Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-17. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:29:41Z : No. of bitstreams: 1 000850005.pdf: 1236403 bytes, checksum: b1877b4be5ffb104086b39681ebd86a7 (MD5) / As hortaliças são itens indispensáveis na dieta dos seres humanos, atuando como adjuvantes na prevenção e tratamento de doenças. Porém, destaca-se o aumento de surtos de Doenças Transmitidas por Alimentos (DTA) associados ao consumo de produtos hortícolas. O objetivo desse trabalho foi verificar o perfil microbiológico de diferentes tipos de saladas de cozinhas hospitalares. No período de 2010 a 2014, o Serviço de Orientação a Alimentação Pública (SOAP) recebeu 641 amostras de saladas provenientes de hospitais da região de Bauru e Botucatu, onde foram submetidas às análises microbiológicas para a determinação do número mais provável de coliformes a 35°C e 45°C, pesquisa de Salmonella spp e contagem de estafilococos coagulase positiva. Os resultados revelaram que em 30,56% das amostras a contagem de coliformes a 35°C foi maior que 1.100 NMP/g e 12,17% apresentaram coliformes a 45°C acima de 100 NMP/g, limite máximo estabelecido pela legislação brasileira. A prevalência de amostras contaminadas sem tratamento térmico foi de 97,44% e de 2,56% para amostras com tratamento térmico, cozidas ou refogadas. Todas as amostras foram negativas para presença de Salmonella spp e apresentaram contagem de estafilococos coagulase positiva < 1,0X102 UFC/g. Apesar das amostras de saladas não oferecerem risco microbiológico associado à patógenos, deve-se atentar para os micro-organismos indicadores, pois as refeições são servidas a indivíduos hospitalizados / Vegetables crops are indispensable items in human diet, acting as adjuvants in the prevention and treatment of diseases. However, the number of Foodborne Diseases outbreaks associated with their consumption increases. The aim of this study was determine the microbiological profile of different salads from hospital kitchens. In the period between 2010 and 2014 the Public feeding orientation service (SOAP) received 641 samples of salads from hospital kitchens in the region of Botucatu and Bauru. They, where subjected to microbiological analysis to determine the most probable number of coliforms at 35 ° C and 45 ° C, besides Salmonella spp presence and coagulase-positive staphylococci counts. The results reveal that 30.56% of the samples had counts for coliform at 35°C greater than 1.100 MPN/g and 12.17% had MPN/g of coliforms at 45°C above 100 MPN/g, the maximum limit established by Brazilian legislation. The prevalence of samples without heat treatment was 2.56% and 97.44% with heat treatment, cooked or braised. All samples were negative for Salmonella spp count and coagulase positive staphylococci < 1,0x102 UFC/g. Although most salads had an adequate microbiological quality, attention should be paid to the safety indicators as the meals are served to hospitalized individuals

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-03-01Bitstream added on 2014-06-13T21:03:39Z : No. of bitstreams: 1 000742593.pdf: 859815 bytes, checksum: 5425a81ef339c86fb09a4e61bcbfe71f (MD5) / Peritonites e infecções do orifício de saída do cateter de diálise representam as principais complicações infecciosas relacionadas à diálise peritoneal, frequentemente respondem pela falência deste método dialítico, portanto com importante impacto na morbidade e mortalidade dos pacientes. Existem associações entre o portador de S. aureus e aumento no risco de infecções nos pacientes tratados por diálise peritoneal. Entretanto, desconhecemos estudos que avaliaram a virulência de Staphylococcus spp. carreados. Fatores de virulência são descritos como responsáveis pelos sintomas e gravidade de diversas infecções causadas por S. aureus. Esses fatores incluem as hemolisinas α, β, γ e δ, lipases, lecitinases, proteases, toxina 1 da Síndrome do Choque tóxico (TSST-1) e as enterotoxinas estafilocócicas (EEs), desoxirribonuclease (DNAse) e de desoxirribonuclease termoestável (TNAse). Este estudo teve como objetivo avaliar se fatores de virulência produzidos por Staphylococcus spp. e as características clinicas e epidemiológicas dos pacientes podem influenciar na ocorrência de infecções relacionadas ao tratamento. Para tal, foram incluídos 32 pacientes tratados por diálise peritoneal na Unidade de Diálise do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu- UNESP, avaliados primariamente quanto à colonização (culturas de coletas nasais e pele pericateter, em três momentos distintos no período de 12 meses) e subsequentemente foram observados quanto ao risco para a ocorrência de infecções, acompanhados por até 36 meses confirmados com culturas do efluente peritoneal na ocorrência de peritonites e secreção da pele pericateter na vigência de infecção de orifício de saída do cateter. As amostras de