Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 338043 bytes, checksum: a834b14ee2a313c551703de0f053cc4d (MD5) Previous issue date: 2008-03-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In the study of genetic linkage between two marker loci or between markers and a QTL it is usually necessary to have appropriate designed populations (experimental populations). However, for some species such designed populations could be hard to obtain. In this scenario, the linkage disequilibrium (LD) has been used to build genetic map and to identify QTL. In this work, we used simulation to evaluate the efficiency of LD to construct genetic maps (LD-genetic map) of molecular markers as well as to map QTL (LD-QTL mapping) in non- structured families of outbreed populations. As for the LD- genetic map study, we designed genomes with high saturation level (markers apart from each other less than 5 cM), and random saturation level (markers apart from each other ranging from 0 to 20 cM), five linkage groups and 20 markers per linkage group. We simulated compounds of second generation with 200 and 1000 individuals, derived from the mating of two parental populations of size 200, under four levels (1.0, 0.9, 0.8 and 0.7) of difference in the frequency of each marker (marker-frequency difference) between parental populations. These compounds were used to obtain the sampled genomes, which were compared with the designed genomes to measure the efficiency of LD to construct genetic map. In the LD-QTL mapping study, we adopted, with slightly modifications, the steps to obtain the designed genome and the compounds as described above. We designed genomes with ten linkage groups, each with 20 markers, but for linkage group 1 which had just five markers. We distributed 200 genes controlling quantitative traits along the ten linkage groups. However, only the linkage group 1 had a major QTL along with 19 minor genes. All other linkage groups had 20 minor genes each. In the LD-QTL mapping study, for the detection, estimation of substitution effects and of dominance, we idealized three quantitative traits, each being affected by a major QTL. The trait yield (g/ear) had a QTL with positive dominance; the trait expansion capacity (mL/g) had a QTL with bidirectional dominance; and the trait relative liquid growth (%) had a QTL with negative dominance. We used the method of single marker analysis base on regression to model the QTL effects. The analyses of power for QTL identification and substitution effect estimation were done by linear regression. On the other hand, the analysis of dominance effect was done by polynomial regression with the quadratic term included in the model. In the LD-genetic map study the linkage groups were satisfactory recovered, with only few exceptions. The bias in recovering the designed genome increased with the decreasing of the marker- frequency difference between parental populations from 1.0 to 0.7. Based on the percentage of correct ordered markers in the genome, we found that the LD-genetic map was efficient, with correct ordering of markers superior to 86%. Our results support that the most efficient population for LD-genetic map was the one equivalent to an F2 intercross population. With respect to the QTL detection, in general, the power of detection was satisfactory, independent of the quantitative trait simulated. The results of effect substitution of marker revealed that markers closer to the QTL had bigger effects. The detections of dominance effects were efficient only on the compounds from the mating of parental populations with marker-frequency difference superior than 0.9 and sample size of 1.000. The results of dominance direction analyses on the markers for the trait yield were efficient in determining the direction of dominance of QTL, with few exceptions where complete dominance was present. For the trait expansion capacity, the specification of which markers had positive or negative effect was not possible because of the bidirectional nature of the simulated dominance effects. For the trait liquid growth the estimated effects of dominance at markers often revealed the correct dominance effects direction of the QTL. It is important to point out that the results of our LD-QTL mapping study were based on traits in which the phenotypic variance explained by the QTL is between 10 and 30% of the total phenotypic variance. / No estudo de ligação entre dois locos marcadores e análise de QTL é preciso realizar cruzamentos apropriados para o mapeamento das populações. No entanto, a realização de cruzamentos pode ser difícil em algumas espécies. Nestes casos, tem-se utilizado desequilíbrio de ligação (LD) ou de fase gamética. Este trabalho, realizado por meio de simulação de dados, teve como objetivos avaliar a eficiência do mapeamento de marcas moleculares e identificar o QTL em populações não-endogâmicas e não-estruturadas em famílias, com base em desequilíbrio de fase gamética. Para o mapeamento de marcas moleculares foram simulados genomas com nível de saturação alto (distância menor que 5 cM) e aleatório (distância entre 0 e 20 cM), cinco grupos de ligação e 20 marcas por grupo. Para obtenção dos genomas amostrais foram simulados compostos de segunda geração, com 1.000 e 200 indivíduos, derivados do cruzamento entre duas populações parentais, com tamanho 200, sob quatro níveis (1,0, 0,9, 0,8 e 0,7) de diferença mínima de freqüência de mesma marca entre os genitores. A partir dos genomas amostrais foi avaliada a eficiência de recuperação dos genomas paramétricos. Na detecção de QTL, seguiu-se o mesmo processo para simulação dos genomas e dos compostos, porém com algumas particularidades. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação, devendo ser ressaltado que em cada genoma somente o grupo de ligação 1 foi simulado com cinco locos marcadores. Nestes grupos também foram distribuídos 200 genes controladores de características quantitativas. Porém, somente no grupo de ligação 1 foram alocados QTL e 19 genes de efeito menor. Em cada um dos demais grupos de ligação foram alocados mais 20 genes de efeito menor. Na análise de QTL, incluindo detecção e estimação dos efeitos de substituição e desvios de dominância, foram idealizadas três características quantitativas, com um QTL controlando cada característica. As características foram: produção (g/espiga), com direção de dominância positiva; capacidade de expansão (ml/g), com direção de dominância bidirecional; e crescimento líquido relativo (%), com direção de dominância negativa. Neste trabalho, foi empregado o método das marcas simples com base em análise de regressão. A avaliação do poder de detecção de QTL e os efeitos de substituição foram obtidos por regressão linear, enquanto os efeitos de dominância foram obtidos por regressão polinomial, incluindo o termo quadrático. No mapeamento de marcas moleculares, verificou-se que os grupos de ligação foram recuperados de forma satisfatória, com algumas exceções. Maior viés na recuperação dos genomas paramétricos foi verificado à medida que se diminuiu a diferença de freqüência de mesma marca entre os genitores de 1,0 para 0,7. Com base no porcentual de marcas ordenadas corretamente o mapeamento foi eficiente, apresentando valores superiores a 86%. Diante dos resultados obtidos concluiu-se que a população mais eficiente para o mapeamento é a equivalente a uma F2. Quanto à detecção de QTL, de modo geral, o poder de detecção foi satisfatório, independentemente do caráter idealizado. A análise do efeito de substituição de marca revelou maior magnitude de efeito para as marcas mais próximas ao QTL. Em relação ao teste de dominância nos locos marcadores, foi verificada eficiência na detecção de dominância apenas nos compostos obtidos do cruzamento entre genitores com diferença de freqüência de mesma marca maior ou igual a 0,9 e com tamanho de amostra igual 1.000. Avaliando o sinal do efeito de dominância, para a característica produção, verificou-se que os efeitos estimados nos locos marcadores foram consistentes em revelar a direção de dominância no loco do QTL, com algumas exceções quando dominância completa. Para característica capacidade de expansão, em virtude de ter sido considerada sob direção de dominância bidirecional, não foi possível a determinação de quais marcas têm efeito positivo ou negativo. Para a característica crescimento líquido relativo, as estimativas dos efeitos de dominância nos marcadores revelaram, quase sem exceção, a direção de dominância no loco do QTL. É importante ressaltar que os resultados obtidos neste trabalho, para o mapeamento de QTL, são válidos para QTLs que expliquem entre 10 e 30% a variação fenotípica do caráter.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005Bitstream added on 2014-06-13T18:58:57Z : No. of bitstreams: 1 carvalho_lm_me_botfmvz.pdf: 178812 bytes, checksum: 797042795544766c3d38f3b7f7288cad (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O desvio ou divergência folicular é um momento importante da seleção folicular, onde pela primeira vez, nota-se uma diferença significativa na taxa de crescimento entre os dois maiores folículos ovarianos. A seleção folicular tem sido estudada intensamente em raças européias (Bos taurus taurus), porém pouco estudada em raças zebuínas (Bos taurus indicus). Objetivou-se com o presente trabalho determinar as características morfológicas do desvio associadas a primera onda folicular do ciclo estral de vacas da raça Nelore. A partir do dia da ovulação, os três maiores folículos (F1, F2 e F3) tiveram seu desenvolvimento acompanhado por ultra-sonografia transretal, realizada a cada 12 h, até o sexto dia após a ovulação. Em cada animal (n= 11), o momento do desvio foi determinado graficamente usando inspeção visual do perfil de crescimento dos F1, F2 e as vezes F3 (desvio observado) e matematicamente, usando análise de regressão linear segmentada para comparar as diferenças de diâmetro entre F1 e F2, e as vezes F3 (desvio calculado). Os resultados da determinação do momento do desvio usando os métodos matemático e observado, não foram significativamente diferentes. Utilizando-se a média dos resultados dos dois métodos, o momento do desvio ocorreu 2,4 dias após a ovulação, quando o F1 atingiu 6,1 mm. Concluiu-se que, o diâmetro do futuro folículo dominante no momento do desvio folicular foi de aproximadamente 6,1 mm em vacas da raça Nelore, cerca de 2,4 dias após a ovulação. / Follicle diameter deviation is defined as the beginning of the differential change in growth rates between the largest and next largest follicles subsequent to wave emergence and is considered a key component of follicle selection. Follicle selection has been extensively studied in European breeds of cattle (Bos taurus) but has not been critically studied in Zebu breeds (Bos indicus). The objective of the present study was to determine the morphological characteristics of deviation associated with the first post-ovulatory wave (Wave 1) of the estrous cycle in nonlactating cows. Beginning on the day of ovulation (day 0), the three largest follicles (F1-F3, respectively) were individually tracked every 12 h for 6 d using transrectal ultrasonography. In individual animals (n=11), deviation was determined graphically using visual inspection of the diameter profiles of F1, F2 and sometimes F3 (observed deviation) and mathematically using segmented regression analysis of the diameter differences between F1 and F2 or sometimes F3 (calculated deviation). The results of determining the beginning of deviation in cows using the observed and calculated methods were not significantly different. Averaged over both methods, diameter deviation occurred 2.4 d after ovulation when F1 reached 6.1 mm in cows. It is concluded that the future dominant follicle has 6.1 mm at the time of deviation in Nelore cows, 2.4 days after ovulation.