Orientadores: Raquel Silveira Bello Stucchi, Sandra Cecília Botelho Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-23T21:51:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Milan_Arlete_D.pdf: 3275520 bytes, checksum: 25bbae8b034967286ca090efbc210090 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O transplante de fígado tornou-se a terapia mais eficaz para o tratamento dos pacientes com doença hepática terminal, sendo que o sucesso pode ser limitado por complicações infecciosas no primeiro ano pós-transplante. O citomegalovírus é o tipo de infecção viral mais comum e está relacionado com a morbidade e mortalidade. A infecção bacteriana é uma séria complicação em pacientes transplantados de fígado. O Herpesvírus humano 8 tem uma distribuição global heterogênea, poucos estudos existem em pacientes submetidos à transplante de fígado. Nosso objetivo foi correlacionar a infecção do citomegalovírus e do Herpesvírus Humano 8 com a ocorrência de infecções bacterianas nos pacientes submetidos à transplante de fígado. Foram incluídos pacientes monitorados por seis meses para a detecção da infecção do citomegalovírus e do Herpesvírus Humano 8. As amostras foram realizadas no momento da cirurgia e semanalmente até o segundo mês, quinzenalmente no terceiro mês e mensalmente do quarto ao sexto mês. A infecção por citomegalovírus foi definida por antigenemia positiva (> três células) ou dois testes positivos de Nested-Reação em Cadeia de Polimerase com intervalo de 30 dias associada a sintomas clínicos. A metodologia para o diagnóstico de infecção bacteriana foi por meio de cultura de urina e de sangue através de testes bioquímicos e automatizado BacT / ALERT® 3 D - VITEK® (bioMérieux, França). A investigação para o Hespesvírus Humano 8 foi através da Nested-Reação em Cadeia de Polimerase da região Open Reading Frame-26 e confirmado pela sorologia da imunoglobulina G - Enzyme Linked Immunosorbet Assay the Advanced Biotechnologies Incorporated (Maryland, EUA). Teste do qui-quadrado foi utilizado para as variáveis dicotômicas com diferenças significativas quando p < 0,05. Cinquenta pacientes foram acompanhados no período de fevereiro de 2008 a janeiro de 2010. Vinte e um (42%) pacientes tiveram infecção bacteriana. Dezesseis pacientes (32%) apresentaram infecção por citomegalovírus . Dos 16 pacientes, 13 (81%) mostraram infecção bacteriana concomitante. Trinta e quatro pacientes (68%) não tiveram infecção por citomegalovírus e deles, 8 (24%) tiveram infecções bacterianas. Não encontramos em nossa casuística positividade para o Herpesvírus Humano 8. As infecções bacterianas pós-transplante de fígado foram associadas a infecção ativa pelo citomegalovírus / Abstract: Liver transplantation has become the most effective therapy for the treatment of patients with end-stage liver disease but its success can be limited by infectious complications during the first year post-transplant. Cytomegalovirus is the most common viral infection and it is associated with morbidity and mortality. Bacterial infection is a serious complication in liver transplant patients. Human Herpesvirus 8 has a global distribution heterogeneous; there are few studies in patients undergoing liver transplantation. Our objective was to correlate infection of cytomegalovirus and with the occurrence of bacterial infections in patients undergoing liver transplantation. This study included patients monitored for six months for detection of cytomegalovirus and of Human Herpesvirus 8 infection. The sample collections were performed at the time of surgery, weekly until the second month, twice a month in the third month, and monthly from the fourth to the sixth month. Cytomegalovirus infection was defined by positive antigenemia (> three cells) or two positive Nested-Polymerase Chain Reaction tests associated with clinical symptoms. The methodology for the diagnosis of bacterial infection was through biochemical tests and the automated BacT / ALERT® 3 D - VITEK® (bioMérieux, França) for identification and antibiogram using samples of urine and blood cultures. Research for Human Herpesvirus 8 was by Nested-Polymerase Chain Reaction region Open Reading Frame-26 and confirmed by serology IgG - Enzyme Linked Immunosorbet Assay the Advanced Biotechnologies Incorporated (Maryland, EUA). Chi-square test was used for dicotomic variables with significant differences when p < 0,05. Fifty patients were followed up from february 2008 to january 2010. Twenty-one (42%) patients had bacterial infection. Sixteen patients (32%) had citomegalovírus infection. Of the 16 patients, 13 (81%) showed concomitant bacterial infection. Thirty-four patients (68%) had no citomegalovírus infection, and of them, 8 (24%) had bacterial infections. Not found in our sample positive for Human Herpesvirus 8. Bacterial infections after liver transplantation were associated with cytomegalovirus active infection / Doutorado / Clinica Medica / Doutora em Clínica Médica

Orientadores: Clarice Weis Arns, Luciana Konecny Kohn / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T23:34:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bianchi_BiancaReal_M.pdf: 1619930 bytes, checksum: 92df5dc0e4cba5e4314f506e39ff0be1 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O vírus herpes simples do tipo 1 (HSV-1), agente etiológico do herpes labial em humanos, é facilmente transmitido e têm o grande problema de causar infecções latentes, sendo que uma vez infectado, o indivíduo passa a ser o portador do vírus por toda a vida. O medicamento mais apropriado contra este tipo de vírus deve ter ação inibitória em qualquer estágio de sua replicação, além de baixa toxicidade, para que as células do hospedeiro não sejam afetadas. Os organismos marinhos representam uma vasta biodiversidade que inclui cerca de 80% de todas as espécies do planeta, o que nos leva a uma grande quantidade de informações que ainda poderão ser descobertas, inclusive acerca de