Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-01Bitstream added on 2014-06-13T21:02:21Z : No. of bitstreams: 1 gomes_mos_dr_jabo.pdf: 698875 bytes, checksum: afd518bba945181192347fd290a0c60e (MD5) / As possíveis diferenças que acometem cães de diferentes idades ainda são pouco estudadas e descritas para esta espécie. O presente estudo avaliou e comparou a composição da microbiota nas fezes e seus produtos de fermentação, aspectos histológicos da mucosa intestinal e a imunidade de cães filhotes, adultos e velhos. Para tal, 30 cães beagle foram divididos igualmente em três grupos: o grupo filhotes (GF), composto por filhotes do desmame aos 10 meses de idade; o grupo adultos (GA), composto por cães adultos entre cinco e seis anos e o grupo velhos (GV), composto por cães velhos entre 10 e 13 anos. Os animais receberam a mesma dieta e nenhum outro tipo de intervenção por 30 dias e após este período amostras de fezes frescas foram colhidas para a mensuração de: pH, determinação da concentração de lactato, ácidos graxos de cadeia curta e ramificada, amônia, indol, fenol, aminas, imunoglobulina A e composição da microbiota. Também foi adquirida amostra de sangue periférico para quantificação das populações linfocitárias CD4+CD5+, CD5+, CD8+CD5+, e CD21+ por citometria de fluxo, sendo esta analisada em cinco idades (45, 66, 87, 105 e 300 dias) do GF e a média destas avaliações comparada com GA e GV. Após esta análise, foi realizado teste de hipersensibilidade cutânea tardia e ao final destes, os animais foram anestesiados e submetidos a procedimento endoscópico para coleta de fragmentos do estômago e intestinos delgado e grosso para análise histológica dos mesmos. Considerou-se como significativos valores de P≤0,05 e como tendência valores de P<0,1. Observou-se que o GF apresentou maior número de Bifidobacterium spp. e Cluster IV. GV apresentou indicativo de menor atividade sacarolítica bacteriana observada pela menor concentração de acetato, propionato, butirato e ácidos graxos voláteis totais o que... / Possible differences that may occur in dogs of different ages have been little studied and described in this specie. The aim of this study was to evaluate and compare the composition of microbiota and some fermentation products in the feces, histological aspects of intestinal mucosa and immunity of puppies, adults and senior dogs. To perform this, 30 beagle dogs were divided into three groups: Puppy group (GF), composed of puppies from weaning to 10 months old, Adult group (GA), composed of adult dogs between five and six years and Old group (GV), composed of old dogs between 10 and 13 years. Animals received the same diet and no other intervention for 30 days, and after this period, fresh fecal samples were collected for measurement of pH, determining the concentration of lactate, short and branched chain fatty acids, ammonia, indol, phenols, amines, immunoglobulin A and composition of the microbiota. It was also acquired a peripheral blood sample for quantification of lymphocyte populations CD4+CD5+, CD5+, CD8+CD5+, and CD21+ by flow cytometry, which was analyzed in five ages of GF (45, 66, 87, 105 and 300 days) and the average of these evaluations compared with GA and GV. After this analysis was performed the delayed type hypersensitivity test and by the end of this, animals were anesthetized and submitted to an endoscopic procedure for collecting fragments of stomach and small and large intestines for histological analysis. P values ≤0.05 was considered significant and P values <0.1 as a trend. GF showed greater number of Bifidobacterium spp. and Cluster IV. GV presented an indication of reduced bacterial saccharolytic activity observed by the lower concentration of acetate, propionate, butyrate, and total volatile fatty acids which resulted in higher pH in the feces of this group. GF showed... