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Agrupando dados e kernels de um simulador cardíaco em um ambiente multi-GPU

Cordeiro, Raphael Pereira 10 March 2017 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-07-04T17:30:00Z No. of bitstreams: 1 raphaelpereiracordeiro.pdf: 17027543 bytes, checksum: 91ef68c2021ff4c93dc8b4fe66217cf2 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-08-08T13:42:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 raphaelpereiracordeiro.pdf: 17027543 bytes, checksum: 91ef68c2021ff4c93dc8b4fe66217cf2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-08T13:42:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 raphaelpereiracordeiro.pdf: 17027543 bytes, checksum: 91ef68c2021ff4c93dc8b4fe66217cf2 (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / A modelagem computacional é uma ferramenta útil no estudo de diversos fenômenos complexos, como o comportamento eletro-mecânico do coração em condições normais e patológicas, sendo importante para o desenvolvimento de novos medicamentos e métodos de combate às doenças cardíacas. A alta complexidade de processos biofísicos se traduz em complexos modelos matemáticos e computacionais, o que faz com que simulações cardíacas necessitem de um grande poder computacional para serem executadas. Logo, o estado da arte em simuladores cardíacos é implementado para ser executado em arquiteturas paralelas. Este trabalho apresenta a implementação e avaliação de um método com dados e kernel agregados, método este utilizado para reduzir o tempo de computação de códigos que executam em ambientes computacionais compostos de múltiplas unidades de processamento gráfico (Graphics Processing Unit ou simplesmente GPUs). Este método foi testado na computação de uma importante parte da simulação da eletrofisiologia do coração, a resolução das equações diferenciais ordinárias (EDOs), resultando em uma redução pela metade do tempo necessário para a sua resolução, quando comparado com o esquema onde este método não foi implementado. Com o uso da técnica proposta neste trabalho, o tempo total de execução das simulações cardíacas foi reduzido em até 25%. / Computational modeling is a useful tool to study many distinct and complex phenomena, such as to describe the electrical and mechanical behavior of the heart, under normal and pathological conditions. The high complexity of the associated biophysical processes translates into complex mathematical and computational models. This, in turn, translates to cardiac simulators that demand a lot of computational power to be executed. Therefore, most of the state-of-the-art cardiac simulators are implemented to run in parallel architectures. In this work a new coalesced data and kernel scheme is evaluated. Its objective is to reduce the execution costs of cardiac simulations that run on multi-GPU environments. The new scheme was tested for an important part of the simulator, the solution of the systems of Ordinary Differential Equations (ODEs). The results have shown that the proposed scheme is very effective. The execution time to solve the systems of ODEs on the multi-GPU environment was reduced by half, when compared to a scheme that does not implemented the proposed data and kernel coalescing. As a result, the total execution time of cardiac simulations was 25% faster.
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Modelo matemático de potencial de ação e transporte de Ca2+ em miócitos ventriculares de ratos neonatos / Mathematical model of action potential and Ca2+ transport in ventricular myocytes of neonatal rats

Oshiyama, Natália Ferreira, 1985- 24 August 2018 (has links)
Orientadores: José Wilson Magalhães Bassani, Rosana Almada Bassani / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-24T11:00:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oshiyama_NataliaFerreira_D.pdf: 4721295 bytes, checksum: 5ed8a9a173462afb13315f133bf426f8 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O potencial de ação (PA), variação do potencial elétrico através da membrana (Em), é gerado por fluxos iônicos através de canais e transportadores, cuja função e expressão pode ser alterada por hormônios, neurotransmissores, drogas e toxinas. Trata-se de um sistema complexo, para o qual os modelos computacionais constituem ferramenta importante de estudo. No presente trabalho, foi desenvolvido um modelo de PA e transporte de Ca2+ em células ventriculares de ratos neonatos, para o que foi necessário medir a concentração intracelular de Na+ ([Na+]i) e a corrente de Na+ (INa) em cardiomiócitos isolados, sobre as quais há pouca informação na literatura, e as correntes de Ca2+ (ICa), transiente de saída (Ito) e retificadora tardia (IK) de K+, além do próprio PA para melhorar a precisão do modelo. Medições em miócitos de ratos adultos foram realizadas para comparação. Foi observada menor excitabilidade das células de ratos neonatos, o que poderia ser explicado por um deslocamento da curva de ativação de INa de ~10 mV para a direita, i.e., a ativação dos canais de Na+ ocorreu em Em menos negativos e numa faixa mais ampla de Em em miócitos de neonatos do que em células de adultos. Outra diferença encontrada foi com relação à densidade de INa, ~2 vezes maior em células de neonatos. O maior influxo de Na+ poderia causar um aumento da [Na+]i durante a atividade em células de recém-nascidos, que foi confirmado pela medição de [Na+]i. No entanto, não houve aumento significativo quando ICa e o trocador Na+/Ca2+ (NCX) foram inibidos, o que indica que o aumento da [Na+]i se deve mais ao efluxo de Ca2+ via NCX do que ao influxo pelos canais de Na+ do sarcolema. Além disso, observou- se maior duração do PA em miócitos de neonatos, que poderia ser explicada pela menor densidade observada de correntes repolarizantes (Ito e IK). No entanto, não foi detectada diferença entre idades na densidade de ICa. Dados de simulações mostraram