Made available in DSpace on 2018-03-07T17:02:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) silvana_portes_ioc_dout_2017.pdf: 8610199 bytes, checksum: 0cccd6bb223121b0a0613dee1f34758f (MD5) / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Os vírus gastrentéricos são associados à casos esporádicos e surtos de doença diarreica (DD). A DD é uma complicação frequente em crianças imunocompetentes e imunocomprometidas. O objetivo principal deste estudo, foi avaliar a frequência de detecção dos vírus gastroentéricos (rotavírus [RVA], norovírus [NoV], astrovírus [HAstV] e adenovírus [HAdV]) ou emergentes (bocavírus [HBoV] e aichivírus [AiV-1]), em crianças hospitalizadas com DD, infectadas ou não infectadas pelo HIV-1, no estado do Rio de Janeiro. Neste contexto, as taxas de detecção destes vírus nessas crianças, foram descritas e comparadas e, a infecção recorrente de HAdV em crianças soropositivas para HIV-1, foi avaliada. Além disso, foi possível investigar a etiologia viral de um surto de DD ocorrido no Rio de Janeiro, em 2013. O RVA foi detectado por ensaio imunoenzimático (EIE) e por eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA), sendo caracterizado por semi-nested multiplex RT-PCR. Os NoV, HAdV,HAstV, HBoV e AiV-1 foram detectados e caracterizados através da PCR ou RT-PCR e sequenciamento. A carga viral dos RVA, NoV, HAstV, HAdV e HBoV foram determinadas nas fezes das crianças estudadas. Nossos resultados, mostraram que o AiV-1, NoV, HBoV e HAdV foram significativamente mais frequentes entre as crianças HIV-1 soropositivas, enquanto RVA e HAstV foram significativamente menos frequentes entre essas crianças. A circulação do AiV-1 genótipos A e B foi demonstrada nas crianças estudadas. Foram observadas coinfecções nas crianças estudadas, sendo mais frequentes nas crianças com AIDS A mediana da carga viral de HAstV nas fezes das crianças estudadas, foi significativamente maior entre as crianças HIV-1 positivas em comparação com crianças HIV-1 negativas, enquanto que para RVA, NoV, HBoV e HAdV, não hove significância nas medianas das cargas virais nas fezes destas crianças. NoV e o HBoV foram significativamente mais frequentes entre crianças com contagem de linfócitos TCD4+<200 células/mm3. Os dados apontam o NoV, AiV-1 e HAdV como patógenos oportunistas, infectando crianças com AIDS e DD. A diversidade genética foi demonstrada, sendo possível apresentar as variantes circulantes para os vírus estudados. A infecção recorrente por HAdV foi detectada entre as crianças HIV-1 soropositivas, com HAdV-F40, -F41 e D associados a diarreia crônica e persistente. O HAdV foi o único vírus detectado no surto de 2013, no Rio de Janeiro, sendo o HAdV-A12 associado ao surto. Os resultados obtidos neste estudo, monstram que os vírus gastroentéricos e emergentes devem ser considerados como causas importantes de DD em crianças HIV-1 soropositivas. Além disso, este estudo enfatiza a importância de investigar os vírus gastroentéricos e emergentes em casos de DD, especialmente em surtos, visando a vigilância desses vírus em DD em países onde a vacinação com RVA é rotineiramente realizada / Gastroenteric viruses are associated with sporadic cases and outbreaks of diarrheal disease (DD). DD is a frequent complication in immunocompetent and immunocompromised children. The main objective of this study was to evaluate the frequency of detection of gastroenteric (rotavirus [RVA], norovirus [NoV], astrovirus [HAstV] and adenovirus [HAdV]) or emergent (bocavirus [HBoV] and aichivirus [AiV-1]) viruses in children hospitalized with DD, infected or not infected by HIV-1, in the state of Rio de Janeiro. In this context, detection rates of these viruses in these children were described and compared, and recurrent HAdV infection in children HIV-1 seropositive was evaluated. In addition, it was possible to investigate the viral etiology of a DD outbreak occurred in Rio de Janeiro in 2013. The RVA was detected by immunoenzymatic assay (EIE) and by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), characterized by semi-nested multiplex RT-PCR. NoV, HAdV, HAstV, HBoV and AiV-1 were detected and characterized by PCR or RT-PCR and sequencing. The viral load of RVA, NoV, HAstV, HAdV and HBoV were determined in the feces of the studied children. Our results showed that AiV-1, NoV, HBoV and HAdV were significantly more frequent among children HIV-1 seropositive, whereas RVA and HAstV were significantly less frequent among these children. The circulation of the AiV-1 genotypes A and B was demonstrated in the studied children. Coinfections were observed in the studied children, being more frequent in children with AIDS The median HAstV viral load in the feces of the children studied was significantly higher among children HIV-1 seropositive compared to children HIV-1 seronegative, while for RVA, NoV, HBoV and HAdV, there is no significance in the medians of the viral loads in the feces of these children. NoV and HBoV were significantly more frequent among children with TCD4 + cells <200 cells / mm3. The data point to the NoV, AiV-1 and HAdV as opportunistic pathogen infecting children with AIDS and DD. The genetic diversity was demonstrated, being possible to present the circulating variants for the virus studied. Recurrent HAdV infection was detected among children HIV-1 seropositive with HAdV-F40, -F41 and D associated with chronic and persistent diarrhea. HAdV was the only virus detected in the 2013 outbreak in Rio de Janeiro, with HAdV-A12 associated with the outbreak. The results obtained in this study, show that the gastroenteric and emergent viruses should be considered as important causes of DD in children HIV-1 seropositive. In addition, this study emphasizes the importance of investigating the gastroenteric and emergent viruses in cases of DD, especially in outbreaks, aiming the surveillance of these viruses in DD in countries where vaccination with RVA is routinely performed

