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Estudo químico e avaliação biológica dos fungos endofíticos Xylaria sp. e Colletotrichum crassipes isolados de Casearia sylvestris (Flacourtiaceae)Cafêu, Mariana Carrara [UNESP] 17 August 2007 (has links) (PDF)
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cafeu_mc_dr_araiq.pdf: 2687839 bytes, checksum: 6f78bffb8a9f427b48e9b75f8cda9db6 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho descreve a triagem de 21 fungos endofíticos associados a espécies vegetais de Cerrado e Mata Atlântica. Os extratos brutos fornecidos por estes fungos foram avaliados quimicamente (CLAE e RMN1H) e submetidos a bioensaios para avaliação da potencialidade antifúngica, antioxidante e anticolinesterásica, onde se mostraram promissores. Após esta triagem, os fungos Xylaria sp. E Colletotrichum crassipes, associados a Casearia sylvestris, foram selecionados para o estudo químico/biológico. Estes fungos foram cultivados nos meios líquido (MDB) e sólido (milho) para obtenção dos extratos brutos. O extrato bruto de Xylaria sp. em milho foi submetido a fracionamento cromatográfico e levou ao isolamento da griseofulvina, 7-desclorogriseofulvina e citocalasina B, enquanto que o extrato obtido do meio líquido conduziu ao isolamento da citocalasina D, citocalasina C e 5-carbóxi-6-hidroxi-3-metil-3,4- diidroisocumarina. Após fracionamento do extrato bruto do endófito C. crassipes no meio líquido MDB foram isoladas 8 substâncias da classe de dicetopiperazinas, N-(2-feniletil)acetamida, tirosol e as substâncias inéditas 1-hidroxi-1-feniletil-tirosol e (6-metil-3- (feniletóxi)-1,4-dioxan-2-il)metanol. Algumas substâncias puras foram submetidas à bioensaios e apresentaram potencial bioatividade frente aos fungos fitopatogênicos Cladosporium cladosporioides e C. sphaerospermum e nos ensaios antioxidante e anticolinesterásico. As citocalasinas D e B isoladas durante este trabalho e outras 5 citocalasinas isoladas anteriormente foram submetidas à avaliação da citotoxicidade utilizando linhagens de células de adenocarcinoma murino e se mostraram muito ativas. Os fungos endofíticos Xylaria sp. e C. crassipes foram utilizados em biotransformação do substrato 4-etilciclohexanona. Este experimento foi realizado através do cultivo... / This work describes the screening of 21 endophytic fungi from plant species from Cerrado and Atlantic Forest. The crude extracts produced by these fungi after fermentation in potato dextrose broth (PDB) were evaluated by HPLC, 1HNMR and potential biological activities: antifungal, antioxidant and anticholinesterasic. After screening, the extracts of Xylaria sp. and Colletotrichum crassipes, isolated from Casearia sylvestris, were selected, based on the chemical/biological results. These endophytic fungi were cultivated in PDB and corn for crude extract preparation. The crude corn extract of Xylaria sp. led to isolation of griseofulvin, 7- dechlorogriseofulvin and cytochalasin B while the crude PDB extract led to isolation of cytochalasin C, cytochalasin D and 5-carboxy-6- hidroxy-3-methyl-3,4-dihydroisocoumarin. The crude PDB extract of Colletotrichum crassipes led to isolation of eight diketopiperazines, N-(2-phenylethyl)acetamide, tyrosol, 1-hidroxy-1- phenylethyl-tyrosol and (6-methyl-3-(phenethyloxy)-1,4-dioxan-2- yl)methanol. The some of them pure compounds showed potential antifungal activity against Cladosporium cladosporioides and C. sphaeropermum, antioxidant and anticholinesterasic activities. The Cytochalasins D and B, isolated in this work, and other five cytochalasins produced by Xylaria sp.1 showed potential activity for cytotoxic activity against adenocarcinomatous murine cells. The fungi Xylaria sp. and C. crassipes were evaluated as biocatalysts for biotransformation of 4-ethylcyclohexanone. Four biotransformation products were isolated. Their structures were established by spectroscopic methods, including the application of bidimensional NMR techniques and comparison with published data.