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-02-09T21:51:18Z No. of bitstreams: 1 CarlosDavidCequeiraFeitor_TESE.pdf: 4965385 bytes, checksum: 6ca79b114402ddef06010138d789f3ae (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-02-10T17:22:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarlosDavidCequeiraFeitor_TESE.pdf: 4965385 bytes, checksum: 6ca79b114402ddef06010138d789f3ae (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T17:22:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarlosDavidCequeiraFeitor_TESE.pdf: 4965385 bytes, checksum: 6ca79b114402ddef06010138d789f3ae (MD5) Previous issue date: 2016-08-24 / O estudo desenvolveu um modelo de valor da marca para Institui??es de Ensino Superior (IES) de natureza privada na perspectiva do consumidor. Al?m disso, por meio da literatura, definiu o conjunto de dimens?es, antecedentes e consequentes do valor de marca da IES, e procurou explicitar as formas de operacionaliza??o desses fatores constituintes do modelo proposto. Por ?ltimo, analisou o modelo relacional entre os fatores da Experi?ncia Universit?ria, Comunica??o Controlada, Boca a Boca Eletr?nico (e-WOM), Co-Cria??o, Consci?ncia da Marca, Associa??es ? Marca e Valor de Marca Total, bem como almejou validar o modelo te?rico desenvolvido nesta tese. Para tanto, em termos de l?gica, este estudo ? classificado como hipot?tico-dedutivo, e a pesquisa foi organizada do ponto de vista metodol?gico por tr?s etapas, a saber: explorat?ria, descritiva e anal?tica. A pesquisa explorat?ria permitiu esclarecer os conceitos da tem?tica, definir o problema de pesquisa, elaborar o modelo te?rico, e desenvolver o instrumento de coleta dos dados. Na etapa descritiva foi realizado o pr?-teste do question?rio, os ajustes nas escalas, a defini??o da amostra e a descri??o dos procedimentos de coleta dos dados. O tipo de amostragem foi n?o probabil?stico, por julgamento ou intencional, no qual os indiv?duos foram selecionados por crit?rios estabelecidos pelo pesquisador. A amostra do estudo foi composta por 1156 estudantes do curso de gradua??o em administra??o, e os dados foram coletados em centros universit?rios e universidades de categoria administrativa privada, localizadas no estado do Rio Grande do Norte e Par?, com ?ndice Geral de Cursos (IGC ? FAIXA) a partir de 3. A an?lise dos dados foi desenvolvida por uma abordagem quantitativa multivariada, incluindo a an?lise fatorial explorat?ria e confirmat?ria e modelagem de equa??es estruturais. A partir das an?lises dos dados foi poss?vel verificar que o conte?do das escalas ? representativo do objeto que se pretende mensurar, e demonstraram tanto validade de conte?do quanto estat?stico. Vale destacar a confirma??o da hip?tese de relacionamento positivo entre eWOM e as Associa??es ? Marca, e da Co-cria??o e Consci?ncia da Marca. Conclui-se tamb?m, por meio da modelagem emp?rica, a validade do modelo de mensura??o do Valor de Marca da IES com base no consumidor. / The study developed a brand equity model for private higher education institutions from a consumer perspective. Furthermore, through theory, it defined the set of dimensions, history and consequences of higher education institutions brand equity, as well as sought to clarify the deployment of these factors in the proposed model. Finally, an analysis of the University Experience, Controlled Communication, e-WOM, Co-Creation, Brand Awareness, Brand Association and Overall Brand Equity relational model was conducted, aiming towards the validation of the theoretical model developed in this thesis. In order to achieve this, a deductive reasoning approach was applied, and the research, from a methodology standpoint, was divided into three phases: exploratory, descriptive and analytic. The exploratory phase focused on clarifying the topic?s concepts, defining the research problem, elaborating the theoretical model, and developing the instrument to be used for data collection. During the descriptive phase, a survey questionnaire pre-test was conducted, scales were adjusted, the sample size was defined and data collection procedures were detailed. The probability sampling process was not employed, either intentionally or by judgment, and individuals were selected using criteria established by the researcher. The sample size of 1156 Business Administration students was used, and data was collected from university institutes and privately run universities located in the Brazilian states of Rio Grande do Norte and Par?, ranked 3 or higher according to the country?s Course Ranking Index. Data analysis was conducted using a multivariate quantitative approach, including exploratory factor and confirmatory analysis, and structural equation modeling. Data analyses confirm that the variables scale is representative of the object to be measured, and demonstrate both content and statistical validity. It is worth highlighting confirmation of the hypothesis of positive correlation between eWOM and Brand Association, as well as Co-Creation and Brand Awareness. Empirical modeling also confirmed the validity of the higher education institutions brand equity measurement model, based on consumer perspective.