compostos com atividade antiherpética, já que atualmente temos poucos medicamentos disponíveis e nem sempre de total eficácia. Para o estudo com HSV-1 foi escolhida a cepa KOS, por ser resistente ao medicamento considerado mais eficaz para o herpes humano, o aciclovir. Foi utilizada a linhagem celular VERO para o estudo da atividade antiviral de extratos de organismos marinhos. Inicialmente foi realizada uma triagem com 129 extratos. Utilizou-se a concentração de 50?g/ml para todos os extratos, considerando ativos aqueles que apresentaram 97% de inibição do crescimento viral. Dentro dos grupos analisados foram identificados 6 extratos brutos de fungos e 7 extratos brutos de esponjas marinhas como possíveis antivirais. O cálculo do Índice de Seletividade foi realizado para as amostras de fungos Demateaceous (grupo) e Trichoderma sp., apresentando os valores 0,03 e 0,3, com atividade nas fases de adsorção e inativação viral, respectivamente e, para as amostras de esponjas, Monanchora arbuscula e Hemimycale sp., ambas apresentando o valor 0,1, com atividade também nas fases de adsorção e inativação viral, respectivamente / Abstract: Herpes simplex virus type 1 (HSV-1), the etiologic agent of herpes labialis in humans, is transmitted easily and have great problem to cause latent infections, and once infected, the individual becomes the carrier of the virus by life. The most suitable medicament against such virus should have inhibitory action at any stage of its replication as well as low toxicity to the host cells is not impaired. Marine organisms represent a wide biodiversity that includes about 80% of all species on the planet, which leads to a large amount of information that can still be found, including about compounds that may help a possible treatment of symptoms caused by this virus, since currently available medicines have few and not always fully effective. For the study of HSV-1, the KOS strain was chosen because it is resistant to the drug considered most effective for the human herpes, the acyclovir. Was used the cell lines VERO (African Green Monkey - ATCC CCL 81) for the study the antiviral activity of extracts of marine organisms. Initially was realized a screening with 129. We used the concentration of 50?g/ml for all the extracts, whereas those with active 97% inhibition of viral growth. Within the groups analyzed were identified 6 extracts of fungus and 7 crude extracts of marine sponges as possible antiviral. The calculation of the Selectivity Index was conducted for samples of fungi Demateaceous (group) and Trichoderma sp., presenting the values 0.03 and 0.3 with activity phases of adsorption and viral inactivation, respectively, and for samples of sponges, Monanchora arbuscula and Hemimycale sp. both presenting the value 0.1, with activity also in the phases of adsorption and viral inactivation, respectively / Mestrado / Clinica Medica / Mestra em Ciências

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-23Bitstream added on 2014-06-13T20:53:06Z : No. of bitstreams: 1 arede_lt_me_araca.pdf: 290368 bytes, checksum: 4a463ee30cc7d940d6313f3fb94b9bec (MD5) / Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) / O vírus Epstein-Barr (EBV) faz parte da família herpesvirus humano e está relacionado com doenças benignas e malignas de cabeça e pescoço e sua possível relação com o carcinoma espinocelular (CEC) oral tem sido estudada. O objetivo deste estudo foi detectar a presença do EBV em pacientes com CEC oral e mucosa normal, correlacionando os achados com as variáveis clínico-patológicas, fatores de risco e sobrevida. Foi aplicada a nested-PCR em peças parafinizadas de CEC oral, sendo 20 amostras de assoalho bucal, 25 de língua e 12 de orofaringe. Também foi utilizado grupo controle, sem carcinoma espinocelular, com 19 amostras de mucosa oral normal. O vírus foi encontrado em 10% das amostras de assoalho bucal e 12% de língua, não sendo detectado na orofaringe. Para as amostras de mucosa normal a prevalência foi de 15,79%. Não houve diferença estatisticamente significante entre a presença do vírus e as variáveis: localização anatômica, sexo, idade, tabagismo, etilismo, estadiamento clínico, gradação histológica, esvaziamento cervical e sobrevida. Os resultados sugerem que o EBV não participa isoladamente da carcinogênese oral / The Epstein-Barr virus (EBV) is part of human herpesvirus family being associated with benign and malignant diseases head and neck. Its possible relation with oral squamous cell carcinoma (OSCC) has been studied. The aim of this study was to detect the presence of EBV in patients with OSCC and normal mucosa, correlating the findings with clinicopathologic variables, risk factors and patient’s survival. Nested PCR was applies in paraffin embedded samples of OSCC being 20 samples of mouth floor, 25 tongue and 12 oropharyngeal. A control group composed of 19 normal oral mucosa samples was used. The virus was found in 10% of mouth floor samples, 12% of tongue not being detected in oropharynx. The prevalence in oral mucosa samples was 15.79%. There was no statistically significant differences between the virus presence and the variables: anatomical localization, gender, age, smoking, alcoholism, clinical stage, histological grade, neck dissection and patient’s survival. The results suggest that EBV alone did not have participation in carcinogenesis or oral SCC

