El modelo de análisis de clases latentes tiene como finalidad describir una variable no observable a través del agrupamiento de los individuos en base a sus patrones de respuestas. La estimación en este modelo se puede realizar mediante el algoritmo de Esperanza-Maximización (EM) y su desarrollo para el caso politómico se encuentra implementado en el paquete poLCA de R. Desde el punto de vista bayesiano, esta estimación ha sido hasta el momento implementada sólo para el caso de variables dicotómicas. En este trabajo, se busca extender este ultimo aporte para el caso politómico, haciendo uso del muestrador de Gibbs. La aplicación del modelo de análisis de clases latentes, bajo el enfoque bayesiano aquí desarrollado, se realizó sobre un conjunto de datos reales relacionados con la con fianza hacia 21 instituciones públicas en una encuesta para Lima Metropolitana. En general, se identificaron tres grupos de encuestados seg un sus niveles de confianza institucional, los cuales se analizaron luego en relación a otras variables.

Los modelos lineales mixtos de clases latentes desarrollados por Proust-Lima, Philipps y Liquet (2017) son útiles para analizar el aspecto dinámico y la naturaleza multidimensional de un fenómeno de interés en poblaciones no necesariamente homogéneas. Estos permiten identificar las posibles clases latentes en la población bajo estudio y cómo un conjunto de covariables afecta en cada clase a la variable respuesta de interés. En esta tesis se desarrolla el modelo lineal mixto de clases latentes con variable respuesta latente y variable mani-fiesta ordinal, a través de sus dos componentes: el sub-modelo estructural y el sub-modelo de medición, que son complementados con un modelo logístico multinomial para analizar la probabilidad de pertenencia a una clase latente. El modelo se aplicó a un conjunto de datos pertenecientes al Estudio Nacional de Juventud y Religión (NSYR por las siglas en inglés “National Study of Youth and Religion”), con el fin de encontrar clases latentes en el constructo religiosidad y describir su evolución. Como resultado, se identificaron tres clases latentes con trayectorias distintas para cada caso. / Latent class linear mixed models developed by Proust-Lima, Philipps y Liquet (2017) are useful to analyze the dynamic aspect and the multidimensional nature of a phenomenon of interest in populations not necessarily homogeneous. These allow to identify the possible latent classes in the population under study and how a set of covariates affects the response variable of interest in each class. In this thesis, the latent class linear mixed model with latent response variable and ordinal manifest variable is developed, through its two components: the structural sub-model and the measure sub-model, which are complemented with a mul-tinominal logistic model to analyze the probability of belonging to a latent class. The model was applied to a dataset from the National Study of Youth and Religion (NSYR), in order to find latent classes in the religiosity construct and to describe their evolution. As a result, three latent classes were identified with different trajectories for each case.

Introdução: Um dos principais fatores associados à mortalidade e morbidade no período perinatal é o nascimento pré-termo. Sua prevalência está aumentando em diversas localidades e os motivos para tal envolve complexa inter-relação de fatores que incluem aspectos biológicos, de assistência, psicológicos, sociais e econômicos, entre diversos outros associados ao nascimento pré-termo. Objetivo: O presente estudo objetiva analisar os efeitos de variáveis associadas ao nascimento pré-termo, via modelagem de equações estruturais (MEE), com a construção de variáveis latentes de vulnerabilidade socioeconômica, familiar, psicossocial, condições maternas e intercorrências. Outros objetivos são analisar as diversas fontes de obtenção da idade gestacional (IG) visando gerar uma variável latente para a idade gestacional e comparar modelos com diferentes tipos de variável de desfecho (contínuo, ordinal, binário e latente). Métodos: Esse estudo foi baseado na pesquisa do tipo caso-controle populacional sobre nascidos vivos hospitalares de mães residentes na cidade de Londrina, estado do Paraná, realizado entre junho de 2006 e março de 2007. A partir de um modelo conceitual, foi empregada a MEE para construir modelos com variáveis latentes e compostas com utilização de medidas de ajustes. Resultados: O Modelo final apontou os seguintes efeitos diretos sobre IG: intercorrências, atenção de pré-natal inadequada, gestação múltipla, condição reprodutiva, IMC, consumo de bebida alcoólica, prática de caminhadas e esforço físico. Além do efeito direto da atenção pré-natal, foi encontrado seu papel de variável de mediação entre as variáveis latentes: Vulnerabilidade Socioeconômica, Não Aceitação da Gravidez e Vulnerabilidade Familiar e o desfecho IG. Conclusões: Para a utilização de MEE, foi necessário rediscutir o papel das variáveis propostas no estudo original, o que sugere que, para a aplicação da metodologia, já seja considerada a formulação de variáveis latentes à priori na fase de planejamento de uma pesquisa. A aplicação do MEE permitiu construir variáveis latentes e variáveis compostas a partir do estudo original e identificar efeitos diretos, indiretos e de mediação sobre IG. Ademais, foi possível construir e utilizar a variável latente IG a partir das fontes de registro. / Introduction: One of the main factors associated with mortality and morbidity in the perinatal period is preterm birth. Its prevalence is increasing in many locations and the reasons for such involves a complex interplay of factors associated with preterm birth including biological aspects, assistance, psychological, social and economic factors birth, among many others associated with preterm birth. Objective: This study aims to analyze the effects of variables associated with preterm birth via structural equation modeling (SEM), with the construction of latent variables of socioeconomic vulnerability, family, psychosocial, and maternal complications. Other objectives are to analyze the use of various sources of registering gestational age in order to generate a latent variable for gestational