O leite bovino é um alimento essencial na nutrição humana, principalmente para os mais jovens por ser uma fonte importante de proteínas, minerais e vitaminas. A crescente demanda por quantidade e qualidade de leite nos últimos anos tem impulsionado inúmeras pesquisas, principalmente em relação ao perfil de ácidos graxos por diferir substancialmente das exigências humanas. Nutrição e melhoramento genético são os principais fatores capazes de promover a alteração da qualidade nutricional do leite. Por muito tempo as mudanças alcançadas via melhoramento genético foram obtidas exclusivamente com base na genética quantitativa, mas a partir dos anos 90 o interesse nesta área passou a ser divido com a genética molecular. Os avanços alcançados na biologia molecular obtidos por meio do mapeamento e sequenciamento do genoma das diversas espécies e de estudos de associação fenótipo-genótipo vêm auxiliando a explicar o fundo genético das características quantitativas. Atualmente, a maioria dos estudos de associação fenótipo-genótipo foram delineados para estimar apenas efeitos genéticos aditivos em um único lócus. No entanto, parte da variação observada nestes fenótipos resultam da interação entre loci ou genes, tornando estes estudos fundamentais para conhecer a origem da variação biológica destas características. Assim, os objetivos deste estudo foram: I) Associar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) com características produtivas e o perfil de ácidos graxos no leite; e II) Identificar interações entre os SNPs associados a estas características no leite de bovinos da raça Holandesa. Fenótipo ajustado de 760 vacas para o efeito fixo de grupo de contemporâneo e covariáveis dias em lactação, idade à mensuração e produção de leite, e 6.553 SNPs foram considerados para realizar a associação por meio de regressão SNP a SNP. No total nove SNPs foram associados a uma ou mais características relacionadas ao teor de gordura e perfil de ácidos graxos. Algumas destas associações evidenciam a presença de epistasia e/ou pleiotropia entre estas regiões. Para a identificação de interação entre os SNPs, foram usados modelos que consideraram os efeitos individuais (aditivo e dominante) e os efeitos individuais e de interação entre os nove SNPs para comparação por meio do teste de razão de verossimilhança (LRT). Foi observado efeito epistático aditivo x dominante (P < 0,01) somente entre os marcadores ARS-BFGL-NGS-71749 e ARS-BFGL-NGS-34135, ambos situados no cromossomo 14 bovino (BTA14), para as características teor de ácidos graxos saturados e teor de ácido palmítico (C16:0). Para o melhor entendimento da sua interação biológica existe ainda a necessidade de maior conhecimento sobre as rotas metabólicas em que tais genes identificados estão situados estes marcadores. Mais estudos nestas regiões cromossômicas possibilitarão ampliar o conhecimento sobre os genes e suas interações. / Bovine milk is an essential food in human nutrition, especially for younger people for being as important source of proteins, minerals and vitamins. The growing for quantity and quality for milk in recent years has stimulated numerous studies, especially regarding the fatty acid profile by differ substantially of human requirements. Nutrition and animal breeding are the main factors which would enhance change the nutritional quality of cow milk. For a long time the changes achieved by animal breeding were obtained purely based on quantitative genetics, but from 90 the interest in this area came to be divided with molecular genetics. The advances made in the molecular biology obtained through the mapping and sequencing of the genomes of different species and genome-wide association studies is helping to explain more about the genetic background of quantitative traits. Currently, most of genome-wide association studies were designed to estimate additive genetic effects only at a single locus, excluding additional effects. However, part of the observed variation in these phenotypes result from the interaction between genes or loci, thus, such studies are also important for the understanding of the origin of biological variation of these traits, such as their metabolic and biochemical pathways. The aims of this study were: I) Associate single nucleotide polymorphisms (SNPs) with production traits and fatty acid profile in milk; and II) Identify interactions between SNPs associated with these traits in milk from Holstein cows. Phenotype adjusted of 760 cows for the fixed effects of contemporary group and covariates days in milk, age at measurement and milk yield, and information from 6,553 SNPs were considered for performing the association using single SNP regression method. A total of nine SNPs were associated with one or more traits related to the fat percentage and fatty acid profile. Some of these associations showed the presence of epistasis and/or pleiotropy between these regions. To identify interaction between SNPs, models that consider the individual effects (additive and dominance); and individual and interaction effects between the nine SNPs for comparison using the likelihood ratio test (LRT). Additive x dominance epistatic effect (P < 0.01) was observed only between markers ARS-BFGL-NGS- 71749 and ARS-BFGL-NGS-34135, both located on chromosome 14 (Bos taurus autossome, BTA14), for fat percentage (FP), saturated fatty acids (SFA) and palmitic acid (C16:0). For a better understanding of its biological interaction there is a need for greater knowledge of the metabolic pathways in with these genes identified these markers are located. More studies will enable these chromosomal regions expand knowledge about genes and their interactions.