que o retículo sarcoplasmático (RS) é a principal fonte do Ca2+ ativador da contração e que a liberação fracional de Ca2+ do RS nos ratos neonatos é menor que nos adultos, confirmando dados experimentais deste laboratório. Portanto, o modelo poderá ser utilizado para predizer possíveis alterações eletrofisiológicas dos cardiomiócitos de ratos neonatos em diferentes condições. / Abstract: The action potential (AP), a change in electrical potential across the membrane (Em), is generated by ionic fluxes through channels and transporters, of which function and expression may be affected by hormones, neurotransmitters, drugs and toxins. Computational models constitute an important tool for the study of this highly non-linear and complex system. In this work, a model of AP and Ca2+ transport in ventricular cells of neonatal rats was developed. It was necessary to measure the intracellular Na+ concentration ([Na+]i) and the Na+ current (INa), for which information in the literature is scarce, and the Ca2+ current (ICa), as well as the outward transient (Ito) and delayed rectifier (IK) K+ currents, in addition to the AP itself, to improve the accuracy of the model. Measurements from adult rat myocytes were also made in order to compare these developmental phases. It was observed that neonatal rat cells are less excitable, which could be explained by a ~10 mV shift to the right of the channel activation curve, i.e., Na+ channels activation occured at less negative Em value and over a higher range of Em compared to adult cells. On the other hand, INa density was twice as great as that in adults. This might promote increase in [Na+]i during activity in cells from newborns, which was confirmed by measurement of [Na+]i. Nonetheless, significant Na+ accumulation was suppressed when ICa and the Na+ / Ca2+ exchanger (NCX) were inhibited, which indicates that the increase in [Na+]i probably depends more on Ca2+ efflux via NCX than on the influx through sarcolemmal Na+ channels. The longer AP duration in neonatal myocytes could be explained by the lower density of the repolarizing currents (Ito and IK). However, age-dependent difference in ICa density was not observed. Simulation data agreed with experimental data from this laboratory regarding the sarcoplasmic reticulum (SR) as the main source of Ca2+ during excitation-contraction coupling and the lower SR fractional release in neonatal than in adult myocytes. In conclusion, the present model may be used to predict possible electrophysiological alterations in developing cardiomyocytes under different conditions. / Doutorado / Engenharia Biomedica / Doutora em Engenharia Elétrica
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Potenciais evocados auditivos de longa latência em indivíduos com apneia obstrutiva do sono / Long latency auditory evoked potentials in individuals with obstructive sleep apnea

Raquel Meirelles Pedreno 18 May 2017 (has links)
Introdução: A Apneia Obstrutiva do Sono (AOS) é uma das entidades clínicas mais encontradas na população, sendo caracterizada por obstruções parcial ou total recorrente da via aérea durante o sono, levando a hipóxia intermitente e fragmentação do sono. Suas consequências envolvem sonolência excessiva, risco de acidentes de trabalho e de trânsito, déficits cognitivos e doenças cardiovasculares. Os potenciais evocados auditivos avaliam a atividade neuroelétrica na via auditiva, fornecendo uma medida objetiva do funcionamento do sistema auditivo. Visto que as alterações cognitivas na AOS podem ser múltiplas, espera-se que os potenciais evocados auditivos de longa latência (PEALL) possam ser utilizados como uma ferramenta de avaliação nos pacientes com AOS, mostrando uma melhor compreensão dos prejuízos da AOS e auxiliando no tratamento. Objetivo: Caracterizar os potenciais evocados auditivos de longa latência em indivíduos portadores de AOS de grau leve, moderado e grave, correlacionando os achados eletrofisiológicos com a severidade do distúrbio do sono, além de comparar com os resultados obtidos em indivíduos sem AOS. Método: Participaram deste estudo 59 indivíduos, na faixa etária de 22 a 54 anos (média de 34,87 anos) e de ambos os gêneros (52 homens e 07 mulheres). Os voluntários foram divididos em quatro grupos: sem AOS, com AOS leve, com AOS moderada e com AOS grave. Todos os participantes realizaram a polissonografia (PSG) para fornecer o grau da severidade da AOS, mesmo os voluntários sem queixa para AOS, para se descartar a possibilidade de apresentar a doença. Os indivíduos também foram submetidos à avaliação audiológica convencional. Para a obtenção dos componentes P1, N1, P2, N2 e P3 do PEALL, foram utilizados dois estímulos acústicos: fala (sílabas /ba/ e /da/), e tone-burst (frequências de 1000 Hz e 2000Hz), ambos na intensidade de 75dBnNA. Foram analisadas as latências (em ms) dos componentes P1, N1, P2, N2 e P3 e as amplitudes (em uv) P1- N1, P2-N2 e P3. Resultados: No PEALL com estímulo fala, o grupo grave apresentou a menor latência no N2 (p-valor < 0,001) e para o P3, todos os grupos apresentaram maior latência na orelha direita (p-valor=0,016). Houve diferença estatisticamente significante para amplitude do P3 (p-valor=0,016), com maior amplitude para orelha esquerda em todos os grupos. No PEALL com estímulo tone burst, apenas as latências dos componentes P2 e N2 apresentaram diferença estatisticamente significante (p-valor=0,010 e p-valor= 0,010, respectivamente), com menor latência para o grupo com AOS grave. Nestes mesmos componentes, houve diferença entre as orelhas. Foi encontrada diferença na amplitude P2-N2, com menor amplitude para o grupo com AOS grave (p-valor < 0,001). Conclusão: Indivíduos com AOS apresentam um aumento progressivo da latência do componente P3 dos PEALL conforme aumento da severidade da doença para o estímulo fala, bem como uma diminuição da amplitude P2-N2 para estímulo tone-burst no