age (GA) and compare models with different types of outcome (continuous, ordinal, binary and latent variable). Methods - This study was based on research in population case-control over hospital births to mothers resident in the city of Londrina, Paraná, conducted between June 2006 and March 2007. From a conceptual model it was used SEM to build models with latent and composite variables with use of adjustment measures. Results: The final model showed the following direct effects on GA: complications, prenatal care inadequate, multiple gestation, reproductive condition, BMI, alcohol consumption, going for walks and effort. Besides the direct effect of prenatal care, found their role of mediating variable between latent variables: Socioeconomic Vulnerability, Not Acceptance of Pregnancy, Vulnerability and Family and the outcome GA. Conclusions: For the use of SEM it was necessary to revisit the role of the variables proposed in the original study, which suggests that, for the application of the methodology, it is already considered the formulation of a priori latent variables in the planning phase of a research. The application allowed SEM to build latent variables and composite variables from the original study and identify direct, indirect and mediating effects on GA. Furthermore, it was possible to build and use the GA latent variable from the recording sources.

A variabilidade espacial e temporal do suprimento larval pode influenciar fortemente as taxas de recrutamento em populações de invertebrados marinhos do entre marés, e, assim, determinar os padrões de abundância e distribuição de adultos. No entanto, o comportamento de larvas antes do assentamento, e a sua condição fisiológica, podem também desempenhar um papel importante. Há vários fatores que influenciam a qualidade fisiológica de uma larva, sendo um deles o efeito materno, ou seja, a forma como os recursos são manipulados pelas mães para produzir sua prole, especialmente como afeta a fecundidade. Outro fator importante é o estado trófico do ambiente onde estágios iniciais se desenvolvem em estágios finais pré-competentes. No entanto, pouco se sabe sobre a relação entre esses dois processos e se a variabilidade natural das condições da costa realmente provoca uma pior qualidade no desempenho juvenil e nas taxas de recrutamento. Neste estudo nós analisamos se os processos que afetam a qualidade embrionária e larval são independentes ou interativas, e também se as condições ambientais ao longo de uma costa subtropical pode mediar tendências de qualidade de larvas à mesoescala e também determinar padrões de distribuição de invertebrados sésseis do entre marés. Usamos a craca Chthamalus bisinuatus como modelo biológico, e experimentos de laboratório e de campo foram realizados para explorar a relação de diversas variáveis ambientais nos padrões de distribuição destes cirripédios. Testamos também se as oscilações naturais na disponibilidade de alimento determinam padrões espaciais e temporais da qualidade da larva produzida e os efeitos da disponibilidade de alimento para as mães e para os seus descendentes na qualidade do estágio larval final deste organismo. Os resultados obtidos nessa tese apontam para a importância da disponibilidade de alimento na coluna d\'água em determinar padrões de abundância e tamanho dos organismos adultos, bem como a relação com o grau de exposição à ação de ondas na manutenção de populações adultas. Concluímos também que mudanças sazonais na produtividade primária tem um efeito na fecundidade e qualidade da larva produzida ao longo do ano por esses cirripédios. Finalmente pudemos demonstrar que pequenas alterações na quantidade de alimento fornecida à mães e larvas de Chthamalus são suficiente para provocar plasticidade de alguns tratos larvais importantes para os processos e sucesso do recrutamento destes organismos. / Spatial and temporal variability of larval supply can strongly influence the recruitment rates in populations of marine intertidal invertebrates, and thus determine the abundance and distribution patterns of adults. However, the behavior of larvae prior to settlement, and its physiological condition, may also play an important role. There are several factors that influence the physiological quality of a larva, one of them being maternal effects, that is, the way resources are allocated by mothers to produce their offspring, especially the way it affects fecundity. Another important factor is the trophic state of the environment where early stages develop into competent pre-final stages. However, little is known about the relationship between these two processes and if the natural variability of coastal conditions actually causes poorer quality in young performance and recruitment rates. In this study we analyzed the processes affecting embryonic and larval quality and if they are independent or interactive, and also if the environmental conditions along a subtropical coast can mediate trends in quality larvae to mesoscale and also determine sessile intertidal invertebrates distribution patterns. We used the barnacle Chthamalus bisinuatus as a biological model, and laboratory and field experiments were conducted to explore the relationship of various environmental variables in the patterns of distribution of these barnacles. We tested also if natural fluctuations in food availability determine spatial and temporal patterns of larvae quality produced and the effects of food availability for mothers and their descendants in the quality of the final larval stage of this organisms. The results obtained in this thesis point to the importance of the food availability in the water column in determining patterns of abundance and size of adult organisms, and the relationship with the degree of exposure to wave action in the maintenance of adult populations. We also conclude that seasonal changes in primary productivity has an effect on fecundity and quality of the larvae produced throughout the year by those barnacles. Finally we were able to demonstrate that small changes in the amount of food provided to mothers and larvae Chthamalus are enough to cause plasticity of some important larval traits which impacts the processes and success of recruitment in these organisms.

