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Divergência genética de acessos e interação genótipo x ambiente de famílias de meloeiro / Genetic divergence of access and genotype x environment interaction of melon familiesAragão, Fernando Antônio Souza de 29 April 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-04-29 / The Brazilian melon agribusiness is in expansion, reaching almost 500 thousand tons per year and making melon the main domestic fruit in both exported volume and value, with this activity being concentrated in the Brazilian Semiarid region. However, Brazil ranks only twelfth among the producing countries in area planted and production and the twentieth-third in productivity, demonstrating that there is still much to do on melon breeding and genetic resources of this crop. Thus, the objectives of this work were to estimate the genetic diversity of melon accessions collected from the traditional agricultural areas of the Brazilian Northeastern region by using descriptors for the fruit and microsatellite markers, and to study the nature of genotype vs. environment interaction and to estimate genetic parameters and gains by selection of melon families, in the Jaguaribe/Assú irrigation projects (Ceará and Rio Grande do Norte States, Brazil). The study of genetic diversity showed great variability among accessions, within and among the botanical groups, enabling advances in genetic improvement of fruit quality traits. Cluster analysis by fruit descriptors formed eight groups, without taxonomic criteria. The characters fruit longitudinal diameter, number of fruits per plant, cavity thickness and total soluble solids were descriptors that contributed most to the dissimilarity of the genotypes. The SSR markers amplified 41 alleles with average of 2.41 alleles and three genotypes per locus. A phylogenetic molecular analysis separated the accessions into 13 groups, also without taxonomic coherence in groups formed. The degree of association between genetic distance morpho-agronomic and molecular matrices was null. Then, there was no significant association between the descriptors and SSR markers, which was predictable due the number of distinct groups, the quantitative nature of the descriptors and the distribution of SSR markers in the genome. In the study of genotype vs. environment interaction, there was heterogeneity among the families for all traits. Heritability estimates in the combined analysis were consistently lower than those estimated for each environment. The simple part of G vs. E interaction was always above 99%, except for pulp firmness, with a predominance of the large complex part between the pairs of environments A1 and A3 and A2 and A3. The direct gains by selection were higher than the indirect gains for all traits in all environments evaluated. Gains were closer to the direct genetic gains when the selection was based on the average of the three environments. Estimates of genetic parameters associated with the simple nature of the family vs. environment interaction allowed genetic progress by simple breeding methods. As the genotype-environment interaction overestimates the coefficient of genetic variation and genetic variance among families in an environment, genotype assessments in more than one location are necessary since that selection is made considering the average of the families on the environments. Therefore, the potential of genetic improvement was demonstrated for the germplasm used in the study of genetic diversity as well as for the germplasm evaluated in the analysis of genotype-environment interaction. / O agronegócio do melão brasileiro tem se expandido bastante, alcançando quase 500 mil toneladas de frutos por ano e tornando o melão a principal fruta nacional, tanto em volume de exportação quanto em valor exportado, estando esta atividade concentrada no semiárido brasileiro. Contudo, o Brasil é apenas o décimo segundo país em produção e área plantada e vigésimo terceiro em produtividade, evidenciando que ainda existe muito por ser feito em termos do melhoramento e recursos genéticos desta cultura. Assim sendo, os objetivos deste trabalho foram estimar a divergência genética de acessos de meloeiro coletados em propriedades de agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, tanto por descritores do fruto quanto por marcadores microssatélites e estudar a natureza da interação genótipo x ambiente (G x A) bem como estimar parâmetros genéticos e ganhos por seleção de famílias de melão, no polo Jaguaribe-CE/Assu-RN. O estudo de divergência genética mostrou grande variabilidade entre os acessos, entre e dentro dos grupos botânicos, possibilitando avanços no melhoramento genético dos caracteres de qualidade dos frutos. A análise de agrupamento por descritores do fruto formou oito grupos, sem critérios taxonômicos. Os caracteres diâmetro lateral, número de frutos por planta, espessura da cavidade e sólidos solúveis foram os descritores que mais contribuíram para a dissimilaridade dos genótipos. Os marcadores SSR amplificaram 41 alelos com média de 2,41 alelos e três genótipos por loco. A análise filogenética molecular separou os acessos em 13 grupos, também sem coerência taxonômica nos grupos formados. O grau de associação entre as matrizes de distâncias genéticas morfoagronômica e molecular foi nulo, não havendo associação entre os descritores e os marcadores SSR, o que era previsível devido ao número distinto de grupos, a natureza quantitativa dos descritores e a forma de distribuição dos marcadores SSR no genoma. No estudo de interação genótipo x ambiente, houve heterogeneidade entre as famílias para todas as características avaliadas. As herdabilidades estimadas nas análises conjuntas foram sempre inferiores àquelas estimadas em cada ambiente. A parte simples da interação G x A foi sempre superior a 99%, exceto para firmeza da polpa, com amplo predomínio da parte complexa entre pares de ambientes A1 e A3 e A2 e A3. Os ganhos diretos com seleção foram maiores do que os ganhos indiretos para todas as características, em todos os ambientes avaliados. Os ganhos foram mais próximos dos ganhos genéticos diretos quando se praticou a seleção pela média dos três ambientes. As estimativas de parâmetros genéticos associadas à natureza simples da interação família x ambiente permitem progresso genético por meio de métodos de melhoramento menos sofisticados. Como a interação genótipo x ambiente superestima o coeficiente de variação genético e a variância genética entre famílias em um ambiente, são necessárias avaliações dos genótipos em mais de um local, desde que a seleção seja praticada considerando a média das famílias nos ambientes. Portanto, ficou comprovado o potencial de melhoramento genético tanto no germoplasma utilizado no estudo de divergência genética quanto do germoplasma avaliado nas análises da interação genótipo x ambiente.
