Em concentrações subletais, agentes antimicrobianos modulam a expressão gênica bacteriana, sendo que o conjunto de genes que é modulado depende tanto da cepa bacteriana, como da natureza do agente antimicrobiano. Neste trabalho, avaliamos o perfil de expressão gênica de Xylella fastidiosa cepa 9a5c em resposta ao tratamento por até 60 minutos com dose subletal do antibiótico estreptomicina. Esta é uma cepa virulenta, originalmente isolada de laranjeiras com sintomas de clorose variegada dos citros. A hibridização de microarranjos de DNA representando 2608 das 2848 sequências codificadoras (CDS) previamente anotadas no genoma desta cepa, revelou que 136 CDS apresentaram expressão gênica diferencial em resposta à exposição à estreptomicina, sendo que destas 109 foram negativamente moduladas e 27 positivamente moduladas. Realizamos, também, ensaios de PCR quantitativo precedido de transcrição reversa (RTqPCR) de 21 CDS para confirmar a modulação observada na análise global da expressão gênica. O perfil de expressão gênica de X. fastidiosa em resposta à estreptomicina foi analisado de forma integrada com outros perfis de expressão gênica desta bactéria. Entre as CDS positivamente moduladas, destacamos aquelas codificadoras das chaperoninas GroEL e GroES, que estão associadas a resposta de choque térmico, e CDS associadas à tradução, tais como proteínas ribossomais e fatores de tradução. Interessantemente, a exposição à estreptomicina induz a expressão da CDS que codifica poligalacturonase, que é um fator de virulência em algumas cepas de X. fastidiosa. Por outro lado, o tratamento com estreptomicina promoveu a modulação negativa de CDS relacionadas à formação e manutenção de biofilme ao contrário do observado quando estas bactérias foram submetidas ao tratamento com gomesina, um peptídeo antimicrobiano. O conjunto destas observações sugere que a exposição à dose subletal de estreptomicina possa promover um fenótipo de maior virulência, contrariamente ao efeito previamente observado com a gomesina. Neste trabalho, também descrevemos o pirosequenciamento do genoma da cepa J1a12 de Xylella fastidiosa, que exibe fenótipo menos virulento em citros e tabaco em relação à cepa 9a5c. A comparação da sequência genômica destas duas cepas confirma diferenças anteriormente observadas utilizando-se microarranjos de DNA e destaca genes potencialmente importantes para virulência de Xylella fastidiosa. / At sublethal concentrations, antimicrobials compounds modulate bacterial gene expression and the gene set that is modulated depends not only on the bacterial strain but also on the nature of antimicrobial agent. In this study, we evaluated changes in gene expression profile of Xylella fastidiosa strain 9a5c exposed up to 60 min to sublethal concentration of streptomycin. This a virulent strain originally isolated from orange trees with symptoms of citrus variegated chlorosis. Hybridization of DNA microarrays representing 2,608 out of 2848 coding sequences (CDS) previously annotated in strain 9a5c genome revealed 136 CDS differentially expressed upon streptomycin treatment. Of which 109 were down-regulated and 27 up-regulated. Differential expression for a subset of 21 CDS was further evaluated by reverse transcriptionquantitative PCR (RT-qPCR). In addition, we performed an integrated analysis of the gene expression profile of X. fastidiosa in response to streptomycin along with other gene expression profiles available for this bacterium. Among the up-regulated CDS, we highlight those encoding chaperonins GroEL and GroES, which are associated with heat shock response, and those CDS related to translation, such as ribosomal proteins and translation factors. Interestingly, exposure to streptomycin induces the expression of a CDS encoding polygalacturonase, which is a virulence factor for some X. fastidiosa strains. Furthermore, treatment with streptomycin down-regulates some CDS related to biofilm formation oppositely to treatment with gomesin, an antimicrobial peptide. Together, these observations suggest that exposure to sublethal dose of streptomycin might promote a higher virulent phenotype, in contrast to the effect previously observed with gomesin. In the present work, we also describe the pyrosequencing of J1a12 genome, a X. fastidiosa strain that exhibits a less virulent phenotype in citrus and tobacco if compared to strain 9a5c. A comparison of genome sequences of these two strains confirms differences previously observed using DNA microarrays and highlights important genes for virulence of X. fastidiosa.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5821.pdf: 2231996 bytes, checksum: edfd5a3ae517fd70ccf6718b1c349351 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Along its evolutionary history, plants have developed biosynthetic routes to synthesize and accumulate a wide variety of secondary metabolites, which respond to the environment characteristics where they occur. The studies about these compounds effects on nearby organisms constitute the field of allelopathy. Allelopathy is an important phenomenon in plant chemical ecology that involves bioactive compounds, from which one can produce natural pesticides that would be more specific, less harmful to the environment and applied to a model of sustainable agriculture. Drimys brasiliensis Miers is found in the Atlantic Forest and in the Cerrado domain. It s chemically characterized by the presence of monoterpenes, sesquiterpenes and flavonoids, with great use potential in the pharmaceutical industry. There are few studies about the allelopathic potential of D.brasiliensis and its secondary metabolites to act as natural pesticides, specialy as herbicide or insecticide. Thus, in the first chapter we studied the phytotoxic potential of aqueous extracts of D.brasiliensis according to the seasonality and different plant organs. The phytotoxic effect of D.brasiliensis