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003Bitstream added on 2014-06-13T19:41:23Z : No. of bitstreams: 1 monreal_mtfd_dr_botfm.pdf: 1555649 bytes, checksum: 0bf7e0b05dcf2f4d0b89f10dce0efb02 (MD5) / O trato gastrointestinal possui enorme variedade de bactérias aeróbias e anaeróbias, metabolicamente ativas, que interagem entre si em complexo ecossistema. Essa microbiota desempenha funções importantes no metabolismo, nutrição, imunidade e proteção contra a colonização por microrganismos patogênicos. Vários fatores podem influenciar essa microbiota, entre eles a idade, dieta, processos inflamatórios e infecciosos e utilização de antimicrobianos. Assim, este estudo foi desenvolvido com o objetivo de verificar a influência das infecções bacterianas do trato respiratório e do tratamento com amoxicilina sobre a microbiota intestinal normal do paciente. O processo infeccioso bacteriano do trato respiratório influenciou a microbiota intestinal dos pacientes. Houve redução significativa na quantidade de UFC/g de fezes de microrganismos dos gêneros Bacteroides e Lactobacillus. A utilização de amoxicilina também influenciou a microbiota intestinal. Foi observada redução significativa na quantidade de UFC/g de fezes de microrganismos dos gêneros Bifidobacterium e Lactobacillus. É importante identificar modificações na composição da microbiota intestinal, uma vez que a diminuição destes microrganismos pode representar diversos prejuízos para o hospedeiro. Um destes prejuízos é a diminuição da resistência à colonização. Esses prejuízos, quando acompanhados, podem ser minimizados pela equipe de saúde por meio de medidas relativas à conduta terapêutica e alimentar, visando reduzir a influência nociva sobre o ecossistema gastrointestinal. / The gastrointestinal tract contains an enormous variety of metabolically active aerobic and anaerobic bacteria, that interact with each other in a complex ecosystem. That microbiota carries out important functions in the metabolism, nutrition, immunity and protection against the colonization by pathogenic microorganisms. Several factors can influence this microbiota, among them are age, diet, inflammatory and infectious processes and use of antimicrobial agents. Thus, this study was developed with the objective of verifying the influence of the bacterial infections of the respiratory tract and of the treatment using amoxicillin on the patient's normal intestinal microbiota. The bacterial infectious process of the respiratory tract influenced the patients' intestinal microbiota. There was significant reduction in the amount of CFU/g of feces of microorganisms of the Bacteroides and Lactobacillus genus. The use of amoxicillin also influenced the intestinal microbiota. Significant reduction was observed in the amount of CFU/g of feces of microorganisms of the Bifidobacterium and Lactobacillus genus. It is important to identify modifications in the composition of the intestinal microbiota, once the decrease of these microorganisms can cause damage to the host. One of these damages is the decrease in the resistance to the colonization. Those damages, when accompanied, can be minimized by the health staff using measures related to the therapeutic and alimentary conduct, seeking to reduce the noxious influence on the gastrointestinal ecosystem.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-15Bitstream added on 2014-06-13T19:44:13Z : No. of bitstreams: 1 sterzo_ev_dr_jabo.pdf: 1284040 bytes, checksum: 1b92a11284babaa3c1ccc125e04e5893 (MD5) / O presente estudo teve por objetivo descrever as alterações morfológicas ocorridas nos cecos de pintos de corte, machos e fêmeas, tratados com Microbiota Cecal (MC) antes e após infecção por Salmonella enterica enterica sorovar Enteritidis (SE) durante a primeira semana de vida. No 1º dia de vida, os pintos foram tratados com MC antes e depois da infecção por SE. Durante todo o período experimental as condições clínicas, assim como a taxa de mortalidade foram observadas. No 1º, 3º, 5º e 7º dias pós infecção (dpi) quatro aves de cada sexo/tratamentos foram sacrificadas por meio de deslocamento cervical para obtenção de amostras do ceco para análises morfológicas (histologia e microscopia eletrônica de varredura), morfométricas e contagem do número de células inflamatórias e células caliciformes PAS+ e AB+. Os dados mostraram alguns episódios de diarréia e quadros de depressão nos pintos infectados com SE no 5º e 7º dpi; nesse período não foi observada mortalidade. No tocante às análise morfológicas, os pintos infectados por SE respondem ao processo infeccioso com um processo inflamatório agudo no 1º dpi, e a partir do 3º dpi, o processo se cronifica. A Microbiota Cecal (MC) antes da infecção, evita as alterações morfofuncionais causadas pela bactéria nos cecos dos pintos de corte, além