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Métodos de inoculação, reação de acessos e herança da resistência do meloeiro a Rhizoctonia solani / Inoculation methods, reaction of accessions and inheritance of resistance of melon plant to Rhizoctonia solaniMelo, Dalila Regina Mota de 04 August 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-08-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Many problems occur in melon, among them the diseases caused by soil born fungi such as Rhizoctonia solani. The use of resistant cultivars is a strategic measure in the integrated management of diseases. In order to obtain cultivars with resistance, it is necessary to identify sources of resistance in germplasm available and know the genetic control of resistance. Objectives of this study were to evaluate two methods of inoculation, the reaction of melon accessions to R. solani and to study the inheritance of resistance of melon to Rhizoctonia canker. The experiments were conducted at the Rural Federal University of the Semi-arid. In the first experiment, two methods of inoculation (sandy-organic and toothpick) of R. solani in melon were evaluated. The method toothpick was the most efficient in discriminating the reaction of melon accessions and virulence of isolates of R. solani. In the second experiment, the reaction of 42 hits and 3 melon hybrids to three isolates of R. solani was evaluated. The C-AC-03 and 'Olympic' accessions were identified as moderately resistant. In the third experiment, we investigated the inheritance of resistance of 'Olympic' in crosses with the susceptible parents 'Mabel' and C-AC-11. A major gene with both additive and dominant effects and polygenes with additive effects controlled the resistance to Rhizoctonia canker melon / Muitos problemas ocorrem na lavoura meloeira, entre eles as enfermidades causadas pelos fungos habitantes do solo, como a Rhizoctonia solani. A utilização de cultivares resistentes constitui uma medida estratégica no manejo integrado de doenças. Para se obter essas cultivares, é preciso ter métodos de inoculação eficiente, identificar as fontes de resistência no germoplasma disponível e conhecer a herança genética dessa característica. Os objetivos deste trabalho foram avaliar dois métodos de inoculação, a reação de acessos e a herança da resistência do meloeiro a R. solani. Os experimentos foram conduzidos em estufa agrícola, horta didática e laboratório de microbiologia e fitopatologiana da Universidade Federal Rural do Semi-Árido. No primeiro experimento, foram avaliados dois métodos (areno-orgânico e palito de dente) de inoculação de R. solani em meloeiro. O método do palito de dente foi o mais eficiente em discriminar acessos de meloeiro resistentes e suscetíveis e os isolados de R. solani quanto à virulência. No segundo experimento, foi avaliada a reação de 45 acessos de melão a três isolados de R. solani. Os acessos C-AC-03 e Olimpic foram identificados como medianamente resistentes. No terceiro experimento, investigou-se a herança da resistência de Olimpic em cruzamentos com os genitores suscetíveis Mabel e C-AC-11. A resistência do meloeiro ao fungo R. solani foi controlada por um gene maior de efeito aditivo e dominante e poligenes de efeitos aditivos
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Reação de acessos e cultivares de meloeiro a Pseudoperonospora cubensis e identificação de Quantitative Trait Loci de resistência do meloeiro ao míldio / Reaction of cultivars and accessions of melon Pseudoperonospora cubensis and the identification of Quantitative Trait Loci for resistance to downy mildew of melonAlbuquerque, Leidiane Bezerra 28 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Downy mildew, caused by the fungus Pseudoperonospora cubensis, is a major threat to the production of melons in wetlands worldwide. Despite its importance, there are few studies involving the assessment of sources of resistance, as well as the identification of molecular markers that are connected to this feature and that may help breeders in marker-assisted selection (MAS). Given this, the objectives of this work were promote the selection of sources of resistance to downy mildew, from melon accessions, collected from different states in the Northeast region of Brazil and to identify QTLs that co-segregate with the resistance gene of this pathogen, using the F2:3 obtained from parents and Védrantais MR-1, contrasting to the register character. To identify sources of resistance, thirty-six accesses and four commercial cultivars in a randomized block design (RBD) were assessed with three replications and seven plants per plot, which evaluation was made on the field. The evaluation was carried out on 24 days after transplanting the seedlings to the field, when 50% of plants reached the stage of flowering, with the aid of a diagrammatic scale. It was observed that there is variability in melon germplasm for reaction to downy mildew. The accessions A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 and A36 were considered promising for use in breeding programs aiming resistance to P cubensis. All commercial cultivars analyzed were highly susceptible to the pathogen. To identify markers connected the resistance QTLs, MR-1 and Védrantais parents were crossed and subsequently the F2 generation was obtained. It was extracted the DNA for evaluation molecular of the 98 plants obtained with microsatellite primers polymorphic selected from contrasting parents. Of F2 plants were obtained 98 progenies F2:3 that were used for the assessments phenotypic of the severity caused by P. cubensis, it was used the same time assessment described in the previous experiment, the period April-June 2013. The experimental