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Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) sont des polluants persistants retrouvés majoritairement dans l’environnement, qui sont reconnus comme hautement toxiques pour les organismes vivants. Les nombreux travaux réalisés sur les mécanismes contrôlant l’évolution des HAP dans le sol et dans la rhizosphère ont mis en exergue le rôle majeur de la biodégradation par les microorganismes et de la sorption aux constituants du sol. Néanmoins, un manque d’informations persiste concernant le devenir de ces HAP dans le sol, et plus particulièrement leur localisation dans les compartiments du sol ainsi que la nature et le comportement des composés issus de leur dégradation. La thèse avait donc comme principaux objectifs : (a) la localisation des HAP et des produits dérivés dans les compartiments du sol (matières organiques, phases minérales, microorganismes et plante), et (b) la quantification et l’identification des composés organiques formant les résidus liés du sol. Pour cela, nous avons couplé deux approches:(i) le suivi d’un HAP modèle marqué, le 13C-phénanthrène (13C-PHE), dans un sol artificiellement contaminé planté et non planté pour notamment déterminer par IRMS et NanoSIMS la distribution du C issu du PHE dans les compartiments et pour identifier les composés dérivés du 13C-PHE par 13C-RMN et TD/pyGCMS. (ii) le suivi d’une contamination ancienne et récente en HAP dans un sol historiquement contaminé pour étudier l’influence des matières organiques et des phases minérales (séparées par un fractionnement densimétrique) dans la rétention des HAP. Plus de 40% du C issu du 13C-PHE est retenu dans le sol après 14 jours de croissance du ray-grass. L’enrichissement en 13C observé dans la plante est du même ordre que celui du sol (E13C ≈ 0.04 % at.) démontrant une incorporation homogène du 13C-PHE entre la plante et le sol. Cet enrichissement global dans la plante est confirmé par les images NanoSIMS réalisées sur les racines. Des hotspots en 13C ont également été observés dans la rhizosphère, et à partir de leur taille, leur forme et leur composition élémentaire en C, N et S ils ont été identifiés comme étant des bactéries, ce qui met en avant leur rôle dans la dynamique des HAP du sol. Dans le sol industriel, la majorité des HAP est retrouvée dans les MO non complexées aux minéraux. En revanche, les HAP fraîchement ajoutés se sont significativement liés aux associations organo-minérales composées de quartz, de feldspaths et de phyllosilicates / Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are major persistent pollutants in the environment that are recognized as highly toxic to living organisms. Numerous studies were carried out on the fate of PAHs in soil and in plant rhizosphere and highlighted the major contribution of biodegradation processes and of the sorption to soil constituents. However, a lack of knowledge remains about the fate of PAHs in the soil and especially their location in soil compartments as well as the nature and the behavior of degradation products. The main objectives of the thesis were: (a) to localize PAHs and their derived products within soil compartments (organic matter, minerals, microorganisms and plant), and (b) to quantify and identify the organic compounds forming bound residues. For this purpose, we used two approaches: (i) the monitoring of a labeled PAH, the 13C-phenanthrene (13C-PHE), in a spiked soil planted or not to determine by IRMS and NanoSIMS the 13C-distribution into compartments and to identify derived compounds of 13C-PHE by 13C-RMN et TD/pyGCMS. (ii) the distribution and localization of aged and freshly spiked PAH contamination in a brownfield soil to study the impact of organic matter and minerals (using soil densimetric fractionation) in the PAH retention. More than 40% of C from 13C-PHE remained in the soil after 14 days of ryegrass growth. The 13C-enrichment in plant tissue was similarly to the soil enrichment (E13C ≈ 0.04 at.%) indicating uniform uptake of 13C-PHE between the soil and plant. NanoSIMS images acquired for roots confirmed this global enrichment in the plant. 13C-Hospots were also observed in the rhizosphere, and on the basis on their size, their shape and their elemental composition in C, N and S, they were identified as bacteria, which emphasize their contribution to the fate of PAHs in soil. In the industrial soil, most of the PAHs were found attached to the free OM. However, the freshly spiked PAHs in the soil were significantly associated with organo-mineral associations containing quartz, feldspars and phyllosilicates