Staphylococcus spp. carreadas depois de devidamente identificadas, foram reavaliadas usando como critério de similaridade o método de susceptibilidade com... / Peritonitis and infections in the exit orifice of the dialysis catheter represent the main infectious complications related to peritoneal dialysis, and are often responsible for the failure in this dialysis method, therefore with a significant impact on morbidity and mortality of patients. There are associations between the carrier of S. aureus and increased risk of infection in peritoneal dialysis patients. However, studies that evaluated the virulence of Staphylococcus spp. carried are not aware. Virulence factors are described as responsible for the symptoms and severity of different infections caused by S. aureus. These factors include hemolysins α, β, and δ, lipases lecithinases, proteases, toxin 1 in Toxic Shock Syndrome (TSST-1) and staphylococcal enterotoxins (SEs), deoxyribonuclease (DNase) and thermostable deoxyribonuclease (TNAse). This study aimed to evaluate whether virulence factors produced by Staphylococcus spp. and the clinical and epidemiological characteristics of patients may influence the occurrence of infections related to the treatment. In order to do this, 32 patients treated by peritoneal dialysis at the Dialysis Unit of the University Hospital, Botucatu School of Medicine, UNESP, Brazil were included, evaluated primarily by the colonization (cultures collected from the nose and pericatheter skin, at three different times during 12 months) and subsequently were observed regarding the risk for the occurrence of infections, followed by at least 36 months confirmed with cultures from peritoneal effluent in the occurrence of peritonitis and secretion of the pericatheter skin in the occurrence of infection in the outlet orifice of the catheter. Samples of Staphylococcus spp. carriers after being properly identified, were reevaluated using similarity criteria from the method of susceptibility agar drug diffusion technique (Kirby-Bauer method), thus allowing strains selection of ...

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2104-07-18. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:21Z : No. of bitstreams: 1 000830226.pdf: 861219 bytes, checksum: 814efdb359b08c3f5dab035dde587b30 (MD5) / A atividade leiteira na agricultura familiar é fundamental para sobrevivência e manutenção do homem no campo. A mastite bovina impacta negativamente a produção leiteira e oferece riscos à saúde pública. O presente estudo avaliou a qualidade do leite proveniente da agricultura familiar na região de Botucatu-SP, as dificuldades enfrentadas pelos produtores, a etiologia das mastites, e o perfil de sensibilidade dos patógenos aos antimicrobianos. Avaliou-se também a presença de genes produtores de enterotoxinas em linhagens de Staphylococcus isoladas. Objetivou também a recomendação de ações para melhoria na produção, visando a qualidade do leite. Aplicou-se um questionário socioeconômico aos produtores e foram coletadas amostras individuais do leite do conjunto de latões de cada propriedade e de vacas diagnosticadas com mastite pelo California Mastitis Test (CMT). Avaliou-se os teores de gordura, proteína, lactose, extrato seco, extrato seco desengordurado, a contagem bacteriana total (CBT), e a contagem de células somáticas (CCS). Foram analisadas 21 propriedades onde constatou-se que a idade média dos produtores era de 59 anos. Apenas cinco deles (23,8%) tinham ensino médio completo ou superior, sendo que nenhum (0%) contava com assessoria veterinária. Quanto às instalações da sala de ordenha, apenas quatro (19,0%) possuíam estábulos com piso concretado e quatro (19,0%) utilizavam sistema de ordenha mecânica. Quanto ao manejo, apenas um (4,8%) realizava pré-dipping corretamente, nenhum (0%) realizava pós-dipping, dois (9,5%) utilizavam papel toalha descartável na ordenha e somente dois produtores (9,5%) utilizavam o CMT com periodicidade. Em contrapartida, 15 produtores (71,4%) revelaram terem utilizado antimastíticos para tratamento das vacas. Com relação aos animais, foram avaliadas 239 vacas (média = 11,4 animais/propriedade). A mastite clínica foi verificada em apenas duas vacas (<1%), enquanto que ... / Dairy farming on family farms is critical for survival and maintenance of the rural worker. Bovine mastitis negatively impacts milk production and presents risks to public health. This study evaluated the quality of the milk from the family farm in the region of Botucatu-SP, the difficulties faced by producers, the mastitis etiology, and sensitivity profile of pathogens against antimicrobials. Also evaluated the presence of enterotoxin producing genes in isolated staphylococcal strains. Also aimed the recommendation of actions to improve the production, seeking the quality of the milk. A Socioeconomic questionnaire was applied to producers and