design utilized was lattice simple 10 x 10. The efficiency of lattice was low (100.28%) thus data were analyzed in DBC. Significant genetic differences (P<0.01) between the progenies were identified. The estimated of heritability was considered high (86.75%), indicating successful selection. Were found 23 primers polymorphic, of this sum, thirteen amplified in all the population and were used for analyzes genotypic. Of these, ten markers presented values below level critical specified by FDR test. There was more proportion allele of parent Védrantais for eight loci, while there was more proportion allele the parent MR-1 for two loci. For other loci (three), frequencies allelic did not change. The values coefficients of determination (R2) obtained for the markers were relatively low in population. By regression simple linear, the markers explained the feature in population F2:3 the most were CMBR 139 and CMMS 22-2, being the same identified by regression multiple linear, thus they can also be used in SAM / O míldio, causado pelo fungo Pseudoperonospora cubensis, é uma das principais ameaças à produção do meloeiro em áreas úmidas em todo o mundo. Apesar de sua importância, são poucos os trabalhos envolvendo a avaliação de fontes de resistência, bem como a identificação de marcadores moleculares que estejam ligados a esta característica e que possam auxiliar os melhoristas na seleção assistida por marcadores (SAM). Diante disso, os objetivos deste trabalho foram promover a seleção de fontes de resistência ao míldio, a partir de acessos de meloeiro, coletados em diferentes estados da região Nordeste do Brasil e também identificar QTLs que co-segreguem com genes de resistência a este patógeno, utilizando progênies F2:3 obtidas dos genitores MR-1 e Védrantais, contrastantes para o caráter. Para a identificação de fontes de resistência, foram avaliados trinta e seis acessos e quatro cultivares comerciais em delineamento em blocos casualizados (DBC) com três repetições e sete plantas por parcela, cuja avaliação foi feita em campo. A avaliação se deu aos 24 dias após o transplantio das mudas para o campo, depois que 50% das plantas atingiram o estágio de floração, com o auxílio de uma escala diagramática. Observou-se que existe variabilidade no germoplasma de meloeiro para reação ao míldio. Os acessos A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 e A36 foram considerados promissores para o uso em programas de melhoramento visando resistência a P cubensis. Todas as cultivares comerciais analisadas foram altamente suscetíveis ao patógeno. Para identificação de marcadores ligados a QTLs de resistência, os genitores MR-1 e Védrantais foram cruzados e posteriormente foi obtida a geração F2. Das 98 plantas obtidas foi extraído o DNA para avaliação molecular com primers microssatélites polimórficos selecionados a partir dos genitores contrastantes. Das plantas F2 foram obtidas 98 progênies F2:3 que foram utilizadas para as avaliações fenotípicas quanto a severidade provocada por P. cubensis, seguindo a mesma época de avaliação descrita no experimento anterior no período de abril a junho de 2013. O delineamento utilizado foi o látice simples 10 x 10. A eficiência do látice foi baixa (100,28%), por isso, os dados foram analisados em DBC. Foram identificadas diferenças genéticas significativas (P<0,01) entre as progênies. A estimativa de herdabilidade foi considerada alta (86,75%), indicando sucesso com a seleção. Foram encontrados 23 primers polimórficos. Treze amplificaram em toda a população e foram utilizados para as análises genotípicas. Destes, dez marcadores apresentaram valores abaixo do nível crítico especificado pelo teste FDR. Para oito locos houve maior proporção de alelos do genitor Védrantais, enquanto que para dois locos houve maior proporção de alelos do genitor MR-1. Para os demais locos (três), as frequências alélicas não se alteraram. Os valores dos coeficientes de determinação (R2) obtidos para os marcadores foram relativamente baixos na população. Pela regressão linear simples, os marcadores que mais explicaram a característica na população F2:3 foram CMBR 139 e CMMS 22-2, sendo os mesmos identificados pela regressão linear múltipla, podendo, portanto, serem utilizados na SAM
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Novas fontes de resistência em meloeiro a Liriomyza sativae, Acidovorax avenae e Alternaria spp. / New sources of resistance in melon to Liriomyza sativae, Acidovorax avenae and Alternaria spp.Costa, Jose Maria da 24 February 2017 (has links)
Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-07-04T13:48:44Z
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Previous issue date: 2017-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of the present work was to identify sources of resistance in melon accessions to Liriomyza sativae; Alternaria spp., and Acidovorax avenae. Two experiments were performed in a greenhouse and in the Laboratory of Applied Entomology (UFERSA) in a completely randomized design, with ten replicates, each plant being a plot. In the first experiment 38 accessions and two hybridswere evaluated. The infestation was held in cages coated with antiophidic screen. The second experiment was performed with the accessions that revealed to be promising and some were susceptible in the first trial. In the evaluations, the number of mines, larvae, pulps and adult flies were determined. In some materials, leaf colorimetry, number, size of stomata and trichomes were analyzed. The accessions AM 55 and Nantais Oblong as well as the Ruthenium hybrid are resistant to Liriomyza sativa. The number of mines, larvae and adult flies correlated negatively with the number of trichomes and positively with the size