Malgré leur importance dans le déterminisme du sexe chez de nombreux organismes, les chromosomes sexuels ont été étudiés chez quelques espèces seulement du fait du manque de séquences disponibles. En effet, le séquençage et l'assemblage des chromosomes sexuels est rendu très difficile par leurs abondantes séquences répétées. Durant cette thèse, une méthode probabiliste a été développée pour inférer les gènes liés au sexe à partir de données RNA-seq chez une famille. Des tests de cette méthode appelée SEX-DETector sur des données réelles et simulées suggèrent qu'elle fonctionnera sur une grande variété de systèmes. La méthode a inféré ∼1300 gènes liés au sexe chez Silene latifolia, une plante dioïque qui possède des chromosomes sexuels XY pour lesquels quelques données de séquence sont disponibles (dont certaines obtenues lors de cette thèse par séquençage de BACs). Les gènes du Y sont moins exprimés que ceux du X chez S. latifolia, mais le statut de la compensation de dosage (un mécanisme qui corrige la sous-expression des gènes liés au sexe chez les males) est encore controversé. L'analyse des nouveaux gènes liés au sexe inférés par SEX-DETector a permis de confirmer la compensation de dosage chez S. latifolia, qui est effectuée par la surexpression du X maternel, possiblement via un mécanisme epigénétique d'empreinte. Les données ont également été utilisées pour étudier l'évolution de l'expression biaisée pour le sexe chez S. latifolia et ont révélé que la majorité des changements de niveaux d'expression ont eu lieu chez les femelles. Les implications de nos résultats concernant l'évolution de la dioécie et des chromosomes sexuels sont discutés / In many organisms, sexes are determined by sex chromosomes. However, studies have been greatly limited by the paucity of sex chromosome sequences. Indeed, sequencing and assembling sex chromosomes are very challenging due to the large quantity of repetitive DNA that these chromosomes comprise. In this PhD, a probabilistic method was developed to infer sex-linked genes from RNA-seq data of a family (parents and progeny of each sex). The method, called SEX-DETector, was tested on simulated and real data and should performwell on a wide variety of sex chomosome systems. This new method was applied to Silene latifolia, a dioecious plant with XY system, for which partial sequence data on sex chromosomes are available (some of which obtained during this PhD by BAC sequencing), SEX-DETector returned ∼1300 sex-linked genes. In S. latifolia, Y genes are less expressed than their X counterparts. Dosage compensation (a mechanism that corrects for reduced dosage due to Y degeneration in males) was previously tested in S. latifolia, but different studies returned conflicting results. The analysis of the new set of sex-linked genes confirmed the existence of dosage compensation in S. latifolia, which seems to be achieved by the hyperexpression of the maternal X chromosome in males. An imprinting mechanism might underlie dosage compensation in that species. The RNAseq datawere also used to study the evolution of differential expression among sexes in S. latifolia, and revealed that in this species most changes have affected the female sex. The implications of our results for the evolution of dioecy and sex chromosomes in plants are discussed

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Contexte : Jusqu'à présent, les résultats de la recherche de contextes environnementaux et les comportements antécédents de l’obésité pédiatrique n'ont pas été cohérents. But : L’objectif global de cette thèse est d'étudier l'association entre les caractéristiques des parcs, des écoles et des quartiers résidentiels avec des indicateurs liés à l'adiposité : 1) De regroupés les parcs par leurs caractéristiques saillantes et déterminer si certains " types " de parcs sont associés à l'activité physique (AP) et à l'adiposité ; 2) Décrire les écoles en fonction de leurs caractéristiques d’environnement bâties (EB) et sociales prédominantes pour l'AP et d’explorer leurs associations avec l'AP; 3) Déterminer si les caractéristiques théoriquement marchable de l'EB résidentiel sont associées aux comportements de mouvement de 24 heures (sommeil, sédentarité, AP légère (APL), AP modérée à vigoureuse (APMV)) dans les analyses transversales et prospectives. Méthodes : Les données proviennent de la cohorte QUALITY, une étude québécoise portant sur 630 enfants, âgés de 8 à 10 ans lors du recrutement, et ayant une histoire d’obésité parentale. Les environnements des parcs, des résidences et des écoles de 512 participants habitant la Région métropolitaine de Montréal ont été caractérisés. Les données comprenaient des données administratives, de recensement et des observations directes y compris des questionnaires complétés par un membre du personnel de l’école. L'AP des jeunes a été auto rapporté et mesuré par accéléromètres au temps 0 et au suivi 2 ans plus tard. La sédentarité a été mesuré aux deux temps à l'aide d'accéléromètres et le sommeil a été calculé basé sur le temps pendant lequel l'accéléromètre n'était pas porté. L’adiposité a été mesuré avec un DXA au temps 0. L'indice de masse corporelle a été calculé aux deux temps. Les données ont été analysées avec l’analyse en composantes principales, l'analyse en grappes, la régression linéaire et logistique, les équations d'estimation généralisées et