Com o objetivo de semi-quantificar a expressão gênica para receptores de gonadotrofinas nas células de folículos dominantes em animais pré-púberes (bezerras) das raças Nelore e Marchigiana e novilhas púberes da raça Nelore, buscando diferenças que possibilitem a procura de respostas para a deficiência da competência de desenvolvimento dos oócitos de animais pré-púberes que permitam a utilização destes em programas de melhoramento genético animal, foram utilizados 8 animais, sendo três bezerras Nelore, três bezerras Marchigiana, com 7 meses de idade, e duas novilhas Nelore, com 25 meses de idade. Foi realizado acompanhamento da onda folicular através de ultra-sonografia por dois meses, e os animais foram abatidos no momento que o folículo dominante apresentava diâmetro máximo (8, 10 e 14 mm, respectivamente). Folículos dominantes foram dissecados e isolados, e foi feita extração de RNA total. Foram feitas quatro reações de síntese de cDNA a partir de cada amostra. Para análise da expressão gênica semi-quantitativa, foram realizadas reações de Duplex-PCR, utilizando-se dois oligonucleotídeos iniciadores em cada reação, um para gene controle, o gapdh, e outro para o gene alvo, receptor do hormônio folículo estimulante ou receptor do hormônio luteinizante. Estas reações foram realizadas em triplicata a partir de cada fonte de cDNA de cada amostra, e os produtos foram aplicados em gel de poliacrilamida, e fotografados. Os resultados foram obtidos a partir da razão entre a intensidade da banda do gene alvo e a intensidade da banda do gene controle, e os valores médios foram analisados estatisticamente. Foi encontrada menor expressão relativa do gene do receptor de LH em bezerras da raça Nelore quando comparadas com as novilhas da raça Nelore e as bezerras da raça Marchigiana. Foi detectada a presença de um splicing alternativo para o gene do LHr, que apresentou comportamento semelhante ao gene padrão. Não foi encontrada diferença significativa na expressão do gene do FSHr entre os grupos estudados. Os resultados sugerem uma maior importância do LH nos estágios finais de desenvolvimento folicular, demonstrado aqui pela menor expressão relativa de lhr nos folículos dominantes de bezerras Nelore em relação às novilhas púberes, que pode ser um dos motivos para o baixo potencial de desenvolvimento dos oócitos destes animais após a fertilização in vitro / With the objective to semiquantify the gene expression for gonadotrophins receptors in dominant follicles in Nelore and Marchigiana prepubertal heifers and Nelore adult cows, being searched differences that make possible the search of answers for the low developmental potential of oocytes from prepubertal heifers that allow the use of these in programs of animal genetic improvement, had been used 8 animals, being three Nelore heifers, three Marchigiana heifers, with 7 months of age, and two Nelore heifers, with 25 months of age. Accompaniment of the follicular wave was carried through daily ultrasonografic exams for two months, and the animals had been slaughtered at the moment that dominant follicle presented maximum diameter (8, 10 and 14 mm, respectively). Dominant follicles had been dissected and isolated, and extraction of total RNA was performed. Four reactions of synthesis of cDNA from each sample had been made. For analysis of the semi-quantitative gene expression, reactions of Duplex-PCR had been carried through, using themselves two initiating oligonucleotídeos in each reaction, one for housekeeping gene, gapdh, and another one for the target gene, fshr and lhr. These reactions had been carried through in third copy from each source of cDNA of each sample, and the products had been applied in poliacrilamida gel electrophoresis, and photographed. The results had been gotten from the reason enter the intensity of the band of the target gene and the intensity of the band of the housekeeping gene, and the average values had been analyzed in a statistical software. Lower relative expression of lhr in Nelore heifers was found when compared with the Nelore adult cows and the Marchigiana heifers. An alternative splicing for lhr was detected, that presented similar behavior to the gene standard. Significant difference in the expression of the gene of the FSHr between the studied groups was not found. The results suggest a importance of the LH in the final periods of follicular development, demonstrated for the lower relative expression of lhr in the dominant follicles of Nelore heifers in relation to the adult cows in this study, that can after be the one of the reasons for the low developmental capacity of oocytes of these animals after in vitro fertilization

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_claiton_rodrigues.pdf: 611037 bytes, checksum: 71a8a51da2372a1903bb54a0a0d9073e (MD5) Previous issue date: 2012-12-20 / The change in the profile of soybean varieties which favor the reduction of population is accompanied by the necessity of enhancement in the process for classifying seeds by size, standardizing the distribution in the sowing row. The present study aimed to characterize the classification of soybean seeds by size with the purpose of precision sowing. The first experiment conceptualized sorted lots at intervals of 0.5mm, 1.00mm, and unrated by size. To that end, the retention in the dominant sieve and number of diameters found in each of the intervals evaluated were used as parameters. In the second experiment combinations of intervals of classification by size of 0.5mm, 1.00mm, and unrated by size with different seed base diameters in a soybean cultivar. 