disso, a MC induz a proliferação de células caliciformes PAS+ e AB+ e, conseqüentemente aumenta a produção de muco, sendo um fator de proteção ao epitélio cecal / This study aimed to describe the morphological changes occurred in the caecu, of males and females broiler chickens treated with Cecal Microbiote (CM) before and after the infection with Salmonella enterica enterica serovar Enteritidis (SE) during the first week of life. On the first day of life, chickens were treated with CM before and after the infection with SE. Throughout the experimental period, the clinical conditions as much as the mortality rates were observed. On 1st, 3rd, 5th and 7th days post infection (dpi), four birds of each sex/treatment were slaughtered by cervical dislocation in order to obtain samples from the caecum for morphological analysis (histology and scanning electron microscopy), morphometrical analysis and counting of the number of inflammatory and goblet cells PAS+ and AB+. The data showed some diarrhea episodes and depression symptoms in the chickens infected with SE on 5th and 7th dpi; in this period it was not observed any mortality. Concerning the morphological analysis, the chicks infected with SE respond to infectious process with and acute inflammatory process on 1st dpi and after the 3rd dpi the process gets chronicle. The Cecal Microbiote (CM) prior to infection avoid the morphological and functional alterations caused by the bacteria in broiler chickens caecum, in addition, the CM induces the proliferation of goblet cells PAS+ and AB+ and consequently increases mucus production being a protection factor to the caecum epithelium

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-01-29Bitstream added on 2014-06-13T21:06:49Z : No. of bitstreams: 1 childs_gmf_dr_jabo.pdf: 764394 bytes, checksum: e911809aa7ff8c7e97896f6faa8e8727 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Funep / Monsanto / Avaliou-se o efeito de oito herbicidas em duas concentrações (2 e 10 vezes a dose media recomendada por hectare) sobre a microbiota de solo. Os herbicidas (bentazon, metolachlor, trifluralin, imazethapyr, imazethapyr+lactofen, haloxyfop-methyl, glyphosate e chlorimuron-ethyl) foram selecionados em função dos resultados de um estudo prévio. Como bioindicadores de atividade se utilizou: respiração microbiana, quantificando-se a emissão de CO2 aos 2, 4, 8, 12, 16, 20, e 24 dias de incubação, mineralização de nitrogênio, atividade da enzima desidrogenase e a hidrólise do diacetato de fluoresceína (FDA), aos 8 e 28 dias. Também se estimou diversidade microbiana. Bentazon e a mistura de imazethapyr+lactofen, na maior concentração, e o haloxyfop-methyl nas duas concentrações, apresentaram efeitos inibitórios na respiração microbiana, embora diferentes em época e duração do efeito. Na mineralização de nitrogênio não foi possível detectar efeitos dos tratamentos. Nenhum dos tratamentos herbicidas afetou a hidrólise do FDA. A atividade da desidrogenase mostrou comportamento variável aos 8 e 28 dias, com resultados de inibição e de estimulo. Somente o herbicida metolachlor 10x causou inibição na quantidade de fungos, os restantes efeitos detectados resultaram em incrementos dos microrganismos. A única correlação significativa encontrada foi entre a atividade da desidrogenase e a respiração basal aos oito dias de incubação. / The effects of eight herbicides on soil microorganism activity were evaluated at two concentrations: 2x and 10x the recommended doses for each product in soybean. These herbicides were selected through the results of a prior experiment were 17 herbicides were tested. The selected herbicides were: bentazon, metolachlor, trifluralin, imazethapyr, imazethapyr+lactofen, haloxyfop-methyl, glyphosate e chlorimuron-ethyl. To study the microorganism activity the following parameters were measured: CO2 soil production until 28 days of incubation, nitrogen mineralization rate, dehydrogenase and FDA activities, at 8 and 28 days of incubation. The functional microbe diversity also was investigated. Bentazon (10x) and the mix imazethapyr+lactofen (10x) and haloxyfopmethyl at both concentrations, reduced the CO2 production, although with differences in timing and duration. No effects of the herbicides could be detected on nitrogen mineralization or FDA hydrolyses. Variable effects involving inhibition or stimulation were detected in the dehydrogenase activity according on herbicide, concentration and period of incubation. Only metolachlor (10x) had inhibition effects on the soil fungi population; the other herbicides promoted increases on microorganism populations. Only dehydrogenase activity and soil respiration at 8 days correlated significatively.