Orientador: Glauco Issamu Miyahara / Coorientador: José Fernando Garcia / Banca: Eder Ricardo Biasoli / Banca: Luiz Alberto Veronese / Resumo: O vírus Epstein-Barr (EBV) faz parte da família herpesvirus humano e está relacionado com doenças benignas e malignas de cabeça e pescoço e sua possível relação com o carcinoma espinocelular (CEC) oral tem sido estudada. O objetivo deste estudo foi detectar a presença do EBV em pacientes com CEC oral e mucosa normal, correlacionando os achados com as variáveis clínico-patológicas, fatores de risco e sobrevida. Foi aplicada a nested-PCR em peças parafinizadas de CEC oral, sendo 20 amostras de assoalho bucal, 25 de língua e 12 de orofaringe. Também foi utilizado grupo controle, sem carcinoma espinocelular, com 19 amostras de mucosa oral normal. O vírus foi encontrado em 10% das amostras de assoalho bucal e 12% de língua, não sendo detectado na orofaringe. Para as amostras de mucosa normal a prevalência foi de 15,79%. Não houve diferença estatisticamente significante entre a presença do vírus e as variáveis: localização anatômica, sexo, idade, tabagismo, etilismo, estadiamento clínico, gradação histológica, esvaziamento cervical e sobrevida. Os resultados sugerem que o EBV não participa isoladamente da carcinogênese oral / Abstract: The Epstein-Barr virus (EBV) is part of human herpesvirus family being associated with benign and malignant diseases head and neck. Its possible relation with oral squamous cell carcinoma (OSCC) has been studied. The aim of this study was to detect the presence of EBV in patients with OSCC and normal mucosa, correlating the findings with clinicopathologic variables, risk factors and patient's survival. Nested PCR was applies in paraffin embedded samples of OSCC being 20 samples of mouth floor, 25 tongue and 12 oropharyngeal. A control group composed of 19 normal oral mucosa samples was used. The virus was found in 10% of mouth floor samples, 12% of tongue not being detected in oropharynx. The prevalence in oral mucosa samples was 15.79%. There was no statistically significant differences between the virus presence and the variables: anatomical localization, gender, age, smoking, alcoholism, clinical stage, histological grade, neck dissection and patient's survival. The results suggest that EBV alone did not have participation in carcinogenesis or oral SCC / Mestre

Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-08T20:07:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thomasini_RonaldoLuis_M.pdf: 1552471 bytes, checksum: 69e020e777011a1dab1c773d2466694a (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Neste estudo, 29 pacientes adultos, transplantados de fígado foram monitorados (até 180 dias pós-transplante) para infecções ativas por HCMV, HHV-6 e HHV-7 usando Nested-PCR (N-PCR). O protocolo de imunossupressão foi baseado na combinação de esteróides e ciclosporina e profilaxia com ganciclovir não foi usada. Aciclovir foi usado como profilaxia para o Herpes simples. Um grupo controle foi estudado, N-PCR em DNA extraído de PBL e soro de 53 indivíduos sadios foram realizados. Destes indivíduos, 8 amostras de saliva foram coletadas para isolamento do HHV-7 e produção de controle positivo. DNA do HHV-7 foi detectado em 87,5% de saliva, em 28,3% de PBL e 0% de soro. Isolamento do vírus mostrou ser 100% correlato com N-PCR. Soro foi considerado a amostra de escolha para detectar infecção ativa por HHV-7. DNA do HHV-6, HHV-7 e HCMV foram, frequentemente, detectados em pacientes após transplante hepático (65,5%, 51,7% e 48,2%, respectivamente). A maioria dos pacientes com infecção ativa por mais que um vírus é infectado de forma seqüencial e não concorrente. Infecção ativa por HHV-7 ocorreu em muitos casos antes da infecção ativa por HCMV e/ou HHV-6 indicando que ele poderia ser um fator para reativação daqueles vírus. Nested-PCR para HCMV teve valor preditivo positivo de 50% e valor preditivo negativo de 100% para infecção sintomática. Neste estudo, o HCMV foi relacionado disfunção do enxerto, HHV-6 foi associado com pneumonite, encefalite, disfunção e rejeição do enxerto e predisposição para infecção oportunista. Em pacientes livres de HCMV e/ou HHV-6, nenhuma manifestação clínica nem achados laboratoriais significativos foram relacionados ao HHV-7. O tratamento antiviral com ganciclovir foi considerado satisfatório para o HCMV, mas para o HHV-6 e HHV-7, os dados não foram conclusivos. O aciclovir poderia ter demonstrado uma limitada atividade contra o HHV-7 / Abstract: In this study, 29 adult liver transplant patients were monitored (until day 180th posttransplantation) for HCMV, HHV-6 e HHV-7 active infections using Nested-PCR (N-PCR). Immunosuppression protocol was based on combinations of steroids and cyclosporine and no ganciclovir prophylaxis was used. Aciclovir was employed as Herpes simplex prophylaxis. A control group was studied; N-PCR in DNA extracted from PBL and serum of 53 healthy individuals was carried out. From these individuals, 8 samples of saliva were collected to design a positive control to N-PCR. HHV-7 DNA was detected in 87.5% of saliva, in 28.3% of PBL and 0% of serum. Virus isolation showed to be 100% correlated with N-PCR. Serum was considered to be the sample of choice to detect HHV-7 active infection. HHV-6, HHV-7 and HCMV DNA were frequently detected in patients after liver transplant (65.5%, 51.7% and 48.2%, respectively). The results show that few patients remain negative to active infection with betaherpesviruses after liver transplantation. Most of the patients with active infection with more than one virus were infected sequentially and not concurrently. HHV-7 active infection occurred in most of cases prior HCMV and HHV-6 active infections indicating that it could be a factor to reactivation of these viruses. HCMV Nested-PCR presented positive predictive value of 50% and negative predictive value of 100%. In this study, HCMV was related with graft dysfunction, HHV-6 was associated with pneumonitis, encephalitis, liver dysfunction, graft rejection and predisposition to opportunist infections. In HCMV and/or HHV-6 free patients, no clinical manifestation nor significant laboratory findings was related to HHV-7. Ganciclovir Antiviral treatment was considered satisfactory to HCMV symptomatic infections but to HHV-6 and HHV-7, no conclusive data was found. Aciclovir could be a limited activity against HHV-7 / Mestrado / Farmacologia / Mestre em Farmacologia

