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Coupling selection of the HIV-1 tRNA primer used for reverse transcription with viral translation and encapsidationDjekic, Uros V. January 2007 (has links) (PDF)
Thesis (Ph. D.)--University of Alabama at Birmingham, 2007. / Title from first page of PDF file (viewed June 23, 2008). Includes bibliographical references.
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The mechanism of protein synthesis inhibition by the P56 family of viral stress inducible proteins /Hui, Daniel Jason. January 2005 (has links)
Thesis (Ph. D.)--Case Western Reserve University, 2005. / [School of Medicine Molecular Virology Program. Includes bibliographical references. Available online via OhioLINK's ETD Center.
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Caractérisation de microtextures par la technique ACOM-TEM dans le cadre du développement des technologies avancées en microélectronique / Microtexture characterization by Automated Crystal Orientation Mapping in TEM for the development of advanced technologies in microelectronicsValery, Alexia 16 March 2017 (has links)
Afin d’optimiser les composants de l’industrie de la microélectronique, il est essentiel d’établir le lien entre la texture cristallographique des matériaux constitutifs et leurs propriétés électriques, thermiques et mécaniques. Ainsi, il est nécessaire de disposer d’outils capables de cartographier la morphologie et l’orientation cristallographique des grains à l’échelle nanométrique. La technique ACOM, implémentée sur un Microscope Electronique en Transmission (MET), permet d’obtenir ces informations en exploitant les figures de diffraction électronique. Dans cette thèse, les capacités de cette technique sont évaluées, à la fois pour déterminer la microtexture de matériaux confinés dans quelques dizaines de nanomètres, et pour répondre aux problématiques associées à la fabrication de nouveaux circuits. Cette étude montre dans un premier temps l’importance de l’optimisation des conditions opératoires du MET afin de diminuer les erreurs d’indexation. Des analyses quantitatives de microtexture sont ensuite menées sur des films minces de siliciures de nickel-platine pour différents dopage du substrat, concentration en platine, et température de recuit. Enfin, le cas d’une superposition de signaux de diffraction observé lorsque plusieurs grains sont contenus dans l’épaisseur de l’échantillon est étudié. Les résultats montrent que les erreurs d’indexation restent rares dans ce cas et que les grains de plus large fraction volumique sont majoritairement sélectionnés par l’algorithme d’indexation. Une méthode est alors proposée pour traiter la totalité de l’information détectée dans les clichés de diffraction. Elle s’appuie sur l’indexation successive des orientations cristallographiques après soustraction préalable des réflexions associées à l’orientation précédemment indexée. Les capacités de cet outil en termes de caractérisation de la morphologie des grains superposés sont finalement comparées à deux autres techniques basées sur la reconstruction d’images en champ sombre et sur la factorisation en matrices non-négatives. / The development of advanced nodes in microelectronics requires to understand the impact of crystal size and orientation on the electrical, thermal and mechanical properties of materials. New tools have been developed to map the grains orientation and morphology of nanometer-scaled structures. Among them, the Automated Crystal Orientation Mapping technique used on a Transmission Electron Microscope (ACOM-TEM) is based on the indexation of electron diffraction patterns. The aim of this study was to evaluate the abilities and limitations of the ACOM-TEM technique for the characterization of microelectronics-related materials. Consequently, its ability to analyze nano-sized materials and the possibility of answering problematics related to microelectronics front-end fabrication challenges were investigated. The study highlighted in the first place the importance of the TEM illumination settings. The results showed that minimizing the electron probe convergence angle even at the cost of a larger size has decreased mis-indexation issues. These optimum settings were used to perform quantitative texture analysis of NiPt-silicide thin films. Finally, the case of superimposed diffraction patterns related to overlapping grains was analyzed. Experiments showed that mis-indexing remains limited despite the superimposition and that grains with larger fraction volume were preferentially selected by template matching. A dedicated method was also proposed to overcome crystal overlapping issues. The approach is based on iterative re-indexation of diffraction patterns after subtraction of the reflections related to the previous ACOM best match. Considering the same diffraction patterns data-set, the capabilities of this method to recover the grains size and morphology were compared to two recent techniques based respectively on the analysis of virtual dark field (VDF) images and non-negative matrix factorization (NMF).