of the stomata. Regarding the Alternaria leaf blight, fifty-eight accessions were initially evaluated in a randomized block design (DBC) with three replications under field conditions. In a second experiment, twelve accessions were also evaluated under field conditions, in both tests the evaluations were accomplished 50 days after the transplanting, as far as the severity and incidence of plants with Alternaria. It was concluded that there is variability in the germplasm of melon for reaction to the Alternaria leaf blight, being the accessions C-AC-04, C-AC-08, C-AC-26, C-AC-31, I 162, I 173 e MR-1 with lower severity averages and incidence of diseased plants, being evaluated as promising for use in breeding programs of melon for resistance to the pathogen. For the reaction to A. avenae, fifty accessions were evaluated in greenhouse and in field conditions. There has been accomplished inoculations with bacterial suspension in the concentration os 1,0 x 108 UFC ml-1. There were evaluated leaves (in a controlled environment), leaves and fruits (in field) with bacteriose symptoms. The C-AC-12 accession has intermediate resistance Acidovorax avenae / Os objetivos do presente trabalho foram: identificar fontes de resistência em acessos de meloeiro a Liriomyza sativae, Alternaria spp. e Acidovorax avenae. Dois experimentos foram realizados em casa de vegetação e no Laboratório de Entomologia Aplicada da (UFERSA) em delineamento inteiramente casualizado, com dez repetições, sendo cada planta uma parcela. No primeiro experimento foram avaliados 38 acessos e dois híbridos de meloeiro. A infestação foi realizada em gaiolas revestidas com tela antiafídica. O segundo experimento foi realizado com os acessos que se mostraram promissores e alguns suscetíveis no primeiro ensaio. Nas avaliações, determinou-se o número de minas, larvas, pupários e moscas adultas, em alguns materiais fez-se analise de colorimetria das folhas, número, tamanho de estômatos e tricomas. Os acessos AM 55 e Nantais Oblong bem como o híbrido Rutênio são resistentes a Liriomyza sativae. O número de minas, larvas e moscas adultas correlacionaram negativamente com o número de tricomas e positivamente com o tamanho dos estômatos. Com relação a mancha de alternaria, inicialmente foram avaliados 58 acesso sem delineamento em blocos casualizados (DBC) com três repetições em condições de campo. Em um segundo experimento, foram avaliados 12 acessos também em condições de campo, em ambos os ensaios as avaliações foram realizadas aos 50 dias pós o transplantio, quanto a severidade e incidência de plantas com alternariose.Concluiu-se que, existe variabilidade no germoplasma de meloeiro para reação a mancha de alternaria, sendo os acessos C-AC-04, C-AC-08, C-AC-26, C-AC-31, I 162, I 173 e MR-1 com menores médias de severidade e incidência de plantas doentes, sendo avaliados como promissores para uso em programas de melhoramento genético do meloeiro visando resistência ao patógeno. Para a reação a A. avenae, foram avaliados 50 acessos de meloeiro em estufa e em condições de campo. Realizou-se inoculações com suspensão bacteriana na concentração de1, 0 x 108 UFC ml-1.Avaliou-se folhas (em ambiente controlado), folhas e frutos (em campo) com os sintomas da bacteriose. O acesso C-AC-12 possui resistência intermediaria a Acidovorax avenae / 2017-07-04
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Biotecnologia para conservação ex-situ de plantas medicinais do CerradoSouza, Ana Valéria de [UNESP] 15 August 2006 (has links) (PDF)
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souza_av_dr_botfca.pdf: 1549773 bytes, checksum: 84b4a67f035a5e2a2ded161bbf59589c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Outra / O bioma Cerrado e uma das regioes mais ricas do Brasil no tocante a diversidade de plantas medicinais, sendo atualmente, considerado uma area ghotspots h devido o alto grau de endemismo das especies e a velocidade de degradacao que vem sofrendo. Anemopaegma arvense, Mandevilla illustris e Mandevilla velutina, sao plantas medicinais endemicas do cerrado, muito utilizadas na medicina popular devido suas propriedades terapeuticas. A coleta indiscriminada realizada pela populacao, como tambem por laboratorios farmaceuticos para a fabricacao de medicamentos, tem colocado essas especies em risco de extincao. Ferramentas biotecnologicas como a tecnica da micropropagacao e biologia molecular para analise do DNA, tem sido amplamente usadas para a producao, conservacao e analise da diversidade genetica de especies nativas. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivos estudar a variabilidade genetica em diferentes populacoes de M. velutina por meio do marcador molecular RAPD e estabelecer a conservacao em bancos de germoplasma in vitro; desenvolver protocolos eficientes de enraizamento in vitro para A. arvense, M. illustris e M. velutina; verificar a ocorrencia e identificar especies de micorrizas, avaliando a colonizacao em raizes de plantas de diferentes populacoes e variedades de A. arvense. Para os estudos de enraizamento in vitro, as brotacoes foram submetidas a acao de diferentes substancias que apresentam efeito sobre a formacao de raizes adventicias, sob variadas condicoes. Para a analise da diversidade genetica, utilizou-se a tecnica de Polimosfirmo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e para os estudos micorrizicos, realizou-se a avaliacao da infeccao micorrizica nas raizes e a identificacao de especies de fungos micorrizicos extraidos do solo. As especies comportaram-se de maneira diferente quanto a inducao de raizes adventicias in vitro, mostrando a influencia direta do genotipo no processo de enraizamento. Para as especies M. illustris / The Bioma Cerrado is one