Cette recherche vise à étudier les processus de transformation du « sale boulot » en « bel ouvrage » et ce en privilégiant la problématique de la reconnaissance de soi au travail, entendue comme résultant d’une tension entre les « usages de soi ». La division morale du travail à l'hôpital ordonne les tâches, mais aussi les métiers autour d’une répartition clivant les activités au service de la vie et les activités au service de l’épuration des traces de la mort. L’ investigation part de la notion de « sale boulot » et analyse les traces de cette division morale et psychologique du travail, ici celles qui se réfèrent à des activités de confrontation à la mort.Le cadre théorique retenu articule l’éclairage anthropologique et historique du traitement de la mort dans la société et dans l’hôpital, le concept de négatif psychosocial comme analyseur de la hiérarchisation morale du travail et la reconnaissance de soi, discutée par les théories de la clinique du travail. Ici, l’activité est l’unité d’analyse fondamentale et le collectif de travail est conceptualisé comme espace transitionnel où les usages de soi sont dialectalisés. Les activités analysées et comparées sont les Interruptions Médicales de Grossesse (IMG) et les Interruptions Volontaires de Grossesse (IVG) dans une unité de gynécologie ainsi que celles d’accompagnement de la fin de vie en équipe mobile de soins palliatifs. La méthodologie s’inscrit dans la tradition de la recherche action et s’appuie sur l’observation-participante et la conduite d’entretiens semi-structurés auprès de soignants et de leur encadrement. Les résultats de cette recherche sont présentés selon trois axes : la hiérarchisation morale des unités, des professionnels et des activités est articulée aux stratégies défensives collectives, aux idéologies de métier: elles contribuent à la définition et à la délégation du « sale boulot » dans l’organisation du travail. Le deuxième axe présente les différentes configurations groupales en fonction de la sollicitation d’affects archaïques dans les activités, liant ou déliant les collectifs de travail. Des stratégies de dégagement ont été identifiées : elles ouvrent la voie à la construction des trames symboliques qui permettent de domestiquer les résonances fantasmatiques de la confrontation avec « l’objet » de travail, la mort et ses équivalents symboliques, la maladie, la vieillesse, la déficience, la perte, le manque ... La capacité d’instituer de nouvelles normes et de se reconnaître dans son travail puise dans des configurations collectives fondées sur des règles partagées. Dans les cas de défaillances du collectif de travail, le recours aux ressources trans-individuelles permet de subvertir le négatif en travail estimable : elles renvoient au travail de civilisation, dans ses différentes dimensions. / This research aimed at studying the process of transformation of “dirty work” into “commendable work”. This was done by highlighting self-recognition at work, understood as the result of self-agency tensions. Work moral division at the hospital organizes tasks as well as careers through the separation of life-preserving related activities from death-reminiscence related ones. The research focuses on the notion of “dirty work” and analyzes, through death-related activities, work’s moral and psychological division.The theoretical framework used articulates anthropological and historical views on how modern society and thereby, the hospital deals with death; intertwining theories derived from “work’s clinical psychology” with the concept of psychosocial negative, analyzer of both work’s moral hierarchy and self-recognition. Herein, activity is the fundamental unit of analysis and the “collective work arrangements” are conceptualized as transitional space for the emergence of self-agency dialectics. The activities analyzed and compared are medical termination of pregnancy, abortion at the gynecological unit and accompanying the dying at the palliative care mobile team. The method subscribes to the action-research tradition, whereby participant-observation and semi-structured interviews with healthcare workers as well as chief-nurses were used. The results of this research are presented under three main axes: Firstly, the moral hierarchization of the medical units, of the professions and of the activities is articulated to the collective defense strategies as well as to professional ideology, which contribute to the definition and to the banishment of “dirty work”, thus structuring the organization of work itself. Secondly, the different group configurations are a function of archaic affects emerging from dealing with death-related activities. These may involve, but also encumber healthcare professionals, thus disorganizing the “collective work arrangements”. Strategies to disengage were identified: they open up to symbolic resources which allow restraining fantasmatic resonance induced by the confrontation of the object of their work, i.e. death, and its symbolic equivalents, disease, old-age, deficiency, loss… Moreover, the capacity to institute new norms and to recognize oneself while working has its bearing on collective configuration founded upon shared norms. Finally, should “collective work arrangements” fail to be created, trans-individual resources are called upon to subvert negative into estimable work, based on the different dimensions of “Civilization work”.