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Busca de substâncias bioativas em fungos associados com a espécie Michelia champaca L. (Magnoliaceae)Leptokarydis, Ioanis Hcristos [UNESP] 20 March 2008 (has links) (PDF)
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leptokarydis_ih_dr_araiq.pdf: 4347278 bytes, checksum: 74059159e4a0a5ee40f9805bfa0d6f0d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os fungos, diferente dos vegetais são heterotróficos, mais especificamente quimiorganotróficos, por suas características específicas pertencem a um reino separado. Alguns dos fungos através de sua evolução se especializaram em invadir os espaços intercelulares das plantas passando a sobreviver dentro dos seus hospedeiros, não provocando nenhuma patologia. Estes microrganismos são denominados de fungos endofíticos. A disputa por alimentos entre os fungos no interior das espécies vegetais, gerou a necessidade dos fungos produzirem metabolitos secundários com atividades contra outros microrganismos, podendo assim demarcar seu território. Todo este processo deve acontecer de forma a não causar patologias na planta que é a fonte de seu alimento, em alguns casos essas relações de mutualismo e comensalismo se aprimoraram sendo muito comum alguns vegetais possuirem fungos endofíticos protegendo contra pragas insetos e patógenos. Este trabalho descreve o isolamento e a purificação dos fungos endofíticos associados às folhas, caules, raízes e sementes da espécie vegetal Michela champaca. Foram isolados 8 fungos, sendo 3 dos caules, 4 das folhas, 1 das raízes, nenhum fungo foi isolado das sementes. Os extratos brutos produzidos por estes fungos em caldo de dextrose e batata foram avaliados quimicamente (CLAE-DAD e RMN1H) e submetidos à bioensaios para avaliação da potencialidade anticancerígena, antifúngica e anticolinesterásica. Todos os extratos apresentaram atividade contra os fungos fitopatogênicos Cladosporium cladosporioides e Cladosporium sphaerospermum e 40% apresentaram atividade frente às linhagens mutantes de Saccharomyces cerevisiae. Após esta triagem, os fungos endofíticos Mc-8R (ainda não identificado) e Colletotrichum gloeosporioides (Mc-7F) foram selecionados para estudo químico/biológico. / Some fungal species, through their evolution, have specialized in invading plants and surviving inside their hosts causing no warm them. These microorganisms have been called endophytic which in the invasion process, produce chemical substances that inhibit competitors to invade their neighborhood and thus survive in harmony with the host. This work seeks to evaluate the chemical diversity of substances from endophytic fungi associated to Michelia champaca L. that present biological activity by isolating and identification of their secondary metabolites. This work resulted in the isolation of eight fungi species and selection of 2 strains which presented strong antifungal activity against Cladosporium cladosporioides and C. sphaerospermum, both of them pathogenic fungus; and a weak antitumor activity against mutant strains of Saccharomyces cerevisiae. The first one was codified as Mc-8R and chromatographic fractionation of its EtOAc extract allowed the identification of the Pirenocines A (1), E (2) and B (3) and the Pirenochaetic acids, C (4), A (5) and B (6), and in addition to the novel (7) and (8). Ergosterol (9), was found in the hexanic extract obtained from growing Mc-8R in rice, and the Ergosterol peroxide (10), which was isolated from the hexanic extract in corn. The other selected fungi species was identified as Colletotrichum gloeosporioides. The fractioning of its EtOAc extract led to the isolation of the known substances as Uracil (11), cyclo-(S*-Pro-S*-Tyr) (12), cyclo-(S*-Pro-S*-Val) (13), 2-Aminophenyl acetic acid (2-APA), (14), p-Hydroxyphenylacetic acid (15), 4-Hydroxybenzamide (16) and (2-Hydroxy-phenyl)- acetic acid (17), in addition to the novel compounds (18) and (19). 2-Hexylidene-3-methylsuccinic acid (20) was also identified as major compound from the fungus Mc-C3, (Xylaria sp.).
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Bioprospecção e purificação de substâncias bioativas produzidas por Streptomyces tubercidicus, endofítico isolado de Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) do cerrado de São Carlos-SP / Bioprospection and purification of bioactives substances produced by Streptomyces tubercidicus, endophytic isolated of Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) the Brazilian tropical savannah of São Carlos-SPRatti, Regiane Priscila 11 December 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-12-11 / The need for new and useful compounds to provide assistance and relief in all aspects of human condition is ever-growing. Drug resistance in bacteria, the appearance of life-threatening viruses, and the increase in the incidence of fungal infections in the world s population all underscore our inadequacy to cope with these medical problems. Endophytic microorganisms that colonize internal tissues of plants without causing any negative effects are relatively unstudied as potential sources of novel natural products for medical and commercial exploitation. The Streptomycetes provide nearly 80% of all the world s antibiotics produced. The aim of this work was to investigate the Brazilian tropical savannah tree Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) in São Carlos, in order to isolate the endophytic microorganisms associated with the plant, separating and purifying the bioactives substances produced by the endophytic microorganism. The bioactivity of S. tubercidicus against pathogenic microorganisms was analyzed. The obtained results point out the antagonistic potential of the endophytic isolated against microorganisms of interest in Public Health. The brute extract fresh produced by S. tubercidicus RND-C it presented antimicrobial potential maximum of 200 UA.mL-1 against Escherichia coli ATCC 25922 and Staphylococcus aureus ATCC 25923 after 48 h of cultivation; The bioactive substances produced by S. tubercidicus were submitted to different thermal and enzymatic treatments and pH variation to be determined the nature of the bioactive compounds. After it being submitted to enzymatic treatment with amylase and pepsin, the concentrated extract stayed bioactive, suggesting the lipidic and no-prothein nature of the bioactive substances. Already the active compounds against E. coli