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-05. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:48:54Z : No. of bitstreams: 1 000831351.pdf: 626171 bytes, checksum: 6309f47645c602431c0e00917cabbe12 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A contaminação bacteriana do útero após o parto é um evento quase unânime em vacas, em que a Escherichia coli (E. coli) é o principal micro-organismo encontrado. Apesar disto, a ativação de mecanismos de defesa local e sistêmica eliminam gradualmente os contaminantes ao longo do puerpério fisiológico. Porém, algumas bactérias possuem fatores de virulência, que facilitam sua instalação e permanência no tecido hospedeiro, propiciando o desenvolvimento de infecções uterinas. Embora o mecanismo não esteja completamente elucidado, certifica-se que a presença de E. coli nos primeiros dias pós-parto favorece o crescimento de Trueperella pyogenes num período mais tardio, bactéria frequentemente associada à infecção uterina. Com isto, objetivou-se estabelecer a dinâmica e perfil da microbiota uterina relacionando os fatores de virulência das E. coli isoladas do útero das vacas, 24 horas após a parição, com a presença bacteriana no ambiente uterino na segunda semana pós-parto. O estudo foi conduzido em 75 vacas holandesas preto e branca (HPB) com parto e puerpério isento de complicações. Decorridas 24 horas do parto (Momento 1) foi realizada avaliação ginecológica através da palpação retal, observada a coloração da mucosa vaginal e aferição da temperatura retal. Destes animais foram coletadas, em condições de assepsia, amostras da secreção loquial visando-se o cultivo microbiológico, antibiograma e a citologia uterina. O período pós-parto foi monitorado quanto às intercorrências e alterações da esfera reprodutiva e produtiva. No 14º dia pósparto (Momento 2), foram realizados os mesmos procedimentos, além da ultrassonografia transretal. Amostras de sangue foram coletadas, em ambos os momentos, para a caracterização da capacidade fagocítica dos neutrófilos pelo teste do nitroblue tetrazolium (NBT) estimulado (ES) e não estimulado (NE) e realização de hemograma. Nas E. coli isoladas foram ... / Bacterial contamination of the uterus after delivery is almost an unanimous event in cows, in which the Escherichia coli (E. coli) is the main micro-organism found. Despite this, the activation of local and systemic defense mechanisms gradually eliminate contaminants throughout the physiological puerperium. However, some bacterias possess virulence factors that facilitate its installation and remain in the host tissue, leading to the development of uterine infections. Although the mechanism is not fully elucidated, it is certified that, the presence of E. coli in the first days postpartum favors the growth of Trueperella pyogenes in a later period, bacteria often associated with uterine infection. Thus, aimed to establish the dynamics and profile of uterine microbiota relating the virulence factors of E. coli isolated from the uterus of cows 24 hours after calving, with the bacterial presence in the uterine environment in the second postnatal week. The study was conducted on 75 Holstein cows with normal delivery and postpartum without complications. After 24 hours of parturition (Moment 1), gynecological evaluation was performed by rectal palpation, observed staining of the vaginal mucosa and measurement of rectal temperature. Samples of secretion loquial were collected aseptically of these animals, aiming the microbiological culture, antibiogram and uterine cytology. The postpartum period was uneventful and monitored for changes in the reproductive and productive sphere. On the 14th day postpartum (Time 2), the same procedures were were performed, apart from transrectal ultrasonography. Blood samples were collected at both moments, to characterize the phagocytic ability of neutrophils by the nitroblue tetrazolium test (NBT) stimulated (S) and unstimulated (US) and hemogram. In E. coli isolates were investigated different genes associated with virulence factors (VF) by PCR. Rapid uterine involution, characterized by diameter of the ... / FAPESP: 2011/15852-7

