O DNA está constantemente exposto a danos causados tanto por agentes endógenos quanto exógenos. Estes podem causar diferentes tipos de lesões incluindo modificações de bases e do açúcar, além de quebras de fitas simples ou duplas. As quebras de duplas fitas, quando comparadas às demais, constituem as mais citotóxicas e podem resultar em deleções no DNA e instabilidade genética. Deleções no DNA mitocondrial (mtDNA) causam diversas doenças e estão envolvidas no processo de envelhecimento. No núcleo, as quebras de duplas fitas no DNA podem ser reparadas por recombinação homóloga (HR), ligação de pontas não homólogas (NHEJ) e anelamento de fita simples (SSA). No entanto, em mitocôndrias de células de mamíferos, o reparo de quebras de duplas fitas ainda não foi completamente caracterizado. Experimentos in vitro usando extratos mitocondriais de células de roedores mostraram que estes são capazes de reparar essas quebras, no entanto pouco é sabido sobre quais proteínas são responsáveis por cada etapa de reparo, bem como sua implicação na manutenção da integridade do genoma mitocondrial. Sendo assim, nesse trabalho investigamos a localização e função mitocondrial das proteínas ATM, Rad51, Rad52, Ku70/86 e DNA-PKCs, que são sabidamente envolvidas em reparo de quebras de duplas fitas no núcleo. Para identificar essas proteínas em mitocôndrias de células de mamíferos, mitocôndrias foram isoladas a partir de células da linhagem HEK293T, usando centrifugação diferencial seguida por gradiente de Percoll. Para as proteínas de recombinação homóloga, ATM e Rad51, imunodetectamos isoformas semelhantes em todos os compartimentos celulares. Já para a proteína Rad52 o mesmo anticorpo imunodetectou duas bandas distintas na mitocôndria ao passo que no núcleo foram quatro. Além disso, verificamos que baixos níveis de proteína Rad52, induzidos pela expressão de shRNA (short hairping RNA) específico, resultam em diminuição do número de cópias de mtDNA bem como acúmulo de deleções no genoma mitocondrial. Para as proteínas de NHEJ, DNA-PKCs e a subunidade Ku70, identificamos isoformas semelhantes em todos os compartimentos celulares. Já para a subunidade 86 do heterodímero Ku70/86 o anticorpo detectou, somente em mitocôndrias, uma banda menor de 50 kDa, a qual difere na região N-terminal da subunidade detectada no núcleo (86 KDa). Experimentos de co-imunprecitação de proteínas mostraram que essa isoforma menor compõe o heterodímero mitocondrial juntamente com a subunidade 70 (mtKu70/50) e que esse interage com DNA ligase III mitocondrial. Nossos resultados também mostraram que a estabilidade proteica de mtKu70/50 é regulada por ATM. Tratamento das células com peróxido de hidrogênio, que induz quebras de duplas fitas, aumentou a associação do heterodímero mtKu70/50 com o mtDNA, de forma independente de aumento da concentração proteica intra-mitocondrial. Já a diminuição dos níveis proteicos de Ku, induzida através de shRNA, resultou em diminuição do número de cópias de mtDNA e acumulo de danos nesse genoma. Extratos mitocondriais de células knockdown para Ku apresentaram menor atividade de reparo NHEJ em um ensaio in vitro, sugerindo que o acúmulo de danos nestas células é provavelmente devido a deficiências na via de NHEJ. Em conjunto, nossos dados sugerem que tanto HR quanto NHEJ operam em mitocôndrias. Além disso, a via de NHEJ mitocondrial utiliza o heterodímero mitocondrial Ku70/50 o qual está envolvido na manutenção do mtDNA. Ademais, nossos resultados mostram uma grande conservação molecular e funcional entre as vias de reparo de NHEJ e HR no núcleo e na mitocôndria, o que reforça sua importância para a manutenção da estabilidade genômica mitocondrial e, provavelmente a função mitocondrial. / DNA is constantly exposed to damaging agents from both endogenous and exogenous sources. These can cause different types of DNA lesions that include base and sugar modifications and single and double strand breaks. DNA doublestrand breaks (DSBs) are among the most cytotoxic DNA lesions, which can result in deletions and genetic instability. Deletions in the mitochondrial DNA (mtDNA) cause numerous human diseases and drive normal aging. DSBs in the nuclear DNA are repaired by non-homologous DNA end joining (NHEJ), homologous recombination (HR) or Single Strand Annealing (SSA). Yet, repair of DSBs in mammalian mitochondria has not been fully characterized. Mitochondrial extracts from rodent cells are proficient in ligating DNA ends in vitro, but little is known about which proteins are responsible for each enzymatic step and its implication in mitochondrial genome maintenance. Thus, we investigated mitochondrial localization and function of DSBR (double strand break repair) proteins ATM, Rad51, Rad52, the Ku70/86 heterodimer and DNA-PKCs.To identify DSBR proteins in mammalian mitochondria, highly purified mitochondria from HEK293T cells were isolated using differential centrifugation followed by Percoll gradient. For HR proteins, we detected similar isoforms for ATM and Rad51 proteins in all cellular compartments. Two mitochondriaspecific isoforms of Rad52 were detected, while the same antibody detected four isoforms in the nucleus. In addition, lower Rad52 protein levels, induced by specific shRNA expression, result in decreased mtDNA copy number and accumulation of deleted mitochondrial genomes. For NHEJ proteins, similar isoforms of DNA-PKcs and the Ku70 subunit were detected in all cellular compartments. On the other hand, antibodies against the Ku86 subunit detected a smaller band in mitochondrial extracts (50 KDa), lacking the N-terminal region of the canonical isoform detected in the nucleus (86 KDa). The mitochondrial Ku70/50 heterodimer interacts with mitochondrial DNA ligase III, suggesting a role in DSBR. Moreover, stability of the mtKu heterodimer is regulated by ATM. Hydrogen peroxide treatment, which induces DSBs, increases mtKu70/50 association with the mtDNA and cells with reduced Ku levels, also induced by shRNA transfection, have lower mtDNA copy number and accumulate mtDNA damage. Moreover, mitochondrial extracts from Ku knockdown cells show lower NHEJ repair activity in an in vitro assay, suggesting that damage accumulation in these cells is likely due to deficiencies in NHEJ. Together, our data suggest that both HR and NHEJ operate in mitochondria. Also, mtNHEJ requires the Ku heterodimer and is involved in mtDNA maintenance. Moreover, our results indicate that there is a significant molecular and functional conservation between NHEJ and HR repair pathways in the nucleus and in mitochondria, which reinforces their importance for maintenance of mitochondrial genomic stability and, likely mitochondrial function.

