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CA 125 e HER-2/neu em tumores e ovario do tipo borderline : estudo imunohistoquimico e por hibridização in situ por fluorescencia (FISH)

Heinrich, Juliana Karina Ruiz 23 March 2001 (has links)
Orientador : Fatima Aparecida Bottcher Luiz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-27T17:22:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Heinrich_JulianaKarinaRuiz_M.pdf: 18386840 bytes, checksum: c19d3d316185e0ce073e85707046d04e (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Marcadores para a caracterização biológicade tumores de ovário borderfíne são pouco explorados. Assim sendol foram investigados o marcador tumoral CA125 e o oncogene HER-2jneuatravés de ensaios imunohistoquímicos(lHQ) e de hibridização ín sítu por fluorescência (FISH). Foram incluídos 45 tumores serosos e mucinosos de estágios clínicos 11II e TIl.A expressão de CA125foi positiva em 49% dos casos (22/45) e pôde ser associada ao tipo seroso. Embora superexpressão da proteína Her-2jneu não tenha sido encontrada através de lHQI resultados alterados de F1SHforam encontrados em 16% dos casos (7/45). Os ganhos foram detectados em baixo número de cópias (máximo de 4/célula) e, assim, não foram considerados como amplificação. Não foi encontrada associação entre a expressão do marcador CA125e os resultados de FISH,bem como entre este último e o tipo histológico. Por outro ladol resultados anormais de FISH representados por extensa aneussomia do cromossomo 17 puderam ser associados ao estágio clínico avançado. Mesmo na ausência de confirmação estatístical os dois casos que apresentaram recidiva eram do tipo serosol estágio clínico TI11positivos para CA125e apresentaram anomalias por FISH. Os dados apresentados sugerem que HER-2/neupOde não estar envolvidona iniciação desses tumores masl possivelmentel na progressão destes para fenótipos mais agressivos / Abstract: Since Borderline Ovarian Tumors (BOTs) biological markers and behavior are not well understood, we studied CA125and HER2-neugene status by either immunohistochemical and fluorescence in situ hybridization of 45 mucinous and serous borderline specimensof clinical stage l, TI and TIl. CA 125 expression was found in 49% of the samples(22/45) and associatedwith serous histological type. Although HER2 protein overexpression was not found with the HercepTest immunohistochemical assay, abnormal FISHresults were detected in 16% (7/45) involving specific chromosome 17 gain, specific HER2gain or both chromosome and gene gain. The gains for either gene or chromosome were detected at low levels (maximum 4 copies/cell)and in a low percentageof cellsper specimenor analyzed area which was consideredgene copy number gain and not gene amplification. Association was not found between CA 125 expression and HER2 FISH status. No significant relationship was found between FlSH status and histological type. Abnormal FISH results were associated to advanced clinical stage. Even in the absence of statistical support, the two patients with tumor recurrence had a serous histological type, clinical stage lTI, CA125 positive tumor with both gene and chromosome gains. The data suggest that the HER2-neugene may not be involved on tumor initiation but on its progression / Mestrado / Mestre em Ciências Médicas
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Preparação e caracterização de membranas a base de material hibrido organo-inorganico e avaliação da permeabilidade a gases

Jose, Nadia Mamede 31 July 2018 (has links)
Orientador : Inez Valeria Pagotto Yoshida / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-31T22:06:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose_NadiaMamede_D.pdf: 4063637 bytes, checksum: e3a00c388ad2721825333df38909d224 (MD5) Previous issue date: 2001 / Doutorado
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Estudo da estrutura molecular dos cromossomos supranuméricos em Moenkhausia sanctaefilomenae (Teleostei, Characiformes, Characidae) /

Scudeler, Patrícia Elda Sobrinho. January 2010 (has links)