individual milk samples were collected from the set of brasses of each property and from cows diagnosed with mastitis by California Mastitis Test (CMT). It was evaluated the levels of fat, protein, lactose, dried extract and nonfat dry extract, the total bacterial count (TBC) and the somatic cell count (SCC). Twenty one (21) properties were analyzed where it was found that the average of the farmers was 59 years. Only five of them (23.8%) had completed high school or higher, and none (0%) counted on veterinary advice. As for their facilities of milking parlor, only four (19.0%) had stables with concreted floor and four (19.0%) used mechanical milking system. As to the handling, only one (4.8%) performed pre-dipping correctly, none (0%) performed post-dipping, two (9.5%) used disposable paper for milking and only two producers (9.5%) used the CMT with periodicity. On the other hand, 15 producers (71.4%) stated that they used anti mastitis for treating the cows. Regarding the animals, 239 cows (average = 11.4 animals / property) were evaluated. The clinical mastitis was detected in only two cows (<1%), whereas 86 animals showed milk positive to CMT (35.9% of subclinical mastitis). One hundred seventy-seven (177) milk samples were cultured, on 55 (31.1%) of them it was identified staphylococci, on ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-19Bitstream added on 2014-11-10T11:58:27Z : No. of bitstreams: 1 000790238.pdf: 2127036 bytes, checksum: b9b9441469c5121308bed247ca78c0ac (MD5) / Na última década houve uma clara mudança na etiologia da sepse. Dados recentes do National Healthcare Safety Network (NHSN) mostram que os cocos Gram-positivos têm ultrapassado os bacilos Gram-negativos como os principais agentes etiológicos e os Estafilococos coagulase negativa (ECN) se tornaram os agentes mais frequentes. Entretanto a maioria dos laboratórios clínicos não identifica esses microrganismos a nível de espécies devido à necessidade de realização de uma série de provas bioquímicas. A aplicação de técnic as de biologia molecular, entre elas a reação em cadeia da polimerase (PCR) para a identificação de bactérias se mostrou uma técnica promissora devido a sua rapidez, acurácia e sensibilidade. Assim, este trabalho objetivou avaliar a eficiência, acurácia e sensibilidade da técnica de PCR multiplex para a detecção do gênero e de espécies de Staphylococcus spp. mais encontradas em hemoculturas, do operon ica de produção de biofilme e da presença do gene mecA de resistência à oxacilina diretamente dos frascos de hemocultivo. Foram analisadas 371 amostras de hemoculturas, positivas para o gênero Staphylococcus obtidas de pacientes atendidos no HC da Faculdade de Medicina de Botucatu (FMB). As amostras foram isoladas e identificadas por testes bioquímicos convencionais e simultaneamente o DNA bacteriano foi extraído diretamente das hemoculturas e destes realizou-se o PCR multiplex. Das 371 amostras estudadas 85 (23,0%) foram de S. aureus e 286 (77,0%) ECN. Dos ECN 152 (53,1%) foram identificados como S. epidermidis, 36 (12,6%) S. haemolyticus, 36 (12,6%) S. hominis, 23 (8,0%) S. capitis, 18 (6,3%) S. warneri, 7 S. caprae, 5 S. simulans, dois S. lugdunensis, dois S. cohnii, um S. saprophyticus, um S. schleiferi, um S. xylosus e concomitantemente um S. haemolyticus e S. hominis, e um S. haemolyticus e S. epidermidis. Das 85 amostras de S. aureus, 43 (50,6%) se mostraram resistentes à oxacilina pelo ... / A clear shift in the etiology of sepse has occurred in the last decade. Recent data from the National Healthcare Safety Network (NHSN) show that Gram-positive cocci have exceeded Gram-negative bacilli as the major etiological agents. In this respect, coagulase-negative staphylococci (CoNS) have become the most frequent. However, most clinical laboratories do not identify these microorganisms to species level due to the need for a series of biochemical tests. The application of molecular biology techniques, including the polymerase chain reaction (PCR), for bacterial identification proved to be promising due to their speed, accuracy and sensitivity. The aim of this study was to evaluate the efficiency, accuracy and sensitivity of multiplex PCR for the detection of Staphylococcus spp. frequently found in blood cultures, investigation of the ica operon involved in biofilm formation and the mecA gene encoding oxacillin resistance, and direct detection of major CoNS species in blood culture flasks. A total of 371 blood culture samples positive for Staphylococcus spp. obtained from patients seen at the Hospital of the Botucatu School of Medicine (FMB) were analyzed. The strains were isolated and identified by conventional biochemical tests. Simultaneously, bacterial DNA was extracted directly from the blood cultures for multiplex PCR. S. aureus was isolated from 85 (23%) of the 371 samples studied and CoNS from 286 (77%). Among the