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-17Bitstream added on 2014-08-13T18:00:03Z : No. of bitstreams: 1 000767460.pdf: 1202890 bytes, checksum: cef3aa26e78e27beaab21a517efebe46 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As doenças inflamatórias intestinais (DII), entre elas a doença de Crohn (DC) e a retocolite ulcerativa idiopática (RCUI) compreendem um grupo de patologias que possuem como principal característica a inflamação da mucosa intestinal. Embora sua origem ainda não seja completamente conhecida, existe uma crescente evidência baseada em estudos recentes associando predisposição genética, composição da microbiota intestinal e sistema imunológico como fatores precursores para a iniciação e progressão dessas patologias. O uso de determinadas cepas probióticas vem sendo apontado como uma forma promissora de se reduzir o risco de doenças inflamatórias intestinais, mais precisamente da colite ulcerativa. Diversos mecanismos têm sido propostos para explicar os benefícios dos probióticos, indicando que algumas cepas bacterianas são capazes de modular positivamente a microbiota intestinal e o sistema imune, além de produzirem metabólitos com capacidade antiinflamatória. Como os efeitos e os mecanismos de ação envolvidos são cepa-específicos, é de extrema importância a realização de novos estudos para compreender as interações entre microbiota intestinal e hospedeiro, contribuindo para o entendimento do potencial terapêutico dos probióticos nas doenças relacionadas ao desequilíbrio da microbiota intestinal. O presente trabalho se propõe a investigar o efeito da ingestão diária de um produto à base de extrato aquoso de soja, fermentado com Enterococcus faecium CRL 183 e Lactobacillus helveticus 416 e com adição de Bifidobacterium longum ATCC 15707, na colite induzida quimicamente em ratos. A colite foi induzida, pela administração de dextran sulfato de sódio (DSS) a 4%, que foi dissolvido na água fornecida diariamente aos animais e administrado durante um período de sete dias. Os animais foram distribuídos aleatoriamente em cinco grupos (n=10): Grupo C: Animais sadios que não receberam os produtos em estudo. ... / Inflammatory bowel disease (IBD), including Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), comprise a group of disorders and their main characteristic is an inflammation of the intestinal mucosa. Although its origin is not yet fully known, there is growing evidence linking genetics predisposition, composition of the intestinal microbiota and immune system factors as precursors for the initiation and progression of these pathologies. The use of certain probiotic microorganisms has been considered as promising way to reduce the risk of inflammatory bowel disease, specifically ulcerative colitis. Several mechanisms have been proposed to explain the benefits of probiotics, indicating that some bacterial strains are able to positively modulate the intestinal microbiota and the immune system, and produce metabolites with anti-inflammatory capacity. As the effects and the mechanisms involved are strain-specific, further studies are extremely important to understand the interactions between gut microbiota and host, contributing to the knowledge on therapeutic potential of probiotics in diseases related to dysbiosis. This current paper aims to bring together the various results and information based on scientific evidence that are related to probiotics and the inflammatory bowel disease, with emphasis on the possible mechanisms involved in this action. Furthermore, the effects of daily ingestion of a product based on an aqueous extract of soybean, fermented by Enterococcus faecium CRL 183 and Lactobacillus helveticus 416 with the addition of Bifidobacterium longum ATCC 15707, were also investigated on chemically induced colitis in rats. Colitis was induced by 4% dextran sulfate sodium (DSS), dissolved in the drinking water supplied to the animal, which was ingested daily for a period of seven days. The animals will then be assigned randomly to four groups (n=10): Group C: healthy animals that do not receive the products under study; Group CL: ...