Resumo: Os chamados cromossomos supranumerários ou B, também denominados de cromossomos extras ou acessórios, são elementos genômicos adicionais e não homólogos aos do complemento A. Alguns estudiosos consideram que os cromossomos B poderiam ter sido originados dos cromossomos do complemento cariotípico e posteriormente seguido sua própria evolução, mas existem também outras hipóteses a respeito disso. A presença desse tipo de cromossomo tem sido descrita em animais e plantas e estes elementos estruturais extras constituem material genético de origem e função geralmente desconhecidas. As mudanças no complemento cariotípico relacionadas à presença dos cromossomos B e a sua distribuição têm sido descritas como participantes dos mecanismos evolutivos em vertebrados. Entre os peixes, principalmente da fauna Neotropical, a presença de cromossomos B apresenta-se de forma expressiva entre as espécies, sendo de grande interesse para estudos sobre sua estrutura, origem e função no processo de diversificação biológica. Estes cromossomos têm um comportamento diferencial, quando submetidos à coloração por bandamento C, geralmente se apresentando total ou parcialmente heterocromáticos e às vezes eucromáticos. Essas características podem ser uma forte evidência da sua provável origem e evolução independente. Portanto, sabendo-se que o entendimento sobre os cromossomos B depende de intensivas análises citogenéticas e moleculares, e com o intuito de entender a natureza dos processos envolvidos na evolução desses cromossomos, no presente trabalho foram analisados cinco populações de Moenkhausia sanctaefilomenae e as espécies Moenkhausia cosmops e Moenkhausia oligolepis pertencentes a diferentes bacias hidrográficas brasileiras. Foram utilizadas em exemplares de M. sanctaefilomenae, população do ribeirão Araquá, técnicas citogenéticas básicas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The so-called supernumerary or B chromosomes, also known as extra or accessory chromosomes, are additional genomic elements non-homologous to those from the standard or A complement. Some experts argue that B chromosome would have been derived from the standard karyotype that have undergone their own evolutionary history, bout other hypotheses have also been proposed. The occurrence of these chromosomes has been described in both animals and plants but the origin and function of such extra structural elements remains poorly understood. Karyotypical changes related to the presence of B chromosomes and their distribution have been reported as evolutionary mechanisms in vertebrates. Among fish, mainly neotropical ones, B chromosomes are expressively found in many species, justifying their great interest for studies about structure, origin and function during biological diversification processes. These chromosomes have a differential behavior when submitted to C-banding, being entirely or partially heterochromatic or else euchromatic. These features might be a reliable evidence of their probable independent origin and evolution. Therefore, the understanding about B chromosomes depends on intensive cytogenetic and molecular analyses, and in order to comprehend the nature of their evolutionary processes, five populations of Moenkhausia sanctaefilomenae and the species Moenkhausia cosmops and Moenkhausia oligolepis from different Brazilian hydrographic basins were analyzed in the present work. Basic cytogenetic (Giemsa staining, silver-stained NOR location and C-banding) and molecular (base-specific fluorochromes, 18S rDNA and 5S rDNA fluorescent in situ hybridization) techniques were applied on specimens of M. sanctaefilomenae from Araquá stream, to verify particularities related to heterochromatin distribution and B chromosomes, representing an interesting model for further molecular... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Adriane P. Wasko / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: Sanae kasahara / Banca: Débora Diniz Bezerra / Banca: Orlando Moreira Flho / Doutor
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Síntese e avaliação biológica de novos híbridos tuberculostático-chalcona como potenciais agentes contra a tuberculose /

Assis, Leticia Ribeiro de. January 2017 (has links)
Orientador: Luis Octavio Regasini / Coorientador: Fernando Rogério Pavan / Banca de: Cristiane Duque / Banca de: Márcio José Tiera / Resumo: A tuberculose (TB) é uma doença infecciosa provocada pelo Mycobacterium tuberculosis (MTB), sendo considerada um problema de saúde pública devido ao alto número de casos e óbitos relatados. Considerando que uma ampla variedade de chalconas (CHA) naturais e sintéticas vêm demonstrando atividade contra o MTB, o presente trabalho propôs a síntese de novos híbridos moleculares tuberculostático-chalcona contra o MTB. A obtenção dos híbridos moleculares foi realizada em três etapas: i) síntese das chalconas; ii) síntese das hidrazidas dos ácidos pirazinoico (PZA) e nalidíxico (NDX); e iii) síntese dos híbridos moleculares pirazinamida-chalcona (PZA-CHA, série I) e