suggests the presence of a substance of glycidic and lipidic nature, due to resistance to the action of the enzyme invertase and lipase, respectively, suggesting that the substances contained in the brute extract of S. tubercidicus RND-C against E.coli can be a ´glycolipid. The concentrated extract stayed active biologically when exposed to lower (-20 and -80 ºC) and high (100 and 121 ºC) temperatures, suggesting that the bioactive compounds produced are not subject to spontaneous degradation. The extract stayed active against E. coli in acidity conditions (pH, 2,0 - 5,0) and it also presented bioactivity in pH 7,0 and 8,0. In conditions of high alkalinity (pH 9,0) bioactivity was not detected. Already against S. aureus, the extract stayed assets in the strip of pH 7,0. In conditions of acidity and alkalinity the bioactive substances produced by S. tubercidicus were inactivated. The molar mass of the substances was esteemed in minor than 3,0KDa. The bioactive molecules contained in the concentrated extract produced by S. tubercidicus RNC-C were purified and separated by bio monitoring analyzes, suggesting the presence of two different substances. The evaluation of the separation using a hight performance liquid chromatography (HPLC), suggests the existence of two different substances produced by S. tubercidicus, one being active against S. aureus and the other one active against E.coli and S. aureus. In the separation by using reverse-phase chromatography (Sep-Pak), were obtained four fractions (St. 1, St. 2, St. 3 and St. 4). The fractions St. 2 and St. 4 presented antimicrobial activity against bacteria and they were purified separately by Sephadex LH-20 Gel permeation chromatography obtaining the fractions St. 2-A; St. 2- B; St. 4-A and St. 4-B. The fractions St. 2-B was activity against S. aureus. Already the fractions St. 4-B was activity against S. aureus and E. coli. These results suggest the presence of two different substances. This work intends to contribute for understanding the interactions of endophitic and plants besides opening new perspectives on the biotechnological potential of the endophitics microorganisms of plants. The investigation of new composed assets biologically starting from microorganisms brings important contributions for the discovery of new drugs. / O aumento da incidência de doenças bacterianas, virais e fúngicas enfatiza a necessidade de investigar a produção microbiana de novos compostos bioativos. Microrganismos endofíticos que colonizam tecidos internos de plantas são relativamente pouco estudados como fontes potenciais de novos produtos naturais para a exploração médica e comercial. O gênero Streptomyces tem grande importância industrial devido à capacidade de produzir muitos metabólitos secundários, respondendo por 80% dos antibióticos utilizados atualmente. Com base neste contexto, o objetivo deste trabalho foi isolar Streptomyces spp., endofítico de plantas do Cerrado, da região de São Carlos, SP, separando e purificando as substâncias bioativas produzidas pelo isolado. O endofítico Streptomyces tubercidicus foi isolado de Solanum lycocarpum St. Hill (Lobeira) relatando, pela primeira vez, o endofitismo da bactéria isolada a partir de vegetação de Cerrado de São Carlos. A bioatividade de S. tubercidicus foi avaliada e os resultados obtidos ressaltam o potencial antagônico do endofítico isolado contra microrganismos de interesse em Saúde Pública, se constituindo em uma fonte promissora para a pesquisa de novos compostos bioativos. O extrato bruto fresco produzido por S. tubercidicus RND-C apresentou potencial antimicrobiano máximo de 200 UA.mL-1 contra Escherichia coli ATCC 25922 e Staphylococcus aureus ATCC 25923 após 48 h de cultivo; As substâncias bioativas produzidas por S. tubercidicus foram submetidas a diferentes tratamentos térmicos, enzimáticos e variação de pH para determinação da natureza dos compostos bioativos. Após ter sido submetido a tratamento enzimático com amilase e pepsina, o extrato concentrado manteve-se bioativo, sugerindo a natureza lipídica e nãoproteinácea das substâncias bioativas. Já o composto ativo contra E. coli sugere a presença de substância de natureza glicídica e lípidica, devido a resistência à ação da enzima invertase e lipase, respectivamente, sugerindo que as substâncias contidas no extrato bruto de S. tubercidicus RND-C contra E.coli pode ser um glicolipídio. O extrato concentrado manteve-se biologicamente ativo quando exposto a baixas (-20 e -80 ºC) e elevadas (100 e 121 ºC) temperaturas, sugerindo que os compostos bioativos produzidos não são sujeitos a degradação espontânea. O extrato manteve-se ativo contra E. coli em condições de acidez (pH, 2,0 5,0) e também apresentou bioatividade em pH 7,0 e 8,0. Em condições de alta alcalinidade (pH 9,0) não detectou-se bioatividade. Já contra S. aureus, o extrato manteve-se ativo apenas na faixa de pH 7,0. Em condições de acidez e acalinidade as substâncias bioativas produzidas por S. tubercidicus foram inativadas. A massa molar dos compostos bioativos produzidos por S. tubercidicus RND-C foram estimadas em menor que 3,0 kDa. As moléculas bioativas contidas no extrato concentrado produzidas por S. tubercidicus RND-C foram purificadas por separação biomonitorada, sugerindo a presença de duas substâncias diferentes. A avaliação da separação usando cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) sugere a existência de duas substâncias diferentes produzidas por S. tubercidicus, sendo duas ativas contra S. aureus e a outra ativa contra E.coli e S. aureus. Na separação por cromatografia em coluna pré-empacotada de fase reversa do tipo Sep-Pak, foram obtidas quatro frações (St. 1, St. 2, St. 3 e St. 4). As frações St. 2 e St. 4 apresentaram atividade antimicrobiana contra bactérias e foram purificadas separadamente por cromatografia de permeação em gel de Sephadex LH-20 obtendo as frações St. 2-A; St. 2-B; St. 4-A e St. 4-B. A fração St. 2-B foi ativa contra S. aureus. Já a fração St. 4-B foi ativa contra S. aureus e E. coli. Estes resultados sugerem a presença de duas substâncias diferentes. Este trabalho pretende contribuir para a compreensão das interações endófitos/plantas além de abrir novas perspectivas sobre o potencial biotecnológico dos microrganismos endofíticos de plantas. A investigação de novos compostos biologicamente ativos a partir de microrganismos traz importantes contribuições para a descoberta de novas drogas.
