Resumo: Este projeto tem como objetivo descrever, implementar e avaliar um modelo de Unit Commitment (UC) hidrotérmico para o ambiente de mercados de energia. O modelo deve considerar aspectos que têm sido negligenciados na abordagem atualmente vigente no Brasil, ou seja, o modelo deve apresentar as seguintes contribuições: i) a discretização do problema deve ser feita em base horária e não semanal, de modo a permitir o estabelecimento de um mercado de curtíssimo prazo efetivo; ii) o modelo deve levar em conta os custos de partida/parada de máquinas, comparando a solução do modelo proposta com o modelo em que essses custos não são considerados; iii) as inter-relações entre os mercados pool e bilateral são descritas de forma explícita em um único problema de otimização de UC; iv) a inserção dos custos de oportunidade hidráulica propostos no âmbito desse trabalho na função de custos / Abstract: This project aims to describe, implement and evaluate a model of Unit Commitment (UC) for the hydrothermal environment of energy markets. The model takes into account aspects that have been neglected in the approach currently used in Brazil, and present the following contributions: i) discretization of the problem is performed in an hourly basis, instead of the weekly-based approach currently used, to allow the establishment of an effective market for short term generation planning; ii) the model takes into account unit start-up and shut down costs; the outcomes of the proposed model are compared with those of a model in which these costs are not considered; iii) the interrelationships between pool and bilateral markets are described explicity within a single optimization problem in the proposed UC model; iv) the inclusion of opportunity costs associated with hydraulic utility, proposed in the context of this research / Orientador: Leonardo Nepomuceno / Coorientador: Paulo Sérgio da Silva / Banca: Eduardo Nobuhiro Asada / Banca: Antonio Roberto Balbo / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-22Bitstream added on 2014-06-13T18:31:09Z : No. of bitstreams: 1 teixeira_lbc_me_botfmvz.pdf: 3120181 bytes, checksum: 3181d271a5e87cedca9b186e0f737df8 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As hepatites crônicas são comumente encontradas em muitas raças de cães na prática veterinária e independentemente da causa evoluem para um quadro de fibrose e conseqüentemente cirrose. Nos homens os quadros de hepatites crônicas e cirrose podem evoluir para lesões displásicas e conseqüentemente neoplásicas. Esta evolução do processo, como ocorre nos homens, não é bem definida nos cães. Alguns autores acreditam que possa ocorrer uma progressão das hepatites crônicas caninas para carcinomas hepatocelulares. Marcadores imunoistoquímicos são utilizados com o objetivo de avaliar o potencial pré-neoplásico das hepatites crônicas caninas. No presente trabalho, os marcadores imunoistoquímicos PCNA, caspase-3 e p53 foram utilizados com vistas a nos fornecer informações sobre a proliferação e apoptose dos hepatócitos e possíveis alterações genéticas que induzam a carcinogênese hepática. Os resultados obtidos mostram que as hepatites crônicas nos cães expressam estes marcadores em maior quantidade que o tecido hepático normal e de maneira mais próxima às lesões hepáticas neoplásicas o que permite afirmar que estas lesões têm potencial de sofrer alterações neoplásicas. / Chronic hepatitis is usually found in several breeds of dogs in veterinary practice, and independently of the cause it progress to a stage of fibrosis and consequently cirrhosis. In men chronic hepatitis and cirrhosis may progress to dysplasic and neoplasic lesions. The evolution of this process, as occurs in men is not well established in dogs. Some authors believe that the progression of chronic canine hepatitis for hepatocellular carcinomas can occur. Some immunohistochemical markers can be used to assess the pre-malignant potential of the canine chronic hepatitis. In this study, the immunohistochemical markers PCNA, caspase-3 and p53 were used to give information about the proliferation and apoptosis index of the hepatocytes and the possible genetic alterations that can lead the hepatic carcinogenesis. Results show that the expression of these markers are higher in chronic canine hepatitis than in normal hepatic tissue and closer to the expression in the hepatocellular carcinomas, which allows us to confirm that these lesions have the potential of undergoing neoplasic alterations.