5.0mm, 5.5mm, 6.0mm, and 6.5mm diameters were used. We evaluated the percentage of sowing at normal spacing, double spacing, spacing at failure, spacing at double failure, average spacing, number of seeds per linear meter, and population per hectare. A speed of 6.5km/hr was set for evaluation and desired sowing density of 14 seeds per linear meter. In the Experiment 3 the same parameters of the Experiment 2 were evaluated, but in four different soybean cultivars. The equipment used in the Experiments 2 and 3 to evaluate the plantability was Corn Counter from Syngenta. In the Experiment 4 the evaluation involved 182 samples of soybean seed lots collected in the warehouses of seeds buying companies. A quality assessment of classification by seed company size from Brazil, Paraguay, Argentina, saved grains, and Sementes Iruña company was done. All samples were subjected to sieving retention test. RDS parameters, number of sieves, and the percentage participation of each seed diameter. Based on the results, the following conclusions were drawn: the classification of soybean seeds by size favors plantability, showing lower rates of double sowing, failures and double failures, and a better distribution in lower spacing that favors a better fit in the sowing density. The classification in the range of 0.5 mm favors the plantability indexes with high retention in the dominant sieve, and favoring the choice of sowing disks. The great majority of seeds producing companies from Brazil, Paraguay, and Argentina have no rigor in seed classification by size classification. / A mudança no perfil das variedades de soja que favorecem a redução de população vem acompanhada da necessidade de aperfeiçoamento no processo de classificação das sementes por largura, uniformizando a distribuição na linha de semeadura. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a classificação de sementes de soja por largura, com fins de precisão de semeadura. O primeiro experimento conceituou lotes classificados em intervalos de 0,5mm, 1,00mm e sem classificação por largura. Para tal, usou-se como parâmetros a retenção na peneira dominante e o número de diâmetros encontrados em cada um dos intervalos avaliados. No segundo experimento foram avaliadas as combinações de intervalos de classificação por largura em 0,5mm, 1,0mm e sem classificação por largura, com diferentes diâmetros base de sementes em uma cultivar de soja. Foram utilizados os diâmetros: 5,0mm, 5,5mm, 6,0mm e 6,5mm. Também, foram avaliados: percentagem de semeadura em espaçamento normal, espaçamento duplo, espaçamento em falha, espaçamento em dupla falha, espaçamento médio, número de sementes por metro linear e população por hectare. Para a avaliação fixou-se a velocidade de 6,5Km-1h e densidade de semeadura desejada de 14 sementes por metro linear. No experimento três, foram avaliados os mesmos parâmetros do experimento dois, porém em quatro diferentes cultivares de soja. Para os experimento dois e três, o equipamento utilizado para plantabilidade foi o Corn Counter, da Syngenta No experimento 4 a avaliação envolveu 182 amostras de lotes de sementes de soja coletadas em armazéns de empresas compradoras de sementes. Nesse experimento, fez-se uma avaliação da qualidade da classificação por largura de empresas de sementes originadas do Brasil, Paraguai, Argentina, semente caseira e da empresa Sementes Iruña . Todas as amostras foram submetidas ao teste de retenção de peneiras. Avaliaram-se, ainda, os parâmetros: retenção na peneira dominante (RPD), número de peneiras e participação em percentagem de cada diâmetro de semente. Com base nos resultados, obtiveram-se as seguintes conclusões: a classificação de sementes de soja por largura favorece a plantabilidade, demonstrando menores índices de semeaduras duplas, falhas e duplas falhas, e uma melhor distribuição em espaçamento normal, favorecendo um melhor ajuste na densidade de semeadura; a classificação em intervalo de 0,5mm favorece os índices de plantabilidade, apresentando alta retenção na peneira dominante, favorecendo a escolha de discos de semeadura.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The study uses dominant trees to describe the tinning, because they are those that possess larger energy inside of a forest settlement. The main objective of the work is to model and to select models to describe the relationship among the potential number of trees for hectare in function of the dominant height, elaborating a system of curves guides how to aid in the determination of the tinning. The municipal and districts where are located the forests are: Cambará do Sul (RS), São Francisco de Paula (RS), Distrito de Tainhas (RS), Distrito dos Kroeff (RS), Bocaína do Sul (SC), Correia Pinto (SC), Curitibanos (SC), Lages (SC), Otacílio Costa (SC), Ponte Alta do Norte (SC) and Santa Cecília (SC). The units temporary sample random were installed using the Method of modified Prodan, or be, 12 trees were measured by unit sample being the center of the unit the dominant tree of the sample. The units were installed at forests in competition from 5 to 40 meters of dominant height. In those units they were measured: the distance of the 11 trees to the central dominant tree; diameter and the height of the 12 trees; the crown diameter, the length of total crown and the exposed crown length to the light of the 2 dominant trees of the sample. The calculated variables were the number of potential trees for hectare, the Index of relative spacing, the crown percentage and the index of competition of Glover and Hool. The modelling made calculations by the statistical package (Statistical Analysis System) version 8.0 and the adjustment of the equations and covariance analysis for the procedure GLM ( General Lineal Models). The equations that best describes the potential number of trees for hectare were Ln(Np) = 10,31285 - 1,28518*(ln(hdom) with a R²aj 0,68 and CV of 4,76% for the class of S'% of 14-20% and Ln(Np) = 10,36304 - 1,16938*(ln(hdom) with a R²aj 0,34 and CV of 5,24% for the class of S'% of 14-20%. The use of the dominant height as independent variable is efficient to describe the guidelines for tinning in the settlements of Pinus taeda. The model of negative exponential regression adjusts with good precision and low mistake the relationship among the potential number of trees for hectare and the dominant height. The variation of the values of potential frequency for hectare for a given dominant height is strongly reduced with the bedding of the data in classes of Index of relative spacing of Hart Becking larger than 14% and smaller than 14% allowing to elaborate frequency curves for hectare for those two situations. The development of the frequency curves stratified by Index of relative spacing influences in the dimension of the diameter of the trees for a same dominant height. / O estudo utiliza árvores dominantes para descrever o desbaste, pois são aquelas que possuem maior vigor dentro de um povoamento florestal. O principal objetivo do trabalho é modelar e selecionar modelos para descrever a relação entre o número potencial de árvores por hectare em função da altura dominante, elaborando um sistema de curvas guias