isinfluenced by the period of collection, with more evident activity in leaves collected in the dry season. Aqueous extracts from leaves, roots and stems of D.brasiliensis showed activity on crop plants, and all organs are a promising source in the search of phytotoxic compounds. In the second chapter, we investigated the phytotoxic potential of crude extract fractions from D. brasiliensis roots and leaves on weeds. The inhibitory effects of the root hexane fraction on seedling growth was similar to the herbicide, indicating that D. brasiliensis is a possible alternative form of control for the weed species examined. In chapter three, was carried a bioassay-guided isolation of bioactive compounds present in D.brasiliensis roots. Four drimanes sesquiterpenes were isolated from bioactive fractions of roots, determined as polygodial, polygodial 12 α- acetal, dendocarbin L and (+) fuegin. The polygodial caused phytotoxic effects on wheat coleoptile and on crop and weed species. In the last chapter, the effect of the hexane fraction and polygodial obtained from D.brasiliensis roots was evaluated on Toxoptera citricidus Kirkaldy (black citrus aphid), and both caused toxicity, with high mortality on nymphs and adults stages of this aphid. The polygodial, isolated for the first time in the roots of D. brasiliensis, may be the primarily responsible for the biological activities detected in this study. The herein presented data allow the indication of this compound as a potential biopesticide. / Ao longo do seu processo evolutivo, as plantas desenvolveram rotas de biossíntese, através das quais sintetizam e acumulam uma ampla variedade de metabólitos secundários, que respondem às características do meio onde se encontram. Os estudos realizados sobre os efeitos desses compostos em organismos próximos constituem o campo da alelopatia. A alelopatia representa um importante fenômeno dentro da ecologia química de plantas e envolve a síntese de metabólitos secundários, a partir dos quais se pode produzir pesticidas naturais, mais específicos, menos prejudiciais ao ambiente e aplicáveis a um modelo de agricultura de base ecológica. A espécie Drimys brasiliensis Miers ocorre na Mata Atlântica e no domínio do bioma Cerrado. Fitoquimicamente é caracterizada pela presença de monoterpenos, sesquiterpenos e flavonóides com grande potencial de uso na indústria farmacológica. São poucos os trabalhos publicados que tratam de investigações do potencial de D. brasiliensis e de seus metabólitos secundários para atuarem como pesticidas naturais, principalmente no que concerne às ações herbicida e inseticida. Nesse sentido, no primeiro capítulo foram realizadas investigações sobre o potencial fitotóxico de extratos aquosos de D. brasiliensis em função da sazonalidade e de diferentes órgãos da planta. O efeito fitotóxico de D. brasiliensis foi influenciado pela época de coleta, com atividade mais evidente em folhas coletadas na estação seca. Extratos aquosos de folhas, raízes e cascas do caule de D. brasiliensis apresentaram atividade inibitória sobre plantas cultivadas, e todos os órgãos constituem uma fonte promissora para a busca de compostos fitotóxicos. No segundo capítulo, foi investigado o potencial fitotóxico de frações do extrato bruto de folhas e raízes de D. brasiliensis sobre as plantas infestantes Panicum maximum Jacq e Euphorbia heterophylla L. As inibições no crescimento inicial, decorrentes da aplicação da fração hexânica das raízes, foram similares ao efeito produzido pelo herbicida oxyfluorfen, indicando a eficiência de D. brasiliensis para o controle das espécies infestantes estudadas. No terceiro capítulo, foi realizado o isolamento biomonitorado de compostos presentes em raízes de D. brasiliensis. Foram isolados quatro drimanos sesquiterpenos das frações bioativas de raízes, determinados como poligodial, poligodial 12 α-acetal, dendocarbin L e (+) fuegin. O poligodial exerceu efeitos fitotóxicos sobre coleóptilos de trigo e sobre duas espécies infestantes e uma cultivada avaliadas. No último capítulo, o efeito da fração hexânica e do poligodial obtidos de raízes de D. brasiliensis foi avaliado sobre Toxoptera citricidus Kirkaldy (pulgão-preto dos citros), e ambos causaram toxicidade, provocando elevada mortalidade nas fases de ninfas e adultos deste afídeo. O poligodial, isolado pela primeira vez nas raízes de D. brasiliensis, pode ser o principal responsável pelas atividades biológicas registradas neste estudo. Os resultados obtidos permitem a indicação deste composto como um potencial biopesticida.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:52:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5544.pdf: 7904470 bytes, checksum: 2c52d516eecc26e88a4a2c8e6feb1884 (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 / Universidade Federal de Minas Gerais / The Brazilian citrus business occupies a prominent place in the international market, with great economic and social significance in foreign exchange earnings and employment in the country respectively. In recent decades, the industry has been changing due to cyclical economic reasons, and these changes affect the harvesting process. In this context, the mechanization of the mentioned process diffuses as a possible alternative to reduce costs and increase productivity. However, the adoption of these new technologies in Brazilian orchards lacks analysis from the perspective of health and productivity, as opposed to the consolidated manual harvesting. The aim of this study is to bring a qualitative and quantitative comparison of the impacts on working conditions and productivity, between the use of manual harvesting methods and of multi-platform in São Paulo State orchards. On this purpose, it was used the approach of ergonomics analysis, focusing on activity, evaluating times and repeatability of cycles, as well as the amount of movements performed and