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-11-30Bitstream added on 2014-06-13T20:35:35Z : No. of bitstreams: 1 salerno_t_me_botfmvz.pdf: 1170640 bytes, checksum: 4141fa14cadaa626e1808eaa0c9abaae (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Nos últimos anos, Prototheca zopfii tem sido considerada uma das causas mais importantes de mastite de origem ambiental, refratária a terapia convencional. As infecções mamárias por P. zopfii acarretam alterações na composição do leite e redução na produção leiteira. O presente estudo avaliou a sensibilidade “in vitro” de 27 linhagens de P. zopfii isoladas do leite de vacas no Brasil frente a diferentes antimicrobianos e anti-sépticos, aliado a caracterização genotípica dos isolados. Nistatina (100,0%) e gentamicina (66,7%) foram as drogas mais efetivas para as 27 linhagens estudadas. A multi-resistência a três ou mais antimicrobianos foi observada em 100,0% das estirpes, principalmente frente a ampicilina, cefoperazona, cloxacilina, enrofloxacina, florfenicol, neomicina e tetraciclina. Hipoclorito de sódio (0,03-0,15%) e iodo (0,15-0,62%) revelaram efetividade “in vitro” para todos os isolados em baixas concentrações. A caracterização genotípica pela técnica de PCR baseada no fragmento 18S rDNA mostrou similaridade à cepa controle de P. zopfii SAG 2021T, caracterizando todos os isolados como pertencentes ao genótipo 2. O presente estudo descreve pela primeira vez no Brasil, a caracterização genotípica de linhagens de P. zopfii isoladas de leite obtido de vacas com mastite clínica, subclínica e de tanque de expansão. / In last years, Prototheca zopfii has been considered one of the most important causes of mastitis from environmental origin, refractory to conventional therapy. The mammary infections caused by Prototheca zopfii lead to severe alterations in composition of the milk, and reduction in production. The present study evaluate the in vitro antimicrobials and anti-septic susceptibility, of 27 P. zopfii strains isolated from milk in cattle raised in Brazil, allied to the genotypic characterization of isolates. Nystatin (100.0%) and gentamicin (66.7%) were the most-effective drugs for 27 P. zopfii strains. Multiple drug resistance for three or more antimicrobials was observed in 100.0% of strains predominantly for ampicilin, cefoperazone, cloxacillin, enrofloxacin, florfenicol, neomycin e tetracycline. Sodium hypochlorite (0.03-0.15%) and iodine (0.15-0.62%) revealed “in vitro” efficacy in all isolates in low concentrations. The genotypic characterization using PCR technique based on the 18S rDNA displayed similarity to the strain-control of P. zopfii SAG 2021T characterizing all isolates belonging to the genotype 2. The present study describe by first time in Brazil the genotype characterization of P. zopfii strains isolated from milk, obtained in clinical and subclinical bovine mastitis and bulk tank milk.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:57:00Z : No. of bitstreams: 1 ihlaseh_sm_me_botfm.pdf: 228425 bytes, checksum: d8ddb66a9f9af259ca5de94c447588a1 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O câncer de próstata (CaP) é um problema de saúde pública devido suas altas taxas de incidência e de mortalidade. Atualmente, os marcadores disponíveis para o diagnóstico e prognóstico não são capazes de diferenciar os CaPs indolentes dos que progridem mais agressivamente. Estudos moleculares usando análises em larga escala, como hibridação genômica comparativa baseada em arrays (aCGH), permitem a identificação de vários genes candidatos a marcadores. Estudos prévios de nosso grupo usando hibridação aCGH em CaP demonstraram amplificação em 7q21.13, onde estão mapeados os genes STEAP1 e STEAP2 (sixtransmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2). Esses genes apresentam expressão aumentada em diversas linhagens de células neoplásicas, incluindo as de próstata. No entanto, seu