ácido nalidíxico-chalcona (NDX-CHA, série II). A partir da reação entre as chalconas com as hidrazidas do ácido pirazinoico ou do ácido nalidíxico, foram obtidas 26 N-acilhidrazonas inéditas, sendo 13 da série I e 13 da série II com rendimentos que variaram de 4 a 63%. As N-acilhidrazonas das séries I e II foram submetidas a ensaios de atividade antimicobacteriana in vitro contra cepa de M. tuberculosis HR37Rv ATCC 27294. Dentre os 26 híbridos moleculares avaliados, o híbrido para¬-metilado no anel B 61A (série II) apresentou atividade contra o MTB, exibindo concentração inibitória mínima de 37,1 µmol/L. Esse dado evidenciou que a hibridação molecular foi eficiente na obtenção de uma entidade química inédita com ação contra o MTB. / Abstract: Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by Mycobacterium tuberculosis (MTB), wich is considered as a public health problem, due high number cases and deaths reported. Whereas a wide range of natural and synthetic chalconas (CHA) has presented activity against MTB, this study proposes the synthesis of new tuberculostatic-chalcone as molecular hybrids against MTB. Molecular hybrids were obtained in three stages: i) synthesis of chalcones; ii) synthesis of pirazinoic (PZA) and nalidixic (NDX) acid hydrazides; iii) synthesis of molecular pirazinamide-chalcone (PZA-CHA, serie I) and nalidixic acid-chalcone (NDX-CHA, serie II) hydrids. From reaction between chalcones and pirazinoic and nalidixic acid hydrazides were synthesized 26 new N-acylhydrazones. Among these, 13 from serie I and 13 from serie II with yields ranging from 4 to 63%. N-acylhydrazones were evaluated against Mycobacterium tuberculosis H37Rv ATCC 27294 strain. Among 26 evaluated molecular hybrids, para-methylated on ring B hybrid 61A (serie II) displayed potent activity against MTB at minimal inhibitory concentration of 37.1 µmol/L, evidencing hybridization molecular was efficient for anti-MTB chemical entity production. / Mestre
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Síntese e avaliação da atividade antiproliferativa de novos compostos planejados por hibridação molecular da Curcumina e do Resveratrol

SILVA, Matheus de Freitas 26 February 2016 (has links)
O câncer é uma doença caracterizada pela proliferação descontrolada de células que tem a capacidade de invadir tecidos adjacentes e formar metástase. A quimioterapia representa uma abordagem clínica importante no tratamento do câncer, contudo sua eficácia é limitada devido a baixa seletividade dos medicamentos utilizados e o desenvolvimento de resistência por parte das células tumorais. Diante do contexto, é crucial a busca por novas substâncias que possam melhorar as propostas terapêuticas para o tratamento do câncer. A atividade antitumoral da curcumina (5), um composto natural derivado da Curcuma longa, tem sido amplamente relatada. Da mesma forma, o resveratrol (7), um polifenol presente em uma variedade de fontes alimentares tem sido considerado um potencial agente quimiopreventivo/quimioterapêutico. Contudo, a aplicação clínica desses compostos tem sido limitada, devido a baixa solubilidade e biodisponibilidade. Dessa forma, este trabalho visou à síntese, caracterização e avaliação da atividade antiproliferativa de oito diferentes compostos (PQM-160-167), dos quais 6 contêm domínios estruturais em analogia à curcumina (5) e ao resveratrol (7); e 2 são análogos da curcumina (5). O potencial antiproliferativo dos compostos sintetizados foi avaliado sobre diferentes linhagens derivadas de tumores humanos e os resultados mostraram que as substâncias PQM-162 e PQM-163, que são híbridos de curcumina-resveratrol, foram mais efetivos em reduzir a viabilidade de células MCF 7 (IC50 para PQM-162 = 40,49 ± 1,01 µM e PQM-163 = 19,09 ± 0,67 µM) e HT 144 (IC50 de PQM-163 = 25,23 ± 2,93 µM), as quais são derivadas de câncer de mama e de melanoma, respectivamente. O efeito de PQM-162 e PQM-163 sobre as linhagens MCF 7 e HT144 foi superior ao observado para a curcumina (IC50 para MCF 7 = 47,32 ± 2,33 µM e para HT 144 = 42,76 ± 3,79 µM). Além disso, foi demonstrado que a redução na viabilidade induzida pela substância PQM-162 em culturas de células MCF 7 foi devido, pelo menos em parte, a sua capacidade de bloquear o ciclo celular em G2/M. Estudos adicionais devem ser realizados para avaliar o perfil de toxicidade desses compostos sobre células normais, bem como dom possível mecanismo de ação. / Cancer is a disease characterized by uncontrolled proliferation of cells that have the ability to invade surrounding tissues and form