como auxiliar na determinação do desbaste. Os municípios e distritos onde estão localizadas as florestas são: Cambará do Sul (RS), São Francisco de Paula (RS), Distrito de Tainhas (RS), Distrito dos Kroeff (RS), Bocaína do Sul (SC), Correia Pinto (SC), Curitibanos (SC), Lages (SC), Otacílio Costa (SC), Ponte Alta do Norte (SC) e Santa Cecília (SC). As unidades amostrais temporárias foram instaladas aleatoriamente utilizando o Método de Prodan modificado, ou seja, foram medidas 12 árvores por unidade amostral sendo o centro da unidade a árvore dominante da amostra. As unidades foram instaladas em florestas em competição de 5 a 40 metros de altura dominante. Nessas unidades foram medidas: a distância das 11 árvores até a árvore dominante central; o DAP e a altura das 12 árvores; o diâmetro de copa, o comprimento de copa total e o comprimento de copa exposto à luz das 2 árvores dominantes da amostra. As variáveis calculadas foram o número de árvores potenciais por hectare, o Índice de espaçamento relativo, a percentagem de copa e o índice de concorrência de Glover e Hool. A modelagem foi calculada pelo pacote estatístico SAS (Statistical Analysis System) versão 8.0 e o ajuste das equações e análise de covariância pelo procedimento GLM (General Linear Models). As equações que melhor descrevem o número potencial de árvores por hectare foram Ln(Np) = 10,31285 1,28518*(ln(hdom) com um R²aj de 0,68 e CV de 4,76% para a classe de S % de 14 20% e Ln(Np) = 10,36304 1,16938*(ln(hdom) com um R²aj de 0,34 e CV de 5,24% para a classe de S % de 14 20%. O uso da altura dominante como variável independente é eficiente para descrever as diretrizes para desbaste nos povoamentos de Pinus taeda. O modelo de regressão exponencial negativo ajusta com boa precisão e baixo erro a relação entre o número potencial de árvores por hectare e a altura dominante. A variação dos valores de freqüência potencial por hectare para uma dada altura dominante é fortemente reduzida com a estratificação dos dados em classes de Índice de espaçamento relativo de Hart Becking maior do que 14% e menor do que 14% permitindo elaborar curvas de freqüência por hectare para essas duas situações. O desenvolvimento das curvas de freqüência estratificado por Índice de espaçamento relativo influi na dimensão do diâmetro das árvores para uma mesma altura dominante.

La fibrillation atriale (FA) est l’arythmie soutenue la plus fréquente ; elle entraine une majoration significative de la morbidité et de la mortalité. Les mécanismes qui en sont responsables sont encore incomplètement connus, et sa prise en charge n’est pas optimale. Afin de mieux comprendre la physiopathologie de la FA, nous avons mené différents travaux sur des coeurs de moutons isolés et perfusés par un système de Langendorff mais également en créant un modèle chronique de FA persistante de longue durée. Dans un modèle ovin de FA persistante, nous avons ainsi démontré que la fréquence dominante (DF) de la FA augmentait progressivement pendant les premières semaines de l’arythmie, alors que les épisodes étaient paroxystiques, phénomène en rapport avec le raccourcissement de la durée du potentiel d’action secondaire au remodelage électrophysiologique. La DF se stabilisait dès lors que la FA devenait persistante, une fois le remodelage électrophysiologique maximal. L’accélération de la DF (dDF/dt) était significativement corrélée au temps nécessaire à la transition vers la FA persistante. Le remodelage structurel n’apparaissait que secondairement, une fois l’arythmie devenue persistante. Sur le plan thérapeutique, nous avons étudié les mécanismes anti-arythmiques de la chloroquine (bloqueur d’IK1) et de la ranolazine (bloqueur d’INa), molécules entrainant un ralentissement de la fréquence de rotation des rotors, une diminution de la DF et un retour en rythme sinusal. Ces travaux nous ont permis de mieux appréhender le rôle des ces courants ioniques dans le maintien de la FA. Enfin, nous avons démontré l’efficacité de l’ablation de la FA en utilisant le cryoballon (CB) de deuxième génération, efficacité grevée d’un taux de parésie du nerf phrénique élevé, dont nous avons pu prédire la survenue à l’aide d’un prédicteur simple, la distance entre le bord du CB et la cathéter permettant de stimuler le nerf phrénique pendant l’application. Une meilleure compréhension des mécanismes à l’origine de l’initiation et du maintien de cette arythmie, ainsi qu’une meilleure prise en charge thérapeutique permettraient d’améliorer la qualité de vie des patients et d’en diminuer le taux de complications. / Atrial fibrillation (AF) is the most common sustained arrhythmia, significantly increasing patients’ morbidity and mortality. The mechanisms explaining the initiation and maintenance of the arrhythmia are incompletely understood, and the current treatment strategy is suboptimal. To better understand the pathophysiology of AF, we conducted various projects using Langendorff-perfused sheep hearts and a chronic model of long-standing persistent AF. In the model of persistent AF, we demonstrated that dominant frequency (DF) progressively increases during the first weeks of the arrhythmia, during its paroxysmal stage, due to the electrophysiological remodeling resulting in atrial action potential shortening. DF stabilizes once the electrophysiological remodeling is maximal, and the arrhythmia becomes persitent. The rate of DF increase (dDF/dt) was strongly correlated with the time to persistent AF. Structural remodeling appears secondarily, once transition has occured. We also studied the anti-arrhythmic mechanisms of chloroquine (IK1 blocker) and ranolazine (INa blocker), which slow the frequency of rotation of rotors, decrease the DF and favor reversal to sinus rhythm. These projects helped us to better understand the importance of these currents in AF dynamics. Lastly, we demonstrated the increased efficacy of AF ablation when using the second generation cryoballoon (CB), which regrettably increases the occurrence of phrenic nerve palsy. A simple, reliable predictor of this complication was found, the distance between the lateral edge of the CB and the phrenic nerve stimulating catheter. A better understanding of the mechanisms underlying the initiation and maintenance of AF, in conjunction with better therapeutic strategies will help to improve patients’ quality of life and decrease the complications of the arrhythmia.