of the richest regions in Brazil due to the variety of native medicinal plants, and nowadays it is considered a hotspot area because of the high degree of endemism of the species and the speed of degradation that it has been submitted. Anemopaegma arvense, Mandevilla illustris and Mandevilla velutina, are medicinal plants endemic of Cerrado very used in the popular medicine due to their therapeutic properties. The indiscriminate collection accomplished by the population, as well by pharmaceutical laboratories for the formulation of medicines, has put those species in risk of extinction. Biotechnological tools as the technique of micropropagation and molecular biology for the analysis of the DNA, have been widely used for the production, conservation and analysis of the genetic diversity of native species. In this context, the current work was investigate the genetic variability in different populations of M. velutina by means of molecular marker RAPD and to establish a protocol for in vitro conservation in germplasm bank; to develop efficient protocol of in vitro rooting for A. arvense, M. illustris and M. velutina; to verify the occurrence and to identify species of mycorrhiza, colonizing plant roots of different populations and varieties of A. arvense. For the studies of in vitro rooting, the plantlets were exposed to the action of different exogenous substances that a effect the formation of adventious roots, under several conditions. For the analysis of genetic diversity, it was used the technique of Random Amplified Polymorphic DNA at (RAPD) and for the studies on influence of mycorrhizal infection on root development and identification of species of fungi present in the soil. The species behaved in a different ways of induction of adventious roots in vitro. For the species M. illustris and A. arvense, 73,3% e 50% of plantlets rooted after fifteen days in treatment with 1 and 2 mg.L-1 of NAA, respectively. For M.
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Variação genética para caracteres silviculturais em banco ativo de germoplasma de espécies arbóreas do cerrado e da floresta estacional semidecidualRodrigues, Carlos José [UNESP] 27 August 2010 (has links) (PDF)
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rodrigues_cj_dr_ilha.pdf: 1658043 bytes, checksum: 2ad97ce0bc47360910cd7c904ad1c71d (MD5) / A construção da Usina Hidrelétrica Engenheiro Sergio Motta, na região do Pontal do Paranapanema, promoveu severos impactos aos ambientes naturais, especialmente sobre as comunidades florestais remanescentes. Com a finalidade de compensar a perda das espécies florestais na área de inundação do reservatório, desenvolveu-se por meio do convênio CESP – ESALQ/USP-IPEF, o Projeto Banco Ativo de Germoplasma (BAG), implantando-se em forma de teste de progênies, delineamento de blocos ao acaso, constituído por três repetições, contendo parcelas lineares de oito plantas de trinta progênies de cada uma das espécies eleitas para conservação. O presente estudo objetivou verificar o comportamento, variação genética e propor estratégia adequada de seleção para caracteres silviculturais de 32 espécies do Banco Ativo de Germoplasma de espécies de Floresta Estacional Semidecidual (BAG – SP), implantado em Rosana – SP e de 31 espécies conservadas no Banco Ativo de Germoplasma de espécies do Cerrado (BAG - MS), implantado em Anaurilândia – MS. Foram avaliados os caracteres DAP (diâmetro a altura do peito), altura e sobrevivência. Os resultados, obtidos por meio do programa estatístico SELEGEN-REML/BLUP, possibilitaram observar que o sistema de plantio adotado na implantação do Banco Ativo de Germoplasma da Floresta Estacional Semidecidual (BAG – SP) e do Banco Ativo de Germoplasma do Cerrado (BAG - MS), mostra-se promissor para as espécies que se encontram conservadas nestes. Aos 9,3 anos após o início da implantação o BAG – SP apresenta, em média, 67,5% de sobrevivência, DAP de 5,42 cm e 5,73 m de altura. Aos 8,3 anos após o início da implantação o BAG – MS apresenta, em média, 65% de sobrevivência, DAP de 7,51 cm e 5,79 m de altura. A variação genética presente nas populações que compõe o... / The construction of the Hydroeletric Power Plant Engenheiro Sergio Motta; in the region of Pontal do Paranapanema, caused severe impacts to natural environments, especially on the remaining forest communities. To compensate the loss of forest species in the floodplain of the reservoir, was developed, through the partnership CESP – ESALQ/ USP-IPEF, the Project Active Germplasm Bank (AGB), implemented in the form of a progeny test, designed random blocks, consisting of three replicates, containing linear parcels of eight plants from thirty progenies of each one of the elected species for conservation. This work aimed to study the genectic variation for the silvicultural characters of 32 species from the Active Germplasm Bank of species of Semideciduous Seasonal Forest (AGB – SP), implemented in Rosana – SP and 31 species conserved in the Active Germplasm Bank of Cerrado species (AGB-MS), implemented in Anaurilândia – MS. Were evaluated the DBH (diameter at breast height), height and survival. The results obtained through the statistical program SELEGEN-REML/BLUP, allowed to observe that the plantation system adopted in the implementation of the Active Germplasm Bank of the Semideciduous Seasonal Forest (AGB-SP) and the Active Germplasm Bank of Cerrado (AGB-MS) shows promise for the species that are conserved in these. At 9.3 years after the beginning of the implementation, the AGB – SP showed 67.5% of survival, DBH of 5.42 cm and 5.73 m of height and the AGB-MS, at 8.3 years after the beginning of the implementation showed 65% of survival, DBH of 7.51cm and 5.79 m of height. The genetic variation present in populations that make up the AGBSP and AGB-MS validates the ex situ conservation program that was proposed and enables the development of an improving program for these species, in order to produce improved seeds. The strategy... (Complete abstract click electronic access below)