O presente trabalho visou analisar padrões de atividade e uso de habitats por mamíferos de médio e grande porte, bem como dieta e sobreposição de nicho trófico de espécies de felinos e canídeos, numa região fragmentada do estado de São Paulo. Na paisagem estudada, existem duas unidades de conservação de proteção integral com vegetação de cerrado e floresta semidecídua, além de fragmentos de floresta nativa (semidecídua) em propriedades privadas. As hipóteses gerais do trabalho são: em ambientes mais impactados, i. as espécies de mamíferos de médio e grande porte tendem a generalizar seu comportamento de uso de habitat e padrão de atividade e ii. predadores de topo de cadeia alimentar aumentam a competição por recursos alimentares. Para explorá-las, foram estudados, por meio de armadilhas fotográficas e triagem de fezes, os seguintes aspectos: a) a freqüência do uso de diferentes habitats por mamíferos de médio e grande porte; b) o padrão de atividade de mamíferos de médio e grande porte; c) a dieta e a sobreposição de nicho de três carnívoros de topo de cadeia alimentar: lobo-guará (Chrysocyon brachyurus), onça-parda (Puma concolor) e jaguatirica (Leopardus pardalis). As coletas foram distribuídas em sete fragmentos, onde existem fitofisionomias nativas - cerrado sensu stricto, cerradão e floresta semidecídua - e também reflorestamento com espécies de eucaliptos. Foram obtidas 165, fotografias, nas quais identificou-se 17 espécies. Foram coletadas e identificadas 233 amostras de fezes, sendo 93 de lobo-guará, 68 de onça-parda, 38 de jaguatirica, 30 de outros pequenos felinos e 4 de cachorro-do-mato. Os resultados mostraram que, de forma geral, os mamíferos de médio e grande porte utilizam a área como um todo; os mamíferos mais especialistas, como o tapiti (Sylvilagus brasiliensis), mantiveram sua preferência por um habitat específico. Testes de correlação de Spearman mostraram que algumas espécies mais suscetíveis a alterações antrópicas mostraram-se correlacionadas a áreas com maior tamanho e grau de conectividade. Em relação aos padrões de atividade, os dados indicam que as espécies estão generalizando o seu comportamento: espécies que tinham atividade em alguns períodos do dia estão permanecendo ativas também em outros períodos. Quanto à dieta, o lobo-guará foi a espécie que utilizou mais itens entre os carnívoros estudados, alimentando-se de aves, répteis, frutos, mamíferos de diversos portes e insetos. A onça-parda e a jaguatirica apresentaram uma dieta mais restrita, sendo que os mamíferos representaram 90% dos itens consumidos. Houve uma alta sobreposição de nicho trófico entre lobo-guará e jaguatirica, indicando competição entre essas espécies. Os resultados, obtidos tanto por meio de armadilhamento fotográfico como por análise da dieta, indicam que pode existir uma relação entre áreas com maior grau de conservação (áreas maiores, menos isoladas estruturalmente e imersas em matrizes mais permeáveis) e a freqüência de mamíferos, a sobreposição de nicho dos carnívoros de topo e a densidade de fezes encontradas / The following study analyzed activity patterns and habitat use of large and medium size mammals as well as diet and trophic niche overlapping of feline and canid species in a fragmented area of the State of São Paulo. The landscape studied contains two fully protected conservation units with cerrado and semi-deciduous vegetation and also remnants of native semi-deciduous forest located in private properties. The general hypothesis of this study are: in more impacted environments, i, large and medium size mammal species tend to generalize their behavior regarding habitat use and activity patterns and ii, top food chain predators increase the competition for resources. The following aspects were studied through photographic traps and fecal sorting: a) frequency of different habitat use by large and medium size mammals; b) activity pattern of large and medium size mammals; c) diet and niche overlapping of three top food chain carnivores: Chrysocyon brachyurus, Puma concolor and Leopardus pardalis. Samples were withdrawn from seven fragments of native phytophysiognomies - cerrado sensu stricto, cerradão and semideciduous forest - and from areas of eucalyptus plantations. One hundred and sixty five photographs were obtained, where 17 species were identified. Two hundred and thirty three samples of feces were collected and identified, of which 93 of Chrysocyon brachyurus, 68 of Puma concolor, 38 of Leopardus pardalis, 30 of other small felines and 4 of Cerdocyon thous. The results show that, generally, large and medium size mammals use the entire area. However, more specialist mammals, such as the Sylvilagus brasiliensis, kept their preference for a more specific habitat. Spearman correlation tests demonstrated that those species which are more susceptible to anthropic alterations were more correlated with areas containing a higher connectivity and bigger size. The data also indicated that species are generalizing their behavior regarding the activity patterns: species that were active in some periods of the day are now remaining active in other periods as well. Among the carnivore species studied, Chrysocyon brachyurus was the specie with the most diversified diet, feeding on birds, reptiles, fruits, insects and mammals. Puma concolor and Leopardus pardalis had more restricted diets, where 90% of the items ingested belonged to other mammals. The trophic niche of C. brachyurus and L. pardalis species were strongly overlapped, indicating competition between them. The results obtained through photographic traps and diet analysis indicate that there might be a relation between more conserved areas (less isolated larger areas immersed in more permeable matrixes) and the frequency of mammals, the overlapping niche of top food chain carnivores ad the density of feces found.

