A usina hidrelétrica Luis Eduardo Magalhães situada no Estado do Tocantins entre os municípios de Miracema do Tocantis e Lajeado é uma das maiores obras civis no país construída com recursos da iniciativa privada. A barragem apresenta 2.100 m de comprimento e vertedouros com 14 vãos e capacidade para escoar 49.870 m3/s de água. O reservatório encontra-se em área de cerrado com pouca fitomassa, baixo tempo de retenção (24 dias) e morfometria pouco complexa. A usina apresenta um circuito de geração com cinco casas de força e capacidade para abrigar cinco turbinas tipo Kaplan, com potência nominal de 170 MW e cinco grupos geradores de 190 MVA. Os estudos foram desenvolvidos no médio rio Tocantins na área de influência da UHE Lajeado (rio Tocantins e seus principais tributários) no período de fevereiro/99 a agosto/2001 e durante a fase de enchimento do reservatório, de setembro/01 a fevereiro de 2002, a partir da análise de 33 variáveis (temperatura do ar e da água; OD; transparência; turbidez; profundidade; cor; pH; condutividade; oxigênio consumido; DBO; cálcio, magnésio, sódio, potássio, cloreto, ferro total, dureza total, nitrato, nitrito, amônia, fosfato solúvel reativo, sílica reativa; alcalinidade total, sólidos em suspensão (totais, orgânicos e inorgânicos); fósforo total, nitrogênio total, coliformes totais, coliformes fecais, clorofila-a total, fitoplâncton e zooplâncton), além de perfis verticais na fase de enchimento, com o objetivo de caracterizar ecológica e limnologicamente o rio, bem como estudar as respostas das principais variáveis físicas, químicas e biológicas nos mecanismos básicos de funcionamento dos sistemas aquáticos da área, durante a construção da barragem e enchimento do reservatório, subsidiar os sistemas de suporte à decisão gerencial ligados à operação da usina, bem como o processo de educação e capacitação de recursos humanos. A estimativa da carga ) externa afluente ao reservatório baseou-se no modelo de Jorgensen & Vollenweider (1988), a partir das contribuições de nitrogênio e fósforo, com base nos dados de geologia e uso do solo da bacia, precipitação, efluentes domésticos e tributários. A carga interna foi obtida a partir das concentrações totais dos referidos nutrientes em função do volume do reservatório e a carga efluente foi obtida através das concentrações de jusante da barragem em função da vazão defluente. Os modelos adimensionais para as condições do reservatório na fase de enchimento foram calculados segundo; Imberger & Petterson, 1990; Leman et al, 1995 e Salençon & Thébaut, 1997. As análises indicaram diferenças na qualidade da água do rio Tocantins em relação aos seus tributários, tais como no pH, na alcalinidade total, na dureza total, na condutividade e na temperatura. O rio Tocantins apresentou-se como um rio de águas alcalinas, de elevada condutividade, com altos teores de cálcio e magnésio e grande diversidade planctônica, enquanto os tributários apresentaram-se mais ácidos, com baixa condutividade, elevadas concentrações de sódio, potássio e cloreto e temperatura mais baixa de suas águas, provavelmente devido a maior proteção ciliar. Na fase de enchimento os estudos demonstraram a formação de três compartimentos no reservatório, sendo dois deles C1 (Lajeado) e C2 (Palmas-Porto) estratificados termicamente e quimicamente, com formação de termoclimas resultantes do aquecimento térmico diurno. O terceiro compartimento - C3 a partir da região de montante da Ilha do Cachimbo, nas proximidades do ribeirão Conceição (Porto Nacional/Brejinho de Nazaré) é mais sujeito à ação do vento e comporta-se ainda como ambiente lótico. Durante esta fase a relação N:P apresentou variações acentuadas. O aumento de Ptotal é devido à decomposição da matéria orgânica afogada, da contribuição de fontes pontuais e não pontuais de resíduos domésticos e de outras origens, tais como abatedouros, criação de animais e diversas outras fontes. Como conseqüência do aumento do fósforo no reservatório, iniciou-se um processo de eutrofização, promovido também pela anoxia no fundo e pela redissolução do fósforo a partir da camada anóxica. Esse processo de eutrofização produziu florescimentos de Microcystis aeroginosa e Cylindrospermopsis raciborski. A aplicação dos números adimensionais na fase de enchimento mostrou que no reservatório da usina hidrelétrica do Lajeado, a ação do vento e o aquecimento térmico de superfície (radiação solar) são funções de força importantes na determinação dos mecanismos de funcionamento deste sistema determinando períodos de estabilidade e mistura que precisam ser monitorados. Os resultados sinalizam a necessidade de um gerenciamento integrado e preditivo como suporte às decisões técnico-administrativas. Do ponto de vista administrativo-gerencial o município de Palmas deverá trabalhar em parceria com os municípios de Lajeado e Porto Nacional e este último por sua vez, como o município de Brejinho de Nazaré, a partir dos Comitês Integrados de Bacia. Do ponto de vista ambiental, atenção especial deverá ser dada ao monitoramento de eutrofização e dos processos de estratificação em instalação nos compartimentos C1 e C2. / The Luis Eduardo Magalhães Hydroelectric Dam, located in Tocantins State between the municipalities of Miracema do Tocantins and Lajeado, is one of the largest constructions made with private funding in Brazil. The dam is 2,100 meters long with 14 spillways that have a discharge capacity of 49,870 m3/sec. The reservoir has a residence time of 24 days, a maximum depth of 35 m, and an average depth of 3 m. Five generating units with Kaplan turbines of nominal power of 170 MW and generators of 190 MVA compose the power station. This study was developed on the middle Tocantins River in the area of influence of the Lajeado UHE (Tocantins River and its tributaries) during the period ofFebruary 1999 to August 2001 and during the filling ofthe reservoir from September 2001 to February 2002. Thirty-three variables were measured: air and water temperatures, dissolved oxygen, transparency, turbidity, depth, color, pH, conductivity, oxygen deficit, biochemical oxygen demand, calcium, magnesium, sodium, potassium, chloride, total iron, total hardness, nitrate, nitrite, ammonia, reactive soluble phosphate, reactive silica, total alkalinity, suspended solids (total, organic and inorganic), total phosphorus, total nitrogen, total colliforms, fecal