Submitted by Verônica Esteves (vevenesteves@gmail.com) on 2017-09-22T12:19:19Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Detecção e caracterização molecular de vírus associados com gastrenterite aguda (dissertação - Maria da Penha Trindade Pinheiro Xavier).pdf: 1727960 bytes, checksum: bdf6aa7830668ed27e7f7023599907e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Verônica Esteves (vevenesteves@gmail.com) on 2017-09-22T12:20:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Detecção e caracterização molecular de vírus associados com gastrenterite aguda (dissertação - Maria da Penha Trindade Pinheiro Xavier).pdf: 1727960 bytes, checksum: bdf6aa7830668ed27e7f7023599907e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-22T12:21:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Detecção e caracterização molecular de vírus associados com gastrenterite aguda (dissertação - Maria da Penha Trindade Pinheiro Xavier).pdf: 1727960 bytes, checksum: bdf6aa7830668ed27e7f7023599907e5 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Universidade Federal da Bahia / Fundação Oswaldo Cruz. Departamento de Virologia / Estudos baseados em comunidades fornecem informações que representam geograficamente o perfil das doenças diarréicas infantil. Entretanto, nos países em desenvolvimento, são poucos os estudos que relatam a circulação das principais viroses gastrentéricas em uma mesma comunidade. Este estudo apresenta os dados da investigaçao da freqüência da infecção dos norovírus e sapovirus em crianças com gastrenterite aguda participantes de um estudo longitudinal em comunidades carentes da cidade de Salvador, BA, Brasil. A caracterização molecular de outros vírus entéricos previamente detectados nesta mesma população também foi realizada. Este estudo representa a continuidade de um projeto anterior desenhado para estabelecer o perfil dos patógenos entéricos mais prevalentes nessas comunidades. Neste estudo, 139 amostras fecais coletadas no período de julho de 2001 a janeiro de 2002 foram analisadas por RT-PCR usando inicialmente um conjunto de oligonucleotídeos para detecção de calicivirus humanos (norovirus e sapovirus) e um específico para norovirus. Sete amostras (5,0%) foram positivas para calicivirus e 11 amostras (7,9%) para norovirus. Uma amostra foi caracterizada como SaV e sete amostras como norovirus do genogrupo GII, por seqüenciamento de nucleotideos. A caracterização molecular do rotavírus do grupo A (RV-A) e astrovírus (HAstV), previamente detectados, revelou a circulação do RV-A genótipos G1P[8] e G9P[8] e HAstV genótipos 6, 7 e 8. Não foram observadas infecções mistas. Estes achados apontam para a grande diversidade dos genótipos dos mais importantes vírus associados às gastrenterites agudas circulando em comunidades carentes / Community based studies provide geographically representative information on the acute diarrhea disease burden. However, there are only a few reports in developing countries concerning the genotypes of the most important gastro enteric viruses in such communities. This study presents the results obtained by investigating the presence of Norovírus in children with acute gastroenteritis from a longitudinal study in low-income communities of the city of Salvador, BA, Brazil. This study represents an extension of a previous work performed to establish the profile of the most prevalent enteric pathogens present in these communities. In this study, 139 fecal samples collected from July 2001 to January 2002 were analyzed by RT-PCR using a set of primers for calicivirus (norovirus and sapovirus) and a specific set of primers for NoV. Seven out of 139 (5.0%) and 11 (7,9%) samples were positive for calicivirus and norovirus, respectively. One sample was characterized as human sapovirus and seven isolates were characterized as NoV genotype GII. The molecular characterization of the previously detected group A rotaviruses (RV-A) and human astrovíruses (HAstV) was also performed and revealed the circulation of RV-A genotypes G1P[8] and G9P[8]; and HAstV genotypes 6, 7, and 8. No mixed infection was observed. These findings pointed out the circulation of a great diversity of genotypes of the most important viruses responsible for acute gastroenteritis circulating in low-income communities

Les Norovirus (NoV), appartenant à la famille des Caliciviridae, sont une cause majeure dépidémies et de cas sporadiques de gastroentérites hautement contagieuses chez lhomme. Leur transmission emprunte la voie fécale-orale et ils sont à l'origine dune part importante des toxi-infections humaines d'origine alimentaire, en particulier dues à la consommation de mollusques bivalves. Ils possèdent un génome constitué dARN monocaténaire de polarité positive et sont classeés par analyse de proximité génétique en cinq génogroupes, contenant chacun plusieurs génotypes. Un problème majeur réside dans lincapacité à multiplier facilement les NoV en culture de cellules. La RT-PCR est devenue la méthode de choix pour leur détection dans les échantillons de matières fécales, les denrées alimentaires et les prélèvements effectués dans lenvironnement. Il est important de disposer de techniques à la fois sensibles et permettant également la détection dun large panel de NoV. La quantification de la charge virale est possible par lutilisation des techniques de RT-PCR en temps réel et est primordiale pour non seulement déterminer le niveau de contamination dun prélèvement, mais également pour étudier et caractériser la pathogénie de linfection à NoV. Des NoV ont été détectés dans diverses espèces animales, dont lespèce bovine. Ces découvertes ont soulevé d'importantes questions sur une éventuelle transmission zoonotique et l'existence d'un réservoir animal pour les NoV. La caractérisation moléculaire des deux prototypes de NoV bovins, nommément le virus Newbury2 et le virus Jena, a révélé qu'ils étaient génétiquement proches et associés aux NoV humains. Parmi les hypothèses évoquées, les animaux pourraient être soit des porteurs passifs de NoV, soit