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Compréhension des mécanismes de dopage arsenic de CdHgTe par implantation ionique / Arsenic doping of HgCdTe by ion implantationLobre, Clément 04 June 2014 (has links)
Ce travail de thèse aborde l’ensemble de la problématique du dopage de type p de CdHgTe par implantation ioniqued’arsenic, de l’incorporation jusqu’à l’activation en passant par la diffusion. Pour chaque point considéré, plusieurstechniques de caractérisation ont été mises en oeuvre avec comme objectif la compréhension des mécanismes dedopage.Les dommages induits par le processus d’implantation ionique ont été étudiés d’un point de vue structural etélectrique, afin de déterminer leur influence sur les processus de diffusion et d’activation du dopant. Un effet derecuit sous irradiation a été mis en évidence lors de l’implantation ionique, avec une dose critique de saturationdes défauts estimée à 2.1014 at.cm-2. Un modèle simple a permis d’estimer le coefficient de diffusion de la partiemobile de l’arsenic et de montrer que le mercure joue un rôle majeur dans ce processus de diffusion. La limite desolubilité de l’arsenic dans CdHgTe a été déterminée pour les trois compositions d’alliage les plus utilisées dansles domaines d’applications infrarouges. Lorsque la concentration en arsenic dépasse cette limite, la formation denanocristaux riches en arsenic a été mise en évidence expérimentalement pour la première fois en combinant lamicroscopie électronique en transmission et la cartographie chimique à l’échelle nanométrique. La formation de cesnanocristaux permet d’expliquer pourquoi une partie de l’arsenic ne participe ni à la diffusion ni au dopage. Lanature chimique et cristallographique précise de ces nanocristaux reste encore à déterminer. La mesure du profil dedensité de porteurs a montré que les nanocristaux riches en arsenic ne sont pas actifs électriquement et que près de100 % de l’arsenic mobile lors du recuit d’activation présente un comportement accepteur. La formation du complexeaccepteur AsHg8 a été proposée afin d’expliquer les processus de diffusion et d’activation de l’arsenic dans CdHgTe.L’implantation des éléments azote, phosphore et antimoine a également été étudiée, et leurs comportements comparésà celui de l’arsenic. Pour les éléments azote et phosphore, un phénomène de piégeage, bloquant la diffusiondes dopants, a été mis en évidence et rend ces éléments inappropriés pour réaliser un dopage de bonne qualité.L’antimoine présente une diffusion beaucoup plus rapide que l’arsenic. De plus, l’activation en site accepteur deplus de 21 % de l’antimoine ayant diffusé lors du recuit d’activation a été démontrée. Même si le comportement del’antimoine est prometteur, parmi les éléments étudiés, l’arsenic présente les meilleures caractéristiques dans le cadred’une utilisation en tant que dopant de type p. Nos conditions de recuit permettent l’activation d’une grande partiede l’arsenic en site accepteur, tout en permettant de retrouver une bonne qualité cristalline dans la zone implantée. / This thesis addresses the incorporation of arsenic in HgCdTe but also its activation and the related diffusion duringhigh temperature annealing. For each item, a large panel of characterization tools was used in order to obtain abetter understanding of p-type doping of HgCdTe by arsenic implantation.Irradiation induced annealing during ion implantation has been demonstrated with a saturation fluence of about2.1014 at.cm-2. A simple model enabled us to evaluate the diffusion coefficient of arsenic and to evidence the majorrole of mercury in the diffusion process. The solubility limit of arsenic in the HgCdTe alloy was determined forthe three most common compositions used for infrared applications. For arsenic concentration over this limit, theformation of arsenic-rich nanocrystals was demonstrated by transmission electron microscopy coupled with nanoscalechemical mapping. This first experimental evidence of arsenic clustering explains why some of the arsenicdoes not participate in the diffusion process. However, the exact chemical and crystallographic nature of thesenanocrystals remains unknown. The measurement of the depth profile of carrier density allows us to demonstratethe electrical inactivity of arsenic-rich nanocrystals. On the other hand, almost 100 % of the mobile arsenic is foundto be activated as an acceptor. The formation of AsHg8 complexes was proposed to explain the activation and thediffusivity of arsenic in HgCdTe.Ion implantation of nitrogen, phosphorus and antimony was studied and its behavior compared to that of arsenic.For nitrogen and phosphorus, a trapping effect that blocks the dopant diffusion was observed. Therefore, a goodquality doping cannot be achieved under these conditions. Antimony exhibits a faster diffusion than arsenic and theactivation as an acceptor of more than 21 % of mobile antimony was demonstrated. Even if the antimony behaviorseems interesting, arsenic exhibits the most promising properties for HgCdTe doping among all studied elements.As well as restoring a good crystal quality, our annealing conditions allow the activation of most of arsenic as anacceptor.