colliforms, phytoplankton, and zooplankton in vertical profiles. The objectives of this study were to characterize the ecology and limnology of the river/reservoir system and to study the physical, chemical, and biological responses of this system during the construction of the dam and the filling of the reservoir in order to provide information for decision-making linked to the operation of the hydroelectric project. Estimates of extemalloading of the reservoir were based on the model of Jorgensen and Vollenweider (1988) using nitrogen and phosphorus fluxes and data of geology, land use, rainfall, domestic effluents, and tributaries. The intemal loading was obtained from total concentrations of the above nutrients in function of the reservoir volume, and the outflow was determined by concentrations and discharge just downstream of the damo Non- dimensional models for the filling phase of the reservoir were calculated according to Imberger and Petterson (1990), Lerman et al., 1995, and Salençon and Thébault (1997). Water quality differed between the Tocantins River and its local tributaries. The Tocantins River has alkaline waters with high conductivity, high calcium and magnesium concentrations, high planktonic diversity, while its local tributaries are more acid with low conductivity and higher concentrations of sodium, potassium, and chloride. The temperatures of the tributaries are lower than that of the Tocantins River, probably due to proportionally greater forest cover along their margins. The filling of the reservoir produced three distinct limnological regions. Two of them, C 1 and C2, exhibit thermal and chemical stratification with the formation of diurnal thermoclines. The third region, C3, is located upstream of Cachimbo Island near Porto Nacional/Brejinho de Nazaré and is affected by wind action so that it still responds as a lotic environment. During the filling phase the N:P relationship varied greatly. Total P increased due to decomposition of submerged organic matter, point and non-point sources of domestic residues, such as sewage, slaughterhouses, animal raising. As a consequence of the P increase in the reservoir, eutrophication began, accelerated by anoxic bottom conditions, which promoted liberation of P from submerged soils. This eutrophication process produced blooms of Microcystis aeroginosa and Cylindrospermopsis raciborski. Non-dimensional analysis of the filling phase showed that wind and solar heading of surface waters are important forcing functions that control stratification and mixing regimes in the Reservoir. These results illustrate the necessity of integrated and predictive management of the reservoir. From an administrative perspective, the Municipality of Palmas should work with the Municipalities of Lajeado and Porto Nacional, and the latter with the Municipality of Brejinho de Nazaré via integrated basin committees. From an environrnental perspective, special attention should be given to monitoring eutrophication and stratification in sections C1 and C2 of the reservoir.

As estratégias de mapeamento utilizando múltiplos robôs móveis possuem uma série de vantagens quando comparadas àquelas estratégias baseadas em um único robô. As principais vantagens que podem ser elucidadas são: flexibilidade, ganho de informação e redução do tempo de construção do mapa do ambiente. No presente trabalho, um método de integração de mapas locais é proposto baseado em observações inter-robôs, considerando uma nova abordagem para a exploração do ambiente. Tal abordagem é conhecida como Sistema de Vigilância baseado na Modificação do Sistema Colônias de Formigas, ou IAS-SS. A estratégia IAS-SS é inspirada em mecanismos biológicos que definem a organização social de sistemas de enxames. Especificamente, esta estratégia é baseada em uma modificação do tradicional algoritmo de otimização por colônias de formiga. A principal contribuição do presente trabalho é a adaptação de um modelo de compartilhamento de informações utilizado em redes de sensores móveis, adaptando o mesmo para tarefas de mapeamento. Outra importante contribuição é a colaboração entre o método proposto de integração de mapas e a estratégia de coordenação de múltiplos robôs baseada na teoria de colônias de formigas. Tal colaboração permite o desenvolvimento de uma abordagem de exploração que emprega um mecanismo não físico para depósito e detecção de feromônios em ambientes reais por meio da elaboração do conceito de feromônios virtuais integrados. Resultados obtidos em simulação demonstram que o método de integração de mapas é eficiente, de modo que os ensaios experimentais foram realizados considerando-se um número variável de robôs móveis durante o processo de exploração de ambientes internos com diferentes formas e estruturas. Os resultados obtidos com os diversos experimentos realizados confirmam que o processo de integração é efetivo e adequado para executar o mapeamento do ambiente durante tarefas de exploração e vigilância do mesmo / The multiple robot map building strategies have several advantages when compared to strategies based on a single robot, in terms of flexibility, gain of information and reduction of map building time. In this work, a local map integration method is proposed based on the inter-robot observations, considering a recent approach for the environment exploration. This approach is based on the Inverse Ant System-Based Surveillance System strategy, called IASSS. The IAS-SS strategy is inspired on biological mechanisms that define the social organization of swarm systems. Specifically, it is based on a modified version of the known ant colony algorithm. The main contribution of this work is the fit of an information sharing model used in an mobile sensor network, adapting the method for mapping tasks. Another important contribution is the collaboration between the local map integration method and the multiple robot coordination strategy based on ant colony theory. Through this collaboration it is possible to develop an approach that uses a mechanism for controlling the access to pheromones in real environments. Such mechanism is based on the integrated virtual pheromones concept. Simulation results show that the map integration method is efficient, the trials are performed considering a variable number of robots and environments with different structures. Results obtained from several experiments confirm that the integration process is effective and suitable to execute mapping during the exploration task

