argentea, utilzando-se técnicas de coloração cromossômica convencional com Giemsa, localização das Ag-RONs, coloração com CMA3, hibridação in situ com as sondas de DNAr 18S e 5S e bandamento C. Todas as quatro amostras de P. argentea apresentaram 2n=52 cromossomos e números fundamentais diferentes, com exceção de duas amostras populacionais coletadas na bacia do rio Paranapanema. Três apresentaram Ag-RONs múltiplas (Avaré, Botucatu e Bauru) e a amostra da população coletada na localidade Itatinga apresentou Ag- RONs simples e um polimorfismo de tamanho das mesmas. A hibridação in situ com o uso de sondas de DNAr 5S mostrou diferenças entre as amostras das populações. O bandamento C marcou em sua maioria as regiões terminais e centroméricas dos cromossomos. As análises evidenciaram a existência de diferenças citogenéticas entre as amostras de P. argentea coletadas, sugerindo a existência de diferenciação populacional. As diferenças citogenéticas encontradas podem ocorrer devido ao fato de que P. argentea habite apenas riachos, o que poderia levar ao isolamento destas populações. Também foi analisada a amostra de uma população de P. anhembi coletada no município de Salesópolis, que também apresentou 2n=52 cromossomos, Ag-RONs simples e polimorfismos de tamanho das Ag-RONs. A hibridação in situ com a utilização da sonda de DNAr 18S mostrou três cromossomos marcados e com a sonda de DNAr 5S mostrou dois cromossomos marcados. O Bandamento C mostrou bandas nas regiões pericentromérica de dois pares cromossômicos nos exemplares desta espécie. Considerando-se o fato deste grupo habitar geralmente regiões específicas dos ambientes de cabeceira dos riachos, isto pode constituir um fator... / Two species of the genus Piabina have been analyzed, P. argentea and P. anhembi using cytogenetic techniques (Staining of Giemsa, staining of Ag-NORs, fluorescent staining CMA3, hybridization in situ using probe of rDNA 18S and 5S and C-band). All samples of P. argentea presented 2n=52 chromosome and different fundamental numbers, with exception of the individuals of two population collected in the Paranapanema river basin. Three samples analyzed from Avaré, Botucatu and Bauru presented multiple NORs and individuals from Itatinga presented the single NOR and the polymorphic NOR. The in situ hybridization technique using the DNAr 5S probe showed differences between samples of all the populations. The technique C-banding showed marks in most of terminals and centromeric regions of the chromosomes. The existence of cytogenetic differences between the individuals of different samples collected of P. argentea, suggests a possible population differentiation. The occurrence of cytogenetic differences happened by the fact that P. argentea live only in upper stream rivers, and this can determine a process of population isolation. A sample of P.anhembi collected in the Salesópolis city was also analyzed and presented 2n=52 chromosomes, simple Ag-NORs and polymorphism of the NORs. The use of in situ hybridization technique with DNAr 18S probe revealed three labellad chromosomes, and with the rDNA 5S probe showed two labellad chromosomes. The technique of C-banding revealed the presence of heterochromatin in the pericentromeric regions of two chromosome pairs. The species Piabina argentea most of the time live in a specific environment in upper stream rivers. This possible isolation can fix spot modifications in the chromosome if it occurs. However this fact don`t change the macro structure of the chromosome in different generations.
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