latter, 152 (53.1%) isolates were identified as S. epidermidis, 36 (12.6%) as S. haemolyticus, 36 (12.6%) as S. hominis, 23 (8%) as S. capitis, 18 (6.3%) as S. warneri, 7 as S. caprae, 5 as S. simulans, two as S. lugdunensis, two as S. cohnii, one as S. saprophyticus, one as S. schleiferi, and one as S. xylosus. S. haemolyticus and S. hominis were concomitantly identified in one sample and S. haemolyticus and S. epidermidis in another. Forty-three (50.6%) of the 85 S. aureus strains were resistant to oxacillin in ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:45Z : No. of bitstreams: 1 000791022_20150101.pdf: 163030 bytes, checksum: 4b930b23cfb760cdac937dea46fd30d0 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-05T11:00:58Z: 000791022_20150101.pdf,Bitstream added on 2015-01-05T11:01:51Z : No. of bitstreams: 1 000791022.pdf: 440136 bytes, checksum: c11d7a5f61556f43d84811421fb93c50 (MD5) / Com o objetivo de avaliar as condições higiênicas e sanitárias de carcaças congeladas de perus, temperadas, foram colhidas 63 amostras no comércio varejista da região nordeste do Estado de São Paulo, levadas ao Laboratório de Análise de Alimentos de Origem Animal e Água, Campus de Jaboticabal, SP, e submetidas à determinação do Número Mais Provável (NMP) de coliformes totais, coliformes termotolerantes e Escherichia coli, à quantificação de microrganismos heterotróficos mesófilos, psicrotróficos, Staphylococcus spp., Staphylococcus coagulase positivo e Staphylococcus aureus, e também à pesquisa e tipificação de bactérias do gênero Salmonella, bem como identificar, in vitro, os antimicrobianos mais eficazes contra os microrganismos isolados. Todas as 63 amostras analisadas mostraram-se de acordo com os padrões microbiológicos estabelecidos na RDC 12/2001 da ANVISA, com limite de 104NMP/g para população de coliformes termotolerantes. Em nenhuma das 63 amostras analisadas foi identificado Staphylococcus aureus e também não foram encontrados microrganismos do gênero Salmonella. Os resultados atribuem condições higiênicas e sanitárias satisfatórias às carcaças congeladas de peru, temperadas, comercializadas no varejo da região nordeste do Estado de São Paulo. Entretanto, cuidados devem ser tomados pelo consumidor no sentido de garantir que os produtos não sejam expostos a temperaturas acima da refrigeração que permitam a multiplicação dos microrganismos presentes, especialmente dos Staphylococcus coagulase positivo, que apesar de não serem estabelecidos limites populacionais para estes microrganismos na legislação vigente para este produto, se apresentaram em populações moderadamente elevadas, constituindo risco caso sejam mantidos em condições de refrigeração inadequadas / This research aims to evaluate the hygienic and sanitary conditions of frozen carcasses of turkeys, temperated, 63 samples were taken at retail in the northeastern region of São Paulo, brought to the Food Analysis Laboratory of Animal Origin and Water, Jaboticabal, SP, and the samples were submitted to different determinations: populations of mesophilic aerobic bacteria and psychotropics, Staphylococcus spp., coagulase positive Staphylococcus and Staphylococcus aureus enumeration, Most Probable Number (MPN) of total coliforms, thermotolerant coliforms and Escherichia coli, as well as to research and typing bacteria of the genus Salmonella, and identify, in vitro, the most effective antibiotics against the isolated microorganisms. All 63 samples were found according to the microbiological standards established in the RDC 12/2001 ANVISA, on limit 104NMP/g for thermotolerant coliform population. In the 63 samples were not identified Staphylococcus aureus and also microorganisms of the genus Salmonella. The results gave satisfactory sanitary conditions to frozen carcasses of turkey, temperated, sold in outlets in the northeastern region of São Paulo. However, cares must be taken by the consumers to ensure that the products are not exposed to temperatures above refrigeration that allow the multiplication of microorganisms, especially Staphylococcus coagulase positive, although there isn’t population limits for these microorganisms in the current legislation for this product, presented at moderately high populations, constituting a risk if they are kept in conditions of inadequate cooling