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Whole genome approaches for characterizing and utilizing synthetic wheatDunckel, Sandra Margarita January 1900 (has links)
Doctor of Philosophy / Genetics - Plant Pathology / Jesse A. Poland / The global population is estimated to reach 9.1 billion by 2050. Together with climate change, insuring food security for this population presents a significant challenge to agriculture. In this context, a large number of breeding objectives must be targeted. The focus of the work presented here is to explore genomic approaches for tapping exotic germplasm for valuable alleles to increased yield, disease resistance and abiotic stress tolerance.
The loss of genetic diversity in bread wheat (Triticum aestivum L.) due to bottlenecks during polyploidization, domestication and modern plant breeding can be compensated by introgressing novel exotic germplasm. Here, the potential of genomic selection (GS) for rapid introgression of synthetic derived wheat is evaluated in field trials. Overall, the GS models had moderate predictive ability. However, prediction accuracies were lower than expected likely due to complex and confounding physiological effects. As such, implementation of rapid cycle GS for introgression of exotic alleles is possible but might not perform very well with synthetic derived wheat.
Disease resistance is another important trait affecting grain yield. Stem rust (Puccinia graminis f. sp. tritici) has historically caused severe yield loss of wheat worldwide. In a quantitative trait loci (QTL) mapping study with a synthetic-derived mapping population, QTLs for resistance to stem rust races TRTTF and QTHJC were identified on chromosomes 1AS, 2BS, 6AS and 6AL. Some of these genes could be new resistance genes and useful for marker-assisted selection (MAS).
In addition to food insecurity through lack of sufficient source of calories, nutrient deficiency is considered the ‘hidden hunger’ and can lead to serious disorders in humans. Through biofortification, essential nutrients are increased in staple crops for improved quality of
food and human health. A high-throughput elemental profiling experiment was performed with the same synthetic derived mapping population to study the wheat ionome. Twenty-seven QTL for different elements in wheat shoots and two QTL in roots were identified. Four “hotspots” for nutrient accumulation in the shoots were located on chromosomes 5AL, 5BL, 6DL and 7AL.
Overall, exotic germplasm is a valuable source of favorable alleles, but improved breeding methodologies are needed to rapidly utilize this diversity.
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Caracterização morfoagronômica de acessos de Coffea arabica L / Morfological and agronomic characterization of Coffea arabica L. accessesLeão, André Pereira 18 December 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-12-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / One hundred accesses from the Coffea spp. germplasm bank of Universidade Federal de Viçosa were evaluated agronomic and morphologically, and separate in groups according to their genetic correlation. 21 descriptors of the IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute) were used. After that, statistics analysis were done, indicating, by order, the following characteristics to discard, because of their minor importance to the genetic clustering: number of nodes in the branch, number of nodes in the main stem, color of the fruit, estimative of fruit production, branch length, crown diameter, leaf length, fruit maturation uniformity and stem length until the first node. Also, the descriptors leaf apex shape and leaf shape were discarded because it does not present variation on the evaluated accesses. Therefore, of the initial 21 characteristics, only 10 were kept by the end of the analysis. Using all the 21 descriptors, the 100 accesses were separate in 78 different genetic groups, 67 of it being singular. On the other hand, after discarding the less important variables, the remaining 10 characteristics allowed the formation of 10 genetic groups, only one being singular. / Cem acessos de café pertencentes ao Banco de Germoplasma de Coffea spp. da Universidade Federal de Viçosa foram caracterizados agronômica e morfologicamente, e divididos em grupos de acordo com suas correlações genéticas. Utilizou-se 21 descritores do IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute). Após a caracterização procederam-se as análises estatísticas que indicaram, na ordem, as seguintes variáveis para descarte, por serem menos relevantes para o agrupamento genético: número de nós no ramo plageotrópico, número de nós na haste principal, cor de fruto, estimativa comparativa de produção de frutos, comprimento do ramo plageotrópico, diâmetro da copa, comprimento da folha, uniformidade de maturação dos frutos e comprimento do ramo plageotrópico até o primeiro nó. Além disso, os descritores formato da folha e formato do ápice da folha foram descartados por não apresentarem variação nos acessos avaliados. Assim, das 21 características inicias, apenas 10 foram mantidas ao final da análise. Com as 21 características os 100 acessos foram separados em 78 grupos distintos, 67 deles sendo grupos singulares. Em contrapartida, após o descarte das variáveis menos relevantes, as 10 características permitiram a formação de 10 grupos, sendo apenas 1 singular.