papel no desenvolvimento e progressão do CaP permanece desconhecido. Há evidências de que eles codificam antígenos tumorais com potencial para serem utilizados como marcadores prognósticos. O presente trabalho visou determinar o perfil de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 por RT-PCR quantitativa em tempo real (qRT-PCR) em adenocarcinomas primários de próstata, em amostras de tecido não-neoplásico adjacente aos tumores e em hiperplasias nodulares da próstata (HNP). Amostras de próstatas avaliadas histologicamente como normais foram obtidas de necropsias e usadas como controles. Os pacientes foram agrupados em três classes segundo o risco de recorrência do tumor (baixo, moderado e alto) de acordo com o PSA (antígeno prostático sérico), a graduação histológica e o estadiamento dos tumores. Foi observado aumento de expressão dos genes STEAP1 e STEAP2 em 28% e 38% das amostras, respectivamente; em três pacientes com alto risco de recorrência houve aumento simultâneo da expressão dos dois genes. A expressão... / Available prognostic markers as serum PSA levels, Gleason differentiation scores and tumor staging have not been able to discriminate indolent from aggressive tumors. Increased expressions of STEAP1 and STEAP2 genes (six-transmembrane epithelial antigen of prostate 1 e 2) have been shown in neoplastic cell lineages from prostate, urinary bladder, ovary and other tumors. Previously, using comparative genomic hybridization based in arrays in prostate adenocarcinomas and their metastasis, we described genomic gains at the 7q21.13. In this region are mapped the STEAP1 and STEAP2 genes. The involvement of these genes in PCa development and progression remains to be clarified. These genes possibly express tumoral antigens and are putative molecular markers.The objective of the present study was to determine the gene expression profiles of the STEAP1 e STEAP2 genes by real time quantitative PCR in primary prostate adenocarcinomas, surrounding non-neoplastic tissues, and in nodular hyperplasia of the prostate. The results were associate with tumor pathologic characteristics and patients clinical features. Samples from histologically confirmed normal prostates obtained from necropsies were used as normal controls. According to potential risk for tumor recurrence (low, moderate and high risk) patients were classified in three groups depending on the serum PSA levels, Gleason scores, and tumor stages. Increased expression of STEAP1 e STEAP2 genes were registered in 28% and 38% of samples, respectively; both genes presented simultaneously increased expression level in three high-risk cases. Similar pattern of expression were detected in the majority of CaP (Spearman r=0,63; p<0,0001) and non-neoplastic surrounding tissue (Spearman r=0,78; p=0,0002) samples. Compared to the non-neoplastic surrounding tissues there was significant increase of STEAP1 gene expression in PCa samples... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004Bitstream added on 2014-06-13T20:36:39Z : No. of bitstreams: 1 silva_gn_me_botfm.pdf: 467036 bytes, checksum: 3b9fa526eae390b7ae86bf47c5bcf731 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O linfoma de Hodgkin (LH) tem características clínicas e anátomo-patológicas distintas dos linfomas não-Hodgkin. Seu componente neoplásico, as células células de Hodgkin/Reed-Sternberg (H-RS), corresponde a cerca de 2% do tumor. As células H-RS apresentam imunofenótipo peculiar e sua origem ainda é objeto de estudo. O LH é classificado em LH clássico (que inclui os subtipos celularidade mista, esclerose nodular, depleção linfocítica e LH rico em linfócitos) e LH predominância linfocítica nodular. A associação do vírus de Epstein-Barr (EBV) com LH é conhecida e acredita-se que este vírus desempenha importante papel no desenvolvimento de parcela significativa dos casos de LH. No LH, o acúmulo de células reativas como linfócitos, plasmócitos, eosinófilos, histiócitos e fibroblastos ocorre em resposta a citocinas secretadas pelas células H-RS. A interleucina 10 (IL-10), importante citocina antiinflamatória da resposta imunitária, tem sido encontrada em grande quantidade em indivíduos com LH. É possível que essa