energy expenditure for each of the methods. The results indicated a pronounced physical stress on the use of manual harvesting with increased caloric expenditure and amount of movements required to complete the harvest cycle. Despite evidence of work intensification in the use of platforms, this method has increased its viability by reducing the main constraints identified in the analysis of the collector‟s activity, especially those related to the use of stairs, as well as maintaining the quality of the fruit harvested. / A citricultura brasileira ocupa lugar de destaque no mercado internacional, com grande representatividade econômica e social na geração de divisas e empregos no país. Nas últimas décadas, o setor vem se alterando por razões conjunturais, com reflexos no processo de colheita. Neste contexto, a mecanização deste processo se difunde como alternativa possível para redução de custos e aumento de produtividade. Entretanto, a implantação destas novas tecnologias nos pomares brasileiros carece de análise do ponto de vista da saúde e produtividade, em contraponto ao uso consolidado da colheita manual. O objetivo deste estudo é trazer uma comparação qualitativa e quantitativa dos impactos nas condições de trabalho e produtividade, entre os métodos de colheita manual e com uso de multiplataformas nos pomares paulistas. Para isto, foi utilizada a abordagem da ergonomia situada, com foco na análise da atividade, avaliando tempos e repetitividade dos ciclos de colheita, bem como a quantidade de movimentos realizados e o gasto calórico, para cada um dos métodos. Os resultados apontaram para um desgaste físico acentuado no uso de colheita manual, com aumento do gasto calórico e da quantidade de movimentos necessária para completar o ciclo de colheita. Apesar dos indícios de intensificação do trabalho no uso de plataformas, esse método tem sua viabilidade aumentada por reduzir os principais constrangimentos identificados na análise da atividade do colhedor, com destaque para aqueles relacionados ao uso de escada, além de manter a qualidade do fruto colhido.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 438498 bytes, checksum: 4a13f8e4826b301b98520f80d321d762 (MD5) Previous issue date: 2013-03-25 / The conservation of Citrus seeds is one of the biggest problems faced by seedling producers due to low seed longevity of this species, which lose viability quickly, compromising the availability of viable seeds during sowing. Thus, the domain of seed conservation techniques is of great importance for the Brazilian citrus production systems, allowing the preservation and maintenance of genetic and buffer stocks to meet unpredictable needs. In this sense, this study aimed evaluates the quality of Rangpur lime, 'Cleopatra' mandarin and Swingle citrumelo seeds stored with different water contents in two environmental conditions. The seeds were harvested in the orchard of the Fruit Sector of the Department of Plant Science at UFV. After extraction, the seeds went through the process of degumming, being rubbed with lime and then washed in water to remove the mucilage. Drying was performed in the shade and in plastic trays for 6 days to obtain the desired moisture contents, which were 35%, 15% and 7%. Subsequently, the seeds were treated with the fungicide Captan 2 g/kg. Then the seeds were placed in hermetic containers, stored at room temperature and under refrigeration for 360 days. Every 90 days, i.e., to 0 (after harvest), 90, 180, 270 and 360 days were conducted the moisture content and germination tests. Regardless of the degree of humidity, was markedly decreased of seeds quality of all varieties stored at room temperature. Seeds of Rangpur lime with water content of 7% maintained high quality physiological stored in refrigerator for 360 days, which did not occur in room temperature storage, where viability was lost from 180 days. / A conservação de sementes dos Citrus é um dos maiores problemas enfrentados pelos viveiristas, devido à sua baixa longevidade, perdendo rapidamente a viabilidade e comprometendo a disponibilidade de sementes viáveis por ocasião da semeadura. Assim, o domínio de técnicas de conservação das sementes é de grande importância para a citricultura brasileira, permitindo a preservação de estoques genéticos e a manutenção de estoques reguladores, para atendimento de necessidades imprevisíveis. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade das sementes de limão 'Cravo', tangerina 'Cleópatra' e citrumelo 'Swingle' armazenadas com diferentes teores de água em duas condições de ambiente. As sementes foram colhidas no pomar do Setor da Fruticultura do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. Após a extração, as sementes passaram pelo processo de degomagem, sendo friccionadas com cal e depois lavadas em água corrente, para a retirada da mucilagem. A secagem foi realizada à sombra durante seis dias, para obtenção dos teores de água desejados, que foram 35%, 15% e 7%. Posteriormente, as sementes foram tratadas com o fungicida Captan 2 g/kg e, em seguida, acondicionadas em embalagens impermeáveis, armazenadas por 360 dias em temperatura ambiente e em ambiente refrigerado. A cada 90 dias, ou seja, a 0 (após a colheita), 90, 180, 270 e 360 dias, foram realizadas avaliações do grau de umidade, da germinação, do comprimento da parte aérea e das raízes e da massa seca das plântulas. Independentemente do grau de umidade, houve redução acentuada da qualidade fisiológica das sementes armazenadas em temperatura ambiente. Sementes de limão 'Cravo' com teor de água de 7% mantiveram alta qualidade fisiológica quando armazenadas em geladeira por 360 dias, e sementes de tangerina 'Cleópatra' armazenadas em ambiente refrigerado apresentaram qualidade fisiológica até os 270 dias, não sendo aconselhável o armazenamento das sementes de citrumelo 'Swingle' em temperatura ambiente após 90 dias.

Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-05-02T18:50:03Z No. of bitstreams: 1 RÔMULO CARANTINO LUCENA MOREIRA - DISSERTAÇÃO PPGSA ACADÊMICO 2016..pdf: 759575 bytes, checksum: 4aac2e1edbf081fcabeba6b5ea8b23fc (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-02T18:50:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RÔMULO CARANTINO LUCENA MOREIRA - DISSERTAÇÃO PPGSA ACADÊMICO 2016..pdf: 759575 bytes, checksum: 4aac2e1edbf081fcabeba6b5ea8b23fc (MD5) Previous issue date: 2016-09 / A citricultura desempenha papel fundamental do ponto de vista social e econômico sendo produzido em quase todo o território nacional geral emprego e renda a pequenos, médios e grandes produtores. As regiões semiáridas e áridas do Brasil são caracterizadas por apresentar insuficiência hídrica e irregularidade de distribuição das chuvas e, desta forma o sistema de produção necessariamente depende da irrigação quem nem sempre disponibiliza de águas de boa qualidade. Diante disto objetiva-se estudar a tolerância de mudas de limão ‘Tahiti’ com distintos portaenxertos oriundos do cruzamento da tangerineira Sunki da Flórida (TSKFL) x Poncirus trifoliata Beneke (TRBK) sob irrigação com águas salinizadas durante a fase de formação do copa/porta-enxerto em casa de vegetação. O experimento foi conduzido em ambiente protegido (casa de vegetação) do Centro de Ciências e Tecnologia Agroalimentar da Universidade Federal de Campina Grande (CCTA/UFCG), localizado no município de Pombal-PB. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso, e tratamentos arranjados em esquema fatorial, 2 x (19+3), relativos a dois níveis de salinidade da água de irrigação (0,3 e 3,0 dS m-1) e 22 combinações copa/genótipos. Utilizaram-se quatro blocos, com uma planta útil por parcela, totalizando 44 tratamentos e 176 parcelas. O aumento da salinidade da água elevou a condutividade elétrica do estrato de saturação e os teores de sais solúveis no substrato. A irrigação com água com água salina reduziu o acúmulo de fitomassa dos genótipos de citros, com exceção dos genótipos TSKFL X TRBK – 19, TSKFL X TRBK – 24, TSKFL X TRBK – 30, TSKFL X TRBK – 39, TSKFL X TRBK – 43, LCRSTC, LVK x LCR-038, identificados como tolerantes à salinidade. A combinação de ‘Tahiti’ com TSKFL X TRBK – 41 e SUNKI TROPICAL foram considerados sensíveis à salinidade dentre os materiais estudados. / Citriculture plays a fundamental role from the social and economic point of view, being produced in almost all the national territory general employment and income to small, medium and large producers. The semi-arid and arid regions of Brazil are characterized by water deficiency and irregular distribution of rainfall and, therefore, the production system necessarily depends on irrigation, which does not always provide good quality water. The objective of this study was to study the tolerance of 'Tahiti' lemon seedlings with different rootstocks of the Florida Sunki (TSKFL) and Poncirus trifoliata Beneke (TRBK) crosses irrigated with salinized waters during the crown formation / Rootstock greenhouse phase. The experiment was carried out in a protected environment (greenhouse) of the Center for Science and Technology Agro-Food of the Federal University of Campina Grande (CCTA / UFCG), located in the municipality of Pombal-PB. The experimental design was a randomized complete block design and treatments arranged in a 2 x factorial scheme (19 + 3), related to two irrigation water salinity levels (0.3 and 3.0 dS m-1) and 22 combinations/Genotypes. Four blocks were used, with one useful plant per plot, totaling 44 treatments and 176 plots. The increase of water salinity increased the electrical conductivity of the saturation stratum and the contents of soluble salts in the substrate. Irrigation with saline water reduced the phytomass accumulation of citrus genotypes, with the exception of TSKFL X TRBK - 19, TSKFL X TRBK - 24, TSKFL X TRBK - 30, TSKFL X TRBK - 39, TSKFL X TRBK - 43, LCRSTC, LVK X LCR-038, identified as salinity tolerant. The combination of 'Tahiti' with TSKFL X TRBK - 41 and SUNKI TROPICAL was considered sensitive to salinity among the studied materials.

Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-05-16T15:33:54Z No. of bitstreams: 1 ROBERTA CHAIENE ALMEIDA BARBOSA - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2013..pdf: 3526390 bytes, checksum: a21451c4bc6f201df292553f64e31284 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T15:33:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ROBERTA CHAIENE ALMEIDA BARBOSA - DISSERTAÇÃO PPGSA PROFISSIONAL 2013..pdf: 3526390 bytes, checksum: a21451c4bc6f201df292553f64e31284 (MD5) Previous issue date: 2013-11-21 / A citricultura é uma atividade importante para a região Nordeste do Brasil devido à geração de emprego e renda, porém, nessa região, a produtividade das árvores cítricas é reduzida em consequência da irregularidade das chuvas e ocorrência de estiagens e secas, havendo, nessas condições, a necessidade de irrigação. Como em vários locais as águas são salinas, com concentrações variadas de sais, são relevantes as pesquisas visando à sua utilização onde se fazem escassos os recursos hídricos de melhor qualidade. Assim, objetivou-se estudar o crescimento e a fisiologia de genótipos de citros, recomendados como porta-enxertos, sob diferentes níveis de salinidade da água de irrigação, visando à identificação de genótipos tolerantes e sensíveis ao estresse salino. O experimento foi conduzido em ambiente protegido de adversidades climáticas, no Campus da UFCG, em Pombal- PB, utilizando-se do delineamento experimental em blocos casualizados, com três repetições, composto por esquema fatorial, 8 x 5, sendo 8 genótipos de citros [limoeiro ‘Cravo Santa Cruz’ (LCRSTC), tangerineira ‘Sunki Comum’ (TSKC) x citrumelo ‘Swingle’ (CTSW) - 028, TSKC x CTSW - 033, TSKC x CTSW - 041, limoeiro ‘Volkameriano’ (LVK) x limoeiro ‘Cravo’ (LCR) - 038, tangerineira ‘Sunki da Flórida’ (TSKFL), TSKC e limoeiro ‘Rugoso da Flórida’ (LRF)] e 5 níveis de salinidade da água de irrigação (irrigação com águas de condutividade elétrica de 0,8; 1,6; 2,4; 3,2 e 4,0 dS m-1), até 120 dias após semeadura. Foram avaliadas variáveis de crescimento e