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Purificação e caracterização bioquímica de substâncias bioativas produzidas por endofítico isolado de Prunus spp.Serrano, Nadja Fernanda Gonzaga 13 March 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-03-13 / Financiadora de Estudos e Projetos / Bioprospective studies of endophytic microorganisms for biotechnological applications are essentials to discovery new substances, which can be used in different areas. Endophytes represent an excellent source of bioactive natural products with chemical structure and biological activities diverses. An endophytic microorganism, isolated from leaves of Prunus spp. (Cerrado of Sao Carlos, SP, Brazil), showed antagonic potential against important pathogen in Public Health. The endophytic microorganism was phenotipic and genetic identified like a Paenibacillus polymyxa and it was given the strain designation RNC-D. The fresh brut extract showed maximum antimicrobial potency of 800 AU.mL-1 against Escherichia coli ATCC 25922 (48 hours
of culture) and Staphylococcus aureus ATCC 25923 (120 hours of culture). The bioactive substances contained on extract kept bioactivity after enzymatic assay with proteases and lipase, pH variation from 2.0 to 9.0, thermic treatment using low (-80, - 20 ºC) and high temperatures (100, 121 ºC) against both microorganisms tested. The molecular weight of bioactive substances against E. coli was estimated by ultrafiltration as smaller than 1 kDa, while the bioactive compounds against S. aureus have the molecular weight between 1 and 2 kDa. It was possible to separate the bioactive substances contained in the extract produced by P. polymyxa RNC-D using chromatographic technique (HPLC). Three new molecules, with molecular weight 403, 420 and 425 Da were identified in bioactive peak (eluted in 22% of solution 20 mM TRIS + 1 M NaCl) against E. coli using LC-MS. This research will be continued to determinate the antimicrobial spectrum of the purified molecules, as well as to evaluate the potential application areas. / Estudos bioprospectivos de microrganismos endofíticos para aplicações biotecnológicas são fundamentais na descoberta de novas substâncias, as quais podem ser utilizadas em diferentes áreas. Por habitarem nichos biológicos únicos, endófitos representam excelente fonte de produtos naturais bioativos com estrutura química e atividade biológica diversas. Um microrganismo endofítico, isolado de folhas de Prunus spp. (Cerrado de São Carlos SP, Brasil), apresentou potencial antagônico contra importante patógeno em saúde pública. O endofítico foi identificado fenotípica e genotipicamente como Paenibacillus polymyxa e denominado RNC-D. O extrato bruto
fresco apresentou potencial antagônico máximo de 800 UA.mL-1 contra Escherichia coli ATCC 25922 (48 horas da cultura) e Staphylococcus aureus ATCC 25923 (120 horas da cultura). As substâncias bioativas contidas no extrato mantiveram a bioatividade após tratamento enzimático utilizando proteases e lipase. O extrato concentrado manteve-se biologicamente ativo quando exposto a temperaturas elevadas (100 e 121ºC)
e baixas temperaturas (-20 e -80 ºC); da mesma maneira, a bioatividade do extrato não foi alterada em valores de pH entre 2,0 e 9,0, contra ambos os microrganismos testados.
A massa molar das substâncias bioativas contra E. coli foi estimada por ultrafiltração como menor que 1 kDa, enquanto que, para S. aureus, a estimativa da massa dos compostos foi maior que 1 e menor que 2 kDa. Através de técnica cromatográfica (HPLC) foi possível a separação das substâncias bioativas contidas no extrato produzido por P. polymyxa RNC-D. Três novas moléculas, com massas molares de 403, 420 e 425 Da foram identificadas por LC-MS em pico bioativo (eluído em HPLC a 22% de solução 20 mM TRIS + 1 M NaCl) contra E. coli. O estudo prosseguirá na determinação
do espectro antimicrobiano das novas substâncias bioativas purificadas, bem como na avaliação de possíveis áreas de aplicação.
