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Probing bacterial uptake of glycosylated ciprofloxacin conjugates

Milner, S.J., Carrick, C. ., Kerr, Kevin G., Snelling, Anna M., Thomas, G.H., Duhme-Klair, A-K., Routledge, A. January 2014 (has links)
No / Mono- and disaccharide-functionalised conjugates of the fluoroquinolone antibiotic ciprofloxacin have been synthesised and used as chemical probes of the bacterial uptake of glycosylated ciprofloxacin. Their antimicrobial activities against a panel of clinically relevant bacteria were determined: the ability of these conjugates to inhibit their target DNA gyrase and to be transported into the bacteria was assessed by using in vivo and in vitro assays. The data suggest a lack of active uptake through sugar transporters and that although the addition of monosaccharides is compatible with the inhibition of DNA gyrase, the addition of a disaccharide results in a significant decrease in antimicrobial activity.
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Effects of Andrographis paniculata (Burm.F.) Nees on performance, mortality and coccidiosis in broiler chickens

Tipakorn, Naiyana 06 May 2002 (has links)
No description available.
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Avaliação de feridas crônicas em pacientes atendidos em Unidades Básicas de Saúde de Goiânia / Assessing of chronic wounds in outpatients treated at basic health unit in goiania

MARTINS, Marlene Andrade 30 April 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:04:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao marleneandrade.pdf: 776220 bytes, checksum: 89f7e969fbef687591092b3ded9dd40a (MD5) Previous issue date: 2008-04-30 / Assessing patients with chronic wounds poses a challenge to professionals and doubts still persist concerning characterization of the wound infection status. We believe that the Basic Health Units are in places of reference for the public to submit chronic wounds and should have full attendance and resolution were objectives of this study: characterizing patients with chronic wounds attended as spontaneous demand in the bandage room; characterizing patients chronic wounds regarding the presence of classical signs and additional infection criteria; isolating and identifying aerobic bacteria and fungi in the samples of chronic wounds clinically signaling to infection; verifying strains susceptibility when isolated before antimicrobial agents often used in praxis as well as new antibiotics and analyzing the relationship of local factors with infection status. This is a cross-sectional study, carried out in ambulatory bandage rooms in basic health units with emergency service in the municipality of Goiânia. Data was collected from June to July, in 2007. Data was obtained through the use of structured interviews containing questions about characterization of patients and a check list for the assessment of chronic wounds through the signs and clinical symptoms indicating infection and analysis of wound samples by using swabs in accordance with Levine s technique. After consent and approval of the ethics committee, 46 patients were evaluated and 60 wound samples were assessed. Data bank was organized in Excel table and statistics analysis in SPSS- 15.0. The average age was 55 years, 37 (80.4%) male, 20 (43.5%) belonging to E social class, 23 (50%) retired people having basic sanitation items. 