grupo com AOS grave quando comparada com os demais grupos, sugerindo interferência do grau de severidade da doença nos PEALL. De uma maneira geral, indivíduos com AOS grave apresentaram latências prolongadas e amplitudes reduzidas no PEALL quando comparados com indivíduos sem AOS / Introduction: The Obstructive Sleep Apnea (OSA) is one of the most common disease found in the population, characterized by partial or full airways obstruction during the sleep, leading to hypoxia and frequent awakenings. Its consequences are daytime sleepless, risk of work and car accidents, cognitive deficit and cardiovascular disease. The auditory evoked potential evaluates the neuroelectric activity in the auditory pathway, giving an objective measure about the auditory system function. Since the OSA cognitive dysfunctions can be multiples, it is expected that the Long Latency Auditory Evoked Potential (LLAEP) could be used as an evaluation tool in the patients with OSA, showing a better comprehension of its injuries and helping on the treatment. Objective: To characterize the long latency auditory evoked potentials in individuals with mild, moderate and severe OSA, comparing the results with the severity of the disease, and also comparing the results with individuals without OSA. Method: 59 individuals participated of this research, with ages bettwen 22 and 54 years old (average 34.87) and from both genders (52 men and 7 women). The volunteers were divided in four groups: without OSA, with mild OSA, moderate OSA and with severe OSA. All participants performed the polysomnography (PSG) for classifying the OSA severity, even the volunteers without OSA, to guarantee the inexistence of the disease. They were also submitted to a conventional audiology evaluation. To obtain the components P1, N1, P2, N2 and P3 in LLEAP, it was used two acoustic stimulus: speech (syllables / ba / e / da /), and tone-burst (frequencies of 1000 Hz and 2000 Hz), both with 75 dBnNA intensity. It were analyzed the latencies (in ms) of the components P1, N1, P2, N2 and P3 and the amplitudes (in uv) P1-N1, P2-N2 and P3 .Results: In the LLEAP with speech stimulus, the severe group presented the lowest latency in N2 (p-value < 0.001) and for P3, all groups had delay of latency in the right ear (p-value = 0.016). There was a significantly difference for P3 amplitude (p-value = 0.016), with higher amplitude for the left ear in all groups. In the LLAEP with tone burst stimulus, only the P2 and N2 latencies presented a significantly difference (P-value = 0.010 and P-value = 0.010, respectively), with lower latency for the group with severe OSA. In these same components, there was difference between the ears. A difference in the P2-N2 amplitude was found, with a lower amplitude for the group with severe OSA (p-value < 0.001). Conclusion: Individuals with OSA showed a progressive increase in the latency according to the severity of the disease in the component P3 in LLAEP for the speech stimulus, as well as lower amplitude in P2-N2 with tone burst stimulus for the severe OSA group, suggesting interference of the disease severity degree in the LLAEP. In general, individuals with severe OSA presented increased latencies and lower amplitudes in the LLAEP when compared to individuals without OSA
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Medidas de dependência entre séries temporais: estudo comparativo, análise estatística e aplicações em neurociências / Measures of dependence between time series: Comparative study, statistical analysis and applications in neuroscience

Carlos Stein Naves de Brito 29 July 2010 (has links)
Medidas de dependência entre séries temporais são estudadas com a perspectiva de evidenciar como diferentes regiões do cérebro interagem, por meio da aplicação a sinais eletrofisiológicos. Baseado na representação auto-regressiva e espectral de séries temporais, diferentes medidas são comparadas entre si, incluindo coerência espectral e a coerência parcial direcionada, e introduz-se uma nova medida, denominada transferência parcial direcionada. As medidas são analisadas pelas propriedades de parcialização, relações diretas ou indiretas e direcionalidade temporal, e são mostradas suas relações com a correlação quadrática. Conclui-se que, entre as medidas analisadas, a coerência parcial direcionada e a transferência parcial direcionada possuem o maior número de características desejáveis, fundamentadas no conceito de causalidade de Granger. A estatística assintótica é desenvolvida para todas as medidas, incluindo intervalo de confiança e teste de hipótese nula, assim como sua implementação computacional. A aplicação a séries simuladas e a análise de dados eletrofisiológicos reais ilustram o estudo comparativo e a aplicabilidade das novas estatísticas apresentadas. / Measures of dependence between temporal series are studied in the context of revealing how different brain regions interact, through their application to electrophysiology. Based on the spectral and autoregressive model of time series, different measures are compared, including coherence and partial directed coherence, and a new measure is introduced, named partial directed transfer. The measures are analyzed through the properties of partialization, direct or indirect relations and temporal directionality, and their relation to quadratic correlation is shown. It results that among the presented measures, partial directed coherence and partial directed transfer reveal the highest number of desirable properties, being grounded on the concept of Granger causality. The asymptotic statistics for all measures are developed, including confidence intervals and null hypothesis testing, as well as their computational implementation. The application to simulated series and the analysis of electrophysiological data illustrate the comparative study and the applicability of the newly presented statistics.