The European Commission considers Small and Medium Enterprises and entrepreneurship as key to ensuring economic growth, innovation, job creation, and social integration in the EU. As regards to this, mergers and acquisitions have long been a popular strategy, and are increasingly common in many industries, such as the agrifood industry, by both large and small firms, and by established and newer firms. There are several reasons that explain mergers and acquisitions such as increasing the critical size, acquiring complementary resources, reducing the transaction costs involved in entering new markets and also the increasing interdependence among organizations. The agrifood industry is mostly formed by Small and Medium-sized Enterprises, they are often characterized by a lower information environment when compared with larger companies. In this context, valuation processes are much needed but due to this lack of information small and medium enterprises' valuation can be a challenging process. The main goal of this research is to help improve the information of the valuation process of small and medium agrifood enterprises. Common to the whole research is the main method. It consists in carrying out a mass valuation of agrifood companies by means of fundamental models. From the mass valuation several valuation multiples are computed then significant differences between fundamental and stock multiples are tested. The whole research shows that listed agrifood valuation multiples, as a reflection of fundamental firm values, are related to the valuation multiples of small and medium-sized agrifood companies obtained by means of fundamental models. / La Comisión Europea considera que las pymes y el emprendimiento en general, son la clave para asegurar el crecimiento económico, la innovación, la creación de trabajo, y la integración social en la Unión Europea. En este sentido, las fusiones y adquisiciones son una estrategia popular de crecimiento desde hace largo tiempo y son comunes a muchos sectores, entre ellos el sector agroalimentario, tanto en grandes como en pequeñas empresas. Existen diversas razones que justifican las operaciones de fusión y adquisición de empresas como el aumento de la dimensión crítica, la adquisición de recursos complementarios, la reducción de los costes de transacción al acceder a nuevos mercados, así como la creciente interdependencia entre las organizaciones. El sector agroalimentario está principalmente formado por pequeñas y medianas empresas, las cuales se caracterizan por hallarse en entornos de poca información en comparación con las grandes compañías. En este contexto, los procesos de valoración son imprescindibles, pero como consecuencia de la mencionada falta de información, la valoración de las pymes agroalimentarias es un proceso complejo. El objetivo principal de esta investigación es contribuir a la mejora de la información del proceso valorativo de pequeñas y medianas empresas en el sector agroalimentario. El proceso metodológico, común a toda la investigación, ha consistido en realizar una valoración masiva de empresas agroalimentarias mediante modelos fundamentales; a partir de la cual se obtienen diferentes múltiplos fundamentales de valoración, para finalmente contrastar estadísticamente la existencia de diferencias significativas entre múltiplos fundamentales y múltiplos bursátiles. La investigación muestra que los múltiplos de valoración de las empresas agroalimentarias cotizadas, como un reflejo del valor fundamental de las compañías, guardan relación con los múltiplos de valoración de pymes agroalimentarias obtenidos mediante modelos de valoración fundamentales. / La Comissió Europea considera que les pimes i l'emprenedoria en general, són la clau per assegurar el creixement econòmic, la innovació, la creació de treball, i la integració social en la Unió Europea. En aquest sentit, les fusions i adquisicions són una estratègia popular de creixement des de fa llarg temps i són comuns a molts sectors, entre ells, el sector agroalimentari, tant en grans com en petites empreses. Existeixen diverses raons que justifiquen les operacions de fusió i adquisició d'empreses com ara l'augment de la dimensió crítica, l'adquisició de recursos complementaris, la reducció dels costos de transacció després d'accedir a nous mercats, així com la creixent interdependència entre les organitzacions. El sector agroalimentari està principalment format per petites i mitjanes empreses, les quals es caracteritzen per trobar-se en entorns de poca informació en comparació amb les grans companyies. En aquest context, els processos de valoració són imprescindibles, però com a conseqüència de l'esmentada falta d'informació, la valoració de les pimes agroalimentàries esdevé un procés complex. L'objectiu principal d'aquesta investigació és contribuir a la millora de la informació del procés valoratiu de petites i mitjanes empreses en el sector agroalimentari. El procés metodològic, comú a tota la investigació, ha consistit en realitzar una valoració massiva d'empreses agroalimentàries mitjançant models fonamentals; a partir de la qual s'obtenen diferents múltiples fonamentals de valoració, per a finalment contrastar estadísticament l'existència de diferències significatives entre múltiples fonamentals i múltiples borsaris. La investigació mostra que els múltiples de valoració de les empreses agroalimentàries cotitzades, com un reflex del valor fonamental de les companyies, guarden relació amb els múltiples de valoració de pimes agroalimentàries obtinguts mitjançant models de valoració fonamentals. / Vidal García, R. (2017). Valoración de pymes del sector alimentario mediante modelos de análisis fundamental [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/85680