28 (61%) presented venous ulcerated lower limbs, 31 (67.4%) performed the bandage both in the BHU and at home. 45 (75%) out of 60 wounds were infected and 15 (25%) noninfected. Through bivariate analysis we verified an association of the infection status with the following characteristics: width depth of tissular damage, necrotic tissue and exudate amount. Among signs and symptoms, classical ones occurred in a frequency higher than 65% both in the infected and noninfected group. Regarding the additional ones, we verified variance in occurrence in both wound groups. Staphylococcus aureus was predominat in 65% of cases and was sensitive to most antibiotics tested. Among Gram-negative bacteria the most frequent were: Pseudomonas aeruginosa (23%), resistant to amoxylin +clavulanic acid, cefalexin and cefotaxim; Proteus mirabilis (16.6%) and Proteus vulgaris (15.0%), all sensitive to gentamicin, aztreonam, ciprofloxacin, and amicacin. These results indicate the need to structure an integrated net to treat patients with chronic wounds and evidence additional criteria to be employed in the elaboration of service protocols pursuing improvement of quality of assistance given in basic health units. / A avaliação de pacientes com feridas crônicas representa um desafio para os profissionais, e dúvidas, ainda persistem em torno da caracterização do status de infecção, nessas lesões. As Unidades Básicas de Saúde constituem-se locais de referência para a população portadora de feridas crônicas, onde deveriam ter atendimento integral e resolutividade. Objetivos deste estudo: caracterizar os pacientes com feridas crônicas, atendidos como demanda espontânea, na sala de curativos; caracterizar as feridas crônicas dos pacientes atendidos em relação à presença de sinais clássicos e critérios adicionais de infecção; isolar e identificar bactérias aeróbias e fungos das amostras de feridas crônicas, com indícios clínicos de infecção; verificar a susceptibilidade das cepas isoladas, frente aos antimicrobianos freqüentemente utilizados na prática e novos antibióticos, e analisar a relação de fatores locais, com o status de infecção. Trata-se de estudo transversal, realizado em Salas de Curativos Ambulatoriais de Unidades Básicas de Saúde (UBS), com atendimento de urgência do Município de Goiânia. Os dados foram coletados no período de junho a julho de 2007 e obtidos por meio de entrevista com roteiro estruturado, contendo questões de caracterização dos pacientes e de um check-list, para a avaliação das feridas crônicas, por meio dos sinais e sintomas clínicos indicativos de infecção, e análise de amostras de feridas utilizando o swab, mediante técnica de Levine. Após aprovação pelo Comitê de Ética e Consentimento, foram avaliados 46 pacientes, e analisadas amostras de 60 feridas. Os programas computacionais utilizados para organizar e analisar estatisticamente os dados foram: o Excel e o SPSS (versão 15.0), respectivamente. A média de idade foi de 55 anos, 37 (80,4%) eram do sexo masculino, 20 (43.5%) pertenciam à classe social E, 23 (50%) eram aposentados e possuíam itens de saneamento básico, 28 (61%) apresentaram úlceras venosas, localizadas nos membros inferiores, 31 (67,4%) realizavam o curativo nas UBS ou em domicílios. Das 60 lesões, 45 (75%) estavam infectadas e 15 (25%) não infectadas. Mediante análise bivariada, verificaram-se associação com o status de infecção as seguintes características: profundidade da extensão do dano tissular, quantidade de tecido necrótico e exsudato. Dentre os sinais e sintomas, os clássicos ocorreram numa freqüência superior a 65%, tanto no grupo de infectadas quanto não infectadas, e nos adicionais verificou-se variação na ocorrência, em ambos os grupos de feridas. Houve predominância do Staphylococcus aureus em 65% dos casos e a maioria sensível aos antibióticos testados. Entre as bactérias Gram-negativas, as mais freqüentes foram: Pseudomonas aeruginosa (23,3%), resistentes à amoxicilina+ácido clavulânico, cefalexina e cefotaxima; Proteus mirabilis (16,6%) e Proteus vulgaris (15,0%) sensíveis a gentamicina, aztreonam, ciprofloxacino e amicacina. Estes resultados indicam a necessidade de se estruturar uma rede integrada, para o atendimento dos pacientes com feridas crônicas. Também evidenciam critérios adicionais que podem ser empregados na elaboração do protocolo de atendimento, buscando a melhoria da qualidade da assistência prestada nas unidades básicas de saúde.