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Efeitos do abrasamento elétrico da amígdala basolateral em padrões oscilatórios durante o sono / Effects of basolateral amygdala kindling on oscillatory patterns during sleep

Zacharias, Leonardo Rakauskas 01 February 2019 (has links)
Na epilepsia do lobo temporal (ELT), alterações morfofuncionais em estruturas límbicas são classicamente acompanhadas de déficits cognitivos. Estudos anteriores revelaram que disfunções eletrofisiológicas em circuitos hipocampo-corticais são observadas durante o sono NREM (non rapid eye movement), onde eventos patológicos como fast ripples e IEDs (interictal epileptiform discharges) substituem gradativamente eventos fisiológicos, como as sharp-wave ripples (SWR). Tal substituição pode estar por trás dos prejuízos cognitivos observados tanto nos modelos animais como em pacientes, já que as SWRs são fundamentais para a transferência de informação do hipocampo ao córtex durante a consolidação de memórias. De maneira complementar, o sono REM também parece exercer um papel fundamental em processos mnemônicos, facilitando eventos de plasticidade sináptica e coordenando regiões encefálicas distantes por meio de acoplamento entre diferentes frequências oscilatórias, tais como teta e gama. Entretanto, as alterações no sono REM durante os processos de epileptogênese ainda foram pouco exploradas. Neste trabalho testamos a hipótese de que disfunções na coordenação rítmica durante o sono REM estariam associadas a prejuízos de memória que se manifestam na epileptogênese. Para isso, submetemos ratos Wistar adultos machos a protocolo de abrasamento rápido da amígdala basolateral, possibilitando a avaliação de alterações eletrofisiológicas gradativas durante o processo de epileptogênese. Foram realizados implantes crônicos de eletrodos para registro do potencial local de campo (LFP, Local Field Potential) nas regiões de CA1 e do córtex pré-frontal medial (mPFC, medial prefrontal cortex), além de eletrodos bipolares para estímulo na amígdala basolateral. Os protocolos de abrasamento foram realizados durante um período de 3 dias, aplicando-se diariamente 10 trens de estímulos a 50 Hz com duração de 10 segundos. Para avaliarmos os prejuízos cognitivos, os animais foram submetidos a testes de reconhecimento de objetos antes do início a após o término dos protocolos de abrasamento. O sonosubsequente às sessões de reconhecimento de objetos e aos protocolos de estimulações foram registrados diariamente. Além do prejuízo no reconhecimento de objetos e alterações eletrofisiológicas durante o sono NREM, como a substituição gradativa de ripples por IEDs, os animais submetidos ao abrasamento elétrico apresentaram um aumento na comodulação fase-amplitude entre oscilações teta e gama durante o sono REM após as estimulações, exibindo também uma correlação negativa entre a comodulação e a duração das pós-descargas induzidas pelos estímulos elétricos do abrasamento durante o sono subsequente a aplicação dos protocolos. Nossos achados ampliam a compreensão vigente sobre como alterações de oscilações cerebrais durante o sono, especialmente da fase REM, poderiam estar subjacentes a prejuízos de memória que ocorrem na ELT. / Morphofunctional changes in limbic structures are classically followed by cognitive deficits in Temporal Lobe Epilepsy (TLE) patients. Previous studies revealed that electrophysiological dysfunctions in hippocampal-cortical circuits are observed during NREM (non-rapid eye movement) sleep, where pathological events such as fast ripples and IEDs (interictal epileptiform discharges) gradually replace physiological events, such as Sharpwave Ripples (SWR). This replacement seems to describe the cognitive impairments observed in animal models and TLE patients since SWRs are fundamental for information transfer from the hippocampus to cortex during memory consolidation. Complementary, REM sleep also plays a significant role in mnemonic processes, facilitating synaptic plasticity events and coordinating distant brain regions by coupling different frequencies, such as theta and gamma. However, alterations in REM sleep during the epileptogenesis processes are poorly investigated. In this study, we tested the hypothesis that dysfunctions on rhythmic coordination during REM sleep would be associated with memory deficits showed during epileptogenesis. For this, we submitted adult Wistar rats to a rapid kindling protocol on basolateral amygdala (BLA), allowing the evaluation of progressive electrophysiological changes during the epileptogenic process. Chronic electrodes were implanted for the local field potentials (LFP) recording in the CA1 and medial prefrontal cortex (mPFC), as well as bipolar electrodes for BLA stimulation. The kindling protocols were performed during three days, applying ten trains of 50 Hz stimulations with ten seconds duration. Object recognition tasks were performed before and after the kindling protocol to evaluate cognitive impairment. Sleep recordings were performed daily after the object recognition or kindling application. Along with object recognition impairment and electrophysiological changes during NREM sleep, such as progressive SWR substitution by IEDs, kindled rats presented an increase in phase-amplitude comodulation between theta and gamma oscillations during REM sleep after stimulation sessions, which also correlates negatively with after-discharges (AD) duration induced by the kindling stimulation. Our findingsexpand the comprehension about how changes in brain oscillations during REM sleep underlies observed memory deficits in TLE.