l'analyse des données compositionnelles. Résultats : Certaines caractéristiques particulières des parcs, des écoles et des aspects « marchables » des quartiers ont été associées aux résultats liés à l'adiposité chez les participants. Les types de parcs qui offraient des possibilités de jeux non structurés et une variété d'AP étaient associés à l'AP autodéclarée, et les parcs esthétiquement agréables étaient également associés à l’adiposité réduite. Les écoles qui offraient des possibilités de jeux non structurés et qui encourageaient l'AP étaient associées à l'AP. Les caractéristiques « marchables » des quartiers étaient associées à une augmentation de l'APMV et à une diminution du sommeil, de la sédentarité et de l'APL sur une période de 24 heures chez les filles. Conclusion : Cette thèse contribue à la littérature en examinant trois influences contextuelles importantes sur les résultats liés à l'adiposité chez les enfants. Ces environnements ont été caractérisés de façon objective, en opérationnalisant leurs principales caractéristiques et en utilisant des approches statistiques novatrices. Les résultats appuient le concept que la prévention de l'obésité et les efforts visants à accroître l'AP devraient inclure la prise en compte des EB et sociaux et devraient cibler les multiples facteurs qui favorisent des comportements sains chez les enfants. / Background: Paediatric obesity is a global public health concern. In order to identify potential population-based intervention and prevention strategies, environmental contexts are being investigated in relation to childhood obesity and antecedent behaviours, including physical activity (PA). However, to date, findings in the area have been inconsistent. Purpose: The overarching goal of this thesis is to investigate the association between features of parks, school and neighbourhood environments in relation to adiposity-related outcomes. Specifically: 1) To group and characterize parks by their salient features and to determine if certain park “types” are associated with PA and adiposity outcomes; 2) To characterise schools by their predominant built and social environmental features for PA and to explore associations between school features and PA in cross-sectional and prospective analyses; 3) To determine if theoretically walkable features of the neighbourhood built environment are associated with 24-hour movement behaviours (sleep, sedentary behaviour, light physical activity (LPA), moderate-to-vigorous physical activity (MVPA)) in cross-sectional and prospective analyses. Methods: Data were drawn from the QUALITY Cohort, a Quebec-based study of 630 children age 8-10 years at baseline with a parental history of obesity. Baseline park, residential and school environments of 512 participants living in the Montreal Metropolitan Area were characterised. Data included geographically linked census and administrative data and in-person observations. Questionnaires were completed by school principals or physical education teachers. PA was measured at baseline and follow up using self-reported questionnaires and by accelerometer. Sedentary time was measured at baseline and follow up using accelerometers while sleep time was calculated as the time the accelerometer was not worn. Body fat was measured using a DXA at baseline. Overweight and obesity was identified using body mass index computed from measured weight and height at baseline and follow up. Analyses included principal component analysis, cluster analysis, linear and logistic regression, generalized estimating equations and compositional data analysis. Results: Findings point to specific features of parks, schools and theoretically walkable neighbourhood features that are associated with adiposity-related outcomes in the youth participants. Notably, certain types of parks that provide opportunities for unstructured play and a variety of physical activities are associated with self-reported PA while aesthetically pleasing parks are also associated with body fat. Schools that provide opportunities for unstructured play and that promote PA are associated with accelerometer measured PA, and the associations are different between boys and girls. Lastly, theoretically walkable neighbourhood features are associated with an increase in MVPA and a slight decrease in sleep, sedentary time and LPA over a 24-hour period among girls only. Conclusion: This thesis contributes to the literature by considering three important contextual influences on children’s adiposity-related outcomes: parks, school and the residential environment. This is done by objectively characterizing these environments, by operationalising key characteristics of them, and by using innovative statistical approaches. Findings support the notion that obesity prevention and efforts to increase PA should include the consideration and modification of built and social environments and should target the multiple population-level factors that support healthy behaviours among children.