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Monitoramento e caracterização molecular de Staphylococcus aureus em lesões cutâneas crônicas tratadas com hidrogel e placa de poliuretano

Barreto, Bruna Maiara Ferreira January 2015 (has links)
Submitted by Fabiana Gonçalves Pinto (benf@ndc.uff.br) on 2016-10-14T16:58:18Z No. of bitstreams: 1 Bruna Maiara Ferreira Barreto.pdf: 2112648 bytes, checksum: 4c761e7719f7c47c46f78b5978ed12be (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-14T16:58:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruna Maiara Ferreira Barreto.pdf: 2112648 bytes, checksum: 4c761e7719f7c47c46f78b5978ed12be (MD5) Previous issue date: 2015 / Mestrado Acadêmico em Ciências do Cuidado em Saúde / Este estudo teve como objetivo analisar a presença de cepas de Staphylococcus aureus nas lesões cutâneas crônicas tratadas com hidrogel a 2% e placa de poliuretano. Para tal, foi realizada pesquisa descritiva, com abordagem quantitativa, tendo como campo de pesquisa o Ambulatório de Reparo de Feridas do Hospital Universitário Antônio Pedro (HUAP/UFF) e a Policlínica Comunitária da Engenhoca (PCE), ambos localizados na cidade de Niterói, RJ. A análise microbiológica foi realizada no Laboratório de Controle Microbiológico da Faculdade de Farmácia da Universidade Federal Fluminense (UFF) e no Instituto de Microbiologia Paulo de Góes da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). A coleta de dados foi realizada em duas etapas, a primeira relacionada ao exame clínico com a identificação do paciente e descrição clínica das lesões e a segunda relacionada à coleta do espécime clínico utilizando-se como instrumento de coleta o swab. Todas as cepas de S. aureus analisadas foram identificadas por MALDI-TOF e a suscetibilidade a antimicrobianos foi determinada pelo teste de disco-difusão em meio sólido, seguindo as normas recomendadas do CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi empregada na detecção do gene mecA e genes lukF-PV e lukS-PV. A diversidade clonal foi verificada pelo PFGE (pulsed-field gel electrophoresis). O S. aureus foi detectado em 82,9% (29/35) dos pacientes em uso de hidrogel e em 100% (8/8) dos pacientes em uso de placa de poliuretano. Os pacientes em uso de placa de poliuretano com prata apresentaram mais sinais clínicos de infecção quando comparados aos pacientes em uso de hidrogel a 2%, principalmente pela presença do exsudato purulento. A razão de prevalência demonstrou que os pacientes que usaram a placa de poliuretano com prata tiveram pelo menos 3,6 vezes maior chance de apresentarem infecção nas feridas quando comparados com os pacientes em uso de hidrogel. A maioria dos S. aureus identificados, em ambos os campos de pesquisa, apresentou resistência à penicilina, meticilina, eritromicina e clindamicina. Em cinco pacientes (10 cepas- 20%) foi observada amplificação para o gene mecA, demonstrando a colonização por MRSA. Não foi observada amplificação para os genes lukF-PV e lukS-PV. Embora tenha sido detectada grande diversidade genética entre as cepas analisadas, o mesmo padrão se repetiu entre os S. aureus coletados em dois momentos diferentes nos mesmos pacientes. No entanto, as amostras 1 e 32/32* apresentaram o mesmo padrão de fragmentação de DNA pelo PFGE. Através da razão de prevalência, determinou-se que os pacientes com MSSA têm 16 vezes mais chance de ter infecção em feridas quando comparados aos pacientes com MRSA. Assim, o tratamento com hidrogel a 2% ou placa de poliuretano não interferiu na colonização por S. aureus. Além disso, verificamos que o uso de placa de poliuretano com prata não é indicado para feridas infectadas quando o paciente possuir como comorbidades hipertensão arterial e insuficiência venosa crônica. / This study aimed to analyze the presence of Staphylococcus aureus in chronic wounds treated with hydrogel 2% and polyurethane plate. To do this, was done a descriptive study with a quantitative approach. The field research was the Wound Repair Clinic at the University Hospital Antônio Pedro (HUAP / UFF) and the Community Polyclinic of the Engenhoca, both located in the city of Niterói, RJ. The microbiological analysis was conducted at the Laboratory of Microbiological Control of the Faculty of Pharmacy of the University Federal Fluminense (UFF) and the Institute of Microbiology Paulo de Góes of the University Federal of the Rio de Janeiro (UFRJ). Data collection was carried out in stages, the first related to the clinical examination with the patient identification and clinical description of the wounds and the other step related to the collection of the clinical specimen using the swab. All strains of S. aureus analyzed were identified by MALDI-TOF and susceptibility to antibiotics was determined by disk diffusion test on solid medium following the standards recommended by CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). The polymerase chain reaction (PCR) was used in the detection of the mecA gene and lukF-PV and luks-PV genes. The clonal diversity was verified by PFGE (pulsed-field gel electrophoresis). The S. aureus was detected in 82.9% (29/35) of patients using hydrogel and in 100% (8/8) the patients using polyurethane plate. Patients using polyurethane plate with silver presented more clinical signs of infection when compared to patients using hydrogel 2%, mainly by the presence of purulent exudate. The prevalence ratio showed that patients who used polyurethane plate with silver had at least 3.6 times more chance to have infection in the wound when compared to patients using hydrogel. Most S. aureus identified in both research fields presented resistance to penicillin, methicillin, erythromycin and clindamycin. Five patients (10 strains - 20%) were observed amplification for the gen mecA demonstranting colonization by MRSA. There was no amplification for lukF-PV and lukS-PV genes. Although was detected a big genetic diversity among the strains analyzed, the same pattern repeated among the S. aureus collected at two different times from the same patients. However, samples 1 and 32/32* showed the same fragmentation pattern by PFGE. Through the prevalence ratio identified that patients with MSSA had 16 times more likely to have infection in wounds when compared to patients with MRSA. Thus, the treatment with hydrogel 2% or polyurethane board did not interfered in the colonization by S. aureus. In addition, we perceived that the use of polyurethane plate with silver is not indicated for infected wounds when patients had comorbidities such as hypertension and chronic venous insufficiency.