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Rétention d'eau et microstructure fine de l'argilite de Bure / Water retention and fine microstructure of Bure argilliteSong, Yang 24 June 2014 (has links)
Dans le contexte du stockage profond des déchets radioactifs, il est important d'identifier l’hystérésis de saturation de la roche hôte, l'argilite du Callovo-Oxfordien, et sa capacité de scellement (en particulier, la porosité et la distribution de taille des pores). Tout d'abord, six cycles différents d'humidité relative sont destinés à évaluer l’hystérésis de saturation, qui n'est pas observée dans les cycles de faible amplitude. D'autre part, une nouvelle méthode est proposée pour la mesure de la porosité, qui utilise l'injection d'un gaz pour évaluer le volume des pores. Par rapport à la porosité par adsorption d'eau, l’injection de gaz fournit des porosités supérieures d’environ 5%. L'injection de gaz est également utilisée pour quantifier les isothermes de sorption-désorption, qui sont sensiblement différentes de celles obtenues par la méthode gravimétrique, avec un volume poreux accessible au gaz plus élevé pour une humidité relative <43%. Enfin, par Microscopie Electronique à Balayage couplée à un Faisceau Ionique Focalisé (FIB/MEB), on reconstruit le réseau poreux 3D de l'argilite à partir de séries d'images 2D espacées de 10nm : la porosité et la distribution de taille des pores sont quantifiés jusqu’à 20nm, ainsi que l’orientation et l'anisotropie. Avec une résolution plus élevée (jusqu’à moins de 1nm), la Microscopie Electronique à Transmission (MET) montre une grande quantité de pores de l’ordre de quelques nm, situés entre les agrégats d'argile. / In the context of deep underground storage of radioactive nuclear waste, it is important to identify the saturation hysteresis of the host rock, i.e. of Callovo-Oxfordian (COx) claystone, and its porosity and pore size distribution. Firstly, six different cycles of relative humidity are applied for saturation hysteresis, which is not observed in the cycles with low magnitude. Secondly, a new method is proposed for measuring porosity, which uses injection of gas to evaluate the pore volume. In contrast to porosity given by water adsorption, the gas injection method provides larger porosity values of around 5%. The gas injection method is also used to quantify the sorption-desorption isotherms of COx claystone, which are significantly different from those obtained by the gravimetric method, with a bigger pore volume accessible to gas in relative humidities < 43%. Finally, by Focused Ion Beam/Scanning Electron Microscopy (FIB/SEM), we obtain 2D image stacks and 3D reconstructed pore volumes, by which porosity and pore size distribution are quantified down to 20nm, as well as pore orientation and anisotropy. At a higher resolution (below 1nm), Transmission Electron Microscopy (TEM) imaging reveals significant amounts of smaller pores (of a few nm) between clay aggregates.