fisiológicas, sendo os dados submetidos à análise de variância, nos casos de significância, foi realizada análise de regressão para o fator salinidade da água de irrigação e o teste de médias (Tukey) entre salinidades em cada época de avaliação nas trocas gasosas. Verificou-se que a concentração de sais na água de drenagem foi o dobro da concentração da água salina aplicada. As taxas de crescimento relativo são mais afetadas pela salinidade do que as variáveis em si (altura de planta, diâmetro do colo e número de folhas). A salinidade reduziu o crescimento da maioria dos genótipos de citros, podendo-se utilizar água de até 2,4 dS m-1 para irrigá-los e garantir um crescimento satisfatório; o maior crescimento foi observado no genótipo TSKFL; com relação às trocas gasosas, a variável mais afetada pela salinidade foi a condutância estomática; quando se produz porta-enxertos em tubetes de 115 mL, o período ideal para avaliação de trocas gasosas é aos 75 dias após semeadura. A salinidade não exerceu efeito significativo sobre os parâmetros da fluorescência da clorofila a em nenhum dos períodos avaliados. Relacionando-se às variáveis de crescimento o genótipo menos sensível à salinidade foi o híbrido TSKC x CTSW - 041 e o mais sensível foi o LRF. / The citrus industry is an important activity for the Northeast region of Brazil due to the generation of employment and income , however, in this region , the productivity of citrus trees is reduced as a result of erratic rainfall and occurrence of droughts and dry , and there , under these conditions the need for irrigation . As in many places the water is saline, with varying concentrations of salts, are relevant studies aiming at the use where water resources are scarce best quality. Thus, the objective was to study the growth and physiology of citrus genotypes, as recommended rootstocks under different levels of salinity of irrigation water, in order to identify tolerant and susceptible genotypes to salt stress. The experiment was conducted in greenhouse climate adversities , Campus UFCG in Pombal -PB , using the randomized complete block design with three replications , consisting of factorial , 8 x 5 , 8 genotypes of citrus [Rangpur lime Santa Cruz ' ( LCRSTC ) , tangerine' Sunki Common ' ( TSKC ) x Swingle Swingle' ( CTSW ) - 028 x TSKC CTSW - 033 x TSKC CTSW - 041 , 'Volkamer' lemon ( LVK ) x lemon Rangpur ( LCR ) - 038 , tangerine ' Sunki Florida ' ( TSKFL ) , and TSKC 'Rugoso Florida ' ( LRF ) ] and 5 salinity levels of irrigation water (irrigation water with electrical conductivity of 0 , 8 , 1.6, 2.4 , 3.2 and 4.0 dS m - 1 ) , up to 120 days after sowing. Growth and physiological variables were assessed, data were submitted to analysis of variance in cases of significance, and regression analysis was conducted for the factor salinity of irrigation water and the means (Tukey) between salinities at each assessment time in gas exchange. It was found that the concentration of salts in the water drainage was twice the concentration of salt water applied. The relative growth rates are more affected by salinity than the variable itself (plant height, stem diameter and number of leaves). The salinity reduced the growth of most citrus genotypes, water may be used up to 2.4 dS m-1 to irrigate them and a satisfactory growth, the highest growth was observed in TSKFL genotype, with respect to gas exchange, the variable most affected by salinity is stomatal conductance, when producing rootstocks in tubes of 115ml, ideal for evaluation of gas exchange period is 75 days after sowing. Salinity did not have significant effect on the parameters of chlorophyll a fluorescence in both seasons. Relating to the growth variables genotype less sensitive to salinity was the hybrid TSKC x CTSW - 041 and the most sensitive was the LRF.

O gênero Xylella é composto de uma única espécie, Xylella fastidiosa, bactéria Gram-negativa, não flagelada, que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo. Em algumas dessas plantas, a bactéria é considerada agente causal de doenças, como a Clorose Variegada do Citros em laranjeiras, a Doença de Pierce das videiras e escaldadura da folha de cafeeiro. Onze diferentes cepas de X. fastidiosa, isoladas de distintos hospedeiros, já tiveram seus genomas sequenciados, entre essas, as cepas 9a5c, isolada de laranjeira, e Temecula 1, isolada de videira. Análises desses genomas indicam uma razoável variabilidade entre suas respectivas sequências e evidenciam vários genes associados a mecanismos de virulência e patogenicidade desta bactéria. No presente trabalho descrevemos o sequenciamento, a montagem e a anotação dos genomas das cepas U24d e Fb7, isoladas de laranjeiras, e da cepa 3124 isolada de cafeeiro, os quais apresentam, respectivamente 2.681.334 pb, 2.733.974 pb e 2.748.594 pb. Destas, apenas a cepa U24d apresenta um plasmídeo, o qual é idêntico ao pXF51 previamente identificado na cepa 9a5c. O genoma da cepa U24d é praticamente colinear ao genoma da cepa 9a5c enquanto que os genomas das cepas Fb7 e 3124 apresentaram maior colinearidade com a cepa Temecula1. Entre as diversas alterações encontradas nas análises comparativas destes genomas, destacamos a inserção no gene pilQ verificada no genoma da cepa U24d. Essa mutação causa ausência do pilus do tipo IV com consequente deficiência na motilidade twitching, sendo que plantas infectadas com a cepa U24d apresentam sintomas localizados restritos ao ponto de inoculação. Na cepa Fb7, detectamos a ausência de formação de biofilme no cultivo in vitro possivelmente devido ausência da expressão dos transcritos de mrkD e pspA, que codificam respectivamente adesina do pilus curto e adesina similar à hemaglutinina. Postulamos que estes genes não são expressos em decorrência de um defeito na via de sinalização de DSF (Fator de Sinalização Difusível) reflexo de uma mutação em rpfC no genoma de Fb7. Assim como as demais cepas de X. fastidiosa, também os genomas de U24d, Fb7 e 3124 apresentaram elevado conteúdo de Elementos Genéticos Móveis (EGM), que aparecem em maior número nas cepas sul-americanas. Os estudos do pangenoma de X. fastidiosa mostraram que essa espécie tem um genoma aberto e grande parte dos genes de