Orientador: Sandra Cecília Botelho Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-19T10:22:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thomasini_RonaldoLuis_D.pdf: 2991233 bytes, checksum: 570abfb75508069faffb192f2c6c5dcd (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Periodontite humana crônica é um processo inflamatório caracterizado por denso acúmulo de células imunes no tecido periodontal. A periodontite pode levar a perda do dente no paciente e a patogênese desta doença não é completamente conhecida. Este estudo testou a hipótese de que as células do infiltrado inflamatório podem abrigar betaherpesviruses e estes vírus estão ligados á subpopulação específicas de linfócitos. Fragmentos de tecido periodontal foram obtidas de pacientes afetados por periodontite e de indivíduos saudáveis. Imuno-histoquímica foi realizada para a contagem de células CD19+, céulas CD3+ e células CD4+ e CD8+. Reação em cadeia da polimerase e imuno-histoquímica foram realizados para detectar citomegalovírus, herpesvirus humanos 6 e 7 nas amostras. Como esperado, os tecidos coletados de indivíduos saudáveis não apresentaram nível significativo de infiltrado inflamatório e, portanto, foram excluídos dos procedimentos de imunofenotipagem. Os resultados mostraram que células CD19+ foram discretamente predomiantes sobre as células CD3+ no tecido periodontal afetado, mas estatisticamente não significativo. A subpopulação CD4+ de linfócitos estava significativamente em maior número que a subpopulação CD8+ de linfócitos (P=0,004), nas amostras. Citomegalovírus e herpesvírus humano 7 foram encontrados em locais afetados, mas não no tecido coletado de indivíduos saudáveis (P=0,04 e P=0,04, respectivamente). Herpesvirus humano 6 foi raramente detectado. Foi encontrado correlação entre citomegalovírus com menor relação de CD19+/CD3+ (P=0,003) e herpesvirus humano 7 com menor relação CD19+/CD3+ (P=0,003) e maior relação de CD4+/CD8+ ( P=0,002). Imuno-histoquímica foi negativa para citomegalovírus, herpesvirus humano 6 e herpesvirus humano 7 em todas as amostras. Este estudo mostra que citomegalovírus e herpesvírus humano 7 podem estar presentes em regiões afetadas pela periodontite, mas são incomuns em regiões saudáveis. Além disso, este estudo sugere que citomegalovírus pode ser relacionado ao infiltrado inflamatório, com predomínio de células CD3+ e, herpesvirus humano 7 pode estar relacionado ao infiltrado inflamatório com predomínio de células CD4+. Os dados sugerem que citomegalovírus e herpesvírus humano 7 podem estar presentes no infiltrado inflamatório, em estado de latência. No entanto, outros métodos deveriam ser realizados para confirmar esta hipótese / Abstract: Human chronic periodontitis is an inflammatory process characterized by dense accumulation of immune cells in the periodontal tissue. The periodontitis can lead to loss of teeth in the patient and the pathogenesis of this disease is not completely known. This study tested the hypothesis that cells within inflammatory infiltrate can harbor betaherpesviruses and these viruses are linked to specific lymphocyte subpopulation. Biopsies of periodontal tissue were taken from periodontitis affected and from healthy subjects. Immunohistochemistry was performed to count CD19+ cells, CD3+ cells, CD4+ and CD8+ cell subsets. Polymerase chain reaction and immunohistochemistry were performed to detected cytomegalovirus, human herpesvirus 6 and 7 in the samples. As expected, tissues collected from healthy subjects presented no significant level of inflammatory infiltration and therefore were excluded from immunostaining procedures. The results showed that CD19+ cells had discrete predominance over CD3+ cells in the periodontitis affected tissue but not statistically significant. CD4+ lymphocyte subset were significantly higher then CD8+ lymphocyte subset (P=0.004) in the samples. Cytomegalovirus and human herpesvirus 7 were found in affected sites but not in tissue collected from healthy subjects (P=0.04 and P=0.04, respectively). Human herpesvirus 6 was rarely detected. We found a correlation between cytomegalovirus with lower CD19+/CD3+ ratios (P=0.003) and human herpesvirus 7 with lower CD19+/CD3+ ratio (P=0.003) and higher CD4+/CD8+ ratios (P=0.002). Imunohistochemistry was negative for cytomegalovirus, human herpesvirus 6 and human herpesvirus 7 in the total of samples. This study shows that cytomegalovirus and human herpesvirus 7 can be present in periodontitis affected sites but are uncommon in healthy sites. Moreover, this study suggests that cytomegalovirus can be related to inflammatory infiltrate with predominance of CD3+ cells and, human herpesvirus 7 can be related to inflammatory infiltrate with predominance of CD4+. The data suggest that cytomegalovirus and human herpesvirus 7 could be present in the inflammatory infiltrate in latent state. However, different methods should be performed to confirm this hypothesis / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica

O Herpesvírus 8 humano (HHV-8) é endêmico em populações africanas e indígenas da região Amazônica. A infecção nestas populações acontece durante a infância e, na África, envolve o contato íntimo no ambiente intrafamiliar. Diversos estudos confirmam a distribuição geográfica dos diferentes subtipos de HHV-8, sendo que o subtipo E é típico das populações indígenas. Objetivos: 1. Caracterizar o(s) subtipo(s) de HHV-8 que circula(m) em população indígena da Amazônia brasileira baseado na análise da região ORF K1 do vírus; 2. Construir a árvore filogenética dos subtipos virais encontrados; 3. Comparar filogeneticamente os subtipos encontrados com os subtipos prevalentes em outras populações indígenas do Brasil e de outros países da América do Sul; 4. Calcular a taxa de substituição para a região VR1 do HHV-8 para as amostras estudadas; 5. Estimar a data de entrada do vírus na população do estudo; 6. Investigar a dinâmica de transmissão do vírus no ambiente intrafamiliar; 7. Averiguar