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Aspects microstructuraux de l'oxydation d'alliages de Zirconium / Microstructural aspects of the oxidation of zirconium alloysProff, Christian 06 May 2011 (has links)
Cette thèse est axée sur la caractérisation microstructurale des précipités dans les oxydes des alliages binaires de zirconium (1 wt.% Fe, Cr , Ni ou 0.6 wt.% Nb). La température d'oxydation est fixée au 415°C. Les échantillons sont oxydés dans l'air et dans l'autoclave sous des pressions différentes et dans un microscope électronique à balayages environnemental sous vapeur d'eau. Les résultats des recherches peuvent être résumés ci-dessous : -Deux types d'oxydation (retardée et non retardée) ont été observés pour les précipités. -Le facteur de Pilling-Bedworth des précipités est plus élevé par rapport à celui de zirconium. -Les précipités contenant du fer entrainent une formation des cristaux de l'oxyde de fer pur à la surface du matériau, quand les précipités sont à la surface ou à la proximité. Ces observations mènent à la conclusion que le comportement d'oxydation des précipités peut être corrélé à leurs compositions et à la tendance d'oxydation de leurs éléments constituants. / This thesis is focused on the microstructural characterisation of precipitates in the oxide of binary zirconium alloys (1 wt.% Fe, Cr or Ni or 0.6 wt.% Nb) under different oxidation conditions at 415°C. The samples were oxidised in autoclave in air and steam and in an environmental scanning electron microscope in water vapour. The microstructural evolution of the precipitates during oxidation was characterised using electron microscopy. The findings from the analysis are the following: -Two types of oxidation behaviour are observed for precipitates. -Pilling-Bedworth ratio of precipitates is higher than that of the zirconium matrix. -Formation of pure iron oxide crystals on the surface for iron bearing precipitates close to or at the surface. From these observations it is concluded that the precipitate oxidation behaviour can be correlated to precipitate composition and oxidation tendency of the elements in the precipitates. Iron exhibits clearly different behaviour.
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Rôles de Gab 1/2 et de Shp2 dans l'établissement du phénotype transformé et invasif de cellules MDCK infectées par le virus du sarcome de MoloneyGoupil, Eugénie January 2006 (has links)
No description available.
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Le rôle de la PI3-kinase dans le phénotype invasif et motile des cellules MSV-MDCK-INVDodier, Yolaine January 2003 (has links)
No description available.
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Avaliação do marcador tumoral c-met/HGF no prognóstico do câncer colorretal através da técnica da imuno-histoquímica / Evaluation of the c-met/hgf tumoral marker in the prognosis of colorectal cancer through the immunohistochemical techniqueOliveira, Antonio Talvane Torres de [UNIFESP] 31 December 2006 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2006-12-31 / Objetivo: Avaliar o significado prognóstico do marcador tumoral c-met/HGF, através da técnica imuno-histoquímica, em doentes portadores de adenocarcinoma colorretal submetidos a tratamento cirúrgico. Métodos: Estudo retrospectivo de 286 doentes,portadores de adenocarcinoma colorretal, atendidos e operados no Hospital do Câncer de Barretos, de 1993 a 2002. A expressão tissular do marcador tumoral foi avaliada utilizando-se o anticorpo monoclonal antiproteína c-met/HGF, com a técnica da estreptavidina-biotina-peroxidase. A análise da positividade do marcador foi feita de maneira semiquantitativa e a leitura das lâminas, realizada por três patologistas, de forma independente e sem prévio conhecimento dos dados clínicos e histopatológicos dos doentes. Resultados: Do total de 286 doentes analisados, o marcador foi positivo em 236 (78,8%) e negativo em 50 (21,2%). Houve diferença, estatisticamente significante (p=0.004), entre os estádios l e lV, na sobrevida global (p=0.009) e no coeficiente de mortalidade por câncer (p=0.022), porém não se identificou associação do marcador com a ocorrência de recidivas (p=0.89) e o intervalo livre de doença (p=0.91). Conclusão: O marcador tumoral c-met/HGF demonstrou significância estatística, em relação à sua expressão, nos estádios l e lV da doença, na sobrevida global e no coeficiente de mortalidade por câncer, porém não se associou de forma significante com as outras variáveis prognósticas estudadas. / Objective: To evaluate the prognostic meaning of the c-met/HGF tumoral marker, through the immunohistochemical technique, in patients with colorectal adenocarcinoma who have been subjected to surgical treatment. Methods: A retrospective descriptive study of 286 patients with colorectal adenocarcinoma, who have been seen and operated at Barretos Cancer Hospital, from 1993 to 2002. The