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-04-09Bitstream added on 2014-06-13T18:08:11Z : No. of bitstreams: 1 lorenzon_cs_me_jabo.pdf: 230149 bytes, checksum: d9f1485e99a4471e89d6e1d273b98a86 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O objetivo deste trabalho foi determinar o número de coliformes totais, termotolerantes, Staphylococcus coagulase positivo e a presença de bactéria do gênero Salmonella no músculo, no tecido superficial, no trato gastrintestinal de peixes e na água de cultivo de pesque-pagues situados na microbacia do Córrego Rico, região nordeste do estado de São Paulo. Não foi detectado Staphylococcus coagulase positivo em nenhuma amostra de água e peixe. Na contagem de Staphylococcus sp. a água de enxaguadura da pele apresentou números que variam de 1,0 x 102 a 3,3 x 105 UFC.mL-1; no músculo de 1,0 X 102 a 6,7 x 103 UFC.g-1; no trato gastrintestinal de 1,0 x 103 a 2,9 x 105 UFC.g-\ e na água de cultivo de < 20 a 3,3 x 102 UFC.mL-1. O número mais provável (NMP) de coliformes totais na pele variou de 1,5 x 103 a > 1,1 x 104 NMP.100mL-1; no músculo variou de 2,0 x 10 a> 1,1 x 103 NMP.g-1; no trato gastrintestinal variou de 2,6 x 103 a> 1,1 x 104 NMP.g-1; e na água de cultivo variou de 4,2 x 104 a> 2,4 x 105 NMP.100mL-1. Para coliformes termotolerantes a água de enxaguadura da pele variou de < 3,0 x 10 a 1,4 x 103 NMP.IOOmL-1; no músculo variou de < 3 a 6 NMP.g-1; no trato gastrintestinal variou de 1,2 X 103 a 5,1 x 103 NMP.g-1; e na água de cultivo variou de 3,8 x 102 a 2,0 x 104 NMP.100mL-1. Não houve diferença estatística (P>0,05) entre as populações de microrganismos pesquisados na água, pele e trato gastrintestinal o que reflete a relação direta entre a presença dos microrganismos na água e nesses dois locais analisados. No que se refere à musculatura verifica-se que existe diferença (P<0,05) entre a população de microrganismos na água e na musculatura, sendo na musculatura sempre menor. Foi isolada Salmonella sp. em uma amostra de músculo e em duas amostras de trato gastrintestinal. O pescado pode ser veículo de contaminação cruzada, tendo como... / The aim of this work was to determine the number of total coliforms, thermotolerant, Staphylococcus coagulase positive and the presence of bacteria of the genus Salmonella in the muscle, in the surface tissue, in the gastrointestinal tract of fish and pond water of fee- fishing located in Cón-ego Rico microwatershed, northeast region of São Paulo state. Staphylococcus coagulase positive was not detected in any sample of pond water and fish. In the Staphylococcus sp. counts the surface tis sue ranged from 1,0 x 102 to 3,3 X 105 UFC.mL-1; in the musc1e from 1,0 x 102 to 6,7 x 103 UFC.g-1; in the gastrointestinal tract of fish from 1,0 x 103 to 2,9 X 105 UFC.g-1; and in pond water from < 20 to 3,3 X 102 UFC.mL¬1. The most probable number (NMP) of total coliforms in the surface tissue ranged from 1,5 x 103 to > 1,1 X 104 NMP.100mL-1; in the muscle from 2,0 x 10 to > 1,1 X 103 NMP.g-1; in the gastrointestinal tract offish from de 2,6 x 103 to> 1,1 X 104 NMP.g-1; and in pond water from 4,2 x 104 to > 2,4 X 105 NMP.1 00mL-1 . In thermotolerant coliforms the surface tissue ranged from < 3,0 x 10 to 1,4 X 103 NMP.100mL-1; in the musc1e from < 3 to 6 NMP.g-1; in the gastrointestinal tract of fish from de 1,2 x 103 to 5,1 X 103 NMP.g-1; and in pond water from 3,8 x 102 to 2,0 X 104 NMP.100mL-1. There was no statistical difference (P>0,05) among the studied populations of microorganisms in water, skin and gastrointestinal tract that reflects the relationship between the presence of microorganisms in water and in these two tissues analyzed. Conceming the musc1e there is difference (P<0,05) among the population of microorganisms in water and muscle, in which muscles were always smaller. Salmonella sp. was isolated in a sample of muscle and in two samples of gastrointestinal tract. The fish ean be a vehic1e of cross contamination, and the gastrointestinal tract and skin as a source of microorganisms... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:10:25Z : No. of bitstreams: 1 000747565.pdf: 762896 bytes, checksum: 9cce482492cfda2fb9dc6de8b7ae0113 (MD5) / A mastite é uma enfermidade que causa inflamação na glândula mamária e geralmente tem origem infecciosa. É uma das principais doenças que acomete os rebanhos de ovinos causando prejuízos econômicos aos produtores. Na mastite infecciosa, as bactérias do gênero Staphylococcus são os principais causadores de mastite em rebanhos de ovinos. Esses micro-organismos se caracterizam pela capacidade de produzir uma ampla variedade de toxinas extracelulares e outros fatores de virulência como a formação de biofilme, além de apresentarem resistência aos agentes antimicrobianos empregados no tratamento dos animais. Esse estudo teve como objetivos caracterizar o perfil clonal e os fatores de virulência e de resistência aos antimicrobianos em Staphylococcus spp. isolados do leite de ovinos de três rebanhos. Após a realização do California Mastitis Test (CMT) as amostras de leite foram colhidas para contagem de Células Somáticas (CCS) e identificação das espécies de estafilococos isoladas, detecção de genes codificadores de enterotoxinas (sea, seb, sec e sed), da toxina TSST-1, da leucocidina PVL e de biofilme (icaA, icaC, icaD, bap, aap e bhp), além da determinação da resistência a oxacilina pela pesquisa do gene mecA e perfil de sensibilidade a doze antimicrobianos. Os isolados