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Estudo dos potenciais evocados auditivos em indivíduos com queixa de zumbido / Study of auditory evoked potentials in individuals with tinnitus complaint

Santos Filha, Valdete Alves Valentins dos 28 September 2009 (has links)
INTRODUÇÃO: na tentativa de elucidar alguns aspectos relacionados ao zumbido, levantou-se a hipótese de alteração nas vias auditivas centrais. Diante disso, os potenciais evocados auditivos podem representar uma alternativa para detectar possíveis alterações auditivas centrais que possam estar presentes nesta população e que indiquem o provável sítio gerador desse sintoma. OBJETIVO: caracterizar os potenciais evocados auditivos de curta, média e longa latências em indivíduos com e sem queixa de zumbido e expostos a ruído ocupacional. MÉTODO: foram avaliados 60 sujeitos expostos a ruído de origem ocupacional com níveis de pressão sonora elevados (maior que 85 dBA), tanto do gênero masculino quanto feminino, na faixa etária entre 29 e 50 anos de idade, sendo 30 com queixa de zumbido (grupo pesquisa) e 30 sem queixa de zumbido (grupo controle). Foram realizados os potenciais evocados auditivos de curta, média e longa latências. RESULTADOS: na análise dos potenciais de curta latência, foi observado um aumento predominante das latências das ondas I e III, bem como, alteração de tronco encefálico baixo em 16 indivíduos do grupo pesquisa. Quanto aos potenciais de média latência, observou-se médias maiores para a latência da onda Na nas modalidades C4/A1 e C3/A2 no grupo pesquisa, evidenciando oito indivíduos com alteração. Por sua vez, para a latência da onda Pa e amplitude Na-Pa, tal aumento foi encontrado em todas as modalidades analisadas (C3/A1, C4/A1, C3/A2, C4/A2), sendo o efeito eletrodo o tipo de alteração mais frequentemente observado para a amplitude Na-Pa, e o aumento de latência para as ondas Na e Pa. Com relação aos potenciais de longa latência, constatou-se que o grupo pesquisa apresentou valores médios das latências das ondas N1, P2 e P300 e amplitude N1-P2 maiores que o grupo controle. Observou-se, também, um maior número de indivíduos alterados para o grupo pesquisa nos componentes N1(18 indivíduos) e P2 (20 indivíduos), sendo que o mesmo não pôde ser observado para o componente P300. Para esses potenciais, o aumento de latência foi tipo de alteração mais evidente. No estudo da associação entre lado da alteração nos potenciais evocados auditivos e localização do zumbido, verificou-se uma maior associação entre zumbido bilateral e alteração bilateral nos potenciais evocados auditivos de tronco encefálico e nos componentes N1, P2 e P300. CONCLUSAO: com base nos achados descritos, os resultados mostraram homogeneidade dos dois grupos quanto à faixa etária e tempo de exposição ao ruído. Apesar da inexistência de significância em algumas análises realizadas, as medidas dos potenciais de curta, média e longa latências mostraram que a maior parte dos indivíduos avaliados do grupo pesquisa apresentou alteração ao serem comparados com o grupo controle. Portanto, poder-se-ia supor a existência de uma possível disfunção no Sistema nervoso auditivo central desde o nervo auditivo até a região cortical em indivíduos com queixa de zumbido expostos a níveis de pressão sonora de origem ocupacional / INTRODUCTION: attempting to elucidate some aspects related to tinnitus, the hypothesis of alteration in the central auditory pathways was raised. Thus, auditory evoked potentials may represent an alternative to detect possible central auditory disorders that may be present in this population and that indicate the probable generator site of such symptom. AIM: to characterize short, middle and long latencies auditory evoked potentials in individuals with and without tinnitus complaint and exposed to occupational noise. METHOD: sixty subjects exposed to occupational noise with elevated sound pressure level (greater than 85 dBA), male and female, ranging in age from 29 to 50 years old took part in this study; 30 of them had tinnitus complaint (study group) and 30 did not have tinnitus complaint (control group). Short, middle and long latencies auditory evoked potentials were performed. RESULTS: analyzing the short latency potentials it was observed a predominant increase of the latency of waves I and III, as well as alteration in the lower brainstem in 16 individuals of the study group. Concerning the middle latency potentials it was observed higher averages for the latency of wave Na in the modalities C4/A1 and C3/A2 in the study group, evidencing eight individuals with altered results. Such increase was found in all modalities analyzed (C3/A1, C4/A1, C3/A2, C4/A2) for the latency of wave Pa and amplitude Na-Pa; the electrode effect was the most frequent type of alteration observed for the amplitude Na-Pa and the latency increase, for waves Na and Pa. Concerning the long latency potentials it was observed that the study group presented greater mean values of latencies of waves N1, P2 and P300, and amplitude N1-P2 than the control group. It was also observed in the study group a greater number of altered results concerning the components N1 (18 individuals) and P2 (20 individuals); the same was not observed for the component P300. For these potentials, the latency increase was the most evident type of alteration. Studying the association between the side of the altered auditory evoked potentials and the localization of the tinnitus it was verified a higher association between bilateral tinnitus and bilateral alteration in the brainstem auditory evoked potentials and in components N1, P2 and P300. CONCLUSION: based on the findings described, results showed homogeneity in both groups concerning the age and the time of noise exposure. Despite the inexistence of statistical significance in some of the analysis performed, measures of short, middle and long latencies potentials showed that most of the individuals analyzed in the study group presented alteration when compared to the control group. Therefore, the existence of a possible dysfunction in the central auditory nervous system from the auditory nerve until the cortical region in individuals with tinnitus complaint, exposed to sound pressure levels of occupational origin could be supposed
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Potenciais evocados auditivos de tronco encefálico e de longa latência em crianças com tronstornos do espectro do autismo / Brainstem evoked response auditory and long-latency auditory evoked potential in children with autism spectrum disorder

Kamita, Mariana Keiko 31 August 2017 (has links)