infectés de manière active par ces virus, responsables dès lors d'une zoonose. Caractériser les NoV circulant chez lhomme et les espèces animales est intéressant dans le but détudier leurs voies de transmission et léventuel passage inter-espèce de ces virus. Un mécanisme important d'évolution des NoV est la recombinaison, dun grand intérêt dans létude des NoV, générant des modifications du génome viral aboutissant à la création dun génome « chimère » à partir de deux génomes parentaux différents. Elle crée ainsi de la variation génétique et par là lémergence de nouveaux virus. En effet, il est bien documenté que la recombinaison se produit souvent parmi les NoV et contribue à la diversité génétique de ces virus ainsi quà lapparition de nouvelles épidémies. La prévalence des souches de NoV recombinants peut être sous-estimée par le fait que la caractérisation des NoV est habituellement basée sur le séquençage partiel du gène de lARN polymérase-ARN dépendante uniquement, alors quidéalement il faudrait séquencer différentes parties du génome, principalement lARN polymérase-ARN dépendante et la protéine de capside, pour identifier de tels virus. Il est important de déterminer précisément l'implication exacte de la recombinaison sur lévolution des NoV afin de comprendre les mécanismes dévolution des souches et l'avantage sélectif conféré pour certaines dentre elles. Etudier ce mécanisme permettra de mieux comprendre lavantage sélectif observé pour certains NoV et aidera à élucider les voies de transmission des NoV. Létude de ces deux points (transmission zoonotique et virus recombinants) est primordiale. En effet, le franchissement de la barrière despèce affecterait à la fois l'épidémiologie et l'évolution de ces virus, et compliqueraient également la capacité au développement dun vaccin ou dun traitement. Dans d'autres espèces animales, comme les chevaux ou les oiseaux, aucun NoV na été détecté à ce jour mais ces dernières années, des NoV ont été décrits dans de nombreuses espèces animales (chien, lion, mouton). Cela laisse donc présager dune gamme despèce cible encore plus étendue. Ce travail sinscrit dans le cadre de létude des voies de transmission des NoV avec comme objectif, après la mise au point de méthodes rapides et sensibles de détection et de quantification, dapporter un éclaircissement aux questions importantes relatives à lévolution des NoV et à leur catégorie dhôte. Dans un premier temps, la RT-PCR conventionnelle a été utilisée afin de détecter les NoV dans les espèces humaine et bovine. Ensuite, une RT-PCR utilisant la technologie SYBR Green a été développée et utilise un contrôle interne constitué dARN ajouté au même tube. Ce test est capable de détecter des NoV humains et bovins appartenant aux génogroupes I, II et III et permet de faire la distinction entre les NoV et le contrôle interne par lanalyse des courbes de dissociation. Une dilution 10 fois des échantillons sest révélée la méthode de choix pour lever les inhibitions. Afin de pouvoir confirmer directement le résultat et de permettre la quantification des NoV, une RT-PCR en temps réel utilisant la technologie TaqMan a été développée. Elle utilise un contrôle interne dARN et un standard dARN. De façon très intéressante, cette méthode peut détecter les NoV humains appartenant au génogroupes I, II et bovins du génogroupe III. Les inhibitions furent efficacement levées par une dilution 10 fois de léchantillon ou lajout de sérum albumine bovine au mix de RT-PCR. Ces deux RT-PCR en temps réel ont montré une sensibilité supérieure comparée à la RT-PCR conventionnelle. Avec pour objectif de comprendre les voies de transmission des NoV, la situation en Belgique a été investiguée et des NoV humains et bovins ont été détectés et analysés par séquençage partiel. Des NoV appartenant à différents génogroupes ont été détectés : GI et GII chez lhomme et GIII chez les bovins. Par analyse de la proximité génétique, les NoV bovins se sont révélés de génotype GIII.2 et les NoV humains de différents génotypes, mais majoritairement de génotype GII.4. Ces analyses ont permis également lidentification dune co-infection et de deux recombinants naturels, ces derniers étant proches de génotypes différents en fonction de la région du génome analysée (polymérase ou capside). L'identification de zones privilégiées pour la recombinaison dans la région située à la jonction de l'ORF (open reading frame) 1 et de lORF2 confirme l'importance de cette région dans ce phénomène. Afin détudier lévolution des NoV bovins, un NoV bovin détecté en Belgique fut séquencé complètement (Bo/B309/2003/BE) et comparé à la souche originale Newbury2 (isolée dans les années 80). Dune part, cette études a permis daboutir à la mise au point et la validation doutils permettant la détection et létude les NoV humains et animaux, tant pour leur pathogénie, que leur évolution ou leurs voies de transmission. Dautre part, basée sur le panel déchantillons recueillis durant cette étude, lanalyse phylogénétique des NoV détectés va dans le sens des études réalisées dans dautres pays tendant à montrer que les NoV bovins constituent un groupe de virus distincts, différents des NoV humains. Cela suggère que les NoV bovins ne représentent pas un risque pour la santé humaine. Néanmoins, la possibilité dune infection zoonotique ou dun réservoir animal ne peut pas être exclue vu la proximité de séquence entre les NoV humains et animaux et aussi la relation étroite et proche entre les populations humaines et les élevages danimaux. La détection dune co-infection et de deux recombinants naturels démontre les possibilités dévolution des NoV et limportance dune analyse complète de leur génome pour leur caractérisation. Ce travail a été pionnier dans létude des NoV au laboratoire et a ouvert la voie à dautres sujets de recherche sur les NoV et à de nouvelles thèses de doctorat, notamment sur létude de linteraction NoV-hôte (NoV dans lespèce bovine) et létude de la recombinaison des NoV in vitro (NoV murins).