com a presença de genes para toxinas e biofilme foram testados para detecção do RNA mensageiro para avaliação da capacidade de expressão dos fatores de virulência. Foram coletadas 473 amostras de leite de 242 animais, sendo encontrados micro-organismos em 169 (35,7%) amostras. Das 169 amostras em que foram isolados micro-organismos, 132 (78,1%) foram identificados como pertencendo ao gênero Staphylococcus, sendo 20 (15,1%) amostras identificadas como Staphylococcus aureus e as demais 112 (84,9%) como estafilococos coagulase-negativa (ECN). Das 20 amostras de S. aureus isoladas, nenhuma apresentou o gene... / Mastitis is a disease that causes inflammation in the mammary gland and is usually infectious. It is a major disease that affects sheep herds causing economic losses for producers. In infectious mastitis, Staphylococcus bacteria are the major cause of mastitis in sheep flocks. These micro-organisms are characterized by the ability to produce a wide variety of extracellular toxins and other virulence factors such as biofilm formation, besides presenting resistance to antimicrobial agents used in the treatment of animals. This study aimed to characterize the profile and clonal virulence factors and antimicrobial resistance in Staphylococcus spp. isolated from milk of sheep from three flocks. After the completion of the California Mastitis Test (CMT) milk samples were collected for Somatic Cell Count (SCC) and species identification of staphylococci isolated detection of genes encoding enterotoxins (sea, seb, sec and sed), the toxin TSST-1, PVL and Leucocidin of biofilm (icaA, icaC, icaD, bap, aap and bhp), besides the determination of resistance to oxacillin by research mecA and sensitivity profile to twelve antimicrobials. Isolates with the presence of toxin genes and biofilm were tested for the detection of messenger RNA for assessing the ability of expression of virulence factors. We collected 473 milk samples from 242 animals, micro-organisms found in 169 (35.7%) samples. Of the 169 samples that were isolated micro-organisms, 132 (78.1%) were identified as belonging to the genus Staphylococcus, 20 (15.1%) samples identified as Staphylococcus aureus and the remaining 112 (84.9%) as coagulase-negative staphylococci (CNS). Of the 20 samples of S. aureus isolates, none had the mecA and most were sensitive to all drugs tested except one sample that was resistant to tetracycline. Seven samples showed a toxin gene, the gene being the most seb found, present in five samples, followed by sea on three, two ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-26Bitstream added on 2014-06-13T19:28:47Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_a_me_botib.pdf: 2150093 bytes, checksum: 919f378505685748f61cc9d4768d368e (MD5) / Os estafilococos coagulase-negativa (ECN) estão entre os microrganismos mais envolvidos em infecções nosocomiais, principalmente em recém-nascidos (RN) prematuros e de baixo peso. Entre os fatores de risco para infecções por esses agentes, a produção de um polissacarídeo extracelular e a conseqüente formação do biofilme, permitindo aderência às superfícies plásticas e lisas de cateteres e outros dispositivos médicos desempenham um papel importante. Uma coleção de 100 amostras de ECN, sendo 50 isoladas de pontas de cateteres e 30 de hemoculturas obtidas de RN da Unidade Neonatal do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP e 20 obtidas de fossas nasais de portadores saudáveis foi analisada quanto à produção de biofilme pelos métodos do tubo (TM), ágar vermelho congo (CRA) e através do método quantitativo de aderência a placa de poliestireno (TCP). Esses métodos foram comparados com a pesquisa dos genes icaA, icaD e icaC envolvidos na produção de biofilme em ECN. Das 100 amostras de ECN estudadas, 82% foram positivas pela técnica de PCR, 82% pelo método do tubo, 81% pelo método da placa de poliestireno e 76% pelo CRA. O método de aderência ao tubo (TM) foi o teste que mostrou resultados mais confiáveis, com uma sensibilidade e especificidade de 100% e boa concordância quando comparado a técnica de PCR. Com o objetivo de determinar o papel do biofilme como fator de risco na ocorrência de infecções em RN, 130 amostras de estafilococos coagulasenegativa (ECN) isoladas de recém-nascidos (RN) internados na Unidade Neonatal do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu foram identificadas e classificadas em significativas e contaminantes, baseado em dados clínicos e laboratoriais obtidos dos prontuários dos RN. Foram pesquisados fatores perinatais de risco para infecção, evolução clínica dos RN e antibiotico... / Coagulase-negative staphylococci (CNS) are most often associated with nosocomial infections, especially in premature and under weight newborns. The most important pathogenic factor of these microorganisms is the production of extracellular polysaccharide and the consequent