Introdução: Indivíduos com Transtorno do Espectro do Autismo (TEA) apresentam prejuízos nas interações sociais, comunicação e comportamento, além de poderem apresentar alterações cognitivas e de linguagem. Tendo em vista que o desenvolvimento da linguagem depende do funcionamento adequado da via auditiva periférica e central, ressalta-se a importância da avaliação audiológica completa, em especial, da avaliação do Sistema Nervoso Auditivo Central nessa população, tanto no diagnóstico como durante o processo terapêutico. Objetivos: caracterizar o Potencial Evocado Auditivo de Tronco Encefálico (PEATE) com estímulos clique e fala e o Potencial Evocado Auditivo de Longa Latência (PEALL) com estímulos tone burst e de fala, em indivíduos com TEA. Metodologia: participaram deste estudo 30 indivíduos na faixa etária de sete a 12 anos, de ambos os sexos, sendo 15 do grupo estudo (GE - crianças com diagnóstico de TEA) e 15 do grupo controle (GC - crianças com desenvolvimento típico - DT), pareados por sexo e idade. Foram realizados os seguintes procedimentos: anamnese, meatoscopia, avaliação audiológica básica (audiometria tonal, logoaudiometria e imitanciometria), e avaliação eletrofisiológica da audição (PEATE com estímulos clique e fala, e PEALL com estímulos tone burst e fala). Todos os exames foram realizados no Centro de Docência e Pesquisa do Departamento de Fisioterapia, Fonoaudiologia e Terapia Ocupacional da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Resultados: No PEATE com estímulo clique, o valor médio de latência da onda I apresentou-se maior para orelha direita em ambos os grupos (valor-p = 0,037), ocorrendo assim o efeito orelha. Observou-se, também, que o interpico III - V no grupo com TEA foi maior do que o obtido no grupo com DT (valor-p = 0,046). No PEATE com estímulo de fala, a latência absoluta da onda V foi menor no grupo com TEA quando comparado ao grupo com DT (valor-p = 0,011). No PEALL, tanto para o estímulo tone burst quanto para o estímulo de fala, a latência do componente N1 foi maior na orelha direita (valor-p = 0,050), não sendo observada diferença significante entre os grupos tanto para os valores de latência quanto para os de amplitude dos componentes estudados. Conclusão: No que diz respeito ao PEATE clique, indivíduos com TEA apresentaram resultados sugestivos de alteração na via auditiva em tronco encefálico alto, indicando possíveis lesões ou disfunções do Sistema Nervoso Auditivo Central (SNAC). Com relação ao PEATE com estímulo de fala, pode-se concluir que a população de estudo apresentou codificação neural mais rápida da parte inicial do estímulo acústico (onset) quando comparada ao grupo com DT. Os resultados do PEALL não demonstraram alteração a nível cortical em indivíduos com TEA. Frente aos resultados obtidos, sugere-se novos estudos que realizem os exames eletrofisiológicos de curta e longa latência com um número maior de participantes / Introduction: Individuals with Autism Spectrum Disorder (ASD), showed issues in social interactions, communication and behavior, and it is also possible to present impaired cognitive and language skills. Taking into account the knowledge about the peripheral and central hearing, it highlights importance of the complete audiological evaluation, in particular, the evaluation of the Central Auditory Nervous System in this population, in diagnosis and during the therapeutic process. Aim: To characterize Brainstem Evoked Response Auditory (BERA) with click and speech stimuli and Long-Latency Auditory Evoked Potential (LLAEP) with tone burst and speech stimuli, in individuals with ASD. Methods: 30 children aged between seven and 12 years, of both sexes participated in this study, 15 of the study group (SG - children diagnosed with ASD) and 15 of the control group (CG - children with typical development - TD), matched by sex and age. The following tests were accomplished: anamnesis, meatoscopy, basic audiological evaluation (tonal audiometry, logoaudiometry and imitanciometry), and electrophysiological evaluation of hearing (BERA with click and speech stimulus and LLAEP with tone burst and speech stimulus). All the exams were done at the Teaching and Research Center of the Department of Physical Therapy, Speech and Hearing Therapy and Occupational Therapy, Faculty of Medicine, University of São Paulo. Results: In BERA with click stimulus, the average latency value of the wave I was higher for the right ear in all groups (p-value = 0.037), this occurring the ear effect. It was also observed that the III-V interpeak is higher in the TEA group than TD group (p-value = 0.046). In BERA with speech stimulus, an absolute latency of wave V was smaller than the ASD group when compared to the group with TD (p-value = 0.011). In the LLAEP, for the tone burst stimulus as well as for the speech stimulus, the latency of the N1 component was higher in the right ear (p-value = 0.050), between the groups were not being observed meaning differences for the latency values as for the amplitude values of the studied components. Conclusion: In relation to the BERA click, TEA group presented suggestive results of impairment in the auditory pathway, upper brainstem part, indicating possible lesions or dysfunctions of the Central Auditory Nervous System (CANS). With regard to BERA speech, can be concluded that the study population presented faster neural encoding of the initial part in the acoustic stimulus (onset) when compared with the TD group. The results of the LLAEP didn\'t show any changes in a cortical level of TEA group. From the results, we suggest new studies with BERA and LLAEP with a larger number of participants
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Desenvolvimento da acuidade visual de resolução de grades em prematuros durante o primeiro ano de vida : estudo eletrofisiológico pelo registro dos potenciais visuais evocados de varredura / Grating visual acuity development in preterm infants during the first year of life: an electrophysiological study using sweep visual evoked potentials

Haro, Filomena Maria Buosi de 18 August 2003 (has links)
Objetivos: determinar a acuidade visual de resolução de grades (AV) durante o primeiro ano de vida por meio dos registros dos potenciais visuais evocados de varredura em grupos de crianças nascidas prematuramente (RNPT) e a termo (RNT); comparar os valores finais da AV no grupo RNPT em relação à idade gestacional e ao desenvolvimento neuropsicomotor e comparar as curvas de desenvolvimento visual entre os grupos RNPT e RNT. Casuística e métodos: Estudo realizado em 25 RNT e 36 RNPT acompanhados em ambulatório e submetidos a avaliações oftalmológica e neuropediátrica. O grupo RNPT foi dividido em subgrupos com relação a idade gestacional e desenvolvimento neuropsicomotor. Para a medida da AV foi utilizado o aplicativo NuDIVA (\"Digital Infant Visual Assessment\") calculando-se a AV em logaritmo do mínimo ângulo de resolução (logMAR) através de curva de regressão linear, relacionando-se a amplitude do potencial do segundo harmônico à freqüência espacial linear. Na análise estatística utilizou-se método de Fischer, teste t, análise de