Durant la décennie écoulée, une série de scandales financiers impliquant des firmes d’envergure internationale (Enron, Tyco, Parmalat, etc.) a secoué les places boursières en déclenchant une crise de la confiance chez les investisseurs. L’analyse des cas précités a révélé un recours massif à la fraude et aux manipulations comptables ce qui a relancé le débat autour de la question de la Qualité du Reporting Financier et de l’efficience des mécanismes de gouvernance.En effet, de récents constats révèlent que des problèmes d’agence générés par une structure de propriété complexe caractérisée par la concentration de la propriété familiale et le recours accru aux mécanismes de renforcement du contrôle vont favoriser l’extraction des bénéfices privés par les actionnaires de contrôle au détriment des minoritaires et par conséquent accroître leur l’incitation à la manipulation de l’information comptable et financière offerte et ce pour dissimuler leurs agissements opportunistes.Dans ce cadre, la présente thèse se propose d’étudier dans quelle mesure la structure de propriété complexe peut entrainer des conflits d’agence aggravant les problèmes d’incitation chez l’actionnaire contrôlant en favorisant l’extraction des bénéfices privés via les transactions avec les parties liées et d’analyser l’effet de cette expropriation sur la Qualité du Reporting Financier de l’entreprise.Nous poursuivons trois principaux objectifs. Le premier est de savoir comment les attributs de la structure de propriété complexe vont impacter la consommation des bénéfices privés faite via les transactions avec les parties liées. Le second est d’analyser comment la dissimulation de la consommation des bénéfices privés va impacter la qualité du reporting financier mesurée par la gestion des résultats comptable et réelle et le conservatisme conditionnel et inconditionnel tout en prenant en considération l’interaction entre la gestion des résultats et le conservatisme. Le troisième objectif est de tester, dans le cadre du conflit principal-principal, l’efficience du rôle du conseil d’administration dans la discipline des actionnaires contrôlants à travers la réduction des bénéfices privés ainsi que dans la garantie d’un reporting financier de qualité en s’opposant à la manipulation de l’information.C’est ainsi que sur un échantillon d’entreprises françaises cotées sur l’indice SBF 250 observées sur la période 2001 à 2009 notre étude a révélé que l’excès du contrôle de l’actionnaire ultime est associée à une plus grande consommation des bénéfices privés. Nous relevons également une relation en U inversé entre la concentration de la propriété de l’actionnaire ultime et les bénéfices privés. La présence de plusieurs détenteurs de blocs de contrôle entrainant une contestabilité du contrôle s’oppose à la consommation des bénéfices privés. Nous avons pu valider l’hypothèse de la dissimulation en confirmant l’effet médiateur des bénéfices privés du contrôle dans la relation entre la concentration de la propriété de l’actionnaire ultime et la concentration de la propriété institutionnelle d’une part et la gestion réelle des résultats de l’autre. Nos résultats empiriques confirment l’efficience de l’indépendance du conseil d’administration dans la réduction des bénéfices privés et la gestion des résultats.Mots clé : Bénéfices privés du contrôle, transactions avec les parties liées, structure de propriété complexe, conseil d’administration, gestion des résultats et conservatisme. / During the past decade, a series of financial scandals involving firms of international scope (Enron, Tyco, Parmalat, etc.) has shaken the stock exchanges in triggering a crisis of confidence among investors. The analysis of the aforementioned cases revealed a massive use of fraud and accounting manipulations which has relaunched the debate on the financial reporting quality and the efficiency of corporate governance mechanisms.Recent findings reveal that of agency problems generated by a structure of complex ownership structure characterized by the concentration of the family ownership and the increased use of control-enhancing mechanisms will promote the extraction of private profits by the controlling shareholders to the detriment of the minority and therefore increase their incentives to the manipulation of earnings in order to conceal their opportunistic behavior.In this framework, this thesis proposes to study to what extent the structure of complex ownership may cause conflicts of agency aggravating the problems of incitement in the controlling shareholder in favoring the extraction of private profits via the conclusion of related party transactions and to analyze the effect of this expropriation on the financial reporting quality of the firm.We are pursuing three main objectives. The first is to understand how the attributes of the complex ownership structure can affect the private benefits consumption via the conclusion of related party transactions. The second objective is to analyze how the concealment of the consumption of private benefits will impact the financial reporting quality as proxied by the accounting and real earnings management and the conditional and unconditional conservatism. while taking into account the interaction between earnings management and the conservatism. The third objective is to test, in the context of the principal-principal agency conflict, the efficiency of the role of the board of directors in the discipline of the controlling shareholders through the reduction of private profit as well as in the guarantee of the financial reporting of quality.Our study focuses on a sample of 81 French companies listed on the SBF 250 index observed on the period 2001 to 2009. Our results reveal that the excess of the control of the ultimate shareholder is associated with greater private benefits consumption. We also note an inverted U-shaped relationship between the ultimate ownership concentration and private benefits. The presence of multiple large shareholders causing a contestability of control reduces the private benefits extraction. We validate the private benefits dissimulation hypothesis by confirming the mediating effect of the private benefits of control in the relationship between the ultimate shareholder ownership and the institutional ownership the real earnings management. Our empirical results confirm the efficiency of the independence of the board of directors in the reduction of private benefits and the earnings management. Against all expectation, we note a week effect of the Audit Committee on of financial reporting qualityKey words: Private benefits of control, related party transactions, ownership structure, board of directors, earnings management, conservatism.