elevada expressão de IL-10 esteja vinculada a determinados polimorfismos de nucleotídeos simples (SNP) na seqüência promotora do gene da IL-10, que podem se associar a características anátomoclínicas do LH. O presente trabalho avaliou a freqüência dos polimorfismos da IL-10 nas posições promotoras -1082, -819/-592 e estudou a correlação destes polimorfismos em LH com subtipos histológicos, infecção pelo EBV, faixa etária e, em alguns casos, estadiamento clínico da doença. Os resultados demonstram que os diferentes fenótipos para produção de IL-10, genótipos na posição -1082 e genótipos nas posições -592/-819 não têm relação com subtipos do LH e idade dos pacientes. Por outro lado, verificou-se que o genótipo GG na posição -1082 e a combinação de haplótipos GCC/GCC para alta... / Clinical and pathologic features of Hodgkin’s lymphoma (HL) reflect an abnormal immune response, which is in part due to the elaboration of a variety of cytokines. It was reported that interleukin 10 (IL -10), which may be produced by the malignant Hodgkin/Reed-Sternberg (H-RS) cells, is an important prognostic factor in HL, and it could play a role in the pathogenesis of this neoplasm. It is well established that genetic factors affect protein expression and function. In this regard, polymorphisms in the promoter region of IL-10 gene may cause different phenotypes for IL- 10 synthesis and activity. Three dimorphic single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been identified at positions -1082, -819 and -519 within the IL-10 promoter region (SNPs/IL-10). These polymorphisms are in close proximity to several transcription factors binding-sites, and may interfere with IL-10 gene transcription. The aim of this study was to evaluate whether is there a particular distribution of SNPs at positions -1082, -819 and -519 in the IL-10 gene promoter in patients with HL, as well as to access the differences in the SNPs/IL10 frequency regarding HL subtype, patient age, EBV infection status, and clinical staging of the disease. For these purposes, sixty-five cases of HL and fifty cases of reactive follicular lymphoid hyperplasia (RFLH) were evaluated for SNPs/IL-10 by polymerase chain reaction amplification plus restriction fragment length polymorphism analysis (PCR-RFLP). Compared to HL EBV-negative cases, in HL EBV-positive cases it was observed a significant increase in the frequency of GG genotype at position -1082 of IL-10 gene promoter region, which is associated to high level of IL -10 production. No differences were observed in the frequency of different SNPs/IL-10 concerning patient age, HL subtype, and clinical stage of the disease. These results... (Complete abstract, click electronic address below)

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-06T10:35:24Z No. of bitstreams: 1 DissCEBR.pdf: 2187824 bytes, checksum: 2b4de8a7ed43422ec5b90e9dfd63a4ac (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-06T18:53:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissCEBR.pdf: 2187824 bytes, checksum: 2b4de8a7ed43422ec5b90e9dfd63a4ac (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-06T18:53:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissCEBR.pdf: 2187824 bytes, checksum: 2b4de8a7ed43422ec5b90e9dfd63a4ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T18:53:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissCEBR.pdf: 2187824 bytes, checksum: 2b4de8a7ed43422ec5b90e9dfd63a4ac (MD5) Previous issue date: 2016-08-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Whereas the S. venaticus, has a wide distribution, estimated from Panama to northern Argentina, the dog vinegar is considered "near threatened" by the IUCN and "Vulnerable (VU)" by MMA. The molecular and biological data deficiency of this species is due mainly to the difficulties of capturing and observing natural environments, indicating a decline in population density of the species. Therefore, the objectives of this study were to determine the socio-genetic structure of family groups of S. venaticus, as well as estimate of kinship and population parameters such as genetic diversity and population structure, comparing parameters of genetic diversity between representatives