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-27Bitstream added on 2014-11-10T11:57:42Z : No. of bitstreams: 1 000792129.pdf: 1387453 bytes, checksum: a23091891fb1b1c568aaa3170eeee7cf (MD5) / O entomopatógeno Bacillus thuringiensis têm se destacado no controle biológico de insetos-praga como alternativa viável em substituição aos inseticidas químicos. A bactéria é caracterizada pela produção de cristais protéicos em concomitância com o processo de esporulação. Esses cristais são formados por polipeptídeos que apresentam propriedade entomopatogênica frente a diversas ordens de insetos, porém são inócuos ao meio ambiente. Dessa forma, o conhecimento da diversidade de genes de B. thuringiensis presente no solo é de extrema importância para compreender sua distribuição ecológica e seus efeitos em habitats diferentes. Em paralelo, o uso de técnicas de análise envolvendo metagenômica são propostas para estudar comunidades microbianas presentes no meio ambiente, permitindo inclusive o acesso a microrganismos incultiváveis. A partir desta proposta o presente trabalho analisou a diversidade de genes codificadores das proteínas entomopatogênicas de B.thuringiensis em seqüências metagenômicas de DNA extraído de solo com cultivo de cana-de-açúcar e solo de floresta nativa em estações climáticas distintas. Foi possível identificar linhagens que possivelmente deram origem ao material genético via plataforma MG-RAST e os genes codificadores das proteínas entomopatogênicas foram identificados utilizando o software BLAST. Os resultados evidenciam uma provável influência das estações climáticas sobre a diversidade dos genes obtidos por este tipo de análise / The entomopathogen Bacillus thuringiensis is the most used alternative to control pests as opposed to the use of chemical products. This bacterium is able to produce crystals protein with entomopathogenic properties coded by the cry genes during its sporulation phase. The knowledge of the diversity of cry genes found in B. thuringiensis that is considered a soil bacterium is of extreme importance to allow us to understand the ecological distribution and its potential effects on the environment. Aside from this, the use of metagenomics techniques are being proposed to study microbial communities, as a way to overcame uncultivable microorganism. Based on such proposition this work aimed to evaluate the presence of B. thuringiensis entomopathogenic protein coding genes from metagenomic DNA extracted from soil samples on which sugar-cane has been cultivated as well as native forest soil samples obtained during different seasons of the year. It was possible to identify some strains of B. thuringiensis using the platform MG-RAST and their respective cry genes using the software BLAST. The obtained results allowed us to consider the influence of the climate on the diversity of cry genes that could be recognized by this type of analysis

Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-25Bitstream added on 2014-11-10T11:57:42Z : No. of bitstreams: 1 000792126.pdf: 1460032 bytes, checksum: 893375b9efeacd9cd350165c560a9ac5 (MD5) / O trabalho objetiva avaliar o papel da comunidade bacteriana na dinâmica dos sedimentos. No presente trabalho, compararam-se as comunidades bacterianas presentes em sedimentos de dois viveiros de piscicultura, um reservatório de água (V1) e o outro com condições de elevada carga orgânica (V4), os quais estão inseridos em um sistema sequencial com fluxo contínuo de água. As coletas de sedimentos foram realizadas em dois períodos distintos, um sendo na seca (Julho e Agosto/2012) e outro na chuva (Janeiro e Fevereiro/2012). A comunidade bacteriana foi avaliada através do sequenciamento do gene 16S rRNA. Os filos bacterianos permaneceram praticamente inalterados nas amostras V1 comparadas nas duas épocas estudadas. Nas amostras do V4 observou-se variação na frequência dos organismos encontrados em relação às diferentes coletas. A predominância em V1 foi dos filos Firmicutes seguido do Proteobacteria, Acidobacteria e Actinobacteria. No V4, o maior número de sequências encontradas pertencia ao filo Proteobacteria, seguido de Acidobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Chloroflexi, Nitrospira, Gemmatimonadetes e TM7. A comparação da população bacteriana dos dois viveiros estudados em diferentes épocas mostrou que as bactérias variam de acordo com as condições climáticas e estão intimamente interligadas com a concentração de nutrientes do local. Estas diferenças são importantes na elucidação do papel desenvolvido pelos procariotos na dinâmica dos sedimentos / The aim of this study was identify the bacterial communities in dynamic of the sediment. In this study, we compared the bacterial communities present in sediment of two fish farm pond a used as water reservoir (V1) and the other with conditions of high nutrient load (V4), which are inserted in a sequential system with continous water flow (six ponds). The sediment sampling were conducted in two distinct periods one in dry season (July and August/2012) and another in the rain (January and February/2012). The bacterial