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Prospecção química e biológica do fungo endofítico Camarops sp. isolado de Alibertia macrophylla (Rubiaceae)Gubiani, Juliana Regina [UNESP] 20 June 2011 (has links) (PDF)
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gubiani_jr_me_araiq.pdf: 4375602 bytes, checksum: ebf0911b0c298d741ce239b8375476b9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A busca por novos produtos para as indústrias farmacêuticas e agroquímicas é um processo que requer otimização contínua. Apesar dos avanços nos processos envolvidos no planejamento racional de fármacos, incluindo química combinatória e ensaios em larga escala, os produtos naturais constituem a estratégia de maior sucesso para a descoberta de novas drogas. Sendo assim, este trabalho foi idealizado, objetivando a obtenção de substâncias potencialmente bioativas a partir do estudo químico e biológico do extrato metanólico produzido pelo fungo endofítico Camarops sp. isolado das folhas de Alibertia macrophylla (Rubiaceae). O endófito Camarops sp. foi cultivado em escala ampliada, utilizando meio de cultivo sólido milho, por 21 dias a temperatura ambiente no modo estático. Os extratos metanólico e acetonitrila obtidos foram avaliados por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência com detector de arranjo de diodos e por Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio, e submetidos aos ensaios para a avaliação da potencialidade antifúngica, antioxidante, anticolinesterásica e anticancerígena. Os resultados evidenciaram extrato e frações com uma variação metabólica intensa e potencialmente bioativos principalmente contra a inibição da enzima acetilcolinesterase. O extrato acetonitrila foi submetido a fracionamento cromatográfico e levou à identificação e determinação estrutural de oito substâncias, sendo estas, (S)-mevalonolactona (1), para-hidroxibenzaldeído (2), Ácido (E)-5-(1-hidroxialil)-4-(pent-1-enil)-2,5-diidrofurano-3-carboxílico (3), azepan-2-ona (4), xylarenona D (5), xylarenona F (6), xylarenona G (7), sendo as duas últimas substâncias inéditas, e xylarenona C (8). Este é o primeiro relato de mevalonolactona obtida de fungo endofítico, substância esta muito utilizada para... / The search for new products to the pharmaceutical and agrochemical industry is a process that requires continuous optimization. Despite advances in the processes involved in rational planning of drugs, including combinatorial chemistry and tests in large scale, the natural products constitute the most successful strategy for the discovery of new drugs. Thus, this work was idealized aiming the obtaining of potentially bioactive substances from the chemical and biological study of methanolic extract produced by the endophytic fungus Camarops sp. isolated from the leaves of Alibertia macrophylla (Rubiaceae). The endophyte Camarops sp. was cultivated in large scale using maize solid culture medium for 21 days at room temperature in the static mode. The methanolic and acetonitrile extracts obtained were evaluated by High Efficiency Liquid Chromatography with diode array detector and by Nuclear Magnetic Resonance of Hydrogen, and submitted to tests for evaluation of antifungal, antioxidant, anticholinesterase and anticancer potenciality. The results showed extract and fractions with an intense metabolic variation and potentially bioactive principally against the inhibition of the enzyme acetylcholinesterase. The acetonitrile extract was submitted to chromatographic fractionation and led to the identification and structural determination of eight substances, being, (S)-mevalonolactone (1), para-hidroxybenzaldehyde (2), acid (E)-5-(1-hidroxyallylic)-4-(pent-1-enyl)-2,5-dihydrofuran-3-carboxylic (3), Azepan-2-one (4), xylarenone D (5), xylarenone F (6), xylarenone G (7), being the last two ones novel substances, and xylarenone C (8). This is the first report of mevalonolactone obtained from endophytic fungus, substance much used for cosmetics, and also the first report of Azepan-2-one as a natural product, which is much used in the making... (Complete abstract click electronic access below)
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Detecção in silico e caracterização dos constituintes micromoleculares majoritários do fungo endofítico Colletotrichum gloeosporioides isolado de folhas de Garcinia xanthochymus usando HPLC-DAD-HRMS e GC-MSCardoso, Patrícia [UNESP] 18 June 2010 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2010-06-18Bitstream added on 2014-06-13T20:19:05Z : No. of bitstreams: 1
cardoso_p_me_araiq.pdf: 3362047 bytes, checksum: fcc1f18d091d35b1b0091e28b5cadc70 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O fungo endofítico Colletotrichum gloeosporioides isolado de Garcinia xanthochymus, foi cultivado em pequena escala nos meios líquidos, (400 mL) MDB, Extrato de Malte, YM, Czapek e em meio sólido (150 g) de milho tipo canjica, a 28ºC, em regime estático. Após triagem por ensaios biológicos, e análise por 1H RMN e HPLC-DAD, os meios de milho e extrato de malte foram selecionados para o estudo químico, sendo cultivados em larga escala. As matrizes brutas foram submetidas a estratégias de separação e de desreplicação utilizando as técnicas hifenadas: cromatografia líquida acoplada a detector de arranjo de diodos e espectrometria de massas de alta resolução, cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas e também a ressonância magnética nuclear, sendo a detecção dos constituintes majoritários realizada in silico, através do uso de bases de dados públicas e pertencentes ao NuBBE. Os experimentos realizados permitiram a detecção de 14 substâncias: 6 por CG-MS (extrato DCM de milho) – dihexadecanoato de glicerila (1); trioctadec-9-enoato de glicerila (2); sn1`, 2` octadeca-9,12-dienoato de glicerila (3); sn1`,3` octadeca-9,12-dienoato de glicerila (4); ácido 6,11-hexadecanóico (5); geranilinalol (6); e 7 por HPLC-DAD-HRMS: colletodiol (7); fischerina (8); sambutoxina (9); micosporina-glicina (10); ciperina (11); micosporina serina (12); arginomicina (13) e aspergillomarasmina B (14). Os compostos 2, 3 e 4, majoritários na matriz bruta foram isolados. Os metabolitos detectados por HPLC-DAD-HRMS (7-10) foram também detectados por 1H RMN / Colletotrichum gloeosporioides, an endophytic fungi isolated from Garcinia xanthochymus, was initially cultivated on the following liquid media (400 mL): MDB, YM, Czapek and static solid medium (150 g) using bleached corn at 28 C. After careful screening using bioassays, 1H NMR and HPLC-DAD, the corn and malt extract were selected for further studies and large-scale growth. The crude matrixes were submitted to several separation strategies using dereplication and hyphenated techniques such as high performance liquid chromatography coupled to a diode array detector (HPLC-DAD), high resolution mass spectrometry (HRMS), gas chromatography coupled to a mass spectrometer (GC-MS) as well as nuclear magnetic resonance (NMR). Most of the detected molecules were achieved using an in silico approach towards the data mining of public and NuBBE’s databases. This approach lead us to detect 14 substances; 6 by means of CG-MS (dichloromethane extract from corn’s media): glyceril dihexadecanoate (1); glyceril trioctadec-9-enoate (2); sn1`, 2` glyceril octadec-9,12-dienoate (3); sn1`, 3` gliceryl octadec-9,12-dienoate (4); 6,11-hexadecanóic acid (5); geranyl linalool (6); and 7 by means of HPLC-DAD-HRMS: colletodiol (7); fischerin (8); sambutoxin (9); micosporin glycin (10); cyperin (11); micosporin serin (12); arginomicin (13) e aspergillomarasmin B (14). Compounds 2, 3 and 4, been the most abundant in the matrix, were isolated and individually characterized. Compounds 7-10 were also confirmed using 1H NMR by means of in situ elucidation
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Prospecção química e biológica do fungo endofítico Camarops sp. isolado de Alibertia macrophylla (Rubiaceae) /Gubiani, Juliana Regina. January 2011 (has links)
Orientador: Angela Regina Araújo / Banca: Luiz Alberto Beraldo de Moraes / Banca: Mary Ann Foglio / Resumo: A busca por novos produtos para as indústrias farmacêuticas e agroquímicas é um processo que requer otimização contínua. Apesar dos avanços nos processos envolvidos no planejamento racional de fármacos, incluindo química combinatória e ensaios em larga escala, os produtos naturais constituem a estratégia de maior sucesso para a descoberta de novas drogas. Sendo assim, este trabalho foi idealizado, objetivando a obtenção de substâncias potencialmente bioativas a partir do estudo químico e biológico do extrato metanólico produzido pelo fungo endofítico Camarops sp. isolado das folhas de Alibertia macrophylla (Rubiaceae). O endófito Camarops sp. foi cultivado em escala ampliada, utilizando meio de cultivo sólido milho, por 21 dias a temperatura ambiente no modo estático. Os extratos metanólico e acetonitrila obtidos foram avaliados por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência com detector de arranjo de diodos e por Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio, e submetidos aos ensaios para a avaliação da potencialidade antifúngica, antioxidante, anticolinesterásica e anticancerígena. Os resultados evidenciaram extrato e frações com uma variação metabólica intensa e potencialmente bioativos principalmente contra a inibição da enzima acetilcolinesterase. O extrato acetonitrila foi submetido a fracionamento cromatográfico e levou à identificação e determinação estrutural de oito substâncias, sendo estas, (S)-mevalonolactona (1), para-hidroxibenzaldeído (2), Ácido (E)-5-(1-hidroxialil)-4-(pent-1-enil)-2,5-diidrofurano-3-carboxílico (3), azepan-2-ona (4), xylarenona D (5), xylarenona F (6), xylarenona G (7), sendo as duas últimas substâncias inéditas, e xylarenona C (8). Este é o primeiro relato de mevalonolactona obtida de fungo endofítico, substância esta muito utilizada para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The search for new products to the pharmaceutical and agrochemical industry is a process that requires continuous optimization. Despite advances in the processes involved in rational planning of drugs, including combinatorial chemistry and tests in large scale, the natural products constitute the most successful strategy for the discovery of new drugs. Thus, this work was idealized aiming the obtaining of potentially bioactive substances from the chemical and biological study of methanolic extract produced by the endophytic fungus Camarops sp. isolated from the leaves of Alibertia macrophylla (Rubiaceae). The endophyte Camarops sp. was cultivated in large scale using maize solid culture medium for 21 days at room temperature in the static mode. The methanolic and acetonitrile extracts obtained were evaluated by High Efficiency