L’atrophie optique dominante (AOD, MIM#165500) est une pathologie héréditaire affectant un individu sur 30 000 environ. Elle touche principalement les cellules ganglionnaires de la rétine qui composent le nerf optique, entraînant une baisse d’acuité visuelle. Cette pathologie, génétiquement et cliniquement hétérogène, est majoritairement due aux mutations du gène OPA1. La protéine mitochondriale OPA1 est impliquée dans de multiples fonctions telles que la fusion des mitochondries, le métabolisme énergétique, l’apoptose et la maintenance de l’ADN mitochondrial. Afin d’appréhender les effets globaux des dysfonctions d’OPA1, nous avons développé des approches métabolomiques et lipidomiques non-targeted sur des plasmas et des fibroblastes de patients ainsi que sur des modèles murins. En dépit des spécificités de chaque modèle et matrice, nos études ont clairement révélé des altérations métaboliques communes dont une déficience en aspartate. Ce déficit est impliqué dans le métabolisme des nucléotides et est en relation directe avec le défaut énergétique révélé dans nos différents modèles. Avec l’approche lipidomique, nous avons montré dans les fibroblastes de souris invalidés pour le gène OPA1 une augmentation importante des triglycérides qui est en lien avec le défaut énergétique. De plus, nous avons mis en évidence un remaniement majeur des phospholipides qui témoigne d’un profond remodelage des structures membranaires mitochondriales. Ces approches nous ont ainsi permis d’avoir de nouvelles données sur les implications physiopathologiques d’OPA1. L’ensemble de ce travail ouvre de nouvelles perspectives pour une meilleure prise en charge de la pathologie. / Dominant Optic Atrophy (DOA, MIM #165500) is an inherited disease affecting one of 30,000 individuals. It mostly affects the retinal ganglion cells that make up the optic nerve, leading to the decrease invisual acuity. This genetically and clinically heterogeneous pathology is mainly related to the mutations on OPA1 gene. The mitochondrial protein OPA1 has been implicated in many functions including mitochondrial fusion, energy metabolism, apoptosis and maintenance of mitochondrial DNA. In order to investigate the overall effects of OPA1 dysfunctions, we developed non-targeted metabolomic and lipidomic approaches on patients' plasmas and fibroblasts as well as on OPA1 knock-out mouse fibroblast model. Despite the specificities of each model and matrix, we clearly revealed a common metabolic alteration including an aspartate deficiency due to the energy defect observed in all our models and responsible for the alteration of nucleotide metabolism. With a lipidomic approach, we revealed in the knock-out cell model a huge increase of triglycerides which is related to the energetic deficiency. Moreover, we highlighted a major alteration on phospholipids, testifying a deep remodeling of mitochondrial membrane structures. Taken together, our analysis revealed new pathophysiological roles of OPA1. Finally, our work opens new perspectives to improve the diagnosis and the patient care.

« Derniers instants », première partie de ce mémoire, est un roman dont la protagoniste, une octogénaire issue d’une famille aux valeurs traditionnelles, refuse de se conformer aux idéologies d’une société patriarcale, comme sa mère, sa grand-mère et toutes les femmes qui les ont précédées l’ont fait avant elle. C’est une démarche créative inspirée par la restitution de la part des femmes dans l’histoire, depuis l’avènement des études féministes. Un regard a posteriori, une relecture de l’expérience féminine. Dans la deuxième partie, « Modèle familial et filiations dans Fugueuses de Suzanne Jacob », je m’intéresse à la fonction que Jacob attribue à l’écrivain. En effet, pour l’auteure, chaque individu est un lecteur du monde. Le rapport dialogique qu’elle établit entre le texte littéraire et les « fictions dominantes » rend compte de sa démarche créative, c’est-à-dire l’écriture comme l’aboutissement d’une lecture singulière des évidences, de l’entendu, du ce-qui-va-de-soi. / « Derniers instants » is a novel about a lady in her eighties, born in a family with traditional values, who refuses to conform to the rules of a Patriarchal Society. A creative approach inspired by the restitution of women’s contribution to History. It proposes a kind of a look back, like a reviewed version of feminine experience. The essay « Modèle familial et filiations dans Fugueuses de Suzanne Jacob » analyses the fonction that the author attributes to writers. According to her, each individual is able to bring new meanings to social hegemonies. The dialogical relation that she establishes between them and literature is relevant of her scripture, in which writing is the result of a unique interpretation of the obvious and the evidences.