metastases. Chemotherapy is an important clinical approach in the treatment of cancer, but their effectiveness is limited due to low selectivity and the development of resistance by tumor cells. On the context, it is crucial the search for new substances, that can improve the therapeutic approaches to cancer treatment. The antitumor activity of curcumin (5), a natural compound derived from Curcuma longa, has been widely reported. Similarly, resveratrol (7), a polyphenol present in a variety of food sources, has been considered as a potential chemoprotective/chemotherapeutic agent. However, clinical application of such compounds has been limited due to low solubility and poor bioavailability. Thus, this work aimed at the synthesis, characterization and evaluation of the antiproliferative activity of eight different compounds (PQM-160-167), of which six contain structural domains of analogy with curcumin (5) and resveratrol (7); and two are analogs of curcumin (5). The proliferative potential of these compounds was evaluated on different cell lines derived from human tumors. The results showed that substances PQM-162 and PQM-163, which are hybrids of curcumin and resveratrol, were more effective in reducing the viability of MCF 7 cells (IC50 for PQM-162 = 40.49 ± 1.01 µM and PQM-163 = 19.09 ± 0.67 µM) and HT 144 (IC50 PQM-163 = 25.23 ± 2.93 µM), which are derived from breast cancer and melanoma, respectively. The effect of PQM-162 and PQM-163 on lines MCF 7 and HT144 was higher than that observed for curcumin (IC50 for MCF 7 = 47.32 ± 2.33 µM and HT 144 = 42.76 ± 3.79 µM). Furthermore, it was shown that the reduction in viability induced by PQM-162 substance in MCF 7 cell cultures was due, at least in part, its ability to block the cell cycle in G2/M stage. Additional studies should be conducted to assess the toxicity profile of these compounds on normal cells and the possible mechanism of action. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
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Estimativas de heterose e capacidades de combinação em cebola para resistência a raiz rosada /

Santos, Ricardo Lima dos, 1984. January 2013 (has links)
Orientador: Marcelo Agenor Pavan / Coorientador: Norberto da Slva / Banca: Arlete Marchi Tavares de Melo / Banca: Paulo Tarcísio Della Vecchia / Banca: Rumy Goto / Banca: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Resumo: O objetivo deste trabalho foi estimar a magnitude da heterose e das capacidades de combinação em um cruzamento dialélico parcial em cebola (Allium cepa L.) visando à resistência a raiz rosada e inferir possíveis correlações entre a resistência e algumas características agronômicas. O cruzamento dialélico parcial foi realizado utilizando dois grupos de linhagens parcialmente endogâmicas. O grupo I foi constituído de linhagens parentais femininas, macho estéreis, originárias de uma População Tropical Brasileira, selecionada para plantio no verão. O grupo II foi constituído de linhagens parentais masculinas, que em sua maioria são originárias de populações de cebola Crioula, obtidas por meio de autofecundações sucessivas e mantidas através de seleção massal dentro das linhagens. A resistência a raiz rosada foi avaliada por escalas de notas de 1 a 5. Avaliaramse as seguintes características agronômicas: vigor foliar, arquitetura foliar, número de folhas, altura de folha (cm), número total de bulbos e peso total de bulbos (Kg). Utilizou-se o delineamento experimental de blocos ao acaso com três repetições. Houve ação dos efeitos aditivos para resistência a raiz rosada, verificando-se a magnitude de efeitos não aditivos em algumas combinações. Não houve correlação entre resistência a raiz rosada e peso total de bulbos, porém é possível realizar seleção intrapopulacional com as linhagens utilizadas no presente trabalho e obter híbridos com bom nível resistência a raiz rosada e boas características agronômicas / Abstract: The objective of this work was estimate the heterosis and combining ability in a partial diallel crossing in onion (Allium cepa L.) aiming resistance to pink root and infer possible correlations of it with agronomic traits. The partial diallel was carried out between two groups of partly endogamic inbred lines. The group I consisted of parental male-sterile female inbred lines, originated from a Brazilian Tropical Onion Population selected for sowing during the summer. The group II consisted of parental male inbred lines, most of them originated from a Crioula population, obtained by successive self-pollinations