formation of biofilm which facilitates their adherence to the surfaces of catheters and other medical devices. A total of 100 clinical isolates of coagulase-negative staphylococci (CNS) isolated from infected medical devices received from the Neonatal Unit, University Hospital, Botucatu Medical Schooll, including 50 isolated from catheter tips, 30 from blood cultures, and 20 collected from the nasal cavity of healthy subjects were investigated in order to evaluate the efficiency of three phenotypic methods of detection of biofilm formation, and also analyze the icaA, icaD and icaC genes, using the PCR method. The clinical isolates were screened by tissue culture plate (TCP), Tube method (TM), and Congo Red Agar (CRA) method. Of the 100 tested isolates, 82% were positive in the PCR method; in the TM, 82%; in the TCP assay, 81%; and 76% in CRA method. The method of adherence to the test tube was shown that more reliable results, with a sensitivity and specificity of 100% and good agreement when compared with the PCR technique. In order to determine the role of biofilm as a risk factor in the occurrence of infections in newborns 130 clinical isolates of CNS were identified and classified as significant and contaminant, based on clinical data obtained from the patients’ reports. Perinatal risk factors for infection, clinical evolution and antibiotic therapy for the newborns were studied, as well as the detection of the genes responsible for the production of biofilm in CNS.Of the 130 clinical isolates of CNS, 66 (50.8%) were classified as clinically significant and 64 (49.2%) as contaminant... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-06-15Bitstream added on 2014-06-13T19:10:40Z : No. of bitstreams: 1 witzel_cl_me_botfm_parcial.pdf: 120396 bytes, checksum: ec18337e12bca612c7c9844103a8160d (MD5) Bitstreams deleted on 2014-06-27T19:00:45Z: witzel_cl_me_botfm_parcial.pdf,Bitstream added on 2014-06-27T19:02:01Z : No. of bitstreams: 1 witzel_cl_me_botfm.pdf: 1277080 bytes, checksum: c6e53fb083813be017b346181b7be466 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / As Infecções estafilocócicas são grande causa de mortalidade e morbidade. A emergência de isolados de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) originários da comunidade na década de 1990 trouxe desafios para sua prevenção e abordagem terapêutica. A identificação da prevalência e características de MRSA adquirido em comunidade (CA-MRSA) em populações de alto risco pode fornecer valiosas informações para compreensão de sua epidemiologia. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência, os fatores de risco e as características moleculares de CA-MRSA isolado em nasofaringe de uma população carcerária em Avaré, Brasil. Foram coletados swabs nasais de 302 homens encarcerados no Centro de Ressocialização de Avaré. A caracterização da resistência à meticilina foi feita através de difusão em disco (Oxacilina e Cefoxitina) e identificação do gene mecA (por Reação em Cadeia de Polimerase (PCR). Utilizou-se também PCR para identificação dos genes lukF-PVe lukS-PV que codificam a leucocidina de Panton-Valentine. Fatores de risco para colonização nasal por S. aureus e por MRSA foram avaliados em modelos univariados e multivariados (regressão logística). A prevalência de colonização nasal por S. aureus como um todo foi de 16,5%, e a MRSA (definida como positividade para o gene mecA), de (02) 4,0%. Os testes de difusão com disco de Oxacilina e Cefoxitina identificaram 2 (4%) resistentes simultaneamente a Oxacilina e Cefoxitina. Nenhum dos isolados de S. aureus apresentou genes codificadores da PVL. As amostras positivas para gene mecA apresentaram SCCmec tipo IV, confirmando esta tipagem presente em amostras comunitárias.Uma das amostras positivas para gene mecA apresentou SCCmec IV-d, que pelo método PFGE agrupou em 85,7% com o clone JCSC 4469 de origem japonesa. Os fatores de risco para... / Staphylococci infections are a major cause of morbidity and mortality. The emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates original from the community in the 1990s brought challenges for prevention and therapeutic approach.Identifying the prevalence and characteristics of community-acquired MRSA (CA-MRSA) in high-risk populations can provide valuable information for understanding its epidemiology. The objective of this study was to identify the prevalence, risk factors and molecular characteristics of CA-MRSA isolates in nasopharynx of a prison population in Avare, Brazil. Nasal swabs were collected from 302 men incarcerated in Central Resocialization of Avaré. The characterization of methicillin resistance was done by disk diffusion (Oxacillin and Cefoxitin) and mecA gene identification (by Polymerase Chain Reaction(PCR). We also used PCR to identify the lukF-PV and lukFS-PV genes that encode the Panton- Valentine Leukocidin. Risk factors