of nature and captivity. For this, we used 12 microsatellite genetic markers, three specific primers and nine heterologous originally described for Canis familiaris and mitochondrial marker (CR - d-loop). They were obtained 38 blood samples of these, one 23 from the sample bank of CENAP/ICMBio, samples from the municipalities of N. Xavantina and Água Boa (MT), located of north the Mortes’s river, a place with great agricultural exploitation, reducing the closed portion by human actions. The nine heterologous loci showed a PIC> 0,6. Average values of observed heterozygosity (Ho) by codominant markers indicated a deficiency in the captive population, while haplotype diversity of data were the same for both populations. Diversity of data and allelic richness when compared to both populations showed a low for the captive population. Analysis of population structure, estimated a FST 0,165 between populations. Kinship analysis, suggested that 23.8% of individuals in the population in situ. However, also point out the need to expand the number of individuals sampled and conduct a follow-up field to elucidate the issues that emerged from this study. / Considerando que o S. venaticus, apresenta uma ampla distribuição, estimada desde o Panamá até o norte da Argentina, o cachorro-vinagre é considerado “quase ameaçado” pela IUCN e “vulnerável (VU) ” pelo MMA. A deficiência de dados moleculares e biológicos dessa espécie deve-se, principalmente, às dificuldades de captura e observação em ambientes naturais, indicando uma baixa na densidade populacional da espécie. Assim sendo, os objetivos foram: determinar a estrutura sócio-genética dos grupos familiares de S. venaticus, assim como estimar relações de parentesco e parâmetros populacionais, tais como diversidade genética e estruturação populacional para as populações ex situ e in situ. Para tanto foram utilizados 12 marcadores genéticos microssatélites desses, três primers específicos e nove heterólogos e um marcador mitocondrial (CR - d-loop). Foi extraído o DNA de 38 amostras de sangue dessas, 23 provenientes do banco de amostras do CENAP/ICMBio, coletadas nos municípios de N. Xavantina e Água Boa (MT), localizados ao norte do Rio das Mortes. Os nove locos heterólogos apresentaram um PIC>0,6. Análises de estruturação populacional, estimaram um FST de 0,165 entre populações, considerando uma diferenciação maior entre que dentro de populações, sem evidencia de estruturação Valores médios de heterozigosidade observada (Ho) por marcadores codominantes, indicaram uma deficiência na população cativa, enquanto dados de diversidade haplotípica foram iguais para ambas populações, apresentando cinco haplótipos e seis mutações. Dados de diversidade e riqueza alélica, quando comparados para ambas populações, apresentaram uma baixa para à população cativa. As análises de parentesco, sugeriram que 23.8% dos indivíduos da população in situ, possuem algum grau de parentesco entre si, indicando desvios na composição social esperada para Speothos com base nas observações de campo. Os resultados obtidos representam avanço importante no conhecimento da composição social da espécie. No entanto, apontam também a necessidade de ampliar o número de indivíduos amostrados e realizar um acompanhamento em campo visando elucidar as questões que surgiram a partir deste estudo.

Orientador: Fausto Foresti / Resumo: Os estudos em citogenética de peixes Neotropicais têm se expandido de modo considerável nos últimos anos, principalmente devido à incorporação de novas técnicas de obtenção e interpretação de dados cariomórficos. O presente estudo se inseriu no programa geral de estudos de Citogenética e Genética Molecular de Peixes Neotropicais que vem sendo desenvolvido no Laboratório de Biologia e Genética de Peixes (IBB/UNESP/Botucatu). Foram analisadas citogeneticamente, com relação aos aspectos estrutural e molecular cinco espécies de peixes da ordem dos Siluriformes, tendo como foco especial as espécies mais representativas da família Heptapteridae, sendo Rhamdia quelen, Pimelodella avanhadavae, Cetopsorhamida iheringi, Heptapterus mustelinus e Imparfinis mirin encontrados nos componentes das bacias hidrográficas dos rios Grande, Tietê