Submitted by PPG Psicologia (psicologia-pg@pucrs.br) on 2018-06-08T22:34:55Z No. of bitstreams: 1 MAILA_ROSSATO_HOLZ_DIS.pdf: 1327596 bytes, checksum: 8e58e96dcb1cc4cc6fa912a07c9c18a1 (MD5) / Approved for entry into archive by Sheila Dias (sheila.dias@pucrs.br) on 2018-06-20T11:37:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MAILA_ROSSATO_HOLZ_DIS.pdf: 1327596 bytes, checksum: 8e58e96dcb1cc4cc6fa912a07c9c18a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-20T11:52:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MAILA_ROSSATO_HOLZ_DIS.pdf: 1327596 bytes, checksum: 8e58e96dcb1cc4cc6fa912a07c9c18a1 (MD5) Previous issue date: 2018-03-02 / Both health aging and mild cognitive impairment are associated with the existence of neurocognitive profiles and sociodemographic and clinical factors that may be considered as a risk for conversion to a major neurocognitive disorder. However, it is known that within this continuum between normal and pathological aging there are heterogeneous characteristics that are still little explored that need to be better understood to identify factors of cognitive reserve and demential risk. Thus, the present dissertation is composed of two studies, the first with the objective of verifying if there are subgroups of executive processing in the elderly with MCI and controls; secondarily, to examine whether the latent executive profiles are differentiated by sociodemographic, clinical and mnemonic variables. In this study 120 elderly adults (50 controls and 70 MCI patients) participated in a complete neuropsychological evaluation battery. A latent profile analysis was performed to verify possible subgroups of executive functions (EF), followed by a multivariate ANOVA controlling years of formal education and frequency of reading and writing habits (FRWH). Three executive profiles were found (1) Profile 1 with processing speed, executive attention and visuospatial initiation impairment (23.33% of the sample); (2) Profile 2 with intermediate performance in EF (45.84% of the sample); and (3) Profile 3 with superior performance in working memory, planning and verbal organization (30.83% of the sample). Comparative analysis showed differences in education, economy class, FRWH, global cognition, symptoms of depression, immediate episodic memory, recent memory, visual memory, recognition of new information learned and prospective memory. In all variables, Profile 1 had worse performance and Profile 3 had the best performance. The second study aimed at evaluating cognitive processing evolution (mnemonic, executive, linguistic, praxis and attentional), socio-demographic and clinical characteristics of elderly individuals with MCI and elderly controls, as well as verifying whether the elderly will convert the clinical condition and if there were risk factors for this conversion. In study 2, 65 elderly adults (41 MCI patients and 24 controls) participated in two complete neuropsychological assessments (time 1 and time 2). ANOVA analyzes of repeated measures were performed, controlling years of formal education and FRWH. There were differences in the evaluation one year later in the working memory, visual episodic memory, and visual and spatial cognitive flexibility variables. Eighteen participants (27.69%) converted to the clinical condition. The 11 functionality explained 12.5% of clinical conversion. The results of these two studies suggest that there is heterogeneity in the neurocognitive and executive profile within healthy aging and MCI that need to be monitored longitudinally to identify the continuum of these impairments. Variables such as processing speed, working memory and inhibitory control are essential executive measures for monitoring beyond episodic memory evaluation. Future studies should investigate transversally and longitudinally MCI severity, using factorial analyzes and composite scores of cognitive components, more specifically from executive components. These measures may be quantitative and qualitative measures of better measurement of cognitive impairment extent in elderly patients, allowing more accurate and earlier diagnoses towards the implementation of specific neurocognitive stimulation programs. / O envelhecimento seja ele saud?vel ou com Comprometimento Cognitivo Leve (CCL) tende a estar relacionado ? exist?ncia de perfis neurocognitivos e fatores sociodemogr?ficos e cl?nicos que podem ser considerados de risco para convers?o para um transtorno neurocognitivo maior. Contudo, sabe-se que dentro desse cont?nuo entre o envelhecimento normal e patol?gico existem caracter?sticas heterog?neas ainda pouco exploradas que necessitam ser mais bem compreendidas para identifica??o de fatores de reserva cognitiva e de risco demencial. Assim, a presente disserta??o ? composta por dois estudos, sendo o primeiro com o objetivo de verificar se