Les femmes développent une réponse immunitaire plus forte que celle des hommes. Ceci les protège vis-à-vis des infections virales ou bactériennes, mais augmente également leur risque de développer une pathologie auto-immune. Le lupus érythemateux systémique (LES) est une pathologie auto-immune prototypique à fort dimorphisme sexuel, avec 9 femmes affectées pour 1 homme. TLR7 (Toll-like receptor 7) est un TLR endosomal spécifique de l'ARN simple brin. Ce récepteur joue un rôle crucial dans la réponse antivirale mais aussi dans la rupture de tolérance à la base de la pathologie lupique. Sa surexpression dans un modèle murin suffit à induire le développement spontané d'un lupus. Au contraire, son invalidation dans des souches de souris développant un lupus spontané, est protectrice. Chez l'Homme, TLR7 est exprimé dans les cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDC), les monocytes, ainsi que dans les lymphocytes B (LB). Son engagement induit la production de médiateurs pro-inflammatoires par les pDC et les monocytes, et la maturation et la production d'anticorps par les LB. Le gène TLR7 est porté sur le bras court du chromosome X. Un mécanisme compensatoire du dosage des gènes portés sur les gonosomes intervient dans les cellules des mammifères, où un des deux chromosomes X est aléatoirement inactivé pendant le développement embryonnaire. Or ce mécanisme est imparfait et, chez les femmes, au minimum 15% des gènes portés sur l'X sont susceptibles d'échapper à son inactivation. Vu l'effet du dosage de Tlr7 dans les modèles murins du lupus, et de la localisation de TLR7 sur le chromosome X humain, nous avons cherché à déterminer si TLR7 serait sujet à l'échappement à l'inactivation de l'X chez les femmes. Pour cela nous avons développé une approche basée sur l'analyse sur cellule unique de l'expression d'un marqueur allélique au niveau des transcrits de TLR7. Nos résultats démontrent que ce gène échappe à l'inactivation du chromosome X dans 30% environ des LB, monocytes et pDC de femmes saines. De plus, nous avons observé par une technique d'hybridation in situ la transcription simultanée des deux allèles. L'expression bi-allélique de TLR7 est associée à une augmentation significative de l'ARNm de TLR7 dans les LB naïfs. Enfin, nos résultats démontrent que les LB naïfs exprimant les deux allèles de TLR7 sont préférentiellement enrichis dans les cellules différentiées dont la commutation de classe a été induite par un ligand de TLR7. De la même façon, les cellules plasmocytaires où TLR7 échappe à l'inactivation de l'X sont enrichies parmi les cellules prolifératrices en réponse à l'engagement de TLR7. En conclusion, ce travail démontre que le gène TLR7 échappe à l'inactivation de l'X chez plusieurs types de cellules immunitaires, que le dosage des transcrits du gène s'en trouve augmenté chez les lymphocytes B, et que la réponse biologique à l'engagement TLR7 est plus importante chez les lymphocytes B à expression bi-allélique. Par ailleurs, de premiers résultats mettent en évidence l'échappement de TLR7 à l'inactivation de l'X chez des hommes atteints du syndrome de Klinefelter (47, XXY). Ceci pourrait expliquer leur susceptibilité équivalente à celle des femmes au développement du lupus. / Women develop stronger immune responses than men, with positive effects on the resistance to viral or bacterial infections but magnifying also the susceptibility to autoimmune diseases like systemic lupus erythematosus (SLE), which affects 9 women per 1 man. Toll-like receptor 7 (TLR7) is an endosomal single-stranded RNA sensor that plays a key role in the initiation of the antiviral response. TLR7 dosage, however, is also a crucial determinant in SLE, and Tlr7 overexpression suffices to induce spontaneous lupus-like disease. Conversely, Tlr7 knock-out abolishes SLE development in lupus-prone mice. In humans, TLR7 is expressed in plasmacytoid dendritic cells (pDCs), monocytes and B lymphocytes. TLR7 engagement increases B cell maturation and production of antibodies, but also the production of pro-inflammatory cytokines by pDCs and monocytes. Human TLR7 is encoded on the short arm of the X chromosome. The cells of female mammals randomly inactivate one X chromosome in the course of embryonic development to equalize gene dosage between the sexes. However, 15% of X-linked human genes consistently escape inactivation so that both alleles are expressed in individual cells. Because increased dosage of TLR7 expression due to non-inactivation could contribute to autoimmunity, we investigated allelic expression of TLR7 in individual immune cells from women using a TLR7 allelic marker observable on mRNA molecules. Our results show that TLR7 escapes X chromosome inactivation in about 30% of B cells, pDCs and monocytes. TLR7 bi-allelic expression was observed also in situ by RNA-FISH. Naive B cell TLR7 bi-allelic expression is accompanied by higher TLR7 mRNA expression. Our results demonstrate that TLR7 escape from X-inactivation is associated with an enhanced plasma cell proliferative response to TLR7 ligands, and promotes immunoglobulin class switch induced by T cell help and TLR7 engagement. Our study provides proof of principle that TLR7 escapes from X chromosome inactivation in several types of immune cells of women and results in greater transcriptional expression, and shows also that cellular function in bi-allelic B cells is augmented in a TLR7-specific manner. Bi-allelic expression of TLR7 in women is thus a potential risk factor in the pathogenesis of SLE. Our initial results show also that TLR7 escapes from X inactivation in the immune cells of men with Klinefelter syndrome (47, XXY), which may explain a risk of SLE equivalent to women's.