Orientadora: Fabiana Pilarski / Coorientadora: Márcia Mayumi Ishikawa / Banca: Ricardo Massato Takemoto / Banca: Luiz Augusto do Amaral / Resumo: Neste trabalho foi registrada a primeira ocorrência de infecção por Citrobacter freundii, Lactococcus lactis subsp. lactis e Enterococcus faecalis associadas a surtos de doenças em bagres Sul Americanos. Além do isolamento das bactérias, também foi realizada a caracterização bioquímica e o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos dos isolados. Para o isolamento, foram utilizados bagres provenientes de surtos em diferentes fazendas-berçário no Estado do Mato Grosso do Sul e também de criações em laboratório. Os peixes com sinais clínicos de bacteriose foram submetidos à necropsia e biópsia de rim e encéfalo para isolamento bacteriano em meios de cultura apropriados. Os isolados obtidos foram submetidos à coloração de Gram, teste da oxidase, catalase, produção de hemólise e identificação presuntiva através de kits comerciais API 20E ou API 20 Strep. A análise de susceptibilidade a 15 antimicrobianos foi realizada pelo método da difusão em disco com o Agar Muller Hinton. Foram obtidos dois isolados de C. freundii proveniente de cachara, que apresentaram multiresistência a 66,7 % dos antimicrobianos testados. Nos ensaios de infecção experimental, a doença foi reproduzida com sucesso, caracterizada como septicemia hemorrágica, com enterite acentuada e com reisolamento de C. freundii dos tecidos acometidos. Outros 57 isolados obtidos do rim e do encéfalo da cachara foram caracterizadas como cocos gram positivos associadas a meningoencefalite, identificadas como Lactococcus lactis subsp. lactis e Enterococcus faecalis. Todos os isolados apresentaram multiresistência aos antimicrobianos testados. A bactéria L. lactis subsp. lactis foi sensível somente a ampicilina e penicilina. Todas nossos isolados de E. faecalis foram sensíveis a sulfazotrim e a amoxilina e ao ácido clavulânico / Abstract: The first occurrence of infection by Citrobacter freundii, Lactococcus lactis subsp. lactis and Enterococcus faecalis associated with outbreaks of diseases in South American catfish was recorded in this study. The isolates were biochemically characterized and the profile antimicrobial susceptibility performed. For isolation, fingerlings of catfish from sequential outbreaks at different farms nursery in the state of Mato Grosso do Sul and also creations in the laboratory were used. Fingerlings with clinical signs of bacterial infection were necropsied and biopsy of the kidney and brain obtained for bacterial isolation in appropriate culture media. The isolates were subjected to Gram staining, oxidase and catalase test, hemolysis production and presumptive identification using commercial kits API 20E and API 20 Strep. The analysis of susceptibility to 15 antimicrobials was performed by the disc diffusion method with the Muller Hinton Agar. Were obtained two isolates of C. freundii from cachara, which showed multiresistance to 66.7% of the antimicrobials tested. In experimental challenge, the disease was successfully reproduced, characterized as hemorrhagic septicemia, with severe enteritis, and reisolation of C. freundii from infected tissue was obtained. Another 57 isolates obtained from kidney and brain of catfish were characterized as gram-positive cocci associated with meningoencephalitis, identified as Lactococcus lactis subsp. lactis and Enterococcus faecalis. All isolates showed multidrug resistance to antimicrobials. The bacteria L. lactis subsp. lactis was only sensitive to ampicillin and penicillin. All our isolates of E. faecalis were sensitive to sulfazotrim and amoxilin and to clavulanic acid / Mestre

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, 2008. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2009-09-22T16:29:12Z No. of bitstreams: 1 2008_MarciaSAAndreasi.pdf: 741748 bytes, checksum: e4f79a5ac97936b0473612f6dec5189d (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-10-05T14:41:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_MarciaSAAndreasi.pdf: 741748 bytes, checksum: e4f79a5ac97936b0473612f6dec5189d (MD5) / Made available in DSpace on 2009-10-05T14:41:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_MarciaSAAndreasi.pdf: 741748 bytes, checksum: e4f79a5ac97936b0473612f6dec5189d (MD5) Previous issue date: 2008 / Os vírus entéricos ocupam papel de destaque na etiologia das gastroenterites virais como importante causa das diarréias infantis no mundo. Uma ampla diversidade de agentes etiológicos virais tem implicações na epidemiologia das diarréias agudas. A detecção dos vírus entéricos em idosos tem sido valorizada em função da possibilidade de epidemias, bem como da preocupação da saúde pública com a qualidade de vida dessa população, uma vez que os avanços tecnológicos têm contribuído para elevar a expectativa de vida. O papel dos vírus entéricos nas gastroenterites infantis agudas no Brasil está bem estabelecido através de diferentes estudos, entretanto poucos dados estão disponíveis sobre a ocorrência desses vírus na população de adultos. Visando contribuir para essa questão, este estudo definiu a etiologia da gastroenterite viral em crianças hospitalizadas e idosos institucionalizados na cidade de Campo-Grande, MS. A detecção de astrovírus e calicivírus foi realizada pela metodologia da reação em cadeia pela polimerase (PCR) e a detecção de adenovírus e rotavírus pelo ensaio imunoenzimático combinado para rotavírus e adenovírus (EIERA). A amostra do estudo constitui-se de fezes de crianças com até 3 anos de idade internadas na Santa Casa e no Hospital Universitário de Campo-Grande/MS, bem como de fezes de idosos institucionalizados no asilo São João Bosco. Nas crianças estudadas, foi observada ocorrência de 3,1% para astrovírus, 7,6% para calicivírus e 3,6% para adenovírus. Das 115 amostras estudadas dos idosos institucionalizados, 13 (11,3%) foram positivas para os vírus pesquisados. Não ocorreu detecção de Rotavírus do grupo A, e o percentual observado para astrovírus, calicivírus, adenovírus foi de 0,8%, 8,7% e 1,7%, respectivamente. Os dados obtidos neste estudo reforçam a importância de constante monitoramento das infecções entéricas na população infantil, bem como também evidenciam a circulação desses agentes virais na população de idosos institucionalizados em Campo Grande, MS. Tais comprovações constituem importante instrumento para avaliação dos resultados obtidos com a vacina para Rotavírus A, presente desde 2006 no Calendário Nacional de Imunização. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Enteric viruses play a major role in the etiology of viral gastroenteritis as an important cause of infantile diarrhea in the world. A wide range of etiological agents has implications in the epidemiology of acute diarrheas. The detection of enteric viruses among the elderly has been enhanced due to the possibility of outbreaks, and also because of the Public Health concern about the quality of life of this population, as technological progress has contributed to an increase in life expectancy. The role of enteric viruses in acute infantile gastroenteritis in Brazil has been well defined through different studies. However, few data about the occurrence of these viruses in the adult population are available. In order to contribute to this issue, this study defined the etiology of viral gastroenteritis in hospitalized children and institutionalized elderly in Campo Grande/MS. Astrovirus and calicivirus have been detected by Polymerase Chain Reaction (PCR) and adenovirus and rotavirus by a combined enzyme immunoassay for rotavirus and adenovirus (EIARA). This study comprised the analyses of stool samples of children under 3 years of age admitted to Santa Casa and University Hospital in Campo Grande/MS, and elderly people institutionalized at Asilo São João Bosco. Among the children, astrovirus (3,1%), calicivirus (7,6%) and adenovirus (3,6%) have been observed. Among the 115 elderly people samples, 13 (11,3%) were positive for the viruses at issue. Group A rotavirus was undetected in the elderly population and astrovirus, calicivirus and adenovirus accounted for 0,8%, 1,7% and 8,7%, respectively. The results of this study reinforce the importance of a constant surveillance of enteric infections in child population and also show the circulation of these viral agents among the elderly population institutionalized in Campo Grande, MS. Such findings constitute an important tool to evaluate the results of the vaccine against Rotavirus A, used since 2006 in the National Immunization Program (Calendário Nacional de Imunização) in Brazil.