se há correlação entre os alelos de HLA classe I (A e B) e II (DQB1 e DRB1) e suscetibilidade à infecção por HHV-8. Casuística e métodos: Estudo de soroprevalência da infecção por HHV-8 em amostra de população indígena da Amazônia brasileira utilizando IFI para detecção de antígenos da fase latente (LANA) e lítica (Lítico) do vírus. Análise filogenética da amostras encontradas utilizando-se o DNA/HHV-8 extraído de amostras de saliva, submetidas à reação de nested PCR para amplificar as regiões hipervariáveis VR1 e VR2. Cálculo da taxa de substituição do HHV-8, utilizando-se os métodos de distância e técnica bayesiana. Estimar a data do ancestral comum mais recente para as amostras em estudo, utilizando-se o programa BEAST. Tipagem de HLA de indivíduos positivos e negativos para a infecção por HHV-8, utilizando-se a técnica de PCR-SSO. Resultados: A soroprevalência geral da infecção por HHV-8 na população em estudo foi de 75,3% (399/530). Observou-se que a soropositividade dos filhos está correlecionada com a soropositividade materna. O único subtipo viral encontrado foi o subtipo E. A taxa de substituição de nucleotídeos do HHV-8 utilizando a região VR1 foi da ordem de 6x10-4 substituições por sítio por ano (s/s/a). Ao analisar todas as seqüências estudadas o ancestral comum mais recente está em torno de 138 anos. Não houve correlação entre a susceptibilidade à infecção por HHV-8 e alelos de HLA classe I ou II. Conclusões: A população estudada é endêmica para a infecção por HHV-8. A infecção ocorre principalmente na infância, por via horizontal não-sexual, e a transmissão se dá provavelmente pela saliva. Assim como em outras populações endêmicas da África, a soropositvidade dos filhos está correlacionada com a soropositividade das mães. Confirmando achados anteriores, o único subtipo do HHV-8 circulante na população estudada, foi o subtipo E. Nossos dados sugerem que a região do gene VR1 do HHV-8 evolui com uma taxa de 6x10-4 substituições por sítio por ano (s/s/a), e que o ancestral comum mais recente do vírus, a partir das amostras analisadas está em torno de 138 anos. Os dados sugerem, também, que não há correlação entre a susceptibilidade à infecção por HHV-8 e os alelos de HLA classe I ou II. / The human herpesvirus 8 (HHV-8) is endemic in Africa and Amerindian populations from Amazon region. The infection in those populations occurs during childhood and, in Africa, involves a close contact in intrafamilial environment. Several studies confirm the geographical distribution of different subtypes of HHV-8, and the subtype E is typical of the Amerindian population. Objectives: 1. To characterize the HHV-8 subtypes circulating in Amerindian population from Brazilian Amazon, based on the analysis of ORF K1 region of the virus. 2. To construct a phylogenetic tree of viral subtypes found among Amerindians 3. To compare by phylogenetic methods the subtypes found in Mapuera Amerindians with the subtypes prevalent in others Amerindians populations of Brazil and South America 4. To determine the substitution rate of VR1 region of HHV-8 for the sequences obtained in the present study 5. To estimate the date of entry of the viruses in the Mapuera population 6. To investigate the dynamic of transmission of the virus in the intrafamilial environment 7. To investigate if there is a correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I (A and B) and II (DQB1 and DRB1) alleles. Patients and methods: The seroprevalence of HHV-8 infection in a sample of the indigenous population of the Brazilian Amazon was carried out using IFA to detect antibodies to latent (LANA) and lytic phase antigens of HHV-8. Phylogenetic analysis of the sequences was performed by using the DNA extracted from samples of saliva, using a nested PCR to amplify the hypervariable regions VR1/ VR2 of HHV-8. Estimation of the substitution rate of HHV-8 nucleotides was performed by using the method of distance and the Bayesian technique. Estimates of the time of the most recent common ancestor (TMRCA) for all samples studied were done by using the BEAST program. HLA typing of positive and negative subjects for HHV-8 infection was performed by using the PCR-SSO technique. Results: The overall HHV-8 seroprevalence was 75.3% (399/530). There was a positive correlation between soropositivity of children and maternal seropositivity. The only viral subtype found was subtype E. The substitution rate of HHV-8 using the VR1 region was estimated around 6x10-4 substitutions per site per year (s / s / y). By using this rate of substitution, the TMRCA of the Mapuera viruses sequences was estimated to be around 138 years. There was no correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I or II alleles. Conclusions: The population studied is endemic for HHV-8 infection. The infection occurs mainly in childhood, by horizontal, nonsexual transmission, probably by saliva. As in endemic populations of Africa, the soropositvity of children is positively correlated with the seropositivity of the mothers. In agreement with previous reports, the subtype E was the only HHV-8 subtype found in Mapuera Amerindians. Our data suggest that the VR1 gene region of HHV-8 evolves with a rate of 6x10-4 substitutions per site per year (s / s / y), which results in a time of the most recent common ancestor for Mapuera HHV-8 sequences of 138 years. There was no correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I or II alleles.