A busca aproximada por múltiplos padrões similares é um problema encontrado em diversas áreas de pesquisa, tais como biologia computacional, processamento de sinais e recuperação de informação. Na maioria das vezes, padrões não possuem uma correspondência exata e, portanto, buscam-se padrões aproximados, de acordo com um modelo de erro. Em geral, o modelo de erro utiliza uma função de distância para determinar o quanto dois padrões são diferentes. As funções de distância são baseadas em medidas de similaridade, que são classificadas em medidas de similaridade baseadas em distância de edição, medidas de similaridade baseadas em token e medidas de similaridade híbridas. Algumas dessas medidas extraem um vetor de características de todos os termos que constituem o padrão. A similaridade entre os vetores pode ser calculada pela distância entre cossenos ou pela distância euclidiana, por exemplo. Essas medidas apresentam alguns problemas: tornam-se inviáveis conforme o tamanho do padrão aumenta, não realizam a correção ortográfica ou apresentam problemas de normalização. Neste projeto de pesquisa propõe-se uma nova medida de similaridade híbrida que combina TF-IDF Weighting e uma medida de similaridade baseada em distância de edição para estimar a importância de um termo dentro de um padrão na tarefa de busca textual. A medida DGD não descarta completamente os termos que não fazem parte do padrão, mas atribui um peso baseando-se na alta similaridade deste termo com outro que está no padrão e com a média de TF-IDF Weighting do termo na coleção. Alguns experimentos foram conduzidos mostrando o comportamento da medida proposta comparada com as outras existentes na literatura. Tem-se como recomendação geral o limiar de {tf-idf+cosseno, Jaccard, Soft tf-idf} 0,60 e {Jaro, Jaro-Winkler, Monge-Elkan} 0,90 para detecção de padrões similares. A medida de similaridade proposta neste trabalho (DGD+cosseno) apresentou um melhor desempenho quando comparada com tf idf+cosseno e Soft tf-idf na identificação de padrões similares e um melhor desempenho do que as medidas baseadas em distância de edição (Jaro e JaroWinkler) na identificação de padrões não similares. Atuando como classificador, em geral, a medida de similaridade híbrida proposta neste trabalho (DGD+cosseno) apresentou um melhor desempenho (embora não sinificativamente) do que todas as outras medidas de similaridade analisadas, o que se mostra como um resultado promissor. Além disso, é possível concluir que o melhor valor de a ser usado, onde corresponde ao limiar do valor da medida de similaridade secundária baseada em distância de edição entre os termos do padrão, corresponde a 0,875. / Multiple approximate pattern matching is a challenge found in many research areas, such as computational biology, signal processing and information retrieval. Most of the time, a pattern does not have an exact match in the text, and therefore an error model becomes necessary to search for an approximate pattern match. In general, the error model uses a distance function to determine how different two patterns are. Distance functions use similarity measures which can be classified in token-based, edit distance based and hybrid measures. Some of these measures extract a vector of characteristics from all terms in the pattern. Then, the similarity between vectors can be calculated by cosine distance or by euclidean distance, for instance. These measures present some problems: they become infeasible as the size of the pattern increases, do not perform the orthographic correction or present problems of normalization. In this research, we propose a new hybrid similarity metric, named DGD, that combines TF-IDF Weighting and a edit distance based measure to estimate the importance of a term within patterns. The DGD measure doesnt completely rule out terms that are not part of the pattern, but assigns a weight based on the high similarity of this term to another that is in the pattern and with the TF-IDF Weighting mean of the term in the collection. Experiment were conducted showing the soundness of the proposed metric compared to others in the literature. The general recommendation is the threshold of {tf-idf+cosseno, Jaccard, Soft tf-idf} 0.60 and {Jaro, Jaro-Winkler, Monge-Elkan} 0.90 for detection of similar patterns. The similarity measure proposed in this work (DGD + cosine) presented a better performance when compared with tf-idf+cosine and Soft tf-idf in the identification of similar patterns and a better performance than the edit distance based measures (Jaro and Jaro-Winkler) in identifying non-similar patterns. As a classifier, in general, the hybrid similarity measure proposed in this work (DGD+cosine) performed better (although not significantly) than all other similarity measures analyzed, which is shown as a promising result . In addition, it is possible to conclude that the best value of to be used, where is the theshold of the value of the secondary similarity measure based on edit distance between the terms of the pattern, corresponds to 0.875.

A simbiose desenvolvida entre seres vivos e microrganismos desempenha um importante papel na relação saúde-doença do hospedeiro. Neste sentido, o corpo humano abriga uma grande e diversa comunidade de microrganismos, sendo as mucosas vaginal, intestinal e oral as principais superfícies mucosas do corpo feminino que abrigam as comunidades bacterianas de fundamental importância para a mulher. Estes microrganismos atuam no desenvolvimento e modulação do sistema imune, na manutenção e otimização de vias metabólicas e competem por sítios de colonização, prevenindo que microrganismos patogênicos estabeleçam colonização. A composição da microbiota feminina varia com a idade, pH, secreção hormonal, ciclo menstrual, uso de anticoncepcional e atividade sexual. O presente estudo buscou caracterizar a composição da microbiota do corpo feminino durante o período gestacional, comparando os achados entre gestantes e não gestantes saudáveis, através de técnicas de biologia molecular. Foram selecionadas 60 mulheres saudáveis para o estudo e coletadas amostras de secreção vaginal, fezes e swab oral de cada participante. O DNA das amostras foi extraído e submetido à sequenciamento do gene 16S rRNA e quantificado através da técnica de PCR em tempo real. Das participantes selecionadas, 42 eram gestantes e 18 eram mulheres não gestantes em idade reprodutiva. Observamos que a quantificação total de bactérias na vagina não apresentou diferenças entre gestantes e não gestantes. Houve aumento na abundância de Lactobacillus no sítio vaginal, bactérias produtoras de butirato na microbiota intestinal e Streptococcus na microbiota oral de mulheres grávidas quando comparadas com mulheres não gestantes. Além disso, observamos que a composição e a disposição dos gêneros encontrados sofrem uma modificação, tal como aumento de gêneros relacionados com