h? subgrupos de processamento executivo em idosos com CCL e controles; secundariamente, examinar se os perfis executivos latentes se diferenciam por vari?veis sociodemogr?ficas, cl?nicas e mnem?nicas. Nesse estudo participaram 120 adultos idosos (50 controles e 70 com CCL) que realizaram uma bateria de avalia??o neuropsicol?gica completa. Foi conduzida uma an?lise de perfis latentes para verificar poss?veis subgrupos de fun??es executivas, seguida de uma ANOVA multivariada controlando escolaridade e frequ?ncia de h?bitos de leitura e de escrita (FHLE). Foram encontrados tr?s perfis executivos (1) Perfil 1 com preju?zos de velocidade de processamento, aten??o executiva e inicia??o visuoespacial (23,33% da amostra); (2) Perfil 2 com desempenho intermedi?rio em FE (45,84% da amostra); e (3) Perfil 3 com desempenho superior em mem?ria de trabalho, planejamento e organiza??o verbal (30,83% da amostra). A an?lise comparativa mostrou diferen?as quanto ? escolaridade, classe econ?mica, FHLE, cogni??o global, sintomas de depress?o, mem?ria epis?dica imediata e recente, mem?ria visual, reconhecimento de novas informa??es aprendidas e mem?ria prospectiva, sendo que em todas as vari?veis o Perfil 1 teve pior desempenho e o Perfil 3 teve o melhor desempenho. J? o segundo estudo, teve como objetivo avaliar a evolu??o do processamento cognitivo (mnem?nico, executivo, lingu?stico, pr?xico e atencional), sociodemogr?fico e cl?nico de idosos com CCL e idosos controles verificando, ainda, se os idosos iriam converter o quadro cl?nico e se existiriam fatores de risco para essa convers?o. No estudo 2 participaram 65 adultos idosos (41 CCL e 24 controles) no qual passaram por duas avalia??es neuropsicol?gicas completas (tempo 1 e tempo 2). Foram realizadas an?lises de ANOVA de medidas repetidas, controlando escolaridade e FHLE. Houve diferen?as na avalia??o um ano depois nas vari?veis de mem?ria de trabalho, mem?ria epis?dica visual, e flexibilidade cognitiva visuoespacial. 9 Dezoito participantes da amostra (27,69%) converteram o quadro cl?nico. A funcionalidade explicou 12,5% da convers?o do quadro cl?nico. Os resultados dos dois estudos sugerem que h? uma heterogeneidade no perfil neurocognitivo e executivo dentro do envelhecimento saud?vel e com CCL que precisam ser acompanhadas longitudinalmente para identificar o cont?nuo desses preju?zos. Percebe-se que vari?veis como velocidade de processamento, mem?ria de trabalho e controle inibit?rio s?o medidas executivas essenciais para acompanhamento al?m da mem?ria epis?dica. Futuros estudos que investiguem de forma transversal e longitudinal a severidade do CCL a partir de an?lises fatoriais e de escores compostos dos componentes cognitivos, mais especificamente de componentes executivos, podem ser medidas quantitativas e qualitativas de melhor mensura??o da dimens?o do preju?zo cognitivo em idosos, permitindo diagn?sticos mais acurados e mais precoces rumo ? implementa??o de programas de estimula??o neurocognitiva espec?fica.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-04-29T16:18:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SolitonsLatentesCordas.pdf: 472398 bytes, checksum: 8c4b56ce0727a674ba202e7a46a8fb4c (MD5) / Approved for entry into archive by Albirene Aires (albireneufpa@gmail.com) on 2014-06-16T17:14:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SolitonsLatentesCordas.pdf: 472398 bytes, checksum: 8c4b56ce0727a674ba202e7a46a8fb4c (MD5) / Made available in DSpace on 2014-06-16T17:14:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_SolitonsLatentesCordas.pdf: 472398 bytes, checksum: 8c4b56ce0727a674ba202e7a46a8fb4c (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Neste trabalho investigamos soluções solitônicas em modelos de Kaluza-Klein com um número arbitrário de espaços internos toroidais, que descrevem o campo gravitacional de um objeto massivo compacto. Cada toro di-dimensional possui um fator de escala independente Ci, i = 1, ..., N, que é caracterizado pelo parâmetro ᵞi. Destacamos a solução fisicamente interessante correspondente à massa puntual. Para a solução geral obtemos equações de estado nos espaços externo e interno. Estas equações demonstram que a massa pontual solitônica possui equações de estado tipo poeira em todos os espaços. Obtemos também os parâmetros pósnewtonianos que nos possibilitam encontrar as fórmulas da precessão do periélio, do desvio da luz e do atraso no tempo de ecos de radar. Além disso, os experimentos gravitacionais levam a uma forte limitação nos parâmetros do modelo: T = ƩNi=1 diYi = −(2, 1±2, 3)×10−5. A solução para massa pontual com Y1 = . . . = YN = (1+ƩNi=1 di)−1 contradiz esta restrição. A imposição T = 0 satisfaz essa limitação experimental e define uma nova classe de soluções que são indistinguíveis para a relatividade geral. Chamamos estas soluções de sólitons latentes. Cordas