Liquid Chromatography with diode array detector and by Nuclear Magnetic Resonance of Hydrogen, and submitted to tests for evaluation of antifungal, antioxidant, anticholinesterase and anticancer potenciality. The results showed extract and fractions with an intense metabolic variation and potentially bioactive principally against the inhibition of the enzyme acetylcholinesterase. The acetonitrile extract was submitted to chromatographic fractionation and led to the identification and structural determination of eight substances, being, (S)-mevalonolactone (1), para-hidroxybenzaldehyde (2), acid (E)-5-(1-hidroxyallylic)-4-(pent-1-enyl)-2,5-dihydrofuran-3-carboxylic (3), Azepan-2-one (4), xylarenone D (5), xylarenone F (6), xylarenone G (7), being the last two ones novel substances, and xylarenone C (8). This is the first report of mevalonolactone obtained from endophytic fungus, substance much used for cosmetics, and also the first report of Azepan-2-one as a natural product, which is much used in the making... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Bioprospecção de fungos endofílicos Camarops sp., Periconia atropurpurea e Pseudofusicoccum stromaticum e avaliação epigenética de Phoma sp. /Gubiani, Juliana Regina. January 2015 (has links)
Orientador: Angela Regina Araujo / Banca: Ana Helena Januário / Banca: Luce Maria Brandão Torres / Banca: Geraldo Humberto Silva / Banca: Afonso Duarte Leão de Souza / Resumo: Os fungos são considerados fontes promissoras de compostos bioativos com potencial aplicação na indústria alimentícia, agricultura e medicina, e de fato, diversos medicamentos utilizados na saúde pública são originárias de fungos. Estes são encontrados em vários ecossistemas, entre os quais podemos citar os que vivem no interior das espécies vegetais. Estes micro-organismos são denominados de endófitos e tem se revelado uma fonte promissora de metabólitos bioativos. Dentro deste contexto, este trabalho foi idealizado, objetivando a obtenção de substâncias potencialmente bioativas a partir do estudo químico e biológico dos extratos produzidos pelos fungos endofíticos Camarops sp., Periconia atropurpurea e Pseudofusicoccum stromaticum isolados de espécies vegetais do Cerrado e, o estudo epigenético de Phoma sp. isolado de espécie vegetal do Deserto de Sonora, utilizando no cultivo o modificador epigenético SAHA. Estes endófitos foram cultivados em escala reduzida em meios de cultivo líquidos e sólidos para obtenção dos extratos brutos, os quais foram submetidos a análises químicas (CCDC, HPLC e RMN de 1H) e biológicas (antifúngico, anticolinesterásico e citotóxico). Todos os extratos brutos apresentaram pelo menos uma atividade biológica, o que adicionado às análises químicas permitiram selecionar os meios de cultivo adequados para o crescimento em escala ampliada e, isolamento dos metabólitos secundários. Do cultivo de Camarops sp. no meio sólido de Milho isolou-se cinco substâncias, das quais quatro são inéditas 3-((1S,2S)-1,2-dihidroxibut-3-enil)-4-((E)-pent-1-enil)furan-2(5H)-ona (1), 3, 5, 9-trihidroxi presilfiperfolano (2), deacetilbotridial (3), ácido (E)-2,4-dimetilocta-2-enóico (4) e, ácido (E)-2,4-dimetilnon-2-enóico (5), os compostos 4 e 5 foram ativos na inibição da enzima acetilcolinesterase. Do extrato, obtido do meio líquido de Malte, de... / Abstract: Fungi are considered promising sources of bioactive compounds with potential application in the food, agriculture and medicine industry, and in fact, many drugs used in public health originate from fungi. These are found in various ecosystems, among which we can mention those who live inside the plant species. These microorganisms are called endophytes and have proved to be a promising source of bioactive metabolites. Within this context, this work was carried out, aiming to obtain potentially bioactive substances from chemical and biological study of extracts produced by the endophytic fungi Camarops sp., Periconia atropurpurea and Pseudofusicoccum stromaticum isolated from plant species of the Cerrado and epigenetic studies of Phoma sp. isolated from plant species of the Sonoran Desert using in cultivation the epigenetic modifier SAHA. These endophytes were grown on small scale in liquid culture media and solid to obtain the crude extract. These were subjected to chemical analysis (TLC, HPLC and 1H NMR) and biological (antifungal, anticholinesterase and cytotoxic). All crude extracts showed at least one biological activity, which added the chemical analysis allowed to select the culture medium of appropriate for growth in large scale and isolation of secondary metabolites. The growing of Camarops sp. in solid medium of corn were isolated five compounds of which four are new 3-((1S,2S)-1,2-dihydroxybut-3-enyl)-4-((E)-pent-1-enyl)furan-2(5H)-one (1), 3, 5, 9-trihydroxy presilphiperfolane (2), deacetyl-botrydial (3), (E)-2, 4-dimetilocta-2-enoic acid (4), and (E)-2, 4-dimetilnon-2-enoic acid (5), compounds 4 and 5 were active in inhibiting the enzyme acetylcholinesterase. From the extract obtained from the liquid medium Malt, of P. atropurpurea were isolated the compounds 4,5-diethyl-3,4,5,6-tetrahydrobenzo[c][1,6]dioxecine-1,8-dione (6) and periconicina B (7). From the cultivation of P. stromaticum... / Doutor
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Exploração racional da rede metabólica de Xylaria sp. visando à produção de metabólitos de interesse farmacológico através de ferramentas quimiométricas e técnicas de desreplicação /Vieira, Rafael. January 2015 (has links)