O DNA está constantemente exposto a danos causados tanto por agentes endógenos quanto exógenos. Estes podem causar diferentes tipos de lesões incluindo modificações de bases e do açúcar, além de quebras de fitas simples ou duplas. As quebras de duplas fitas, quando comparadas às demais, constituem as mais citotóxicas e podem resultar em deleções no DNA e instabilidade genética. Deleções no DNA mitocondrial (mtDNA) causam diversas doenças e estão envolvidas no processo de envelhecimento. No núcleo, as quebras de duplas fitas no DNA podem ser reparadas por recombinação homóloga (HR), ligação de pontas não homólogas (NHEJ) e anelamento de fita simples (SSA). No entanto, em mitocôndrias de células de mamíferos, o reparo de quebras de duplas fitas ainda não foi completamente caracterizado. Experimentos in vitro usando extratos mitocondriais de células de roedores mostraram que estes são capazes de reparar essas quebras, no entanto pouco é sabido sobre quais proteínas são responsáveis por cada etapa de reparo, bem como sua implicação na manutenção da integridade do genoma mitocondrial. Sendo assim, nesse trabalho investigamos a localização e função mitocondrial das proteínas ATM, Rad51, Rad52, Ku70/86 e DNA-PKCs, que são sabidamente envolvidas em reparo de quebras de duplas fitas no núcleo. Para identificar essas proteínas em mitocôndrias de células de mamíferos, mitocôndrias foram isoladas a partir de células da linhagem HEK293T, usando centrifugação diferencial seguida por gradiente de Percoll. Para as proteínas de recombinação homóloga, ATM e Rad51, imunodetectamos isoformas semelhantes em todos os compartimentos celulares. Já para a proteína Rad52 o mesmo anticorpo imunodetectou duas bandas distintas na mitocôndria ao passo que no núcleo foram quatro. Além disso, verificamos que baixos níveis de proteína Rad52, induzidos pela expressão de shRNA (short hairping RNA) específico, resultam em diminuição do número de cópias de mtDNA bem como acúmulo de deleções no genoma mitocondrial. Para as proteínas de NHEJ, DNA-PKCs e a subunidade Ku70, identificamos isoformas semelhantes em todos os compartimentos celulares. Já para a subunidade 86 do heterodímero Ku70/86 o anticorpo detectou, somente em mitocôndrias, uma banda menor de 50 kDa, a qual difere na região N-terminal da subunidade detectada no núcleo (86 KDa). Experimentos de co-imunprecitação de proteínas mostraram que essa isoforma menor compõe o heterodímero mitocondrial juntamente com a subunidade 70 (mtKu70/50) e que esse interage com DNA ligase III mitocondrial. Nossos resultados também mostraram que a estabilidade proteica de mtKu70/50 é regulada por ATM. Tratamento das células com peróxido de hidrogênio, que induz quebras de duplas fitas, aumentou a associação do heterodímero mtKu70/50 com o mtDNA, de forma independente de aumento da concentração proteica intra-mitocondrial. Já a diminuição dos níveis proteicos de Ku, induzida através de shRNA, resultou em diminuição do número de cópias de mtDNA e acumulo de danos nesse genoma. Extratos mitocondriais de células knockdown para Ku apresentaram menor atividade de reparo NHEJ em um ensaio in vitro, sugerindo que o acúmulo de danos nestas células é provavelmente devido a deficiências na via de NHEJ. Em conjunto, nossos dados sugerem que tanto HR quanto NHEJ operam em mitocôndrias. Além disso, a via de NHEJ mitocondrial utiliza o heterodímero mitocondrial Ku70/50 o qual está envolvido na manutenção do mtDNA. Ademais, nossos resultados mostram uma grande conservação molecular e funcional entre as vias de reparo de NHEJ e HR no núcleo e na mitocôndria, o que reforça sua importância para a manutenção da estabilidade genômica mitocondrial e, provavelmente a função mitocondrial. / DNA is constantly exposed to damaging agents from both endogenous and exogenous sources. These can cause different types of DNA lesions that include base and sugar modifications and single and double strand breaks. DNA doublestrand breaks (DSBs) are among the most cytotoxic DNA lesions, which can result in deletions and genetic instability. Deletions in the mitochondrial DNA (mtDNA) cause numerous human diseases and drive normal aging. DSBs in the nuclear DNA are repaired by non-homologous DNA end joining (NHEJ), homologous recombination (HR) or Single Strand Annealing (SSA). Yet, repair of DSBs in mammalian mitochondria has not been fully characterized. Mitochondrial extracts from rodent cells are proficient in ligating DNA ends in vitro, but little is known about which proteins are responsible for each enzymatic step and its implication in mitochondrial genome maintenance. Thus, we investigated mitochondrial localization and function of DSBR (double strand break repair) proteins ATM, Rad51, Rad52, the Ku70/86 heterodimer and DNA-PKCs.To identify DSBR proteins in mammalian mitochondria, highly purified mitochondria from HEK293T cells were isolated using differential centrifugation followed by Percoll gradient. For HR proteins, we detected similar isoforms for ATM and Rad51 proteins in all cellular compartments. Two mitochondriaspecific isoforms of Rad52 were detected, while the same antibody detected four isoforms in the nucleus. In addition, lower Rad52 protein levels, induced by specific shRNA expression, result in decreased mtDNA copy number and accumulation of deleted mitochondrial genomes. For NHEJ proteins, similar isoforms of DNA-PKcs and the Ku70 subunit were detected in all cellular compartments. On the other hand, antibodies against the Ku86 subunit detected a smaller band in mitochondrial extracts (50 KDa), lacking the N-terminal region of the canonical isoform detected in the nucleus (86 KDa). The mitochondrial Ku70/50 heterodimer interacts with mitochondrial DNA ligase III, suggesting a role in DSBR. Moreover, stability of the mtKu heterodimer is regulated by ATM. Hydrogen peroxide treatment, which induces DSBs, increases mtKu70/50 association with the mtDNA and cells with reduced Ku levels, also induced by shRNA transfection, have lower mtDNA copy number and accumulate mtDNA damage. Moreover, mitochondrial extracts from Ku knockdown cells show lower NHEJ repair activity in an in vitro assay, suggesting that damage accumulation in these cells is likely due to deficiencies in NHEJ. Together, our data suggest that both HR and NHEJ operate in mitochondria. Also, mtNHEJ requires the Ku heterodimer and is involved in mtDNA maintenance. Moreover, our results indicate that there is a significant molecular and functional conservation between NHEJ and HR repair pathways in the nucleus and in mitochondria, which reinforces their importance for maintenance of mitochondrial genomic stability and, likely mitochondrial function.