and mass. The resistance to pink root was evaluated by a scale from 1 to 5. The following traits were evaluated: foliar vigor, foliar architecture, number of leaves, plant height (cm), total number of bulbs and total weight of bulbs (Kg). The experimental randomized block design with three replications was utilized. The additive effects for pink root resistance were found and non-additive effects were observed in some combinations. There were no correlation between pink root resistance and bulb total weight, but is possible to make intrapopulation selection with the inbred lines used in the current work and get hybrids with good level of pink root resistance and good agronomic traits / Doutor
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Hibridação cultural como horizonte metodológico para a criação de música contemporânea

Rios Filho, Paulo Oliveira January 2010 (has links)
Submitted by Suelen Reis (suziy.ellen@gmail.com) on 2013-03-15T14:43:31Z No. of bitstreams: 3 Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%203%20seg.pdf: 6640041 bytes, checksum: 038dc153c4ee183c1e8b2d2ab86058b4 (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%202%20seg.pdf: 6374384 bytes, checksum: 9747383c57d848f3b0109c73d0a80b3e (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%201%20seg.pdf: 6995121 bytes, checksum: 421fb53efe27a24fb8afcc204b747dad (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Meirelles(rodrigomei@ufba.br) on 2013-03-22T15:03:22Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%203%20seg.pdf: 6640041 bytes, checksum: 038dc153c4ee183c1e8b2d2ab86058b4 (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%202%20seg.pdf: 6374384 bytes, checksum: 9747383c57d848f3b0109c73d0a80b3e (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%201%20seg.pdf: 6995121 bytes, checksum: 421fb53efe27a24fb8afcc204b747dad (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-22T15:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%203%20seg.pdf: 6640041 bytes, checksum: 038dc153c4ee183c1e8b2d2ab86058b4 (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%202%20seg.pdf: 6374384 bytes, checksum: 9747383c57d848f3b0109c73d0a80b3e (MD5) Dissertacao%20Paulo%20Oliveira%20Rios%20Filho%20parte%201%20seg.pdf: 6995121 bytes, checksum: 421fb53efe27a24fb8afcc204b747dad (MD5) Previous issue date: 2010 / O presente trabalho é o resultado de um percurso de pesquisa em composição musical voltado ao estudo da hibridação cultural como um horizonte metodológico para a criação de música contemporânea. Visando a investigação dos processos criativos de promoção de diálogos interculturais em música, este percurso está dividido em três partes fundamentais: a primeira trata de uma considerável revisão da literatura produzida sobre o tema da hibridação e da teoria da composição; a segunda é a própria elaboração desse horizonte metodológico; e a última envolve a composição de obras musicais. Os seus dois principais resultados, a proposta do Quadro Tipológico da Hibridação Cultural em Composição Musical e o memorial do processo composicional de quatro obras musicais, envolvem a identificação de estratégias e procedimentos de hibridação e representam um continuum entre avaliação analítica e prática do compor. / Salvador
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Estudo citogenético em aranhas (Mygalomorphae e Araneomorphae) com ênfase na evolução dos genes de DNA ribossômico /

Gimenez-Pinheiro, Tatiana. January 2015 (has links)
Orientador: Marielle Cristina Schneider / Banca: Patricia Pasquali Parise Maltempi / Banca: Katia Cristina Machado Pellegrino / Banca: Douglas de Araujo / Banca: Liano Cenofante / Resumo: Na ordem Araneae existem 45.741 espécies de aranhas descritas taxonomicamente, as quais estão distribuídas em duas subordens, Mesothelae e Opisthothelae, 114 famílias e 3.965 gêneros. Considerando o número de espécies de aranhas descritas taxonomicamente, as informações citogenéticas são muito escassas, pois menos de 2% dos representantes foram caracterizados até o momento. Dentre as 114 famílias de aranhas, 45 não possuem sequer uma espécie examinada citogeneticamente. Nas aranhas, o número diploide varia de 2n♂=7 a 2n♂=128, com sistema cromossômico sexual simples, como X0 e XY, ou múltiplo, como o X1X20, X1-X130, X1X2Y e X1-X7Y, e cromossomos com morfologia meta/submetacêntrica ou subtelo/telocêntrica. Em relação a regiões cromossômicas específicas, como as regiões organizadoras de nucléolo (RONs), somente cerca de 50 espécies de aranhas foram caracterizadas, principalmente através de