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Sensibilidade in vitro de isolados de Clostridium difficile: comparação de duas metodologias (disco-difusão e ágar-diluição) / Susceptibility in vitro of isolates of Clostridium difficile: comparison of two methodologies (disk-diffusion and agar-dilution)

Fraga, Edmir Geraldo de Siqueira 16 July 2015 (has links)
Introdução: O Clostridium difficile é um bacilo Gram-positivo, anaeróbio estrito, formador de esporos, que produz toxinas que podem causar diarreia, colite pseudomembranosa, dilatação do cólon, sepse e até morte. Nos últimos anos o quadro clínico e epidemiológico das infecções por Clostridium difficile tem se modificado e as limitações das opções terapêuticas tornaram-se mais evidentes. Objetivo Primário: Comparar as metodologias de disco-difusão e ágar-diluição na detecção de sensibilidade/resistência de isolados de Clostridium difficile. Objetivos Secundários: Avaliar prospectivamente o perfil de sensibilidade/resistência de isolados clínicos hospitalares de Clostridium difficile provenientes de seis hospitais terciários da cidade de São Paulo e fornecer evidências para fundamentar o diagnóstico e o tratamento empírico das diarreias causadas por Clostridium difficile. Métodos: utilizamos os métodos de disco-difusão e ágar-diluição, de acordo com os critérios estabelecidos pelo CLSI e EUCAST. Resultados: Os coeficientes de correlação observados entre os diâmetros dos halos de inibição e Concentração Inibitória Mínima foram abaixo do esperado tornando inviável o método de disco-difusão para determinação de sensibilidade aos antimicrobianos nitazoxanida, teicoplanina e tigeciclina. Todas as 50 cepas deste estudo foram sensíveis ao metronidazol (MIC50 foi de 1 ?g/mL a MIC90 foi de 2 ug/mL). Para o método de disco-difusão, sugerimos que halos de inibição >= 33mm possam ser interpretados como sensíveis. Devido à moderada correlação, significância estatística e distribuição de halos de inibição das amostras próximos aos valores encontrados utilizando a cepa ATTC, sugere-se a utilização do método de disco-difusão para vancomicina, onde halos com diâmetro >= 22mm possam ser considerados como sensíveis pelo método. Para o moxifloxacino houve uma boa correlação entre as duas metodologias: discodifusão e de ágar-diluição (O coeficiente de Pearson foi de -0,84, e o valor de p foi menor que 0,00001), sugerindo que halos de inibição >= 18mm possam ser interpretados como sensíveis pela metodologia de disco-difusão. A nitazoxanida foi à droga que mostrou melhor atividade in vitro (MIC50 foi 0,06 ?g/mL e a MIC90 de 0,12 ug/mL). Por se mostrar uma droga com potente atividade in vitro (MIC50 e a MIC90 foi de 0,12 ug/mL), a tigeciclina poderia ser mais uma opção terapêutica em infecções por Clostridium difficile, dependendo de mais estudos para avaliar sua real eficácia clínica e segurança. Conclusão: Os resultados verificados neste estudo indicam a necessidade de mais estudos in vitro e clínicos para definir os limites de sensibilidade/resistência para a teicoplanina e a nitazoxanida, pois faltam critérios de interpretação tanto para disco-difusão quanto para ágar-diluição. Os resultados deste trabalho in vitro confirmaram a utilidade do metronidazol como uma droga eficaz no tratamento de infecção por Clostridium difficile. A nitazoxanida foi à droga que mostrou melhor atividade in vitro por método dilucional. Sugerimos a utilização do método de disco-difusão para: metronidazol, vancomicina e moxifloxacino. Os resultados desse trabalho sugerem que halos de inibição para metronidazol ( >= 33mm), moxifloxacino ( >= 18mm) e vancomicina ( >= 22mm) poderiam ser considerados como sensíveis pelo método de disco-difusão. O método de ágardiluição é um método de boa acurácia, porém trabalhoso para ser executado na rotina laboratorial / Introduction: Clostridium difficile is a Gram-positive bacillus, strictly anaerobic, spore-forming, which produces toxins that can cause diarrhea, colitis pseudomembranous, colon expansion, sepsis