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-09-11Bitstream added on 2014-06-13T20:07:18Z : No. of bitstreams: 1 norris_d_dr_rcla.pdf: 38321765 bytes, checksum: bbf9bcf8dc9e2ff16a2c5117dac74585 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Existe uma necessidade urgente de se desenvolver conhecimento ecológico de apoio à conservação e gestão da rede protegida da Mata Atlântica dentro da região biogeográfica Serra do Mar. Resultados de pesquisas anteriores mostraram variações elevadas nas abundâncias dos grandes mamíferos dentro destas grandes áreas protegidas, que são comparáveis, se não maiores, do que as encontradas nos ecossistemas fragmentados da Mata Atlântica. Neste trabalho demonstrou-se como variáveis ambientais e antrópicas influenciam grandes mamíferos em remanescentes contínuos da Mata Atlântica Brasileira na região biogeográfica da Serra do Mar. Remanescentes contínuos da Mata Atlântica apresentam um ambiente altamente heterogêneo, resultado de fatores ambientais e impactos antrópicos. Os resultados apresentados nos 4 capítulos dessa tese destacam que, embora a Mata Atlântica seja o bioma mais intensamente estudado para mamíferos no Brasil, ainda não se atingiu o conhecimento necessário para a conservação e gestão eficaz desta classe na Mata Atlântica. Estudos adicionais são necessários para permitir a definição de zonas dentro das áreas protegidas, como definido pela legislação brasileira (Lei: 9.985/2000 (SNUC)). Este zoneamento é necessário para a realização dos objetivos múltiplos das áreas protegidas (incluindo a manutenção da biodiversidade e o fornecimento dos serviços dos ecossistemas) dentro do contexto sócio-econômico em um escala regional e nacional / There is an urgent need to develop ecological knowledge to support conservation and management of the protected area network within the Serra do Mar biogeographical region. Results of previous research showed a high variation in the abundance of large mammals within large protected areas of Atlantic Forest within this region that is comparable if not greater than that found in fragmented Atlantic Forest ecosystems. This thesis shows how environmental variables and anthropogenic impacts influence large mammals within the remaining continuous Atlantic Forest remnants of the Serra do Mar. Continuous Atlantic Forest remnants are highly heterogeneous and this heterogeneity results from environmental factors and human impacts. The results presented in the four chapters of this thesis highlight that, although the Atlantic Forest is the most intensely studied biome for mammals in Brazil, the knowledge necessary for the conservation and effective management of this class in the Atlantic Forest is still lacking. Additional studies are needed to allow the establishment of zones within protected areas as defined by Brazilian legislation (Law: 9.985/2000 (SNUC)). This zoning is necessary to achieve the multiple objectives of protected areas (including the maintenance of biodiversity and the provision of ecosystem services) within the socioeconomic development in a regional and national scale

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-09-27Bitstream added on 2014-06-13T20:07:21Z : No. of bitstreams: 1 briani_dc_dr_rcla.pdf: 421185 bytes, checksum: 2d752e584452d7ba048387b912c4f60c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) / O presente estudo versa sobre energética alimentar de um animal. O estudo procurou analisar, dentre outras coisas, os fatores intrínsecos e extrínsecos que respondem pela variabilidade na taxa metabólica em repouso (TMR) e a relação entre esta variação e padrões de história de vida de um marsupial (Gracilinanus microtarsus). Especificamente, a variabilidade da TMR seria determinada através de um aspecto especifico da história de vida, a dieta. Aspectos como possíveis efeitos da dinâmica de variação das reservas energéticas sobre esta relação também foram analisados. Utilizando metodologia apropriada também analisamos a variação da disponibilidade e qualidade da dieta. Variações desses fatores induzem modificações na condição corpórea e, desta forma, os efeitos desta variável sobre a TMR mediariam um dos objetivos do estudo, servindo como elemento de ligação para averiguar quais componentes da condição corpórea seriam responsáveis pela variabilidade na TMR. / The present study turns about energetics to feed of an animal. The study analyzed, among other things, the intrinsic and extrinsic factors that answer for the variability in the resting metabolic rate (RMR) and the relationship between this variation and patterns of life history of a marsupial (Gracilinanus microtarsus). Specifically, the variability of RMR would be determined through an aspect specify of the life history, the diet. Aspects as possible effects of the dynamics of variation of the energy budge about this relationship were also analyzed. Using appropriate methodology also analyzed the variation of the availability and quality of the diet. Variations of those factors induce modifications in the body condition and, this way, the effects of this variable on RMR would mediate one of the objectives of the study, serving as connection element to discover which components of the body condition would be responsible for the variability in RMR.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6725.pdf: 3328461 bytes, checksum: 517c1b60ab0c8976991fed71cb2ffa40 (MD5) Previous issue date: 2015-03-26 / Financiadora de Estudos e Projetos / Gruta da Lapinha is one of the largest limestone caves in Bahia state, located in Municipality of Iramaia. In the year 2012 speleologists of Grupo Pierre Martin de Espeleologia (GPME Pierre Martin Speleology Group), discovered a complete skeleton of Holmesina major. In 2014, in a joint expedition between researchers of Federal University of São Carlos and GPME, three more specimens were found and glyptodonts remains. In a taphonomic analysis it was concluded that due to the integrality of the bones, the sedimentation patterns and the lack of some marks, those animals entered alive in the cave probably in search of resources and posteriorly dead locally, however, the deposition of the glyptodont material happened asynchronously to the pampathere ones. And all of the fossils collected in this cave were of cingulates. Cingulata is the order of xenarthrans that has the largest number of species and the widest geographical distribution in the present time; however, it is only reduced to the Family Dasypodidae. During the Pleistocene there were more than one Family; Pampatheriidae was one among them. In that Family, the species H. major was distributed from Northeast to South of Brazil through the eastern regions. Most of what is known about the geographical distribution of those animals is due to their osteoderms that has been found; nevertheless, few specimens with an almost complete skeleton had been found. This paper makes a literature review about phylogenetic relationships and paleoecology of pampatheres; describes two well-preserved new specimens of H. major found in Bahia state, detailing new structures of Pampatheriidae, such as pelvis and xenarthrous vertebrae; compares the specimens, analyzing inter- and intraspecific variations; and concludes that H. major treats being a clade distinct from H. paulacoutoi. / A Gruta da Lapinha, localizada no Município baiano de Iramaia, é uma das maiores cavernas calcárias do estado. No ano de 2012, espeleólogos do Grupo Pierre Martin de Espeleologia (GPME) descobriram um esqueleto completo do Holmesina major. Em 2014, numa expedição conjunta de pesquisadores da UFSCar e GPME, mais três espécimes foram encontrados e remanescentes de gliptodonte. Numa análise tafonômica, concluiu-se que, devido à integralidade dos ossos, aos padrões de sedimentação e à ausência de marcas, estes animais entraram vivos na caverna provavelmente em busca de recurso e posteriormente morreram no local, entretanto, a deposição dos restos do gliptodontídeo ocorreu assincronamente à dos pampaterídeos. Apesar disso, todos os fósseis coletados eram de cingulados. Cingulata é a ordem de xenartros que possui maior número de espécies e maior distribuição geográfica na atualidade, entretanto, é resumida apenas à família Dasypodidae. No Pleistoceno, havia mais de uma família, dentre elas, Pampatheriidae. Dessa família, a espécie H. major distribuía-se do nordeste ao sul do Brasil nas regiões leste. Muito do que se sabe da distribuição geográfica desses animais é por seus osteodermos que são encontrados, porém, apenas poucos espécimes com o esqueleto quase completo haviam sido encontrados. Este trabalho faz uma revisão de literatura sobre as relações filogenéticas e a paleoecologia de pampaterídeos; descreve dois novos espécimes de H. major bem preservados encontrados na Bahia, detalhando novas estruturas para a família Pampatheriidae, como pélvis e vértebras xenártricas; compara os espécimes, analisando as variações inter- e intraespecíficas e conclui que H. major trata-se de um clado distinto de H. paulacoutoi.