Données Liées est un terme pour définir un ensemble de meilleures pratiques pour la publication et l'interconnexion des données structurées sur le Web. A mesure que le nombre de fournisseurs de Données Liées augmente, le Web devient un vaste espace de données global. La fédération de requêtes est l'une des approches permettant d'interroger efficacement cet espace de données distribué. Il est utilisé via un moteur de requêtes fédéré qui vise à minimiser le temps de réponse du premier tuple du résultat et le temps d'exécution pour obtenir tous les tuples du résultat. Il existe trois principales étapes dans un moteur de requêtes fédéré qui sont la sélection de sources de données, l'optimisation de requêtes et l'exécution de requêtes. La plupart des études sur l'optimisation de requêtes dans ce contexte se concentrent sur l'optimisation de requêtes statique qui génère des plans d'exécution de requêtes avant l'exécution et nécessite des statistiques. Cependant, l'environnement des Données Liées a plusieurs caractéristiques spécifiques telles que les taux d'arrivée de données imprévisibles et les statistiques peu fiables. En conséquence, l'optimisation de requêtes statique peut provoquer des plans d'exécution inefficaces. Ces contraintes montrent que l'optimisation de requêtes adaptative est une nécessité pour le traitement de requêtes fédéré sur les données liées. Dans cette thèse, nous proposons d'abord un opérateur de jointure adaptatif qui vise à minimiser le temps de réponse et le temps d'exécution pour les requêtes fédérées sur les endpoints SPARQL. Deuxièmement, nous étendons la première proposition afin de réduire encore le temps d'exécution. Les deux propositions peuvent changer la méthode de jointure et l'ordre de jointures pendant l'exécution en utilisant une optimisation de requêtes adaptative. Les opérateurs adaptatifs proposés peuvent gérer différents taux d'arrivée des données et le manque de statistiques sur des relations. L'évaluation de performances dans cette thèse montre l'efficacité des opérateurs adaptatifs proposés. Ils offrent des temps d'exécution plus rapides et presque les mêmes temps de réponse, comparé avec une jointure par hachage symétrique. Par rapport à bind join, les opérateurs proposés se comportent beaucoup mieux en ce qui concerne le temps de réponse et peuvent également offrir des temps d'exécution plus rapides. En outre, le deuxième opérateur proposé obtient un temps de réponse considérablement plus rapide que la bind-bloom join et peut également améliorer le temps d'exécution. Comparant les deux propositions, la deuxième offre des temps d'exécution plus rapides que la première dans toutes les conditions. En résumé, les opérateurs de jointure adaptatifs proposés présentent le meilleur compromis entre le temps de réponse et le temps d'exécution. Même si notre objectif principal est de gérer différents taux d'arrivée des données, l'évaluation de performance révèle qu'ils réussissent à la fois avec des taux d'arrivée de données fixes et variés. / Linked Data is a term to define a set of best practices for publishing and interlinking structured data on the Web. As the number of data providers of Linked Data increases, the Web becomes a huge global data space. Query federation is one of the approaches for efficiently querying this distributed data space. It is employed via a federated query engine which aims to minimize the response time and the completion time. Response time is the time to generate the first result tuple, whereas completion time refers to the time to provide all result tuples. There are three basic steps in a federated query engine which are data source selection, query optimization, and query execution. This thesis contributes to the subject of query optimization for query federation. Most of the studies focus on static query optimization which generates the query plans before the execution and needs statistics. However, the environment of Linked Data has several difficulties such as unpredictable data arrival rates and unreliable statistics. As a consequence, static query optimization can cause inefficient execution plans. These constraints show that adaptive query optimization should be used for federated query processing on Linked Data. In this thesis, we first propose an adaptive join operator which aims to minimize the response time and the completion time for federated queries over SPARQL endpoints. Second, we extend the first proposal to further reduce the completion time. Both proposals can change the join method and the join order during the execution by using adaptive query optimization. The proposed operators can handle different data arrival rates of relations and the lack of statistics about them. The performance evaluation of this thesis shows the efficiency of the proposed adaptive operators. They provide faster completion times and almost the same response times, compared to symmetric hash join. Compared to bind join, the proposed operators perform substantially better with respect to the response time and can also provide faster completion times. In addition, the second proposed operator provides considerably faster response time than bind-bloom join and can improve the completion time as well. The second proposal also provides faster completion times than the first proposal in all conditions. In conclusion, the proposed adaptive join operators provide the best trade-off between the response time and the completion time. Even though our main objective is to manage different data arrival rates of relations, the performance evaluation reveals that they are successful in both fixed and different data arrival rates.