EGMs correspondem a genes acessórios. A grande quantidade de EGMs em X. fastidiosa pode estar relacionada a falta do sistema CRISPR/cas completo, um provável resultado de eventos de erosão do genoma desta espécie. A inferência filogenética por MSLA mostrou uma clara distinção dos grupos de cepas da América do Norte em relação às do Sul, sugerindo a ocorrência de mais eventos de recombinações genéticas nas cepas sul-americanas, provavelmente pela falta de isolamento geográfico. Assim, é possível que as cepas norte e sul-americanas sofreram divergência alopátrica e simpátrica, respectivamente. / The genus Xylella consists of a single species, Xylella fastidiosa, a Gram-negative and non-flagellated bacterium that colonizes the xylem of a diversity of cultivated and wild plants in several parts of the world. In some of these plants, this bacterium is considered causal agent of diseases such as the Citrus Variegated Cholorosis in orange trees, Pierce\'s Disease of grapevines and coffee leaf scald. Eleven different strains of X. fastidiosa isolated from different hosts had their genomes sequenced, including 9a5c and Temecula1 strains, respectively isolated from orange tree and grapevine. Analyses of these genomes indicate a reasonable variability in their sequences and showed several genes associated with pathogenicity and virulence mechanisms of this bacterium. In this work we describe the genome sequencing, assembly and annotation of the strains U24d and Fb7, isolated from orange trees, and 3124 isolated from coffee, which have, respectively, 2,681,334 bp, 2,733,974 bp and 2,748,594 bp. Of these, only strain U24d has a plasmid, identical to pXF51 from strain 9a5c. The genome of U24d strain is almost collinear to the genome of strain 9a5c while the genomes of strains Fb7 and 3124 had higher collinearity to Temecula1 strain. Among many changes found in the comparative analysis of these genomes, we highlight an on insertion in pilQ gene that was found in U24d strain genome. This mutation causes lack of type IV pilus with a consequent deficiency in twitching motility. Moreover orange trees infected with U24d strain showed localized symptoms near to the inoculation point. We verified that Fb7 strain does not form biofilm in vitro possibly due to the absence of expression of mrkD and pspA transcripts, which encode, respectively, a short pilus adhesin and a hemagglutinin-like adhesin. We postulate that these genes are not expressed due to a defect in the signaling pathway of DSF (Diffusible Signal Factor) reflecting a mutation on rpfC in the Fb7 genome. Similarly to other X. fastidiosa strains, the genomes of U24d, Fb7 and 3124 also showed high content of mobile genetic elements (MGE), which appear in larger numbers in South American strains. Pan genome studies of X. fastidiosa showed that this species has a open genome and that most of MGE genes correspond to accessory genes. The large number of MGE in X. fastidiosa may be related to the lack of a complete system CRISPR/cas, likely a result of erosion events of the genome of this species. The phylogenetic reconstruction by MLSA showed a clear distinction between groups of strains from North and South America, suggesting the occurrence of more recombination events in South American strains, probably due to lack of geographical isolation. Thus it is possible that North and South American strains underwent allopatric and sympatric divergence, respectively.

A clorose variegada dos citros (CVC) é uma das principais doenças que afeta a citricultura brasileira, causada pela bactéria Xylella fastidiosa (Wells), que coloniza o xilema de culturas de interesse econômico, além de plantas ornamentais e daninhas, sendo transmitida por cigarrinhas (Hemiptera: Cicadellidae: Cicadellinae). A compreensão do patossistema CVC é fundamental para planejar táticas eficazes de controle da doença. Entretanto, as pesquisas sobre interações patógeno-planta-vetores são escassas, devido à falta de plantas hospedeiras adequadas para ensaios de transmissão da bactéria, visto que citros não é um bom hospedeiro experimental. Assim, nesta pesquisa objetivou-se identificar espécies herbáceas que permitam a colonização sistêmica da estirpe de X. fastidiosa de citros, e avaliar seu uso como plantas-fonte e plantas-teste (indicadoras) em testes de transmissão por Bucephalogonia xanthophis (Berg). Para tal foram escolhidas as plantas Bidens pilosa L., Catharanthus roseus L., Citrus sinensis (L.) Osbeck, Medicago sativa L., Nicotiana tabacum L., Ocimum basilicum L., Parthenium hysterophorus L., Phaseolus vulgaris L., Sida rhombifolia L. e Solanum americanum Mill, que foram inoculadas mecanicamente com isolados de X. fastidiosa de citros e posteriormente avaliadas quanto à infecção por isolamento primário e reação de cadeia da polimerase (PCR). As espécies que permitiram colonização bacteriana foram posteriormente avaliadas em experimentos de transmissão por B. xanthophis, sendo divididos em duas etapas. Na primeira delas, variaram-se as espécies de plantas-fonte para aquisição da bactéria e fixou-se C. roseus como planta-teste para inoculação. Na segunda etapa, fixou-se C. roseus como planta-fonte e variaram-se as espécies de planta-teste. Durante os experimentos de transmissão, foram avaliados dois parâmetros biológicos de B. xanthophis: mortalidade (%) e volume de honeydew excretado (medida indireta de ingestão). Entre 30 a 90 dias após a inoculação, as plantas-testes foram analisadas quanto à infecção bacteriana por meio de PCR e isolamento. As inoculações mecânicas mostraram colonização sistêmica e multiplicação de X. fastidiosa em sete espécies vegetais (B. pilosa, C. roseus, C. sinensis, M. sativa, N. tabacum, O. basilicum e S. americanum), com maiores taxas de infecção e populações bacterianas em C. roseus e N. tabacum. As espécies C. roseus, M. sativa e O. basilicum, quando usadas como plantas-fonte de X. fastidiosa, propiciaram maiores volumes de excreção e menores taxas de mortalidade (15, 20 e 20%) da cigarrinha após 48 h de acesso à aquisição da bactéria. No experimento de transmissão com variação de espécies de plantas-teste, detectou-se a inoculação pelo vetor em C. roseus, M. sativa, O. basilicum e