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2015-12-01T16:36:49Z No. of bitstreams: 1 2015_ JulianaFernandesRibeiro.pdf: 2610910 bytes, checksum: 1f2a5b41a14be0f3933be971ffe10447 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-12-15T19:40:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_ JulianaFernandesRibeiro.pdf: 2610910 bytes, checksum: 1f2a5b41a14be0f3933be971ffe10447 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-15T19:40:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_ JulianaFernandesRibeiro.pdf: 2610910 bytes, checksum: 1f2a5b41a14be0f3933be971ffe10447 (MD5) / Compreender os fatores que colaboram para a co-ocorrência de espécies em um local ou região é de extrema importância para a conservação e manejo dos pequenos mamíferos terrestres do Cerrado brasileiro. Essas espécies possuem adaptações morfológicas distintas que permite selecionar hábitats em diferentes escalas espaciais, apresentar diferenças na utilização dos recursos alimentares, bem como possuírem distintas capacidades de locomoção para explorarem o ambiente. No presente estudo avaliamos a diversidade e distribuição desse grupo nas diferentes formações vegetais do bioma e em distintas escalas espaciais. A diversidade beta foi alta entre formações vegetais em uma mesma área e entre as áreas, indicando a relevância de processos locais e regionais na estruturação dessas comunidades e na abundância das espécies. Ao avaliarmos o uso do hábitat em diferentes escalas e dos recursos alimentares, verificamos que as características do hábitat em diferentes escalas espaciais são importantes para a estruturação das comunidades, bem como na seleção do hábitat por determinadas espécies. Os recursos alimentares (i.e., frutos e invertebrados) não apresentaram relação com a estrutura das comunidades, nem com a abundância das espécies. Além disso, avaliamos quais são os grupos de recursos alimentares consumidos que foram assimilados através dos isótopos estáveis (δ13C e δ15N) e como esses animais os exploram nas diferentes formações vegetais e épocas do ano. As espécies de pequenos mamíferos terrestres são onívoras, porém algumas tendem à frugivoria (i.e., Oecomys bicolor, Rhipidomys macrurus e Nectomys squamipes), e outras à insetivoria (i.e., Monodelphis domestica, Gracilinanus agilis, Thrichomys apereoides e Oxymycterus delator). Além disso, algumas espécies apresentaram grande plasticidade na dieta, de acordo com a época do ano e com a formação vegetal, enquanto outras não alteram a origem dos recursos. Essa plasticidade pode ser devido à disponibilidade e diversidade dos recursos alimentares. Avaliamos também se pequenos mamíferos que utilizam os estratos verticais (i.e., escansoriais-arborícolas) são mais seletivos na dieta e mais frugívoros que os exclusivamente terrestres. Além disso, verificamos a relação da complexidade estrutural da vegetação com o nicho isotópico das comunidades de cada formação vegetal (i.e., florestal, savânica e campestre). Nossas hipóteses foram corroboradas, com o hábito de locomoção terrestre provavelmente mais relacionada à facilidade de capturar as presas potenciais. A amplitude do nicho isotópico das comunidades de cada formação vegetal seguiu o gradiente de complexidade da vegetação, sendo maior na formação florestal, seguida pela savânica e menor na campestre. Locais com maiores possibilidades de recursos alimentares (i.e., formação florestal) proporcionam uma maior sub-divisão do nicho, com maior empacotamento do nicho isotópico. / Understanding the factors that contribute to the co-occurrence of species in a site or region is of utmost importance for the conservation and management of non-volant small mammals in the Brazilian Cerrado. These species have different morphological adaptations, which allow them to select specific habitat features at different spatial scales, to show differences in the use of food resources, and also to rely on distinct mobility strategies to explore the environment. In this study we evaluated the diversity and distribution of this group in different vegetation types of the Brazilian Cerrado at distinct spatial scales. The estimated beta diversity was high between vegetation formations within the same area and also between geographical areas, revealing the importance of both local and regional processes in structuring these communities. We also evaluated the habitat use at different scales and also its relation with the availability of food resources. The results indicated that the habitat characteristics at different spatial scales are important to the structure of the communities, as well as habitat selection by certain species. Food resources (i.e., fruits and invertebrates) were not associated with the structure of the communities, nor with the species abundance. In addition, we assessed which groups of food sources are assimilated through stable isotopes (δ13C and δ15N) and how these animals exploit them in the different vegetation types and seasons. According to our results, the species of non-volant small mammals are omnivorous, but some tend to frugivory (i.e., Oecomys bicolor, Rhipidomys macrurus and Nectomys squamipes), whereas others are more insectivorous (i.e., Monodelphis domestica, Gracilinanus agilis, Thrichomys apereoides and Oxymycterus delator). In addition, some species showed a greater plasticity in the diet, changing their feeding habits according to the season and the formation vegetation, while others do not alter the origin of the food sources. This plasticity may be due to the availability and variety of food resources. We evaluated also whether small mammals that use the vertical strata (i.e., arboreal-scansorials) are more selective in food-item selection and more frugivorous than exclusively terrestrial species. In addition, we investigated the relation between the structural complexity of the vegetation and the communities‘ isotopic niche at each vegetation type (i.e., forest, savanna and grassland). Our hypotheses were supported, with insectivore habits of terrestrial species probably related to the ease of capturing potential prey. The range of isotopic niche of the mammalian communities at each plant formation followed the plant complexity gradient, being higher in the forests, followed by savanna and lower in the grasslands. Sites with greater availability of food resources (i.e., forests) provided greater niche sub-division, with a higher packing within the isotopic niche dimension.

Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-07-15T17:52:46Z No. of bitstreams: 1 Norlan_Dissertação_Ecologia e Biomonitoramento_versao_final.pdf: 1224029 bytes, checksum: 3eb150cd674fb47b23f9e4245d11c757 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Valéria de Jesus Moura (anavaleria_131@hotmail.com) on 2016-06-21T17:55:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Norlan_Dissertação_Ecologia e Biomonitoramento_versao_final.pdf: 1224029 bytes, checksum: 3eb150cd674fb47b23f9e4245d11c757 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-21T17:55:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Norlan_Dissertação_Ecologia e Biomonitoramento_versao_final.pdf: 1224029 bytes, checksum: 3eb150cd674fb47b23f9e4245d11c757 (MD5) / Capes, fapesb, Cnpq / A redução de habitat é considerada a maior ameaça à biodiversidade, dentre outras razões, pela alteração da relação entre parasitos e hospedeiros, gerando impactos negativos nas espécies envolvidas. Neste estudo foi avaliada a modificação na riqueza e abundância de parasitos e as taxas de parasitismo em relação ao processo de redução de abitat. No presente estudo foram analisados 130 pequenos mamíferos, distribuídas em 18 espécies, 14 de roedores e 4 de marsupiais. Foram identificadas 20 espécies de ectoparasitos. As espécies de ácaros: Eubrachilaelaps rotundus (n=347), Gigantolaelaps oudemansi (n=83) e G. vitzthumii (n=66), pertencentes à Sub-classe Acari e Família Laelapidae foram as mais frequentes. O cálculo de prevalência de ectoparasitismo por paisagem resultou em 91% em Valença (25% de cobertura florestada), 64% em Nilo Peçanha (35% de cobertura florestada), 72% em Camamú (45% de cobertura florestada) e 50% em Jaguaripe (55% de cobertura florestada). O cálculo da intensidade do ectoparasitismo, número de ectoparasitos por hospedeiro infestado, resultou em 13,6 em Valença, 8,9 em Nilo Peçanha, 13,6 em Camamú e 4,8 em Jaguaripe. Foi identificada maior riqueza e maior abundância de parasitos associados à redução de habitat. São necessários mais estudos que abordem as implicações epidemiológicas destes achados. / The process of habitat reduction is considered the most threat to biodiversity and may alter animal communities and ecological relationships, among then the parasitism. The parasites play important roles in ecosystems, and may alter the biodiversity. In the four sampling units were captured 130 individuals belonging to 18 species of small mammals, 14 species of rodents and four marsupials. We identified 20 species of ectoparasites. The mite species: Eubrachilaelaps rotundus (n = 347), Gigantolaelaps oudemansi (n = 83) and G. vitzthumii (n = 66), belonging to the Sub-Class and Family Laelapidae Acari were the most frequent. The calculation unit ectoparasitismo prevalence of a sample size at Valença was 91% (25% coverage forested), 64% at Nilo Peçanha (35% coverage forested) 72% at Camamú (45% coverage forested) and 50% at Jaguaripe (55% coverage forested). The calculation of the intensity of ectoparasitismo, number of ectoparasites per infested host, resulted in 13.6 at Valenca, 8.9 at Nilo Peçanha, 13.6 at Camamú, and 4.8 at Jaguaripe. Was identified greater richness and greater abundance of parasites associated with the reduction of habitat. / Salvador

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-06T04:06:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 334682.pdf: 1779341 bytes, checksum: f13f3100c4305fa56031661a8a022aa9 (MD5) Previous issue date: 2015 / Após décadas de estudos em cativeiro, nos últimos anos os avanços no conhecimento sobre a bioacústica dos odontocetos têm contado com estudos com animais de vida livre. Tais estudos permitem a investigação da influência de aspectos comportamentais e sociais no repertório acústico destes animais, possibilitando a compreensão sobre como os sinais acústicos são usados e como o comportamento e as relações sociais os influenciam. Buscando contribuir com estas investigações, o presente trabalho estudou uma população residente de Tursiops truncatus que apresenta um comportamento peculiar e tem sua organização social conhecida. Os botos-da-tainha, como são conhecidos na região, habitam o complexo estuarino situado na cidade de Laguna, sul do Brasil. O nome popular da espécie se deve ao comportamento de pesca cooperativa que realizam, interagindo com pescadores artesanais. Somente alguns botos realizam este comportamento, determinando parte da estrutura social modular da população. Assim, esta população representa um excelente modelo para se investigar a influência dos fatores comportamentais e sociais no repertório acústico da espécie. Para tanto, entre 2010 e 2011, foram gravados os sons produzidos pelos botos durante com e sem a participação dos pescadores, para avaliar possíveis variações nas emissões sonoras. Os registros foram feitos com um hidrofone Aquarium AQ-9, com capacidade de captação de frequência entre 0,01 e 100 kHz, e um gravador Sony DAT PCM-M1 (48 kHz), com frequência de amostragem em 22 kHz. Os sons foram digitalizados e analisados através do programa Raven Lite versão 1.0. Posteriormente, entre 2013 e 2014, os registros da população foram feitos com o mesmo hidrofone acoplado a um gravador digital portátil Sony PCM-M10 (96 kHz), com frequência de amostragem em 48 kHz, associado ao registro fotográfico dos botos gravados, para posterior foto-identificação. Os sons deste período foram analisados através do programa Raven Pro 1.5. As análises de ambos os períodos focaram em dois tipos de emissões sonoras: ecolocalização e assobios, e os resultados são aqui apresentados em dois capítulos. No primeiro capítulo, os assobios foram analisados através do teste do qui-quadrado (?²), para verificar se há diferença na taxa de emissão de cada tipo de assobio que permita distinguir situações de forrageio com e sem interação com os pescadores; e através dos testes de PCA, DFA e MANOVA, para investigar se os assobios da pesca cooperativa podem ser diferenciados, por parâmetros acústicos, dos assobios produzidos durante outras estratégias de forrageio, bem como a possibilidade de diferenciação dos assobios por módulo social da população. Os resultados mostram que a maioria dos assobios produzidos pelos botos-da-tainha são descendentes e ascendentes, com o predomínio de assobios descendentes durante a pesca cooperativa. Os parâmetros acústicos analisados (frequência inicial, frequência final, frequência máxima, frequência mínima, duração, número de pontos de inclinação e número de inflexões) permitiram distinguir os assobios por módulos sociais e estratégia de forrageio. Para o segundo capítulo, a ecolocalização foi avaliada pelo teste de permutação e pelo teste t pareado. Como resultado, encontrou-se que a ecolocalização foi mais utilizada durante a pesca cooperativa e, neste comportamento, houve mais emissão deste som em momentos em que as redes de pesca foram lançadas na água. Tal padrão de uso de ecolocalização deve-se ao comportamento de pesca cooperativa, não sendo uma característica de carater individual. Assim, havendo modelagem do repertório acústico dos botos-da-tainha devido à pesca cooperativa, estes resultados se somam aos esforços para compreender as características desta interação entre botos e pescadores, bem como servem para subsidiar medidas de conservação da população e do comportamento peculiar que apresentam, principalmente no que se refere a ameaças acústicas causadas por poluição sonora antrópica. Além disso, conhecendo os parâmetros acústicos dos assobios que variam entre as atividade de forrageio e na manutenção das relações sociais dos botos, é possível avançar na compreensão da transmissão de informações através destes sons.