community was assessed by sequencing the 16S rRNA. Through this data we observed in V1 regardless of time of year the bacterials phyla remained virtually unchanged.In V4 samples, was observed a variation in the frequency of organisms found in relation to different collections. In V1 was the predominance of the Phylum Firmicutes followed Proteobacteria, Acidobacteria and Actinobacteria. The largest number of sequences found at V4 belonged to the Proteobacteria phylum followed Acidobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Chloroflexi, Nitrospira, Gemmatimonadetes and TM7. A comparison of the bacterial population of the two ponds studied at different times showed that the bacteria at these sites varies according to the climatic conditions and are closely linked with nutrient concentration local. These differences are important in elucidating the role played by prokaryotes in the sediment dynamics

Made available in DSpace on 2014-12-02T11:16:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-23Bitstream added on 2014-12-02T11:21:12Z : No. of bitstreams: 1 000792833.pdf: 1266724 bytes, checksum: a118abe3dc3a9c6eb8d6d54eaae120c9 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O câncer de cólon é um dos tipos de cânceres mais prevalentes e, sua etiologia pode estar relacionada à fatores genéticos, ambientais e tipo de dieta. Por isso, o setor de alimentos investe cada vez mais no desenvolvimento de alimentos funcionais e entre esses, se destacam as bactérias probióticas e ingredientes prebióticos. O objetivo desta pesquisa foi avaliar os efeitos do consumo de probiótico (Lactobacillus acidophilus CRL 1014) e prebiótico (extrato de yacon) sobre a microbiota intestinal de animais induzidos quimicamente ao câncer de cólon. Foram utilizados 175 ratos machos Wistar divididos aleatoriamente em cinco tratamentos: Tratamento I-GCN: animais controle negativo (animais sadios que consumiram apenas a ração comercial); Tratamento II-GCP: animais controle positivo (induzidos quimicamente ao câncer de cólon e que consumiram apenas a ração comercial); Tratamento III-GPRO: (induzidos quimicamente ao câncer de cólon e que consumiram ração comercial + L. acidophilus CRL 1014); Tratamento IV-GPRE: (induzidos quimicamente ao câncer de cólon e que consumiram ração comercial + yacon); Tratamento V-GS: (induzidos quimicamente ao câncer de cólon e que consumiram ração comercial + L. acidophilus CRL 1014+ yacon). Os animais induzidos foram inoculados semanalmente com 1,2 dimetilhidrazina durante 2 semanas, sendo 2 induções semanais na concentração de 40mg/kg de peso. O L. acidophilus CRL 1014, na concentração de 109UFC/mL foi administrado aos animais na quantidade de 3 ml/kg de peso/dia, já o extrato aquoso de yacon foi administrado na quantidade de 10% de FOS/ração. Foram realizadas análises microbiológicas dos gêneros Enterococcus spp., Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Enterobactérias, Clostridium spp., Bacteroides spp., aeróbios facultativos e aeróbios totais por método convencional. Foi realizada a análise de PCR- DGGE para o gênero Lactobacillus spp., além da produção de ácidos ... / Colon cancer is one of the most prevalent types of cancer, and its etiology may be related to genetic, environmental factors and type of diet. Therefore, the food industry invests in the development of functional foods, such as probiotic bacteria and prebiotic ingredients. This research was evaluate the effects of consumption of probiotic (Lactobacillus acidophilus CRL 1014) and prebiotic (yacon extract) on the gut microbiota on 1.2 dimethylhydrazine (DMH) induced colon carcinogenesis in Wistar rats. The animals were randomly allocated into five groups (n=35): Treatment I-GCN: negative control animals (healthy animals + commercial feed); Treatment II-GCP: positive control animals (DMH induced + commercial feed); Treatment III-GPRO: (DMH induced + commercial feed + L. acidophilus CRL 1014); Treatment IV-GPRE: (DMH induced + commercial feed + yacon); Treatment V-GS: (DMH induced + commercial feed + L. acidophilus CRL 1014+ yacon). The induced animals were inoculated with DMH twice weekly for 2 weeks at a concentration of 40mg/kg weight. The probiotic, L. acidophilus CRL 1014 was administered in 109CFU/mL (3 ml/kg body weight) and the yacon extract (10% FOS/ feed),once daily. Microbiological analysis of Enterococcus spp., Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Enterobacteriaceae, Clostridium spp., Bacteroides spp., total aerobes and facultative anaerobes were performed by plate count. Analysis of PCR-DGGE for the lactobacilli community, short-chain fatty acids (SCFA) production, ammonium ions and fecal pH were performed. The viable counts showed that the Enterococcus spp., at the end of the experimental protocol, the treated groups showed higher than controls count. The counts of Enterobacteriaceae and Bacteroides spp., were higher to GCP. There was an increase of Lactobacillus spp. for GPRO and Bifidobacterium ssp. for GPRE and GS. All groups increased counts facultative anaerobes, and GPRO was the only group that reduced total aerobes ...