for nasal colonization by S. aureus and MRSA were evaluated with univariate and multivariate models (logistic regression). The prevalence of nasal colonization by S. aureus as a whole was 16.5%, and MRSA (defined as positive for the mecA gene), from (02) 4.0%. The diffusion testing with Oxacillin and Cefoxitin identified 2 (4%) isolates resistants to both Oxacillin and Cefoxitin. None of the isolated S.aureus had genes encoding PVL. Positive samples for mecA showed SCCmec type IV, confirming this typing in community samples. One of the positive samples for mecA showed SCCmec IV-d, which by PFGE method grouped in 85.7% with clone 4469 JCSC of Japanese origin. Risk factors for S. aureus acquisition revealed in the survey were: men who... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-07-01T13:10:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-26. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:14:18Z : No. of bitstreams: 1 000866926.pdf: 743081 bytes, checksum: 2828d0722b47842ed4053d5ce7906847 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente estudo investigou a eficácia do ceftiofur intramamário no tratamento estendido com dez aplicações, a cada 12 horas, na mastite subclínica por estafilococos em primíparas bovinas. Foram utilizados 60 animais da raça holandesa, divididos em quadro grupos: G1 = Grupo negativo ou sem infecção estafilocócica, CMT negativo e CCS < 200.000 células/mL; G2 = Grupo com infecção estafilocócica não tratado, CMT positivo (2+ ou 3+) e CSS > 200.000 células/mL; G3 = Grupo com infecção tratado no início da lactação (entre 15 e 100 dias de lactação), CMT positivo (2+ ou 3+) e CCS > 200.000 células/mL e G4 = Grupo tratado final da lactação (entre 101 e 200 dias de lactação), CMT positivo (2+ ou 3+) e CCS > 200.000 células/mL. As amostras de leite foram coletadas em cinco momentos: M0 ou dia zero (diagnóstico da mastite subclínica), M1 = 7 dias após o diagnóstico da mastite subclínica e início da terapia estendida, M2 = 2 dias após o término do tratamento estendido (dia 14 após o diagnóstico da mastite subclínica), M3 = 7 dias após M2 (dia 21 após o diagnóstico da mastite ou 9 dias após o final do tratamento), M4 = 7 dias após M3 (dia 28 após o diagnóstico da mastite ou 16 dias após o final do tratamento). Nos grupos tratados com ceftiofur intramamário, foi evidenciada a cura microbiológica com redução na CCS em 73,34% no G3 e 46,66% no G4. Assim, nos grupos tratados (G3 + G4) e não tratado (G2), as taxas de cura foram, respectivamente, 60,00% e 26,66% (p<0,05). Foram isoladas 45 linhagens de Staphylococcus spp., das quais foram identificados principalmente S. aureus (51,12%), S. intermedius (40,0%) e S. epidermidis (8,88%). O perfil de sensibilidade microbiana in vitro dos isolados apresentou maiores índices de sensibilidade para oxacilina (80,00%), ceftiofur (77,78%) e cefalexina (77,78%), seguidos do ciprofloxacino (66,66%) e gentamicina (60,00%). Em contraste... / This study investigated the efficacy of extended ceftiofur intramammary therapy using 10 applications by five days in primiparous heifers infected by staphylococcal subclinical mastitis. Sixty Holstein cows were divided in four groups: G1 = negative group or without staphylococcal infection, CMT-negative and SCC<200.000 cells/mL; G2 = untreated group with staphylococcal infection, CMT-positive and SCC>200.000 cells/mL; G3 = treated early lactation group (15-100 days of lactation) with staphylococcal infection, CMT-positive and SCC>200.000 cells/mL, G4 = treated late of lactation group (101-200 days of lactation) with staphylococcal infection, CMT-positive and SCC>200.000 cells/mL. The milk samples were collected at five moments: M0 or day zero (diagnosis of subclinical mastitis), M1 = 7 days after diagnosis of subclinical mastitis and early extended therapy, M2 = 2 days after the end of the extended treatment (day 14 after the diagnosis of subclinical mastitis), M3 = 21 days after diagnosis of mastitis (9 days after the end of treatment), M4 = 28 days after diagnosis of mastitis (16 days after the end of treatment). In the groups treated with intramammary ceftiofur, microbiological cure was observed with reduction in SCC in 73.34% and 46.66% of animals for G3 and G4, respectively. Thus, in the treated (G3 + G4) and untreated (G2) groups, microbiological cure rates were 60.00% and 26.66% (p<0.05), respectively. Forty-five Staphylococcus spp. strains were isolated. From these, S. aureus (51.12%), S. intermedius (40.0%), and S. epidermidis (8.88%) were the most common species. In vitro antimicrobial susceptibility profile of isolates showed that the most effective drugs were oxacillin (80.0%), ceftiofur (77.78%), and cephalexin (77.78%), followed by ceftriaxone (69.0%), ciprofloxacin (66.66%) and gentamicin (60,0%). In contrast, high-resistance rates of isolates were founded to cloxacillin (24.44%), penicillin...