negras e membranas negras com Yi = 0 pertencem a esta classe. Além disso, a condição de estabilidade dos espaços internos destaca cordas/membranas negras de sólitons latentes, conduzindo exclusivamente para as equações de estado de corda/membrana negra pi = −ε/2, i = 1, . . . ,N, nos espaços internos e ao número de dimensões externas d0 = 3. As investigações do fluido perfeito multidimensional estático e esfericamente simétrico com equação de estado tipo poeira no espaço externo confirmam os resultados acima. / In Kaluza-Klein models with an arbitrary number of toroidal internal spaces, we investigate soliton solutions which describe the gravitational field of a massive compact object. Each di-dimensional torus has its own scale factor Ci, i = 1, ..., N, which is characterized by a parameter Yi. We single out the physically interesting solution corresponding to a pointlike mass. For the general solution we obtain equations of state in the external and internal spaces. These equations demonstrate that the point-like mass soliton has dust-like equations of state in all spaces. We also obtain the parameterized post-Newtonian parameters, which give the possibility to obtain the formulas for perihelion shift, deflection of light and time delay of radar echoes. Additionally, the gravitational experiments lead to a strong restriction on the parameters of the model: T = ƩNi=1 diYi = −(2, 1±2, 3)×10−5. The point-like mass solution with Y1 = . . . = YN = (1+ƩNi=1 di)−1 contradicts this restriction. The condition T = 0 satisfies the experimental limitation and defines a new class of solutions which are indistinguishable from general relativity. We call such solutions latent solitons. Black strings and black branes with Yi = 0 belong to this class. Moreover, the condition of stability of the internal spaces singles out black strings/branes from the latent solitons and leads uniquely to the black string/brane equations of state pi = −ε/2, i = 1, . . . ,N, in the internal spaces and to the number of the external dimensions d0 = 3. The investigation of multidimensional static spherically symmetric perfect fluid with dust-like equation of state in the external space confirms the above results.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:04:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5104.pdf: 2493280 bytes, checksum: 296329e73498a367b56e93dcbe6f0aaa (MD5) Previous issue date: 2013-04-08 / Financiadora de Estudos e Projetos / In this thesis new families of survival distributions are proposed. Those distributions are derived by assuming a latent activation structure to explain the occurrence of the event of interest. In general, the competitive causes may have different activation mechanisms. Here we assume three different ones, namely, fisrt, random and last actvation mechanisms. The presence of cure fraction are also addressed in two contexts. The models assumed that the number of causes follows a Geometric distribution and the lifetime for these causes follows an Exponential distribution, and a Gamma Generalized distribution. The properties of the proposed distributions are discussed, including a formal proof of its probability density function and explicit algebraic formulas for its reliability and failure rate functions, moments, order statistics and modal value. Inferetial procedure is based on frequentist and Bayesian perspectives. Moreover, Bayesian case influence diagnostics based in -divergence, with include Kulback Leibler divergence measure as a particular case, are developed. Simulation studies are performed and experimental results are illustrated based in real datasets. / Nesta tese, novas famílias de distribuições são propostas para modelar dados de tempo de vida. Essas distribuições são obtidas assumindo que a ocorrência do evento de interesse é explicada por uma estrutura latente de ativação. Em geral, as causas competitivas podem ter diferentes mecanismos de ativação, consideramos os casos: primeiro, último e aleatório. A presença de fração de curados é considerada nestes contextos. Os modelos assumem que o número de causas de risco tem distribuição de probabilidade Geométrica; e o tempo de ativação desses fatores segue distribuição Exponencial ou Gama Generalizada. Propriedades das distribuições propostas são discutidas, incluindo obtenção da função densidade de probabilidade e fórmulas explícitas da função de risco, momentos, estatística de ordem e valor modal. Outro objetivo deste trabalho é o desenvolvimento de processos inferenciais nas perspectivas clássica e bayesiana. Além disso, as medidas bayesianas de diagnóstico baseadas na divergência, que incluem a divergência de Kulback Leibler como caso particular, são consideradas para detectar observações influentes. Estudos de simulação são realizados e resultados experimentais são obtidos para conjuntos de dados reais.