Made available in DSpace on 2015-11-11T12:09:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 mariela_gomez_ioc_dout_2014.pdf: 8571554 bytes, checksum: 662bf4d26fe89925ff0e648a52a7d4e6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-06-10 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os Rotavírus da espécie A (RVA) são os principais agentes etiológicos causadores de gastroenterite aguda (GA) em crianças \22645 anos. Após a introdução, em março de 2006, da vacina monovalente G1P[8] (Rotarix® - RV1) no Programa Nacional de Imunizações (PNI) pelo Ministério da Saúde (MS) do Brasil, observou-se uma mudança na epidemiologia dos genótipos de RVA circulantes na população. Apesar desta variação dos genótipos circulantes, observou-se no Brasil uma redução de 22-28% de mortes e de 21-25% de hospitalizações em crianças \02C22 anos de idade, particularmente nas regiões Norte e Nordeste. Provavelmente a variação dos genótipos de RVA, tanto no tempo quando nas regiões geográficas, esteja relacionada a diversos fatores. O fato da vacina RV1 apresentar uma constelação genética (11 genes) Wa-like pode estar influenciando na eficácia da mesma frente aos RVA que apresentem constelações diferentes, como vírus DS-1-like e AU-1-like. Neste estudo foi analisada a diversidade genética de RVA de diversos genótipos detectados no Brasil antes e após a introdução da vacina RV1 pelo PNI, tanto em crianças vacinadas quanto não vacinadas, com o intuito de: i) identificar e caracterizar variantes de RVA emergentes e reemergentes; ii) contribuir para um melhor entendimento da dinâmica evolutiva deste vírus; iii) identificar mutações pontuais e genes que foram introduzidos mediante reestruturação genética, que eventualmente posam estar vinculados ao fato de RVA causarem GA inclusive em crianças vacinadas Deve-se ressaltar que este estudo engloba amostras de diferentes regiões geográficas do Brasil, visto que dados epidemiológicos sugerem diversidades genotípicas regionais. Todas as cepas G2P[4] para as quais foram analisados os 11 segmentos gênicos apresentaram uma constelação gênica DS-1-like: I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2, apesar de que diversas variantes virais circularam no período estudado. Não foram observadas diferenças nos sítios antigênicos das proteínas VP8* e VP7 entre crianças vacinadas e não vacinadas. As cepas G1P[6] analisadas apresentaram uma constelação gênica Wa-like: I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1. As cepas G12P[9] apresentaram uma constelação gênica AU-1-like: I3-R3-C3-M3-A3-N3-T3-E3-H6, enquanto as cepas G12P[8] revelaram uma constelação gênica Wa-like: I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1. Além disso, a análise do viéis no uso de códons de RVA genótipo G2P[4] revelou que existe uma correlação entre o viéis no uso de códons e a composição de bases, o que sugere que a pressão mutacional é um fator importante na determinação do viéis no uso de códons em RVA humanos / Specie A rotaviruses (RVA) are the main etiological agents of acute gastroenteritis (AG) in children ≤ 5 years old. After the introduction of monovalent vaccine G1P[8] (Rotarix® - RV1) in the National Immunization Program (NIP) in March 2006, a change in the epidemiology of RVA circulating genotypes in the population was observed in Brazil. Despite this variation, a reduction of 22-28% of deaths and 21-25% of hospital admissions in children ˂ 2 years of age, particularly in the North and Northeast regions, occurred after RV1 introduction. RVA genotypes variation along time and in the different geographical regions might be related to several factors. Since the RV1 vaccine has a Wa-like genetic constellation the effectiveness of this vaccine against RVA showing different genetic constellations, such as DS-1-like and AU-1-like viruses, it might be influenced. In this study we analyzed the genetic diversity of different RVA genotypes detected in Brazil, before and after the introduction of the RV1 vaccine by the NIP, in vaccinated and unvaccinated children in order to: i) identify and characterize RVA emerging and reemerging variants; ii) contribute to a better understanding of the evolutionary dynamics of this virus; iii) identify point mutations and genes that have been introduced by reassortment events and that could eventually be linked to the fact that some RVA are capable to cause AG in vaccinated children. It should be emphasized that this study includes different geographical regions of Brazil, as epidemiological data suggests regional genotypic diversity. All G2P[4] strains analyzed revealed a DS-1-like genome constellation: I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2. However, several viral variants circulated during the study period. No differences were observed inside antigenic sites of VP7 and VP8* proteins between vaccinated and unvaccinated children. The G1P[6] strains analyzed showed a Wa-like genome constellation: I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1. The G12P[9] strains showed a AU-1-like genome constellation: I3-R3-C3-A3-M3-N3-T3-E3-H6, while G12P[8] strains showed a Wa-like genome constellation: I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1. Furthermore, analysis of codon usage bias of RVA G2P[4] genotype revealed that a correlation between the codon usage bias and base composition exists, suggesting that the mutational pressure is the main factor in determining the codon usage bias in human RVA.