e Paranapanema, no Estado de São Paulo, além de espécimes de Pimelodella elongata, provenientes do Rio Dos Bocas (03°16'07.6"S 079°44'14.8"W) Province El Oro, Equador. As análises de citogenética clássica envolveram a aplicação das técnicas de coloração por Giemsa para a caracterização do número diploide das espécies, que mostrou variação entre 2n=46 a 2n=58 cromossomos e o bandamento C para a localização de regiões heterocromáticas, além de técnicas de citogenética molecular com produção de sondas e mapeamento dos genes de DNAr 5S e 18S e mapeamento físico de 4 sequências de microssatélites ((CA)15, (GA)15, (CG)15 e (TTA)10). Além disso, foi realizado a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Márcio Garcia Ribeiro / Coorientador: Hélio Langoni / Banca: Antônio Carlos Paes / Banca: Alice Maria Melville Paiva Libera / Resumo: Nos últimos anos, Prototheca zopfii tem sido considerada uma das causas mais importantes de mastite de origem ambiental, refratária a terapia convencional. As infecções mamárias por P. zopfii acarretam alterações na composição do leite e redução na produção leiteira. O presente estudo avaliou a sensibilidade "in vitro" de 27 linhagens de P. zopfii isoladas do leite de vacas no Brasil frente a diferentes antimicrobianos e anti-sépticos, aliado a caracterização genotípica dos isolados. Nistatina (100,0%) e gentamicina (66,7%) foram as drogas mais efetivas para as 27 linhagens estudadas. A multi-resistência a três ou mais antimicrobianos foi observada em 100,0% das estirpes, principalmente frente a ampicilina, cefoperazona, cloxacilina, enrofloxacina, florfenicol, neomicina e tetraciclina. Hipoclorito de sódio (0,03-0,15%) e iodo (0,15-0,62%) revelaram efetividade "in vitro" para todos os isolados em baixas concentrações. A caracterização genotípica pela técnica de PCR baseada no fragmento 18S rDNA mostrou similaridade à cepa controle de P. zopfii SAG 2021T, caracterizando todos os isolados como pertencentes ao genótipo 2. O presente estudo descreve pela primeira vez no Brasil, a caracterização genotípica de linhagens de P. zopfii isoladas de leite obtido de vacas com mastite clínica, subclínica e de tanque de expansão. / Abstract: In last years, Prototheca zopfii has been considered one of the most important causes of mastitis from environmental origin, refractory to conventional therapy. The mammary infections caused by Prototheca zopfii lead to severe alterations in composition of the milk, and reduction in production. The present study evaluate the "in vitro" antimicrobials and anti-septic susceptibility, of 27 P. zopfii strains isolated from milk in cattle raised in Brazil, allied to the genotypic characterization of isolates. Nystatin (100.0%) and gentamicin (66.7%) were the most-effective drugs for 27 P. zopfii strains. Multiple drug resistance for three or more antimicrobials was observed in 100.0% of strains predominantly for ampicilin, cefoperazone, cloxacillin, enrofloxacin, florfenicol, neomycin e tetracycline. Sodium hypochlorite (0.03-0.15%) and iodine (0.15-0.62%) revealed "in vitro" efficacy in all isolates in low concentrations. The genotypic characterization using PCR technique based on the 18S rDNA displayed similarity to the strain-control of P. zopfii SAG 2021T characterizing all isolates belonging to the genotype 2. The present study describe by first time in Brazil the genotype characterization of P. zopfii strains isolated from milk, obtained in clinical and subclinical bovine mastitis and bulk tank milk. / Mestre

Orientador: Maria Isabel Nogueira Cano / Resumo: O presente trabalho teve por objetivo mapear os domínios de interação da proteína LaRbp38 (RNA binding protein 38 KD) de Leishmania amazonensis com ácidos nucléicos e a identificação de proteínas parceiras que formassem possíveis complexos com ela nos telômeros do parasita. LaRbp38 é uma proteína exclusiva de protozoários tripanosomatídeos, entre os quais estão os agentes etiológicos da leishmaniose, uma doença endêmica presente em diversas regiões do Brasil. Novos casos da doença vêm aumentando progressivamente, principalmente entre indivíduos imunocomprometidos e por isso a Organização Mundial da Saúde tem incentivado a busca de