A variabilidade espacial e temporal do suprimento larval pode influenciar fortemente as taxas de recrutamento em populações de invertebrados marinhos do entre marés, e, assim, determinar os padrões de abundância e distribuição de adultos. No entanto, o comportamento de larvas antes do assentamento, e a sua condição fisiológica, podem também desempenhar um papel importante. Há vários fatores que influenciam a qualidade fisiológica de uma larva, sendo um deles o efeito materno, ou seja, a forma como os recursos são manipulados pelas mães para produzir sua prole, especialmente como afeta a fecundidade. Outro fator importante é o estado trófico do ambiente onde estágios iniciais se desenvolvem em estágios finais pré-competentes. No entanto, pouco se sabe sobre a relação entre esses dois processos e se a variabilidade natural das condições da costa realmente provoca uma pior qualidade no desempenho juvenil e nas taxas de recrutamento. Neste estudo nós analisamos se os processos que afetam a qualidade embrionária e larval são independentes ou interativas, e também se as condições ambientais ao longo de uma costa subtropical pode mediar tendências de qualidade de larvas à mesoescala e também determinar padrões de distribuição de invertebrados sésseis do entre marés. Usamos a craca Chthamalus bisinuatus como modelo biológico, e experimentos de laboratório e de campo foram realizados para explorar a relação de diversas variáveis ambientais nos padrões de distribuição destes cirripédios. Testamos também se as oscilações naturais na disponibilidade de alimento determinam padrões espaciais e temporais da qualidade da larva produzida e os efeitos da disponibilidade de alimento para as mães e para os seus descendentes na qualidade do estágio larval final deste organismo. Os resultados obtidos nessa tese apontam para a importância da disponibilidade de alimento na coluna d\'água em determinar padrões de abundância e tamanho dos organismos adultos, bem como a relação com o grau de exposição à ação de ondas na manutenção de populações adultas. Concluímos também que mudanças sazonais na produtividade primária tem um efeito na fecundidade e qualidade da larva produzida ao longo do ano por esses cirripédios. Finalmente pudemos demonstrar que pequenas alterações na quantidade de alimento fornecida à mães e larvas de Chthamalus são suficiente para provocar plasticidade de alguns tratos larvais importantes para os processos e sucesso do recrutamento destes organismos. / Spatial and temporal variability of larval supply can strongly influence the recruitment rates in populations of marine intertidal invertebrates, and thus determine the abundance and distribution patterns of adults. However, the behavior of larvae prior to settlement, and its physiological condition, may also play an important role. There are several factors that influence the physiological quality of a larva, one of them being maternal effects, that is, the way resources are allocated by mothers to produce their offspring, especially the way it affects fecundity. Another important factor is the trophic state of the environment where early stages develop into competent pre-final stages. However, little is known about the relationship between these two processes and if the natural variability of coastal conditions actually causes poorer quality in young performance and recruitment rates. In this study we analyzed the processes affecting embryonic and larval quality and if they are independent or interactive, and also if the environmental conditions along a subtropical coast can mediate trends in quality larvae to mesoscale and also determine sessile intertidal invertebrates distribution patterns. We used the barnacle Chthamalus bisinuatus as a biological model, and laboratory and field experiments were conducted to explore the relationship of various environmental variables in the patterns of distribution of these barnacles. We tested also if natural fluctuations in food availability determine spatial and temporal patterns of larvae quality produced and the effects of food availability for mothers and their descendants in the quality of the final larval stage of this organisms. The results obtained in this thesis point to the importance of the food availability in the water column in determining patterns of abundance and size of adult organisms, and the relationship with the degree of exposure to wave action in the maintenance of adult populations. We also conclude that seasonal changes in primary productivity has an effect on fecundity and quality of the larvae produced throughout the year by those barnacles. Finally we were able to demonstrate that small changes in the amount of food provided to mothers and larvae Chthamalus are enough to cause plasticity of some important larval traits which impacts the processes and success of recruitment in these organisms.