and even death. In recent years the clinical and epidemiological picture of infection by Clostridium difficile has been modified and limitations of therapeutic options have become more evident. Primary Objective: Comparing the methods of disk diffusion and agar dilution in the detection sensitivity/resistance isolates of Clostridium difficile. Secondary Objectives: Prospectively evaluate the profile of sensitivity/resistance of hospital clinical isolates of Clostridium difficile from six tertiary hospitals in São Paulo city and provide evidence to support the diagnosis and empirical treatment of diarrhea caused by Clostridium difficile. Methods: We use the disk diffusion method and agar dilution method, according to the established criteria by CLSI and EUCAST. Results: The observed correlation coefficients between the inhibitions diameter zone of the and Minimum Inhibitory Concentration were under expectations impeding the disk diffusion method for determining sensitivity to nitazoxanide antimicrobial, teicoplanin and tigecycline. All 50 strains of this study were sensitive to metronidazole (MIC50 was 1 Ug/ml to MIC90 was 2 ug/ml). For the method disk diffusion, we suggest that inhibition zones >= 33mm can be interpreted as sensitive. Due to the moderate correlation, statistical significance and distribution of zones of inhibition on samples of the next found values using the strain ATTC, we suggest using the disk diffusion method for vancomycin where halos diameter >= 22mm can be considered as sensitive by the method. There was a good correlation to moxifloxacin between the two methodologies: disk diffusion and agar dilution (Pearson\'s coefficient was -0.84 , and the \"p\" value was less than 0.00001), suggesting that inhibition zones >= 18mm can be interpreted as sensitive by disk diffusion method. Nitazoxanide was the drug that showed a better performance in vitro activity (MIC50 was 0.06 ?g/ml and MIC90 0.12 ug/ml). For a drug that shows potent activity in vitro (MIC50 and MIC90 was 0.12 ug/ml), the tigecycline could be a therapeutic option in infection by Clostridium difficile, depending on further studies to evaluate their real clinical efficacy and security. Conclusion: Obtained results in this study indicate the need for further studies in vitro and clinicians to define the limits of sensitivity/resistance to teicoplanin and nitazoxanide, so there is no interpretation criteria for both disk diffusion and for agar dilution. Results of this work in vitro study confirmed the utility of metronidazole as an effective drug in the treatment of infection by Clostridium difficile. Nitazoxanide was the drug that showed better performance in vitro by dilutional method. We suggest the use of disk diffusion method: metronidazole, vancomycin and moxifloxacin. This work suggest that inhibition zones for metronidazole ( >= 33mm), moxifloxacin ( >= 18mm) and vancomycin ( >= 22mm) could be considered as sensitive by disk diffusion method. The agar dilution method is a method to be accurate, but laborious to run in the laboratory routine
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Sensibilidade in vitro de isolados de Clostridium difficile: comparação de duas metodologias (disco-difusão e ágar-diluição) / Susceptibility in vitro of isolates of Clostridium difficile: comparison of two methodologies (disk-diffusion and agar-dilution)

Edmir Geraldo de Siqueira Fraga 16 July 2015 (has links)