Plusieurs ressources publiées sur le Web de données sont dotées de références spatiales qui décrivent leur localisation géographique. Ces références spatiales sont un moyen favori pour interconnecter et visualiser les ressources sur le Web de données. Cependant, les hétérogénéités des niveaux de détail et de modélisations géométriques entre les sources de données constituent un défi majeur pour l’utilisation de la comparaison des références spatiales comme critère pour l’interconnexion des ressources. Ce défi est amplifié par la nature ouverte et collaborative des sources de données du Web qui engendre des hétérogénéités géométriques internes aux sources de données. En outre, les applications de visualisation cartographique des ressources géoréférencées du Web de données ne fournissent pas une visualisation lisible à toutes les échelles.Dans cette thèse, nous proposons un vocabulaire pour formaliser les connaissances sur les caractéristiques de chaque géométrie dans un jeu de données. Nous proposons également une approche semi-automatique basée sur un référentiel topographique pour acquérir ces connaissances. Nous proposons de mettre en oeuvre ces connaissances dans une approche d’adaptation dynamique du paramétrage de la comparaison des géométries dans un processus d’interconnexion. Nous proposons une approche complémentaire s’appuyant sur un référentiel topographique pour la détection des liens de cardinalité n:m. Nous proposons finalement des applications qui s’appuient sur des données topographiques de référence et leurs liens avec les ressources géoréférencées du Web pour offrir une visualisation cartographique multiéchelle lisible et conviviale / Many resources published on the Web of data are related to spatial references that describe their location. These spatial references are a valuable asset for interlinking and visualizing data over the Web. However, these spatial references may be presented with different levels of detail and different geometric modelling from one data source to another. These differences are a major challenge for using geometries comparison as a criterion for interlinking georeferenced resources. This challenge is even amplified more due to the open and often volunteered nature of the data that causes geometric heterogeneities between the resources of a same data source. Furthermore, Web mapping applications of georeferenced data are limited when it comes to visualize data at different scales.In this PhD thesis, we propose a vocabulary for formalizing the knowledge about the characteristics of every single geometry in a dataset. We propose a semi-automatic approach for acquiring this knowledge by using geographic reference data. Then, we propose to use this knowledge in approach for adapting dynamically the setting of the comparison of each pair of geometries during an interlinking process. We propose an additional interlinking approach based on geographic reference data for detecting n:m links between data sources. Finally, we propose Web mapping applications for georeferenced resources that remain readable at different map scales

La septicémie associée à un cathéter de voie centrale (central line-associated bloodstream infection, CLABSI) est la cause la plus fréquente d’infection nosocomiale aux soins intensifs et entraine une morbidité significative, un allongement des durées d’hospitalisation et un accroissement des coûts. La maîtrise des CLABSI est une préoccupation permanente dans les institutions hospitalières. <p>Les staphylocoques à coagulase négative (SCN), et en particulier Staphylococcus epidermidis, colonisants de la peau, sont parmi les agents pathogènes opportunistes les plus fréquemment impliqués dans les infections de matériel étranger comme les cathéters, grâce à leur capacité à produire un biofilm. <p>Dans un travail préliminaire sur la prise en charge des septicémies sur cathéters à chambres implantables, nous avons observé qu’un tiers des septicémies dues à des SCN se solde par le retrait du cathéter et que la sévérité des présentations cliniques est très variable. Nous avons suspecté que des facteurs liés à S. epidermidis lui même pouvaient jouer un rôle dans la sévérité de la présentation clinique et le succès ou l’échec thérapeutique. <p><p>Objectifs :<p>Ce travail de thèse a pour but d’approfondir les connaissances nécessaires à la maîtrise de la septicémie sur cathéter à S. epidermidis. Il a été développé sur deux axes principaux :(1) une recherche sur les facteurs liés au pathogène, basée sur l’étude phénotypique et génotypique des différences entre les S. epidermidis provenant de trois sous-populations (volontaires sains - personnel soignant - patients avec CLABSI) et sur la compréhension de la source à l’origine de la contamination (peau du patient versus personnel soignant); (2) une approche clinique opérationnelle sur les aspects de prévention et de surveillance des CLABSI.<p><p>Méthodes :<p>Nos travaux de recherche ont porté sur l’épidémiologie moléculaire des S. epidermidis (pulsotypie, PFGE et multi-locus sequence typing, MLST), sur leur antibio-résistance (phénotypique et génotypique), sur la détermination du type de cassette mec (SCCmec typing), sur l’identification de facteurs de virulence [ACME (arginine catabolic mobile element) et ica (intercellular adhesin)] et sur la recherche de la production de biofilm in vitro dans les sous-populations étudiées. <p>Nous avons également discuté les limites des définitions des CLABSI dans une étude comparative et avons investigué, dans une étude multicentrique, la prévention des CLABSI par un programme de monitoring externe des processus de soins de cathéters et de feedback régulier au personnel soignant concernant leurs indicateurs de performance. <p><p>Résultats :<p>Facteurs liés au pathogène :<p>Les souches de S. epidermidis colonisant le personnel soignant sont résistantes à plus <p>d’antibiotiques que celles colonisant les volontaires sains (multisensibles), mais à un moins grand nombre que celles causant des CLABSI (souvent multirésistantes), à l’exception de la résistance à la méticilline. <p>La production de biofilm est sous la dépendance de l’opéron ica mais l’expression de ces gènes est variable, soumise à une régulation complexe. La majorité des S. epidermidis ayant une production importante de biofilm in vitro sont porteurs de l’opéron ica tandis que la majorité des S. epidermidis n’en produisant pas sont ica négatif. Par contre, nous avons observé que les souches de S. epidermidis formant un biofilm in vitro avec une biomasse importante étaient présentes dans les trois sous-populations étudiées. <p>Tant les S. epidermidis commensaux que ceux responsables d’infection présentent une grande diversité génétique par PFGE mais ils se révèlent, après analyse MLST, comme appartenant pour la plupart au même complexe clonal (CC).