impregnação pelo íon prata. Nas Mygalomorphae e Araneomorphae, as RONs estão localizadas predominantemente sobre a região terminal de um a três pares autossômicos. Porém, em algumas espécies foram observadas RONs sobre o cromossomo sexual X. Considerando as particularidades cromossômicas encontradas em Araneae e a escassez de informações citogenéticas, especialmente de regiões específicas como as RONs, este trabalho tem como objetivo estabelecer os mecanismos de evolução cromossômica em espécies de aranhas pertencentes a diferentes famílias de Mygalomorphae e Araneomorphae, levando-se em conta as características cariotípicas básicas e o padrão de distribuição das RONs. As análises cromossômicas foram realizadas através de coloração convencional, impregnação pelo nitrato de prata (Ag-RON) para identificar as RONs ativas e hibridização in situ fluorescente (FISH) para localizar os genes de rDNA 18S. As 17 espécies examinadas neste trabalho pertencem a três famílias de Haplogynae, cinco de... / Abstract: The order Araneae possesses 45,741 taxonomically described species, which are distributed in two suborders, Mesothelae and Opisthothelae, 114 families and 3,965 genera. The cytogenetic data in this order are scarce, considering that less than 2% of the species were studied up to now. Among the 114 families of Araneae, in 45 there are no species cytogenetically examined. In the spiders, the diploid number ranged from 2n♂=7 to 2n♂=128, with sex chromosome system of the simple (X0 and XY) or multiple (X1X20, X1-X130, X1X2Y e X1-X7Y) types, and chromosomes with meta/submetacentric or subtelo/telocentric morphology. In relation to specific chromosome sites, such as the nucleolar organizer regions (NOR), only 30 species were investigated mainly through silver impregnation. In Mygalomorphae and Araneomorphae, the NORs were predominantly located in the terminal region from one to three autosomal pairs. However, in some species, the NORs occurred in the X sex chromosome. Considering the cytogenetic particularities observed in Araneae and the scarcity of information of specific chromosome regions, the purpose of this work was to establish the mechanism of chromosome evolution in Mygalomorphae and Araneomorphae spiders with the focus of the rDNA genes. The chromosome analyses were accomplished with standard staining, silver nitrate impregnation (Ag-NOR) to identify the active NORs and fluorescent in situ hybridization (FISH) to locate the 18S rDNA genes. The 17 species examined here belong to three families of Haplogynae, five of Entelegynae and three of Mygalomorphae. Mitotic metaphase cells exhibited 2n♂=16+X1X2Y in Sicarius cariri and Sicarius ornatus and 2n♂=18+XY in Sicarius tropicus, with Ag-NORs on the terminal region of pair 1. In S. ornatus and S. tropicus, the FISH technique showed similar results to Ag-NOR, but in S. cariri, the ribosomal cistrons were located in the terminal region of the X1 sex chromosome. The description of a ... / Doutor
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Estudo citogenético em aranhas (Mygalomorphae e Araneomorphae) com ênfase na evolução dos genes de DNA ribossômico

Gimenez-Pinheiro, Tatiana [UNESP] 18 November 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-02-05T18:30:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-18. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:32:58Z : No. of bitstreams: 1 000857570_20181118.pdf: 1213871 bytes, checksum: 1217b26e49381e1c08a0877fcc38cb08 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-11-21T11:45:01Z: 000857570_20181118.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-11-21T11:45:57Z : No. of bitstreams: 1 000857570.pdf: 3162544 bytes, checksum: 933a175ada75ae354b262fe8ecddcd7a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Na ordem Araneae existem 45.741 espécies de aranhas descritas taxonomicamente, as quais estão distribuídas em duas subordens, Mesothelae e Opisthothelae, 114 famílias e 3.965 gêneros. Considerando o número de espécies de aranhas descritas taxonomicamente, as informações citogenéticas são muito escassas, pois menos de 2% dos representantes foram caracterizados até o momento. Dentre as 114 famílias de aranhas, 45 não possuem sequer uma espécie examinada citogeneticamente. Nas aranhas, o número diploide varia de 2n♂=7 a 2n♂=128, com sistema cromossômico sexual simples, como X0 e XY, ou múltiplo, como o X1X20, X1-X130, X1X2Y e X1-X7Y, e cromossomos com morfologia meta/submetacêntrica ou subtelo/telocêntrica. Em relação a regiões cromossômicas específicas, como as regiões