Introdução: O Clostridium difficile é um bacilo Gram-positivo, anaeróbio estrito, formador de esporos, que produz toxinas que podem causar diarreia, colite pseudomembranosa, dilatação do cólon, sepse e até morte. Nos últimos anos o quadro clínico e epidemiológico das infecções por Clostridium difficile tem se modificado e as limitações das opções terapêuticas tornaram-se mais evidentes. Objetivo Primário: Comparar as metodologias de disco-difusão e ágar-diluição na detecção de sensibilidade/resistência de isolados de Clostridium difficile. Objetivos Secundários: Avaliar prospectivamente o perfil de sensibilidade/resistência de isolados clínicos hospitalares de Clostridium difficile provenientes de seis hospitais terciários da cidade de São Paulo e fornecer evidências para fundamentar o diagnóstico e o tratamento empírico das diarreias causadas por Clostridium difficile. Métodos: utilizamos os métodos de disco-difusão e ágar-diluição, de acordo com os critérios estabelecidos pelo CLSI e EUCAST. Resultados: Os coeficientes de correlação observados entre os diâmetros dos halos de inibição e Concentração Inibitória Mínima foram abaixo do esperado tornando inviável o método de disco-difusão para determinação de sensibilidade aos antimicrobianos nitazoxanida, teicoplanina e tigeciclina. Todas as 50 cepas deste estudo foram sensíveis ao metronidazol (MIC50 foi de 1 ?g/mL a MIC90 foi de 2 ug/mL). Para o método de disco-difusão, sugerimos que halos de inibição >= 33mm possam ser interpretados como sensíveis. Devido à moderada correlação, significância estatística e distribuição de halos de inibição das amostras próximos aos valores encontrados utilizando a cepa ATTC, sugere-se a utilização do método de disco-difusão para vancomicina, onde halos com diâmetro >= 22mm possam ser considerados como sensíveis pelo método. Para o moxifloxacino houve uma boa correlação entre as duas metodologias: discodifusão e de ágar-diluição (O coeficiente de Pearson foi de -0,84, e o valor de p foi menor que 0,00001), sugerindo que halos de inibição >= 18mm possam ser interpretados como sensíveis pela metodologia de disco-difusão. A nitazoxanida foi à droga que mostrou melhor atividade in vitro (MIC50 foi 0,06 ?g/mL e a MIC90 de 0,12 ug/mL). Por se mostrar uma droga com potente atividade in vitro (MIC50 e a MIC90 foi de 0,12 ug/mL), a tigeciclina poderia ser mais uma opção terapêutica em infecções por Clostridium difficile, dependendo de mais estudos para avaliar sua real eficácia clínica e segurança. Conclusão: Os resultados verificados neste estudo indicam a necessidade de mais estudos in vitro e clínicos para definir os limites de sensibilidade/resistência para a teicoplanina e a nitazoxanida, pois faltam critérios de interpretação tanto para disco-difusão quanto para ágar-diluição. Os resultados deste trabalho in vitro confirmaram a utilidade do metronidazol como uma droga eficaz no tratamento de infecção por Clostridium difficile. A nitazoxanida foi à droga que mostrou melhor atividade in vitro por método dilucional. Sugerimos a utilização do método de disco-difusão para: metronidazol, vancomicina e moxifloxacino. Os resultados desse trabalho sugerem que halos de inibição para metronidazol ( >= 33mm), moxifloxacino ( >= 18mm) e vancomicina ( >= 22mm) poderiam ser considerados como sensíveis pelo método de disco-difusão. O método de ágardiluição é um método de boa acurácia, porém trabalhoso para ser executado na rotina laboratorial / Introduction: Clostridium difficile is a Gram-positive bacillus, strictly anaerobic, spore-forming, which produces toxins that can cause diarrhea, colitis pseudomembranous, colon expansion, sepsis and even death. In recent years the clinical and epidemiological picture of infection by Clostridium difficile has been modified and limitations of therapeutic options have become more evident. Primary Objective: Comparing the methods of disk diffusion and agar dilution in the detection sensitivity/resistance isolates of Clostridium difficile. Secondary Objectives: Prospectively evaluate the profile of sensitivity/resistance of hospital clinical isolates of Clostridium difficile from six tertiary hospitals in São Paulo city and provide evidence to support the diagnosis and empirical treatment of diarrhea caused by Clostridium difficile. Methods: We use the disk diffusion method and agar dilution method, according to the established criteria by CLSI and EUCAST. Results: The observed correlation coefficients between the inhibitions diameter zone of the and Minimum Inhibitory Concentration were under expectations impeding the disk