a manutenção da homeostase no grupo de mulheres gestantes. O período gestacional influencia positivamente na composição da microbiota, garantindo assim a prevalência de gêneros bacterianos responsáveis pela manutenção das condições ideais para o desenvolvimento da gestação saudável. / The symbiosis developed between living organisms and microorganisms plays an important role in the health-disease relationship of the host. In this sense, the human body harbor a large and diverse community of microorganisms, the vaginal, intestinal and oral mucosa are the main mucosal surfaces of the female body that harbor bacterial communities of fundamental importance for women. These microorganisms act in the development and modulation of the immune system, in the maintenance and optimization of metabolic pathways and compete for colonization sites, preventing pathogenic microorganisms from establishing colonization. The composition of the female microbiota varies with age, pH, hormonal secretion, menstrual cycle, contraceptive use and sexual activity. The present study aimed to characterize the microbiota composition of the female body during the gestational period, comparing the findings between healthy and non - pregnant women through molecular biology techniques. Sixty healthy women were selected for the study and samples of vaginal secretion, stool and oral swab from each participant were collected. The DNA of the samples was extracted and submitted to the 16S rRNA gene sequencing and quantified by the real-time PCR technique. Were select, 42 were pregnant and 18 were non-pregnant women of reproductive age. We observed that the total quantification of bacteria in the vaginal samples did not present differences between pregnant and non-pregnant women. There was an increase in the abundance of Lactobacillus in the vaginal site, butyrate producing bacteria in the intestinal microbiota and Streptococcus in the oral microbiota of pregnant women when compared to nonpregnant women. In addition, we observed that the composition and arrangement of the genera found undergo a modification, such as an increase in genera related to the maintenance of homeostasis in the group of pregnant women. The pregnancy influences the composition of the microbiota, thus ensuring the prevalence of bacterial genera responsible for the maintenance of the ideal conditions for the development of healthy pregnancy.

A infecção de corrente sanguínea (ICS) causada por bactérias multirresistentes tem alta mortalidade em pacientes receptores de transplante de células-tronco hematopoiéticas (TCTH). A Pseudomonas aeruginosa é um dos agentes mais frequentes e de difícil tratamento nessa população de pacientes. Objetivos: Avaliar características clínicas, microbiológicas e moleculares de 30 isolados de P. aeruginosa resistente à carbapenêmicos (PARC) em ICS de pacientes submetidos a TCTH e a presença de sinergismo antimicrobiano in vitro. Métodos: Os dados clínicos foram obtidos retrospectivamente de prontuários médicos e registrados em banco de dados. Análises bivariadas e multivariadas foram realizadas para avaliar determinantes de desfechos clínicos e uma curva de sobrevida foi construída. Determinou-se a concentração inibitória mínima (CIM) dos antimicrobianos por meio de microdiluição, foram realizados ensaios de sinergismo por método de checkerboard e time-kill, avaliação da clonalidade por eletroforese em campo pulsado e detecção de genes codificadores de mecanismos de resistência e virulência por reação em cadeia de polimerase. O sequenciamento do genoma completo (WGS) dos principais clones foi realizado por Nextera XT, utilizando a tecnologia Illumina MiSeq. Resultados: A maioria dos pacientes era do gênero feminino, com mediana de idade de 48 anos. Neutropenia foi presente em 93% dos pacientes e colonização prévia por PARC em 32%. A mortalidade em 14 dias foi 68%; a maioria dos pacientes que morreram foram transplantados alogênicos (79% vs. 17% entre receptores de transplante autólogo; p=0,012). Pacientes tratados com duas ou três drogas não apresentaram diferença estatisticamente significante na mortalidade até 14 dias após a ICS. Foram avaliados 30 isolados bacterianos. Todos apresentaram alto nível de resistência ao meropenem (MERO): CIM90 > 512 ug/mL; dois terços eram resistentes à amicacina (AMK) (CIM 2-512 ug/mL) e todos mantinham sensibilidade à colistina (COL). Muitos isolados (17/30) alcançaram efeito sinérgico in vitro pelo método time-kill com a combinação MERO mais COL, mas não com AMK. Nenhum antagonismo foi observado. Houve menor mortalidade em pacientes cujo isolado apresentou sinergismo entre COL e MERO quando comparados a pacientes portadores de isolados sem sinergismo, sem significância estatística. O gene de carbapenamase mais identificado foi blaSPM e 6 isolados apresentaram blaSPM e blaKPC. Os isolados apresentaram genes relacionados com virulência, tais como toxA, exoS e lasB; pacientes com ICS causada por P. aeruginosa que abrigava o gene lasB apresentaram maior risco de evoluir para o óbito. O WGS mostrou que os clones abrigavam SPM-1, Tn4371, mutações em porinas, em partes das bombas de efluxo, nas proteínas ligadores de penicilina (PBP) e pertenciam a ST277. Conclusão: As ICS por PARC cursaram com alta mortalidade em pacientes submetidos à TCTH. Houve uma grande proporção de resultados positivos para sinergismo entre os antimicrobianos in vitro, mas não foi possível demonstrar benefício estatisticamente significante no uso da terapia combinada com três drogas. Os clones carreavam SPM-1, Tn4371 e pertenciam a ST277 / Bloodstream infection (BSI) has high mortality in hematopoietic stem cell transplant (HSCT) recipients and Pseudomonas aeruginosa is an important and challenging organism. Objectives: To evaluate clinical, microbiological and molecular features of carbapenem-resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates from BSI identified among HSCT patients and address in vitro synergy of antibiotic combination. Methods: Patient medical records were retrospectively reviewed and registered in a database. We used bivariate and multivariate analyzes to investigate determinants of clinical outcomes, and demonstrated overall mortality using a survival curve. We determined minimal inhibitory concentrations (MIC) for antimicrobials and in vitro synergies using checkerboard and time-kill assays, pulsed-field