Bien que les impacts des changements climatiques se ressentent de plus en plus, une réponse concertée tarde à voir le jour à l’international. Pour surmonter ces impasses diplomatiques, plusieurs considèrent que la mobilisation de la population pourrait être la clé. C’est pourquoi un nombre croissant de chercheurs se penchent sur l’étude des cadrages des changements climatiques. Ces études suggèrent qu'il serait effectivement possible d'influencer la volonté d'agir des citoyens selon la présentation de l’information. Cependant, peu d'études expérimentales ont été menées, notamment au Canada. Pour combler cette lacune, la présente étude visait à identifier les meilleures façons de communiquer au sujet des changements climatiques actuellement au Québec afin de favoriser l'engagement de la population. Plus précisément, nous souhaitions voir si le fait d'informer la population des impacts sanitaires locaux des changements climatiques augmenterait son soutien aux politiques climatiques, et ce, en diminuant la distance psychologique des changements climatiques. Nous avons donc mené un sondage expérimental en utilisant un échantillon par quotas d'adultes québécois (n = 3 900). Les participants ont été répartis au hasard, soit dans un groupe contrôle qui n'a reçu aucune information, soit dans l'un des groupes de traitement qui a lu un bref essai sur les impacts économiques ou sanitaires des changements climatiques au Québec attribué à l'un des messagers suivants : médecin, économiste, climatologue ou écologiste. Les participants devaient répondre à des questions avant et immédiatement après la lecture de chaque essai. En analysant les différents groupes, nous avons observé que, même si l'exposition au cadrage santé n'a pas augmenté le soutien aux politiques climatiques dans notre échantillon, elle a diminué la distance psychologique des changements climatiques (β = -0.036; IC 95 % -0.060,-0.012; p<0.01). Ce résultat est prometteur, car la diminution de la distance psychologique des changements climatiques pourrait effectivement favoriser l'engagement de la population. / Although our knowledge of the impacts of climate change is growing, a concerted international response is slow to emerge. According to many, we could overcome these diplomatic impasses by increasing political pressure through public engagement. Researchers are now studying how to frame climate change to influence citizens' beliefs and willingness to take action. However, few experimental studies have been conducted, particularly in Canada. To fill this gap, this study aimed to identify the best ways of communicating climate change currently in Quebec to foster greater engagement among the general population. More precisely, we wanted to see if informing the population on the local health impacts of climate change would increase their support for climate policies by diminishing the psychological distance of climate change. Hence, we conducted an experimental survey using a quota sample of Quebec adults (n = 3 900). Participants were randomly assigned to either a control group that received no additional information or to one of the treatment groups that read a brief essay on the economic or health impacts of climate change in Quebec that was attributed to one of the following messengers: a doctor, economist, climate scientist, or environmentalist. Participants answered questions before and immediately after reading their assigned treatment. In the regression analysis, we found that, even though exposure to a health message did not increase climate policy support, it did decrease the psychological distance of climate change (β = -0.036; 95 % CI -0.060,-0.012; p<0.01). This result is promising as diminishing the psychological distance of climate change could indeed foster greater public engagement.

Thèse ou mémoire avec insertion d'articles / Les troubles anxieux et dépressifs sont parmi les problématiques de santé mentale les plus fréquemment diagnostiquées chez les aînés. Malgré la disponibilité de traitements efficaces, une sous-utilisation des services de soins en santé mentale est observée dans la population âgée par rapport aux jeunes adultes. La stigmatisation des troubles de santé mentale pourrait être une explication de cette sous-utilisation parce qu'elle peut entraver la recherche d'aide et la participation aux traitements. Le présent mémoire a pour objectif de comparer les aînés (n = 103) et les jeunes adultes (n = 96) sur trois types de stigmatisation (l'auto-stigmatisation, la stigmatisation personnelle et la stigmatisation perçue) en lien avec la dépression et l'anxiété tout en ajustant pour des variables potentiellement confondantes (sexe, niveau de scolarité, symptômes passés et actuels et le fait de connaître quelqu'un qui a déjà vécu de l'anxiété ou la dépression). Les participants ont répondu à une série de questionnaires mesurant les différents types de stigmatisation ainsi que les symptômes dépressifs et anxieux. Les résultats montrent que les aînés présentent des niveaux de stigmatisation personnelle plus élevés que les jeunes mais des niveaux de stigmatisation perçue et d'auto-stigmatisation moins élevés que les jeunes. Les résultats appuient donc en partie l'idée que les aînés ont une plus grande SSM que les personnes plus jeunes et démontrent la nécessité d'interventions adaptées à l'âge pour améliorer la littératie en santé mentale.