diffusion method for determining sensitivity to nitazoxanide antimicrobial, teicoplanin and tigecycline. All 50 strains of this study were sensitive to metronidazole (MIC50 was 1 Ug/ml to MIC90 was 2 ug/ml). For the method disk diffusion, we suggest that inhibition zones >= 33mm can be interpreted as sensitive. Due to the moderate correlation, statistical significance and distribution of zones of inhibition on samples of the next found values using the strain ATTC, we suggest using the disk diffusion method for vancomycin where halos diameter >= 22mm can be considered as sensitive by the method. There was a good correlation to moxifloxacin between the two methodologies: disk diffusion and agar dilution (Pearson\'s coefficient was -0.84 , and the \"p\" value was less than 0.00001), suggesting that inhibition zones >= 18mm can be interpreted as sensitive by disk diffusion method. Nitazoxanide was the drug that showed a better performance in vitro activity (MIC50 was 0.06 ?g/ml and MIC90 0.12 ug/ml). For a drug that shows potent activity in vitro (MIC50 and MIC90 was 0.12 ug/ml), the tigecycline could be a therapeutic option in infection by Clostridium difficile, depending on further studies to evaluate their real clinical efficacy and security. Conclusion: Obtained results in this study indicate the need for further studies in vitro and clinicians to define the limits of sensitivity/resistance to teicoplanin and nitazoxanide, so there is no interpretation criteria for both disk diffusion and for agar dilution. Results of this work in vitro study confirmed the utility of metronidazole as an effective drug in the treatment of infection by Clostridium difficile. Nitazoxanide was the drug that showed better performance in vitro by dilutional method. We suggest the use of disk diffusion method: metronidazole, vancomycin and moxifloxacin. This work suggest that inhibition zones for metronidazole ( >= 33mm), moxifloxacin ( >= 18mm) and vancomycin ( >= 22mm) could be considered as sensitive by disk diffusion method. The agar dilution method is a method to be accurate, but laborious to run in the laboratory routine
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Resistência antimicrobiana e tipagem molecular de pseudomonas aeruginosa isoladas de feridas crônicas

Pessanha, Fernanda Soares January 2015 (has links)
Submitted by Fabiana Gonçalves Pinto (benf@ndc.uff.br) on 2016-10-24T17:42:22Z No. of bitstreams: 1 Fernanda Soares Pessanha.pdf: 2199380 bytes, checksum: bb078e15b653af8e5dfd1387ea2db7e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-24T17:42:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernanda Soares Pessanha.pdf: 2199380 bytes, checksum: bb078e15b653af8e5dfd1387ea2db7e4 (MD5) Previous issue date: 2015 / Mestrado Acadêmico em Ciências do Cuidado em Saúde / Introdução: Para a correta reparação das feridas, as diversas fases do processo de cicatrização devem ocorrer na sequencia correta, numa intensidade ideal. Vários fatores afetam a cicatrização das feridas ao interferir em uma ou mais fases deste processo, tal como, a presença de infecção. Objetivo geral: Analisar as cepas de Pseudomonas aeruginosa encontradas nas feridas crônicas tratadas com gel de carboximetilcelulose a 2% ou com placa de poliuretano. Método: Pesquisa observacional descritiva, com abordagem quantitativa, realizada através da coleta de material biológico de feridas crônicas de pacientes atendidos em serviços ambulatoriais, empregando swabs. A pesquisa foi aprovada pelo Comitê de Ética em Pesquisa (Hospital Universitário Antônio Pedro – UFF) com número de parecer 815.353. As cepas de P. aeruginosa foram identificadas por MALDI-TOF MS, submetidas a testes de susceptibilidade aos antimicrobianos, identificação de genes de virulência através de PCR e tipagem molecular através de PFGE. Resultados: Das 43 feridas a partir das quais foram coletados swabs, em 31 (72,09%) obteve-se isolamento de P. aeruginosa (foram identificadas 48 cepas). Estas feridas têm 3,6 vezes mais chances