<p>Nous avons également montré que dans un tiers des cas, les souches de S. epidermidis récoltées sur les mains des soignants dans le même hôpital et au cours de la même période de temps, sont identiques à celles responsables de CLABSI, ce qui soutient l’hypothèse que les soignants peuvent servir de réservoir.<p>Cependant, les présentations cliniques les plus sévères de CLABSI sont dues à des souches de S. epidermidis appartenant à certains MLST séquences types (STs) particuliers :ST2 et SLV (single locus variant) ST54, toutes ica positives, mecA positives et multi-résistantes. Aucune souche présentant ces MLST types n’a été retrouvée sur les mains des soignants, ni chez les volontaires sains. <p><p>Surveillance et prévention :<p>Nous avons démontré que l’intensité de la documentation microbiologique et l’usage de définitions incluant des critères cliniques font varier les densités d’incidence de CLABSI mesurés et donc limitent l’intérêt des comparaisons inter-hospitalières. <p>Nous avons également démontré l’efficacité d’un programme original de prévention de type audit externe des compliances aux processus de soins des cathéters associé à un feedback régulier. En effet, nous avons observé une diminution statistiquement significative de l’incidence des CLABSI dans les unités de soins intensifs mais nous avons également identifié les limites de cette approche.<p><p>Conclusion :<p>La septicémie sur cathéter due à S. epidermidis peut être contrôlée par un programme de prévention en diminuant les risques de contamination tant endo- qu’extra-luminale. Cependant, certains clones de S. epidermidis (ST2 et ST54) particulièrement adaptés à l’environnement hospitalier, combinant virulence et multi-résistance, sont responsables de présentations cliniques sévères de CLABSI. De nouvelles approches basées sur les caractéristiques des souches pathogènes de S. epidermidis et sur la sévérité de la présentation clinique de la CLABSI pourraient permettre le développement de stratégies de prévention et de traitement plus ciblées.<p> / Doctorat en Sciences médicales / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Cette thèse s’intéresse à l’exploitation de la sémantique de données pour la recherche exploratoire. La recherche exploratoire se réfère à des tâches de recherche qui sont très ouvertes, avec de multiples facettes, et itératives. Les données sémantiques et les données liées en particulier, offrent de nouvelles possibilités pour répondre à des requêtes de recherche et des besoins d’information complexes. Dans ce contexte, le nuage de données ouvertes liées (LOD) joue un rôle important en permettant des traitements de données avancés et des interactions innovantes. Nous détaillons un état de l’art de la recherche exploratoire sur les données liées. Puis nous proposons un algorithme de recherche exploratoire à base de données liées basé sur une recherche associative. A partir d’un algorithme de propagation d’activation nous proposons une nouvelle formule de diffusion optimisée pour les graphes typés. Nous proposons ensuite des formalisations supplémentaires de plusieurs modes d’interrogation avancée. Nous présentons également une architecture logicielle innovante basée sur deux choix de conception paradigmatiques. D’abord, les résultats doivent être calculés à la demande. Deuxièmement, les données sont consommées à distance à partir de services SPARQL distribués. Cela nous permet d’atteindre un niveau élevé de flexibilité en termes d’interrogation et de sélection des données. L’application Discovery Hub implémente ces résultats et les présente dans une interface optimisée pour l’exploration. Nous évaluons notre approche grâce à plusieurs campagnes avec des utilisateurs et nous ouvrons le débat sur de nouvelles façons d’évaluer les moteurs de recherche exploratoires. / The general topic of the thesis is web search. It focused on how to leverage the data semantics for exploratory search. Exploratory search refers to cognitive consuming search tasks that are open-ended, multi-faceted, and iterative like learning or topic investigation. Semantic data and linked data in particular offer new possibilities to solve complex search queries and information needs including exploratory search ones. In this context the linked open data cloud plays an important role by allowing advanced data processing and innovative interactions model elaboration. First, we detail a state-of-the-art review of linked data based exploratory search approaches and systems. Then we propose a linked data based exploratory search solution which is mainly based on an associative retrieval algorithm. We started from a spreading activation algorithm and proposed new diffusion formula optimized for typed graph. Starting from this formalization we proposed additional formalizations of several advanced querying modes in order to solve complex exploratory search needs. We also propose an innovative software architecture based on two paradigmatic design choices. First the results have to be computed at query-time. Second the data are consumed remotely from distant SPARQL endpoints. This allows us to reach a high level of flexibility in terms of querying and data selection. We specified, designed and evaluated the Discovery Hub web application that retrieves the results and present them in an interface optimized for exploration. We evaluate our approach thanks to several human evaluations and we open the discussion about new ways to evaluate exploratory search engines.