variância (ANOVA) e teste para comparação entre retas de regressão linear simples. O nível de significância foi fixado em 0,05. Resultados: Estrabismo foi detectado em cinco crianças, todas do grupo RNPT, quatro delas com alteração neurológica (p=0,07). Erros de refração com necessidade de prescrição óptica foi encontrado em seis crianças, todas do grupo RNPT (p=0,07). A medida da AV foi obtida com sucesso em 96,4% dos casos, sendo ao final do primeiro ano de vida significativamente inferior nos RNPT com alteração neurológica (p<0,05). A medida da AV estimada ao nascimento foi maior em todos os RNPT com relação aos RNT (p<0,05) porém a velocidade de aquisição da AV foi maior no grupo RNT (p<0,05). Conclusões: A AV pôde ser facilmente determinada durante o primeiro ano de vida tanto em RNPT quanto em RNT sendo seus valores semelhantes, com exceção dos RNPT que apresentaram alteração neurológica. Todos os RNPT apresentaram desenvolvimento visual semelhante, porém, significativamente inferior ao encontrado para os RNT / Purpose: Determine the grating visual acuity (VA) of a group of preterm infants using sweep visual evoked potentials (sweep-VEP). Compare the development of VA of these infants to that of normal full-term infants, with respect to: gestational age, neuropsychomotor development and visual development. Methods: The study was conducted on 25 preterm and 36 full-term infants, with follow-up ophthalmologic and neuropediatric evaluations. The preterm infants were divided into subgroups in accordance with their gestational age and neurological development. VA was assessed using the Digital Infant Visual Assessment (NuDiva) sweep-VEP system, expressed in logMAR, and threshold grating acuities were estimated using the VEP second harmonic amplitudes, determined by a linear regression line drawn through the highest spatial frequency peak and the spatial frequency at which signal amplitude reaches the noise level. Statistical analysis was performed using the Fisher, Student-t test, analysis of variance (ANOVA) and comparison by simple linear regression test between the two groups. The significance level was 0.05. Results: Strabismus was detected in five preterm infants; four of these had neurological alterations (p=0.07). Prescription for refractive errors was necessary in six preterm infants (p=0.07). Grating VA was assessable in 96.4% of the infants; preterm infants with neurological alterations had significantly lower grating VA (p<0.05) at the end of the first year. Early VA scores were higher in all of the preterm infants compared to the full term infants (p<0,05) but at the end of the first year of life the VA was improving at a higher rate in the full term group (p<0.05)
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Avaliação da atividade elétrica uterino em ratas Wistar prenhes e não prenhes induzida por eletroacupuntura e da influência do sistema nervoso central e dos circuitos elétricos biologicamente fechados / Evaluation of uterine electric activity in pregnant and non pregnant Wistar rats induced by electroacupuncture and the influence of central nervous system and biologically closed electric circuits

Paulo Luiz Farber 26 March 1998 (has links)
O objetivo desse trabalho foi a avaliação da atividade elétrica uterina em ratas Wistar prenhes antes e após a eletroacupuntura e a influência do sistema nervoso central e dos circuitos elétricos biologicamente fechados. A avaliação da atividade elétrica cerebral e uterina foi realizada por meio de experimentos crônicos (n=16, 8 prenhes e 8 não prenhes) e agudos (n=11, 4 prenhes e 7 não prenhes). As ratas prenhes receberam a eletroacupuntura nos pontos Sanyinjiao e Zusanli entre 17 a 19 semanas de prenhez. A fase de experimentos agudos consistiu de lesão na medula espinhal no nível de T1 (2 ratas, uma prenhe e a outra não), denervação do útero utilizando álcool absoluto (3 ratas, uma prenhe e duas não), eletroestimulação de artéria isolada do rabo (2 ratas não prenhes) e experimentos in vitro (4 ratas, duas prenhes e duas não). A atividade elétrica uterina de repouso foi semelhante nas ratas prenhes (1,87 +/- 2,35 eventos / 3 minutos) e não prenhes (2,31 +/- 1,57 eventos / 3 minutos, p>0.1). Após a eletroacupuntura o número de eventos aumentou de 1,87 +/- 2,35 / 3 minutos para 28,06 +/- 17,27 / 3 minutos; p<0.01. Verificou-se uma correlação entre o aumento da atividade elétrica cerebral (córtex e hipocampo) e da atividade uterina em 3 ratas (2 prenhes e 1 não prenhe). Nem lesões na medula espinhal, nem a denervação do útero nem a realização dos experimentos in vitro modificou o aumento da atividade uterina. A eletroestimulação da artéria isolada do rato alcançou o útero mas parou após o clampeamento da artéria. Portanto, a atividade elétrica uterina é semelhante nas ratas prenhes e não prenhes. A atividade elétrica uterina aumenta após 90 minutos de eletroacupuntura em ratas Wistar prenhes, provavelmente através dos circuitos elétricos biologicamente fechados. O sistema nervoso não é necessário para esse fenômeno. / The objective of this work was the evaluation of uterine electric activity in pregnant Wistar rats before and after electroacupuncture stimulation and the influence of central nervous system and biologically closed electric circuits on uterine electric activity. The evaluation of brain electric activity and uterine electric activity was studied by means of chronic experiments (n=16, 8 pregnant and 8 non pregnant rats). In pregnant rats electroacupuncture was performed at acupoints Sanyinjiao and Zusanli between 17 and 19 days of pregnancy. The acute experiments phase was lesions in spinal cord at T1 level (2 rats, one pregnant and one non pregnant), denervation of uterus using absolute alcohol (3 rats, one pregnant and two non pregnant), electric stimulation of isolated tail artery (2 animals, non pregnant) and in vitro experiment (2 pregnant rats and 2 non pregnant rats). The uterine activity was similar in pregnant (1,87 +/- 2,35 events / 3 minutes) and non pregnant rats (2,31 +/- 1,57 events / 3 minutes, p>0.1). After electroacupuncture, the number of events rises for 1,87 +/- 2,35 / 3 minutes to 28,06 +/- 17,27 / 3 minutes; p<0.01 (pregnant rats). In 3 rats (1 non-pregnant and 2 pregnants), was observed correlation between the rise of cerebral activity (cortex and hipoccampus) and the uterine activity. Neither lesions in spinal cord nor denervation of uterus and in vitro experiments modified the rising of uterine activity. The electric stimulation of isolated tail artery reached the uterus but stopped after clamping the artery. Therefere, the basal uterine electric activity is similar in pregnant and non pregnant Wistar rats; uterine activity rises after 90 minutes of electroacupuncture in Wistar pregnant rats, probably by biologically closed electric circuits and the nervous system is not necessary for this phenomenon.