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-02-06T12:12:53Z No. of bitstreams: 2 Tese - Vanessa Duarte Dias - 2016.pdf: 2283005 bytes, checksum: 467160bb33424613a588c7251fabc187 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-02-06T12:13:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Vanessa Duarte Dias - 2016.pdf: 2283005 bytes, checksum: 467160bb33424613a588c7251fabc187 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T12:13:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Vanessa Duarte Dias - 2016.pdf: 2283005 bytes, checksum: 467160bb33424613a588c7251fabc187 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-06-30 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The sugarcane production areas are increasing in Brazil due to increased ethanol consumption by flex fuel cars. The planted area is growing, but productivity has been declining in recent years, and factors such as incidence of diseases in the crop may be contributing to this situation. Among the diseases, bacteria such as scald of the leaves and ratoon stunting disease are of great importance to the crop because they can reduce productivity by up to 30%. In addiction and the symptoms are not always displayed in the field, thus requiring advanced techniques to detect such bacterial diseases For Leifsonia xyli subsp. xyli, which causes rickets in the ratoon cane sugar control measure most commonly used besides varietal resistance is thermally treating the billets that will serve seedlings. Thus, the purpose of the first study was to perform the heat water treatment of billets with the addition of kasugamycin antibiotic dosage 300mL/100L H2O in order to try to reduce bacterial escape from the standard treatments, as also in other time and temperature combinations proposed: T1 = 52°C/30 '; T2 = 52°C/1hr; T3 = 50°C/1hr; T4 = 50°C/2hrs; T5 = 52°C/30 '+ antibiotic; T6 = 52°C/1hr + antibiotic; T7 = 50°C/1hr + antibiotic; T8 = 50°C/2hrs + antibiotic; T9 = antibiotic and T10 = control. Moreover, among techniques for diagnosis of such diseases, the most used by laboratories are the serological tests which have the advantage of quantitatively detecting the presence of bacteria on the stems but, however, has the disadvantage of detecting only when the bacterial population is relatively high. PCR technique that is one of the techniques considered most sensitive, has not been used in practice, as this high sensitivity has not been used, the protocols do not detect bacterial diseases in the case of latent infection, where bacterial title is relatively low. So the other work aimed at improving the Xanthomonas albilineans detection developing a LAMP protocol, and compared to other techniques of detection and isolation in semiselective medium, PCR and nested PCR for both symptomatic samples and for asymptomatic and the latter where population in general pathogen is low, we improved Nested one protocol to detect the leaf scald in latent infections by comparing the vascular fluid extraction techniques combined with four different DNA extraction protocols. / O cultivo de cana-de-açúcar está em expansão no Brasil, devido principalmente ao crescente consumo de etanol por carros bicombustíveis. A área plantada está em crescimento, mas a produtividade nos últimos anos vem decrescendo, e fatores como incidência de doenças podem estar contribuindo para tal situação. Dentre as doenças, as bacterianas, como o raquitismo das soqueiras e a escaldadura das folhas, possuem grande importância para a cultura, pois podem reduzir a produtividade em até 30%. Nem sempre os sintomas são visualizados em campo, necessitando assim de técnicas avançadas de detecção ou controle. Para a bacteria Leifsonia xyli subsp. xyli (Lxx), que causa o raquitismo das soqueiras em cana-de-açúcar a medida de controle mais utilizada além da resistência varietal é tratar termicamente os toletes que servirão de mudas. Assim o objetivo do primeiro trabalho foi realizar o tratamento térmico dos toletes com a adição de antibiótico casugamicina à dosagem de 300mL/100L de H2O com o intuito de tentar reduzir o escape bacteriano dentre os tratamentos padrões, como também em outras combinações de tempo e temperatura propostos: T1= 52ºC/30’; T2= 52ºC/1hr; T3= 50ºC/1hr; T4= 50ºC/2hrs; T5= 52ºC/30’ + antibiótico; T6= 52ºC/1hr + antibiótico; T7= 50ºC/1hr + antibiótico; T8= 50ºC/2hrs + antibiótico; T9= antibiótico e T10= testemunha. Além disso, dentre as técnicas para diagnose de tais doenças, as mais utilizadas por laboratórios são os testes sorológicos, que tem como vantagem detectar quantitativamente a presença das bactérias nos colmos mas, no entanto, possui a desvantagem de detectar somente quando a população bacteriana está relativamente alta. Já a técnica de PCR que é uma das tecnicas consideradas mais sensíveis, não vem sendo utilizada na prática, pois esta alta sensibilidade não vem ocorrendo. Os protocolos não detectam as bacterioses no caso de infecção latente, onde o título bacteriano é relativamente baixo. Portanto, os demais trabalhos visaram aprimorar a detecção Xanthomonas albilineans desenvolvendo um protocolo LAMP, e comparando com outras tecnicas de detecção como isolamento em meio semi-seletivo, PCR e Nested-PCR, tanto para amostras sintomáticas quanto para assintomáticas. Para estas últimas onde a população do patógeno de maneira geral é baixa, aprimoramos um protocolo Nested para detectar escaldadura das folhas em infecções latentes, comparando técnicas de extração do fluído vascular combinado a quatro diferentes protocolos de extração de DNA.