electrophoresis (PFGE) for clonality assessment and polymerase chain reaction (PCR) to detect carbapenamases and virulence genes were performed for all isolates. Whole genome sequence (WGS) of main clones was performed by Nextera XT, using Illumina MiSeq technology. Results: Most patients were female, median age was 48 years old. Main baseline disease was acute leukemia and 68% received allogeneic HSCT. 93% of patients had neutropenia and 32% had prior CRPA gut colonization.14-day mortality was 68%; mortality was higher among allogeneic HSCT recipients compared to autologous HSCT recipients (79% vs. 17% p = 0,012). Patients treated with two or three drugs did not present a statistically significant difference in 14-day mortality after BSI. In total, 30 bacterial isolates were analyzed; all presented a high resistance level to meropenem (MERO): MIC90 > 512ug/mL; two thirds were also resistant to amikacin (AMK) (MIC 2-512 ug/mL) and all were susceptible to colistin (COL). Many (17/30) isolates achieved in vitro synergistic effect in time-kill assay with the association of MERO and COL, but synergistic effect was not observed with AMK, by time-kill. No antagonistic effect was observed. There was a tendency towards better survival in patients whose CRPA isolate had in vitro synergy between COL and MERO without statistical significance. The most frequent carbapenamase gene identified was blaSPM, and six co-harboured both blaKPC and blaSPM. Isolates presented genes related to virulence factors such as toxA, exoS and more patients with BSI caused by P. aeruginosa harbouring gene lasB evolved to death. WGS analysis showed that clones harboured SPM-1, Tn4371 and belonged to ST277. They also presented mutations in genes related with porins and efflux pumps, as well in penicillin binding proteins (PBPs). Conclusion: CRPA BSI as associated with high mortality in HSCT recipients. A large proportion of isolates had in vitro synergy; however, we could not demonstrate statistically significant benefit in the use of combination therapy. Clones carried SPM-1, Tn4371 and belonged to ST277

A tuberculose multirresistente (TBMR) - resistência simultânea a rifampicina e isoniazida, principais fármacos do esquema de tratamento da tuberculose (TB), gera mais ônus aos doentes e aos Serviços de Saúde, pois acarreta maiores custos, aumenta o tempo de tratamento e relaciona-se a prognósticos desfavoráveis. A TBMR ocorre devido à falha em algum princípio do tratamento, seja por parte dos profissionais e serviços de saúde, seja por questões ligadas ao doente. Frente a isso, o presente estudo objetivou identificar e analisar as condições de produção da TBMR relacionadas ao doente e seu entorno. Esta investigação foi realizada junto aos sujeitos em seguimento em um hospital de referência do interior paulista, entre janeiro de 2010 a janeiro de 2012. Foi utilizada a abordagem qualitativa. Por meio da análise dos prontuários médicos do serviço terciário, caracterizamos o universo do estudo - composto por todos os doentes já seguidos pela instituição, descrevendo e analisando dados sociodemográficos e clínicos correspondentes. Caracterizamos, também, a amostra estudada, formada por oito doentes de TBMR em seguimento, detalhando seu contexto de vida e trajetória com a doença, assim como a estruturação municipal para seu acompanhamento. A segunda etapa do trabalho constituiu na análise das percepções dos sujeitos a cerca do adoecimento por TB e pela forma MR. Os dados foram coletados por meio de entrevistas semi-estruturadas, gravadas e transcritas na íntegra. Os textos resultantes constituíram o corpus do estudo, organizado com recurso do software Atlas. Ti versão 7.0 e analisado sob o referencial teórico da Análise de Discurso, de matriz francesa. Os resultados da investigação baseiam-se na análise de três aspectos: percurso diagnóstico - em que é apontadas a percepção da doença e dos sintomas, as histórias pessoais e familiares do adoecimento por TB, o desenvolver até a obtenção do diagnóstico e as histórias de fracasso dos tratamentos convencionais; tratamento e acompanhamento dos casos MR - momento em que são discutidas questões ligadas a percepção do tratamento pelos doentes, as modalidades de supervisão empreendidas, os instrumentos e insumos fornecidos, além do apoio da rede familiar; coordenação da assistência - em que são analisadas as nuances da relação entre os diferentes serviços envolvidos na atenção ao doente, tanto dentro do mesmo nível assistencial quanto em sua intersecção com a atenção terciária, a fim de compreender suas fragilidades e promover as potencialidades para o tratamento dos sujeitos. Essas condições de produção mostraram-se complexas, ao passo que sofrem influência das peculiaridades da forma como os serviços locais de atenção organizando-se para atender esses doentes, além de questões relacionadas à trajetória de vida e doença desses sujeitos, apontando para a necessidade de ampliação do espaço de negociação dentro do sistema de saúde. / Multidrug-resistant tuberculosis - simultaneous resistance to rifampicin and isoniazid, the main drugs in the treatment for tuberculosis (TB), generates more onuses to patients and Health Services because it involves higher costs, increases the treatment time and relates to the unfavorable outcomes. MDR-TB occurs due to failure in some treatment principles, either by professionals and health services, or by patient issues. Concerning this, the present study aimed to identify and analyze the conditions of MDR-TB production related to the patients and their surroundings. This investigation was conducted with the subjects followed up in a referral hospital in São Paulo State, between January 2010 and January 2012. It was used a qualitative approach. By analyzing the medical records of the tertiary service, we characterized the universe of the study - consisting of all patients who were already followed by the institution, describing and analyzing the demographic and clinical data matching. We also characterized the sample, formed by eight MDR-TB patients in follow-up, detailing the context of their lives and the disease trajectory, as well as the municipal structure to monitor them. The second stage of the work consisted of analyzing the subjects\' perceptions about TB development and MR strain. Data was collected through semi-structured interviews which were recorded