<br> / Abstract : After decades of studies in captivity, the progresses in knowledge about bioacoustics of odontoceti in last years have counting with studies with free-ranging animals. These studies permit the investigation about behavioral and social influence in acoustic repertoire of these animals, enabling the comprehension about how acoustics signals are used and in which aspects they vary on the behavior and social relations influence. In collaboration to these investigations, the present paper studied a Tursiops truncatus resident population, that present a unique behavior and their social organization is known. ?Botos-da-tainha?, how are called the bottlenose dolphins in the region, inhabit the estuarine complex localized in Laguna city, south Brazil. The popular name of specie is due to cooperative fishery behavior that they present, interacting with artisanal fishermen. Only some bottlenose dolphins present this behavior, determining part of social modulated structure of population. Thus, these bottlenose dolphins are an excellent model to investigate influence of both factors behavioral and social in the acoustic repertoire. In this way, initially, between 2010 and 2011, were recorded sounds produced by bottlenose dolphins during cooperative fishery and foraging without fishermen participation, to evaluate possible variations in sonorous emissions. The records were made with a hydrophone Aquarium AQ-9, with frequency response at 0.01 to 100 kHz, and a recorder Sony DAT PCM-M1 (48 kHz), with upper frequency limit of 22 kHz. The sounds were digitized and analyzed through software Raven Lite version 1.0. Posteriorly, between 2013 and 2014, population records were made with the same hydrophone connected to digital portable recorder Sony PCM-M10 (96 kHz), with upper frequency limit of 48 kHz, and associated with photographic records of recorded bottlenose dolphins, to posterior photo-identification. The sounds of this period were analyzed through software Raven Pro 1.5. Analysis of both periods focus on two kinds of sonorous emissions: echolocation and whistles, and results are here presented in two chapters. In the first chapter, whistles were analyzed through of qui-square test (?²), to verify if there is difference in repertoire used during cooperative fishery comparing with foraging without interaction with fishermen; and through PCA, DFA and MANOVA tests, to investigate if cooperative fishery whistles could be differentiated, by their acoustics parameters, of whistles produced during others foraging strategies, as well as possible differentiation of whistles by social module of population. We found that bottlenose dolphins emit, principally, descending and ascending whistles, with prevalence of descending whistles during cooperative fishery. Acoustic parameters used (beginning frequency, end frequency, maximum frequency, minimum frequency, duration, number of inclination points and number of inflections) permit distinguish whistles by social module and foraging strategy. For second chapter, echolocation was evaluated by permutation test and paired t test. As a result, we found that echolocation was more used during cooperative fishery and, in this behavior, there been more emission of this sound in moments that fishery nets were casted in water. This use pattern of echolocation is due to behavior of cooperative fishery, do not being an individual character characteristic. Thus, there being acoustic repertoire modelling of ?botos-da-tainha? due to cooperative fishery, these results sum at effort to understand characteristics of this interaction between dolphins and fishermen, as well as help to subsidize conservation measures to the population and unique behavior that they present, principally with relation to acoustic threats caused by anthropic sonorous pollution. Moreover, known the acoustical parameter that varies between foraging activities and in relationship maintenance of bottlenose dolphins, it is possible progressing in transmission comprehension of information through these sounds.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-10-11T04:04:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 342200.pdf: 2254759 bytes, checksum: f419531573dcc76beab93db50eb2cab1 (MD5) Previous issue date: 2016 / A Área de Proteção Ambiental de Anhatomirim (APAA), inserida no contexto da Baía Norte da Ilha de Santa Catarina, é uma unidade de conservação de Uso Sustentável, criada com os objetivos de proteção da população residente de Sotalia guianensis (botos-cinza), bem como a proteção de remanescentes da Floresta Ombrófila Densa e recursos hídricos de relevante interesse para a sobrevivência das comunidades de pescadores artesanais da região e suas práticas artesanais. Nos últimos 23 anos, além da tendência de alteração nos padrões de ocupação dos botos-cinza, com a diminuição da frequência de avistamentos no local considerado de maior incidência da população, a Baía dos Golfinhos, a APAA e o seu entorno vêm sofrendo um acelerado desenvolvimento urbano e intensa atividade turística, intensificando problemas ambientais, sociais e de infra-estrutura local. O conhecimento ecológico local (CEL) de moradores residentes em unidades de conservação contribui para o entendimento do contexto local, baseado em sua experiência empírica do uso de recursos naturais e status de preservação da unidade de conservação e seu entorno, convergindo para a efetividade dos objetivos estabelecidos para a área de proteção. O CEL pode auxiliar no planejamento, adaptação e mitigação de situações ambientais e sociais a que a área possa estar suscetível. Sob o enfoque da Etnoecologia, o objetivo desta pesquisa foi investigar as mudanças ambientais ocorridas e em curso na APAA, sob a perspectiva da comunidade residente, assim como identificar a distribuição espacial dos botos-cinza na Baía Norte da Ilha de Santa Catarina, a partir da percepção de pescadores locais desta Baía. Foram realizadas entrevistadas semi-estruturadas, com moradores locais e pescadores artesanais, na APAA e ao longo da Baía Norte, respectivamente. Para o primeiro artigo foram realizadas 76 entrevistas individuais com moradores da comunidade da Costeira da Armação, nas