Introdução: Um dos principais fatores associados à mortalidade e morbidade no período perinatal é o nascimento pré-termo. Sua prevalência está aumentando em diversas localidades e os motivos para tal envolve complexa inter-relação de fatores que incluem aspectos biológicos, de assistência, psicológicos, sociais e econômicos, entre diversos outros associados ao nascimento pré-termo. Objetivo: O presente estudo objetiva analisar os efeitos de variáveis associadas ao nascimento pré-termo, via modelagem de equações estruturais (MEE), com a construção de variáveis latentes de vulnerabilidade socioeconômica, familiar, psicossocial, condições maternas e intercorrências. Outros objetivos são analisar as diversas fontes de obtenção da idade gestacional (IG) visando gerar uma variável latente para a idade gestacional e comparar modelos com diferentes tipos de variável de desfecho (contínuo, ordinal, binário e latente). Métodos: Esse estudo foi baseado na pesquisa do tipo caso-controle populacional sobre nascidos vivos hospitalares de mães residentes na cidade de Londrina, estado do Paraná, realizado entre junho de 2006 e março de 2007. A partir de um modelo conceitual, foi empregada a MEE para construir modelos com variáveis latentes e compostas com utilização de medidas de ajustes. Resultados: O Modelo final apontou os seguintes efeitos diretos sobre IG: intercorrências, atenção de pré-natal inadequada, gestação múltipla, condição reprodutiva, IMC, consumo de bebida alcoólica, prática de caminhadas e esforço físico. Além do efeito direto da atenção pré-natal, foi encontrado seu papel de variável de mediação entre as variáveis latentes: Vulnerabilidade Socioeconômica, Não Aceitação da Gravidez e Vulnerabilidade Familiar e o desfecho IG. Conclusões: Para a utilização de MEE, foi necessário rediscutir o papel das variáveis propostas no estudo original, o que sugere que, para a aplicação da metodologia, já seja considerada a formulação de variáveis latentes à priori na fase de planejamento de uma pesquisa. A aplicação do MEE permitiu construir variáveis latentes e variáveis compostas a partir do estudo original e identificar efeitos diretos, indiretos e de mediação sobre IG. Ademais, foi possível construir e utilizar a variável latente IG a partir das fontes de registro. / Introduction: One of the main factors associated with mortality and morbidity in the perinatal period is preterm birth. Its prevalence is increasing in many locations and the reasons for such involves a complex interplay of factors associated with preterm birth including biological aspects, assistance, psychological, social and economic factors birth, among many others associated with preterm birth. Objective: This study aims to analyze the effects of variables associated with preterm birth via structural equation modeling (SEM), with the construction of latent variables of socioeconomic vulnerability, family, psychosocial, and maternal complications. Other objectives are to analyze the use of various sources of registering gestational age in order to generate a latent variable for gestational age (GA) and compare models with different types of outcome (continuous, ordinal, binary and latent variable). Methods - This study was based on research in population case-control over hospital births to mothers resident in the city of Londrina, Paraná, conducted between June 2006 and March 2007. From a conceptual model it was used SEM to build models with latent and composite variables with use of adjustment measures. Results: The final model showed the following direct effects on GA: complications, prenatal care inadequate, multiple gestation, reproductive condition, BMI, alcohol consumption, going for walks and effort. Besides the direct effect of prenatal care, found their role of mediating variable between latent variables: Socioeconomic Vulnerability, Not Acceptance of Pregnancy, Vulnerability and Family and the outcome GA. Conclusions: For the use of SEM it was necessary to revisit the role of the variables proposed in the original study, which suggests that, for the application of the methodology, it is already considered the formulation of a priori latent variables in the planning phase of a research. The application allowed SEM to build latent variables and composite variables from the original study and identify direct, indirect and mediating effects on GA. Furthermore, it was possible to build and use the GA latent variable from the recording sources.