Orientador: Ian Castro-Gamboa / Banca: Fabíola Manhas Verbi Pereira / Banca: Flávia Talarico Saia / Resumo: Este trabalho de mestrado tem, como foco principal, analisar o comportamento do fungo Xylaria sp. perante variações físico - químicas, através da abordagem OSMAC (One Strain, Many Compounds). Para realizar tais induções e explorar a variabilidade da rede metabólica deste micro - organismo, um planejamento fatorial foi desenhado visando induzir a variabilidade (ou a potencialização) de metabólitos. Diante de respaldos quim iométricos, induções planejadas foram impostas ao micro - organismo e observou - se variações no perfil químico nos extratos brutos. Somado a isso, técnicas de desreplicação foram usadas a fim de estudar quimicamente as matrizes complexas produzidas por este fungo visando a produção de metabólitos de alto valor agregado e determinou - se condições específicas para produção de moléculas de citocalasina D e de griseofulvina. / Abstract: This work has as its main focus, analyze the behavior of the fungus Xylaria sp. before physicochemical variations via the OSMAC approach (One Strain, Compounds Many). To achieve such induction and exploit the variability of the metabolic network of this micro - organism, a factorial design was designed to induce variability (or potentiating) metabolites. Before chemometric backrests, planned inductions were imposed on the micro - organism and it was observed variations in the chemical profile in crude extracts. Added to this, dereplication techniques were used to study the che mically complex matrices produced by this fungus aimed at producing high added value and metabolites was determined specific conditions for the production of molecules cytochalasin D and griseofulvin. / Mestre
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Fungos endofíticos de Calotropis procera (AIT.) R. BR.: aspectos ecológicos e potencial antimicrobianoNASCIMENTO, Tatianne Leite 11 February 2010 (has links)
Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-17T13:22:51Z
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Previous issue date: 2010-02-11 / CAPES e FINEP / Fungos endofíticos são micro-organismos que colonizam assintomaticamente, intra e/ou
intercelularmente, tecidos sadios de plantas em algum período do seu ciclo de vida. Estes
despertaram grande interesse biotecnológico em virtude da aplicabilidade de seus
metabólitos secundários na medicina, indústria e agricultura. Calotropis procera (Ait.) R.
Br. (Apocynaceae) é uma planta medicinal muito utilizada nas regiões de origem (Ásia e
África) com comprovado potencial farmacológico, sendo de ocorrência subespontânea no
Nordeste do Brasil. Com o objetivo geral de analisar alguns aspectos ecológicos e o
potencial antimicrobiano dos fungos endofíticos de C. procera, no presente estudo, foram
realizadas duas coletas de material vegetal: uma no canteiro experimental do Centro de
Ciências Biológicas, UFPE (Área 1), para avaliar a influência da idade foliar na
comunidade de fungos endofíticos; e nas margens da BR-232, no início da Serra das
Russas-PE (Área 2), para estudar a influência do tipo de tecido vegetal na comunidade de
fungos endofíticos associados a folhas e pedúnculos florais. Os endofíticos foram
caracterizados quanto à produção de substâncias antimicrobianas contra micro-organismos
testes, patogênicos ao homem e vegetais, através de seleção em meio sólido e líquido. Na
Área 1, um total de 156 isolados fúngicos distribuídos em 19 táxons, foram obtidos a partir
dos 468 fragmentos foliares analisados. Verificou-se que o aumento da idade foliar exerceu
uma forte influência no aumento da taxa de colonização e da riqueza de táxons dos fungos
endofíticos isolados. Ocorreu pouca variação entre os índices de diversidade de Shannon
calculados para as diferentes categorias etárias. A espécie dominante foi Phaeoramularia
calotropidis, seguida por Guignardia bidwellii. Seis fungos endofíticos mostraram
atividade contra pelo menos um micro-organismo teste. A capacidade antagônica foi
verificada apenas contra bactérias Gram-positivas e os fungos patogênicos
Epidermophyton floccosum e Colletotrichum dematium. Na Área 2, dos 400 fragmentos
vegetais analisados foram isolados 214 fungos endofíticos distribuídos em 30 táxons,
incluindo 11 morfoespécies. A taxa de colonização dos fungos endofíticos foi bem superior
nos fragmentos de pedúnculos florais (61%) que nos foliares (22,5 %). Nos pedúnculos
florais as leveduras predominaram, enquanto que nas folhas os fungos filamentosos foram
o grupo prevalente. Dentre as espécies de fungos filamentosos isolados de pedúnculo
floral, destaca-se a espécie Monodisma fragilis de primeira ocorrência na América Latina.
Dos 51 fungos endofíticos submetidos a seleção primária em meio sólido, 47% mostraram
atividade contra pelo menos um micro-organismo teste, principalmente contra bactérias
Gram-positivas. Dos fungos selecionados em ensaio em meio sólido, apenas quatro
apresentaram resultados positivos nas condições de cultivo aplicadas no ensaio em meio
líquido, com destaque para o isolado do pedúnculo floral Xylaria sp., com atividade contra
Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis, Escherichia coli e Salmonella typhi.
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