S. americanum, com maior proporção de plantas positivas (cerca de 20%) para as duas primeiras. Dentre essas espécies, C. roseus e M. sativa são as indicadoras mais adequadas para ensaios de transmissão de X. fastidiosa por B. xanthophis, sendo a primeira também adequada como planta-fonte. / Citrus variegated chlorosis (CVC) is a major disease that affects the Brazilian citrus industry, caused by the xylem-limited bacterium Xylella fastidiosa (Wells), which colonizes several crop plants, ornamentals and weeds, and is transmitted by sharpshooter leafhoppers (Hemiptera: Cicadellidae: Cicadellinae). A better understanding of the CVC pathossystem is critical for developing effective tactics to control the disease. However, research on the relationships among pathogen strains, host plants and insect vectors associated with CVC is scarce, partly because of the lack of adequate host plants for transmission assays, since citrus is not a suitable experimental host for this purpose. Thus, the present study aimed to identify herbaceous plants that allow systemic colonization of citrus strains of X. fastidiosa, and evaluate them as source and test (indicator) plants in transmission assays by the sharpshooter Bucephalogonia xanthophis (Berg). Ten plant species, Bidens pilosa L., Catharanthus roseus L., Citrus sinensis (L.) Osbeck, Medicago sativa L., Nicotiana tabacum L., Ocimum basilicum L., Parthenium hysterophorus L., Phaseolus vulgaris L., Sida rhombifolia L. and Solanum americanum Mill were mechanically inoculated with citrus isolates of X. fastidiosa and then evaluated for bacterial infection by primary isolation in culture medium and polymerase chain reaction (PCR). Those plant species that allowed bacterial colonization were later evaluated in two transmission experiments by B. xanthophis, In the first experiment, different plant species were tested as source plants for bacterial acquisition and transmission to C. roseus (test plant). In the second one, C. roseus was used as a source plant and different plant species were evaluated as test (indicator) plants for bacterial inoculation. During the transmission experiments, two biological parameters of B. xanthophis were evaluated: mortality rate (%) and honeydew excretion (as an indirect measure of ingestion). Between 30 and 90 days after inoculation, the test plants were analyzed for X. fastidiosa infection by PCR and culturing. The mechanical inoculation experiments showed systemic colonization and multiplication of X. fastidiosa in seven plant species (B. pilosa, C. roseus, C. sinensis, M. sativa, N. tabacum, O. basilicum and S. americanum), with higher rates of infection and bacterial populations of C. roseus and N. tabacum. The species C. roseus, M. sativa and O. basilicum, when used as source plants of X. fastidiosa, allowed higher ingestion (honeydew excretion) rates and lower mortality (15, 20 and 20%) of B. xanthophis during the 48-h acquisition access period. In the transmission experiment with different species of test plants, X. fastidiosa inoculation by the vector was detected in C. roseus, M. sativa, O. basilicum and S. americanum, with a higher rate of infected plants (about 20%) in the former two species. Among the herbaceous plant species evaluated in this research, C. roseus and M. sativa are the most appropriate indicator hosts of X. fastidiosa infection for transmission assays by B. xanthophis, whereas the former species is also suitable as a source plant.

Este trabalho foi realizado com o objetivo de identificar cigarrinhas vetoras ou potenciais vetoras de Xylella fastidiosa Wells et al. em pomares cítricos do litoral norte da Bahia, determinando-se as espécies predominantes com ênfase na subfamília Cicadellinae. Os levantamentos foram conduzidos no período de março/2002 a fevereiro/2003, em cinco propriedades do litoral norte do Estado da Bahia, nos municípios de Alagoinhas, Inhambupe e Rio Real, em pomares de laranja doce [Citrus sinensis (L.) Osbeck] cv. Pêra, enxertada sobre limão cravo (Citrus limonia Osbeck) com idade de 7 a 9 anos. Em cada pomar, foram instalados 15 cartões adesivos amarelos de 8,5 X 11,5 cm, dispostos em um espaçamento de 40x40 m. Os cartões foram amarrados a 1,5 m de altura em ramos da face norte, na periferia da copa, sendo substituídos periodicamente. Também foram realizadas avaliações periódicas na vegetação rasteira presente nas entrelinhas dos pomares através de rede de varredura, amostrando-se, em cada avaliação, cinco pontos escolhidos aleatoriamente e efetuando-se 30 redadas por ponto. Os dados de coleta foram submetidos a uma análise faunística, calculando-se os índices de constância, freqüência, abundância, dominância, diversidade, eqüitabilidade e similaridade. Coletaram-se 1860 espécimes pertencentes a 54 espécies de sete famílias da subordem Auchenorrhyncha, sendo a maioria deles das famílias Cicadellidae (84,3%) e Membracidae (14,2%). Um maior número de espécies de Auchenorrhynca foi observado em pomar vizinho a mata nativa pouco degradada. A subfamília Cicadellinae, que inclui os vetores de X. fastidiosa, foi a mais representativa em número de espécies (15) e de indivíduos coletados (63,92%). Observou-se variação na composição de espécies de Cicadellinae dependendo do método e local de amostragem, evidenciando-se a existência de dois grupos de potenciais vetores habitando a copa das laranjeiras e a vegetação rasteira. Acrogonia flagellata Young, A. citrina Marucci & Cavichioli, Homalodica sp. e Cicadellini sp.1 predominaram nos cartões adesivos amarelos (árvores cítricas), enquanto que Hortensia similis (Walker) e Erythrogonia dubia (Medler) foram dominantes na rede de varredura (vegetação rasteira). Entre as espécies de Cicadellinae já conhecidas como vetoras de X. fastidiosa em citros, apenas A. citrina, Bucephalogonia xanthophis (Berg) e Ferrariana trivittata (Signoret) foram observadas, sendo que as duas últimas foram de ocorrência acidental na vegetação rasteira. Entre os novos potenciais vetores, A. flagellata, Homalodisca sp. e Cicadellini sp.1 são espécies predominantes nos pomares cítricos do litoral norte da Bahia, devendo ser investigadas quanto à capacidade de transmissão de X. fastidiosa para