quais buscou-se investigar se há diferença na percepção sobre mudanças ambientais, entre grupos de moradores com maior ou menor relação com a unidade de conservação. A maior (G1) ou menor (G2) relação foi determinada de acordo com ofício de trabalho e/ou maior ou menor envolvimento com questões referentes à APAA, as quais poderiam aproximar tais informantes a uma maior interação e ciência nos assuntos relativos à área de proteção, assim como seus próprios interesses convergindo para tal. Todos os entrevistados perceberam mudanças ambientais na APAA e seu entorno, não havendo diferença significativa no número de citações de mudanças entre grupos. Portanto, a maior ou menor relação com a área de proteção não se mostrou como diferencial na percepção ambiental de mudanças ocorridas e em curso na APAA. Devido à sua pequena população e a economia centralizada em somente duas atividades (pesca artesanal e turismo), o conhecimento e a percepção ambiental estão distribuídos pela comunidade como um todo e a APAA é amplamente reconhecida pela comunidade residente. No segundo capítulo foram realizadas 56 entrevistas com pescadores artesanais, em sete comunidades ao longo da Baía Norte. Os entrevistados relataram que a população de botos sempre foi observada em toda Baía Norte, tanto na costa continental quanto na da Ilha de Santa Catarina. Suas áreas de maior concentração informadas foram a Baía de São Miguel e a Baía dos Golfinhos, essa última não relatada pelos pescadores locais da comunidade adjacente a ela. Foram investigadas a existência de sobreposições de áreas de pesca e áreas de deslocamento e concentração de botos, assim como a possível sobreposição de espécies-alvo da pesca e da dieta dos botos, a partir do conhecimento ecológico local dos pescadores. Os entrevistados não relataram consequências negativas para tais sobreposições. Foram citadas algumas ameaças na Baía Norte aos botos, como as redes fundeadas e as embarcações turísticas (escunas), em sua maioria, consideradas pelos colaboradores como ameaças reversíveis (fáceis de se mitigar ou fiscalizar) mas, estas não foram atestadas como as verdadeiras causas da diminuição de avistamentos de botos na Baía dos Golfinhos. A percepção ambiental e conhecimento ecológico das comunidades pesqueiras, oferecem uma rica fonte de informações que pode auxiliar a conservação e manejo de espécies, assim como a manutenção de práticas artesanais e utilização sustentável de recursos. Trazem indicativos importantes sobre a efetividade da UC, com vistas para uma gestão participativa, assim como evidenciam alguns conflitos com os órgãos fiscalizadores, mas também se certificam das ações efetivas realizadas na área de proteção para a elaboração de novas estratégias.<br> / Abstract : Anhatomirim?s Environmental Protection Area (APAA), inserted in Santa Catarina Island?s North Bay, is a Sustainable Use conservation unit, created to protect the Sotalia guianensis (Guiana dolphin) resident population, as well as remaining Dense Ombrophylous Forest and water resources of relevant interest to the survival of artisanal fishermen?s communities in the region and their artisanal practices. In the past 23 years, along with the trend of change in the occupancy patterns of Guiana dolphin there is a decreasing frequency sightings at locations considered most incident, Dolphins Bay and APAA and its surroundings are undergoing an accelerated urban development and an intensive touristic activity, intensifying the environmental, social and infrastructure problems. The resident?s local ecological knowledge (LEK) living in conservation units, contributes to the understanding, based on their empirical experience, the use of natural resources and preservation status of the conservation unit and its surroundings, converging to the effectiveness of the objectives set for the protection area. LEK can assist in planning, adaptation and mitigation of environmental and social situations which the area may be susceptible. Focused on ethnoecology, the objectives of this research were to investigate and evaluate the occurred and ongoing environmental changes in APAA, from the community perspective, as well as understand the decreasing frequency of sightings of Sotalia guianensis, from local fishers perception of Santa Catarina Island?s North Bay. Semi-structured interviews were conducted with residents and artisanal fishers, at APAA and along the North Bay, respectively. In the first article, 76 individual interviews were conducted, and we investigated if there we are differences between groups of residents with higher or lower relation with the protected area. Higher (G1) or lower (G2) groups of relation were determined according to the conomic activity and/or more or less involvement with APAA?s issues, which could approach such collaborators to an increased interaction and awareness about the protectied area, as well as their own interests converging for this. All interviewees noticed environmental changes in APAA and its surroundings, with no significant difference in the number of citations of changes among the groups. Therefore, the higher or lower relation with the protection area was not differential in occurred and ongoing environmental changes perception at APAA. Due to its small population and centralized economic practice in only two activities (artisanal fishing and tourism), knowledge and environmental awareness are entirely distributed through the community and APAA is widely recognized by resident community. In the second article, 56 interviews were conducted with artisanal fishers, in seven communities throughout North Bay. Interviewees reported that porpoises population was always observed throughout North Bay, both on mainland coast and in Santa Catarina Island, and its highest concentration reported areas were São Miguel Bay and Dolphin Bay, the latter not reported by local fishers adjacent to it. Possible overlapping of fishing areas and porpoise?s areas of displacement and concentration were investigated, as well as overlap of fishing target species and species on porpoises? diet, from fishers ecological knowledge, in which interviewees reported no negative evidence for such overlapping. Some threats to porpoises were cited in North Bay, as bottom-set gillnets and schooners, mostly considered as reversible threats (easy to mitigate or supervise), but these are not attested as the true causes of porpoise?s sightings decrease in Dolphins Bay. Fishing communities? environmental perceptions and ecological knowledge offers a rich source of specific information that can help conservation and management of species, as well as maintenance of handcraft practices and sustainable use of resources. They bring important indications about protected area effectiveness, aiming a participative management, as well as show some conflicts with surveillance body, but also make sure the effective actions taken in protection area for new development strategies.