L'objectif principal de cette étude est de mieux comprendre l'expérience de la relocalisation résidentielle involontaire à travers l'étude du cas du réaménagement de la route 175 dans la municipalité de cantons unis de Stoneham-et-Tewkesbury. La prise en compte du contexte et du discours public entourant le projet de réaménagement, de même que l'analyse du discours des personnes relocalisées sur leur expérience, nous permettent de constater la forte relation qui unit les individus à leur espace. Pour ceux qui y habitent, l'espace requis pour le réaménagement est exceptionnel et ne pourra que difficilement être compensé ou remplacé. L'expérience de la relocalisation résidentielle involontaire semble liée au rapport au chez-soi et à l'âge : alors que les jeunes propriétaires doivent faire le deuil d'un projet basé sur un mode de vie, les personnes âgées sont contraintes de quitter leur résidence qui représente notamment leur passé et leur vie familiale.

Plusieurs évidences scientifiques ont démontré un déclin important de la pratique d’activités physiques lors de l’adolescence. Plusieurs études épidémiologiques rapportent les effets délétères de la sédentarité sur notre société. Cette recherche examine les perceptions et les mécanismes expliquant les comportements d’étudiants du collégial quant à leur pratique d’activités physiques. Cette étude comporte trois objectifs. La première étude vise à identifier les déterminants psychosociaux de la pratique d’activités physiques chez les collégiens. Le deuxième objectif consiste à étudier les interactions entre la pratique d’activités physiques et le concept du soi physique. Le dernier objectif vise à examiner les changements de perceptions des étudiants au regard de la pratique d’activités physiques lors de leur passage au collégial. L’étude a été réalisée sur une période de deux ans, auprès de 536 étudiants inscrits dans les cours d’éducation physique au Collège Shawinigan. La collecte des données a été effectuée au début et à la fin de chacun des trimestres des années 2008 à 2010. Des analyses par équations structurelles ont été effectuées, étant donné leur potentiel intéressant pour ce type de devis de recherche. La première étude démontre que les intentions, la pratique antérieure d’activités physiques et les perceptions du soi physique sont des facteurs significativement associés à la pratique d’activités physiques. Les attitudes, le soi physique et les barrières perçues sont des prédicteurs directs des intentions à pratiquer des activités physiques diverses. Les résultats de la deuxième étude suggèrent que les sous-dimensions du soi physique prédisent la participation à des groupes d’activités qui correspondent à chacune de leurs dimensions respectives. La troisième étude démontre que les changements des croyances de contrôle et des intentions sont significativement associés à une augmentation de la pratique d’activités physiques lors du passage au collégial. Dans la dernière section de la thèse, des pistes d’interventions sont proposées, afin de favoriser la pratique régulière d’activités physiques chez les étudiants du collégial.

Les inventions biotechnologiques ont un double visage, une face bienveillante et une face terrifiante, chacune source potentielle de risques majeurs. Comment les contrôler et les réguler ? La recrudescence des catastrophes majeures (crises sanitaires) liées à l'usage de produits biotechnologiques, d'une part, puis l'échec à l'adoption d'un protocole de vérification à la Convention d'interdiction des armes biologiques suivi de l'émergence de nombreuses publications à risques dans le domaine des biotechnologies, d'autre part, démontrent l'omniprésence et la transversalité de cette problématique. Par leur essence duale, les biotechnologies appellent des solutions globales. La voie d'une gestion cohérente semble s'ouvrir au travers d'un corps de règle prenant tous ces paramètres en considération, les risques majeurs. L'avantage de cette législation, si elle admet une modification préalable de la nomenclature des risques majeurs en y intégrant les risques liés aux conflits, reposera sur sa globalité et sur la responsabilisation de tous. Face à une menace biotechnologique qui est perçue comme dominante dans les années à venir, l'émerge d'un ordre public mondial favorable à un accroissement de la responsabilité des Etats à l'égard de la sécurité humaine serait souhaitable. Le but de toute institution étatique étant de garantir à ses ressortissants leur sécurité et leur sûreté quelles que soient les circonstances, cet ordre public pourrait trouver ses bases au sein des réglementations relatives aux droits de l'homme et au droit de l'environnement ; réglementations déjà émancipées de la distinction entre situations de paix, de crises ou de conflits