citros. / This study was carried out to identify vectors or potential vectors of Xylella fastidiosa Wells et al. in citrus groves of the north coast of Bahia State, Brazil, based on a faunistic survey and determination of predominant sharpshooter leafhoppers (subfamily Cicadellinae). The survey was carried out from March/2002 to February/2003 in five old sweet orange [Citrus sinensis (L.) Osbeck, cv. Pêra, grafted on rangpur lime (Citrus limonia Osbeck); 7-9 years old] groves of northeastern Bahia State, located in Alagoinhas, Inhambupe and Rio Real. Fifteen yellow sticky cards (8,5 X 11,5 cm) were installed 40x40 m apart in each grove, hanged at the height of 1.5 m on the upper north side of citrus canopies. Cards were replaced monthly or fortnightly. A sweep net was periodically used to sample leafhoppers in the herbaceous weeds inside the groves, by selecting five points at random and performing 30 sweeps in each point (sample unit). Data was uses to calculate indices of constancy, frequency, abundance, dominance, diversity, equitability and similarity. A total of 1860 specimens of 54 species belonging to 7 families of suborder Auchenorrhyncha were collected, most of them in the families Cicadellidae (84,3%) and Membracidae (14,2%). A larger number of species was observed in a grove located nearby a non-degraded native wood. The subfamily Cicadellinae, which includes the sharphooter vectors of X. fastidiosa, showed the largest number of species (15) and specimens (63,92%). There was a variation in Cicadellinae species composition depending upon the sampling method, which indicates that two distinct groups of potential sharpshooter vectors are inhabiting the citrus canopy and the weedy vegetation. Acrogonia flagellata Young, A. citrina Marucci & Cavichioli, Homalodica sp. e Cicadellini sp.1 predominate in the yellow sticky cards hanged on the citrus canopy, whereas Hortensia similis (Walker) e Erythrogonia dubia (Medler) were dominant species on weeds. Among the Cicadellinae species already known as vectors of X. fastidiosa in citrus, only A. citrina, Bucephalogonia xanthophis (Berg) e Ferrariana trivittata (Signoret) were found; the two latter species were accidentally trapped by sweep net in the weedy vegetation. Among the new potential vectors, A. flagellata, Homalodisca sp. e Cicadellini sp.1 are predominant species in citrus groves of the north coast of Bahia and should be tested with respect to their ability to transmit X. fastidiosa to citrus.

Com o objetivo de avaliar o potencial de utilização de espécies/linhagens de Trichogramma como mais um componente do manejo de Ecdytolopha aurantiana (Lima, 1927), importante praga da citricultura paulista, foram realizadas avaliações biológicas envolvendo seleção de linhagens, biologia em diferentes temperaturas, exigências térmicas, capacidade de parasitismo e número de ideal de parasitóides a ser liberado por ovo da praga. A seleção de linhagens/espécies de Trichogramma é básica para o controle de E. aurantiana, pois ocorreu uma grande variação no parasitismo de ovos da praga dentre os vários materiais biológicos estudados. A razão sexual das espécies/linhagens não foi afetada pela temperatura na faixa de 18 a 32ºC, sendo a temperatura de 25ºC a mais adequada para as espécies/linhagens estudadas. A duração do período ovo-adulto de T. atopovirilia Oatman & Platner, 1983 e de T. pretiosum Riley, 1879 foi inversamente relacionada como aumento da temperatura, na faixa térmica de 18 a 32ºC, sendo as exigências térmicas dessas espécies muito próximas, em torno de 108 GD. O hospedeiro de criação natural, E. aurantiana ou o alternativo, Anagasta kuehniella (Zeller, 1879) não afetaram o parasitismo das espécies/linhagens selecionadas. Em laboratório, obteve-se maior parasitismo expondo-se 30 ovos de E. aurantiana por fêmea de Trichogramma spp. durante 34 horas. As maiores taxas de parasitismo de ovos de bicho-furão para as duas espécies/linhagens ocorreram quando os parasitóides foram provenientes de ovos de E. aurantiana. A proporção estimada de 36 parasitóides por ovo de E. aurantiana possibilitou a maior porcentagem de parasitismo por T. pretiosum. Os resultados obtidos indicaram que os parasitóides de ovos do gênero Trichogramma apresentam potencial de controle de E. aurantiana, desde que liberados em grandes quantidades por unidade de área e em torno das plantas. / In order to evaluate the potential of use of Trichogramma species/strains as an additional component in the management of Ecdytolopha aurantiana (Lima, 1927), an important pest of Citrus in the state of São Paulo, biological trials were carried out involving strain selection, biology at different temperatures, thermal requirements, parasitism capacity and optimal number of parasitoids to be released per pest egg. The selection of Trichogramma strains/species is basic to control E. aurantiana for the egg parasitism of the pest varied greatly among several biological materials studied. The sex ratio of the species/strains was not affected by the temperature at a 18-32ºC range, and 25ºC was the more suitable temperature for the species/strains studied. The duration of the egg-adult period of T. atopovirilia Oatman & Platner, 1983 and T. pretiosum Riley, 1879 was inversely related to the increased temperature at a thermal range of 18-32ºC, and the thermal requirements of these species are very close, ranging 108 DD (degree days). Neither the natural rearing host, E. aurantiana, nor the factitious host, Anagasta kuehniella (Zeller, 1879) affected the parasitism of the selected species/strains. The proportion of 30 eggs of E. aurantiana per Trichogramma spp. female provided a higher parasistism rate, with eggs exposed to the parasitoid for 34 hours. The higher parasitism rates of the eggs of citrus fruit borer for the two species/strains occurred when the parasitoids were reared on eggs of E. aurantiana. The estimated ratio of 36 parasitoids per egg of E. aurantiana allowed a higher parasitism percentage of T. pretiosum. The results achieved showed that the egg parasitoids of Trichogramma have a potential to control E. aurantiana provided that they are released in large amounts per area unit and surrounding the plants.