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Desenvolvimento da acuidade visual de resolução de grades em prematuros durante o primeiro ano de vida : estudo eletrofisiológico pelo registro dos potenciais visuais evocados de varredura / Grating visual acuity development in preterm infants during the first year of life: an electrophysiological study using sweep visual evoked potentials

Filomena Maria Buosi de Haro 18 August 2003 (has links)
Objetivos: determinar a acuidade visual de resolução de grades (AV) durante o primeiro ano de vida por meio dos registros dos potenciais visuais evocados de varredura em grupos de crianças nascidas prematuramente (RNPT) e a termo (RNT); comparar os valores finais da AV no grupo RNPT em relação à idade gestacional e ao desenvolvimento neuropsicomotor e comparar as curvas de desenvolvimento visual entre os grupos RNPT e RNT. Casuística e métodos: Estudo realizado em 25 RNT e 36 RNPT acompanhados em ambulatório e submetidos a avaliações oftalmológica e neuropediátrica. O grupo RNPT foi dividido em subgrupos com relação a idade gestacional e desenvolvimento neuropsicomotor. Para a medida da AV foi utilizado o aplicativo NuDIVA (\"Digital Infant Visual Assessment\") calculando-se a AV em logaritmo do mínimo ângulo de resolução (logMAR) através de curva de regressão linear, relacionando-se a amplitude do potencial do segundo harmônico à freqüência espacial linear. Na análise estatística utilizou-se método de Fischer, teste t, análise de variância (ANOVA) e teste para comparação entre retas de regressão linear simples. O nível de significância foi fixado em 0,05. Resultados: Estrabismo foi detectado em cinco crianças, todas do grupo RNPT, quatro delas com alteração neurológica (p=0,07). Erros de refração com necessidade de prescrição óptica foi encontrado em seis crianças, todas do grupo RNPT (p=0,07). A medida da AV foi obtida com sucesso em 96,4% dos casos, sendo ao final do primeiro ano de vida significativamente inferior nos RNPT com alteração neurológica (p<0,05). A medida da AV estimada ao nascimento foi maior em todos os RNPT com relação aos RNT (p<0,05) porém a velocidade de aquisição da AV foi maior no grupo RNT (p<0,05). Conclusões: A AV pôde ser facilmente determinada durante o primeiro ano de vida tanto em RNPT quanto em RNT sendo seus valores semelhantes, com exceção dos RNPT que apresentaram alteração neurológica. Todos os RNPT apresentaram desenvolvimento visual semelhante, porém, significativamente inferior ao encontrado para os RNT / Purpose: Determine the grating visual acuity (VA) of a group of preterm infants using sweep visual evoked potentials (sweep-VEP). Compare the development of VA of these infants to that of normal full-term infants, with respect to: gestational age, neuropsychomotor development and visual development. Methods: The study was conducted on 25 preterm and 36 full-term infants, with follow-up ophthalmologic and neuropediatric evaluations. The preterm infants were divided into subgroups in accordance with their gestational age and neurological development. VA was assessed using the Digital Infant Visual Assessment (NuDiva) sweep-VEP system, expressed in logMAR, and threshold grating acuities were estimated using the VEP second harmonic amplitudes, determined by a linear regression line drawn through the highest spatial frequency peak and the spatial frequency at which signal amplitude reaches the noise level. Statistical analysis was performed using the Fisher, Student-t test, analysis of variance (ANOVA) and comparison by simple linear regression test between the two groups. The significance level was 0.05. Results: Strabismus was detected in five preterm infants; four of these had neurological alterations (p=0.07). Prescription for refractive errors was necessary in six preterm infants (p=0.07). Grating VA was assessable in 96.4% of the infants; preterm infants with neurological alterations had significantly lower grating VA (p<0.05) at the end of the first year. Early VA scores were higher in all of the preterm infants compared to the full term infants (p<0,05) but at the end of the first year of life the VA was improving at a higher rate in the full term group (p<0.05)

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