and fully transcribed. The resulting texts constituted the corpus of the study, organized using the Atlas.Ti software version 7.0 and analyzed from the theoretical framework of Discourse Analysis of French matrix. The results are based on analysis of three aspects: The first is diagnosis route - which shows the disease and symptoms perception of the patient, personal and family histories of TB development, the disease development until the diagnosis, and the failed conventional treatment stories. The second aspect was treatment and monitoring of MDR cases - when cases are discussed we focused on the following aspects: perceptions of treatment by patients, undertaken methods of supervision, instruments and inputs provided, and the familiar support network. The third is assistance coordination - where the nuances of the relationship between several departments involved in the patient care are analyzed, within the same care level as well as its intersection with tertiary care in order to understand their weaknesses and promote the potential treatments for the subjects. These production conditions proved to be complex whereas the local care services peculiarities influence the way they are organized to assist these patients, as well as aspects related to life and illness trajectory of these subjects, indicating the need of expanding the negotiation space within the health system

Um dos problemas encontrados em sistemas de Processamento de Línguas Naturais (PLN) é a dificuldade de se identificar que elementos textuais referem-se à mesma entidade. Esse fenômeno, no qual o conjunto de elementos textuais remete a uma mesma entidade, é denominado de correferência. Sistemas de resolução de correferência podem melhorar o desempenho de diversas aplicações do PLN, como: sumarização, extração de informação, sistemas de perguntas e respostas. Recentemente, pesquisas em PLN têm explorado a possibilidade de identificar os elementos correferentes em múltiplos documentos. Neste contexto, este trabalho tem como foco o desenvolvimento de um método aprendizado não supervisionado para resolução de correferência em múltiplos documentos, utilizando como língua-alvo o português. Não se conhece, até o momento, nenhum sistema com essa finalidade para o português. Os resultados dos experimentos feitos com o sistema sugerem que o método desenvolvido é superior a métodos baseados em concordância de cadeias de caracteres / One of the problems found in Natural Language Processing (NLP) systems is the difficulty of identifying textual elements that refer to the same entity. This phenomenon, in which the set of textual elements refers to a single entity, is called coreference. Coreference resolution systems can improve the performance of various NLP applications, such as automatic summarization, information extraction systems, question answering systems. Recently, research in NLP has explored the possibility of identifying the coreferent elements in multiple documents. In this context, this work focuses on the development of an unsupervised method for coreference resolution in multiple documents, using Portuguese as the target language. Until now, it is not known any system for this purpose for the Portuguese. The results of the experiments with the system suggest that the developed method is superior to methods based on string matching

A tuberculose (TB) embora passível de tratamento efetivo, ainda é um grave problema de saúde pública em diversos países, inclusive no Brasil. Nas últimas décadas houve progressos consistentes no controle da doença, porém o avanço da resistência bacilar ainda é um desafio a ser superado, já que os mecanismos da resistência são bastante complexos e não totalmente conhecidos, o que dificulta o desenvolvimento de testes de sensibilidade com elevada acurácia. O objetivo deste trabalho foi caracterizar as mutações gênicas de cepas de Mycobacterium tuberculosis de pacientes do Brasil e de Moçambique com doença resistente a drogas através do sequenciamento genômico total, além de descrever padrões de mutações obtidos por testes moleculares comerciais e comparar estes dados com resultados de testes fenotípicos. Estudo descritivo e transversal que incluiu 30 isolados (17 do Brasil e 13 de Moçambique), submetidos aos testes moleculares comerciais Genotype MTBDRplus®, Genotype MTBDRsl®, Xpert MTB/RIF® e teste fenotípico BACTEC MGIT 960 SIRE®. Todos os isolados também foram avaliados pelo sequenciamento genômico realizado pelo Illumina MiSeq Sequencing System® e submetidos a análise de mutações que conferem resistência às drogas contra TB utilizando o TB profiler online tool. A sensibilidade e especificidade do sequenciamento genômico para detecção de resistência a rifampicina foi de 87,5% e 92,3%, respectivamente. Além disso, o sequenciamento detectou a mutação (Val170Phe) no gene rpoB em dois isolados de M. tuberculosis de Moçambique. Esta mutação não é detectada pelos testes genotípicos comerciais. A sensibilidade do sequenciamento para a isoniazida foi de 95,6% e a especificidade de 100%. Para a estreptomicina, a sensibilidade foi de 85,7% e a especificidade de 93,3%. Para o etambutol, observamos sensibilidade de 100% e especificidade de 77,2%. As mutações mais frequentes associadas à resistência à rifampicina foram a Ser450Leu e a His445Tyr no gene rpoB. Em relação à isoniazida, predominou a mutação Ser315Thr no gene katG. O sequenciamento genômico, dado seu alto poder discriminatório, tem grande potencial de fornecer informações mais acuradas sobre mecanismo gênicos da resistência bacilar, possibilitando futuramente o aprimoramento de testes diagnósticos mais precisos. / Although there is an effective treatment for tuberculosis (TB), it is still a serious public health problem in several countries, including Brazil. In the last decades, there has been consistent progress in disease control, but the increasing number of disease caused by resistant strains is still a challenge to be overcome, since the mechanisms of resistance are quite complex and not fully known, which difficult the development of susceptibility tests with high accuracy. The aim of this work was to characterize gene mutations of Mycobacterium tuberculosis strains from Brazilian and Mozambican patients with drug-resistant disease through whole genome sequencing, as well as to describe patterns of mutations obtained by commercial