tissular expression of the tumoral marker was evaluated using the cmet/ HGF anti-protein monoclonal antibody through the estreptavidin-biotinperoxidase technique. The positivity analysis of the marker was semiquantitative, and plate reading was independently carried out by three pathologists with no previous knowledge on clinical and histopathological data of patients. Results: Out of a total of 286 patients, the marker was positive in 236 (78.8%) and negative in 50 (21.2%). It was found statistically significant difference (p=0.004) between stages l and lV, at global life span (p=0.009), and at cancer mortality rate (p=0.022); however, there was no association between the marker and recurrence (p=0.89) or the marker and disease-free period (p=0.91). Conclusion: c-met/HGF has shown significance as a tumoral marker in stages l and lV of the disease, at global life span, and at cancer mortality rate; however, there was no significant association with the remaining prognostic variables that have been studied. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Ler o pol?tico no modo como se l? as met?foras de leitura no discurso da cr?tica liter?riaBicicgo, Cleber 25 June 2014 (has links)
Submitted by Diego dos Santos Borba (dborba@uffs.edu.br) on 2017-04-13T20:24:22Z
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Previous issue date: 2014-06-25 / A partir do conceito de met?fora e da no??o de efeito metaf?rico fundamentados no trabalho do franc?s Michel P?cheux, esta disserta??o prop?e analisar as met?foras de leitura no discurso da Cr?tica Liter?ria, para compreender o funcionamento do pol?tico-ideol?gico no discurso metaf?rico. A disputa ideol?gica na produ??o do conhecimento, segundo P?cheux, est? na materialidade das met?foras que uma ci?ncia usa para ?compreender e se fazer compreender?. Questionando, ent?o, as met?foras de leitura, como est?o formuladas no discurso da Cr?tica Liter?ria, o presente estudo leva a considerar que a constitui??o hist?rico-discursiva das met?foras n?o possui uma origem, e sim diferentes formas de funcionamento, conjunturalmente tomadas pela disputa entre diferentes concep??es de leitura. A partir desse entendimento, surgem duas considera??es: a primeira ? que n?o existe uma mem?ria homog?nea que estaria na ?origem? da met?fora; a segunda ? que a met?fora ? produzida conforme o contexto de produ??o, podendo se deslocar para dentro de diferentes forma??es discursivas. O funcionamento do discurso metaf?rico marca um posicionamento pol?tico-ideol?gico, cujo resultado aponta para a rela??o entre uma pr?tica cient?fica e uma pr?tica pol?tica, materializadas nas met?foras de leitura. Trata-se, dessa maneira, de um estudo que problematiza o discurso metaf?rico a partir do posicionamento pol?tico-ideol?gico que o sujeito cr?tico liter?rio assume ao interpretar. Esta pesquisa traz uma contribui??o importante para os estudos sobre a met?fora, na perspectiva da An?lise de Discurso, al?m de subsidiar a pr?pria Cr?tica Liter?ria, na compreens?o do processo hist?rico que marca as met?foras que ela usa para compreender o funcionamento dos sentidos numa obra liter?ria. / From the concept of metaphor and metaphorical effect?snotion based on Michel P?cheux?swork, this dissertation proposes to examine the metaphors of reading on the discourse of literary criticism to understand the functioning of the political-ideological discourse in metaphorical discourse. The ideological struggle in the production of knowledge, according to P?cheux, is the materiality of metaphor that a science uses ?to understand and be understood?.So, questioning the metaphors of reading, as they are formulated in the discourse of literary criticism, this study leads to the conclusion that historical and discursive constitution of metaphors does not have a source, but different ways of working, conjuncturally taken by the dispute between different conceptions of reading. Based on this understanding, two considerations arise: the first is that there is no homogeneous memory that would be the ?origin? of metaphor; the second is that the metaphor is produced according to the context of production and can move within different discursive formations. The functioning of metaphoric discourse marks a political-ideological stance which the results points to the relationship between scientific practice and political practice, embodied in the metaphors of reading. It is, thus, a study that discusses the metaphoric discourse from the political-ideological stance that the literary critic subject assumes when he interprets. This research makes an important contribution to studies on metaphor, from the perspective of discourse analysis, in addition to supporting the literary criticism itself on understanding the historical process that marks the metaphors it uses to understand the functioning of the senses in a literary work.
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