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2018. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2018-05-18T19:05:38Z No. of bitstreams: 1 2018_RafaelaAlvesRibonTozetti.pdf: 533432 bytes, checksum: ca4e97eb58a255b42c896ebb49fa7e22 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-05-30T18:07:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_RafaelaAlvesRibonTozetti.pdf: 533432 bytes, checksum: ca4e97eb58a255b42c896ebb49fa7e22 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-30T18:07:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_RafaelaAlvesRibonTozetti.pdf: 533432 bytes, checksum: ca4e97eb58a255b42c896ebb49fa7e22 (MD5) Previous issue date: 2018-05-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). / Os organismos fúngicos de importância oftálmica são classificados em fungos filamentosos e leveduras. Esses fungos estão envolvidos na invasão e infecção da córnea de equinos, e são os mesmos presentes na superfície ocular saudável, que varia com a região geográfica e estação climática. O objetivo desse estudo é identificar e descrever a incidência de fungos na conjuntiva ocular de equinos saudáveis do Distrito Federal, e correlacionar com a estação do ano, gênero de animal e meios de cultura utilizados, bem como avaliar a relação entre o meio de cultura utilizado e o crescimento de isolados fúngicos. Foram utilizados cinquenta cavalos (100 olhos), machos e fêmeas, com idade entre sete e 31 anos, provenientes do Regimento de Polícia Montada do Distrito Federal, Brasil. Swabs do fórnix conjuntival foram coletados e transportados em meio Stuart e solução salina, para semeadura em Ágar Sabouraud e Ágar Mycosel. O efeito da estação climática, gênero e meio de cultura, na frequência de fungos isolados foi avaliada. Culturas positivas foram obtidas em 220 amostras de um total de 300. Os cultivos apresentaram 33,67% de crescimento de bactérias e 55,97% de crescimento fúngico. O Aspergillus spp. foi o gênero mais incidente, encontrado em 26,33% das amostras, mais presente no verão, seguido pelo Cladosporium spp. 9%, Rhodotorula spp. 7,33%, Candida spp. 2,33%, Malassezia spp. 5,66%, Penicillium spp. 2,33%, Scopulariopsis spp. 2%, Fusarium spp. 0,66% e Exophiola jeanselmei 0,33%. Os fungos filamentosos foram mais prevalentes que as leveduras. A maior frequência foi do gênero Aspergillus spp. no verão, seguido do Cladosporium e Rhodotorula, caracterizados como fungos ambientais e agentes de infecções oportunistas. Bactérias, Aspergillus spp e Cladosporium spp. tiveram maior crescimento no meio Sabouraud, devido a seletividade do meio Mycosel. / Fungal organisms of ophthalmic importance are classified as filamentous fungi and yeasts. These fungi are involved in the invasion and infection of the cornea of horses, and are the same present on the healthy ocular surface, which varies with geographic region and climatic season. The aim of this study is to identify and describe the incidence of fungi in the ocular conjunctiva of healthy horses of the Federal District, and to correlate with the season of the year, animal genus and culture media used, as well as to evaluate the relationship between the culture medium used and the growth of fungal isolates. Fifty horses (100 eyes), males and females, aged between seven and 31 years old, coming from the Mounted Police Regiment of the Federal District, Brazil. Swabs of conjunctival fornix were collected and transported in Stuart medium and saline solution for sowing in Sabouraud Agar and Mycosel Agar. The effect of climatic season, genus and culture medium, on the frequency of isolated fungi was evaluated. Positive cultures were obtained in 220 samples of a total of 300. The cultures had 33.67% of bacterial growth and 55.97% of fungal growth. Aspergillus spp. was the most incident genus, found in 26.33% of the samples, most present in the summer, followed by Cladosporium spp. 9%, Rhodotorula spp. 7.33%, Candida spp. 2.33%, Malassezia spp. 5.66%, Penicillium spp. 2.33%, Scopulariopsis spp. 2%, Fusarium spp. 0.66% and Exophiola jeanselmei 0.33%. Filamentous fungi were more prevalent than yeasts. The highest frequency was of the genus Aspergillus spp. in the summer, followed by Cladosporium and Rhodotorula, characterized as environmental fungi and agents of opportunistic infections. Bacteria, Aspergillus spp and Cladosporium spp. had greater growth in the Sabouraud medium, due to the selectivity of Mycosel medium.