novos alvos para desenvolver drogas que eliminem eficazmente o parasita. LaRbp38 é uma proteína codificada por um gene nuclear, que parece exercer diferentes funções nas maquinarias de replicação nuclear e mitocondrial. Foi primeiramente descrita como proteína estabilizadora de RNA mitocondrial e parece estar envolvida com a replicação de DNA mitocondrial. Em Leishmania, LaRbp38 também interage in vivo com DNA mitocondrial, com seqüências ricas em GT e com DNA telomérico simples e dupla fita. A análise estrutural da proteína não indica a presença de nenhum domínio canônico de interação a ácidos nucléicos. Para dar inicio aos experimentos, a primeira estratégia foi desenhar mutantes delecionais da proteína de L. amazonensis (LaRbp38) de forma que cada um representa uma sobreposição do outro. Cada mutante, nomeados mut1, mut2, mut3, mut4 e mut5, foram subclonados em vetor de expressão bacteriano para produção de polipeptídios recombinantes. Em seguida os polipeptídios foram purificados e testados em western blotting, que mostra tanto LaRbp38 quantos os 5 mutantes sendo reconhecidas pelo soro antLLaRbp38. Ensaios in vitro de interação proteína-DNA (EMSA), usando DNA telomérico simples fita Te11, dupla fita... (Resumo completo clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Recent results demonstrated that Rbp38 is a protein exclusively expressed in trypanosomatid parasites, which includes the genus Leishmania. Rbp38 is a multifunctional protein exerting functions in the kinetoplast, such as the stabilization of mitochondrial RNAs and in the nucleus, as a protein that binds in vivo kDNA, the double-stranded (LaTel) and the G-rich telomeric DNAs (Tel1). The trypanosomatid Rbp38 does not share sequénce or functional/structural similarities with any other protein deposited in the public data bank. The present work has the aim of mapping the boundaries of the DNA-binding domain of LaRBP38, since using the available in silico tools, we were not able to define any known nucleic acid binding domain in this protein. Therefore, we constructed truncated overlapping mutants of LaRbp38 in order to map the boundaries of its DNA binding domain. These mutant proteins were expressed in a bacterial system and were produced in high amounts as shown by SDS-PAGE and Western blotting analyses. Electrophoretic mobility shift assays (EMSA) were done in order to test the ability of each mutant to bind in vitro the G-rich telomeric DNA, double-stranded telomeric DNA and kDNA. EMSA and competition assays confirmed that LaRbp38 has at least one DNA binding domain (DBD), centrally located, between amino acid residues 141 and 235. This DBD, interacts with distinct affinities with ali DNAs tested. Our results suggested that this binding domain has at least two extensions one towards the N-terminus of mut2 (aa 95 and 141), which showed binding affinity to LaTel and kDNA and other towards the C-terminus of mut3 (aa 235 to283) that strongly interacted with kDNA. However, we can not discard that others parts of the protein may also contribute to these interactions. Other controversial point about LaRbp38 is whether this protein has nuclear and mitochrondrial subcelular localization... (Completo abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Gerson Francisco / Banca: Rogério Rosenfeld / Banca: Rodrigo de Losso da Silveira Bueno / Resumo: Neste trabalho é apresentado um estudo do Jogo da Minoria, um modelo que visa simular o comportamento coletivo dos agentes no mercado financeiro. As propriedades deste sistema, bem como a resolução analítica do mesmo, são tratadas. Por fim, faz-se uma discussão das relações do jogo com o mercado real e reproduz-se um método que busca a utilização deste sistema para fins de modelagem e previsão de séries temporais / Abstract: In this work we study the Minority Game, a model which tries to simulate the collective behavior of the agents in the financial market. The properties of the system, as well as its analytical resolution, are shown. A discussion of the relations between this game and the real market, and also a reproduction of a method, which uses this system to look for modeling and prediction of temporal series, are made / Mestre