O Herpesvírus 8 humano (HHV-8) é endêmico em populações africanas e indígenas da região Amazônica. A infecção nestas populações acontece durante a infância e, na África, envolve o contato íntimo no ambiente intrafamiliar. Diversos estudos confirmam a distribuição geográfica dos diferentes subtipos de HHV-8, sendo que o subtipo E é típico das populações indígenas. Objetivos: 1. Caracterizar o(s) subtipo(s) de HHV-8 que circula(m) em população indígena da Amazônia brasileira baseado na análise da região ORF K1 do vírus; 2. Construir a árvore filogenética dos subtipos virais encontrados; 3. Comparar filogeneticamente os subtipos encontrados com os subtipos prevalentes em outras populações indígenas do Brasil e de outros países da América do Sul; 4. Calcular a taxa de substituição para a região VR1 do HHV-8 para as amostras estudadas; 5. Estimar a data de entrada do vírus na população do estudo; 6. Investigar a dinâmica de transmissão do vírus no ambiente intrafamiliar; 7. Averiguar se há correlação entre os alelos de HLA classe I (A e B) e II (DQB1 e DRB1) e suscetibilidade à infecção por HHV-8. Casuística e métodos: Estudo de soroprevalência da infecção por HHV-8 em amostra de população indígena da Amazônia brasileira utilizando IFI para detecção de antígenos da fase latente (LANA) e lítica (Lítico) do vírus. Análise filogenética da amostras encontradas utilizando-se o DNA/HHV-8 extraído de amostras de saliva, submetidas à reação de nested PCR para amplificar as regiões hipervariáveis VR1 e VR2. Cálculo da taxa de substituição do HHV-8, utilizando-se os métodos de distância e técnica bayesiana. Estimar a data do ancestral comum mais recente para as amostras em estudo, utilizando-se o programa BEAST. Tipagem de HLA de indivíduos positivos e negativos para a infecção por HHV-8, utilizando-se a técnica de PCR-SSO. Resultados: A soroprevalência geral da infecção por HHV-8 na população em estudo foi de 75,3% (399/530). Observou-se que a soropositividade dos filhos está correlecionada com a soropositividade materna. O único subtipo viral encontrado foi o subtipo E. A taxa de substituição de nucleotídeos do HHV-8 utilizando a região VR1 foi da ordem de 6x10-4 substituições por sítio por ano (s/s/a). Ao analisar todas as seqüências estudadas o ancestral comum mais recente está em torno de 138 anos. Não houve correlação entre a susceptibilidade à infecção por HHV-8 e alelos de HLA classe I ou II. Conclusões: A população estudada é endêmica para a infecção por HHV-8. A infecção ocorre principalmente na infância, por via horizontal não-sexual, e a transmissão se dá provavelmente pela saliva. Assim como em outras populações endêmicas da África, a soropositvidade dos filhos está correlacionada com a soropositividade das mães. Confirmando achados anteriores, o único subtipo do HHV-8 circulante na população estudada, foi o subtipo E. Nossos dados sugerem que a região do gene VR1 do HHV-8 evolui com uma taxa de 6x10-4 substituições por sítio por ano (s/s/a), e que o ancestral comum mais recente do vírus, a partir das amostras analisadas está em torno de 138 anos. Os dados sugerem, também, que não há correlação entre a susceptibilidade à infecção por HHV-8 e os alelos de HLA classe I ou II. / The human herpesvirus 8 (HHV-8) is endemic in Africa and Amerindian populations from Amazon region. The infection in those populations occurs during childhood and, in Africa, involves a close contact in intrafamilial environment. Several studies confirm the geographical distribution of different subtypes of HHV-8, and the subtype E is typical of the Amerindian population. Objectives: 1. To characterize the HHV-8 subtypes circulating in Amerindian population from Brazilian Amazon, based on the analysis of ORF K1 region of the virus. 2. To construct a phylogenetic tree of viral subtypes found among Amerindians 3. To compare by phylogenetic methods the subtypes found in Mapuera Amerindians with the subtypes prevalent in others Amerindians populations of Brazil and South America 4. To determine the substitution rate of VR1 region of HHV-8 for the sequences obtained in the present study 5. To estimate the date of entry of the viruses in the Mapuera population 6. To investigate the dynamic of transmission of the virus in the intrafamilial environment 7. To investigate if there is a correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I (A and B) and II (DQB1 and DRB1) alleles. Patients and methods: The seroprevalence of HHV-8 infection in a sample of the indigenous population of the Brazilian Amazon was carried out using IFA to detect antibodies to latent (LANA) and lytic phase antigens of HHV-8. Phylogenetic analysis of the sequences was performed by using the DNA extracted from samples of saliva, using a nested PCR to amplify the hypervariable regions VR1/ VR2 of HHV-8. Estimation of the substitution rate of HHV-8 nucleotides was performed by using the method of distance and the Bayesian technique. Estimates of the time of the most recent common ancestor (TMRCA) for all samples studied were done by using the BEAST program. HLA typing of positive and negative subjects for HHV-8 infection was performed by using the PCR-SSO technique. Results: The overall HHV-8 seroprevalence was 75.3% (399/530). There was a positive correlation between soropositivity of children and maternal seropositivity. The only viral subtype found was subtype E. The substitution rate of HHV-8 using the VR1 region was estimated around 6x10-4 substitutions per site per year (s / s / y). By using this rate of substitution, the TMRCA of the Mapuera viruses sequences was estimated to be around 138 years. There was no correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I or II alleles. Conclusions: The population studied is endemic for HHV-8 infection. The infection occurs mainly in childhood, by horizontal, nonsexual transmission, probably by saliva. As in endemic populations of Africa, the soropositvity of children is positively correlated with the seropositivity of the mothers. In agreement with previous reports, the subtype E was the only HHV-8 subtype found in Mapuera Amerindians. Our data suggest that the VR1 gene region of HHV-8 evolves with a rate of 6x10-4 substitutions per site per year (s / s / y), which results in a time of the most recent common ancestor for Mapuera HHV-8 sequences of 138 years. There was no correlation between susceptibility to HHV-8-infection and HLA class I or II alleles.

Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-13T09:16:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andrade_PaulaDurante_M.pdf: 3994483 bytes, checksum: eca47ce9f7df65d68a6da3ad72ad056b (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O Citomegalovírus Humano (HCMV) é o principal causador de complicações pós-transplante. Métodos específicos que permitam identificar, precocemente, os pacientes com risco de desenvolvimento de doença, para os quais tratamento é indicado, têm sido requeridos, a fim de que poucos pacientes sejam desnecessariamente tratados e para a efetiva instituição terapêutica. A "Nested-PCR", dupla Reação em Cadeia da Polimerase, é um teste comumente utilizado no diagnóstico da infecção ativa por HCMV, contudo, quando realizada em leucócitos do sangue periférico, devido à sua alta sensibilidade, não apresenta boa correlação com o desenvolvimento de doença por HCMV. A detecção do DNA do HCMV no soro, pela PCR, tem sido associada com o desenvolvimento de doença por HCMV. Neste estudo, nós aplicamos a "Nested-PCR" em leucócitos do sangue periférico (denominada "L-PCR"), o método Convencional do Laboratório, e em soro ("sPCR"), para o diagnóstico da infecção ativa por HCMV, a fim de estabelecermos a correlação dos resultados obtidos, de ambos os métodos, com o desenvolvimento de infecção sintomática. Com este propósito, nós avaliamos, prospectivamente, amostras de 37 pacientes, 20 submetidos a transplante renal, e 17 submetidos a transplante de células tronco hematopoiéticas. Para excluir resultados falso negativos, na reação de amplificação pela "sPCR", um controle interno foi construído e todas as reações foram realizadas utilizando-o. De acordo com os critérios estabelecidos neste estudo, 21 pacientes (21/37 - 57%) desenvolveram infecção ativa por HCMV. Todos os pacientes com infecção ativa por HCMV foram positivos para a "L-PCR" (p= 0,0003). A "sPCR" foi positiva para somente 10 pacientes (10/37 - 27%) (p= 0,01). Resultados discordantes foram observados em 11 pacientes que foram positivos para infecção ativa para a "L-PCR", mas negativos para a "sPCR", 5 dos quais desenvolveram sintomas clínicos para o HCMV. O coeficiente Kappa de concordância observado para ambos os métodos foi de 0,44 (acordo moderado). Em dezesseis pacientes (43%), dos 37 estudados, não foram observados resultados positivos por nenhum dos métodos empregados - não desenvolveram infecção ativa -, contudo, 2 destes desenvolveram sintomas clínicos de provável doença por HCMV e um apresentou, posteriormente, biópsia confirmativa para doença por HCMV. Sintomas clínicos foram observados em 14 pacientes, em 12 deles infecção ativa foi diagnosticada através da "L-PCR" (p= 0,007) e, em 7, através da "sPCR" (p= 0,02). Ausência de sintomas clínicos foram observados em 9 pacientes nos quais a "L-PCR" detectou infecção ativa e em 3 pacientes nos quais a "sPCR" detectou (coeficiente Kappa 0,57, acordo moderado). De 14 pacientes sintomáticos, 2 pacientes soronegativos para o HCMV que receberam rins soropositivos desenvolveram infecção primária. Analizando os dois métodos para o diagnóstico da infecção ativa, nós observamos maior sensibilidade e valor preditivo negativo da "L-PCR" ("L-PCR" 100% vs. "sPCR" 62%), e maior especificidade e valor preditivo positivo da "sPCR" ("sPCR" 81% vs. "L-PCR" 50% e 72%). O valor dos testes positivos, "L-PCR" e "sPCR", para predizer doença por HCMV foram, respectivamente, 57% e 70%, e o valor dos testes negativos para predizer que doença não desenvolveria foi 88% para "L-PCR" e 74% para a "sPCR". A análise comparativa entre os primeiros resultados positivos para a presença de infecção ativa por HCMV e o aparecimento de sintomas mostrou que a "L-PCR" precedeu o inicio dos sintomas clínicos 19 dias (mediana) em 8 pacientes. Em 2 pacientes, a "sPCR" precedeu 7 dias (mediana) a "L-PCR" na detecção de infecção sintomática por HCMV. A "L-PCR" e a "sPCR" foram considerados métodos complementares para o diagnóstico e monitoramento da infecção sintomática por HCMV. / Abstract: The Human Cytomegalovirus (HCMV) is the main cause of post-transplant complications. Specific methods that allow to identify early patients with risk of developing disease for which treatment is indicated, have been required so that few patients are treated unnecessarily and for the effective therapeutic institution. The "Nested-PCR" has been commonly used in the diagnosis of HCMV infection, however, when performed in peripheral blood leukocytes, due to its high sensitivity does not present good correlation with the development of HCMV disease. Detection of HCMV DNA in serum by PCR has been associated with the development of HCMV disease. In this study, we apply the "Nested-PCR" in peripheral blood leukocytes (termed "L-PCR"), the conventional method of Laboratory, and in serum ("sPCR"), for the diagnosis of active HCMV infection, in order to establish the correlation of results obtained of both methods with the development of symptomatic infection. With this purpose, we evaluated prospectively samples of 37 patients, 20 undergoing kidney transplantation, and 17 submitted to haematopoietic stem cells transplantation. To exclude false negative results in the amplification reaction by "sPCR", an internal control was constructed and all reactions were carried out by using it. According to the criteria established in this study, 21 patients (21/37 - 57%) developed active HCMV infection. All patients with active HCMV infection were positive by LPCR (p= 0,0003). The serum PCR were active HCMV infection positive for only 10 patients (10/37 - 27%) (p= 0,01). Discordant results were observed in 11 patients who had active HCMV infection positive for "L-PCR" but negative for "sPCR", of which 5 developed clinical symptoms for HCMV. The observed Kappa coefficient of agreement for both assays was 0,44 (moderate agreement). Sixteen of 37 patients (43%) did not develop active HCMV infection by neither of the methods employed, however 2 of these developed clinical symptoms of probable HCMV disease and one presented later confirmative biopsy for HCMV disease. Clinical symptoms were observed in 14 patients, in 12 of whom active infection was diagnosed by "LPCR" (p= 0,007) and in 7 by "sPCR" (p= 0,02). Absence of clinical symptoms were observed in 9 patients in which the "L-PCR" detected active HCMV infection and in 3 patients in which the "sPCR" detect it (kappa coefficient 0,57, moderate agreement). Of the fourteen symptomatic patients, 2 HCMV-seronegative patients who received seropositive Kidneys developed primary infection. Analyzing the two methods for the diagnosis of active infection, we observed higher sensitivity and negative predictive value of the "L-PCR" ("L-PCR" 100% vs. "sPCR" 62%), and higher specificity and positive predictive value of "sPCR" ("sPCR" 81% vs. "L-PCR" 50% e 72%). The value of positive "L-PCR" or "sPCR" tests to predict HCMV disease were respectively 57% and 70% and, the value of the negative tests to predict that HCMV disease would not develop was 88% to "L-PCR" and 74% to "sPCR". The comparative analysis between the first positive results for the presence of active HCMV infection and the onset of symptoms, showed that the "L-PCR" test preceded the onset of clinical symptoms 19 days (median) in 8 patients. In two patients the "sPCR" preceded 7 days (median) the "L-PCR" in the detection of symptomatic HCMV infection. Therefore the "L-PCR" and the "sPCR" were considered complementary methods for the diagnosis and manegement of HCMV symptomatic infection. / Mestrado / Mestre em Farmacologia