de desenvolverem infecção quando comparadas àquelas a partir das quais esse microrganismo não foi isolado. As cepas isoladas dos pacientes em uso de gel de carboximetilcelulose a 2% apresentaram maiores taxas de resistência a gentamicina e ciprofloxacino (ambos com 7,89%). Já as cepas isoladas dos pacientes tratados com placa de poliuretano, destacaram-se pela resistência a ciprofloxacino (90%). Foram identificadas três cepas multirresistentes de duas feridas tratadas com placa de poliuretano impregnada com prata. Foram positivas para presença do gene exoS 26 cepas (54,16%), e 13 (27,08%), para o gene exoU. Observou-se mesmo perfil de PFGE entre as cepas coletadas em diferentes momentos de onze pacientes, enquanto que em seis pacientes as cepas coletadas em diferentes momentos foram distintas. Não houve semelhança de padrões de fragmentação de DNA entre cepas derivadas de pacientes diferentes. Conclusão: A maioria das feridas não apresentava sinais clínicos de infecção. Foram identificadas 48 cepas de P. aeruginosa. O isolamento deste microrganismo é fator de risco para desenvolvimento de infecção. As cepas de P. aeruginosa têm baixos índices de resistência antimicrobiana, com apenas três cepas multiresistentes. Os desbridamentos realizados nas feridas crônicas não têm sido efetivos para descolonização de P. aeruginosa, já que um mesmo clone bacteriano foi identificado na ferida em diferentes momentos, na maioria dos casos / Introduction: For proper wound healing, various stages of the healing process must occur in a correct sequence and an ideal intensity. Several factors affect the wounf healing on one or more phases of this process, such as the presence of infection. General objective: To analyze Pseudomonas aeruginosa strains found in chronic wounds treated with 2% carboxymethylcellulose gel or polyurethane plate. Method: Descriptive observational research with a quantitative approach, carried out through the collection of biological material of chronic wounds of patients attended in outpatient services, using swabs. The study was approved by the Research Ethics Committee (Academic Hospital Antonio Pedro - UFF) with number 815.353. P. aeruginosa strains were identified by MALDI-TOF MS, subjected to antimicrobial susceptibility testing, identification of virulence genes by PCR and molecular typing by PFGE. Results: Of the 43 wounds from which swabs were collected, at 31 (72.09%) was obtained isolation of P. aeruginosa (48 strains have been identified). These wounds are 3.6 times more likely to develop infection when compared to those from which this microorganism was not identified. The strains isolated from patients using 2% carboxymethyl cellulose gel showed more resistance rates to gentamicin and ciprofloxacin (both 7.89%). Already the strains isolated from patients treated with polyurethane plate, highlighted by the resistance to ciprofloxacin (90%). Three multiresistant strains were identified from two wounds treated with polyurethane plate impregnated with silver. 26 strains (54.16%) were positive for the presence of exoS gene and 13 (27.08%), for the exoU gene. It was observed even PFGE profile among strains collected at different times of eleven patients, while in six patients, strains collected at different times were different. There was no resemblance DNA fragmentation patterns among strains derived from different patients. Conclusion: Most of the wounds showed no clinical signs of infection. 48 strains of P. aeruginosa have been identified. The isolation of this microorganism is a risk factor for development of infection in chronic wounds. Strains of P. aeruginosa demonstrated low antimicrobial resistance rates and only three multi-resistant strains were identified. The debridement performed in chronic wounds is not effective for removing colonization by P. aeruginosa, because same bacterials clones was identified in the wound swabs collected in same patients at different times in most cases

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