Made available in DSpace on 2016-05-02T13:06:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 carmen_vieira_ioc_dout_2015.pdf: 6531759 bytes, checksum: 8c78e754c64e162a1229bcecc9f3e83b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A disseminação de vírus entéricos em ambientes aquáticos está diretamente relacionada ao despejo in natura de esgotos e, consequentemente, associada a doenças de veiculação hídrica. Atualmente, os vírus vêm sendo sugeridos como marcadores espécie-específicos para rastreamento microbiológico de fonte de contaminação fecal (Microbial Source Tracking [MST]) destes ambientes, podendo ser utilizados em estratégias de monitoramento e gestão de bacias hidrográficas. Neste contexto, este estudo teve como objetivo rastrear fontes de contaminação fecal de origem humana e animal utilizando marcadores virais e determinar a concentração dos principais vírus associados a gastroenterite aguda na bacia hidrográfica do Rio Negro, Manaus, Amazonas (AM), a fim de estimar o risco de infecções por estes vírus por diferentes vias de exposição da população local. Com este propósito, avaliou-se a metodologia de concentração viral por floculação orgânica, além de ensaios quantitativos (qPCR) de detecção. Posteriormente, realizou-se um monitoramento trimestral (2011-2012) ao longo do Rio Negro e dos igarapés da cidade, quando 272 amostras foram coletadas, assim como uma amostragem adicional durante a cheia histórica deste rio (junho de 2012). Parâmetros físico-químicos e bacteriológicos (E. coli e enterococos) também foram determinados, sendo investigada uma possível correlação bactéria-vírus. Adenovírus humanos (HAdV) e poliomavírus JC (JCPyV), utilizados como marcadores de contaminação humana, foram detectados em 91,9 % e 69,5 % das amostras, respectivamente, revelando a origem humana de contaminação dos ecossistemas estudados Adenovírus suíno (PAdV) e poliomavírus bovino (BPyV) foram observados em baixos percentuais, 0,7 e 1,8 %, respectivamente. Rotavírus grupo A (RVA) e norovírus genogrupo II (NoV GII) foram detectados em 23,9 % e 7,4 % das amostras, respectivamente. O NoV GII foi detectado apenas na estação seca enquanto o RVA foi prevalente na cheia, quando suas concentrações apresentaram um aumento significativo. As concentrações dos vírus humanos variaram de 102 a 106 cópias de genoma (CG)/L, sendo observadas maiores contaminações de HAdV e JCPyV nos igarapés e no período de cheia, enquanto as concentrações dos vírus de origem animal variaram de 101 a 102 CG/L. Correlações de 0,274 a 0,762 foram observadas entre HAdV, JCPyV, E. coli e enterococos e apontaram a utilização de HAdV como possível marcador viral de contaminação fecal humana. Pelos resultados obtidos, realizou-se um estudo de avaliação de risco de infecções por RVA, onde estimou-se probabilidades médias de infecção variando de 0,3954 a 0,868 pela exposição por atividades recreacionais ou contato mão-boca com os ambientes aquáticos de Manaus Durante a cheia histórica do Rio Negro, demonstrou-se uma correlação entre o nível de água do rio e o número de casos de gastroenterite, assim como um aumento na concentração de RVA, NoV e HAdV. A investigação de astrovírus e vírus emergentes, como NoV GIV, sapovírus, bocavírus, aichivírus e klassevírus, foi realizada nestas amostras, porém não foram detectados. Globalmente, este estudo representa um grande avanço nos estudos de virologia ambiental no Brasil, sendo pioneiro nas análises de MST e risco virológico, que demonstraram a precariedade de saneamento básico na cidade de Manaus e os riscos de infecção viral associados a esta condição / The dissemination of enteric viruses in aquatic environments is directly related to the discharge of raw sewage and consequently associated with waterborne diseases. Currently, viruses have been suggested as host-specific markers for Microbial Source Tracking (MST) in these environments, and can be used in monitoring and management strategies of watersheds. In this context, this study aimed to assess human and animal sources of contamination by viral markers and the concentrations of the main gastroenteric viruses in the Negro River catchment, Manaus, Amazonas (AM), in order to estimate the risk of infection associated with the use of these waters by the locals. For this purpose, a concentration procedure by organic flocculation and quantitative assays (qPCR) for viruses detection were evaluated. Later, a quarterly monitoring (2011-2012) along the Negro River and the igarapés of the city was carried out, when 272 surface water samples were collected, as well as an additional sampling during the extreme flood of this river (June 2012). Physico-chemical and bacteriological (E. coli and enterococci) parameters were also measured, being investigated the correlation between viruses and bacteria. Human adenovirus (HAdV) and JC polyomavirus (JCPyV) were used as viral markers of human contamination, being detected in 91.9 % and 69.5 % of the samples, respectively, showing the contamination of human origin in the study ecosystems. Porcine adenovirus (PAdV) and bovine polyomavirus (BPyV) were detected in low percentages, 0.7 and 1.8 %, respectively. Group A rotavirus (RVA) and genogroup II norovirus (NoV GII) were detected in 23.9% and 7.4% of the samples, respectively. NoV GII was detected only in the dry season whereas RVA was prevalent in the flood season, when its concentration showed a significant increase. Concentrations of human viruses ranged from 102 to 106 genome copies (GC)/L, being higher contaminations with HAdV and JCPyV observed in the igarapés and during the flood season, whereas concentrations of animal viruses ranged from 101 to 102 GC/L. Correlations between HAdV, JCPyV, E. coli and enterococci ranged from 0.274 to 0.762 and suggested the use of HAdV as a possible viral marker of human fecal contamination. Based on the obtained results, a risk assessment study of RVA infection due to recreational and hand-to-mouth contacts with these contaminated waters was carried out and the estimated mean probabilities of infection ranged from 0.3954 to 0.868. During the extreme flood of the Negro River, a correlation between the river level and number of gastroenteritis cases was demonstrated, as well as an increase in the concentration of RVA, NoV and HAdV. Astrovirus and emerging viruses such as NoV GIV, sapovirus, bocavirus, aichivirus, and klassevirus were also investigated in these samples, but were not detected. The overall results of this thesis represent major advances in environmental virology in Brazil, since it is pioneer in both MST and virological risk assessment studies, which demonstrated the precariousness of basic sanitation in the city of Manaus and risks associated with this condition / 2017-07-26

Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-03-27T20:34:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Keyla Fonseca da Cunha.pdf: 1856967 bytes, checksum: 6b6cfc6d1a359bd14e7736905e4b5ac4 (MD5) / Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-04-09T19:12:19Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Keyla Fonseca da Cunha.pdf: 1856967 bytes, checksum: 6b6cfc6d1a359bd14e7736905e4b5ac4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-09T19:12:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Keyla Fonseca da Cunha.pdf: 1856967 bytes, checksum: 6b6cfc6d1a359bd14e7736905e4b5ac4 (MD5) Previous issue date: 2013-08 / A diarreia é a segunda causa de mortalidade em <5 anos e é responsável pela diminuição da produtividade na população economicamente ativa. Dentre os agentes infecciosos envolvidos, seis patotipos diarreiogênicos de Escherichia coli (DEC) merecem destaque: E. coli enteropatogênica (EPEC), E.coli enteroinvasora (EIEC), E. coli enterotoxigênica (ETEC), E. coli enteroemorrágica ou produtora de toxina de Shiga (EHEC/STEC), E. coli enteroagregativa (EAEC) e E. coli de aderência difusa (DAEC). O objetivo deste estudo foi determinar a frequência dos patotipos de DEC e caracterizar fenotípica e genotipicamente EAEC, DAEC, aEPEC e E. coli chain-like adhesion (CLA) isolados de fezes indivíduos de todas as idades atendidos nas Unidades de Saúde do município de Vitória, ES, entre janeiro de 2008 e junho de 2011. Os isolados de E. coli foram submetidos à: (i) PCR para detecção dos genes eae, bfpA, aat, lt, st, ipaH, stx1 e stx2; (ii) hibridização de colônia com as sondas eae, aat e daaC; (iii) adesão em cultura de células HEp-2 para evidenciar padrão de aderência agregativa (AA), difusa (DA) e chain-like adhesion (CLA). PCR para detecção de genes de virulência foi realizado em isolados de EAEC, CLA, DAEC e aEPEC. Isolados de EAEC e CLA, foram submetidos a testes de formação de biofilme e de película. Foram obtidos 328 espécimes fecais e E. coli foi isolada de 85,7%. Os seguintes patotipos foram identificados: EAEC (18,3%), DAEC (11%), aEPEC (2,6%), ETEC (0,7%). CLA foi identificada em 4,9% e EIEC, tEPEC e STEC não foram detectados. Dos 60 isolados de EAEC (AA) (25% aat+ por PCR e 35% por hibridização), fímbrias de aderência agregativa foram evidenciadas em baixa frequência (aggA- 1,7%, aafA- 0%, agg3A- 11,7%, hdA- 8,3%). EAEC típica correspondeu a 31,7% dos isolados de EAEC (aggR+), e foram significantes nestas a formação de biofilme, escore 3+ de produção de película e presença dos genes aat, agg3A, hdA, aap, sat, pet, set1A e iucA. Todos os isolados CLA apresentaram o gene pet, 87,5%, foram aggR-, formaram película e nenhum produziu biofilme. Dentre dos 42 isolados de DAEC (DA), a sonda daaC detectou 52,4%. PCR evidenciou adesinas afa/Dr (daaD e afa) em 59,5% e adesina AIDA-I não foi encontrada, sugerindo que outras adesinas estejam envolvidas na adesão da DAEC. Isolados de DAEC afa/Dr + foram estatisticamente mais isolados de <5 anos. Em aEPEC, os genes da ilha de patogenicidade OI-122 pesquisados, nleE, efa1/lifA e paa foram evidenciados em 30% dos isolados, todos provenientes de <5 anos. Características de virulência de tEAEC e DAEC Afa/Dr sugerem que sejam subpopulações relacionadas com diarreia. CLA não parece ser variante de EAEC. / Diarrhea is the second leading cause of mortality in <5 years and is responsible for decreased productivity in the economically active population. Among the infectious agents involved six diarrheagenics pathotypes of Escherichia coli (DEC) are worth mentioning: enteropathogenic E. coli (EPEC), enteroinvasive E. coli (EIEC), enterotoxigenic E. coli (ETEC), enterohemorragic E. coli or Shiga toxin-producing (EHEC/STEC), enteroaggregative E. coli (EAEC) and diffuselly adherent E. coli (DAEC). The aim of this study was to determine the frequency of DEC and to characterize phenotypic and genotypically EAEC, DAEC, aEPEC and chain-like adhesion E. coli (CLA) isolated from feces of all ages individuals treated at health units in the city of Vitória, between January 2008 and June 2011. E. coli were subjected to: (i) PCR for detection of eaeA, bfpA, aat, lt, st, ipaH, stx1 and stx2 genes; (ii) colony hybridization with eae, aat and daac probes; (iii) HEp-2 cells culture to show aggregative adherence (AA), diffuse (DA) and chain-like adhesion (CLA). PCR for detection of virulence genes was carried out in EAEC, CLA, DAEC and aEPEC. CLA and EAEC isolates were tested for biofilm formation and clump test. Fecal specimens (n=328) were obtained and E. coli was isolated from 85.7%. The following pathotypes were identified: EAEC (18.3%), DAEC (11%), aEPEC (2.6%), ETEC (0.7%). CLA was identified in 4.9% and EIEC, STEC and tEPEC were not detected. Out of the 60 isolates of EAEC (AA) (25% aat+ by PCR and 35% by hybridization) the aggregative adherence fimbriae were observed at low frequency (aggA-1.7%, aafA-0%, agg3A-11.7%, hda-8.3%). Typical EAEC were 31.7% of the EAEC isolates (aggR+), and among these, biofilm formation, score 3+ in clump test and the presence of aat, agg3A, hda, aap, sat, pet, iucA and set1A were significant. CLA isolates (87.5%) possessed the pet gene, all were aggR- and were clump test+, and no one was biofilm forming. Among the 42 isolates of DAEC (DA), the probe detected DAAC 52.4%. PCR showed adhesin afa/Dr (daad+/afa+) in 59.5% and AIDA-I adhesin was not found, suggesting that other adhesins are involved in DAEC adhesion. afa/Dr DAEC isolates were significant among <5 years. In aEPEC, the genes of pathogenicity island OI-122 (nleE, efa1/lifA and paa) and were seen in 30% all from <5 years. Virulence characteristics of tEAEC and DAEC Afa/Dr suggest that subpopulations are related diarrhea. CLA does not appear to be a EAEC variant.