molecular tests and to compare these data with results of phenotypic susceptibility tests. It was a cross-sectional study that included 30 isolates (17 from Brazil and 13 from Mozambique). Commercial molecular tests Genotype MTBDRplus(TM), Genotype MTBDRsl(TM), Xpert MTB / RIF(TM) and BACTEC MGIT 960 SIRE(TM) phenotypic test were performed for all isolates. All of them were also evaluated by whole genome sequencing performed by the Illumina MiSeq Sequencing System(TM) and submitted to analysis of mutations that confer drug resistance against TB using the TB profiler online tool. The sensitivity and specificity of whole genome sequencing for detection rifampicin resistance was 87.5% and 92.3%, respectively. Also, whole genome sequencing detected the mutation (Val170Phe) in the rpoB gene in two isolates of M. tuberculosis from Mozambique. This mutation is not detected by commercial genotypic tests. The sensitivity of the whole genome sequencing for isoniazid was 95.6%, and the specificity was 100%. For streptomycin, the sensitivity was 85.7%, and the specificity was 93.3%. For ethambutol, we observed a sensitivity of 100% and specificity of 77.2%. The most frequent mutations associated with rifampicin resistance were rpoB Ser450Leu and His445Tyr. About isoniazid, the katG Ser315Thr mutation was the most frequent. Whole genome sequencing, given its high discriminatory power, has great potential to provide more accurate information about the gene mechanisms of bacilli resistance, making possible the improvement of more accurate diagnostic tests in the future.

Essa dissertação pretende identificar uma forma de fazer com que as indústrias incorporem objetivos de preservação ambiental aos seus sistemas de produção de forma mais fácil, rápida e sem perda da competitividade, para contribuírem mais significativamente com o esforço mundial pela sustentabilidade do planeta. Para isso, o trabalho se propõe a alcançar dois objetivos. O primeiro é organizar o conhecimento disponível até agora em torno dos modelos de produção com preocupação ambiental e fazer uma comparação entre eles, de modo a auxiliar o gestor interessado em adotá-los a fazer sua opção. O segundo objetivo é pesquisar a viabilidade da utilização de ferramentas de gerenciamento de produção simples e disponíveis a qualquer empresa, para obter uma melhoria de rendimento também no aspecto ambiental, além da melhoria da produtividade e da qualidade. A pesquisa foi feita com empresas do setor de fundição no Estado de São Paulo, por ser este um setor de grande importância na economia e apresentar um alto potencial de degradação ambiental. O método escolhido foi o estudo de casos múltiplos, com levantamento de dados em 10 empresas. Através de entrevista pessoal, foram avaliados quesitos referentes à aderência das empresas ao modelo da Produção Enxuta e ao modelo da Produção mais Limpa. O modelo da PE foi escolhido como objeto de estudo por ser um modelo muito difundido e suas práticas serem bem conhecidas. Além disso, baseia-se na redução de desperdícios, que tem uma identificação grande com a racionalização de recursos do modelo da P+L. Este modelo, por sua vez, foi selecionado a partir do resultado das comparações efetuadas na busca do objetivo 1. Por ser um modelo ligado mais diretamente aos processos de transformação, este modelo mostra-se mais adequado para ser adotado nos processos de produção. Os dados coletados serviram para responder a três questões de pesquisa, através da análise da correlação entre o grau de aderência aos dois modelos. Além dessa relação, foram estudadas a influência da certificação do sistema de gerenciamento ambiental e a necessidade de medidas complementares à PE para melhorar o rendimento ambiental. A conclusão da pesquisa mostrou que é possível alcançar metas de desempenho ambiental com a utilização de práticas de PE. Além de não implicar em aumento de custos, por não se tornar uma atividade extra, a empresa ainda se beneficia com o aumento da produtividade e da redução de desperdícios. / This thesis aims to identify a way to make the industries incorporate goals of environmental preservation to their production systems more easily, quickly and without loss of competitiveness, and then to contribute more significantly to the global effort for sustainability of the planet. For this, this paper aims to achieve two goals. The first is to organize the available knowledge about the production models with environmental concerns and make a comparison between them, to assist managers of manufacturing firms interested in adopting them to make his choice. The second objective is to investigate the feasibility of using simple management tools production, available to any company, to get increased revenue, also to the environmental aspects, as well as improving productivity and quality. The research was conducted with companies in the foundry sector in the State of São Paulo, because it is a very important sector to the economy and has a high potential for environmental degradation. The method chosen was multiple case study with data collection in 10 companies. Through personal interview, questions were evaluated regarding adherence to the model of Lean Manufacturing and to the model of Cleaner Production. The LM model was chosen as the object of study to be a widespread model and its practices well known. Furthermore, it is based on the reduction of waste, which has a large identification with the resource rationalization aspects of the model of P + L. This model, in turn, was selected from the results of the comparisons made in the pursuit of the goal number one. Being a model more directly linked to the transformation processes, this model seems to be more suitable to be adopted in production processes. The data collected served to answer three research questions by analyzing the correlation of the adherence level to the two models. Besides this relationship, it has been studied the influence of the certification of environmental management systems and the need for additional actions to the LM to improve environmental performance. The conclusion of this study showed that it is possible to achieve environmental performance goals by the use of LM practices. Besides not resulting in increased costs, because it will not become an extra activity, the company will still have benefits from increased productivity and reduction of waste.