organizadoras de nucléolo (RONs), somente cerca de 50 espécies de aranhas foram caracterizadas, principalmente através de impregnação pelo íon prata. Nas Mygalomorphae e Araneomorphae, as RONs estão localizadas predominantemente sobre a região terminal de um a três pares autossômicos. Porém, em algumas espécies foram observadas RONs sobre o cromossomo sexual X. Considerando as particularidades cromossômicas encontradas em Araneae e a escassez de informações citogenéticas, especialmente de regiões específicas como as RONs, este trabalho tem como objetivo estabelecer os mecanismos de evolução cromossômica em espécies de aranhas pertencentes a diferentes famílias de Mygalomorphae e Araneomorphae, levando-se em conta as características cariotípicas básicas e o padrão de distribuição das RONs. As análises cromossômicas foram realizadas através de coloração convencional, impregnação pelo nitrato de prata (Ag-RON) para identificar as RONs ativas e hibridização in situ fluorescente (FISH) para localizar os genes de rDNA 18S. As 17 espécies examinadas neste trabalho pertencem a três famílias de Haplogynae, cinco de... / The order Araneae possesses 45,741 taxonomically described species, which are distributed in two suborders, Mesothelae and Opisthothelae, 114 families and 3,965 genera. The cytogenetic data in this order are scarce, considering that less than 2% of the species were studied up to now. Among the 114 families of Araneae, in 45 there are no species cytogenetically examined. In the spiders, the diploid number ranged from 2n♂=7 to 2n♂=128, with sex chromosome system of the simple (X0 and XY) or multiple (X1X20, X1-X130, X1X2Y e X1-X7Y) types, and chromosomes with meta/submetacentric or subtelo/telocentric morphology. In relation to specific chromosome sites, such as the nucleolar organizer regions (NOR), only 30 species were investigated mainly through silver impregnation. In Mygalomorphae and Araneomorphae, the NORs were predominantly located in the terminal region from one to three autosomal pairs. However, in some species, the NORs occurred in the X sex chromosome. Considering the cytogenetic particularities observed in Araneae and the scarcity of information of specific chromosome regions, the purpose of this work was to establish the mechanism of chromosome evolution in Mygalomorphae and Araneomorphae spiders with the focus of the rDNA genes. The chromosome analyses were accomplished with standard staining, silver nitrate impregnation (Ag-NOR) to identify the active NORs and fluorescent in situ hybridization (FISH) to locate the 18S rDNA genes. The 17 species examined here belong to three families of Haplogynae, five of Entelegynae and three of Mygalomorphae. Mitotic metaphase cells exhibited 2n♂=16+X1X2Y in Sicarius cariri and Sicarius ornatus and 2n♂=18+XY in Sicarius tropicus, with Ag-NORs on the terminal region of pair 1. In S. ornatus and S. tropicus, the FISH technique showed similar results to Ag-NOR, but in S. cariri, the ribosomal cistrons were located in the terminal region of the X1 sex chromosome. The description of a ... / FAPESP: 11/19873-9
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Caracterização molecular de três espécies de Trachycephalus (Anura: Hylidae) : investigando potenciais híbridos interespecíficos

Zaidan, Fernanda Couto 11 April 2014 (has links)
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No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação.FernandaZaidan.pdf: 1993203 bytes, checksum: f121a5630a788106b0700f04818f9194 (MD5) Previous issue date: 2014 / Animais híbridos representam um desafio à taxonomia e sistemática, pois correspondem a unidades evolutivas geralmente sem clara delimitação morfológica, comportamental e genética. Híbridos podem ser morfologicamente intermediários aos parentais ou, devido à introgressão e retrocruzamentos, suas características podem se misturar tornando difícil sua identificação. Uma das formas de identificação de híbridos é por meio de ferramentas de biologia molecular, que ao utilizarem marcadores de DNA mitocondrial (herança exclusiva materna) e DNA nuclear (herança materna e paterna), permitem a comparação entre informações genéticas. Além da hibridização existem outras fontes de conflito entre dados moleculares provenientes do DNA mitocondrial e DNA nuclear, como por exemplo a retenção de polimorfismos ancentrais. Em localidades do Espírito Santo, Brasil, foram coletados indivíduos de morfologia distinta de Trachycephalus mesophaeus e T. nigromaculatus, que são as únicas espécies do gênero conhecidas