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-01-16Bitstream added on 2015-04-09T12:47:50Z : No. of bitstreams: 1 000815198.pdf: 1152828 bytes, checksum: bf552d4b2ff531afe935d24b0d37090d (MD5) / A sepse é uma síndrome de caráter multifatorial e com consequências graves para sobrevida e para os custos de tratamento em cães. Neste contexto a gastroenterite é um representante importante desta síndrome inflamatória de associação infecciosa no campo das urgências veterinárias. Este estudo unicêntrico, prospectivo e de coorte apresentou como objetivo fundamental identificar as variáveis prognósticas associadas com a sobrevivência a curto e médio prazo de 56 cães com gastroenterite, atendidos como urgências e hospitalizados para cuidados intensivos. Foram coletados dados fisiológicos e laboratoriais no momento da admissão de urgência dos pacientes (T0) e 24 horas depois (T24). Desta forma, foram encontradas as relações destes parâmetros com a sobrevivência ou a mortalidade em 24 horas, e aos 7, 30 e 60 dias pós ingresso. Com os resultados obtidos, foram criadas árvores de decisão empregadas na estratificação, previsão e identificação de todas as interações possíveis. A gravidade do quadro clínico, laboratorial e dos antecedentes históricos prediz a mortalidade de pacientes caninos com gastroenterite; e os doentes diagnosticados com parvovirose ou gastroenterite hemorrágica, classificados em sepse grave ou em choque séptico, possuem maior mortalidade tanto às 24 horas quanto aos 7, 30 e 60 dias após atendimento. A queda do potencial de transporte de oxigênio, do potencial oncótico e a alteração metabólica em nível celular foram determinantes no prognóstico dos pacientes, representados respectivamente pelo alto poder prognóstico das variações em 24 horas do hematócrito, das proteínas totais e do lactato sérico, bem como a presença de vasoconstrição periférica grave 24 horas após o início do tratamento, demonstrada pelo maior escore de vasoconstrição. Deste modo, pretendeu-se com este estudo, possibilitar o conhecimento aos Médicos Veterinários de ... / Sepsis is a multifactorial syndrome with serious consequences for survival and costs of treatment in dogs. In this context gastroenteritis is an important representative of this inflammatory syndrome infectious association in the veterinary emergencies area. This single-center, prospective cohort study presented as a fundamental objective to identify the prognostic variables associated with survival in the short and medium term of 56 dogs with gastroenteritis treated in emergency and critical care hospital. Physiological and laboratory datas were collected on admission of emergency patients ( T0 ) and 24 hours later ( T24 ). Thus, the relationship between these parameters and the survival or mortality in 24 hours, and at 7, 30 and 60 days after admission were found. With the results, decision trees used in the stratification, prediction and identification of all possible interactions were created. The severity of the clinical, laboratory findings and historical background predicts mortality in canine patients with gastroenteritis , and patients diagnosed with parvovirus or hemorrhagic gastroenteritis, ranked in severe sepsis or septic shock, have higher mortality both at 24 hours as at 7, 30 and 60 days after treatment. The fall of potential oxygen transport, the oncotic potential and metabolic changes at the cellular level were determining the prognosis of patients, respectively represented by the high prognostic power of variations within 24 hours of hematocrit, total protein and lactate as well as presence of severe peripheral vasoconstriction 24 hours after initiation of treatment, as demonstrated by scores greater vasoconstriction. Thus, it is intended with this study, getting familiar to veterinarians to predict survival in dogs with gastroenteritis based on simple parameters, low cost and easy implementation

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-06-28Bitstream added on 2014-06-13T19:07:01Z : No. of bitstreams: 1 000748629.pdf: 1457578 bytes, checksum: c75b51fdc7faf4a8fe4a16a30730afe6 (MD5) / Neste trabalho foi registrada a primeira ocorrência de infecção por Citrobacter freundii, Lactococcus lactis subsp. lactis e Enterococcus faecalis associadas a surtos de doenças em bagres Sul Americanos. Além do isolamento das bactérias, também foi realizada a caracterização bioquímica e o perfil de susceptibilidade a antimicrobianos dos isolados. Para o isolamento, foram utilizados bagres provenientes de surtos em diferentes fazendas-berçário no Estado do Mato Grosso do Sul e também de criações em laboratório. Os peixes com sinais clínicos de bacteriose foram submetidos à necropsia e biópsia de rim e encéfalo para isolamento bacteriano em meios de cultura apropriados. Os isolados obtidos foram submetidos à coloração de Gram, teste da oxidase, catalase, produção de hemólise e identificação presuntiva através de kits comerciais API 20E ou API 20 Strep. A análise de susceptibilidade a 15 antimicrobianos foi realizada pelo método da difusão em disco com o Agar Muller Hinton. Foram obtidos dois isolados de C. freundii proveniente de cachara, que apresentaram multiresistência a 66,7 % dos antimicrobianos testados. Nos ensaios de infecção experimental, a doença foi reproduzida com sucesso, caracterizada como septicemia hemorrágica, com enterite acentuada e com reisolamento de C. freundii dos tecidos acometidos. Outros 57 isolados obtidos do rim e do encéfalo da cachara foram caracterizadas como cocos gram positivos associadas a meningoencefalite, identificadas como Lactococcus lactis subsp. lactis e Enterococcus faecalis. Todos os isolados apresentaram multiresistência aos antimicrobianos testados. A bactéria L. lactis subsp. lactis foi sensível somente a ampicilina e penicilina. Todas nossos isolados de E. faecalis foram sensíveis a sulfazotrim e a amoxilina e ao ácido clavulânico / The first occurrence of infection by Citrobacter freundii, Lactococcus lactis subsp. lactis and Enterococcus faecalis associated with outbreaks of diseases in South American catfish was recorded in this study. The isolates were biochemically characterized and the profile antimicrobial susceptibility performed. For isolation, fingerlings of catfish from sequential outbreaks at different farms nursery in the state of Mato Grosso do Sul and also creations in the laboratory were used. Fingerlings with clinical signs of bacterial infection were necropsied and biopsy of the kidney and brain obtained for bacterial isolation in appropriate culture media. The isolates were subjected to Gram staining, oxidase and catalase test, hemolysis production and presumptive identification using commercial kits API 20E and API 20 Strep. The analysis of susceptibility to 15 antimicrobials was performed by the disc diffusion method with the Muller Hinton Agar. Were obtained two isolates of C. freundii from cachara, which showed multiresistance to 66.7% of the antimicrobials tested. In experimental challenge, the disease was successfully reproduced, characterized as hemorrhagic septicemia, with severe enteritis, and reisolation of C. freundii from infected tissue was obtained. Another 57 isolates obtained from kidney and brain of catfish were characterized as gram-positive cocci associated with meningoencephalitis, identified as Lactococcus lactis subsp. lactis and Enterococcus faecalis. All isolates showed multidrug resistance to antimicrobials. The bacteria L. lactis subsp. lactis was only sensitive to ampicillin and penicillin. All our isolates of E. faecalis were sensitive to sulfazotrim and amoxilin and to clavulanic acid