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Fontes de resistência e herança genética da murcha de curtobacterium causada por Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens em feijão / Resistence sources and genetic inheritance of bacterial wilt caused by Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens in common beanValentini, Giseli 09 February 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-02-09 / Curtobacterium wilt has become one of the most important emerging diseases in bean plants. Studies aimed at identifying sources of resistance and to know the genetic control of disease are essential for the development of resistant cultivars. The aim of this study was to identify bean genotypes resistant to curtobacterium wilt and determine the inheritance of resistance of this disease on bean, to enable the development of resistant cultivars in a breeding program. Were evaluated 72 genotypes, among which are 67 accessions of the Active Germplasm Bank of beans at the Universidade do Estado de Santa Catarina (UDESC). It was possible to identify Xan 159 as being tolerant to the disease, because it showed the lowest average scores for symptoms of bacterial wilt and is indicated for use in breeding programs to develop resistant cultivars. The study of inheritance of resistance to bacterial wilt was accomplished through a complete diallel of five parents (IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Pyatã, IAC Carioca Tybatã, SCS Guará and Pérola) and through study of six generations of people IAC Carioca Aruã x Guara and IAC Carioca Pyatã x Pérola. Diallel analysis showed that although both the additive effects and non-additive are involved, the additive effect is more important in controlling the curtobacterium wilt. The IAC Carioca Pyatã had the highest general combining ability and is recommended for use in breeding programs that aim to develop resistant genotypes. The analysis of the means of generations between genotypes tolerant x susceptible (IAC Carioca Aruã x SCS Guará and IAC Carioca Pyatã x Pérola), demonstrates the importance of the additive effects on the character determination. Analyses of variance of six generations agree with the results found by the analysis of averages, where the additive effect has greater importance for the inheritance of curtobacterium wilt. The narrow sense heritability was around 35%, demonstrating that it is possible to gain with the selection of resistant individuals / A murcha de curtobacterium tem se mostrado uma das doenças emergentes mais importantes na cultura do feijão. Estudos que visem identificar fontes de resistência e conhecer o controle genético da doença são fundamentais para o desenvolvimento de cultivares resistentes. O objetivo deste trabalho foi identificar genótipos de feijão resistentes à murcha de curtobacterium e estudar a herança da resistência desta doença em feijão, para possibilitar o desenvolvimento de cultivares resistentes em programas de melhoramento. Foram avaliados 72 genótipos, dentre os quais estão 67 acessos pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma de Feijão da Universidade do Estado de Santa Catarina (UDESC). Foi possível identificar a linhagem Xan 159 como tolerante à doença, pois apresentou as menores médias para as notas dos sintomas da murcha de curtobacterium, sendo indicado para uso em programas de melhoramento para o desenvolvimento de cultivares resistentes. O estudo da herança da resistência à murcha de curtobacterium foi realizado, através de um dialelo completo com cinco genitores (IAC Carioca Aruã, IAC Carioca Pyatã, IAC Carioca Tybatã, Pérola e SCS Guará) e através do estudo das seis gerações da populações IAC Carioca Aruã x Guará e IAC Carioca Pyatã x Pérola. A análise dialélica mostrou que, embora ambos os efeitos aditivos e não-aditivos estão envolvidos, o efeito aditivo é mais importante no controle da murcha de curtobacterium. O genótipo IAC Carioca Pyatã apresentou a maior capacidade geral de combinação e é recomendado para uso em cruzamentos dirigidos que objetivam o desenvolvimento de genótipos resistentes. A análise das médias das gerações entre genótipos tolerantes x suscetíveis (IAC Carioca Aruã x SCS Guará e IAC Carioca Pyatã x Pérola), demonstra a importância dos efeitos aditivos para a determinação do caráter. As análises das variâncias das seis gerações concordam com os resultados encontrados pela análise das médias, onde o efeito aditivo possui maior importância para a herança da murcha de curtobacterium. A herdabilidade no sentido restrito foi em torno de 35%, demonstrando que há possibilidade de obter ganhos com a seleção de indivíduos resistentes
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Estratégias para conservação de acessos de coqueiro anão do BAG da Embrapa Tabuleiros Costeiros / Conservation strategies for coconut dwarf accessions of Embrapa Coastal Tablelands BAGMachado, Caroline de Araújo 23 April 2012 (has links)
The conservation of the coconut palm has been investigated in recent years by research organizations, public and private. These studies have concentrated on obtaining conservation protocols in vitro using slow growth and cryopreservation. Storage as a means of maintaining the viability of pollen, it is important for the preservation of genetic variability, facilitates the exchange of germplasm and contributes greatly to the
generation of variability obtained from artificial crosses increasing the efficiency of breeding programs. The objective of this work was to study the effect of mannitol and abscisic acid (ABA) on growth of seedlings of coconut dwarf accessions for conservation purposes, and in vivo studies of the viability and storage conditions of pollen grains. For the study of conservation by slow growth were used mature zygotic embryos of Gramame Red Dwarf (AVG) and Malayan Yellow Dwarf (AAM). The coconut embryos were inoculated in culture medium Y3 (Eeuwens, 1976) supplemented with 30 g L-1 sucrose, gelled with 0.7% agar in presence of 2.5 g L-1 of activated charcoal. Were tested the following concentrations of mannitol: 0; 0.1; 0.2, 0.3 and 0.4 M. In other experiment was tested the following ABA concentrations: 0, 10, 20, 30 and 40 mM. The 0.1 and 0.2 M mannitol reduced the plantlets length of AAM and AVG accessions, respectively at 180 and 270 days of cultivation. Concentrations above 20 μM ABA were viable to inhibit the plantlets growth to 180 and 270 days. The ABA concentrations tested not inhibit the access AVG growth. For the study of determining the culture medium in germination of pollen grains, it was evaluated four culture media: Brewbaker and Kwack (1983) modified by Sousa et al. (2010); Lora et al. (2006); Sousa et al. (1998) and Sousa et al. (1998) modified by the author, in different times: 0, 24, 48
and 72 hours. The Lora culture medium promoted the major in vitro germination of AVeJBr pollen grains. Pollen grains of AVeJBr access showed viability up to 72 hours (3 days). The condition of storage at -20°C and -80°C promotes more viable pollen germination of AVC access up to 60 days. The condition of storage at -196°C promotes greater availability of pollen germination by AVeJBr access up to 60 days. / A conservação do coqueiro tem sido alvo de estudos nos últimos anos por organizações de pesquisa pública e privada. Essas pesquisas têm se concentrado na obtenção de
protocolos por crescimento lento ou criopreservação. O armazenamento, como meio de manutenção da viabilidade do pólen, é importante para a preservação da variabilidade
genética, facilita o intercâmbio de germoplasma e contribui muito na geração de variabilidade obtida através de cruzamentos artificiais aumentando a eficiência dos programas de melhoramento genético. O objetivo do trabalho foi de estudar o efeito do manitol e do ácido abscísico (ABA) no crescimento de plântulas de acessos de coqueiro anão para fins de conservação, além de estudos da viabilidade in vivo e condições de armazenamento de grãos de pólen. Para o estudo de conservação por crescimento lento foram utilizados embriões zigóticos maduros de acessos de coqueiro anão vermelho de Gramame (AVG) e anão amarelo da Malásia (AAM) e para estudos da viabilidade in vivo e condições de armazenamento de grãos de pólen o acesso anão verde de Jiqui do Brasil (AVeJBr). Os embriões foram inoculados em meio de cultura Y3 com 30 g L-1 de sacarose, geleificado com 0,7% de ágar na presença de 2,5 g L-1 de carvão ativado. Foram testadas as seguintes concentrações de manitol: 0; 0,1; 0,2; 0,3 e 0,4 M. Em outro ensaio o ABA foi adicionado ao meio de cultura nas concentrações de 0; 10; 20; 30 e 40 μM. As concentrações de 0,1 e 0,2 M de manitol reduziram o comprimento da parte aérea para os acessos AAM e AVG, respectivamente aos 180 e 270 dias de cultivo. Concentrações acima de 20μM do ABA foram viáveis para inibir o crescimento de plântulas aos 180 e 270 dias. O acesso AVG não sofreu inibição do comprimento da parte aérea, quando concentrações de ABA foram adicionadas ao meio de cultura. Foram avaliados quatro meios de cultura para germinação in vitro do acesso AVeJBr: Brewbaker & Kwack (1983) modificado por Sousa et al. (2010); Lora et al. (2006);
Sousa et al. (1998) e Sousa et al. (1998) modificado pelo autor, em diferentes tempos: 0, 24, 48 e 72 horas. O meio de cultura de Lora promoveu a maior germinação de grãos de
pólen do acesso AVeJBr. Grãos de pólen de coqueiro AVeJBr apresentaram viabilidade média, sob temperatura ambiente, até 72 horas (3 dias). A condição de armazenamento a -20°C e -80°C promove maior viabilidade de grãos de pólen por germinação do acesso AVC até os 60 dias. A condição de armazenamento a -196°C promove maior viabilidade de grãos de pólen por germinação do acesso AVeJBr até os 60 dias.
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