Ces dernières années ont témoigné du succès du projet Linked Open Data (LOD) et de la croissance du nombre de sources de données sémantiques disponibles sur le web. Cependant, il y a encore beaucoup de données qui ne sont pas encore mises à disposition dans le LOD telles que les données sur demande, les données de capteurs etc. Elles sont néanmoins fournies par des API des services Web. L'intégration de ces données au LOD ou dans des applications de mashups apporterait une forte valeur ajoutée. Cependant, chercher de tels services avec les outils de découverte de services existants nécessite une connaissance préalable des répertoires de services ainsi que des ontologies utilisées pour les décrire.Dans cette thèse, nous proposons de nouvelles approches et des cadres logiciels pour la recherche de services web sémantiques avec une perspective d'intégration de données. Premièrement, nous introduisons LIDSEARCH, un cadre applicatif piloté par SPARQL pour chercher des données et des services web sémantiques.De plus, nous proposons une approche pour enrichir les descriptions sémantiques de services web en décrivant les relations ontologiques entre leurs entrées et leurs sorties afin de faciliter l'automatisation de la découverte et de la composition de services. Afin d'atteindre ce but, nous utilisons des techniques de traitement automatique de la langue et d'appariement de textes basées sur le deep-learning pour mieux comprendre les descriptions des services.Nous validons notre travail avec des preuves de concept et utilisons les services et les ontologies d'OWLS-TC pour évaluer nos approches proposées de sélection et d'enrichissement. / The last years witnessed the success of the Linked Open Data (LOD) project as well as a significantly growing amount of semantic data sources available on the web. However, there are still a lot of data not being published as fully materialized knowledge bases like as sensor data, dynamic data, data with limited access patterns, etc. Such data is in general available through web APIs or web services. Integrating such data to the LOD or in mashups would have a significant added value. However, discovering such services requires a lot of efforts from developers and a good knowledge of the existing service repositories that the current service discovery systems do not efficiently overcome.In this thesis, we propose novel approaches and frameworks to search for semantic web services from a data integration perspective. Firstly, we introduce LIDSEARCH, a SPARQL-driven framework to search for linked data and semantic web services. Moreover, we propose an approach to enrich semantic service descriptions with Input-Output relations from ontologies to facilitate the automation of service discovery and composition. To achieve such a purpose, we apply natural language processing techniques and deep-learning-based text similarity techniques to leverage I/O relations from text to ontologies.We validate our work with proof-of-concept frameworks and use OWLS-TC as a dataset for conducting our experiments on service search and enrichment.

Internet est une source infinie de données émanant de sources telles que les réseaux sociaux ou les capteurs (domotique, ville intelligente, véhicule autonome, etc.). Ces données hétérogènes et de plus en plus volumineuses, peuvent être gérées grâce au web sémantique, qui propose de les homogénéiser et de les lier et de raisonner dessus, et aux systèmes de gestion de flux de données, qui abordent essentiellement les problèmes liés au volume, à la volatilité et à l’interrogation continue. L’alliance de ces deux disciplines a vu l’essor des systèmes de gestion de flux de données sémantiques RSP (RDF Stream Processing systems). L’objectif de cette thèse est de permettre à ces systèmes, via de nouvelles approches et algorithmes à faible coût, de rester opérationnels, voire plus performants, même en cas de gros volumes de données en entrée et/ou de ressources système limitées.Pour atteindre cet objectif, notre thèse s’articule principalement autour de la problématique du : "Traitement de flux de données sémantiques dans un contexte de systèmes informatiques à ressources limitées". Elle adresse les questions de recherche suivantes : (i) Comment représenter un flux de données sémantiques ? Et (ii) Comment traiter les flux de données sémantiques entrants, lorsque leurs débits et/ou volumes dépassent les capacités du système cible ?Nous proposons comme première contribution une analyse des données circulant dans les flux de données sémantiques pour considérer non pas une succession de triplets indépendants mais plutôt une succession de graphes en étoiles, préservant ainsi les liens entre les triplets. En utilisant cette approche, nous avons amélioré significativement la qualité des réponses de quelques algorithmes d’échantillonnage bien connus dans la littérature pour le délestage des flux. L’analyse de la requête continue permet d’optimiser cette solution en repèrant les données non pertinentes pour être délestées les premières. Dans la deuxième contribution, nous proposons un algorithme de détection de motifs fréquents de graphes RDF dans les flux de données RDF, appelé FreGraPaD (Frequent RDF Graph Patterns Detection). C’est un algorithme en une passe, orienté mémoire et peu coûteux. Il utilise deux structures de données principales un vecteur de bits pour construire et identifier le motif de graphe RDF assurant une optimisation de l’espace mémoire et une table de hachage pour le stockage de ces derniers. La troisième contribution de notre thèse consiste en une solution déterministe de réduction de charge des systèmes RSP appelée POL (Pattern Oriented Load-shedding for RDF Stream Processing systems). Elle utilise des opérateurs booléens très peu coûteux, qu’elle applique aux deux motifs binaires construits de la donnée et de la requête continue pour déterminer et éjecter celle qui est non-pertinente. Elle garantit un rappel de 100%, réduit la charge du système et améliore son temps de réponse. Enfin, notre quatrième contribution est un outil de compression en ligne de flux RDF, appelé Patorc (Pattern Oriented Compression for RSP systems). Il se base sur les motifs fréquents présents dans les flux qu’il factorise. C’est une solution de compression sans perte de données dont l’interrogation sans décompression est très envisageable. Les solutions apportées par cette thèse permettent l’extension des systèmes RSP existants en leur permettant le passage à l’échelle dans un contexte de Bigdata. Elles leur permettent ainsi de manipuler un ou plusieurs flux arrivant à différentes vitesses, sans perdre de leur qualité de réponse et tout en garantissant leur disponibilité au-delà même de leurs limites physiques. Les résultats des expérimentations menées montrent que l’extension des systèmes existants par nos solutions améliore leurs performances. Elles illustrent la diminution considérable de leur temps de réponse, l’augmentation de leur seuil de débit de traitement en entrée tout en optimisant l’utilisation de leurs ressources systèmes / Internet is an infinite source of data coming from sources such as social networks or sensors (home automation, smart city, autonomous vehicle, etc.). These heterogeneous and increasingly large data can be managed through semantic web technologies, which propose to homogenize, link these data and reason above them, and data flow management systems, which mainly address the problems related to volume, volatility and continuous querying. The alliance of these two disciplines has seen the growth of semantic data stream management systems also called RSP (RDF Stream Processing Systems). The objective of this thesis is to allow these systems, via new approaches and "low cost" algorithms, to remain operational, even more efficient, even for large input data volumes and/or with limited system resources.To reach this goal, our thesis is mainly focused on the issue of "Processing semantic data streamsin a context of computer systems with limited resources". It directly contributes to answer the following research questions : (i) How to represent semantic data stream ? And (ii) How to deal with input semantic data when their rates and/or volumes exceed the capabilities of the target system ?As first contribution, we propose an analysis of the data in the semantic data streams in order to consider a succession of star graphs instead of just a success of andependent triples, thus preserving the links between the triples. By using this approach, we significantly impoved the quality of responses of some well known sampling algoithms for load-shedding. The analysis of the continuous query allows the optimisation of this solution by selection the irrelevant data to be load-shedded first. In the second contribution, we propose an algorithm for detecting frequent RDF graph patterns in semantic data streams.We called it FreGraPaD for Frequent RDF Graph Patterns Detection. It is a one pass algorithm, memory oriented and "low-cost". It uses two main data structures : A bit-vector to build and identify the RDF graph pattern, providing thus memory space optimization ; and a hash-table for storing the patterns.The third contribution of our thesis consists of a deterministic load-shedding solution for RSP systems, called POL (Pattern Oriented Load-shedding for RDF Stream Processing systems). It uses very low-cost boolean operators, that we apply on the built binary patterns of the data and the continuous query inorder to determine which data is not relevant to be ejected upstream of the system. It guarantees a recall of 100%, reduces the system load and improves response time. Finally, in the fourth contribution, we propose Patorc (Pattern Oriented Compression for RSP systems). Patorc is an online compression toolfor RDF streams. It is based on the frequent patterns present in RDF data streams that factorizes. It is a data lossless compression solution whith very possible querying without any need to decompression.This thesis provides solutions that allow the extension of existing RSP systems and makes them able to scale in a bigdata context. Thus, these solutions allow the RSP systems to deal with one or more semantic data streams arriving at different speeds, without loosing their response quality while ensuring their availability, even beyond their physical limitations. The conducted experiments, supported by the obtained results show that the extension of existing systems with the new solutions improves their performance. They illustrate the considerable decrease in their engine’s response time, increasing their processing rate threshold while optimizing the use of their system resources

Cette thèse s’inscrit dans le cadre de travaux relatifs au Web Social Sémantique, dans la perspective de la complémentarité et de la coévolution de deux aspects du Web, l’aspect social et sémantique. Le développement du Web au cours de ces dernières années a fait émerger un énorme graphe de données structurées, sémantiques résultant en partie de l’activité des utilisateurs, le LOD. Nous nous intéressons à l’utilisation de ce graphe afin de faciliter l’accès à l’information présente sur le Web, et ce de manière utile, informative et enrichissante pour l’utilisateur. Cette problématique est notamment étudiée dans les scénarios de l’innovation sur le Web – pratiques visant à utiliser des technologies du Web pour contribuer à l’émergence de l’innovation. Une spécificité de ce contexte, assez peu abordé dans la littérature existante, est sans doute le besoin d’inciter les découvertes inattendues et fortuites. Au delà de la simple pertinence sollicitée dans toute situation de recherche et de recommandation sur le Web, le contexte d’innovation impose une certaine ouverture d’esprit pour permettre à l’utilisateur d’accéder aux informations inattendues mais néanmoins pertinentes, et permet par la même occasion de s’inspirer et de transposer des idées d’un domaine à l’autre. Les travaux présentés dans cette thèse ont donc pour objectif d’aider, de manière directe ou indirecte, les acteurs de l’innovation en ligne (e.g., les entreprises qui cherchent à innover, les experts et les porteurs d’idées) de faire des découvertes. Cet objectif ce décline particulièrement par les travaux de construction d’un système de recherche d’experts, un système de recommandation de mots-clés pertinents pour un problème et un système de recommandation de collaborateurs pour aider à un expert d’affronter des problèmes pluridisciplinaires. / This thesis builds upon the work on the Social Semantic Web, a research perspective on the complementarity and coevolution of two aspects of the Web, the social and semantic one. Web development in recent years has given rise to a huge graph of semantically structured data, partly resulting from user activity. We are particularly interested in the use of this graph in order to facilitate access to information found on the Web, in a useful, informative manner. This problem is particularly studied in scenarios related to innovation on the Web - practices to use Web technologies to contribute to the emergence of innovation. A notable specificity of this context, so far little discussed in literature, is the need to encourage serendipity and discovery. Beyond the simple relevance sought in any search and recommendation situation on the Web, the context of innovation requires a certain openness to allow the user to access information relevant yet unexpected, and should also open opportunities to learn and translate ideas from one domain to another.The work presented in this thesis therefore aims to assist, directly or indirectly, the innovators online (eg, companies seeking to innovate, experts and carriers of ideas) to make discoveries. We address each of these challenges in different parts of the thesis. This vision is principally implemented through the construction of an expert search system, Hy.SemEx, a system for keyword recommendation allowing to discover unknown relevant keywords, HyProximity, and an approach for recommending collaborators to experts in order to help them face multidisciplinary problems.