nesse estado. Porém, estudos piloto usando o gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI) agruparam esses espécimes com amostras de T. typhonius. Devido a estas incongruências, foram sequenciados fragmentos de dois genes mitocondriais - COI e Nicotinamida Desidrogenase subunidade 2 (ND2) e um exon nuclear (tirosinase) de 173 indivíduos de Trachycephalus, de forma a esclarecer as identificações taxonômicas e investigar a correspondência entre caracteres morfológicos e genéticos nesta linhagem, na sua área de ocorrência As filogenias moleculares, divergências genéticas, redes de haplótipos e polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) confirmaram as três espécies acima mencionadas como linhagens evolutivas distintas e revelaram mais sete indivíduos potencialmente híbridos, mas morfologicamente assinalados a T. mesophaeus, T. nigromaculatus ou T. typhonius.. Devido à taxa de evolução lenta da tirosinase, as espécies mais recentes T. typhonius e T. nigromaculatus parecem não terem sido sorteadas completamente nesse gene. Já T. mesophaeus, que é a espécie mais antiga das três, foi recuperada inequivocamente em todas as análises. De forma inédita, as análises moleculares evidenciaram a ocorrência de introgressão bidirecional entre T. nigromaculatus e T. typhonius e entre T. nigromaculatus e T. mesophaeus, sendo que há indícios de indivíduos F1 (cruzamentos entre espécies parentais puras gerando híbridos). A utilização do gene ND2 mostrou-se mais eficiente do que o gene COI nas filogenias e, apesar da tirosinase ser um gene nuclear de evolução lenta, contribuiu para a identificação de incongruências citonucleares. Nossos resultados mostram que a história filogenética de Trachycephalus é complexa e que o uso de marcadores nucleares de evolução mais rápida e ampliação dessas análises para outras espécies do gênero podem revelar mais eventos de hibridização. / Hybrids are evolutionary units generally without clear morphological, behavioral and genetic delimitation, thus representing a challenge to taxonomy and systematics. They can morphologically resemble their parents or, due to introgression, their characteristics can be diluted with a prevailing appearance of one of the parental species, which could hinder identification. One way to identify hybrids is through molecular biology tools, such as mitochondrial DNA (maternal inherintance exclusively) and nuclear DNA (maternal and paternal inheritance), allowing genetic comparisons. Besides hybridization, conflicting mtDNA and nDNA identifications may have other explanations, such as Incomplete Lineage Sorting. Some individuals collected in localities of Espírito Santo State, Brazil, presented a mix of morphological characters of T. mesophaeus and T. nigromaculatus, which are the only Trachycephalus species known to the region. However, previous studies using COI sequences grouped theses individuals as T. typhonius. Giving this, we sequenced fragments of two mitochondrial genes (COI and ND2) and part of the nuclear exon of tyrosinase of 173 individuals of Trachycephalus, in order to better clarify the taxonomic uncertainty, and the link between morphological and genetic characters behind the identifications, according to the occurrence area. Results of molecular phylogenies, genetic divergences, haplotype networks, and single nucleotide polymorphisms (SNPs) confirmed .T. mesophaeus, T. nigromaculatus, and T. typhonius as distinct evolutionary lineages and revealed seven more individuals potentially hybrids, but morphologically assigned to one species. Due to the slow mutation rate of tyrosinase, the most recently diverged species (T. typhonius and T. nigromaculatus) have not completely sorted in this gene. Trachycephalus mesophaeus is the oldest species of the three, and it was identified unambiguously in all analysis. Here, for the first time, evidence of bidirectional introgression between T. nigromaculatus and T. typhonius and between T. nigromaculatus and T. mesophaeus, with signs of F1 individuals, is presented. The use of ND2 gene seems to be more efficient than COI to recover the phylogenies in this particular group and, although tyrosinase is a slow evolving gene, it contributed significantly in order to identify cytonuclear incongruences. Our results indicate a complex phylogenetic history of Trachycephalus, and that more introgressive hybrids may be identified with the use of faster nuclear markers and the inclusion of more species of the genus in the analyses..

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