Orientadores: Sandra Cecília Botelho Costa, Sandra Helena Alves Bonon / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-24T11:43:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peigo_MurilodeFreitas_M.pdf: 1466925 bytes, checksum: 094e2cd00645843fd5fa2c56ca66c2d5 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES) é uma patologia sistêmica do tecido conjuntivo, que se apresenta de maneira variada na dependência do órgão afetado, da gravidade de seu acometimento e da idade do paciente, tendo influência de fatores raciais, de padrões imunológicos e ambientais. Pacientes lúpicos têm grande predisposição para desenvolver infecções graças à imunossupressão induzida pela própria doença como pelo uso de vários medicamentos em seu tratamento. Infecções causadas por herpesvírus, principalmente o Citomegalovírus Humano (CMV) e o Epstein-Barr (EBV), têm sido implicadas em várias doenças autoimunes graves, incluindo o LES. A reativação dos herpesvírus 6 e 7 (HHV-6 e HHV-7) geralmente ocorre em pacientes imunodeprimidos, mas seus papéis ainda são pouco estudados. As infecções por herpesvírus têm influência tanto no início do processo autoimune quanto na exacerbação da progressão da doença. A identificação de pacientes com alto risco de desenvolver doença pelos herpesvírus pode ser realizada utilizando técnicas de detecção de infecção ativa, como a Reação em Cadeia da Polimerase (Nested-PCR) e a detecção do antígeno pp65 do CMV (Antigenemia). Dependendo do caso, estes pacientes podem receber tratamento com antivirais. Diante do exposto, os objetivos deste estudo foram: monitorizar os pacientes com LES em relação à infecção ativa por CMV, EBV, HHV-6 e HHV-7, utilizando as técnicas de Nested-PCR e de antigenemia, bem como avaliar o impacto clínico dessas infecções. Foram incluídos neste trabalho, amostras de sangue de 71 pacientes em seguimento no Departamento de Reumatologia da Faculdade de Ciências Médicas ¿ UNICAMP, com diagnóstico de LES confirmado, sendo que 20/71 (28%) estavam com o lúpus ativo (SLEDAI ? 8) e 51/71 (72%) dos pacientes não tinham atividade lúpica (SLEDAI < 8). Das amostras de sangue pesquisadas, 10/71 (14%) foram positivas para os herpesvírus estudados, sendo que 90% destes pacientes com infecção ativa apresentavam o lúpus em atividade (p?0,006). Infecção ativa pelo CMV ocorreu em 4 pacientes (5,6%). HHV-7 foi detectado em 4 amostras (5,6%). Dois outros pacientes apresentaram dupla infecção por CMV e HHV-7 (2,8%). Infecção ativa pelo EBV e HHV-6 não foi detectada em nenhuma das amostras analisadas. Dois pacientes foram a óbito, sendo que um deles evoluiu com sepse de foco pulmonar (provável doença por CMV) e o outro com sepse por Psedomonas aeruginosa. Diante dos resultados obtidos, podemos observar que a infecção ativa pode ocorrer nos pacientes com LES, principalmente naqueles com a doença em atividade. Poucos estudos têm avaliado o impacto destas infecções no cuidado diário dos pacientes com LES. Acreditamos que este trabalho seja pioneiro e será de fundamental importância, contribuindo com este grupo de pacientes. Entretanto, futuros estudos deverão ser implementados com um número maior de pacientes e de coletas/paciente, principalmente naqueles com LES em atividade, que foram demonstrados com aqueles com fator de risco aumentado / Abstract: Systemic lupus erythematosus (SLE) is a connective tissue systemic pathology that presents itself in several ways, depending on the organ affected, the seriousness of the disease and patient¿s age, being influenced by racial factors, immunologic and environmental patterns. SLE patients have great predisposition to develop infections due to the immunosuppression induced by the disease itself and by the use of medicine in the treatment. Infections caused by herpesvirus, especially Human Cytomegalovirus (CMV) and Epstein-Barr (EBV), have been developed into several serious autoimmune diseases, including SLE. Herpesvirus 6 and 7 (HHV-6 and HHV-7) reactivation generally occurs in immunodepressed patients, but their roles are unclear. Herpesvirus infections have influence both on the beginning of the autoimmune process and on the aggravation of the disease progression. The patients that present high risks of developing herpesvirus related diseases can be identified using active infection detection techniques, such as the Nested polymerase chain reaction (Nested-PCR) and the CMV pp65 antigen detection (antigenemia). Depending on the case, the patients can receive treatment with antivirals. Face to the exposed, the objectives of this study were: to monitor the patients with SLE with regard to active infection by CMV using Nested-PCR and antigenemia techniques, and EBV, HHV-6, HHV-7 in serum, as well as to evaluate the clinic impact to these infections. There were included in this work blood samples of 71 patients that are being treated at the Department of Rheumatology, Faculty of Medical Sciences ¿ University of Campinas - UNICAMP, with a confirmed SLE diagnosis, given that 20/71 (28%) had active lupus (SLEDAI ? 8) and 51/71 (72%) of the patients didn¿t present lupic activity (SLEDAI < 8). Considering the blood samples researched, 10/71 (14%) were positive for the studied herpesvirus, and 90% of the patients with active infection presented lupus in activity (p ? 0,006). Active infection by CMV was observed in 4 patients (5,6%). HHV-7 was detected in 4 samples (5,6%). Two other patients presented double infection by CMV and HHV-7 (2,8%). Active infection by EBV and HHV-6 was not detected in any of the analyzed samples. Two patients have deceased, whose conditions developed into pulmonary sepsis (probable disease by CMV) and into Psedomonas aeruginosa sepsis, respectively. After analyzing the achieved results, we observe that active infection can appear in patients with SLE, especially in those with the disease in activity. Few studies have evaluated the impact of these infections on the daily care of patients with SLE. In this sense, we believe that this work is pioneer and that it will be of fundamental importance, contributing to this group of patients. However, future studies should be implemented, with a larger number of patients and samples, especially those with SLE in activity, which are the ones with increased risk factor as shown / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica